Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-02-15T20:55:07Z No. of bitstreams: 2 Cirino, G. G. - Tese Doutorado.pdf: 11238553 bytes, checksum: f8491c9a19a89be5cb23dc7a65a80003 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-15T20:55:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Cirino, G. G. - Tese Doutorado.pdf: 11238553 bytes, checksum: f8491c9a19a89be5cb23dc7a65a80003 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-12-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Atmospheric aerosols play an important role in human-induced climate change because of their effects on solar insolation and cloud processes. The direct and indirect effects of aerosols on Amazonian climate have been studied in recent years. The Amazonian forest is linked to the mechanisms that control atmospheric concentration of critical trace gases and particles, changing the physical chemical and biological properties of this environment. The natural biogenic sources emitted by vegetation are linked to the mechanisms of cloud microphysics and precipitation production, to the atmospheric radiation balance and to nutrient cycling, which in turn may affect important processes in the ecosystem. However, the sharp population growth of large urban centers in the Central Amazon has interfered with these mechanisms in a still unknown way. The understanding of these natural processes that regulate the atmospheric composition in Amazonia is an essential step for the establishment of a sustainable development strategy in the region. Here, we show for the first time the impact of urban emissions of the Manaus on the chemical and physical composition of natural aerosols in the Central Amazon. Using emission ratios of inert chemical species and a simulated set of air masses back-trajectories over the experimental sites, the chemical signature of the pollution plume was determined and thus the effects generated on the physico-chemical properties of aerosols, downwind of the city. An increase corresponding to 8 to 10 and 2 to 4 multiplicative factors in the total particle concentration (CN), black carbon (BC) and ozone (O3) when compared to natural forest conditions. On the average it was observed that the Manaus urban plume emission affects areas downwind with particle number usually above 3000-4000 cm-3 and BC concentrations often above 1000 ngm-3. The SO2 concentrations are in the range of 0.20-0.30 ppbv during the wet season, but can reach up to 0.60 ppbv in the dry season, contributing greatly to the fine fraction and greater increase scattering. A significant increase of around 40% in the concentration of organic aerosols (OA) attributed to the formation of secondary organic aerosol during transportation 4-6h between experimental sites was found. Also, a clear evolution in the distribution of particle size of ~ 50-100nm (Aitken to accumulation mode), and up to 30% reduction in the total concentration of aerosols (CN) was found, attributed here, especially to the formation of secondary organic aerosols (SOA), condensation of inorganic materials and of organic oxidation products. In addition to the changes in the chemical composition of natural aerosol of the pristine forest, various optical properties have also been changing with potential effects on the ecosystem. Absorption and scattering coefficients increased by multiplicative factors 3.0 and 1.8 in respect to the pristine forest conditions, respectively. The SSA, that is a key parameter in determining the climatic effects of aerosols, is strongly altered and reduced by about 10-15% under the direct influence of the city's emissions. The observed changes in the characteristics of the population of aerosols downwind the city (size distribution, quantity and chemical composition) may be changing significantly important properties of clouds, such as albedo and precipitation, thus contributing to impacts on the hydrological cycle and changes in radiative transfer rates, with consequences (indirect) still unknown for photosynthesis rates. / Aerossóis atmosféricos desempeham um papel importante na mudança climática induzida pelo homem, alterando os processos de transferência radiativa e de formação de nuvens. Os efeitos diretos e indiretos dos aerossóis atmosféricos no clima da Amazonia têm sido estudados intensivamente nos últimos anos. A floresta Amazônica interage intrinsecamente com a atmosfera absorvendo e emitindo gases e partículas e, assim, controlando as características físico-químicas e biológicas naturais do ecossistema. As emissões de partículas biogênicas são fundamentais para os mecanismos de produção de nuvens, balanço de radiação solar e ciclagem de nutrientes. No entanto, o crescimento acentuado de grandes núcleos urbanos na Amazônia Central tem interferido nestes mecanismos de forma ainda desconhecida. Entender os processos naturais e antrópicos que regulam a composição natural da atmosfera é fundamental para que se possam desenvolver estratégias de desenvolvimento sustentável na região. Aqui, mostram-se pela primeira vez os impactos das emissões urbanas da cidade de Manaus na composição química e física dos aerossóis naturais de floresta da Amazônia Central. Utilizando razões entre espécies químicas inertes e um conjunto de retro trajetórias de massas de ar simuladas entre os sítios experimentais, foi possível determinar a assinatura química da pluma de poluição e, com isso, os efeitos gerados sobre as propriedades físico-químicas dos aerossóis, vento abaixo da cidade. Foi observado um aumento, respectivo, de 8-10 e de 2-4 fatores multiplicativos na concentração total das partículas (CN), black carbon (BC) e Ozônio (O3), em relação às condições naturais da floresta. As emissões de Manaus afetam áreas, vento abaixo, com número de partículas normalmente acima de 3000-4000 cm-3 e concentrações de BC frequentemente acima de 1000 ng/m³ (em média). As concentrações de SO 2 são da ordem de 0,20-0,30 ppbv durante a estação chuvosa, mas podem chegar até 0,60 ppbv na estação seca, contribuindo fortemente para a fração fina de partículas mais espalhadoras. Um aumento importante de 40% na concentração de aerossóis orgânicos (OA) foi observado e atribuído à formação de aerossóis orgânicos secundários durante o transporte de 4-6h entre os sítios experimentais. Encontrou-se clara evolução na distribuição de tamanho das partículas entre ~ 50-100nm (moda de Aitken para acumulação), e redução de até 30% na concentração total dos aerossóis (CN), atribuídos aqui, principalmente à formação de aerossóis orgânicos secundários (SOA), condensação de materiais inorgânicos e produtos de oxidação de compostos orgânicos. Além das alterações na composição química do aerossol natural da floresta, várias propriedades óticas foram também alteradas, com potenciais efeitos para o ecossistema. Os coeficientes de absorção e espalhamento aumentaram por fatores multiplicativos de 3 e 1,8 em relação às condições limpas de floresta, respectivamente. O SSA, um dos principais parâmetros na determinação dos efeitos climáticos dos aerossóis, é alterado fortemente e diminui cerca de 10-15% sob a direta influência das emissões da cidade. As alterações observadas nas características da população de aerossóis, vento abaixo da cidade (distribuição de tamanho, quantidade e composição química), podem está alterando significativamente importantes propriedades das nuvens, como albedo e precipitação, contribuindo dessa forma para impactos no ciclo hidrológico e alterações nas taxas de transferência radiativa, com consequências (indiretas) ainda desconhecidas para as taxas de fotossíntese.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-08-24T14:23:48Z No. of bitstreams: 2 tese_final.pdf_cledenilson.pdf: 18209996 bytes, checksum: fa94e66d990e5575444b4cd9cce2a803 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-24T14:23:48Z (GMT). No. of bitstreams: 2 tese_final.pdf_cledenilson.pdf: 18209996 bytes, checksum: fa94e66d990e5575444b4cd9cce2a803 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-09-12 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / In this doctoral thesis is characterized and studies the forest-atmosphere interaction through nonlinear tools using data from micrometeorological towers and high-resolution environmental satellites images. We analyzed the forest-atmosphere interaction and characteristics of horizontal heterogeneity regarding the Amazonian experimental sites Sustainable Development Reserve Uatumã (1 56 'S 2 21' S and 59 16 'W 57 57' W) and the Biological Reserve in Jarú Rondônia (10 05 'S 10 19' S and 61 35 'W 61 57' W), which contain primary forest. We analyzed the average aspect vertical wind profile above and inside the canopy structure, such as analytical expressions for it, for example, a hyperbolic tangent function and its variant, considering also the variability of the inflection point of the height of the profile and its relation to the scale of the occurrence of coherent structures. We studied aspects of surface drag and consequences of its existence drains above dense forests. We have investigated the occurrence of gravity waves (GWs) above experimental site in central Amazonia, generated by the ground swell in the nocturnal boundary layer (NBL). We used the number of internal waves to classify Scorer forced by gravity or no topography. To this were certain characteristic scales of rolling terrain for various wind directions between wind north-east and south-east, which are prevalent in the region. Altimetric data were used with a resolution of 30 m, which provided information to detect the characteristic length scales of the terrain undulations in specific directions via multi-scale analysis using the Continuous Wavelet Transform with a Morlet wavelet analyzer. Were also used meteorological data measured in a tower 80 meters high (2 08 '40.0 "S 59 ° 00' 10.0" W) which lies approximately 130 meters above sea level, as part of German-Brazilian scientific project "ATTO" (Amazonian Tall Tower Observatorium) in experimental site of Sustainable Development Reserve Uatumã, northeast of Amazonas. The results showed that most of the GWs detected satisfied the criterion Steeneveld et al. (2009) to characterize waves induced Orografically. Those who did not meet this criterion were detected preferably in two arcs centered on meteorological tower, the first in which the wind direction was between 0° to 45°, and the second, with the wind direction between 120° and 180°. WGs events not forced by the topography are associated with the "Night Regime Turbulence 3" proposed by Sun et al. (2012), where the local effects do not predominate in the generation of turbulence, but effects associated with strong descending air movements and located in time (the top-down phenomena). As part of the characterization of horizontal heterogeneity of the land, we used high spatial resolution satellite imagery (IKONOS, 1 -4 m) to investigate aspects of variability in scale texture regions covered by the forest and deforested area in the Rebio- Jarú. We sought to determine the existence of possible variability patterns in the texture of vegetation cover for scale in both regions covered by forest, pasture, forestpasture, cultivated area and water bodies. The detection of texture characteristic scales was developed through directional study based on the application of Continuous Wavelet Transform Two-dimensional, using the Morlet wavelet function of analyzer. The Recurrence Analysis and its quantifiers was a method of analysis of nonlinear time series used to discriminate regions covered by forests of others with different land uses in the area located west of the Brazilian Amazon from a satellite image of high resolution . This was done as part of efforts to identify and characterize heterogeneity patterns of tropical forest and other areas with coverage in the Amazon region. The results suggest the existence of possible preferential axes of texture patterns in forested areas and specific standards for areas with different land cover and water bodies. In addition to these results and innovative methodologies, the conclusion of this study highlights the importance of adequately characterize the horizontal variability of the land and to investigate aspects of the relationship between this variability and the occurrence of specific physical phenomena in the atmospheric boundary layer. This type of research will point certainly innovative ways to identify the most appropriate parameterization of forest-atmosphere exchange processes in complex terrain. / Nesta tese de doutorado caracteriza-se e estuda-se a interação floresta-atmosfera por meio de ferramentas não-lineares utilizando dados de torres micrometeorológicas e de imagens de alta resolução de satélites ambientais. Foram analisadas a interação floresta-atmosfera e características da heterogeneidade horizontal referentes aos sítios experimentais amazônicos de Reserva de Desenvolvimento Sustentável de Uatumã (1º 56' S 2º 21' S e 59º 16' W 57º 57' W) e da Reserva Biológica do Jarú em Rondônia (10º 05' S 10º 19' S e 61º 35' W 61º 57' W), os quais contêm floresta primária. Foram analisados aspectos do perfil vertical do vento médio acima e no interior do dossel florestal, tais como expressões analíticas para ele, como, por exemplo, a função tangente hiperbólica e variante suas, considerando-se inclusive a variabilidade da altura do ponto de inflexão do perfil e sua relação com a escala de ocorrência de estruturas coerentes. Foram estudados aspectos do arrasto superficial e consequências de sua existência em escoamentos acima de florestas densas. Procurou-se investigar a ocorrência de ondas de gravidade (OGs) acima de sítio experimental na Amazônia central, geradas pela ondulação do terreno na camada limite noturna (CLN). Utilizouse o número de Scorer para classificar ondas internas de gravidade forçadas ou não pela orografia. Para isso foram determinadas escalas características das ondulações do terreno para várias direções do vento compreendidas entre vento de norte-leste e de leste-sul, que são predominantes na região. Foram utilizadas imagens altimétricas com resolução de 30 m, as quais forneceram informações para a detecção de escalas de comprimento características das ondulações do terreno em direções específicas, via análise multi-escala, utilizando-se a Transformada Wavelet Contínua, com uma wavelet analisadora de Morlet. Também foram utilizados dados meteorológicos medidos em uma torre de 80 m de altura (2º 08' 40,0" S 59° 00' 10,0" W) que se encontra aproximadamente a 130 m acima do nível do mar, como parte integrante do projeto científico teuto-brasileiro “ATTO” (Amazonian Tall Tower Observatorium), no sitio experimental da Reserva de Desenvolvimento Sustentável de Uatumã, a nordeste do Amazonas. Os resultados mostraram que a maior parte das OGs detectadas satisfizeram o critério de Steeneveld et al. (2009) para caracterização de ondas induzidas orograficamente. Aquelas que não satisfizeram tal critério foram as detectadas preferencialmente em dois arcos, centrados na torre meteorológica, o primeiro, em que a direção do vento esteve entre 0º a 45º, e o segundo, com a direção do vento entre 120º e 180º. Os eventos de OGs não forçadas pela orografia estão associados ao “Regime Noturno de Turbulência 3” proposto por Sun et al. (2012), em que os efeitos locais não predominam na geração de turbulência, mas efeitos associados a fortes movimentos descendentes de ar bem localizados no tempo (fenômenos do tipo top-down). Como parte da caracterização da heterogeneidade horizontal do terreno, utilizouse imagem de satélite de alta resolução espacial (IKONOS, 1 -4 m) para investigar aspectos da variabilidade em escala da textura de regiões cobertas pela por floresta e desmatadas em área da Rebio-Jarú. Procurou-se determinar a existência de possíveis padrões de variabilidade na textura da cobertura vegetal por escala em regiões tanto cobertas por floresta, pastagem, floresta-pastagem, área cultivada e corpos de água. A detecção de escalas características da textura foi desenvolvida por meio de estudo direcional baseado na aplicação da Transformada Wavelet Contínua Bidimensional, com a utilização da função wavelet analisadora de Morlet. A Análise de Recorrência e de seus quantificadores foi um método de análise de séries temporais não lineares utilizados para discriminar regiões cobertas por florestas de outras com distintos usos da terra em área situada a oeste da Amazônia brasileira a partir de uma imagem de satélite de alta resolução. Isso foi efetuado como parte dos esforços para identificar e caracterizar padrões de heterogeneidade da floresta tropical e de áreas com outras coberturas na região amazônica. Os resultados sugerem a existência de possíveis eixos preferenciais de padrões de textura em áreas cobertas por floresta e de padrões específicos para áreas com diferentes coberturas do solo e com corpos de água. Além desses resultados e metodologias inovadoras, a conclusão deste estudo destaca a importância de caracterizar adequadamente a variabilidade horizontal do terreno e de investigar aspectos da relação entre esta variabilidade e a manifestação de fenômenos físicos específicos na camada limite atmosférica. Tal tipo de investigação certamente apontará caminhos inovadores na busca de parametrizações mais adequadas dos processos de troca floresta-atmosfera em terrenos complexos.

Submitted by FERNANDA DA SILVA VON PORSTER (fdsvporster@univates.br) on 2015-04-28T19:18:12Z No. of bitstreams: 3 license_text: 22573 bytes, checksum: 52b1b0e0904a0f02da770d316346fc65 (MD5) license_rdf: 19874 bytes, checksum: 38cb62ef53e6f513db2fb7e337df6485 (MD5) 2014SamuelRenner.pdf: 1926865 bytes, checksum: b145097869ff708e628ea5a02e775acf (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Lisboa Monteiro (monteiro@univates.br) on 2015-05-04T14:48:24Z (GMT) No. of bitstreams: 3 license_text: 22573 bytes, checksum: 52b1b0e0904a0f02da770d316346fc65 (MD5) license_rdf: 19874 bytes, checksum: 38cb62ef53e6f513db2fb7e337df6485 (MD5) 2014SamuelRenner.pdf: 1926865 bytes, checksum: b145097869ff708e628ea5a02e775acf (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-04T14:48:24Z (GMT). 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No Estado do Rio Grande do Sul, o bioma Mata Atlântica ocupava as regiões mais altas e de encosta, cobrindo praticamente toda metade norte do estado. A FOM é caracterizada principalmente pela presença da Araucaria angustifolia (Bertol.) Kuntze (Araucariaceae). Atualmente os fragmentos remanescentes da FOM encontram-se dispersos em matriz de campo, agricultura ou áreas urbanas. Neste contexto o inventariamento de espécies desempenha um valioso papel na conservação destes remanescentes florestais. O presente trabalho foi desenvolvido em um grande fragmento de floresta, o qual contempla uma reserva ecológica: a Floresta Nacional de São Francisco de Paula/RS. Foi desenvolvido um inventariamento de espécies de Odonata, utilizando-se 30 pontos de amostragem, distribuídos entre quatro tipos de vegetação e três tipos de sistemas aquáticos. Foram registradas 47 espécies, distribuídas entre oito famílias. A composição da assembleia de Odonata foi comparada entre diferentes tipos de ambientes aquáticos: rios, lagos e banhados, e diferentes tipos de formações vegetais: mata nativa (FOM), araucária plantada, Pinus e campos. Foi encontrada maior riqueza de espécies em florestas de pinus, sendo esta composta principalmente por espécies generalistas. Foi utilizada e adaptada uma metodologia de seleção de espécies indicadoras de qualidade ambiental. Assim aprofundou-se o escasso conhecimento sobre esta ordem na Floresta Atlântica/FOM, gerando uma contribuição para medidas futuras de conservação e definição de áreas de proteção ambiental. / The human development brings several consequences to the environment, being the most remarkable the fragmentation of natural systems, resulting in ecological imbalance, biodiversity loss and degradation of the watershed. One of the richest biomes of this planet is the Atlantic Forest, which still poorly known in many animal groups, one example is the Odonata order. Actually this biome remains, under pressure in a fragmented mosaic. The forest formation occurring in the South of Brazil is the Mixed Ombrophilous Forest (MOF), a subtype of the Atlantic Forest. In the state of Rio Grande do Sul, this biome covered the high regions and the slopes of the Atlantic Ocean, occurring mostly in the northern half of the state. The MOF is remarkable by the presence of the Brazilian Pine (Araucaria angustifolia). Nowadays the remnants of the MOF are disperse in open fields, agriculture or urban matrix. In this context, the species inventory can play a key role in the conservation of these forest remnants. The present study was developed in a big forest fragment, in which exists an ecologic reserve: the Floresta Nacional de São Francisco de Paula, RS. The dragonfly species inventory was performed by sampling 30 aquatic sources distributed in four vegetation types and three types of aquatic systems. Were registered 47 species scattered in eight families. The Odonata assemblages found in all the types of water (rivers, lakes and swamps) and vegetation types (MOF, araucaria forest, pinus forest and open fields) were statistically compared. In the pinus areas was found the richest assemblage, being composed mainly by generalist species. Was applied and adapted a known methodology for the selection of potential indicator species. The poor knowledge of the Odonata order was improved in the Atlantic Forest/MOF, contributing for future conservation measures and definition of priority protection areas.

O uso do espaço é definido como a quantidade, a qualidade e a intensidade de exploração do habitat por um indivíduo, onde área e intensidade de uso, estratificação vertical e mobilidade são alguns dos atributos que podem ser avaliados. A Floresta Ombrófila Mista possui no seu elemento dominante, a araucária, uma das principais fontes de recurso (pinhão) para muitas espécies, inclusive os pequenos mamíferos. Entretanto, são poucas as informações sobre o uso do espaço pelos pequenos mamíferos nesse ambiente, assim como não há estudos que avaliem a relação entre a disponibilidade de alimento e os movimentos efetuados pelos animais. Os objetivos deste trabalho foram comparar os atributos área e intensidade de uso, estratificação vertical e mobilidade entre as espécies de pequenos mamíferos e avaliar como a disponibilidade de pinhões influencia estes atributos. A área de estudo foi a Floresta Nacional de São Francisco de Paula, onde foram demarcadas oito grades em áreas de floresta nativa, sendo que em quatro dessas grades foram removidos os pinhões (grades remoção) e nas outras quatro não (grades controle). Em cada uma das grades foram realizadas seis sessões de captura-marcação-recaptura de pequenos mamíferos, com cinco noites de duração, no período de março de 2010 a fevereiro de 2011. Akodon montensis e Delomys dorsalis foram as espécies mais capturadas no estudo. Os machos de ambas as espécies movimentaram-se por áreas e distâncias maiores que as fêmeas, indicando que seus movimentos possivelmente são mais influenciados pela atividade reprodutiva, enquanto que para as fêmeas a disponibilidade de alimento teria maior influência. Esse resultado se confirma no período de produção de pinhões, onde somente as fêmeas alteraram seus movimentos, utilizando áreas maiores nas grades remoção. Na estratificação vertical foi possível verificar diferentes espécies utilizando os estratos da vegetação, sendo que no período de maior abundância de indivíduos e escassez de recursos, os estratos foram explorados diferentemente. A disponibilidade de pinhões influenciou tanto os movimentos das fêmeas das espécies estudadas quanto a estratificação vertical, reforçando a importância deste recurso para estas espécies.

Made available in DSpace on 2018-08-01T23:27:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_10696_Divulgação de Defesa_Brenno.pdf: 355833 bytes, checksum: 118c350786e34e5b4f93e94da65717a5 (MD5) Previous issue date: 2017-02-23 / Neste trabalho é descrita, ilustrada e apresentada uma análise comparativa com uma espécie semelhante. Chrysophyllum pubipetalum uma nova espécie pertencente a família Sapotaceae. O Epíteto Específico ―pubipetalum‖ refere-se a tricomas pubescentes encontrados na face interna da corola. Até o momento, a espécie é conhecida apenas na localidade tipo, ocorrendo na Mata Atlântica (Floresta de Tabuleiro) no estado do Espírito Santo, Brasil.

O Rio Grande do Sul com a implantação de novas empresas da área florestal e aumento da produtividade das já estabelecidas tende a se tornar um importante pólo da produção de papel e celulose no Brasil. Como plantas de Eucalyptus spp. são a principal fonte para extração de celulose, o plantio de extensas áreas se faz necessário para suprimento de matéria-prima, portanto, a produção de mudas de qualidade é primaz. A produção de mudas de eucaliptos sofre perdas importantes devido ao ataque de microrganismos fitopatogênicos em condições de viveiro, sendo os mesmos controlados basicamente por meio de resistência genética e pelo uso de insumos químicos. Entretanto, não há produtos químicos registrados para a eucaliptocultura e, e alguns casos como o da bacteriose foliar causada por Xanthomonas sp., inexistem métodos efetivos de controle desta doença. Neste sentido, este trabalho visou o isolamento, a caracterização bioquímica e molecular, e a aplicação de bactérias endofíticas que atuem na redução de doenças nos viveiros de eucalipto e/ou estejam associados à promoção de crescimento vegetal, diminuindo assim os custos de produção e o impacto ambiental causado pelo uso de insumos químicos. Dos 28 isolados de bactérias endofíticas, oito mostraram-se promissores nos ensaios in vitro, e o isolado de Bacillus subtilis EUCB10 foi o mais efetivo nos ensaios de controle de doenças e promoção de crescimento nos ensaios in vivo, tanto no verão quanto no inverno. Alguns isolados de bactérias endofíticas de eucalipto foram produtores de enzimas extracelulares, metabólitos voláteis, HCN e AIA, além de serem capazes de solubilizar fosfato e fixar nitrogênio, sendo possível relacionar a produção de alguns metabólitos avaliados com os índices de biocontrole e promoção de crescimento in vivo. / The state of Rio Grande do Sul with the implantation of new enterprises in the forest area and with the increase of the productivity of those already established tends to become an important production polo of paper and cellulose. Since plants such as the Eucalyptus spp. are the main source of extraction of cellulose, the plantation of extensive areas is necessary for the supply of raw material, therefore the production of quality seedlings is foremost. The production of eucalyptus seedlings undergoes serious losses due to the attack of pathogens in nursery conditions, controlled basically through genetic resistance and through the use of chemical insumes. However, there is no registered chemical product for eucalyptus farming and in some cases such as the foliar bacteriosis caused by Xanthomonas sp. there is no effective control method of the disease. In that sense this work aimed at the isolation, the biochemical and molecular characterization and the application of endophytic bacteria that act in the reduction of diseases in the eucalyptus plant nursery and/or that are associated to the promotion of vegetable growth, thus decreasing the production costs and the environmental impact caused by the use of chemical insumes. Of the twenty-eight endophytic bacterial isolates eight showed to be promising in the in vitro assays and the Bacillus subtilis EUCB10 isolate was the most effective in the control assays of diseases and the growth production in the in vivo assays, not only in summer as well as in winter. Some eucalyptus endophytic bacterial isolates were extracellular enzyme producers, volatile metabolites, HCN and AIA, in addition to being capable of solubilizing phosphate and fixing nitrogen, being therefore possible to relate the production of some metabolites evaluated to biocontrol indexes and to the promotion of growth in vivo.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-11-13T19:06:27Z No. of bitstreams: 2 dissertacao_Guilherme_lobo_versao_final.pdf: 2388333 bytes, checksum: 181a5c1da0f382a01669569a1acc8202 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-13T19:06:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 dissertacao_Guilherme_lobo_versao_final.pdf: 2388333 bytes, checksum: 181a5c1da0f382a01669569a1acc8202 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-07-17 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The monomodal flood pulse of major Amazonian rivers is seasonal phenomenon that determines ecological and biogeochemical processes in adjacent floodplain forests. Changes in the flood pulse transform the pattern of hydrological variation and natural disturbances to which the native biota may be poorly adapted. Severe modifications of the hydrological regime can be observed downstream of hydroelectric power plants, where the flood pulse is driven by energy demands. In the black-water floodplain forests (igapó) associated with the Uatumã river (Central Amazonia), hydrological changes and alterations in ecological processes of the associated river were recorded after the installation of the Balbina hydroelectric power plant. In this study, floristic and forests structure of igapó forests at the regulated river (Uatumã) were compared to a pristine river (Abacate), evaluating its edaphic characteristics and inundation period. We sampled adjacent non-flooded upland forests to evaluate behavior in relation to igapó forests. A quantitative inventory of all trees diameter breast height (DBH) ≥ 5 cm was carried in low igapó, high igapó and adjacent upland forests, totaling 1,5 ha in each river. In both rivers, the low igapó forests showed low relative tree density with DBH < 10 cm and high tree density with DBH ≥ 25 cm. High igapó forests of the Uatumã river presented higher height average than the Abacate river’s equivalent portion, being the only structural characteristic difference between pristine and regulated rivers. When we analyzed the rivers together, phosphorus content was related to species diversity and flood was determinant for species composition, richness, species diversity and structure variables (DBH and basal area). In Uatumã river, phosphorus amount was correlated to DBH and tree density. Additionally, tree density was associated with soil pH and clay proportion in the regulated river. Abacate river’s species composition followed flood gradients. In the regulated river, the species composition of high igapó forest was similar to upland forest and dissimilar in species composition to the low igapó forest. The pattern observed was understood as reflecting the flood period intensification in the lower portion of igapó forest and the invasion into high igapó forest of species commonly described in upland forests. The study results emphasize the need to include downstream effects in environmental impacts studies and reports of hydroelectric power plants in the Amazon region. / As florestas alagáveis amazônicas são submetidas anualmente ao regime de cheia e vazante dos grandes rios, devido ao pulso de inundação monomodal, fenômeno sazonal que determina os processos ecológicos e biogeoquímicos em florestas alagáveis. Alterações no pulso de inundação transformam o padrão de variação hidrológica e de distúrbios naturais, criando condições às quais a biota nativa pode ser pouco adaptada. Severas modificações do regime hídrico podem ser observadas em zonas à jusante de Usinas Hidrelétricas (UHEs), onde o pulso de inundação é determinado pela demanda de geração de energia. Isso foi constatado para o regime hidrológico do rio Uatumã e os processos ecológicos das florestas de igapó associada após a construção UHE Balbina, Amazônia Central. O presente estudo procurou comparar a estrutura e composição florística da floresta de igapó situada em um rio regulado (Uatumã) com o afluente pristino (Abacate) e determinar a relação com características edáficas e duração de inundação. Foram amostradas as florestas de terra firme adjacentes para avaliar o comportamento em relação às florestas de igapó. Um inventário de todos os indivíduos (DAP) ≥ 5 cm foi realizado para o igapó baixo, igapó alto e terra firme adjacente, totalizando 1,5 ha em cada rio. Os estratos florestais de igapó baixo apresentaram baixa densidade relativa de indivíduos com DAP < 10 cm e alta densidade de indivíduos com DAP ≥ 25 cm. O igapó alto do rio Uatumã apresentou maior altura média que a porção equivalente do rio Abacate, sendo esta a principal característica estrutural diferencial entre o rio pristino e o rio regulado. Quando analisamos os rios em conjunto, os teores de fósforo foram relacionados à diversidade de espécies e a inundação foi determinante na composição florística, riqueza, diversidade de espécies e as variáveis estruturais (DAP e área basal). No rio Uatumã os teores de fósforo foram relacionados com DAP e densidade de indivíduos. No rio regulado, a densidade de indivíduos também foi relacionada com pH e proporção de argila do solo. No rio Abacate a composição florística seguiu o gradiente de inundação. A composição de espécies do igapó alto do rio regulado foi similar à terra firme adjacente e muito dissimilar ao igapó baixo. O padrão observado foi interpretado como reflexo da intensificação do período de inundação na porção mais baixa do igapó, e pela invasão de espécies comumente descritas em floresta de terra firme no igapó alto. Os resultados do estudo enfatizam a necessidade de incluir os efeitos a jusante de barragens nos estudos e relatórios de impactos ambientais de hidrelétricas na região amazônica.

Submitted by Inácio de Oliveira Lima Neto (inacio.neto@inpa.gov.br) on 2017-12-12T13:41:05Z No. of bitstreams: 2 LUIS OCTAVIO VIEIRA PEREIRA.pdf: 747868 bytes, checksum: a2f8af2f3d294db3ff1234201d7c1a8f (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-12T13:41:05Z (GMT). No. of bitstreams: 2 LUIS OCTAVIO VIEIRA PEREIRA.pdf: 747868 bytes, checksum: a2f8af2f3d294db3ff1234201d7c1a8f (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-07-08 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / According to recent estimates, one-fifth of Legal Amazon forest cover has been intensely altered, and although deforestation rates fluctuate, they have remained growing and consequently have promoted forest degradation. Species of the Fabaceae family have been indicated for the recovery of altered areas due to functional characteristics such as rusticity, biological nitrogen fixation, fast growing and great biomass production. An important fact is that only some of these species are able to fix atmospheric nitrogen, a feature that deserves attention given that in degraded tropical areas this element can become a limiting factor to plant establishment and growth. In this sense, we studied the interspecific differences in the mineral nitrogen partitioning, assimilation and allocation in six Fabaceae species cultivated on a degraded area where soil nutrient availability was increased by fertilizer application. In addition, intraspecific differences in nitrate and ammonium partitioning, assimilation and allocation were evaluated in A. mangium and D. odorata species cultivated with and without fertilization. The experiment was installed in an area around the Balbina Hydroelectric Power Plant (HPP - Balbina) in the municipality of Presidente Figueiredo, AM. Of all six evaluated species, three are able to perform biological nitrogen fixation (A. mangium, C. fairchildiana and I. edulis) while the other half (S. reticulata, D. odorata and C. tocantinum) are not. The variables analyzed were soil, root, leaf and sap NH 4 +, and NO 3 – contents; root and leaf nitrate reductase activity; nitrogen use efficiency, nodule production amount of leaf chloroplastidic pigments and soluble proteins. The strategies of partitioning and assimilation of mineral nitrogen varied specifically without grouping by functional traits. Protein content was higher in all noduliferous species. Nitrogen efficiency was correlated with photosynthetic capacity, but not with total leaf nitrogen content. C. fairchildiana species showed lower nodule production than the other noduliferous species. A. mangium cultivated with and without fertilizer application exhibited similar strategy of partitioning and assimilation of nitrate, although fertilization stimulated nodule production. D. odorata changed its nitrate assimilation strategy when fertilized and accumulated more nitrate in roots and leaves when it was not fertilized. / Estimativas recentes dão conta que um quinto da cobertura florestal da Amazônia Legal foi bastante alterada e apesar das taxas de desmatamento flutuarem elas têm se mantido crescentes e, por conseguinte, estimulam o crescimento das áreas degradadas. Espécies da família Fabaceae têm sido indicadas para recuperação de áreas alteradas devido a características funcionais como alta rusticidade, fixação de nitrogênio (N), rápido crescimento e grande produção de biomassa. Um fato importante é que somente algumas dessas espécies são capazes de fixar nitrogênio atmosférico, característica que merece destaque, uma vez que em áreas tropicais degradadas este elemento pode se tornar fator limitante para o estabelecimento e crescimento vegetal. Neste sentido, foram estudadas as diferenças interespecíficas no particionamento, assimilação e alocação de nitrogênio mineral de seis espécies da família Fabaceae (C. fairchildiana, A. mangium, C. tocantinum, S. reticulata, D. odorata e I. edulis) cultivadas em área degradada cuja disponibilidade de nutrientes no solo foi elevada via fertilização mineral. Além disso, avaliaram- se diferenças intraespecíficas no particionamento, assimilação e alocação de nitrato e amônio nas espécies A. mangium e D. odorata quando cultivadas com e sem fertilização. O experimento foi instalado em área da Usina Hidrelétrica Balbina (UHE – Balbina) no município de Presidente Figueiredo, AM. Das seis espécies estudadas três são capazes de fixar N; A. mangium, C. fairchildiana e I. edulis; enquanto a outra metade; S. reticulata, D. odorata e C. tocantinum; não fixam. As variáveis analisadas foram NH 4+ e NO 3- no solo, na raiz, na folha e na seiva, atividade radicular e foliar da redutase do nitrato, eficiência no uso do nitrogênio, produção de nódulos, teores de pigmentos cloroplastídicos foliares e proteínas solúveis. As estratégias de particionamento e assimilação de nitrogênio mineral variaram especificamente sem separação por grupo funcional. O teor de proteínas foi maior em todas as espécies nodulíferas. A eficiência no uso de nitrogênio foi correlacionada à capacidade fotossintética, mas não ao teor total de nitrogênio foliar. A espécie C. fairchildiana apresentou produção de nódulos inferior às demais espécies nodulíferas. A espécie A. mangium exibiu estratégia similar de particionamento e assimilação de nitrato quando cultivada com e sem aplicação de fertilizantes, embora a fertilização tenha estimulado a produção de nódulos. A espécie D. odorata variou sua estratégia de assimilação nitrato quando fertilizada e acumulou mais nitrato nas raízes e folhas quando não fertilizada.

Submitted by Inácio de Oliveira Lima Neto (inacio.neto@inpa.gov.br) on 2018-01-23T13:12:30Z No. of bitstreams: 2 Anelena Lima de Carvalho.pdf: 2021200 bytes, checksum: 0d602f9d5ed3f0c9325fa642b77f2a23 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-23T13:12:30Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Anelena Lima de Carvalho.pdf: 2021200 bytes, checksum: 0d602f9d5ed3f0c9325fa642b77f2a23 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-08-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Although sustainable forest management has become a consensus in recent years, many issues regarding its sustainability are still present. Forest management can generate short-term and long-term effects, ranging from changes in forest microclimate, soil compaction and erosion to changes in floristic composition. On the other hand, areas impacted by logging can be an important microsite for shade-intolerant, commercially valuable, species. To better understand how the forest responds to this activity, the present study aimed to evaluate logging effects on the natural regeneration of tree species considering different levels of disturbance along a chronosequence of areas logged in the Antimary State Forest, in the state of Acre - Brazil. Natural regeneration was evaluated through plots established in Annual Production Unit (APU), one, four and eight years since logging, considering the different levels of impacts generated by this activity, where natural regeneration comprised all tree individuals with a minimum height of 50 cm and 10 cm of diameter at breast height (DBH). Areas not directly affected by logging were used as controls. Canopy opening data and soil data were also collected obtained for the analysis of light availability and soil physical characteristics. The areas disturbed by logging and the frequency and distribution of gaps were quantified using LiDAR data. No significant differences were observed regarding total natural regeneration density at different disturbance levels for all analyzed ages (p ≥ 0.08). Pioneer species displayed a high relative density in environments with high disturbance levels, for all analyzed years (p < 0.001). The floristic composition in areas one year since logging was different from forest areas not directly affected by this activity (p = 0.022). Eight years after logging, species diversity differed only in environments with high disturbance (p = 0.00). Three years after logging, the mortality rate was higher in environments displaying a high level of disturbance (p < 0.001), which was also observed for growth rates (p < 0.001). However, no significant differences were observed in recruitment rates in areas displaying different levels of disturbance (p > 0.46). Four years after logging, the canopy openness did not exceed 10% and the areas did not present significant differences (p ≥ 0,69). Although differences in soil bulk density were observed in the early years, these differences disappeared since eight years of logging (p > 0.50). The area percentages directly affected by logging ranged from 7.0 to 8.6%, while felling gaps represented the highest percentage of disturbance (3.0 - 3.7%). No significant differences in the frequency and distribution of gaps before and after logging (p = 0.25) and among APU (p = 0.25) were observed. Results indicate that the disturbances produced by logging were temporary, and that, after eight years, a good part of the evaluated characteristics, such as seedling density, floristic composition, soil physical conditions and canopy opening, returned to their previous stage. / Embora nos últimos anos o manejo florestal sustentável venha se tornando um consenso ainda existem muitos questionamentos sobre a sua sustentabilidade. O manejo florestal pode gerar efeitos de curto e longo prazo que vão desde mudanças no microclima da floresta, compactação do solo e erosão até mudanças na composição florística. Mas por outro lado as áreas perturbadas pela exploração florestal podem ser um importante microsítio para espécies de valor comercial intolerantes à sombra. Para entender melhor como a floresta responde a esta atividade este estudo teve como objetivo a avaliar os efeitos da exploração florestal na regeneração natural de espécies arbóreas considerando diferentes níveis de perturbação ao longo de uma cronossequência de áreas exploradas na Floresta Estadual Antimary, Estado do Acre - Brasil. A regeneração natural foi estudada por meio de parcelas estabelecidas em Unidades de Produção Anual (UPA) com um, quatro e oito anos de exploração florestal considerando os diferentes níveis de impactos gerados pela exploração florestal. Onde foi considerada regeneração natural todos os indivíduos arbóreos com altura mínima de 50 cm até 10 cm de diâmetro a altura do peito (DAP). Todos os indivíduos dentro destes critérios foram marcados, identificados e medidos. Áreas não afetadas diretamente pela exploração florestal foram utilizadas como controle. Foram também coletados dados de abertura do dossel e amostras de solos para análises de características física dos solos. Quantificamos a área perturbada pela exploração florestal e a frequência e distribuição de clareiras utilizando dados LiDAR. A densidade da regeneração natural não variou entre os diferentes níveis de perturbação (p ≥ 0,08). As espécies pioneiras apresentaram uma densidade relativa alta nos ambientes com alta perturbação para todos os anos analisados (p < 0,001). Apenas as áreas com ano apresentaram diferenças significativas na diversidade florística para todos os níveis de perturbação (p=0,022). Oito anos após a exploração a diversidade foi menor apenas nos ambientes com alta perturbação (p < 0,001). As taxas de mortalidade e crescimento foram elevadas nos ambientes com nível de perturbação alta três anos após a exploração (p ≤ 0,001). Enquanto as taxas de recrutamento não variaram (p > 0,46). Após quatro anos da exploração a abertura do dossel não ultrapassou 10% e as áreas não apresentam diferenças significativas (p ≥ 0,69). Embora tenham sido observadas diferenças na densidade aparente do solo nos anos iniciais essas diferenças não estavam presentes oito anos após exploração (p > 0,50). O percentual de área diretamente afetada pela exploração florestal variou de 7.0 a 8.6% onde as clareiras das árvores abatidas representam o maior percentual de perturbação (3,0 – 3,7 %). Não foram encontradas diferenças significativas na frequência e distribuição de clareiras antes e depois da exploração (p = 0,25) e entre UPA (p = 0,25). Os resultados demostraram que os distúrbios produzidos pela exploração florestal foram temporários, onde depois de oito anos boa parte das características avaliadas, como densidade de plântulas, composição florística, condições físicas do solo e abertura do dossel, retornaram ao estado anterior.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2018-02-28T13:13:06Z No. of bitstreams: 2 Tese _Final_Corrigida_CFT_Dirceu Miranda_2017.pdf: 2816894 bytes, checksum: af62272f75b9b96c6d5c48c074e558cf (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-28T13:13:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese _Final_Corrigida_CFT_Dirceu Miranda_2017.pdf: 2816894 bytes, checksum: af62272f75b9b96c6d5c48c074e558cf (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-09-12 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Many forests in southern Amazonia are reaching the second cycle of cutting (CC), which raises concerns about these forest’s sustainability. Current forest management criteria may not be suitable primarily for these forests and lead on to an over or under exploitation of timber resources. Allied to this, it is not known if the impact of the forest management would trigger radial variations in the anatomy of the logged trees and influence the quality of the wood extracted in these forests. In this study, the performed analyzes were concentrated in two species: Qualea paraensis Duke and Parkia pendula (Willd.) Benth. Ex Walp. All samples analyzed come from tree trunk discs, destructively collected in a tropical moist terrafirme forest managed in southern Amazonia. In chapter 1, an annual periodicity of rings growth was investigated, in addition to describing their growth and estimating the minimum logging diameter (MLD) and the CC for such species. For this purpose, techiniques of dendrochronological and radiocarbon analyzes were combined and equation adjustments were used to estimate MLD and CC. In both species the rings were considered anual and are delimited by density difference in Q. paraensis and by marginal parenchyma band and fibrous zone in P. pendula. However, without radiocarbon analysis, it was observed that approximately 10% errors can occur in the delineation and ring count in P. pendula. The mean growth was 0.93 cm.year-1 ± 0.201 in Q. paraensis and 0.63 cm.year-1 ± 0.221 in P. pendula. It can be affirmed that the area’s logging history promoted an increase in the growth rate only in Q. paraensis. The MLD estimative was 53 cm in Q. paraensis and 42 cm in P. pendula with 11 and 17 years of CC, respectively. In chapter 2, it was analyzed the variations in density and in the cellular dimensions of fibers and vessels in the medulla-cambial direction and an influence of the forest management on the variations of Q. paraensis and P. pendula wood. The disks were prepared for an annual identification of the growth rings and removal of 10 predefined samples along the radius for fiber and vessel measurement. The density was obtained by x-ray densitometry. Graphical and comparative analyzes were performed between samples in different radial positions. X-ray densitometry detected variations in density due to forest management in Q. paraensis and in juvenile wood it was up to 8 cm of radius in P. pendula. There was an increase in vessel diameter and a decrease in vessel frequency in Q. paraensis. In addition to the vessel diameter, in P. pendula there was a lengh and thickeness increase of the fibers’ wall and a decrease in the total thickness of the fibers. The influence of forest management was more evident in the area occupied by vessels due to the increase in vessel diameter and / or vessel frequency. The results presented in this thesis allow to conclude: i) the criteria of forest management in Brazil do not apply to the studied species; ii) errors in growth ring analysis may occur when no radiocarbon dating is applied; iii) the studied species of logged wood have important radial variations in the anatomical elements, especially due to this practice of forest management, which could alter the quality of the logged wood from these forests. / Muitas florestas no sul da Amazônia estão entrando em um segundo ciclo de corte (CC), o que traz preocupações quanto à sustentabilidade dessas florestas. Os critérios atuais do manejo florestal podem não ser adequados principalmente a essas florestas e ocasionar uma super ou sub exploração dos recursos madeireiros. Aliado a isso, não se sabe se o impacto do manejo na floresta poderia desencadear variações radiais na anatomia do lenho das árvores e influenciar a qualidade da madeira extraída nessas florestas. Neste estudo, as análises envolvidas foram concentradas em duas espécies: Qualea paraensis Duke e Parkia pendula (Willd.) Benth. ex Walp. As amostras para todas as análises provieram de discos dos troncos das árvores coletados de forma destrutiva, em uma floresta tropical úmida de terra firme manejada no sul da Amazônia. No capítulo 1 , foi investigada a periodicidade anual dos anéis de crescimento, além de descrever os seus incrementos e estimar o diâmetro mínimo de corte (DMC) e o CC dessas espécies. Para esse propósito foram utilizadas combinações de técnicas dendrocronológicas com análises de radiocarbono e ajustes de equação para estimar o DMC e CC. Nas duas espécies os anéis foram considerados anuais e são delimitados por diferença de densidade em Q. paraensis e por faixa de parênquima marginal e zona fibrosa em P. pendula. No entanto, sem as análises de radiocarbono, constatou-se que podem ocorrer erros de aproximadamente 10% na delimitação e contagem de anéis em P. pendula. O incremento médio foi 0,93 cm.ano-1 ± 0,201 em Q. paraensis e 0,63 cm.ano-1 ± 0,221 em P. pendula. Pode-se afirmar que o histórico de exploração da floresta promoveu aumento no ritmo de crescimento apenas em Q. paraensis. A estimativa do DMC foi 53 cm em Q. paraensis e 42 cm em P. pendula com CC de 11 e 17 anos respectivamente. No capítulo 2, foram analisadas as variações da densidade e as dimensões celulares de fibras e vasos na direção medula-câmbio e a influência do manejo florestal nessas variações. Os discos foram preparados para a marcação anual dos anéis de crescimento e remoção de 10 amostras pré-definidas ao longo do raio para mensuração das fibras e vasos. A densidade foi obtida por densitometria de raios-x. Foram realizadas análises gráficas e comparativas entre as amostras nas diferentes posições radiais. Os resultados da densitometria de raios-x detectaram variações na densidade decorrente do manejo florestal em Q. paraensis e um lenho juvenil até 8 cm de raio em P. pendula. Houve aumento nas dimensões do diâmetro de vaso e diminuição na frequência dos vasos em Q. paraensis. Além do diâmetro de vaso, em P. pendula houve aumento do comprimento e da espessura da parede das fibras e diminuição da espessura total das fibras. A influência do manejo florestal foi mais evidente na área ocupada por vasos devido ao aumento nas dimensões do diâmetro de vaso e/ou frequência de vasos. Os resultados apresentados nesta tese permitem concluir: i) os critérios de manejo florestal no Brasil não se aplicam as espécies estudadas; ii) podem ocorrer erros na análises dos anéis de crescimento quando não são aplicadas datações com radiocarbono; iii) a madeira das espécies estudadas possui importantes variações radiais nos elementos anatômicos, inclusive devido a prática do manejo florestal as quais poderiam alterar a qualidade da madeira explorada dessas florestas.