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Avaliacao de metodos analiticos para determinacao de desoxinivalenol e sua ocorrencia em amostras de trigo e farinha de trigoLamardo, Leda Conceicao Antonia. January 2004 (has links) (PDF)
Mestre -- Sao Paulo (Estado). Secretaria da Saude. Coordenacao dos Institutos de Pesquisa. Programa de Pos-Graduacao em Ciencias, Sao Paulo, 2004.
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Untersuchungen zum Einfluss spezieller Rhizosphärenbakterien auf Pflanzenwachstum und Fusarium spp.-Toleranz bei Spargel (Asparagus officinalis L.)Lord, Fritz. Unknown Date (has links) (PDF)
Humboldt-Universiẗat, Diss., 2002--Berlin.
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Multi-sensor and data fusion approach for determining yield limiting factors and for in-situ measurement of yellow rust and fusarium head blight in cerealsWhetton, Rebecca L. January 2016 (has links)
The world’s population is increasing and along with it, the demand for food. A novel parametric model (Volterra Non-linear Regressive with eXogenous inputs (VNRX)) is introduced for quantifying influences of individual and multiple soil properties on crop yield and normalised difference vegetation Index. The performance was compared to a random forest method over two consecutive years, with the best results of 55.6% and 52%, respectively. The VNRX was then implemented using high sampling resolution soil data collected with an on-line visible and near infrared (vis-NIR) spectroscopy sensor predicting yield variation of 23.21%. A hyperspectral imager coupled with partial least squares regression was successfully applied in the detection of fusarium head blight and yellow rust infection in winter wheat and barley canopies, under laboratory and on-line measurement conditions. Maps of the two diseases were developed for four fields. Spectral indices of the standard deviation between 500 to 650 nm, and the squared difference between 650 and 700 nm, were found to be useful in differentiating between the two diseases, in the two crops, under variable water stress. The optimisation of the hyperspectral imager for field measurement was based on signal-to-noise ratio, and considered; camera angle and distance, integration time, and light source angle and distance from the crop canopy. The study summarises in the proposal of a new method of disease management through suggested selective harvest and fungicide applications, for winter wheat and barley which theoretically reduced fungicide rate by an average of 24% and offers a combined saving of the two methods of £83 per hectare.
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Micorrização e resistência a Fusarium oxysporum Sch. f. sp. herbemontis em genótipo de porta-enxerto de videiraDalla Costa, Murilo 25 October 2012 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2010 / Made available in DSpace on 2012-10-25T06:57:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1
276368.pdf: 19499211 bytes, checksum: a68479fe79440173224ed0cfd8bac176 (MD5) / O declínio e morte de videiras, problema fitossanitário que limita a vitivinicultura no estado de Santa Catarina, tem como um dos agentes causais o fungo do solo Fusarium oxysporum f. sp. herbemontis. Até o momento, o controle da murcha vascular causada pelo patógeno é feito com uso de porta-enxertos resistentes. A inoculação de fungos micorrízicos arbusculares na fase de aclimatização de videiras micropropagadas in vitro pode acelerar a produção de mudas de alta qualidade; essa biotecnologia pode também reduzir a incidência de Fusarium spp., podendo melhorar a expressão do potencial genético de porta-enxertos, até mesmo daqueles suscetíveis ao patógeno. Os mecanismos de resistência de plantas micorrizadas a patógenos radiculares ainda estão pouco esclarecidos, especialmente no que se refere ao papel indutor da simbiose na expressão de genes de defesa da planta. O trabalho tem como objetivo avaliar, em genótipo de porta-enxerto suscetível a fusariose, o papel da formação de micorriza na expressão de proteínas radiculares e na indução de resistência localizada contra F. oxysporum f. sp. herbemontis. Mudas micropropagadas de videira da cultivar SO4 foram aclimatizadas e metade delas foram inoculadas com o fungo micorrízico Glomus intraradices. Após 75 dias, as raízes das plantas foram mergulhadas em suspensão de conídios de Fusarium spp. ou água estéril. Para realizarem-se avaliação dos níveis de atividade hidrolítica das enzimas quitinases e -1,3-glucanases e para eletroforese bidimensional de proteínas, amostras radiculares foram coletadas aos quatro e aos 14 dias após a inoculação do patógeno, respectivamente. A avaliação de sintomas de infecção por Fusarium spp. foi realizada aos 90 dias após inoculação do patógeno. A expressão de quitinases acima dos níveis basais foi induzida nas raízes dos tratamentos com inoculação do fungo micorrízico e/ou patógeno. A atividade de -1,3-glucanases foi maior somente no tratamento com inoculação de G. intraradices e do patógeno. Os simbiontes mutualístico e parasítico induziram 11 e duas proteínas, respectivamente. A formação de micorrizas e a inoculação de Fusarium spp. promoveram mudanças no nível de expressão de 13 proteínas do sistema radicular de videiras. Videiras inoculadas com G. intraradices apresentaram diminuição nos sintomas de infecção por Fusarium spp., sugerindo que a simbiose mutualística promoveu a indução de quitinases e -1,3-glucanases com ação específica na supressão do patógeno, bem como a expressão diferenciada de proteínas relacionadas com indução de resistência e com efeito bioprotetor contra o patógeno vascular.
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Zhodnocení odrůdové odolnosti vybraného sortimentu zeleniny vůči houbovým patogenům / Evaluation of cultivars tolerance of chosen vegetable assortment to fungal diseasesMaláková, Dana January 2016 (has links)
The aim of this Diploma thesis was to assess the cultivar tolerance of a chosen assortment of butterhead lettuce, leaf lettuce, iceberg lettuce and cabbage to fungal pathogens (Bremia lactucae, Fusarium oxysporum f. sp. conglutinans).
The experiment was conducted in the laboratory conditions of the gardening department FAPPZ of the Czech University of Agriculture in growth chambers. The lettuce experiments were done in given conditions with the temperatures of 18 - 20 °C under the regime 12 hrs. of light and 12 hrs. of darkness. The cabbage experiments were conducted in given conditions under the regime 12 hrs. of light and 12 hrs. of darkness with the temperatures of 14 °C during the day and 12 °C in the night. The lettuce plants were planted in dishes on fine sand. All experiments had infected and control variants. After emergence, the experimental plants were inoculated with variants of the selected pathogen. The plants were observed in 2 - 3 day intervals throughout the whole experiment. The experiment was assessed using the modified standard method according to Pawelec et al. (2006). A modified method with a percentage scale was used to assess the lettuce experiments. Cabbage experiments were evaluated with a scale of points ranging from 0 to 9 according to the percentage of infection on the plants. The results of the methodology were determined using the program Statistica 12.
In the experiments evaluating the variety tolerance of a chosen assortment leaf lettuce and iceberg lettuce to the pathogen Bremia lactucae Bl:31, a statistically significant difference in the sensitivity to this pathogen was established. The results show that the most resistant varieties are Tarzan, Stamir, Adinal a Verala. The greatest sensitivity to the pathogen Bl:31 has a variety "Dětenická Atrakce" then Traper and Nikolaj. Effect of seed treatment with hot water (HWT) to suppress pathogen B. lactucae was statistically significant in the varieties "Dětenická Atrakce" (10% decrease) and Dubáček (7% decrease) compared with untreated infectious variant with HWT. In the sensitivity evaluation of varieties and lines of white cabbage was a statistically significant difference in infecting of pathogen Fusarium oxysporum f. Sp. conglutinans breed 1. The most significantly susceptible to the pathogen Foc was variety Pourovo late-season (degree of assault after inoculation was 6.52 points).
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Análise da diversidade genética por marcadores RAPD e SSR em Fusarium oxysporum f. sp. cubense no Estado de Santa CatarinaSilva, Cristiane Maria da 24 October 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2009 / Made available in DSpace on 2012-10-24T07:27:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1
274971.pdf: 2846578 bytes, checksum: f745a914e07ddeda6a34cc83417453f8 (MD5) / O Mal-do-Panamá causado por Fusarium oxysporum f. sp. cubense (FOC) é um dos principais problemas fitossanitários da bananicultura. Para esta doença, o uso da resistência genética é o método de controle recomendável. Porém, sua eficiência depende tanto de genes de resistência disponíveis como da presença de patótipos do patógeno. Assim este estudo teve como objetivo caracterizar a diversidade genética de isolados de FOC por meio de descritores morfológicos e marcadores moleculares (RAPD, SSR). Para tanto, foram avaliados 66 isolados coletados em regiões produtoras de Santa Catarina. Os resultados de patogenicidade revelaram que 100% dos isolados foram patogênicos à bananeira da cultivar Enxerto. Quanto às características morfológicas dos isolados não se observou diferenças significativas com relação à taxa de crescimento das colônias, que variaram de 4,4 a 6,6 mm.dia-1. A coloração das colônias sobre meio de cultura BDA variou de branco, salmão e roxo. Os resultados utilizando marcadores moleculares RAPD apresentaram uma variabilidade considerável entre os isolados de FOC, com estimativas de similaridade que variaram de 35 a 98%. Baseado nos 10 marcadores selecionados de RAPD, os 66 isolados foram agrupados em cinco grupos distintos, sendo que o número de indivíduos provenientes das regiões norte e sul do Estado foi igualmente distribuído no primeiro grupo, onde 58 indivíduos foram agrupados. Nos outros quatro grupos formados teve-se somente isolados provenientes do norte do Estado, os quais apresentaram uma maior distância genética quando comparados ao grupo um. A técnica de marcador molecular SSR separou os isolados em três grupos distintos. O primeiro grupo foi constituído de 59 indivíduos provenientes dos diversos municípios onde as coletas foram feitas. O segundo grupo, composto por dois isolados (CO16, JS23), caracterizou-se por apresentar alelo nulo para o marcador MB11. Já o terceiro grupo, formado por quatro isolados (JS26, SI53, SI54, SI55, SI56), apresentou um alelo extra no marcador MB02. No estudo de compatibilidade vegetativa não foi possível observar o pareamento entre os quatro isolados testados não havendo, portanto compatibilidade vegetativa entre os mesmos. Não houve associação dos agrupamentos RAPD e SSR com origens geográficas e características morfológicas da colônia de FOC, visto que os isolados foram distribuídos indistintamente nos grupos.
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Perfil do produtor de abacaxi e incidência da fusariose em Conceição do Araguaia, PA / Profile of pineapple producer and incidence of gummosis in Conceição do Araguaia, PASilva, Jorge Luis Carvalho 31 March 2015 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-02-15T16:06:33Z
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Previous issue date: 2015-03-31 / O Pará é o maior estado produtor de abacaxi no Brasil. No município paraense de Conceição do Araguaia, o cultivo de abacaxi é a principal atividade econômica, e a cultivar Pérola é a mais plantada. A fusariose, causada pelo fungo Fusarium guttiforme, é uma das principais doenças da cultura. Apesar da importância da cultura e da fusariose, pouco se conhece sobre ambas em Conceição do Araguaia. Assim, efetuaram-se entrevistas estruturadas, para identificar o perfil dos abacaxicultores, e levantamento da incidência da fusariose, para quantificar a importância da doença. Em torno de 70% dos abacaxicultores têm mais de 41 anos, baixo nível de escolaridade, expressiva participação em associações comunitárias, recebem informações principalmente via televisão, esporadicamente fornecem ou compram mudas dos vizinhos e comercializam os frutos com atravessadores. A incidência da fusariose nas lavouras de Conceição do Araguaia, durante a fase de desenvolvimento vegetativo, foi menor que a observada em outras regiões, com aumento progressivo nos primeiros meses após o plantio até a indução floral com etefom. / Pará state is the major Brazilian pineapple producer. In the Conceição do Araguaia county in Pará, pineapple cropping is the main economic activity, and ‘Pérola’ is the most planted cultivar. Gummosis, caused by the fungus Fusarium guttiforme, is a major disease of the crop. Despite the importance of both pineapple and gummosis for the county, little is known about them. Thus we set structured interviews, to characterize the profile of pineapple producers, and surveyed the disease incidence. About 70% of the growers are older than 41, have low level of education, participate actively in community associations, receive information mainly through television, use their own slips or suckers or buy them from neighbors and commercialize the fruits through intermediaries. The incidence of gummosis in Conceição do Araguaia crops during the vegetative growth was lower than that from other regions. The incidence gradually increases from the first months after planting up to the floral induction with ethephon.
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Análise de elementos transponíveis e DNA polimórfico amplificado ao acaso (RAPD) de Fusarium oxysporum / Analyze of transposable elements and random amplified polymorphic DNA (RAPD) in Fusarium oxysporumZanotti, Michele Galvão Sant’Ana 13 February 2003 (has links)
Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-06-13T12:59:08Z
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Previous issue date: 2003-02-13 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / A variabilidade genética de 20 isolados de Fusarium oxysporum não- patogênicos e patogênicos em feijoeiro foi determinada com base na distribuição do elemento transponível impala e com a técnica de DNA polimórfico amplificado ao acaso (RAPD). A presença de elementos transponíveis impala das subfamílias D e E foi determinada por experimentos de PCR empregando oligonucleotídeos específicos para cada subfamília. Foi observada a presença de representantes das duas subfamílias na maioria dos isolados, sugerindo, portanto, que impala é um antigo componente do genoma de F. oxysporum f. sp. phaseoli. A hibridização do DNA total de cada isolado, clivado com a enzima EcoRI, com um fragmento do elemento impala da subfamíla E, mostrou uma variação nos padrões de bandas dos isolados não-patogênicos, indicando a possível atividade desses elementos. No entanto, no caso dos isolados patogênicos, foram observados padrões de bandas mais homogêneas e alguns isolados apresentaram o mesmo perfil de bandas, indicando que se trata de cópias de impala que possivelmente não são mais capazes de sofrer transposição. Estas cópias inativas são excelentes marcadores genéticos. Um dos isolados patogênicos, Fus4, não apresentou cópias endógenas de impala, o que torna esse isolado um candidato para experimentos de mutagênese insercional usando o vetor pNI160, que apresenta o elemento impala ativo interrompendo o oligonucleotídeos polimorfismo gene niaD. gerou 224 observado foi A análise dos fragmentos compatível dados de polimórficos com o padrão RAPD e 7 de utilizando-se 16 monomórficos. O hibridização. Foram calculadas as distâncias genéticas entre os isolados e estas variaram de 8 a 76%, entre os patogênicos; de 2 a 63%, entre os não-patogênicos, e de 45 a 76%, entre patogênicos e não-patogênicos. Baseados nestas distâncias, quatro grupos foram definidos por análise de agrupamento. Dois grupos foram específicos para patogênicos, um para os não- patogênicos, e um grupo incluiu patogênicos e não-patogênicos. A distância genética observada dentro de um grupo de isolados patogênicos é compatível com os valores de distância genética que definem raças fisiológicas. / The genetic variability of twenty nonpathogenic and pathogenic isolates of Fusarium oxysporum, the causative agent of bean wilt, was analyzed based on the distribution of the transposable element impala and on the random amplification of polymorphic subfamilies DNA D and (RAPD). E of The impala presence was of transposable determined reaction) using specific primers for each subfamily. two subfamilies was observed in most of through elements PCR The presence of belonging (polymerase members of to chain the the isolates, suggesting that it is an old component in the F. oxysporum f. sp. phaseoli genoma. Hybridization of total DNA of each isolate, digested with EcoRI, with impala fragment of subfamily E produced a highly band pattern in the nonpathogenic isolates, indicating the possible activity of these elements. patterns were On the other hand, in the case of the pathogenic isolates, the band more homogeneous and some isolates showed very similar patterns, indicating that these impala copies have lost their capacity to transpose. These inactive copies are suitable as genetic markers. Among the pathogenics isolates, Fus4 did not present endogenous copies of impala and could be used in experiments of insertional viiimutagenesis with the pNI160 plasmid, that harbors the active impala element disrupting the niaD gene. monomorphic The RAPD analysis using 16 primers resulted in 224 polymorphic and 7 fragments. The genetic distances among the isolates based on the presence/absence of the RAPD bands varied between 8 and 76% within the pathogenic isolates, between 2 a 63% within the nonpathogenic isolates and 45 to 76% between the two groups. Based on these distances, four groups were defined by UPGMA analysis. Two groups included within were both the specific pathogenic group of for and pathogenics nonpathogenic pathogenic isolates and isolates.
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Giberela do trigo: resistência a fungicidas e metanálise da eficácia do controle químico / Fusarium head blight of wheat: resistance to fungicides and meta-analysis of control efficacyMachado, Franklin Jackson 23 February 2016 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-08-22T11:29:51Z
No. of bitstreams: 1
texto completo.pdf: 956629 bytes, checksum: 1096a842439a74fe8b122975f58e42bd (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-22T11:29:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1
texto completo.pdf: 956629 bytes, checksum: 1096a842439a74fe8b122975f58e42bd (MD5)
Previous issue date: 2016-02-23 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os fungicidas são normalmente aplicados para o manejo da giberela com o objetivo de garantir a produtividade e reduzir níveis de micotoxinas associadas à doença. Vários ingredientes ativos estão disponíveis no Brasil, sendo que os mais comumente recomendados pertencem ao grupo dos inibidores da demetilação (DMI) e benzimidazóis (MBC), ou usados em mistura com fungicidas do grupo das estrobilurinas (QoI). Dada a importância crescente de epidemias de giberela no Brasil, o uso de fungicidas vêm aumentando consideravelmente e, geralmente, duas aplicações têm sido recomendadas. Parcelas de campo em 16 municípios na região de Guarapuava, Sul do Paraná foram monitoradas durante quatro anos (2011 a 2014) e um total de 227 isolados semelhantes a espécies do complexo de espécies de Fusarium graminearum foram obtidos a partir de espigas de trigo sintomáticas. Uma amostra de 173 isolados foi identificada quanto ao genótipo tricoteceno com base em PCR. Entre eles, 67% foram identificados como 15- (A)cetil-desoxinivalenol(DON), 29% do nivalenol (NIV) e 4% como genótipo 3-ADON. Uma amostra de 35 isolados foi selecionada para determinar a concentração dos fungicidas tebuconazol e carbendazim que reduz em 50% do crescimento de micelial (EC 50 ), usando as seguintes doses (0; 0,5; 1,0; 2,0 e 4,0 μg / ml). As medias estimadas de EC 50 , independente do genótipo, foram 0,39 μg/ml (0,0004 a 3,0) e 1,25 μg/ml (0,91 a 2,65) para tebuconazol e carbendazim, respectivamente. As medias de EC 50 foram 1,32 μg/ml e 1,21 μg/ml para carbendazim e 0,58 μg/ml e 0,05 μg/ml para tebuconazol, para os isolados 15-ADON e NIV ou 3-ADON, respectivamente. O teste não paramétrico Kolmogorov-Smirnov mostrou diferença entre os isolados 15-ADON e os NIV+3-ADON quanto ao tebuconazol (P = 0,002), mas não para o carbendazim (P = 0,514). As doses discriminatórias de 1,4 μg/ml e 2,0 μg/ml foram usadas para identificar isolados menos sensíveis à carbendazim e tebuconazol, respectivamente, em toda coleção. Baseado nessas doses, dois isolados menos sensíveis ao tebuconazol e seis isolados menos sensíveis ao carbendazim foram encontrados, sendo todos originários do munícipio de Guarapuava ao longo de três safras e possuem o genótipo 15-ADON. Houve correlação significativa entre os valores de EC 50 dos dois fungicidas (r = 0,45; P = 0,007). Um único isolado apresentou os maiores valores de EC 50 para ambos fungicidas e apresentou uma mutação (R31K) no gene cyp51A. A presença da reduzida sensibilidade e um isolado resistente, reportado pela primeira vez no Brasil, sugerem que a seleção pode conduzir mudanças nas populações com consequências no manejo da doença. Estudos futuros devem se concentrar em atributos de fitness, competitividade e experimentos in vivo para verificar se a eficácia do fungicida é prejudicada na presença de isolados menos sensíveis. Em estudos de controle químico da giberela, resultados sobre a eficácia têm sido inconsistentes e variáveis para um mesmo fungicida. Uma revisão sistemática de estudos de eficácia dos fungicidas pode ser útil para apontar para os produtos mais eficazes e cenários onde a eficácia pode ser melhorada. Os objetivos deste trabalho foram a) revisar sistematicamente estudos de controle químico para o manejo da giberela realizados no Brasil durante os últimos 15 anos (2000-2015), publicados em revistas com e sem corpo editorial e b) conduzir uma metanálise da eficácia de controle e retorno em produtividade de fungicidas selecionados. Uma busca na literatura identificou 18 estudos que relataram a severidade da giberela (o mesmo que índice giberela) para pelo menos um tratamento com fungicida em comparação com um tratamento controle sem o fungicida, e também uma medida da variância amostral do ensaio. Apenas três e dois estudos relataram valores médios de grãos giberelados e deoxinivalenol (DON), respectivamente. Os estudos foram analisados e oito tratamentos com fungicidas, com pelo menos dez entradas foram selecionados para o estudo de metanálise. Foram incluídos os tratamentos com os fungicidas dos grupos: DMI (tebuconazol, metconazol e propiconazol) e MBC (carbendazim) formulados individualmente e uma pré-mistura de DMI + QoI (azoxistrobina + tebuconazol, piraclostrobina + metconazol, trifloxistrobina + prothioconazol e trifloxistrobina + tebuconazol). Foram testadas uma aplicação (×1) e duas aplicações (×2), sendo a primeira na floração plena e a segunda dez dias após. Um modelo metanalítico multivariado foi ajustado para o log das médias para cada fungicida e o tratamento controle de cada ensaio. A diferença nas estimativas médias do log da severidade entre um tratamento com fungicida e o controle foram usadas para calcular a razão de resposta média (R) e então transformadas para porcentagem de controle (C) e porcentagem de retorno em produtividade (P). A média de C e P variou de 48,94 a 70,39% e de 7,41 a 21,29%, respectivamente. Metconazol (×2) teve o melhor desempenho para reduzir a severidade da doença (C = 70,39%) e tebuconazol (×1) em retorno em produtividade (P = 21,29%). Propiconazol foi o menos eficaz entre os DMIs (C = 48,94%), seguido de carbendazim (C = 53,90%). Em geral, os fungicidas mais eficazes resultaram em maior retorno de rendimento. Quando os grupos de fungicidas foram comparados, em geral, os DMIs e as misturas tiveram o melhor desempenho, especialmente em ensaios conduzidos sob elevada pressão da doença (> 7% no tratamento controle). Os resultados mostraram que a eficácia de controle média em estudos brasileiros quando se utiliza duas aplicações são mais elevadas do que quando se utiliza apenas uma aplicação, como relatado em outro estudo de metanálise na América do Norte. Estudos futuros deverão centrar-se no efeito sobre os níveis de DON, especialmente para as misturas, que estão estrategicamente utilizadas para o controle de doenças foliares. / Fungicides are commonly applied for managing Fusarium head blight (FHB) with the aim of protecting yield and improving grain quality, but especially targeting mycotoxin reduction. Several active ingredients are available in Brazil and the most common belong to the demethylation-inhibitor (DMI) and benzimidazoles (MBC) groups, with the former commonly used in mixture with fungicides of the quinone-outside inhibitor (QoI) group. Given the increasing importance of FHB epidemics in Brazil, the use of fungicides is increasing considerably and usually two sprays are recommended. Experimental trials where fungicides have been applied for FHB control were monitored in 16 municipalities at the Guarapuava region, Southern Paraná, during four years (2011 to 2014). A total of 227 isolates resembling those of the Fusarium graminearum species complex were obtained from wheat heads with FHB symptoms. Of those, 173 isolates were assigned to trichothecene genotypes based on PCR assays. A random sample of 35 isolates from 2011 to 2013 was selected to determine the concentration of tebuconazole and carbendazim fungicides that reduces 50% of the mycelial growth (EC 50 ). The following doses were used: 0, 0.5, 1.0, 2.0 and 4.0 μg/ml. In the PCR assays, most isolates (67%) were of the 15-(A)cetyl-deoxynivalenol (DON), 29% of the nivalenol (NIV) and 4% of the 3-ADON genotype. The estimated means of the EC 50 , irrespectively of the genotype, were 0.39 μg/ml (0.0004 to 3.0) and 1.25 μg/ml (0.91 to 2.65) for tebuconazole and carbendazim, respectively. The mean EC 50 were 1.32 μg/ml and 1.21 μg/ml for carbendazim and 0.58 μg/ml and 0.05 μg/ml for tebuconazole, for isolates of the 15-ADON and NIV + 3-ADON isolates, respectively. A Kolmogorov-Smirnov non-parametric test suggested that the sensitivity to tebuconazole of the 15-ADON and NIV+3-ADON isolates were sampled from populations with different distributions (P = 0.002), but not for carbendazim (P = 0,514). Discriminatory doses of the 1.4 μg/ml and 2.0 μg/ml were used to screen for less- sensitive isolates in the whole sample. Based on those doses, two tebuconazole-less sensitive and six carbendazim-less sensitive isolates were found, all were originated from Guarapuava municipality across three growing seasons and possessed the 15-ADON genotype. There was as significant correlation between the EC 50 values of tebuconazole and carbendazim (r = 0.45; P = 0,007). One isolate exhibited the highest EC 50 values for both fungicides and showed a mutation (R31K) in the cyp51A gene. The presence of less sensitive and a resistant isolate reported for the first time in Brazil suggest that selection may drive changes in the populations with impact in disease management. Future studies should focus on the attributes of fitness, competitiveness and in vivo assays to check whether fungicide efficacy is hindered in the presence of resistant isolates. Furthermore, results on fungicide efficacy have been inconsistent and variable for a same fungicide. Quantitative summary of fungicide data available in the country is lacking and could be useful to point to the most efficacious products and scenarios where efficacy can be improved. The objectives of this work were to a) systematically review the peer- and non- peer reviewed literature on chemical control studies for FHB management conducted in Brazil during the last 15 years and b) conduct a meta-analysis of the control efficacy and yield return of selected fungicides. A search in the literature identified 18 studies that reported FHB severity (same as FHB index) for least one fungicide treatment compared to a non-treated check, and also a measure of sampling variance in the trial. Only three and two studies reported mean values of Fusarium-damaged kernels (FDK) and deoxyninvalenol (DON), respectively. Studies were scrutinized and eight fungicide treatments with at least 10 entries were selected for the meta-analysis study. They included DMI (tebuconazole, metconazole and propiconazole) and MBC (carbendazim) fungicide treatments formulated solo and a pre-mix of DMI+QoI (azoxystrobin + tebuconazole, pyraclostrobin + metconazole, trifloxystrobin + prothioconazole and trifloxystrobin + tebuconazole). One (×1) and two applications (×2) were tested, the first at full flowering and the second 10 days later. A multivariate meta-analytic model was fitted to the log of the means for each fungicide and check treatment of the trial. The difference in the mean estimates of the log of severity between a fungicide treatment and the check were used to calculate the mean response ratio represented by percentage control efficacy (C) and percentage yield return (P). Mean C and P ranged from 48.94 to 70.39% and from 7.41 to 21.29%, respectively. Metconazole (×2) performed best to reduce disease severity (C = 70.39%) and tebuconazole (×1) to increase yield (P = 21.29%). Propiconazole was the least efficacious among the DMIs (48.94%), followed by carbendazim (53.9%). In general, the most efficacious fungicides resulted in higher yield return. When fungicide groups were compared, the DMIs and the mixtures performed best in general, especially in trials conducted under high disease pressure (>7% in the check treatment). Results showed that mean control efficacy in Brazilian studies when using two sprays are higher one spray, as reported in other meta-analysis study in North America. Future studies should focus on the effect on DON levels, especially for the mixtures, which are strategically used for the control foliar diseases.
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Potencial genético de variedades tradicionais de feijão-caupi e avaliação para resistência à murcha-de-Fusarium / Genetic potential of traditional varieties of cowpea and evaluation for resistance to Fusarium wiltAraújo, Linda Brenna Ribeiro January 2017 (has links)
ARAÚJO, Linda Brenna Ribeiro. Potencial genético de variedades tradicionais de feijão-caupi e avaliação para resistência à murcha-de-Fusarium. 2017. 80 f. Dissertação (Mestrado em Agronomia/Fitotecnia) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2017. / Submitted by Deocleciano Xavier (dixavier.ufc@gmail.com) on 2017-08-21T18:35:50Z
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Previous issue date: 2017 / Traditional varieties are an important source of germplasm for several crops, and may present alleles that have long been lost, such as those that confer resistance to biotic and abiotic stresses. In the state of Ceará, the cultivation of the cowpea is highlighted because it is mainly carried out by family farmers who make use of these varieties, and their great adaptation to the region of cultivation and to the management adopted by the farmers can be used in the development of cultivars that better meet their demands. Thus, this work was carried out to evaluate the genetic potential of traditional varieties of cowpea collected from family farmers in the state of Ceará. In order to achieve this objective, laboratory analyzes, field and greenhouse tests were carried out. The laboratory analyzes consisted of the evaluation of the genetic diversity of the varieties through ISSR markers. The field experiments consisted of tests for the evaluation of morphological and agronomic descriptors in two environments: Fortaleza and Madalena, in the state of Ceará. The experiment in greenhouse was conducted to evaluate the existence of sources of resistance to Fusarium wilt by the root-dipping inoculation method. The ISSR markers selected for the study were efficient in identifying the genetic variability of the species, presenting high values of polymorphism and polymorphism information content (PIC). Even so, the genetic distance found between the studied varieties ranged from 0,05 to 0,31, values considered low and that suggest a narrow genetic base of the species. Some traditional varieties evaluated showed higher grain yield than commercial cultivars for the evaluated environments (3286.66 tons/ha), indicating a high agronomic potential and a great environmental adaptation. They presented greater genetic variability for the morphological characters evaluated, when compared to the molecular data. Regarding the severity of the disease, the varieties formed three distinct groups. The group with the lowest severity of the disease (25,00 to 32,50 %) consisted of thirty-seven varieties, the second group with intermediate values of severity (33,75 to 37,50 %) consisted of eight varieties and in the third Group were the five varieties that presented the highest values of severity (41,25 to 51,25 %). The varieties with the best results for agronomic traits, resistance to Fusarium wilt and greater genetic distance are promising for use in breeding programs. / As variedades tradicionais constituem importante fonte de germoplasma para diversas culturas, podendo apresentar alelos há muito perdidos, como os que conferem resistência a estresses bióticos e abióticos. No estado do Ceará, o cultivo do feijão-caupi tem destaque por ser realizado principalmente por agricultores familiares que fazem uso dessas variedades, e a grande adaptação delas à região de cultivo e ao manejo adotado pelos agricultores pode ser utilizada no desenvolvimento de cultivares que atendam melhor às suas demandas. Assim, objetivou-se com esse trabalho avaliar o potencial genético e a resistência à murcha-de-Fusarium de variedades tradicionais de feijão-caupi coletadas junto a agricultores familiares no estado do Ceará. Para se alcançar tal objetivo foram realizadas análises em laboratório, ensaios em campo e em casa de vegetação. As análises em laboratório constaram da avaliação da diversidade genética das variedades através de marcadores ISSR. Os experimentos de campo constaram de ensaios para a avaliação de descritores morfológicos e agronômicos em dois ambientes: Fortaleza e Madalena, no estado do Ceará. O ensaio em casa de vegetação foi realizado para avaliar a existência de fontes de resistência à murcha-de-Fusarium através do método de dipping. Os marcadores ISSR selecionados para o estudo foram eficientes na identificação da variabilidade genética dos genótipos, apresentando altos valores de polimorfismo e conteúdo de informação polimórfica (PIC). Ainda assim, a distância genética encontrada entre as variedades estudadas variou de 0,05 a 0,31, valores considerados baixos e que sugerem uma estreita base genética dos genótipos avaliados. Algumas variedades tradicionais avaliadas apresentaram produtividade de grãos superior às cultivares comerciais para os ambientes avaliados (3286,66 ton/ha), o que indica um alto potencial agronômico e uma grande adaptação ambiental. Elas apresentaram maior variabilidade genética para os caracteres morfológicos avaliados, quando comparados aos dados moleculares. Com relação à severidade da doença, as variedades formaram três grupos distintos. O grupo com a menor severidade da doença (25,00 a 32,50 %) foi constituído por trinta e sete variedades, o segundo grupo com valores intermediários de severidade (33,75 a 37,50 %) foi constituído por oito variedades e no terceiro grupo ficaram as cinco variedades que apresentaram os maiores valores de severidade (41,25 a 51,25 %). As variedades com melhores resultados para os caracteres agronômicos, de resistência à murcha-de-Fusarium e maior distância genética são promissoras para uso em programas de melhoramento genético.
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