Submitted by ALEXANDRIUS DE MORAES BARBOSA null (alexandriusmb@yahoo.com.br) on 2017-04-11T18:03:28Z No. of bitstreams: 1 Tese_Alexandrius_de_Moraes_Barbosa.pdf: 6312773 bytes, checksum: 8fa7ab196e23dc84217434a3a267b570 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-04-17T19:16:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 barbosa_am_dr_bot.pdf: 6312773 bytes, checksum: 8fa7ab196e23dc84217434a3a267b570 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-17T19:16:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 barbosa_am_dr_bot.pdf: 6312773 bytes, checksum: 8fa7ab196e23dc84217434a3a267b570 (MD5) Previous issue date: 2017-02-17 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A produção mundial de energia necessita aumentar no mínimo 50% até 2050 de modo a se atender crescimento populacional e o desenvolvimento econômico. Uma das estratégias será aumentar a eficiência da conversão de energia solar em fito-energia, no entanto, ainda faz se necessário conhecer qual a real eficiência deste processo à campo e como o ambiente de produção pode influenciá-lo, principalmente na cultura da cana-de-açúcar, que é a principal matéria-prima no Brasil. Nesse sentido o objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito do ambiente de produção na eficiência da conversão de energia solar em fito-energia em três cultivares de cana-de-açúcar. Adotou-se o delineamento experimental em blocos ao acaso no esquema fatorial 2x3, tendo dois ambientes de produção (A e C) e três cultivares de cana-de-açúcar (SP80-3280, RB855156 e RB867515). Foram avaliados dois ciclos de cultivo (cana-planta, março de 2014 a maio de 2015; cana-soca, maio de 2015 a junho de 2016). Aos 150, 285 e 415 dias após o plantio (DAP) e 150, 180 e 380 dias após a colheita (DAC) foi avaliado a produtividade de biomassa (MSPA), eficiência de uso da radiação (EUR) e eficiência da conversão de energia solar em fito-energia (EC). A produtividade de colmos na cana-planta e cana-soca foi 30,2 e 28,9% maior no ambiente de produção A, enquanto que a produtividade de MSPA foi de 11,2 e 21,9% na cana-planta e cana-soca nos ambientes de produção A e C, respectivamente. Apesar do ambiente de produção A ter recebido 5,2 e 5,8% menos radiação solar do que o ambiente de produção C na cana-planta e cana-soca, observou-se que a EUR e a EC foi maior em todas cultivares no ambiente de produção A nos dois ciclos de cultivo. A EC média das cultivares foi de 3,84 e 2,93% na cana-planta e de 3,42 e 2,24% na cana-soca nos ambientes A e C, respectivamente. A EC foi maior no ambiente de produção A devido a maior fração da radiação solar difusa, maior disponibilidade de água e fertilidade do solo. / World energy production needs to increase by at least 50% until 2050, to meet population growth and economic development. One of the strategies will be to increase the conversion efficiency of solar energy to phyto energy, however, it is still necessary to know the real efficiency of this process in the field and how the production environment can influence it, especially in sugarcane, which is the main raw material in Brazil. In this sense, the objective of this work was to evaluate the effect of production environment on efficiency of the conversion of solar energy to phyto-energy in three cultivars of sugarcane. It was used a design of complete block randomized in the 2x3 factorial scheme, with two production environments (A and C) and three sugarcane cultivars (SP80-3280, RB855156 and RB867515). Two cultivation cycles (cane-plant, from March 2014 to May 2015, cane-ratoon, from May 2015 to June 2016) were evaluated. At 150, 285 and 415 days after planting (DAP) and 150, 180 and 380 days after harvest (DAH) the biomass productivity (DMAP) the radiation use efficiency (RUE) and efficiency of the conversion of solar energy to phyto-energy (EC). The stalks production in cane-plant and cane-ratoon was 30,2 and 28,9% higher in production environment A, while DMAP yield was 11,2 and 21,9% in cane-plant and cane-ratton in production environments A and C, respectively. Although the production environment A received 5,2 and 5,8% less solar radiation than the production environment C in cane-plant and cane-ratoon, it was observed that the RUE and EC was higher in all cultivars in the production environment A in both crop cycles. The average EC of the cultivars was 3.84 and 2.93% in cana-plant and 3,42 and 2,24% in cane-ratoon in productions environments A and C, respectively. The EC was higher in the production environment A due to higher fraction of diffuse solar radiation, higher water availability and soil fertility. / FAPESP: 2013/13031-1

Introdução: Mais do que 50% dos pacientes infectados pelo vírus da hepatite crônica C (HCV) não respondem ao tratamento com interferon convencional (IFN) associado a ribavirina (RBV). O objetivo do nosso estudo foi avaliar a efetividade do retratamento com alfapeginterferona 2a ou 2b (PEG-IFN 2a ou 2b) concomitantemente com RBV, em pacientes com HCV, genótipo 2 e 3, que foram não-respondedores ou recidivantes ao primeiro tratamento convencional com IFN/RBV e identificar possíveis fatores preditivos de resposta virológica sustentada (RVS). Métodos: No período de setembro de 2003 a março de 2009 uma coorte de 216 pacientes portadores de hepatite C foram acompanhados em um serviço especializado, implementado no Sistema Único de Saúde-Rio Grande do Sul/Brasil. Todos os pacientes foram retratados com PEG-IFN 2a ou 2b, na dose de 180 mcg ou 1,5 mcg/Kg de peso corporal por semana, respectivamente, associado a RBV na dose de 1.000-1.250mg/dia por 48 semanas. O HCV-RNA foi testado por Polymerase Chain Reaction (PCR) nas semanas 12 (por PCR quantitativo), 48 e 72 (por PCR qualitativo). A resposta virológica (RV) nas 48 semanas e a RVS nas 72 semanas foram considerados para avaliação de eficácia do tratamento. As análises foram realizadas nos pacientes que receberam pelo menos 1 dose de PEG-IFN 2a ou 2b. Resultados: A taxa de RVS para os não-respondedores ao primeiro tratamento foi de 34,4% e para os recidivantes foi de 50% (P=0,031) através do teste exato de Fisher. Foram identificados como fatores preditivos que contribuem na melhora da RVS, a idade (P=0,005), ser recidivante ao tratamento anterior (P=0,023) e apresentar exame de biópsia hepática Metavir F0-F2 (P=0,004), os demais fatores avaliados não demonstraram diferença estatística significativa. Na avaliação do perfil de segurança 51 pacientes (23,6%) interromperam precocemente o tratamento. Destes, 18,5% por eventos adversos onde os mais freqüentes foram anormalidades laboratoriais (40%), óbito (20%) e cirrose descompensada (17,5%). Conclusões: Este é o primeiro estudo pragmático realizado no cenário da realidade do SUS brasileiro que avalia a efetividade do retratamento com PEG-IFN 2a ou 2b e RBV. Esta alternativa de retratamento para pacientes que falharam à terapias prévias anti-HCV, tem demonstrado uma promissora taxa de RVS, desde que seja feita uma seleção cuidadosa dos pacientes com fatores preditivos de resposta e monitorizados os eventos adversos.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:52:23Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6691_1.pdf: 1642955 bytes, checksum: 98614c8a4454fa030de2f193ee5c3589 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Trata-se de dois estudos realizados em pacientes com infecção crônica pelo vírus da hepatite B, com idade média de 50 anos, sendo 37 (66%) do sexo masculino, provenientes do ambulatório de hepatologia do Hospital das Clínicas da Universidade Federal de Pernambuco. O primeiro estudo teve como objetivo identificar a distribuição subgenotípica do vírus da hepatite B (HBV) e elaborar estudo evolutivo através da confecção da árvore filogenética. O segundo objetivou avaliar a correlação entre os níveis séricos do antígeno de superfície do vírus da hepatite B (HBsAg) e a quantificação do HBV DNA (viremia). No primeiro estudo as amostras foram submetidas à extração do DNA e um fragmento de 1306 pares de bases compreendendo parcialmente o HBsAg e as regiões codificadoras da polimerase (S/POL) foi extraído e amplificados por nested PCR. As sequências foram subgenotipadas através da reconstrução filogenética, usando sequências e referências de cada genótipo obtidas do GenBank(n=267), e submetidas à análise Bayesiana a fim de inferir a dinâmica e o tempo de evolução linhagem-específica. No primeiro estudo, identificou-se que o subgenótipo A1 foi o de maior prevalência (78%), e de acordo com a disposição dos mesmos na árvore filogenética, admite-se que provêm de uma linhagem ancestral comum. A análise Bayesiana sugere que provavelmente foi introduzido em nossa região através da imigração de escravos provenientes da África, uma vez que, esse genótipo também é prevalente no continente africano. O segundo estudo teve como objetivo avaliar a correlação entre os níveis séricos do HBsAg e o HBV DNA (viremia) em pacientes com infecção crônica pelo HBV. As amostras foram submetidas à quantificação sérica do HBsAg por ensaio imuno-enzimático por quimioluminescência com micropartículas, as aminotransferases foram quantificadas pelo método cinético automatizado e a quantificação do HBV DNA foirealizada pelo método de PCR real- time (SITNIK et al, 2010). Identificou-se correlação entre os testes HBsAg quantitativo e o HBV DNA (viremia) (p = 0, 0500), como também, entre os níveis séricos do HBsAg e os valores da alanina aminotransferase (ALT) (p = 0, 0306). Estes dados sugerem que a quantificação do HBsAg pode ser considerada ferramenta para avaliação da replicação do vírus da hepatite B, assim como para avaliação da atividade bioquímica da infecção por este agente

Orientadores: Reginaldo Bruno Gonçalves, Cristiane Duque / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-16T07:13:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sardi_JanainadeCassiaOrlandi_D.pdf: 1215494 bytes, checksum: 51470817af2a54ba8f45aa4374a2e52f (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: Candida spp. são leveduras comensais que habitam diferentes sítios da cavidade bucal. Em indivíduos saudáveis, sem alterações imunológicas, esses microrganismos não causam doença. Entretanto, diante de condições imunossupressoras, essas leveduras podem se tornar mais virulentas e expressar patogenicidade. Espécies de Candida apresentam diversos fatores de virulência, incluindo mecanismos de adesão e invasão celular associado à produção de enzimas que auxiliam na degradação tecidual e facilitam sua proliferação na mucosa bucal. Estudos têm demonstrado a presença de Candida sp. em sítios periodontais de pacientes com periodontite crônica, principalmente quando estes são imunologicamente comprometidos. Entretanto, ainda é desconhecido o papel desses microrganismos na patogênese da doença periodontal. Os objetivos do presente trabalho foram: 1) identificar a presença de espécies de Candida e periodontopatógenos por PCR em sítios bucais de pacientes diabéticos ou não com periodontite crônica; 2) isolar cepas de Candida albicans desses pacientes e avaliá-las quanto à atividade das enzimas proteinase, fosfolipase e hemolisina e os graus de hidrofobicidade da superfície celular, sob diferentes condições atmosféricas, além de realizar a análise genotípica desses isolados; 3) avaliar a capacidade de adesão e invasão de cepas de Candida albicans com diferentes graus de hidrofobicidade, em fibroblastos gengivais humanos. As reações de PCR mostraram que os diabéticos tiveram maior prevalência de Candida spp. principalmente C. albicans e C. dubliniensis, e menor freqüência de Tannerella forsythia, quando comparado aos pacientes não diabéticos, para bolsa periodontal e furcas. C. glabrata e C. tropicalis não foram encontradas em sítios periodontais de pacientes não diabéticos. Dos pacientes diabéticos, foram isoladas 128 cepas de C. albicans, das quais 51.6% foram determinadas como genótipo B e 48.4% como genótipo A. As condições ambientais consideradas neste estudo, níveis reduzidos de oxigênio ou anaerobiose, não modificaram o tipo de hemólise realizado pelo microrganismo, sendo que a maioria das cepas foi alfa-hemolítica. Nesses ensaios, 100% das cepas em anaerobiose apresentaram as colônias rugosas, enquanto que em ambiente de oxigênio reduzido, houve variação em relação à morfologia e a maioria delas apresentou colônia lisa. Com relação à atividade de proteinase e fosfolipase, cepas de C. albicans não produziram as enzimas na ausência total de oxigênio. Em ambiente com nível reduzido de oxigênio, a maioria das cepas de C. albicans foram fortemente produtoras de proteinase e a maioria das cepas foi positiva para fosfolipase. A hidrofobicidade foi mais alta na condição de anaerobiose. A partir desses resultados, foram selecionadas 16 cepas com alta ou baixa hidrofobicidade e avaliadas quanto à capacidade de adesão e invasão em fibroblastos gengivais humanos. Foi verificado que ambos os processos foram maiores nas cepas com alta hidrofobicidade. A produção de óxido nítrico foi maior para as cepas mais hidrofóbicas. Os resultados demonstraram que as espécies de Candida podem ser encontradas, em grande proporção, em bolsas periodontais e furcas de pacientes portadores de periodontite crônica, principalmente naqueles acometidos por diabetes mellitus. A maioria das cepas de C. albicans apresentou atividade enzimática, que atuaria diretamente na degradação tecidual. Além disso, a hidrofobicidade das cepas de C. albicans mostrou estar relacionada à maior capacidade de adesão e invasão em fibroblastos. Todos esses fatores de virulência aumentam a patogenicidade da Candida, que poderia colaborar na progressão da doença periodontal, principalmente em pacientes imunodeficientes / Abstract: Candida spp. are commensal yeasts that inhabit different sites of the oral cavity. In healthy subjects, without immunological alterations, these microorganisms do not cause disease. However, in immunosuppressive conditions, these yeasts can become more virulent and express pathogenicity. Candida species have different virulence factors, including mechanisms of cell adhesion and invasion associated with the production of enzymes that facilitate tissue degradation and their proliferation in oral mucosa. Studies have shown the presence of Candida spp. in periodontal sites of patients with chronic periodontitis, especially when they are immunologically compromised. However is still unknown their role in the pathogenesis of periodontal disease. The objectives of this study were: 1) to identify the presence of Candida species and putative periodontopathogens by PCR in periodontal sites of diabetic or non-diabetic patients with chronic periodontitis; 2) to isolate strains of Candida albicans in these patients and evaluate the proteinase, phospholipase and haemolysin activities and degrees of cell surface hydrophobicity under different atmospheric conditions, besides to performe the genotypic analysis of these isolates; 3) to evaluate the ability of adhesion and invasion of Candida albicans strains with different degrees of hydrophobicity, in human gingival fibroblasts. The PCR reactions revealed that diabetics had higher prevalence of Candida spp., mainly C. albicans and C. dubliniensis, and lower T. forsythia frequency, when compared to non-diabetic patients, for both periodontal sites. C. glabrata and C. tropicalis were not found in periodontal pockets and furcation sites of non-diabetic patients. From diabetic patients, it was isolated 128 strains of C. albicans and 51.6% were determined as genotype B and 48.4% as genotype A. The atmospheric conditions, reduced oxygen and anaerobiosis, did not change the type of hemolysis, and the most of strains were alpha-hemolytic. From these assays, 100% of the strains under anaerobiosis showed rough colonies, whereas in an environment with reduced oxyen was no change in relation to morphology and most of them had smooth colony. Considering proteinase and phospholipase activities, C. albicans strains did not produce the enzymes in the total absence of oxygen. In reduced oxygen, the majority of C. albicans strains were strong proteinase producers and most strains were positive for phospholipase. Hydrophobicity was higher in anaerobic condition. From these results, 16 hydrophobic or hydrophilic strains were selected and evaluated their ability of adhesion and invasion in human gingival fibroblasts. Both processes were greater in strains with high hydrophobicity. The production of nitric oxide was higher for hydrophobic strains. The results showed that Candida species can be found in large proportion, in periodontal pockets and furcation of patients with chronic periodontitis, especially diabetics. The most of C. albicans strains showed enzymatic activity, which could act directly on tissue degradation. Moreover, the hydrophobicity of C. albicans seems to be related to higher capacity of adhesion and invasion in fibroblasts. All these virulence factors enhance the pathogenicity of Candida that could collaborate for the progression of periodontal disease / Doutorado / Microbiologia e Imunologia / Doutor em Biologia Buco-Dental

Orientador: Maria Silvia Viccari Gatti / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-11T09:06:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Martini_IzabelJulien_M.pdf: 1690786 bytes, checksum: ad68ca07a7cffdeef9fcdd571b9ae911 (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: Gastroenterites e diarréias, doenças comuns em humanos, são responsáveis por altas taxas de morbidade e mortalidade em todo o mundo. Os rotavírus são um dos principais agentes dessas doenças, acometendo principalmente crianças com idade inferior a três anos. Esses vírus pertencem à família Reoviridae, gênero Rotavirus, não envelopados e de simetria icosaédrica. Seu genoma é composto por 11 segmentos de RNA dupla fita que podem separar os rotavírus em sete grupos (RV-A a RV-G), dada a migração desses segmentos em eletroforese em gel de poliacrilamida (EGPA). Os RV-A estão mais frequentemente associados a infecções no homem e em outros animais. Os rotavírus apresentam três camadas protéicas concêntricas, com o capsídeo externo contendo a proteína VP4 e a glicoproteína VP7, indutoras de anticorpos neutralizantes. Variações nas seqüências de nucleotídeos dos segmentos genômicos que codificam para essas proteínas diferenciam os rotavírus em genotipos G (VP7) e [P] (VP4). A distribuição desses genótipos é variável nos diferentes países e a utilização da técnica de semi-nested RT-PCR permite a caracterização dos genotipos circulantes, o que é importante para a definição de estratégias vacinais contra esses vírus. O uso de diferentes vacinas contra a rotavirose vem sendo implementado, inclusive no Brasil. Nesse trabalho o objetivo foi caracterizar os genotipos de rotavírus associados a surtos de diarréia em humanos, ocorridos na cidade de Campinas, SP, Brasil, nos anos de 2003 e 2004. Das 328 amostras de fezes estudadas, 98 foram positivas para rotavírus em EGPA, sendo 96 delas RV-A e duas RV-C. Todas as amostras positivas em EGPA para RV-A e outras 96 amostras negativas nesse teste foram submetidas à genotipagem G (G1 a G6 e G8 a G10) e P (P[4] e P[8]). Com os resultados obtidos concluiu-se que a técnica de seminested RT-PCR foi mais sensível na detecção de rotavírus (73,9%) que a EGPA (50,0%) (?2=67,06, valor-p= 0,000 e Kappa= 0,52).Os genotipos de rotavírus mais freqüentes nas amostras coletadas no ano de 2003 (n=38) foram: G1P[8] (38,4%), G3P[8] (15,4%), G5P[8], G9P[8] (7,8%) e G2P[4] (3,9%). Para as amostras enviadas em 2004 (n=290) os genotipos mais freqüentes foram: G3P[8] (18,7%), G9P[8] (13,9%), G1P[8] (8,4%), G5P[8] (6,0%) e G4P[8] (5,4%). A proporção de identificação do genotipo G1P[8] no ano de 2004 foi significativamente maior no ano de 2004 (Z= 3,07; valor-p=0,002). O genotipo emergente G9 foi identificado em 13,5% (n= 26) das amostras estudadas. Infecções mistas com os genotipos G1 e G2, G1 e G8, G2 e G3, G3 e G5 e G5 e G8 foram identificadas em oito amostras de fezes (4,1%). Nas regiões Sul e Sudoeste de Campinas, consideradas como menos favorecidas socio-economicamente, foi verificada maior variabilidade de genotipos circulantes nos dois anos de análise. Os dados obtidos poderão contribuir para a verificação da eficácia da vacina em uso no Brasil contra a rotavirose / Abstract: Gastroenteritis and diarrhea are a important cause of morbidity and mortality worldwide. Rotavirus is the most important etiologic agent of these disorders in infants and young children. These viruses, which form a genus of the Reoviridae family, are icosahedral, non-enveloped and their genome consists of 11 segments of double stranded RNA. When submitted to electrophoresis in polyacrylamide gels the RNAds of rotaviruses classify these viruses into seven groups (RV¿A to RV-G). Group A rotaviruses have been established as the most common cause of severe infections in human and other animals worldwide. The genome of rotaviruses is surrounded by three concentric protein layers. The outer capsid consists of VP4 and VP7 that carry neutralization and protective antigens and allow classification into P and G genotypes, respectively. The VP7 serotype is designated as G serotype (VP7 is a glycoprotein), whereas the VP4 serotype is designated as [P], from protease-sensitive. Many studies have been showed fluctuations in the distribution of rotavirus G-P combinations in many countries, using the seminested RT-PCR. These data, in relation of the circulation of different rotavirus genotypes, are important to establish rotavirus vaccine programs. Since a universal immunization of infants with rotavirus vaccine was introduced in Brazil, it becomes important to characterize rotavirus genotypes associated with diarrhea in humans from Campinas, SP, Brazil, in the years of 2003 and 2004. From 328 faecal samples, 98 were positive to rotavirus in polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE), being 96 of them belonging to group A and two to RV-C. All the positive samples in PAGE for RV-A and another 96 negative samples to this test were submitted to semi-nested RT-PCR for G (G1 to G6 and G8 to G10) and P (P[4] and P[8]) genotypes determination. The results obtained showed that that semi-nested RT-PCR was more sensitive to the detection of rotavirus (73.9%) than the PAGE (50.0%) (?2=67.06, p= 0,000 and Kappa= 0,52). In 2003, in 38 faecal samples analyzed were identified as the genotypes G1P[8] (38.4%), G3P[8] (15.4%), G5P[8] (7.8%), G9P[8] (7.8%) and G2P 4] (3.9%). For the samples sent in 2004 (n=290), the genotypes G3P[8] (18.7%), G9P[8] (13.9%), G1P[8] (8.4%), G5P[8] (6.0%) and G4P[8] (5.4%) were identified. The genotype G1P[8] was identified in a higher proportion in 2004 than in 2003 (Z=3.07; p=0.002). The emergent genotype G9 was detected in 13.5% of the samples studied. Mixed infections, with G1 and G2, G1 and G8, G2 and G3, G3 and G5 and G5 and G8 were identified in eight faecal samples (4.1%). In the regions of South and Southwestern of Campinas, both of them considered as less socio-economically favored, a high variability of genotypes circulating in the two years of the study was verified. With these data will be able to contribute to the verification of the effectiveness of vaccines in use in Brazil against rotaviruses / Mestrado / Microbiologia / Mestre em Genética e Biologia Molecular

O objetivo do presente trabalho foi a quantificação dos componentes da interação genótipo x ambiente, mais precisamente genótipo x ano, em progênies provenientes de cruzamentos biparentais de soja [Glycine max (L.) Merril] e suas implicações no melhoramento. Três populações denominadas 1, 2 e 3; oriundas dos cruzamentos BR 80-14853 x PI-165896, PI-123439 x PI-239235 e GAÚCHA x OC 79230 respectivamente; compostas de 60 linhagens homozigóticas aleatórias obtidas pelo método SSD (Single seed descente), foram avaliadas em relação ao caráter produtividade de grãos, em uma localidade (Piracicaba, SP/Brasil) durante três anos agrícolas: 1993/4, 1994/5 e 1995/6. Empregou-se um delineamento em blocos ao acaso modificado com três repetições e parcelas lineares de um metro de comprimento por 0,50 metro de largura, contendo 17 plantas após o desbaste. A população 3 foi em média superior quanto à produção de grãos, seguida pelas populações 1 e 2, respectivamente. Detectou-se variabilidade genética altamente significativa para as três populações, indicando a possibilidade de seleção de linhagens superiores. Detectou-se também uma interação genótipos x ambientes (progênie x anos) altamente significativa para todas as populações avaliadas. A análise dos componentes da interação fenotípicos e genéticos demonstrou que o componente complexo da mesma foi predominante em alto grau (média das três populações: 90,91% e 96,03% , para os componentes genéticos e fenotípicos, respectivamente). As implicações da predominância do componente complexo da interação nos programas de melhoramento foram estudados e discutidas em detalhe no presente trabalho / not available

Orientador: Clarice Weis Arns / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-23T15:29:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rosa_GislaineNonino_M.pdf: 911936 bytes, checksum: 7194af83e7f30e4bcab42d6488202031 (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: A cinomose canina tem sido relatada como uma das mais importantes doenças infecto contagiosas dos canídeos selvagens e domésticos. É causada por um agente viral denominado vírus da cinomose canina (CDV). Os vírus pertencem à família Paramyxoviridae , gênero Morbillivirus. São vírus envelopados, com genoma composto por uma fita simples de RNA, polaridade negativa, não segmentado. Alto grau de variabilidade genética no gene da hemaglutinina ( H) tem sido encontrada entre estirpes virais recentes e vacinais, e estas variações podem estar relacionadas ao aumento da ocorrência global da cinomose. No presente estudo, amostras biológicas de cães com sintomatologia sugestiva da cinomose foram analisadas geneticamente. Para a detecção de um fragmento de 882 pb do gene H do CDV padronizou-se uma RT-PCR que mostrou-se capaz de amplificar o material genético viral em amostras de urina, líquido céfalo-raquidiano, sistema nervoso central (SNC), baço , pulmão , fígado , rins, linfonodos, bexiga e timo. As amostras positivas de acordo com a RT-PCR foram encaminhadas para o sequenciamento e análise filogenética. Os resultados encontrados sugerem que estas amostras assemelham-se geneticamente aos vírus agrupados nas linhagens Européia e Ásia-1. A estirpe vacinal Lederle, utilizada como padrão, foi agrupada junto a linhagem América-1 onde encontram-se todas as estirpes vacinais , também conhecidas como "Old CDVs" . Os achados deste trabalho apontam para a ocorrência de estirpes geneticamente distintas daquelas utilizadas na produção de vacinas e mais estudos são necessários para a avaliação da eficácia das vacinas disponíveis, propiciando um melhor controle da doença / Abstract: Canine distemper has been reported as one of the most important infectious diseases of wild and domestic canids. It is caused by a viral agent called canine distemper virus (CDV). Viruses belonging to the family Paramyxoviridae, genus Morbillivirus. They are enveloped viruses with genome composed of a single strand of RNA, negative polarity, not segmented. High degree of genetic variability in the gene for hemagglutinin (H) has been found between recent viral strains and vaccination strains, and these variations may be related to increased overall occurrence distemper. In this study, biological samples from dogs with symptoms suggestive of distemper were analyzed genetically. For the detection of a 882 base pairs (bp) fragment of the gene of CDV H was standardized a RT-PCR wich proved to be capable of amplifying the viral genetic material in urine, cerebrospinal fluid, central nervous system (CNS), spleen , lungs, liver, kidneys, lymph nodes, bladder and thymus. Positive samples according to RT-PCR were sent for sequencing and phylogenetic analysis. The results suggest that these samples are similar to viruses genetically clustered lineages in European and Asia-1. The Lederle vaccine strain, used as standard, was grouped with Latin-1 lineages which are all vaccine strains, also known as "old CDVs." The findings of this study point to the occurrence of genetically distinct strains from those used in vaccine production and more studies are needed to assess the efficacy of vaccines available, providing better control of the disease / Mestrado / Microbiologia / Mestra em Genética e Biologia Molecular

Orientador: Reginaldo Bruno Gonçalves / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-03T20:22:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Napimoga_MarceloHenrique_M.pdf: 1069386 bytes, checksum: 9b46cfcb9f2de97601711e5d73454c5f (MD5) Previous issue date: 2004 / Mestrado

Orientador: João Antonio da Costa Andrade / Resumo: Na fase final de um programa de melhoramento, especificamente na recomendação de cultivares, o conhecimento da interação genótipos x ambientes (GxA) é essencial, porque analisa a existência de desempenho diferencial de genótipos em diferentes ambientes. Os efeitos da interação genótipos x ambientes sobre a adaptabilidade e estabilidade são de grande importância, visto que cada genótipo possui uma capacidade inerente de responder às mudanças ambientais. Dentre as estratégias usadas para identificar cultivares com baixos níveis de interação genótipos x ambientes, está a seleção de genótipos com alta adaptabilidade e estabilidade. O objetivo deste trabalho foi identificar clones de cana-de-açúcar produtivos, com boa estabilidade e adaptabilidade, considerando dois ciclos produtivos. Vinte e cinco clones precoces mais cinco testemunhas foram avaliados em 24 ambientes, em delineamento de blocos ao acaso, com três repetições. Para verificação da adaptabilidade e estabilidade foi utilizado o método de regressão bissegmentada e os métodos multivariados AMMI e GGE biplot. Os clones avaliados não apresentam os parâmetros ideais, como preconizado pelo método da regressão bissegmentada. De acordo com as três abordagens utilizadas, que são complementares nas informações desejadas, os clones mais promissores em termos de estabilidade e adaptabilidade geral são G13, G12 e G5. / Mestre

Orientador: Pablo Forlan Vargas / Resumo: A batata-doce (Ipomoea batatas L.) é uma hortaliça tuberosa de ampla adaptação à diferentes tipos de solo e clima, e ocupa posição de destaque entre as culturas que desempenham papéis importantes na segurança alimentar. As raízes de polpa alaranjada são ricas em carotenoides, principalmente betacaroteno, precursor de próvitamina A, podendo o consumo de batata-doce de polpa alaranjada ser utilizado no combate à deficiência de vitamina A no Brasil e em diversos lugares do mundo. Diante disso, o presente trabalho teve como objetivo avaliar a interação genótipo x ambiente e estimar a adaptabilidade e estabilidade de genótipos de batata-doce com altos teores de betacaroteno visando a identificação e seleção dos mais adaptados em busca de futura obtenção de novas cultivares. Foram realizados ensaios em quatro ambientes: no município de Vera Cruz-SP, Selvíria-MS e em dois ambientes (sistema de produção orgânico e sistema de produção consorciado) no município de Sete Barras. O delineamento experimental adotado foi em blocos casualizados com duas repetições avaliando 265 genótipos de batata-doce provenientes do International Potato Center e uma cultivar comercial ‘Beauregard’ de polpa alaranjada. Os parâmetros genéticos e componentes de variância foram obtidos pelo procedimento REML/BLUP. Foi utilizado o índice proposto por Mulamba e Mock para selecionar os melhores genótipos e estimar o ganho genético predito com a seleção. Para o estudo de estratificação ambiental, adaptabilidade e ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Sweet potato (Ipomoea batatas L.) is a tuberous vegetable that is widely adapted to different soil and climate types and occupies a prominent position among crops that play important roles in food security. Orange pulp roots are rich in carotenoids, mainly beta-carotene, precursor of pro-vitamin A, and orange-fleshed sweetpotato can be used to combat vitamin A deficiency in Brazil and around the world. Therefore, the present work aimed to evaluate the genotype x environment interaction and to estimate the adaptability and stability of sweetpotato genotypes with high beta-carotene contents, aiming at the identification and selection of the most adapted ones in search of future obtaining of new cultivars. Tests were carried out in four environments: in the municipality of Vera Cruz-SP, Selvíria-MS and in two environments (organic production system and consortium production system) in the municipality of Sete Barras. he experimental design was a randomized block design with two replications evaluating 265 genotypes from the International Potato Center and a commercial orange-fleshed 'Beauregard' cultivar. Genetic parameters and variance components were obtained by the REML/BLUP procedure. The index proposed by Mulamba and Mock was used to select the best genotypes and to estimate the predicted genetic gain with the selection. For the study of environmental stratification, adaptability and stability we used the methodologies MHPRVG and AMMI. The adopted methodologies were concord... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre