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Descoberta e genotipagem por sequenciamento de SNPs em Coffea canephora e aplica????es em estudos de diversidade e estrutura gen??ticaCarneiro, Fernanda de Ara??jo 05 September 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014-09-05 / Of all the different activities related to agricultural industry worldwide, coffee agribusiness is
among the most important ones, both economically and socially, being the main livelihood for
more than 125 million people in more than 60 countries. Commercial coffee production is
mostly based on two species, Coffea arabica and C. canephora. The high genetic variability
of C. canephora, due to its level of allogamy, is of great importance for breeding programs of
coffee as a source of novel alleles and co-evolved genetic combinations. The molecular
analysis of genetic diversity has become increasingly efficient, necessary and refined, as
molecular techniques have evolved and morphological traits do not supply sufficient
information to fully describe an individual. An important tool in the study of genetic diversity
is the use of SNP (Single Nucleotide Polymorphism) based molecular markers. In the case of
C. canephora diversity studies may benefit breeding programs in selecting individuals to
optimize mating schemes or assess the diversity and relatedness of clonal varieties. This study
aimed to (i) evaluate and characterize the diversity and the genetic structure of C. canephora
Conilon individuals belonging to a population located at Embrapa Cerrados, by nextRAD
genotyping (reductively-amplified Nextera tagmented-DNA); (ii) identify potential parents of
these individuals and (iii) validate genotyping technique in genomic scale. A total of 11,230
SNPs were obtained for C. canephora Conilon individuals by technique nextRAD, of these,
573 markers were selected for the diversity analysis, kinship and genetic structure using the
Cervus, adegenet and Structure. The genetic diversity (0.405) and the mean observed
heterozygosity (0:41) were high considering the bi-allelic markers and more than 64% of the
SNPs showed PIC values higher than 0.3. In terms of population, the two methodologies used
(Bayesian method and DAPC) identified different numbers of groups formed for the same set
of data. In kinship analysis some parents are more frequent in the population. The data
generated for the population will be useful in upcoming association studies the development
of genomic prediction models. / Dentre as diferentes atividades ligadas ao neg??cio agr??cola em n??vel mundial, o agroneg??cio
cafeeiro est?? entre as de maior import??ncia econ??mica e social, sendo o principal meio de
subsist??ncia para mais de 125 milh??es de pessoas e produzido em mais de 60 pa??ses. A
produ????o cafeeira comercial baseia-se principalmente em duas esp??cies: Coffea arabica e
Coffea canephora. A grande variabilidade gen??tica do C. canephora devido sua alogamia, ??
um fator de grande import??ncia para os programas de melhoramento do cafeeiro, pois fornece
uma fonte de novos genes. O estudo molecular da diversidade gen??tica vem se demonstrando
cada vez mais eficiente, necess??rio e refinado, uma vez que as t??cnicas moleculares est??o
evoluindo e os descritores morfol??gicos est??o se tornando insuficientes para a descri????o de
um indiv??duo. Uma ferramenta muito importante no estudo da diversidade gen??tica ?? o uso
dos marcadores moleculares SNPs (Single Nucleotide Polymorphism), estes consistem na
varia????o de sequ??ncia de DNA, podendo ser identificados em praticamente todos os genes.
No caso de C. canephora, estudos de diversidade podem facilitar a orienta????o dos programas
de melhoramento na escolha de genitores para cruzamentos ou de gen??tipos para composi????o
de variedades clonais. Este trabalho objetivou (i) avaliar e caracterizar, por meio da t??cnica de
genotipagem nextRAD (Nextera-tagmented reductively-amplified DNA), a diversidade e a
estrutura gen??tica de indiv??duos de C. canephora Conilon, pertencentes a uma popula????o
localizada na Embrapa Cerrados; (ii) identificar os poss??veis genitores desses mesmos
indiv??duos e (iii) validar a t??cnica de genotipagem em escala gen??mica utilizada nesse estudo.
Um total de 11.230 SNPs foram identificados em indiv??duos de C. canephora Conilon por
meio da t??cnica de genotipagem nextRAD, destes, 573 marcadores foram selecionados para
as an??lises de diversidade, parentesco e estrutura gen??tica utilizando os software Cervus,
adegenet e Structure. A diversidade gen??tica (0.405) e a m??dia da heterozigosidade observada
(0.41) foram altas considerando marcadores bial??licos e mais de 64% dos SNPs apresentaram
valores de PIC superiores a 0.3. Em termos de popula????o foi poss??vel verificar que as duas
metodologias utilizadas (m??todo Bayesiano e DAPC) identificaram n??meros diferentes de
grupos formados para o mesmo conjunto de dados. Na an??lise de parentesco foi poss??vel
identificar alguns genitores bastante frequentes na popula????o. Os dados gerados para a
popula????o ser??o ??teis em estudos futuros de associa????o e no desenvolvimento de modelos de
predi????o gen??mica.
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Epigenetic switch induced by MYC in Non-Small-Cell Lung Cancer / Durch MYC induzierte epigenetische Veränderung im Nichtkleinzelligen BronchialkarzinomCardoso e Castro, Inês Sofia January 2012 (has links) (PDF)
Non–Small-Cell Lung Cancer (NSCLC) is the most frequent human lung cancer and a major cause of death due to its high rate of metastasis1. These facts emphasize the urgent need for the investigation of new targets for anti-metastatic therapy. Up to now a number of genes and gene products have been identified that positively or negatively affect the probability of established human tumor cell lines to metastasize2. Previously, together with the group of Professor Ulf Rapp, we have described the first conditional mouse model for metastasis of NSCLC and identified a gene, c-MYC, that is able to orchestrate all steps of this process. We could identify potential markers for detection of metastasis and highlighted GATA4, which is exclusively expressed during lung development, as a target for future therapeutic intervention2. However, the mechanism underlying this metastatic conversion remained to be identified, and was therefore the focus of the present work. Here, GATA4 is identified as a MYC target in the development of metastasis and epigenetic alterations at the GATA4 promoter level are shown after MYC expression in NSCLC in vivo and in vitro. Such alterations include site-specific demethylation that accompanies the displacement of the MYC-associated zinc finger protein (MAZ) from the GATA4 promoter, which leads to GATA4 expression. Histone modification analysis of the GATA4 promoter revealed a switch from repressive histone marks to active histone marks after MYC binding, which corresponds to active GATA4 expression. This work identifies a novel epigenetic mechanism by which MYC activates GATA4 leading to metastasis in NSCLC, suggesting novel potential targets for the development of anti-metastatic therapy. / Das nichtkleinzellige Bronchialkarzinom (Non-Small-Cell Lung Cancer/NSCLC) ist die häufigste Form des Lungenkrebs und ist aufgrund seiner hohen Metastasierungsrate für die meisten krebsbedingten Todesfälle verantwortlich1. Bisher konnte eine Vielzahl von Genen und Genprodukten identifiziert werden, die einen Einfluss auf das Metastasierungspotenzial von humanen Tumorzelllinien in vitro haben2. Vor kurzem gelang es uns unter der Leitung von Prof. Ulf R. Rapp das erste konditionelle Modell der Metastasierung von NSCLC zu beschreiben. Wir identifizierten u.a. das Gen c-MYC, welches in der Lage ist, in alle Schritte des Prozesses manipulierend einzugreifen. Im Rahmen dieser Arbeit konnten wir potentielle Marker zur Detektion der Metastasierung identifizieren. Unser Hauptaugenmerk lag dabei auf GATA4, ein Gen, das nur während der Lungenentwicklung exprimiert wird. Als potentielles Ziel für spätere therapeutische Eingriffe erscheint es daher besonders geeignet2. Die der Metastasierung zugrunde liegenden Mechanismen sind bisher weitestgehend ungeklärt und stellen daher einen Fokus dieser Arbeit dar. Im Rahmen der vorliegenden Arbeit wurde GATA4 als ein von MYC regulierter Faktor identifiziert, der an der Entwicklung von Metastasen beteiligt ist. Epigenetische Veränderungen am GATA4-Promotor nach der Expression von MYC konnten sowohl in vitro als auch in vivo nachgewiesen werden. Die Veränderungen beinhalten ortsspezifische Methylierungen, die einhergehen mit der Dislokation des MYC-assoziierten zinc finger protein (MAZ), die zur Expression von GATA4 führt. Die Analyse der Histon-Modifikationen am GATA4-Promotor ergab, dass nach der Bindung von MYC ein Wechsel von reprimierenden Histon-Markierungen zu aktiven stattfindet, der mit der GATA4-Expression korreliert. Im Rahmen dieser Arbeit konnte also ein neuartiger epigenetischer Mechanismus identifiziert werden, mit dem MYC GATA4 aktiviert und auf diese Weise zur Metastasenbildung bei NSCLC führt. Gleichzeitig wurden dadurch neue potentielle Zielstrukturen für die Entwicklung von anti-metastasierenden Therapeutika gefunden.
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Zur genetischen Heterogenität der Muskeldystrophien: alternative genetische Ursachen der Myotonen Dystrophie und FSHD / The genetic heterogeneity of the muscular dystrophies: alternative genetic causes of myotonic dystrophy and FSHDLarsen, Mirjam January 2015 (has links) (PDF)
Die klinische Symptomatik verschiedener erblicher Muskelerkrankungen verläuft oft erstaunlich ähnlich mit Muskelschwäche und -schwund als den hervorstechenden Alltagsproblemen. Dem gegenüber sind die genetischen Grundlagen sehr vielfältig mit > 250 bisher identifizierten Genen (musclegenetable.org). Auch innerhalb eines definierten Krankheitsbildes werden verschiedene genetische Ursachen nebeneinander gefunden, was durch die Verknüpfung in einem gemeinsamen Pathomechanismus begründet sein kann. Die vorliegende Arbeit beschäftigt sich mit verschiedenen Aspekten dieser genetischen Heterogenität am Beispiel der beiden häufigen Muskelerkrankungen Myotone Dystrophie (DM) und Facioscapulohumerale Muskeldystrophie (FSHD), bei denen alternative genetische Ursachen, sowie anknüpfende Fragestellungen untersucht wurden.
Das erste Projekt dieser Arbeit beschäftigt sich mit Fragestellungen, welche die DM betreffen. Die DM Typ 1 und Typ 2 (DM1 und DM2) bilden zusammen die häufigste Muskelerkrankung im Erwachsenenalter. Sie ist durch die gemeinsamen Symptome Myotonie, Muskelschwäche und Katarakt sowie die Beteiligung weiterer Organsysteme gekennzeichnet, was sie zu einer multisystemischen Erkrankung macht. Die genetische Ursache liegt für beide Formen in einer Repeatexpansion eines Mikrosatelliten in der untranslatierten Region zweier Gene (DMPK in DM1, CNBP in DM2). Dem gemeinsamen Pathomechanismus liegt eine toxische Funktionsgewinn-Mutation des expandierten RNA-Transkripts zugrunde.
Die beiden bekannten Formen der DM sind phänotypisch häufig nicht unterscheidbar, weshalb in vielen Fällen beide Erkrankungen molekulargenetisch untersucht werden müssen. Dabei ist die Diagnostik der DM durch die Notwendigkeit des Nachweises von sehr großen Repeatexpansionen recht aufwändig und die Bestimmung der Repeatlänge im Fall der DM2 nur eingeschränkt möglich. Im Rahmen dieser Arbeit wurde ein Test zum Nachweis der Repeatexpansionen auf der Basis der Methode des Molecular Combing entwickelt, welche den gleichzeitigen Nachweis der beiden Loci von DM1 und DM2 erlaubt und zusätzlich eine direkte Messung der Repeatlänge ermöglicht. Das Molecular Combing ist eine fluoreszenz-mikroskopische Einzelmolekül-Analysemethode, durch die es erstmals möglich wurde, die vermutete somatische Instabilität bei DM2 darzustellen.
Das zweite DM-Teilprojekt beschäftigt sich mit der Identifikation möglicher alternativer genetischer Ursachen für die Erkrankung. Dies wurde anhand einer Kohorte von 138 DM1- und DM2-negativen Indexpatienten mit dem typischen DM-Phänotyp untersucht. Ausgehend von dem gemeinsamen Pathomechanismus wurden die primären Krankheitsgene DMPK und CNBP, sowie CELF1 und MBNL1, welche wichtige Rollen auf sekundärer Ebene des Pathomechanismus spielen, mittels Next Generation Sequencing untersucht. Dabei wurde eine auffällige Variante in DMPK gefunden, keine Varianten in CNBP oder CELF1 und drei Varianten in MBNL1, was auf MBNL1 als Kandidatengen einer alternativen Ursache für DM hinweist. MBNL1 ist ein gewebespezifischer Spleißregulator, welcher einen Wechsel von einem fetalen zu einem adulten Spleißmuster im Muskel steuert. Die Pathogenität einer der Varianten wurde in einem RNA-Spleißassay mit MBNL1-Targetgenen untersucht. Dabei konnten keine spezifischen Spleiß-Effekte festgestellt werden, aber eine Verminderung des Expressionsniveaus im Sinne einer Haploinsuffizienz. Die 3D-Modellierung dieser Variante deutet auf Änderungen der Oberflächenladungen in MBNL1 hin. Der Nachweis der Pathogenität der Varianten und somit die Ursächlichkeit von MBNL1-Mutationen für DM konnte hiermit nicht abschließend geklärt werden. Die gefundenen Ergebnisse regen jedoch hoffentlich zu nachfolgenden Studien an.
Das zweite Projekt dieser Arbeit beschäftigt sich mit Fragestellungen um die FSHD. Diese bildet die dritthäufigste Muskelerkrankung, charakterisiert durch eine oft asymmetrische Schwäche der Muskulatur von Gesicht, Schultergürtel und Oberarmen. Genetisch ist die FSHD Typ 1 (FSHD1) mit einer Kontraktion des Makrosatelliten D4Z4 verknüpft, was eine Relaxation der Chromatinstruktur der Region mit sich bringt und damit die ektopische Expression des apoptotisch wirkenden Proteins DUX4 ermöglicht. Die pathogene Ausprägung dieser Funktionsgewinn-Mutation findet dabei nur in Verbindung mit einem FSHD-permissiven Haplotyp statt.
Auf der Grundlage des gleichen Pathomechanismus wurde eine zweite Form der FSHD (FSHD2) vorgestellt, bei der die Chromatinrelaxation unabhängig von der Länge von D4Z4 durch einen Defekt in dem an der DNA-Methylierung beteiligten Gen SMCHD1 assoziiert sein soll. Die Vererbung von FSHD2 verläuft digenisch mit Mutationen in SMCHD1 und dem FSHD-permissiven Haplotyp auf zwei unabhängigen Loci. Im Rahmen dieser Arbeit wurde eine Kohorte von 55 FSHD1-negativen Patienten mit dem typischen FSHD-Phänotyp untersucht. Dabei wurden der Haplotyp, die Methylierung von D4Z4 sowie das SMCHD1-Gen analysiert. Es konnten neun Patienten mit einem Defekt in SMCHD1 identifiziert werden. In einer zweiten Kohorte von 45 FSHD1-positiven Patienten wurde untersucht, ob SMCHD1-Mutationen auch in Kombination mit einer Kontraktion von D4Z4 vorkommen. Dieser Fall von FSHD1+2 konnte für drei Patienten gezeigt werden, welche außerdem einen auffällig schweren Phänotyp zeigten. SMCHD1 kann also als Modifier-Gen für die Schwere der Erkrankung bei FSHD1 angesehen werden. Damit wurden insgesamt zwölf SMCHD1-Mutationsträger identifiziert, davon sind zehn der Varianten noch nicht beschrieben worden. Für alle erkrankten Mutationsträger konnte eine Methylierung von D4Z4 ≤ 20 % ermittelt werden, was als diagnostisches Kriterium verwendet werden kann. Mit einem Anteil von 16,3 % Mutationsträger in der FSHD1-negetiven Kohorte bildet FSHD2 einen bedeutenden Anteil an dem Krankheitsbild der FSHD, weshalb die entwickelten Analysen in die Routinediagnostik eingegliedert wurden.
Das zweite Teilprojekt der FSHD beschäftigt sich mit der Funktion des SMCHD1-Gens bei der X-Inaktivierung (XI). Es ist bekannt, dass SMCHD1 bei weiblichen Mäusen an der Aufrechterhaltung der XI mitwirkt. Die Untersuchung der XI bei FSHD2-Frauen ergab eine extreme Verschiebung der erwarteten XI von 50:50 auf 0:100 oder 100:0 bei sechs von 13 Patientinnen. Die übrigen sieben zeigten eine XI im Normalbereich von > 20:80 oder < 80:20. Der Befund der einseitigen Verschiebung könnte auf einen negativen Selektionsdruck gegenüber Zellen mit unvollständiger XI hindeuten. Es wäre interessant zu untersuchen, ob sich der gleiche Effekt auch in einer größeren Kohorte wiederfindet und ob er sich mit der Art der Mutation korrelieren lässt. / The clinical presentation of many inherited muscular disorders is often remarkably similar with muscle weakness and wasting as the most prominent everyday problems. By contrast, the genetic basis is highly heterogeneous with so far > 250 identified genes (musclegenetable.org). Even within a defined disease group different genetic causes are found side by side which can be explained by linking into a common pathomechanism. The present thesis deals with different aspects of this genetic heterogeneity using the two common muscular disorders myotonic dystrophy (DM) and facioscapulohumeral muscular dystrophy (FSHD) as examples. It addresses questions on alternative genetic causes and related issues.
The first project of this work is focused on issues related to DM. DM type 1 and DM type 2 (DM1 and DM2) together represent the most frequent muscular disorder in adulthood. Clinically, the disease is characterized by the common symptoms myotonia, muscular weakness and cataract as well as multi organ involvement, making it a multisystemic disorder. The genetic cause of both forms is the expansion of a microsatellite repeat in the untranslated regions of two different genes (DMPK in DM1, CNBP in DM2). The common pathogenic mechanism is based on a toxic gain of function mutation of the expanded RNA transcript.
The two known forms of DM are phenotypically often not distinguishable which is why in many cases molecular genetic testing for both forms must be performed. In addition, the diagnosis of DM is quite challenging due to the need of detecting very large repeat expansions. Furthermore, an exact determination of repeat length in DM2 has so far not been possible. In this study, a test based on the method Molecular Combing was developed for detection of the repeat expansions, which allows for the simultaneous detection of the two loci of DM1 and DM2 in a single assay and in addition for a direct measurement of the repeat length. The Molecular Combing is a fluorescence microscopic single-molecule method which enables for the first time the visualization of the suspected somatic instability in DM2.
The second DM-project deals with the identification of possible alternative genetic causes of the disease. This was investigated by a cohort of 138 DM1- and DM2-negative index patients displaying the typical DM-phenotype. Based on the common pathogenic mechanism, the primary disease genes DMPK and CNBP, as well as CELF1 and MBNL1 which play important roles on a secondary level of the pathomechanism were examined by Next Generation Sequencing. One candidate variant was found in DMPK, no variants in CNBP or CELF1 and three variants in MBNL1, suggesting that MBNL1 is an alternative candidate gene for DM. MBNL1 is a tissue-specific splicing regulator which controls the change from a fetal to an adult splicing pattern in muscle. Pathogenicity of one of the variants was tested in an RNA splicing assay with MBNL1 target genes. No alternative splicing patterns were observed but a reduction in expression levels suggests a haploinsufficiency mechanism. 3D-modelling of this variant suggests a change in surface charge of MBLN1. However, the proof of the pathogenicity of the three variants and thus the causality of MBNL1 mutations as a cause for DM still remains to be confirmed. Hopefully, our observations may foster further studies into this direction.
The second project of this thesis deals with the genetic causes of FSHD. This is the third most common muscular disorder, characterized by often asymmetric weakness of the muscles of the face, shoulder girdle and upper arms. Genetically, FSHD type 1 (FSHD1) is associated with a contraction of the macrosatellite repeat D4Z4 which induces a relaxation of the chromatin structure of the region and thus allows ectopic expression of the apoptotic DUX4 protein. Pathogenicity of this gain-of-function mutation is exclusively associated with a permissive FSHD haplotype.
Based on the same pathomechanism, a second form of FSHD (FSHD2) has been described in which chromatin relaxation is caused by a defect in the SMCHD1 gen that is involved in DNA methylation - independent of the D4Z4 repeat length. The inheritance of FSHD2 is therefore digenic with mutations in SMCHD1 and a FSHD permissive haplotype, located on two different chromosomes. In this study, a cohort of 55 FSHD1-negative patients displaying the typical FSHD phenotype was studied. The haplotype, methylation of D4Z4 and the SMCHD1 gene were analyzed. A number of nine patients with mutations in SMCHD1 could be identified. In a second cohort 45 FSHD1-positive patients were examined, addressing the question, whether SMCHD1 mutations also occur in combination with a contraction of D4Z4. The condition of FSHD1 + 2 was found in three patients who also showed a strikingly severe phenotype. SMCHD1 therefore can be regarded as a modifier gene for disease severity in FSHD1. In total, twelve SMCHD1 mutation carriers were identified in this study with ten novel variants. For all affected mutation carriers methylation of D4Z4 was found to be ≤ 20 % which can be used as a diagnostic criterion. With a proportion of 16.3 % mutation carriers in the FSHD1-negative cohort FSHD2 represents a significant part of the clinical spectrum of FSHD. Based on these findings, a modified algorithm for routine diagnostics of FSHD is presented.
The second FSHD-project deals with the function of the SMCHD1 gene in X-inactivation (XI). It is known that in female mice SMCHD1 is involved in the maintenance of XI. The investigation of XI in FSHD2-women showed an extreme shift of the expected XI of 50:50 to 0:100 or 100:0 in six of 13 patients. The remaining seven patients showed XI in the normal range of > 20:80 or < 80:20. The finding of this one-sided shift could indicate a negative selection pressure against cells with incomplete XI. It would be interesting to investigate whether this effect can be confirmed in a larger cohort and whether it can eventually be correlated with the type of mutation.
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“Dead celebrities are de <em>fac</em>to amusing” : A postmodern analysis of <em>Generation X: Tales for an Accelerated Culture</em>Johansson, Thomas January 2010 (has links)
<p>This essay examines the novel <em>Generation X: Tales for an Accelerated Culture</em> by Douglas Coupland in an attempt to show how it is heavily postmodernist. Postmodernism is explained briefly to give an understanding of how it might be applied to the analysis of the novel. Then the analysis is divided into five different categories: characterization, language and style, setting and society, storytelling and thematic focus. Postmodernist literary theory is applied to various parts of the novel and the postmodernist features are highlighted and discussed. The conclusion is that <em>Generation X: Tales for an Accelerated Culture</em> is indeed a heavily postmodernist novel.</p>
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Spelkaraktär : En kreativ designprocessÖstholm, John January 2009 (has links)
<p>Designprocessen för en ”next-gen”-spelkaraktär är i dag förhållandevis invecklad och innehåller många olika moment innan den når sitt slutgiltiga stadium med en färdig karaktär som resultat. Den här artikeln dokumenterar designprocessen för en spelkaraktär från början till slut och kommer att se mycket till den kreativa men även den tekniska aspekten av detta arbete. Arbetet resulterar i en karaktär som modelleras, skulpteras, animeras och slutligen importeras till Unreal Editor 3.0.</p>
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“Dead celebrities are de facto amusing” : A postmodern analysis of Generation X: Tales for an Accelerated CultureJohansson, Thomas January 2010 (has links)
This essay examines the novel Generation X: Tales for an Accelerated Culture by Douglas Coupland in an attempt to show how it is heavily postmodernist. Postmodernism is explained briefly to give an understanding of how it might be applied to the analysis of the novel. Then the analysis is divided into five different categories: characterization, language and style, setting and society, storytelling and thematic focus. Postmodernist literary theory is applied to various parts of the novel and the postmodernist features are highlighted and discussed. The conclusion is that Generation X: Tales for an Accelerated Culture is indeed a heavily postmodernist novel.
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Study of auxiliary power systemsfor offshore wind turbines : an extended analysis of a diesel gen-setsolutionBerggren, Joakim January 2013 (has links)
Until today the offshore wind power has grown in a steady pace and many new wind farms are being constructed around the globe. An important factor that is investigated today in the industry are the security of power supply to the equipment needed for controlling the offshore system during emergency situations. When a offshore wind farm is disconnected from the external grid and an emergency case occur the wind turbine generators lose their ability to transfer power and they are forced to be taken out of operation. As there are a number of loads in the wind turbines (navigation lights, sensor- and communication-apparatus, ventilation- and heating equipment etc.) they have a load demand which must be supplied in emergency mode. The German Transmission System operator (TSO) TenneT GmbH has set a requirement that the wind turbines is to be supplied by an auxiliary power supply (APS) in 12 hours and therefore there is need for a long-term auxiliary power supply system. This master thesis was assigned to investigate the most feasible APS-system. From the study of a number of different APS's one concept was chosen. This was the diesel gen-set solution placed on an offshore substation at sea. The system was modeled in the software DIgSILENT PowerFactory where a load flow analysis validated the calculated data and a study of the impact of transients in the system was performed.
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Caracterització i regulació transcripcional del gen "pfkfb3"Obach Cortadellas, Mercè 22 May 2007 (has links)
Els resultats que es presenten en aquesta memòria aporten informació que ens permet donar un pas més en el coneixement de la regulació transcripcional del gen pfkfb3 i conseqüentment de la via glucolítica.En primer lloc, hem localitzat els elements de resposta de HIF-1 al promotor del gen i hem observat que aquests eren essencials per a la resposta a la hipòxia en cèl·lules de glioblastoma humà (T98G) i en fibroblasts embrionaris de ratolí (mEF). Seguidament, hem corroborat la implicació de la progesterona en la regulació del gen pfkfb3, que inicialment havien descrit Hamilton i col·laboradors {Hamilton, 1997 #93}. Hem posat de manifest l'augment d'expressió d'uPFK-2 i del seu mRNA en cèl·lules de càncer de mama (T47D) incubades amb la hormona. A més a més, hem determinat que aquest increment era degut a l'acció dels receptors de progesterona (PR, progesterone receptors). Hem localitzat una possible seqüència consens per aquests receptors (PRE, progesterone response element) al promotor del gen pfkfb3, però encara no hem pogut demostrar si el paper que exerceix la progesterona en la regulació d'aquest gen és a nivell transcripcional o a nivell d'estabilització del seu mRNA. Per comprovar els resultats obtinguts en cèl·lules aïllades, hem estudiat la regulació del gen pfkfb3 in vivo, utilitzant com a model d'experimentació animal la soca de ratolins C57/BL6. Els hem tractat amb STZ i hem observat l'increment d'expressió del mRNA del gen pfkfb3, d'uPFK-2, i de la concentració de Fru-2,6-P2 en el fetge d'animals diabètics. Paral·lelament, hem realitzat l'estudi de la regulació transcripcional del promotor del gen pfkfb3, in vivo, utilitzant la tècnica de transferència gènica per hidrodinàmia. Els resultats obtinguts demostren l'augment de la transcripció del gen en el fetge dels ratolins diabètics en condicions de dejuni. A més, hem realitzat estudis immunohistoquímics dels fetges diabètics i controls, demostrant que l'expressió del gen pfkfb3 es produeix principalment en els hepatòcits proliferants de la zona perivenosa del fetge dels ratolins diabètics. També hem estudiat les vies de senyalització que porten a l'augment d'expressió del gen pfkfb3, demostrant que la via PI3K/Akt/mTOR (activa en aquestes cèl·lules altament proliferants) hi té un paper essencial. Aquests resultats obtinguts sobre la regulació del gen pfkfb3, juntament amb els que ja s'havien descrit {Hamilton, 1997 #93}; {Chesney, 1999 #96}; {Atsumi, 2002 #110}; {Riera, 2002 #113}; {Minchenko, 2002 #144}; {Riera, 2003 #114}; {Bando, 2005 #102}; {Telang, 2006 #106}, ens confirmen la importància que té el fenotip glucolític en les cèl·lules proliferants o tumorals. El gen pfkfb3 controla la síntesi de la Fru-2,6-P2 que, com s'ha explicat a la introducció, és l'activador al·lostèric més potent de l'enzim PFK-1. Per tant, podem considerar que el gen pfkfb3 és clau per a la regulació de la via glucolítica, de manera que el seu augment d'expressió en diferents tipus de cèl·lules proliferants i tumorals condueix a l'activació d'aquesta via i, conseqüentment, afavoreix el canvi cap a un fenotip glucolític.
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A Sweet Deal? : A qualitative study regarding the process of empowerment for women who take part in an income generation program in South Lombok, IndonesiaJackson, Karolina January 2012 (has links)
Indonesia signed CEDAW 1980 and ratified it in 1984 making it one of the first countries in South East Asia to do so. Despite legislation and governmental efforts women are still discriminated against in areas such as access to education, resources and credit. Income generation and women´s empowerment have been recognized on an international level as important strategies to enhance gender equality and in the process of alleviating poverty. By using the method of the focus group interview this study examines the process of empowerment for a group of women who take part in an income generation program in South Lombok, organized by a local NGO which uses the CAF methodology of self funded communities. Using Jo Rowlands (1997) empowerment model to analyze the collected data the study identifies encouraging and inhibiting factors to the empowerment process and the changes the process have generated. The study finds that the income generation program provides an important motivation for the women to join and the women experience some empowering impacts due to access to resources. However, it is the educational aspects of the program as well as the social support system that the self-help groups provide that contain the most empowering elements.
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Stewarding the next generation of donors : understanding and engaging generation YMartin, Amy Michelle, 1976- 21 February 2011 (has links)
Nonprofit fundraisers tend to neglect Generation Y as a prospective target audience because they do not feel they provide a worthwhile return on investment. In reality, this age group made over $9 billion in charitable gifts in 2009, and most who made gifts expect to maintain their support in the future (Bhagat, Loeb, and Rovner 2010). Though their giving capacity ranks far behind that of the older generations that make up the majority of nonprofit donor rosters today, as the population ages, older donors will eventually vacate that position and it will be filled by younger donors as they mature in age and means. To establish strong foundations for future support within this cohort, it is important to begin building relationships with them sooner rather than later. Because Generation Y communicates and interacts in significantly different ways from their parents' and grandparents' generations, fundraisers must develop new strategies for reaching and engaging this audience to steward them into long-term giving relationships. / text
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