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Impacto da candidemia na evolução clinica de pacientes pediátricos de um hospital terciário de ensino / Impact of candidemia in patients clinic evoluation in a tertiary teaching hospitalBraga, Monica Santos [UNIFESP] January 2006 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2006 / Objetivos: Identificar a incidencia de candidemia hospitalar entre a populacao pediatrica e avaliar os fatores associados a mortalidade. Metodos: Estudo tipo coorte retrospectivo para avaliar criancas de O a 17 anos com candidemia atendidas nas unidades pediatricas no Hospital São Paulo (HSP) ¬Universidade Federal de São Paulo - entre novembro de 1994 e outubro de 2002. A selecao dos pacientes foi feita atraves dos registros de todos os casos de candidemia ocorridos no periodo do estudo. O estudo foi dividido em duas analises: Analise 1 ¬comparar as variaveis associadas a mortalidade entre os pacientes que tiveram alta hospitalar e os que morreram; Analise 2 - Comparar as variaveis relacionadas a mortalidade entre os pacientes que morreram em ate sete dias apos o episodio de candidemia e os que sobreviveram. Todas as hemoculturas foram coletadas com tecnica asseptica e encaminhadas ao laboratorio central do HSP para identificacao do agente e da especie, posteriormente as amostras foram encaminhadas ao Laboratorio Especial de Micologia (LEMI) para confirmacao da especie. As informacoes clinicas e epidemiologicas foram obtidas pela revisao de prontuarios e preenchimento de ficha clinica padrao. Resultados: Avaliamos 92 pacientes com candidemia. A taxa de incidencia foi de 2,8 casos por 1.000 admissoes ou de 0,36 casos por 1.000 pacientes-dia. Quanto a idade, 13 pacientes (14 por cento) eram recem-nascidos, 46 (50 por cento) tinham entre um mes e dois anos e 33 (36 por cento) entre dois e 17 anos. A Candida albicans foi responsavel por 50 por cento (n= 46) das especies isoladas e outros 50 por cento foi de especies nao-albicans, sendo: C. parapsilosis (26,1 por cento), C. tropicalis (16,3 por cento), C. guilliermondii (3,3 por cento), C. glabrata (2,2 por cento) e C. krusei (2,2 por cento). Trinta e seis pacientes (39 por cento) estavam internados em enfermaria de clinica medica, 14 (15,2 por cento) em unidades de terapia intensiva, 14 (15,2 por cento) em unidade hemato-oncologica e 28 (30,6 por cento) em diferentes unidades hospitalares. A Anfotericina B foi utilizada em todos os 70 pacientes que receberam tratamento. O tempo de permanencia dos pacientes no hospital foi em media de 70 dias (min= 2; max.= 184; mediana=43). A taxa de mortalidade geral foi de 46,7 por cento e a mortalidade no periodo de ate sete dias apos o episodio de candidemia foi de 18,4 por cento. Na Analise 1 os fatores significativos associados a mortalidade foram a manutencao do cateter venoso central (OR= 11,46; IC 95 por cento = 3,18- 41,26) e o uso de antagonista de H2 (OR =2,64¬IC95 por cento = 1,00-7,01). Na analise 2 o tratamento da candidemia apareceu como fator protetor (OR= 0,28 - IC95 por cento= 0,09 -0,89). Conclusoes: A mortalidade por candidemia entre as criancas foi elevada, mostrando que as medidas preventivas, como a retirada do cateter venoso central na vigencia da candidemia, devem ser adotas. A realizacao do tratamento da candidemia precocemente e fundamental para aumentar as chances de sobrevivencia das criancas. / Objectives: The objective of this study was to determine the incidence of hospital candidemia among the pediatric population and to investigate factors related to mortality rates. Methods: Retrospective cohort study of children between 0 and 17 years old with candidemia, attending the pediatric units of Hospital São Paulo (HSP) – Universidade Federal de São Paulo between November 1994 and October 2002. Patients were selected from records that included all cases of candidemia during that period. The study was divided two types of analyses: Analysis 1 – comparison of variables associate to mortality among patients who were discharged or died; Analysis 2 – comparison of variables related to mortality among patients who died within seven days after the candidemia episode and those who survived. Blood for hemocultures was aseptically collected and sent to the HSP central laboratory for identification of the type and species of microorganism. Samples were then sent to the Laboratório Especial de Micologia (LEMI) for confirmation of the species. Clinical and epidemiological information was obtained through medical records and filling of standard clinical forms. Results: A total of 92 candidemia patients were evaluated. The incidence rate was 2.8 cases in 1,000 admission, or 0.36 cases/1,000 patients/day. Thirteen (14%) of the patients were newborns, 46 (50%) were between one month and 2 years old, and 33 (36%) were between 2 and 17 years old. Candida albicans was identified in 50% (n=46) of the cases, and the remaining non-albicans cases included C. parapsilosis (26.1%), C. tropicalis (16.3%), C. guilliermondii (3.3%), C. glabrata (2.2%) and C. krusei (2.2%). Thirty-six patients (39% of the sample) had been admitted to a medical clinics unit, 14 (15,2%) to intensive care units, 14 (15.2%) to a hemato-oncologic unit and 28 to others units. Amphotericin B was administered to all 70 patients receiving treatment. Patients were hospitalized in average for 70 days (range 2 to 184 days, median 43 days). The overall mortality rate was 46.7%, and mortality during the first 7 days after the candidemia episode was 18.4%. Factors significantly associated to mortality in Analysis 1 were maintenance of a central venous catheter (OR= 11.46; 95%CI = 3.18-41.26) and the use of a H2 antagonist (OR =2.64; 95%CI = 1.00-7.01). Treatment of candidemia was shown as a protective factor in Analysis 2 (OR= 0.28; 95%CI = 0.09-0.89). 68 Conclusions: The mortality rate due to candidemia was high among the children, indicating that preventive measures, such as removal of the central venous catheter when candidemia is detected, should be taken. The early treatment of candidemia is of fundamental importance to increase survival rates among the affected children. / BV UNIFESP: Teses e dissertações
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Análise proteômica de paracoccidioides sp. isolado de um caso de fungemia / Proteomics analysis of paracoccidioides sp. isolated from a case of fungemiaMartins, Paulo Henrique Rosa 20 March 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014-03-20 / Paracoccidioides spp. are pathogens of Paracoccidioidomycosis a systemic mycosis that affects about 10 million people in endemic regions. The incidence of the disease is restricted to Latin America and most cases are found in Brazil. The disease is characterized by chronic granulomatous inflammation, and patients may present with a wide spectrum of clinical manifestations. After inhalation of conidia, the installation of fungus in the lungs, which subsequently through hematogenous route may cause an infection spreads. Hematogenous fungal infections represent a serious health problem, involving hospitalized patients with predisposing conditions that lead to a high mortality rate. Fungemia corresponds to isolation of fungi in the bloodstream and occurs mainly in immunocompromised patients. Yeasts have been increasingly present as etiological agents fungemia including Candida albicans and other species such as Candida non- albicans. In this study, Paracoccidioides spp. was isolated from a case of fungemia. So far this is the first molecular study of a case of fungemia caused by this fungus. In order to identify the molecular factors associated with this specific phenotype, a comparative proteomic analysis was performed. The samples were analyzed by nanoscale liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry (nanoUPLC - EPM), where the soluble proteins of fungemia were compared with strain Pb01 -like proteins. 206 proteins regulated positively and negatively regulated 183 were identified. Among the positively regulated protein, 22 % were related to cellular metabolism, 15 % related to protein synthesis and 12% energy. Of phenotypic characterization tests, which showed a better adaptation of isolated Pb9840 blood were also conducted. With this work we propose that the isolated Pb9840 developed mechanisms to better installing the bloodstream and causing the fungemia. The study of the proteomic profile of this isolate may elucidate the virulence mechanisms used by this fungus during fungemia and / or hematogenous spread. / Paracoccidioides spp. são agentes etiológicos da Paracoccidioidomicose uma micose sistêmica que afeta cerca de 10 milhões de pessoas nas regiões endêmicas. A incidência da doença é restrita à América Latina e a maioria dos casos são encontrados no Brasil. A doença é caracterizada por uma inflamação granulomatosa crônica, e os pacientes podem apresentar um amplo espectro de manifestações clínicas. Após a inalação de conídios, ocorre a instalação do fungo nos pulmões, que posteriormente através de rota hematogenica pode causar uma infecção disseminada. Infecções fúngicas hematogênicas representam um grave problema de saúde, envolvendo pacientes hospitalizados com condições predisponentes que levam a uma alta taxa de mortalidade. Fungemia corresponde ao isolamento de fungos na corrente sanguínea e ocorre principalmente em pacientes imunossuprimidos. As leveduras têm sido cada vez mais presente como agentes etiológicos de fungemia, incluindo Candida albicans e outras espécies, como Candida não-albicans. No presente estudo, Paracoccidioides spp. foi isolado de um caso de fungemia. Até o momento esse é o primeiro estudo molecular de um caso de fungemia causado por este fungo. A fim de identificar os fatores moleculares associados a este fenótipo específico, uma análise proteômica comparativa foi realizada. As amostras foram analisadas por cromatografia líquida de nanoescala acoplada a espectrometria de massa em tandem (nanoUPLC - EPM), onde as proteínas solúveis da estirpe fungemia foram comparadas com proteínas do Pb01. Foram identificadas 206 proteinas reguladas positivamente e 183 reguladas negativamente. Dentre as proteínas reguladas positivamente 22% estavam relacionadas com o metabolismo celular, 15% relacionadas com síntese proteica e 12% produção de energia. Foram realizados também testes de caracterização fenotípica, que demonstraram uma melhor adaptação do isolado Pb9840 ao sangue. Com o presente trabalho podemos propor que o isolado Pb9840 desenvolveu mecanismos para melhor de instalar na corrente sanguínea e assim causar o quadro de fungemia. O estudo do perfil proteômico deste isolado poderá elucidar os mecanismos de virulência utilizados por este fungo durante fungemia e / ou disseminação hematogênica.
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Candidemias Nosocomiales: Patrones de cambio clínico-epidemiológicos, factores pronóstico e influencia del tratamiento antifúngico precoz en su evolución. Estudio 2002-2005Espinosa Sierra, Cristina 16 July 2008 (has links)
Estudio descriptivo y comparativo de los cambios clínico-epidemiológicos de las Candidemias Nosocomiales en un hospital universitario, análisis de los factores pronóstico asociados a mayor mortalidad y la influencia del tratamiento precoz y adecuado junto con la retirada precoz del catéter en su evolución.Estudio transversal y observacional de pacientes adultos que desarrollaron CN durante su ingreso en el Hospital (enero-2002 a mayo- 2005). Se revisaron las historias clínicas de pacientes con hemocultivos positivos para Candida sp.El análisis comparativo se realizó con un grupo histórico (1993-8).Los resultados se derivan del estudio estadístico clínico-epidemiológico, patrones de cambio, factores pronóstico asociados a mortalidad y protectores de mortalidad.Conclusiones: La mortalidad (50%) no ha variado en los últimos años. C.no albicans predomina sobre C. albicans.Los principales factores pronóstico asociados a mayor mortalidad son: La situación de gravedad crítica inicial, el tratamiento antifúngico tardío y la no retirada precoz del catéter vascular. / Observational study of a group of adult patients with Nosocomial Candidemia (NC) admitted at a university hospital (january 2002 to may 2005). We analised epidemiological, clinical, microbiological and laboratory data and changes respesct to other historical group (1993-1998).Conclusions: Acute severity od illness at onset is associated to mortality in patients with NC whereas early and adequate treatment and early removing of central venous catheter are asociated to cur
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Avaliação clínica da fungemia detectada pelo sistema de hemocultivo por lise-centrifugação (Isolator). Treze anos de experiência, 1994-2007Oliveira, Flávio de Mattos January 2007 (has links)
Foram incluídos no estudo 525 casos de fungemia causadas por Candida spp, Cryptocossus spp, Trichosporon spp, Rhodotorula spp, Histoplasma capsulatum, Saccharomyces cerevisiae e Pseudozyma aphidis, que constam nos arquivos do Laboratório de Micologia, Santa Casa-Complexo Hospitalar, Porto Alegre (RS) num período de 13 anos (1994-2007). Aspectos demográficos, doenças de base e fatores associadas aos episódios de fungemia foram estudados. Assim como, os agentes etiológicos e a mortalidade global entre os pacientes com fungemia. Os 525 casos foram classificados da seguinte maneira: candidemia (413/78,6%), subdivididos em: Candida albicans (151/36,5%), C. parapsilosis (91/22%), C. tropicalis (65/15,7%), C. glabrata (27/6,5%), C. pelliculosa (18/4,3%), C. guilliermondii (18/4,3%), C. humicola (7/1,7%), C. krusei (7/1,7%), C. famata (5/1,2%), C. lusitaniae (4/0,9%), C. sake (4/0,9%), C. lipolytica (3/0,7%), C. globosa (3/0,7%), C. intermedia (2/0,5%), C. kefyr (1/0,24%), C. colliculosa (1/0,24%) e Candida sp (8/1,9%); criptocococemia (77/14,6%), subdivididos em: Cryptococcus neoformans (72/93,5%), C. gattii (3/3,9%), C. laurentii (1/1,3%), Cryptococcus sp (1/1,3%); Histoplasma capsulatum (21/4%);Trichosporon spp (9/1,5%) subdivididos em: T. asahii (8/89%), T. mucoides (1/11%); Rhodotorula spp (5/0,9%) subdivididos, Rhodotorula sp (4/80%), R. mucilaginosa (1/20%); Saccharomyces cerevisiae (1/0,2%); Pseudozyma aphidis (1/0,2%)O sexo masculino foi o mais prevalente (288/55%), porém sem significância estatística, a idade variou de 12 dias à 97 anos, com uma mediana de 39,64 anos. A mortalidade nestes pacientes variou entre 22% e 52%. As doenças de base mais frequente foram câncer e Aids. Febre foi o sinal mais frequente. x Neste contexto, a fungemia deve ser incluída no diagnóstico diferencial destes pacientes com febre de origem desconhecida e prolongada. Utilizando-se de técnicas laboratoriais específicas para o diagnóstico etiológico. / We reviewd 525 cases of fungemia caused by Candida spp, Cryptocossus spp, Trichosporon spp, Rhodotorula spp, Histoplasma capsulatum, Saccharomyces cerevisiae and Pseudozyma aphidis. They have all been part of the files of the Mycology Laboratory at Santa Casa Hospital Complex in Porto Alegre (RS), during a thirteen-year period (1994 - 2007). Demographic aspects, underlying diseases and factors associated with the fungemia episodes were studied, as well as the etiologic agents and the global mortality among the patients having fungemia. The 525 cases included in the study were classified according to the following: candidemia (413/78,6%), subdivided in: Candida albicans (151/36,5%), C. parapsilosis (91/22%), C. tropicalis (65/15,7%), C glabrata (27/6,5%), C. pelliculosa (18/4,3%), C.guilliermondii (18/4,3%), C. humicola (7/1,7%), C. krusei (7/1,7%), C. famata (5/1,2%), C. lusitaniae (4/0,9%), C. sake (4/0,9%), C. lipolytica (3/0,7%), C. globosa (3/0,7%), C. intermedia (2/0,5%), C. kefyr (1/0,24%), C. colliculosa (1/0,24%) e Candida sp (8/1,9%); criptocococemia (77/14,6%), subdivided in: Cryptococcus neoformans (72/93,5%), C. gattii (3/3,9%), C. laurentii (1/1,3%), Cryptococcus sp (1/1,3%); Histoplasma capsulatum (21/4%);Trichosporon spp (9/1,5%) subdivided in: T. asahii (8/89%), T. mucoides (1/11%); Rhodotorula spp (5/0,9%) subdivided, Rhodotorula sp (4/80%), R. mucilaginosa (1/20%); Saccharomyces cerevisiae (1/0,2%); Pseudozyma aphidis (1/0,2%) The male gender was the most prevalent (288/55%), although no significance difference was observed. The age ranged from 12 days to 97 years old, with an average of 39,64 years. The mortality among these patients ranged between 22% and 52%. The most frequent underlying diseases were cancer and Aids. Fever was the most frequent sign. xii Within this context, fungemia must be included in the differential diagnosis of these patients presenting long-term fever with unknown cause. Making use of specific laboratorial techniques for the etiologic diagnosis.
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Avaliação clínica da fungemia detectada pelo sistema de hemocultivo por lise-centrifugação (Isolator). Treze anos de experiência, 1994-2007Oliveira, Flávio de Mattos January 2007 (has links)
Foram incluídos no estudo 525 casos de fungemia causadas por Candida spp, Cryptocossus spp, Trichosporon spp, Rhodotorula spp, Histoplasma capsulatum, Saccharomyces cerevisiae e Pseudozyma aphidis, que constam nos arquivos do Laboratório de Micologia, Santa Casa-Complexo Hospitalar, Porto Alegre (RS) num período de 13 anos (1994-2007). Aspectos demográficos, doenças de base e fatores associadas aos episódios de fungemia foram estudados. Assim como, os agentes etiológicos e a mortalidade global entre os pacientes com fungemia. Os 525 casos foram classificados da seguinte maneira: candidemia (413/78,6%), subdivididos em: Candida albicans (151/36,5%), C. parapsilosis (91/22%), C. tropicalis (65/15,7%), C. glabrata (27/6,5%), C. pelliculosa (18/4,3%), C. guilliermondii (18/4,3%), C. humicola (7/1,7%), C. krusei (7/1,7%), C. famata (5/1,2%), C. lusitaniae (4/0,9%), C. sake (4/0,9%), C. lipolytica (3/0,7%), C. globosa (3/0,7%), C. intermedia (2/0,5%), C. kefyr (1/0,24%), C. colliculosa (1/0,24%) e Candida sp (8/1,9%); criptocococemia (77/14,6%), subdivididos em: Cryptococcus neoformans (72/93,5%), C. gattii (3/3,9%), C. laurentii (1/1,3%), Cryptococcus sp (1/1,3%); Histoplasma capsulatum (21/4%);Trichosporon spp (9/1,5%) subdivididos em: T. asahii (8/89%), T. mucoides (1/11%); Rhodotorula spp (5/0,9%) subdivididos, Rhodotorula sp (4/80%), R. mucilaginosa (1/20%); Saccharomyces cerevisiae (1/0,2%); Pseudozyma aphidis (1/0,2%)O sexo masculino foi o mais prevalente (288/55%), porém sem significância estatística, a idade variou de 12 dias à 97 anos, com uma mediana de 39,64 anos. A mortalidade nestes pacientes variou entre 22% e 52%. As doenças de base mais frequente foram câncer e Aids. Febre foi o sinal mais frequente. x Neste contexto, a fungemia deve ser incluída no diagnóstico diferencial destes pacientes com febre de origem desconhecida e prolongada. Utilizando-se de técnicas laboratoriais específicas para o diagnóstico etiológico. / We reviewd 525 cases of fungemia caused by Candida spp, Cryptocossus spp, Trichosporon spp, Rhodotorula spp, Histoplasma capsulatum, Saccharomyces cerevisiae and Pseudozyma aphidis. They have all been part of the files of the Mycology Laboratory at Santa Casa Hospital Complex in Porto Alegre (RS), during a thirteen-year period (1994 - 2007). Demographic aspects, underlying diseases and factors associated with the fungemia episodes were studied, as well as the etiologic agents and the global mortality among the patients having fungemia. The 525 cases included in the study were classified according to the following: candidemia (413/78,6%), subdivided in: Candida albicans (151/36,5%), C. parapsilosis (91/22%), C. tropicalis (65/15,7%), C glabrata (27/6,5%), C. pelliculosa (18/4,3%), C.guilliermondii (18/4,3%), C. humicola (7/1,7%), C. krusei (7/1,7%), C. famata (5/1,2%), C. lusitaniae (4/0,9%), C. sake (4/0,9%), C. lipolytica (3/0,7%), C. globosa (3/0,7%), C. intermedia (2/0,5%), C. kefyr (1/0,24%), C. colliculosa (1/0,24%) e Candida sp (8/1,9%); criptocococemia (77/14,6%), subdivided in: Cryptococcus neoformans (72/93,5%), C. gattii (3/3,9%), C. laurentii (1/1,3%), Cryptococcus sp (1/1,3%); Histoplasma capsulatum (21/4%);Trichosporon spp (9/1,5%) subdivided in: T. asahii (8/89%), T. mucoides (1/11%); Rhodotorula spp (5/0,9%) subdivided, Rhodotorula sp (4/80%), R. mucilaginosa (1/20%); Saccharomyces cerevisiae (1/0,2%); Pseudozyma aphidis (1/0,2%) The male gender was the most prevalent (288/55%), although no significance difference was observed. The age ranged from 12 days to 97 years old, with an average of 39,64 years. The mortality among these patients ranged between 22% and 52%. The most frequent underlying diseases were cancer and Aids. Fever was the most frequent sign. xii Within this context, fungemia must be included in the differential diagnosis of these patients presenting long-term fever with unknown cause. Making use of specific laboratorial techniques for the etiologic diagnosis.
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Avaliação clínica da fungemia detectada pelo sistema de hemocultivo por lise-centrifugação (Isolator). Treze anos de experiência, 1994-2007Oliveira, Flávio de Mattos January 2007 (has links)
Foram incluídos no estudo 525 casos de fungemia causadas por Candida spp, Cryptocossus spp, Trichosporon spp, Rhodotorula spp, Histoplasma capsulatum, Saccharomyces cerevisiae e Pseudozyma aphidis, que constam nos arquivos do Laboratório de Micologia, Santa Casa-Complexo Hospitalar, Porto Alegre (RS) num período de 13 anos (1994-2007). Aspectos demográficos, doenças de base e fatores associadas aos episódios de fungemia foram estudados. Assim como, os agentes etiológicos e a mortalidade global entre os pacientes com fungemia. Os 525 casos foram classificados da seguinte maneira: candidemia (413/78,6%), subdivididos em: Candida albicans (151/36,5%), C. parapsilosis (91/22%), C. tropicalis (65/15,7%), C. glabrata (27/6,5%), C. pelliculosa (18/4,3%), C. guilliermondii (18/4,3%), C. humicola (7/1,7%), C. krusei (7/1,7%), C. famata (5/1,2%), C. lusitaniae (4/0,9%), C. sake (4/0,9%), C. lipolytica (3/0,7%), C. globosa (3/0,7%), C. intermedia (2/0,5%), C. kefyr (1/0,24%), C. colliculosa (1/0,24%) e Candida sp (8/1,9%); criptocococemia (77/14,6%), subdivididos em: Cryptococcus neoformans (72/93,5%), C. gattii (3/3,9%), C. laurentii (1/1,3%), Cryptococcus sp (1/1,3%); Histoplasma capsulatum (21/4%);Trichosporon spp (9/1,5%) subdivididos em: T. asahii (8/89%), T. mucoides (1/11%); Rhodotorula spp (5/0,9%) subdivididos, Rhodotorula sp (4/80%), R. mucilaginosa (1/20%); Saccharomyces cerevisiae (1/0,2%); Pseudozyma aphidis (1/0,2%)O sexo masculino foi o mais prevalente (288/55%), porém sem significância estatística, a idade variou de 12 dias à 97 anos, com uma mediana de 39,64 anos. A mortalidade nestes pacientes variou entre 22% e 52%. As doenças de base mais frequente foram câncer e Aids. Febre foi o sinal mais frequente. x Neste contexto, a fungemia deve ser incluída no diagnóstico diferencial destes pacientes com febre de origem desconhecida e prolongada. Utilizando-se de técnicas laboratoriais específicas para o diagnóstico etiológico. / We reviewd 525 cases of fungemia caused by Candida spp, Cryptocossus spp, Trichosporon spp, Rhodotorula spp, Histoplasma capsulatum, Saccharomyces cerevisiae and Pseudozyma aphidis. They have all been part of the files of the Mycology Laboratory at Santa Casa Hospital Complex in Porto Alegre (RS), during a thirteen-year period (1994 - 2007). Demographic aspects, underlying diseases and factors associated with the fungemia episodes were studied, as well as the etiologic agents and the global mortality among the patients having fungemia. The 525 cases included in the study were classified according to the following: candidemia (413/78,6%), subdivided in: Candida albicans (151/36,5%), C. parapsilosis (91/22%), C. tropicalis (65/15,7%), C glabrata (27/6,5%), C. pelliculosa (18/4,3%), C.guilliermondii (18/4,3%), C. humicola (7/1,7%), C. krusei (7/1,7%), C. famata (5/1,2%), C. lusitaniae (4/0,9%), C. sake (4/0,9%), C. lipolytica (3/0,7%), C. globosa (3/0,7%), C. intermedia (2/0,5%), C. kefyr (1/0,24%), C. colliculosa (1/0,24%) e Candida sp (8/1,9%); criptocococemia (77/14,6%), subdivided in: Cryptococcus neoformans (72/93,5%), C. gattii (3/3,9%), C. laurentii (1/1,3%), Cryptococcus sp (1/1,3%); Histoplasma capsulatum (21/4%);Trichosporon spp (9/1,5%) subdivided in: T. asahii (8/89%), T. mucoides (1/11%); Rhodotorula spp (5/0,9%) subdivided, Rhodotorula sp (4/80%), R. mucilaginosa (1/20%); Saccharomyces cerevisiae (1/0,2%); Pseudozyma aphidis (1/0,2%) The male gender was the most prevalent (288/55%), although no significance difference was observed. The age ranged from 12 days to 97 years old, with an average of 39,64 years. The mortality among these patients ranged between 22% and 52%. The most frequent underlying diseases were cancer and Aids. Fever was the most frequent sign. xii Within this context, fungemia must be included in the differential diagnosis of these patients presenting long-term fever with unknown cause. Making use of specific laboratorial techniques for the etiologic diagnosis.
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Identificação de cinco espécies de Candida pela reação em cadeia da polimerase (PCR) e por hemoculturas em pacientes pediátricos com risco para candidemia / Identification of five Candida species by PCR and blood cultures in pediatric patients at-risk of candidemiaNegro, Gilda Maria Barbaro Del 23 January 2009 (has links)
As infecções sistêmicas causadas por Candida spp. representam importante causa de morbidade e mortalidade em pacientes pediátricos internados em unidades de cuidados intensivos. A utilização de fármacos imunodepressores em pacientes submetidos a transplantes, antibioticoterapia prolongada, nutrição parenteral, presença de cateter venoso central, entre outros fatores, contribuem para o aumento na freqüência destas infecções oportunísticas. Embora Candida albicans permaneça como a espécie mais freqüentemente isolada de episódios de candidemia, tem ocorrido aumento do número de infecções causadas por espécies não albicans. Os métodos convencionais de cultivo apresentam sensibilidade limitada, além de demandar tempo prolongado para a identificação das espécies infectantes. A Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) requer pequenos volumes de sangue para análise, situação ideal para crianças gravemente enfermas, propiciando diagnóstico rápido e identificação precisa das espécies de Candida. Este estudo teve como objetivos padronizar técnicas de PCR de dupla amplificação, para identificar cinco espécies de Candida em amostras de sangue de pacientes pediátricos com risco de desenvolver candidemias, e comparar os resultados com as hemoculturas. Foram analisadas amostras de sangue de 80 pacientes pediátricos internados na Unidade de Terapia Intensiva do Instituto da Criança do Hospital das Clínicas da FMUSP, alocados em dois grupos: 58 pacientes que apresentavam duas ou mais condições predisponentes que elevam o risco de infecção fúngica (Grupo 1); e 22 pacientes em condições clínicas de menor gravidade e risco mais baixo, que foram estudados para avaliação da freqüência de resultados falso-positivos por PCR (Grupo 2). A primeira amplificação identificou fragmento da região ITS do DNA ribossômico, e a segunda etapa amplificou fragmentos espécie-específicos para C.albicans, C.glabrata, C.parapsilosis, C.tropicalis e C.krusei. Para as amostras com detecção de Candida spp. somente por PCR, foram realizadas restrições enzimáticas e seqüenciamentos, para a confirmação da especificidade dos amplificados. A concordância entre os resultados das hemoculturas e das PCR foi avaliada pelo teste de McNemar, com nível de significância de 5%. As hemoculturas foram positivas em 15,5% dos pacientes do grupo 1, enquanto as amplificações por PCR detectaram DNA de Candida spp. em 25,9% dos casos, incluindo todos os pacientes com culturas positivas. Houve concordância na identificação das espécies em 88,9% dos casos. Em dois pacientes, a PCR identificou mais de uma espécie infectante, o que não ocorreu pelas hemoculturas. Nos seis casos em que somente a PCR detectou Candida spp. nas amostras de sangue, as restrições enzimáticas e os seqüenciamentos confirmaram a especificidade das amplificações. No grupo 2, as hemoculturas foram negativas em todos os 22 casos, e a PCR detectou C.glabrata em um paciente, cujos amplificados, após seqüenciamento, apresentaram 98% de homologia com o protótipo. O teste de McNemar mostrou que a discordância encontrada entre os métodos é estatisticamente significante e favorece a PCR (p = 0,031). Os resultados do presente estudo demonstraram que a técnica de PCR apresentou maior poder de detecção de Candida spp. em amostras de pacientes com risco de desenvolver candidemia, quando comparada às hemoculturas. A PCR foi ainda capaz de detectar mais de uma espécie infectante na mesma amostra de sangue / Disseminated candidiasis is an important cause of morbidity and mortality in immunocompromised and critically ill pediatric patients. Increased use of immunosupressive drugs, indwelling catheters, broad-spectrum antibiotics, parenteral nutrition and other predisposing conditions have contributed to the increment of Candida bloodstream infections. Although Candida albicans remains the leading species, a growing number of nonalbicans isolates has been reported. Laboratory diagnosis of candidemia is troublesome due to the lack of blood cultures sensitivity. Detection of Candida DNA by polymerase chain reaction (PCR) in tiny blood volumes may provide a more rapid and reliable candidemia detection in critically ill children. The present study aimed at standardizing nested-PCR amplifications for identification of five Candida species, comparing results with those obtained by blood cultures. Eighty patients admitted to the pediatric intensive care unit of the Instituto da Criança do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo were divided into two groups: 58 patients presenting with two or more predisposing conditions to develop candidemia (Group 1), and 22 patients with lower risk, enrolled to establish the frequency of PCR false-positive results (Group 2). Nested amplifications were targeted to Candida ITS sequence, the first round yielding a gender specific fragment, and the second round identified five Candida species corresponding to C. albicans, C. tropicalis, C. glabrata, C. parapsilosis and C. krusei. When PCR positive results were not confirmed by blood cultures, enzymatic restriction and DNA sequencing were performed. Agreement between both methods was assessed by the McNemar test, adopting a level of significance of 5%. Blood cultures were positive in 15.5% of group 1 patients, whereas nested-PCR identified Candida species in 25.9%, including all culture positive patients. PCR was 88.9% concordant with blood cultures species identification, but only the molecular technique identified dual candidemia in two patients. Amplification products of six patients with negative blood cultures submitted to enzymatic restriction and sequencing analysis showed high degree of homology with Candida reference strains, confirming the specificity of PCR. Blood cultures were negative in all patients of group 2, but PCR detected C.glabrata in one case whose amplification products resulted in 98% of homology with the reference strain. The McNemar test showed disagreement between both methods, favoring PCR (p=0.031). In the present study, PCR was more sensitive to detect Candida species in comparison to blood cultures, being also able to identify dual candidemia
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Identificação de cinco espécies de Candida pela reação em cadeia da polimerase (PCR) e por hemoculturas em pacientes pediátricos com risco para candidemia / Identification of five Candida species by PCR and blood cultures in pediatric patients at-risk of candidemiaGilda Maria Barbaro Del Negro 23 January 2009 (has links)
As infecções sistêmicas causadas por Candida spp. representam importante causa de morbidade e mortalidade em pacientes pediátricos internados em unidades de cuidados intensivos. A utilização de fármacos imunodepressores em pacientes submetidos a transplantes, antibioticoterapia prolongada, nutrição parenteral, presença de cateter venoso central, entre outros fatores, contribuem para o aumento na freqüência destas infecções oportunísticas. Embora Candida albicans permaneça como a espécie mais freqüentemente isolada de episódios de candidemia, tem ocorrido aumento do número de infecções causadas por espécies não albicans. Os métodos convencionais de cultivo apresentam sensibilidade limitada, além de demandar tempo prolongado para a identificação das espécies infectantes. A Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) requer pequenos volumes de sangue para análise, situação ideal para crianças gravemente enfermas, propiciando diagnóstico rápido e identificação precisa das espécies de Candida. Este estudo teve como objetivos padronizar técnicas de PCR de dupla amplificação, para identificar cinco espécies de Candida em amostras de sangue de pacientes pediátricos com risco de desenvolver candidemias, e comparar os resultados com as hemoculturas. Foram analisadas amostras de sangue de 80 pacientes pediátricos internados na Unidade de Terapia Intensiva do Instituto da Criança do Hospital das Clínicas da FMUSP, alocados em dois grupos: 58 pacientes que apresentavam duas ou mais condições predisponentes que elevam o risco de infecção fúngica (Grupo 1); e 22 pacientes em condições clínicas de menor gravidade e risco mais baixo, que foram estudados para avaliação da freqüência de resultados falso-positivos por PCR (Grupo 2). A primeira amplificação identificou fragmento da região ITS do DNA ribossômico, e a segunda etapa amplificou fragmentos espécie-específicos para C.albicans, C.glabrata, C.parapsilosis, C.tropicalis e C.krusei. Para as amostras com detecção de Candida spp. somente por PCR, foram realizadas restrições enzimáticas e seqüenciamentos, para a confirmação da especificidade dos amplificados. A concordância entre os resultados das hemoculturas e das PCR foi avaliada pelo teste de McNemar, com nível de significância de 5%. As hemoculturas foram positivas em 15,5% dos pacientes do grupo 1, enquanto as amplificações por PCR detectaram DNA de Candida spp. em 25,9% dos casos, incluindo todos os pacientes com culturas positivas. Houve concordância na identificação das espécies em 88,9% dos casos. Em dois pacientes, a PCR identificou mais de uma espécie infectante, o que não ocorreu pelas hemoculturas. Nos seis casos em que somente a PCR detectou Candida spp. nas amostras de sangue, as restrições enzimáticas e os seqüenciamentos confirmaram a especificidade das amplificações. No grupo 2, as hemoculturas foram negativas em todos os 22 casos, e a PCR detectou C.glabrata em um paciente, cujos amplificados, após seqüenciamento, apresentaram 98% de homologia com o protótipo. O teste de McNemar mostrou que a discordância encontrada entre os métodos é estatisticamente significante e favorece a PCR (p = 0,031). Os resultados do presente estudo demonstraram que a técnica de PCR apresentou maior poder de detecção de Candida spp. em amostras de pacientes com risco de desenvolver candidemia, quando comparada às hemoculturas. A PCR foi ainda capaz de detectar mais de uma espécie infectante na mesma amostra de sangue / Disseminated candidiasis is an important cause of morbidity and mortality in immunocompromised and critically ill pediatric patients. Increased use of immunosupressive drugs, indwelling catheters, broad-spectrum antibiotics, parenteral nutrition and other predisposing conditions have contributed to the increment of Candida bloodstream infections. Although Candida albicans remains the leading species, a growing number of nonalbicans isolates has been reported. Laboratory diagnosis of candidemia is troublesome due to the lack of blood cultures sensitivity. Detection of Candida DNA by polymerase chain reaction (PCR) in tiny blood volumes may provide a more rapid and reliable candidemia detection in critically ill children. The present study aimed at standardizing nested-PCR amplifications for identification of five Candida species, comparing results with those obtained by blood cultures. Eighty patients admitted to the pediatric intensive care unit of the Instituto da Criança do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo were divided into two groups: 58 patients presenting with two or more predisposing conditions to develop candidemia (Group 1), and 22 patients with lower risk, enrolled to establish the frequency of PCR false-positive results (Group 2). Nested amplifications were targeted to Candida ITS sequence, the first round yielding a gender specific fragment, and the second round identified five Candida species corresponding to C. albicans, C. tropicalis, C. glabrata, C. parapsilosis and C. krusei. When PCR positive results were not confirmed by blood cultures, enzymatic restriction and DNA sequencing were performed. Agreement between both methods was assessed by the McNemar test, adopting a level of significance of 5%. Blood cultures were positive in 15.5% of group 1 patients, whereas nested-PCR identified Candida species in 25.9%, including all culture positive patients. PCR was 88.9% concordant with blood cultures species identification, but only the molecular technique identified dual candidemia in two patients. Amplification products of six patients with negative blood cultures submitted to enzymatic restriction and sequencing analysis showed high degree of homology with Candida reference strains, confirming the specificity of PCR. Blood cultures were negative in all patients of group 2, but PCR detected C.glabrata in one case whose amplification products resulted in 98% of homology with the reference strain. The McNemar test showed disagreement between both methods, favoring PCR (p=0.031). In the present study, PCR was more sensitive to detect Candida species in comparison to blood cultures, being also able to identify dual candidemia
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"Rhodotorula spp.isoladas de hemocultura no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo: características clínicas e microbiológicas" / Rhodotorula spp. isolated from blood cultures in Hospital das Clínicas School of Medicine University of São Paulo: clinical and microbiological aspectsAlmeida, Gisele Madeira Duboc de 20 January 2006 (has links)
Foi realizado um estudo para verificar a ocorrência de leveduras do gênero Rhodotorula, em hemocultura por um período de 8 anos. Os pacientes identificados foram descritos clinicamente segundo variáveis de interesse incluindo dados sobre terapêutica e desfecho. Determinou-se também as concentrações inibitórias mínimas de 20 cepas frente a diferentes antifúngicos de acordo com NCCLS e EUCAST. Realizou-se tipagem molecular através da cariotipagem eletroforética em campo pulsátil / A study was conducted to verify the frequency of occurrence of Rhodotorula spp. from blood cultures over an 8-year period, clinically and microbiologically characterizing patients affected, including data regarding antifungal treatment and outcome. The minimal inhibitory concentrations of antifungal agents were determined against 20 isolates. Molecular typing of the strains were performed using pulsed field gel electrophoresis method
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"Rhodotorula spp.isoladas de hemocultura no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo: características clínicas e microbiológicas" / Rhodotorula spp. isolated from blood cultures in Hospital das Clínicas School of Medicine University of São Paulo: clinical and microbiological aspectsGisele Madeira Duboc de Almeida 20 January 2006 (has links)
Foi realizado um estudo para verificar a ocorrência de leveduras do gênero Rhodotorula, em hemocultura por um período de 8 anos. Os pacientes identificados foram descritos clinicamente segundo variáveis de interesse incluindo dados sobre terapêutica e desfecho. Determinou-se também as concentrações inibitórias mínimas de 20 cepas frente a diferentes antifúngicos de acordo com NCCLS e EUCAST. Realizou-se tipagem molecular através da cariotipagem eletroforética em campo pulsátil / A study was conducted to verify the frequency of occurrence of Rhodotorula spp. from blood cultures over an 8-year period, clinically and microbiologically characterizing patients affected, including data regarding antifungal treatment and outcome. The minimal inhibitory concentrations of antifungal agents were determined against 20 isolates. Molecular typing of the strains were performed using pulsed field gel electrophoresis method
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