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Efeito do sexo sobre caracteres quantitativos em megaselia scalaris low (Diptera : Phoridae)Silva, Heriberto Dias da 15 July 2018 (has links)
Orientador : Angelo Pires do Prado / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-15T21:44:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 1992 / Doutorado / Genetica / Doutor em Ciências Biológicas
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Diferenciação morfometrica e evolução de especies de Neosilba (Diptera Lonchae idae)Oliveira, Adalgisa Soares de 17 July 2018 (has links)
Orientador : Hebe Myrina Laghi de Souza / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-17T08:33:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 1992 / Mestrado / Genetica / Mestre em Ciências Biológicas
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Estudos geneticos em amostras de Escherichia coli portadoras do fator de colonização F42Sperandio, Vanessa 18 July 2018 (has links)
Orientador : Wanderley Dias da Silveira / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-18T07:56:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 1993 / Mestrado / Genetica / Mestre em Ciências Biológicas
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Efecto de la humedad edáfica sobre aspectos morfológicos y funcionales de tres leguminosas patagónicas relativos a su uso y conservaciónStronati, Mónica Susana 22 December 2009 (has links)
La conservación de la biodiversidad y el control de la desertificación en la Patagonia tienen necesariamente que estar unidos a la identificación de las especies que potencialmente puedan ser utilizadas. El objetivo general fue el de evaluar el efecto de distintos niveles de disponibilidad de agua en la germinación, establecimiento y supervivencia de las especies estudiadas, y sobre su eventual potencialidad para fijar N. Asimismo se estudiaron la posible existencia de caracteres xeromórficos y/o especializaciones en sus tejidos que les permiten persistir y que posibilitan la fijación de N en distintas condiciones de déficit hídrico. Las poblaciones naturales de Astragalus cruckshanksii (Hook. et Arn.) Griseb., Glycyrrhiza astragalina Gillies ex Hooker et Arnott y Adesmia lotoides Hook.f., vegetan en distintas localidades de la Provincia Fitogeográfica Patagónica donde se colectó semillas y suelo rizosférico de las tres especies en distintas oportunidades para realizar los estudios. Además porciones de plantas de A. lotoides. Se estudió la germinación y la emergencia. Se realizó un ensayo de respuesta a un gradiente de humedad de plantas de las especies en estudio que se llevo a cabo en el exterior y solo cubiertas de la lluvia. Mientras duró el ensayo se estudió la supervivencia.
A la finalización del ensayo en las plantas de todos los tratamientos, se determinó longitud de tallo, número de hojas y folíolos por hoja, superficie foliar, ramificaciones, número de nódulos, longitud de raíz principal, número y longitud de raíces laterales, materia seca de vástago y raíz. Se extrajeron muestras tisulares para futuros estudios. Se registró la nodulación, la fijación biológica del nitrógeno y el contenido de nitrógeno total. G. astragalina y A. lotoides son plantas rizomatosas que en la primera etapa de su desarrollo poseen la base del tallo o corona que sería similar a lo descrito para A. cruckshanksii. Todas las especies mostraron zonas subterráneas con yemas para la permanencia y el crecimiento.
Con menor contenido de humedad edáfica se produjo menos masa de tejido meristemático, lo que determinó un menor desarrollo del banco de yemas y menor diferenciación de tejido secundario. A su vez generó células de menor tamaño y produjo folíolos más delgados.
A. cruckshanksii y A. lotoides vieron dificultado el proceso de germinación a partir de -0,8 MPa, G. astragalina disminuyó su potencial germinativo a partir de -0,4 MPa. A. cruckshanksii fue la especie que evidenció mejor comportamiento en la emergencia. Las especies son afectadas, por la disponbilidad de agua, en los parámetros estudiados pero es probable que posean caracteres genéticos adaptativos al déficit hídrico.
El estudio realizado demostró la supervivencia, infectividad y efectividad de las cepas de Rhizobium nativo, y por otro lado la capacidad de nodular por parte de las leguminosas estudiadas en las condiciones de déficit hídrico en que se desarrollaron durante el estudio. A. lotoides fue la que mayor porcentaje de N total asimiló en la biomasa subterránea de plantas de 15 % de humedad edáfica. / Biodiversity conservation and desertification control in Patagonia must necessarily be related to the identification of plant species that could be used for this purpose.
The general objective of this work was to evaluate different levels of water disponibility effects on germination, establishment and survival of the studied species and their eventual potentiality for N fixation. It was also studied the possible existence of xeromorphic characters and/or tissue specializations that could allow them to persist and fix N at different conditions of water stress. Natural populations of Astragalus cruckshanksii (Hook. et Arn.) Griseb., Glycyrrniza astragalina Gillies ex Hooker et Arnott and Adesmia lotoides Hook.f., can be found at different locations of the Phytogeographic Province of Patagonia, where seeds and rhizospheric soil of the three species were colected at different times, as well as portions of A. lotoides individuals, in order to develop this study. Germination and emergency were determined. Trials for moisture gradient response was conducted for all the plant species. For all the treatments stem long, leaves and leaflets numbers, leaf surface, ramifications, nodes number, main and laterals root long. were registered. There were taken tissue samples for further analysis and dry matter from shoot and root, nodulation was registered, as well as N biological fixation and N total content.
G. astragalina and A. lotoides are rhizomatic plants that during the first stage of their development have a stem base or crown that could be similar to the one described for A. cruckshanksii. All species shown underground areas with buds for persistence and growing. At lower levels of soil moisture, less mass of meristematic tissue was formed. This conducted to a lower development of buds bank and least differentiation of secondary tissue which in turn generated smaller cells and thinner leaflets. Germination was hampered in A. cruckshanksii and A lotoides from -0,8 MPa, and G. astragalina decreased its germination potential from -0,4 MPa. A.cruckshanksii was the species that shown the best emergency behavior.
Plants are affected by water disponibility at the analyzed parameters, but it is possible that they could present genetic adaptatives characters to water deficit. The study also demonstrated survival, infectivity and efectivity of native Rhizobium strains, and, on the other hand, nodulation capacity of Legumes analyzed at the water deficit conditions of the treatments. A. lotoides got the highest total N percentage in the underground biomass at the 15% soil moisture treatment.
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Caracterización de 21 marcadores STR autosómicos en una población peruana inmersa en un proceso judicial aplicado a la práctica forenseDelgado Ramos, Edgardo January 2019 (has links)
Señala que en la práctica forense son utilizados los marcadores del tipo STR por su gran poder discriminativo para identificar genéticamente a personas involucradas en un proceso judicial, en el Perú actualmente se utilizan un mínimo de 20 STRs de acuerdo a las recomendaciones del CODIS. En el presente estudio se caracterizaron 21 marcadores STR autosómicos del kit Globalfiler express, en una población peruana mestiza con aplicación a la práctica forense. Las frecuencias alélicas absolutas fueron estimadas en 300 individuos no emparentados provenientes de diferentes provincias del Perú. Con los datos obtenidos se realizó un análisis de los parámetros estadísticos forenses como el poder de discriminación (PD), poder de exclusión (PE), contenido de información polimórfica (PIC), heterocigosidad observada (Ho) y heterocigosidad esperada (He). Todos los loci estudiados estuvieron en equilibrio de Hardy-Weinberg, tras aplicar la corrección de Bonferroni a los marcadores D10S1248 y D2S1338. El marcador SE33 resulto el más polimórfico con un índice de 90.95%, mientras que el menor índice se registró en el marcador D22S1045 con el 50.71%. La población peruana presento alelos que no se observan en la población hispana, entre estos alelos tenemos al 29.2 y 35.2 del marcador D21S11, alelos 17, 25.3 y 49.2 en el marcador FGA, el alelo 15 en el marcador D5S818, el alelo 11 en el marcador D3S1358, el alelo 18 en el marcador D10S1248, los alelos 17.2, 19.2 y 23 en el marcador SE33. Asimismo, existen algunos alelos que se observaron en la población hispana y no se registraron en la población peruana como los alelos 11, 12 y 17.3 en el marcador vWA, los alelos 24.2, 28.2, 33 y 35 en el marcador D21S11. El poder de discriminación total fue mayor a 99.99999% y el poder de exclusión total fue de 99.99997%. Existe diferencia de 2.9357% entre las frecuencias alélicas absolutas de la población mestiza peruana y la población hispana, esta diferencia es significativa en los cálculos probabilísticos de vínculos biológicos y en la identificación genética. / Tesis
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O gene PHF21B como candidato a predisposição familia em familial em cânceres de cabeça e pescoçoBertonha, Fernanda Bernardi [UNESP] 29 July 2008 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2008-07-29Bitstream added on 2014-06-13T18:43:18Z : No. of bitstreams: 1
bertonha_fb_me_botib.pdf: 504598 bytes, checksum: 9ed1f9c804559ef99cf5530f8969c8f2 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Os carcinomas de células escamosas de cabeça e pescoço (CCECP) constituem 90% de todos os cânceres de cabeça e pescoço e estão associados a altas taxas de mortalidade, devido ao seu alto potencial infiltrativo. Este é o sexto tumor mais incidente na população Brasileira. Pouca atenção tem sido dada a fatores hereditários envolvidos em sua etiologia, mas estudos iniciais revelaram que os carcinomas orais tendem a se agregar em famílias. Evidências adicionais são fornecidas pela ocorrência de múltiplos tumores primários em pacientes com CCECP, pela associação com história familial, aparecimento precoce da doença e por membros afetados sem hábitos tabagista e etilista. Em estudos prévios do grupo foi descrita uma associação entre a perda de 22q e história familial de câncer em pacientes com CCECP, após análise citogenética, análise de LOH e PCR quantitativa em tempo real. O gene PHF21B (PHD finger protein 21B), mapeado em 22q13.31, codifica uma proteína reguladora transcricional e foi selecionado como um gene candidato associado a predisposição familial em CCECP. Os resultados da PCR quantitativa em tempo real mostraram associação estatisticamente significativa com relação à perda de seqüências do gene e história familial de câncer em parentes de 1º grau (P<0,0001). Estes dados sugerem que o PHF21B é um gene supressor tumoral candidato envolvido com história familial em carcinomas de cabeça e pescoço. Para investigar a inativação de um gene supressor tumoral (Knudson, 1971), foram selecionados 13 pacientes com CCECP que mostravam história familial positiva de câncer e outros 14 casos sem história familial. Foram considerados como critério para história familial positiva: parentes de primeiro e segundo graus com câncer; não-fumantes e não-consumidores de álcool; idade igual ou inferior a 56 anos quando do diagnóstico... / Head and neck squamous cell carcinomas (HNSCC) represents 90% of all cancers and are associated with high mortality, due to high infiltrative potential. This tumor is the sixth most incident in the Brazilian population. Little attention have been given to hereditary factors involved in their etiology, but early studies showed that oral carcinomas tend to aggregate themselves in families. Additional evidences are provided for primary multiple tumors occurrence in HNSCC patients, to family history association, early disease development and no tobacco and alcohol consumptions. Previously we described an association between 22q loss and cancer family history in HNSCC patients by cytogenetics, LOH and real time PCR analysis. The PHF21B gene (PHD finger protein 21B), mapped at 22q13.31, codifies a transcriptional regulatory protein and was selected as a putative gene associated with HNSCC familial predisposition. The real time PCR results showed statistical significant association related to gene loss and first degree family history (P<0,0001). This data suggests that PHF21B is a tumor suppressor gene candidate involved in HNSCC family history. To investigate the tumor suppressor gene inactivation (Knudson, 1971), were selected 13 HNSCC patients that had positive cancer family history and other 14 without HNSCC family history. It was considered for positive family history: first and second relatives with cancer; no tobacco and alcohol users; age 56 or less at diagnosis. Investigation analysis was performed by direct sequencing at exons: 7, 8 and 9. These exons were selected for its relation to PHD zinc-finger domain, responsible for PHF21B protein function. No mutations or significative variations were found in these exons. The SNPs (single nucleotide polymorphisms) analysis in gene extension showed a reduced SNPs number in exonic regions, however 16 SNPs were found at 3´UTR region... (Complete abstract click electronic access below)
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Parâmetros genéticos, índices de seleção e diversidade genética de genótipos de cevada irrigada no CerradoSayd, Ricardo Meneses 13 March 2018 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2018. / Submitted by Fabiana Santos (fabianacamargo@bce.unb.br) on 2018-08-22T19:33:34Z
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2018_RicardoMenesesSayd.pdf: 2343312 bytes, checksum: 8f083e0c024f093820a0aa626c23e89d (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2018-08-27T20:55:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1
2018_RicardoMenesesSayd.pdf: 2343312 bytes, checksum: 8f083e0c024f093820a0aa626c23e89d (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-27T20:55:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2018-08-22 / A demanda por cultivares de cevada cervejeira adaptadas ao cultivo irrigado no Cerrado tem crescido de forma constante. Cultivares oriundas da região Sul do país têm sido introduzidas e avaliadas na região a fim de suprir essa demanda instantânea. Com o objetivo de fornecer melhores condições de cultivo ao sistema produtivo do Cerrado, esse trabalho propôs estimar os parâmetros genéticos em diferentes anos e locais a fim de subsidiar uma seleção criteriosa dos genótipos mais aptos a essas condições e analisar a variabilidade genética existente entre eles com base em dados agronômicos e moleculares. Primeiramente foram avaliadas seis características agronômicas (rendimento de grãos, classificação comercial de grãos, peso de mil sementes, altura de plantas, grau de acamamento e ciclo de espigamento) de 113 genótipos de cevada cervejeira em dois ambientes no Cerrado do Distrito Federal com o objetivo de estimar os parâmetros genéticos (valores de F, herdabilidade em sentido amplo, coeficiente de variação ambiental, genotípico e relativo e as correlações fenotípicas, genotípicas e ambientais). A partir dos dados desse primeiro trabalho, foram selecionados 69 genótipos utilizando as características avaliadas. Em um segundo momento, foram avaliados os parâmetros genéticos dos 69 genótipos considerando três anos de avaliações utilizando as mesmas características agronômicas com intuito de verificar a influência dos anos agrícolas no comportamento dos genótipos. Baseado nos dados obtidos nos cinco ensaios realizados, os genótipos foram selecionados por um método proposto pelo melhorista (Seleção Combinada) que foi comparado a quatro índices de seleção (índice livre de pesos e parâmetros, índice dos ganhos desejados, soma de ranks e genótipoideótipo). Foram gerados índices de frequência de seleção e os métodos foram comparados em relação ao ganho de seleção em % para cada experimento. Foram selecionados 20 genótipos de alto rendimento agronômico além de quatro genótipos a serem utilizados como genitores em blocos de cruzamentos por apresentarem uma ou duas características importantes para o melhoramento de cevada. Foram realizados estudos de diversidade genética agronômica e molecular dos 24 genótipos selecionados acrescidos de cinco cultivares de cevada recomendadas para o Cerrado. Os dados agronômicos foram obtidos em dois locais do Distrito Federal utilizando a distância de Mahalanobis. Para a análise de diversidade genética molecular os dados foram obtidos utilizando marcadores moleculares RAPD, SSR e ISSR. A partir dos dados obtidos foram gerados dendrogramas e gráficos de dispersão tanto para a diversidade agronômica como para os dados moleculares, possibilitando através das análises indicar os cruzamentos que possam ter maior efeito heterótico. Os resultados indicaram a existência de variabilidade entre os acessos avaliados, assim como efeito da interação G x A tanto na comparação de locais como em anos. Os genótipos de origem colombiana mostraram-se mais aptos em relação aos demais. Verificou-se que é possível a seleção de acessos de cevada com alto rendimento e ciclo de espigamento precoce simultaneamente, fator decisivo no processo de escolha de genótipos a seguirem em futuros experimentos. No estudo de diversidade observouse a baixa correlação entre as distâncias genéticas, e que os marcadores ISSR correlacionouse positivamente com as distâncias agronômicas. É necessário a realização de estudo de diversidade complementar entre características agronômicas e marcadores moleculares para indicação dos melhores cruzamentos através de genótipos com a maior variabilidade possível. / A demand for breeding barley cultivars adapted as irrigated Cerrado conditions is constant. Cultivars from the southern area of the country have been tested in the Cerrado region aiming to supply this immediate demand. With the purpose of providing better conditions for this production system, this work proposes to estimate genetic parameters in different years and environments in order to promote a careful selection of more suitable genotypes to these conditions and to analyze the existing genetic variability among them based on agronomic and molecular data. First, six agronomic characteristics (grain yield, plumpness kernel, thousand seed weight, plant height, lodging degree and days to heading) of 113 brewery barley genotypes were evaluated in two environments in the Cerrado of the Distrito Federal, focusing on estimating the genetic parameters (F values, heritability in broad sense, environmental, genotypic and relative variation coefficients). Based on the data from the first trial, 69 genotypes were selected based on the evaluated characteristics. In a second experiment, the genetic parameters of the 69 genotypes were evaluated considering three years of evaluations using the same agronomic characteristics. Based on the data obtained in the five experiments, the genotypes were selected by a method proposed by the breeder and compared to four selection indices (free index of weights and parameters, desired earnings index, rankings sum and genotype-ideotype) that served as basis for the accomplished selection. Frequency indices of selection were generated, and methods were compared to the selection gain for each experiment. Twenty genotypes of high agronomic yield were selected, as well as four genotypes to be used as parents in crossbred blocks since they presented one or two important traits for barley breeding. Genetic diversity studies were carried out for the 24 selected genotypes plus five barley cultivars recommended for the Cerrado, based on agronomic data from two locations in the Federal District, using Mahalanobis distance. For the analysis of molecular genetic diversity, the data was obtained using molecular markers RAPD, ISSR and SSR. From the obtained data were generated dendrograms and dispersion graphs for both agronomic diversity and for the molecular data, allowing, through the analysis, to indicate the crosses that could have greater heterotic effect. The results indicated the existence of variability among the accessions, as well as the interaction effect G x E in both location and year comparisons. The genotypes of Colombian origins were more apt in relation to the others. It was verified that the selection of accessions of barley with high yield and early breeding cycle simultaneously is possible, which is a decisive factor in the process of choosing genotypes to survey in future experiments. The diversity study detected a low correlation between genetic distances, and that ISSR markers correlated positively with the agronomic distances. It is necessary to carry out a study of complementary diversity between agronomic traits and molecular markers to indicate the best crosses through genotypes with the greater variability.
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O gene PHF21B como candidato a predisposição familia em familial em cânceres de cabeça e pescoço /Bertonha, Fernanda Bernardi. January 2008 (has links)
Orientador: Silvia Regina Rogatto / Banca: Benedito Mauro Rossi / Banca: Ivan de Godoy Maia / Resumo: Os carcinomas de células escamosas de cabeça e pescoço (CCECP) constituem 90% de todos os cânceres de cabeça e pescoço e estão associados a altas taxas de mortalidade, devido ao seu alto potencial infiltrativo. Este é o sexto tumor mais incidente na população Brasileira. Pouca atenção tem sido dada a fatores hereditários envolvidos em sua etiologia, mas estudos iniciais revelaram que os carcinomas orais tendem a se agregar em famílias. Evidências adicionais são fornecidas pela ocorrência de múltiplos tumores primários em pacientes com CCECP, pela associação com história familial, aparecimento precoce da doença e por membros afetados sem hábitos tabagista e etilista. Em estudos prévios do grupo foi descrita uma associação entre a perda de 22q e história familial de câncer em pacientes com CCECP, após análise citogenética, análise de LOH e PCR quantitativa em tempo real. O gene PHF21B (PHD finger protein 21B), mapeado em 22q13.31, codifica uma proteína reguladora transcricional e foi selecionado como um gene candidato associado a predisposição familial em CCECP. Os resultados da PCR quantitativa em tempo real mostraram associação estatisticamente significativa com relação à perda de seqüências do gene e história familial de câncer em parentes de 1º grau (P<0,0001). Estes dados sugerem que o PHF21B é um gene supressor tumoral candidato envolvido com história familial em carcinomas de cabeça e pescoço. Para investigar a inativação de um gene supressor tumoral (Knudson, 1971), foram selecionados 13 pacientes com CCECP que mostravam história familial positiva de câncer e outros 14 casos sem história familial. Foram considerados como critério para história familial positiva: parentes de primeiro e segundo graus com câncer; não-fumantes e não-consumidores de álcool; idade igual ou inferior a 56 anos quando do diagnóstico... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Head and neck squamous cell carcinomas (HNSCC) represents 90% of all cancers and are associated with high mortality, due to high infiltrative potential. This tumor is the sixth most incident in the Brazilian population. Little attention have been given to hereditary factors involved in their etiology, but early studies showed that oral carcinomas tend to aggregate themselves in families. Additional evidences are provided for primary multiple tumors occurrence in HNSCC patients, to family history association, early disease development and no tobacco and alcohol consumptions. Previously we described an association between 22q loss and cancer family history in HNSCC patients by cytogenetics, LOH and real time PCR analysis. The PHF21B gene (PHD finger protein 21B), mapped at 22q13.31, codifies a transcriptional regulatory protein and was selected as a putative gene associated with HNSCC familial predisposition. The real time PCR results showed statistical significant association related to gene loss and first degree family history (P<0,0001). This data suggests that PHF21B is a tumor suppressor gene candidate involved in HNSCC family history. To investigate the tumor suppressor gene inactivation (Knudson, 1971), were selected 13 HNSCC patients that had positive cancer family history and other 14 without HNSCC family history. It was considered for positive family history: first and second relatives with cancer; no tobacco and alcohol users; age 56 or less at diagnosis. Investigation analysis was performed by direct sequencing at exons: 7, 8 and 9. These exons were selected for its relation to PHD zinc-finger domain, responsible for PHF21B protein function. No mutations or significative variations were found in these exons. The SNPs (single nucleotide polymorphisms) analysis in gene extension showed a reduced SNPs number in exonic regions, however 16 SNPs were found at 3'UTR region... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Caracterización molecular de cepas aisladas de dengue 2 en Perú; 2000-2010Cruz Malpica, Cristhopher Donat's January 2013 (has links)
El virus Dengue (VDEN) es el responsable de más de 50-100 millones de casos anualmente en el mundo. La infección del dengue es causada por cuatro serotipos (VDEN-1, VDEN-2, VDEN-3 y VDEN-4) y el espectro de la enfermedad varía desde una fiebre indiferenciada, fiebre hemorrágica por dengue (FHD), síndrome de shock por dengue, y muerte. Información epidemiológica liga el desarrollo de FHD con una infección secundaria y además sugiere que ciertas cepas son más virulentas que otras. En 2001, aparecieron los primeros casos de FHD asociados con VDEN-2 en la costa del Perú. En el 2010 ocurrió un brote en Iquitos con casos severos convirtiéndose en el más largo en la historia de la región. Sin embargo estudios orientados en determinar el origen distribución y diversidad genética de cepas peruanas de VDEN-2 durante los diez últimos años no han sido realizados. Para atender este vacío de conocimiento en la epidemiología del
VDEN-2 en Perú, extractos de ARN de 30 aislamientos virales en células C6/36 (Aedes albopictus) fueron procesados por RT-PCR. Secuencias del gen de la envoltura (E) fueron determinadas y comparadas con muestras globales de VDEN-2. El análisis filogenético reveló la circulación de dos genotipos en Perú: Americano (hasta el 2000) y Americano/Asiático (2000- 2010). Adicionalmente se identificaron cepas variantes del genotipo Americano/Asiático distribuidos en dos clados principales (1 y 2) que ingresaron al Perú por la costa norte (Ecuador) y por la selva (Brasil o Bolivia). Con el aparente incremento de la virulencia relacionada a cepas Americano/Asiático del clado 2, nuestros resultados soportan la necesidad de un continuo monitoreo de cepas emergentes de nuevos variantes o genotipos de dengue que podrían estar asociados a casos severos de la enfermedad.
Palabras claves: Arbovirus, Dengue 2, Americano/Asiático y relación filogenética.
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Identificación de polimorfismos del gen tlr4 en crías de alpacas con cuadros de neumonías por Pasteurella multocidaGuzmán Masias, Karol Patricia January 2011 (has links)
Las neumonías son la segunda causa de mortalidad en crías de alpacas, esta es causada por agentes virales y bacterianos que coexisten en los procesos infecciosos generando cuadros de neumonías agudas. Pasteurella multocida es la principal bacteria involucrada en las infecciones neumónicas en alpacas, seguida de Mannhemia haemolytica, ambos agentes generan cuadros hiperagudos en crías en época de parición, y afectando a crías más grandes en épocas de estrés. Sin embargo se ha demostrado su asociación con la presencia de virus neumopatógenos como BRSV. Los receptores tipo Toll (TLR, por sus siglas en inglés) son proteínas transmembrana que se encuentran en diversos tipos celulares. Los genes que codifican esta proteína están altamente conservados a lo largo de las diferentes especies, siendo el TLR4 la proteína que reconoce al LPS, estructura que poseen todas las bacterias gram negativas (Pasteurella multocida y Mannhemia haemolytica) y a la proteína F del BRSV. En alpacas no se ha identificado la presencia de este gen, por lo que en el estudio se diseñaron cebadores para poder identificar la presencia del gen en esta especie. Al obtener la secuencia del gen en alpacas permitió analizar y comparar las secuencias obtenidas entre individuos y entre especies, observando el alto grado de conservación de la secuencia del gen tlr4 entre especies. No se logró detectar polimorfismos tipo SNP entre animales enfermos y sanos, pero se pudo determinar SNP en individuos mostrando genotipos GT y GC.
Palabras Clave: alpacas, neumonías, Pasteurella multocida, Mannhemia haemolytica, BRSV, tlr4, polimorfismos. / --- Pneumonias are the second leading cause of mortality of babies’ alpacas; this is caused by viral and bacterial agents that coexist in infectious processes causing acute pneumonia. Pasteurella multocida is the main bacteria involved in pneumonia infections in alpacas, followed by Mannhemia haemolytica, both agents in hyperacute cases generate death of offspring during calving season and stressful times. However this association has the participation of differences virus likes BRSV. Toll-like receptors (TLR) are transmembrane proteins found in various cell types. The genes encoding this protein are highly conserved across different species. The protein TLR4 recognizes LPS, a structure which have all gram-negative bacteria (Pasteurella multocida and Mannhemia haemolytica) and the F protein of BRSV. In alpacas has not identified the presence of this gene, so that the study primers were designed to identify the presence of the gene in this species. We had obtained the sequence of the gene in alpacas allowed analyzing and comparing the sequences obtained between individuals and between species, noting the high degree of conservation of TLR4gene sequence between species. We could not to detect polymorphisms sort of SNP between sick and healthy animals, but we were able to determine SNP genotypes in individuals showing GT and GC.
Key Words: alpacas, pneumonia, Pasteurella multocida, Mannhemia haemolytica, BRSV, tlr4, polymorphism.
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