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Caracterização morfo-agronômica e molecular, processamento mínimo e utilização de raios X em sementes de feijão-caupi [Vigna unguiculata (L.) Walp] / Morpho-agronomic and molecular characterization, minimally processing, and use of X-ray in cowpea seeds [Vigna unguiculata (L.) Walp]Roberto de Albuquerque Melo 10 December 2010 (has links)
O presente estudo foi realizado com os seguintes objetivos de (a) caracterizar morfo-agronômica e molecularmente cinco genótipos de feijão-caupi; (b) avaliar a preservação da qualidade de grãos de feijão-caupi minimamente processado empacotado em três tipos de embalagens (PVC, PP e PEBD) sob temperaturas de armazenamento de 1, 5 e 10 °C, durante nove dias e, (c) identificar os danos causados por caruncho [Callosobruchus maculatus (Fabr.)] e sua relação com a qualidade fisiológica das sementes de feijão-caupi, por meio da análise de raios X. Na caracterização morfo-agronômica os genótipos analisados foram: IPA-206, BRSPAJEU, BRS-POTENGI, L 281.005 e L ESP 10 e na caracterização molecular foram utilizados 26 primers de RAPD e 37 primers de ISSR. Foram construídos três dendrogramas baseados em marcadores moleculares RAPD, ISSR e RAPD+ISSR. Na caracterização morfo-agronômica, as características que apresentaram maior poder discriminante para os cinco genótipos avaliados, foram: cor das folhas; comprimento e largura do folíolo apical; vigor da planta; número de dias à floração, cor das flores; número de dias para maturação da primeira vagem, e ainda, o comprimento, a largura e o número de lóculos por vagem, como também o número de vagens por plantas; e na semente, massa de 100 sementes, comprimento, largura e espessura. A caracterização molecular demonstrou a utilidade do método, não só para avaliar o conjunto da diversidade no germoplasma, mas também para permitir aglomeração potencial dos genótipos com base nas suas afinidades entre si em características de desempenho agronômico. No ensaio de processamento mínimo foi utilizado como matéria prima grãos de feijão-caupi, linhagem L ESP 10. Foram realizadas as seguintes análises: perda de massa fresca, composição gasosa, aroma e aparência. Os dados foram analisados através da construção de gráficos. Constatou-se que a perda de massa dos grãos foi muito reduzida. A temperatura de 1°C e o uso do filme de PVC foi mais eficientes na conservação da qualidade pós-colheita do feijão-caupi minimamente processado, propiciando melhor manutenção da cor verde, aparência, odor e menor oxidação na região próxima ao hilo. Com relação à identificação dos danos causados por caruncho por meio da análise de raios X foram utilizadas três cultivares: IPA-206, BRS-Pajeu, BRS-Potengi e duas linhagens, L 281.005 e L ESP 10. As amostras foram submetidas ao teste de raios X e ao teste de germinação, a fim de determinar a relação de causa e efeito entre os danos provocados pelo caruncho e a germinação das sementes. Para os danos classificados como severos, localizados no eixo embrionário e, ou nos cotilédones, as sementes originaram plântulas anormais ou as sementes estavam mortas. O teste de raios X se mostrou eficiente para a avaliação de danos causados por caruncho em sementes de feijão-caupi, permitindo relacionar os eventuais danos com os prejuízos causados à germinação. / This study was undertaken with the following objectives: (a) to characterize, morphoagronomic and molecularly, five genotypes of cowpea beans, (b) to evaluate the preservation of grain quality of cowpea minimally processed in three types of packaging (PVC, PP and PEBD) under storage temperatures of 1, 5 and 10 ° C for nine days, and (c) to identify the damage caused by the weevil [Callosobruchus maculatus (Fabr.)] using the X-ray analysis and evaluate its relationship to the physiological quality of the cowpea seeds. The genotypes used in this morpho-agronomic characterization were IPA 206, BRS-PAJEU, BRS-POTENGI, L 281.005 and L ESP 10. For the molecular characterization, it was used 26 primers of RAPD and 37 primers of ISSR. Three dendograms were constructed based on molecular markers RAPD, ISSR and RAPD+ISSR. Concerning to morpho-agronomic characterization, the characteristics which presented the highest discriminating power were: color of the leaves, lenght and width of the apical leaflet, plant vigor, number of the days for flowering, color of the flowers, number of the days for first ripe pod, and number of beans per individual plant. For seeds were evaluated, mass of 100 seeds, lenght, width and thickness. The molecular characterization showed the efficiency of the method not only to evaluate all the diversity conditions in the germoplasm but also to allow the potential agglomeration of the genotypes based on their similarities for their characteristics regarding to the agronomic behavior. To set up the trial of cowpea grains minimally processed it was used the line L ESP 10. The following traits were analysed: mass loss, gas composition, odor, and appearance. The results were evaluated by the graphs construction. The results showed that temperature at 1 0C and use of PVC were the most efficient process to preserve the postharvest quality of minimally processed cowpea beans, keeping its green color, appearance, odor, and lowest oxidation level near the hilum. As regards the damage caused to the cowpea seeds by weevil were used the cultivars IPA-206, BRSPajeu and BRS-Potengi, and two lines (L 281.005 and L ESP 10). The samples were exposed to X-ray and germination test to determine the cause-effect relationship between weevil damage and seed germination. Seed damage classified as severe, located in the embryonic axis or in the cotyledons, resulted in abnormal seedlings or dead seeds. The X-ray test, therefore, is efficient for evaluating weevil damage in cowpea seeds.
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Investigação epidemiológica e molecular da infecção pelo vírus da hepatite C em usuários de drogas ilícitas no Brasil Central / Epidemiologic and molecular investigation of hepatitis C virus infection among illicit drug users in Central BrazilLOPES, Carmen Luci Rodrigues 02 April 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009-04-02 / Hepatitis C virus (HCV) infection is an important problem of public health. Drug users (DU) constitute a group of frequent exposure to HCV and little is known about this infection in DU in Brazil. This study aimed to investigate the seroepidemiological and molecular profile of HCV infection among drug users in Central Brazil. A total of 691 DU, being 102 injection drug users (IDU) and 589 noninjecting drug users (NIDU), were interviewed and blood samples collected in 26 treatment drug centers in Campo Grande-MS and Goiânia-GO. Blood samples (sera) were tested for antibodies to HCV (anti-HCV). Anti-HCV-positive samples were submitted to HCV RNA detection by polymerase chain reaction (PCR) with primers complementary to the 5 NC and NS5B regions of viral genome and genotyped by LiPA and direct nucleotide sequencing followed by phylogenetic analysis, respectively. The anti-HCV prevalence was 6.9% (95% CI: 5.2-9.2). The study population reported a low known regarding HCV transmission ways, such as parenteral (20.8-30.5%), sexual (31,7%) and vertical (20%) of HCV. Multivariate analysis of risk factors revealed that age > 40 years, route (injecting) and duration of drug use and blood transfusion were associated with HCV infection. HCV RNA was detected in 85.4% of the anti-HCV-positive samples. Thirty-three samples were of genotype 1 by the LiPA, subtypes 1a (63.4%) and 1b (17.1%), and eight samples (19.5%) were of genotype 3, subtype 3a. The phylogenetic analysis of the NS5B region showed that 17 (68%), 5 (20%) and 3 (12%) samples were of subtypes 1a, 3a and 1b, respectively. This study shows a high HCV infection prevalence and the predominance of subtype 1a among drug users in Central Brazil. Also, the injecting drug use was the risk factor most strongly associated with this infection. In addition, the study population reported a low known regarding HCV transmission ways. Thus, preventive measures are needed to control this infection in illicit drug users / A infecção pelo vírus da hepatite C (HCV) é um importante problema de saúde pública. Os usuários de drogas (UD) constituem um grupo com freqüente exposição ao HCV e, pouco se conhece sobre essa infecção em UD no Brasil. Este estudo teve como objetivo investigar o perfil soroepidemiológico e molecular da infecção pelo HCV em usuários de drogas ilícitas no Brasil Central. Um total de 691 UD, sendo 102 injetáveis (UDI) e 589 não injetáveis (UDNI), foi entrevistado e amostras sanguíneas coletadas em 26 centros de tratamento de uso de drogas situados em Campo Grande-MS e Goiânia-GO. As amostras sanguíneas (soros) foram testadas para a detecção de anticorpos para o HCV (anti-HCV). As amostras anti-HCV positivas foram submetidas à detecção do RNA-HCV pela reação em cadeia da polimerase (PCR) com iniciadores complementares às regiões 5 NC e NS5B do genoma viral e, genotipadas pelo LiPA e por seqüenciamento direto, seguido de análise filogenética, respectivamente. A prevalência para anti-HCV foi 6,9% (IC 95%: 5,2-9,2). A população estudada apresentou conhecimento limitado sobre as formas de transmissão parenteral (20,8-30,5%), sexual (31,7%) e vertical (20%) do HCV. A análise multivariada de fatores de risco revelou que idade > 40 anos, via (injetável) e tempo de uso de drogas e transfusão de sangue foram associados à infecção pelo HCV. O RNA viral foi detectado em 85,4% das amostras anti-HCV positivas. Trinta e três amostras foram do genótipo 1 pelo LiPA, subtipos 1a (63,4%) e 1b (17,1%), e oito (19,5%) do genótipo 3, subtipo 3a. A análise filogenética da região NS5B mostrou que 17 (68%), 5 (20%) e 3 (12%) amostras foram dos subtipos 1a, 3a e 1b, respectivamente. Este estudo mostra uma prevalência elevada da infecção e do subtipo 1a do HCV em usuários de drogas no Brasil Central, bem como o uso injetável de drogas como principal fator de risco para essa infecção. Além disso, evidenciou conhecimento limitado da população estudada sobre as formas de transmissão do HCV. Assim, medidas preventivas são necessárias para o controle dessa infecção em usuários de drogas ilícitas
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Genotipagem do vírus da Hepatite C e do vírus da Hepatite Delta na Amazônia ocidental brasileiraCrispim, Myuki Alfaia Esashika 20 September 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007-09-20 / Hepatitis B and D are endemic in the Western Brazilian Amazon region , but few studies have been conducted to investigate the genetic variability of both viruses. The hepatitis B virus (HBV) has a high genetic variability, with eight different genotypes defined (A-H). In present classification hepatitis D virus (HDV) is also supposed to present eight different genotypes (I-VIII). The aim of this study was to describe the genotypes of the virus B and D of the Western Brazilian Amazon region. We selected 190 samples of chronic carriers with HBV and 50 of them presented double infection with HDV. The serum samples of HBV were submitted to the genotyping through Polymerase Chain Reaction (PCR), with type-specific primers . In the reactive samples for HDV RNA by RT-PCR was used the genotyping by Restriction Fragment Lenght Polymorphism (RFLP). The genotype A of HBV was detected as the most frequent, in 91 participants (56,5%), following by genotype F, in 41 (25,5%), and genotype D, in 29 (18,0%). In the HDV genotyping, we found only the genotype III. This study showed that the genotypes A, D and F of VHB and the genotype III of HDV represented the predominant genotypes in the Western Brazilian Amazon. / As hepatites B e D são endêmicas na Amazônia Ocidental Brasileira, mas poucos estudos têm buscado investigar a variabilidade genética de ambos os vírus. O vírus da Hepatite B (VHB) tem uma alta variabilidade genética, sendo definidos oito genótipos distintos (A-H). O vírus da hepatite D (VHD), na atual classificação, também é sugerido apresentar oito genótipos (I-VIII). O presente estudo teve o objetivo de descrever os genótipos do vírus B e D na Amazônia Ocidental Brasileira. Selecionamos 190 amostras de portadores crônicos do vírus da hepatite B, sendo que, destas, 50 apresentavam infecção dupla com o VHD. As amostras de soro do VHB foram submetidas a genotipagem por meio da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), com iniciadores tipo específicos. Em amostras reativas para o VHD RNA por RT-PCR foi realizada a genotipagem por Análise do Polimorfismo do Tamanho de Fragmentos de Restrição (RFLP). Foi detectado o genótipo A como o mais freqüente em 91 participantes (56,5%), seguido pelo F em 41(25,5%), e o D em 29 (18,0%). Na genotipagem para o VHD encontramos somente o genótipo III. Este estudo mostrou que os genótipos A, D e F do VHB e o genótipo III do VHD, representam os genótipos predominantes na Amazônia Ocidental Brasileira.
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Modelo baseado em agentes para especiação topopátrica / Agent-Based modelling for topopatric speciation.Sergio Candido de Oliveira Junior 20 August 2014 (has links)
No presente modelo em NetLogo, implementou-se um código onde patches genotipicamente homogêneos, reproduzem-se no mapa composto de 64 x 64 células. Buscam parceiros entre si, seguindo algumas orientações. O par reprodutivo deve estar dentro de uma determinada distância genética (G) e espacial (S). Estes parâmetros definem qual a máxima divergência genotípica permitida para a reprodução (G) e qual a distância espacial máxima entre dois possíveis parceiros reprodutivos (S). Além destes, o sliderM determina a probabilidade de ocorrer mutação nos genótipos resultantes das reproduções e A a amplitude, i.e., a quantidade de mudança sofrida pelo genótipo do agente. A princípio, geneticamente homogêneos, todos os indivíduos podem potencialmente formar pares. Contudo, com ocorrência de trocas genéticas e mutações, na formação da prole, aumenta-se a diversidade genética e há isolamento reprodutivo entre indivíduos. Obteu-se especiação dos agentes, ocorrência de corredor de fluxo gênico e mapa robusto de combinação de parâmetros. / In the present model in NetLogo, we implemented a code where genotypically homogeneous patches, reproduce in a map consisting of 64 x 64 cells. Seek partners among themselves by following some guidelines. The breeding pair must be within a certain genetic (G) and spatial (S) distance. These parameters define the maximum genotypic divergence which allowed for reproduction (G) and that maximum spatial distance between two potential reproductive partners (S). In addition, the slider M determines the probability of mutation in resulting genotypes and A the amplitude, i.e., the amount of change experienced by the genotype of the agent. Primarily, genetically homogeneous, all individuals can potentially form pairs. However, with the occurrence of genetic changes and mutations in the offspring formation, the genetic diversity increases and there is reproductive isolation between individuals. There were agents speciation, occurrence of genic flow pathway and robust map of matching parameters.
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Características agronômicas, qualidade da farinha e avaliação de genótipos de trigo duplo propósito submetidos a diferentes manejos de corte / Agronomic characteristics, quality of the flour and evoluated of wheat genotypes dual purpose submitted to different management cutRodrigues, Thyago Roberto Dias 13 February 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-02-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / There need to research involving crop-livestock integration, using different wheats, which can be used with dual purpose. Therefore this study aimed to evaluate the agronomic characteristics and quality of flour in wheat genotypes and dual-purpose and of the new genotypes, submitted to the management of cuts in the phase of tillering. Two experiments were conducted in Cascavel, in the design of randomized blocks with split plot with four replications. In a test the priorities were the cutting management and adaptation of genotypes dual-purpose. And the other was to evaluate the genotype for the double purpose. In the first test in the plot were allocated the wheat (BRS-277 and BRS-Tarumã) and subplots managements of cuts (blunt, with one cut, and with two cuts), totaling six treatments. In the second test in the plot were assigned the genotypes of Coodetec (BATT10-108, BATT10-109-114 BATT, BATT-115-119 BATT, BATT-120 and S09-167) and the genotypes of wheat of dual purpose of Embrapa (BRS 277 and BRS-Tarumã) and subplots managements of cuts (blunt, with one cut), totaling 18 treatments. In two experiments were evaluated agronomic characteristics the dry matter, the grain yield, the mass of thousand grains, the number of grains spike-1, the number of spikes m-2 and the plant height. As flour was evaluated the general force of the gluten, the ratio of tenacity of extensibility, the wet gluten, dry gluten, the hectoliter weight (grain quality), the number of fall, the ash on a dry basis and color (L *, a * and b *). In the first experiment the dry matter of wheat dual purpose BRS-Tarumã (1.523 kg ha-1) and BRS-277 (1.397 kg ha-1) did not differentiated between them. Yields of grain blunt (2.014 kg ha-1) and one cut (1.779 kg ha-1) were similar, but differ from management with two cuts (889 kg ha-1). The force general of gluten smaller was the wheat BRS-277 (323 10-4 J) with two cuts and higher BRS-Tarumã (449 10-4 J) with one cut. The increase in the number of cuts presented improvements to the dry matter, plant height and number of falls, with a reduction in grain yield and thousand grain weight, enabling the management to with one cut, better quality of flour in wheat genotypes. In the second test with one cut the highest yield of grain was found in the genotypes BATT-115 (3.063 kg ha-1), BATT-120 (2.792 kg ha-1) and BRS-Tarumã (2.657 kg ha-1). For the management to cut the genotypes S09-167 (78,63 kg hL-1) and BATT-114 (78,13 kg hL-1) obtained the highest values of hectoliter weight, however the falling number was between 220 to 250 s this classified as type 2. The genotypes of Coodetec that presented the agronomic characteristics and quality of flour more similar to the wheat double purpose of Embrapa were BATT-115, the BATT-119 and BATT-120 / Há necessidade de pesquisas que envolvam a integração lavoura-pecuária, utilizando trigos diferenciados, que podem ser usados com duplo propósito. Por isso neste trabalho, objetivou-se avaliar as características agronômicas e a qualidade da farinha nos genótipos de trigos de duplo propósito e de novos genótipos, submetidos ao manejo de cortes na fase de perfilhamento. Foram conduzidos dois experimentos no município de Cascavel, no delineamento de blocos ao acaso com parcelas subdivididas, com quatro repetições. Em um dos ensaios as prioridades foram o manejo de corte e a adaptação dos genótipos de duplo propósito. E no outro foi a avaliação de genótipo para duplo o propósito. No primeiro ensaio na parcela foram alocados os trigos (BRS-277 e BRS-Tarumã) e nas subparcelas os manejos de cortes (sem corte, com um corte e, com dois cortes) totalizando seis tratamentos. No segundo ensaio na parcela foram alocados os genótipos de trigo da Coodetec (BATT10-108, BATT10-109, BATT-114, BATT-115, BATT-119, BATT-120 e S09-167) e os genótipos de duplo propósito da Embrapa (BRS-277 e BRS-Tarumã) e nas subparcelas foi alocado o manejo de corte (sem corte e com um corte) totalizando 18 tratamentos. Nos dois experimentos foram avaliadas as características agronômicas que foram a matéria seca, a produtividade de grãos, a massa de mil grãos, o número de grãos espiga-1, o número de espigas m-2 e a altura de planta. Na qualidade da farinha foram avaliadas a força geral do glúten, a relação de tenacidade por extensibilidade, o glúten úmido, o glúten seco, o peso hectolítrico (qualidade do grão), o número de queda, as cinzas em base seca e a cor (L*, a* e b*). No primeiro ensaio as matérias secas dos trigo de duplo propósito BRS-Tarumã (1.523 kg ha-1) e BRS-277 (1.397 kg ha-1) não diferenciaram entre si. As produtividades de grãos sem corte (2.014 kg ha-1) e com um corte (1.779 kg ha-1) foram semelhantes entre si, mas diferem do manejo com dois cortes (889 kg ha-1). O menor valor de força geral do glúten foi do trigo BRS-277 (323 10-4 J) com dois cortes e o maior do BRS-Tarumã (449 10-4 J) com um corte. O aumento do número de cortes apresentou melhorias para a matéria seca, a altura de planta e o número de queda, com redução na produtividade de grãos e massa de mil grãos, possibilitando no manejo com um corte melhoria na qualidade da farinha nos genótipos de trigo. No segundo ensaio com um corte as maiores produtividades de grãos foram dos genótipos BATT-115 (3.063 kg ha-1), BATT-120 (2.792 kg ha-1) e BRS-Tarumã (2.657 kg ha-1). Para o manejo com corte os genótipos S09-167 (78,63 kg hL-1) e BATT-114 (78,13 kg hL-1) obtiveram os maiores valores de peso hectolítrico, porém o número de queda foi entre 220 e 250 s classificado estes como tipo 2. Os genótipos da Coodetec que apresentaram as características agronômicas e de qualidade da farinha mais semelhantes aos trigos de duplo propósito da Embrapa foram o BATT-115, o BATT-119 e o BATT-120
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Responsividade e estabilidade da produção de grãos de milho: relações com caracteres relacionados à tolerância a estresses abióticos e heranças / Maize grain yield responsiveness and stability: relationships with traits related to abiotic stresses tolerance and inheritanceOtávio Luiz Gomes Carneiro 09 August 2018 (has links)
Os principais caracteres a serem considerados em programas de melhoramento de milho visando tolerância a estresses abióticos são: prolificidade (PRO), intervalo de florescimento (IF), número de ramificações do pendão (NRP) e stay green (SG). Diversos autores sugeriram que esses caracteres podem estar relacionados à estabilidade da produção de grãos. Ademais, apesar da importância da responsividade e estabilidade da produção de grãos para a seleção de cultivares, há poucos relatos sobre a herança desses parâmetros, com resultados controversos. Os objetivos desse estudo foram investigar a relação entre a estabilidade e os caracteres relacionados à tolerância a estresses abióticos e a herança dos parâmetros responsividade e estabilidade da produção de grãos de milho. Foram avaliados dois Grupos de híbridos simples de milho: Grupo I (GI) consituído por 100 híbridos e o Grupo II (GII) por 48 híbridos, os quais foram avaliados respectivamente em 12 e 28 ambientes. Esses híbridos foram avaliados seguindo delineamento látice 10 x 10 e 7 x 7, compreendendo os 100 e 49 híbridos simples, respectivamente, com duas repetições por ambiente. Para completar o delineamento látice no GII, um híbrido simples comercial foi adicionado aos demais híbridos. Utilizando técnicas uni e multivariadas, as correlações entre os caracteres envolvendo tolerância a estresses abióticos, isto é, PRO, IF, NRP e SG, e os parâmetros de estabilidade apresentaram baixas magnitudes e, de forma geral, não diferiram de zero. Esses resultados indicaram que a estabilidade da produção de grãos e os caracteres relacionados à estresses abióticos são provavelmente independentes. Os resultados das análises dialélicas da responsividade e estabilidade mostraram que a contribuição da capacidade específica de combinação foi superior à capacidade geral de combinação para ambos os parâmetros nos dois Grupos de híbridos. Desta forma, os efeitos gênicos não aditivos (dominância e epistasia) foram mais importantes que os efeitos aditivos para a responsividade e estabilidade da produção de grãos. Apesar de os híbridos selecionados apresentarem os caracteres relacionados à tolerância a estresses abióticos de forma desejada e, assim, possivelmente reduzirem as flutuações da produção de grãos devido principalmente às instabilidades de precipitação, esses não possuem relação direta com os parâmetros de estabilidade. De qualquer forma, é importante que esses caracteres estejam inseridos nos programas de melhoramento de milho visando obter cultivares tolerantes a esses tipos de estresses. Também, a maior importância dos efeitos não aditivos em relação aos efeitos aditivos no controle da responsividade e estabilidade possui uma série de implicações para os programas de melhoramento de milho, uma vez que a seleção deverá ser realizada em cruzamentos de linhagens e não nas performances das linhagens per se. / The main traits considered in maize breeding programs aiming tolerance to abiotic stresses are: prolificacy (PRO), anthesis-silking interval (ASI), number of tassel branches (TB) and stay green (SG). Several authors have suggested that these traits would be related to maize grain yield stability. In addition, despite the importance of grain yield responsiveness and stability for the cultivars selection, there are few reports about the inheritance of these parameters, and they usually have controversial results. The objectives of this study were to investigate the relationship between stability and traits related to tolerance to abiotic stresses and the inheritance of maize grain yield responsiveness and stability parameters. Two groups of maize single-crosses were evaluated: Group I (GI) consisted of 100 single-crosses and Group II (GII) of 48 single-crosses, respectively evaluated in 12 and 28 environments. These hybrids were evaluated following a 10 x 10 and a 7 x 7 lattice designs comprising the 100 and 49 single-crosses, respectively, with two replications per environment. To complete the lattice design in GII a commercial single-cross was added to entries. Using univariate and multivariate techniques, the correlations between the traits involving abiotic stress tolerance, i.e., PRO, ASI, TB and SG, and stability parameters presented low magnitudes and, in general, did not differ from zero. These results indicated that grain yield stability and traits related to abiotic stresses tolerance are likely independent. The diallel analyses results of responsiveness and stability showed that the contribution of the specific combining ability was higher than the general combining ability for both parameters in the two Groups of single-crosses. Therefore, the non-additive genetic effects (dominance and epistasis) were more important than the additive effects for the grain yield responsiveness and stability. Although the selected single-crosses have the traits related to abiotic stresses tolerance in a desired way and possibly reduce grain yield fluctuations due mainly to precipitation instabilities, they are not directly related to the stability parameters. However, it is important that these traits be included in maize breeding programs in order to develop cultivars that are tolerant to these types of stresses. Additionally, the greater importance of non-additive effects than additive effects on responsiveness and stability control have several implications for maize breeding programs, since selection should be assessed in crosses of inbred lines and not in lines per se performance.
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Caracterização dos genótipos do vírus da hepatite b em pacientes atendidos no programa de hepatites virais do núcleo de medicina tropical – UFPA, Belém - ParáALMEIDA, Marcella Kelly Costa de 27 May 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-05-27 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O vírus da hepatite B pertence ao gênero Orthohepdnavirus e a família Hepadnaviridae, compreendendo um vírus de DNA, hepatotrópico capaz de infectar mamíferos. Classificados em 10 genótipos (A-J) diferentes e muitos subgenótipos, estudos sugerem que eles podem influenciar na gravidade da doença, na resposta ao tratamento e na resposta vacinal. Os genótipos e subgenótipos do VHB tem uma distribuição variada, sendo alguns restritos a determinadas regiões geográficas, enquanto outros mostram uma distribuição mundial. É encontrada nas diversas regiões do Brasil com prevalência dos genótipos A, D e F. Este estudo teve como objetivo identificar os genótipos e subgenótipos do vírus da hepatite B entre os pacientes atendidos no Núcleo de Medicina Tropical - UFPA, na cidade de Belém, estado do Pará, no período de janeiro de 2011 a dezembro de 2015. De um total de 1274 pacientes atendidos no NMT-UFPA dentro do período, foram selecionadas para o estudo 222 pacientes, de ambos os sexos, com sorologia reagente para os marcadores HBsAg e/ou anti-HBc total. As amostras foram submetidas a testes de biologia molecular, PCR “in House” e PCR multiplex para detecção do DNA viral e genotipagem, e posteriormente ao sequenciamento, para a confirmação e determinação dos subgenótipos virais. Em 65 das 222 amostras foi detectada a presença do DNA do VHB, sendo identificada a presença dos genótipos A (46/65), com predominância os subgenótipos A1(36/48) seguido do subgenótipo A2 (10/46), e genótipo F (17/65) sendo detectado apenas o subgenótipo F2 (17/17) circulando nesta população. A média de idade entre os paciente foi de 38 anos, com predominância do sexo masculino, sendo a maioria dos pacientes naturais do estado do Pará. Alguns fatores de risco foram identificados entre a população estudada, sendo a não utilização de preservativo durante as relações sexuais o mais predominante. Ao se comparar a presença do DNA viral com a sorologia para o marcador HBsAg, fica evidenciado um quadro que sugerem a presença de hepatite oculta entre os pacientes atendidos. Os resultados encontrados nesta pesquisa estão de acordo com o que é relatado em outros estudos no Brasil. / The hepatitis B virus belongs to the genus Orthohepdnavirus and Hepadnaviridae family, comprising a DNA virus capable of infecting mammalian hepatotropic. Classified into 10 genotypes (A-J) and many different subgenotypes, studies suggest that they may influence the severity of the disease, response to treatment and vaccine response. Genotypes and subgenotypes HBV has a wide distribution, some being restricted to certain geographic regions, while others show a worldwide distribution. It is found in different regions of Brazil with prevalence of genotypes A, D and F. This study aimed to identify genotypes and subgenotypes of hepatitis B virus among patients treated at the Tropical Medicine Center - UFPA, in the city of Belém, state Pará, from January 2011 to December 2015. A total of 1274 patients treated at the NMT-UFPA in the period, were selected for the study 222 patients of both sexes, with positive serology for HBsAg and / or anti-HBc. The samples were subjected to molecular biology, PCR "in house" and multiplex PCR to detect viral DNA and genotyping, and then the sequencing for confirmation and determination of viral subgenotypes. In 65 of the 222 samples was detected the presence of HBV DNA, but only 63 samples were satisfactory after the result of sequencing, which were identified the presence of genotypes A (46/63), especially the subgenotype A1 (36/46) followed by subgenotype A2 (10/46), and genotype F (17/63) and only detected subgenotype F2 (17/17) circulating in this population. The average age of the patients was 38 years, predominantly male, and most natural state of Pará patients. Some risk factors have been identified among the population studied, and not using a condom during sex the most predominant. Comparing the presence of viral DNA with serology for HBsAg marker is shown a picture that suggests the presence of occult hepatitis among the patients treated. The results found in this study are consistent with what is reported in other studies in Brazil.
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Interação genótipo x ambiente e adaptabilidade e estabilidade de híbridos de melão Galia / Genotypic x environment interaction and adaptability and stability of Galia melon hybridsSantos Júnior, Haroldo 26 December 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007-12-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The diversity of environment existent in Rio Grande do Norte due to the different climate conditions and soil can interfere in the adaptability, stability and consequently, in the development of the culture of the melon plant, with reflexes in the productivity and quality of fruits, once those characteristics are influenced directly by the correlation between genotype and environments. The objectives of this work were to verify the importance of the parts simple and complex of the genotype x environment interaction and to evaluate the adaptability and stability of Galia melon hybrid. Nine Galia melon hybrids were tested (GPS 400, DRG 1531, DRG 1537, Solarbel, Solar King, Galileu, Supra, Num 1502 e Arava) in twelve environments of the Rio Grande Norte State (MO-00, MO-01, MO-02, BA-00, BA-01, BA-02, AS-00, AS-01, AS-02, AR-00, AR-01, AR-02) in the period from 2000, 2001 and 2002. The tests were conducted in randomized blocks with three replications. Data were submitted to the analysis of variance individually and jointly and the statistical methods Toler, Wrick and AMMI (Additive Main effect and Multiplicative Interaction) were used to study the adaptability and stability. The complex part is responsible for most of the genotype x environment interaction for the yield and content of solids soluble of fruits. The environments associated with Mossoró and Assu are the most suitable for evaluation of melon Galia. For being stable, productive and to have elevated content of soluble solids, the hybrid DRG 1537 is the most promising for the cultivation in Agripole Mossoró-Assu / A diversidade de ambientes existente no Rio Grande do Norte devido às diferentes condições de clima e solo podem interferir na adaptabilidade, estabilidade e conseqüentemente, no desenvolvimento da cultura do meloeiro, com reflexos na produtividade e qualidade de frutos, uma vez que essas características são diretamente influenciadas pela correlação entre genótipos e ambientes. Os objetivos deste trabalho foram verificar a contribuição das partes simples e complexa da interação genótipo x ambiente e avaliar a adaptabilidade e estabilidade de híbridos de melão Galia. Foram testados nove híbridos de melão Galia (GPS 400, DRG1531, DRG 1537, Solarbel, Solar King, Galileu, Supra, Num 1502 e Arava) em doze ambientes do Estado do Rio Grande Norte (MO-00, MO-01, MO-02, BA-00, BA-01, BA-02, AS-00, AS-01, AS-02, AR-00, AR-01, AR-02) no período de 2000, 2001 e 2002. Os ensaios foram conduzidos em blocos casualizados com três repetições. Os dados foram submetidos à análise de variância individual e conjunta e os métodos estatísticos Toler, Wrick e AMMI (Additive Main effect and Multiplicative Interaction) foram usados para avaliar a adaptabilidade e estabilidade. A parte complexa é a maior responsável pela interação genótipo
x ambiente para a produtividade e o teor de sólidos solúvel dos frutos. Os ambientes associados com Mossoró e Assu são os mais adequados para a avaliação de melão Galia. Por ser estável, apresentar alta produtividade e ter elevado teor de sólidos solúveis, o híbrido DRG 1537 é o mais promissor para o cultivo no Agropolo Mossoró-Assu
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Interação genótipo x ambiente e adaptabilidade e estabilidade de híbridos de melão Galia / Genotypic x environment interaction and adaptability and stability of Galia melon hybridsSantos Júnior, Haroldo 26 December 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007-12-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The diversity of environment existent in Rio Grande do Norte due to the different climate conditions and soil can interfere in the adaptability, stability and consequently, in the
development of the culture of the melon plant, with reflexes in the productivity and quality of fruits, once those characteristics are influenced directly by the correlation between genotype and environments. The objectives of this work were to verify the importance of the parts simple and complex of the genotype x environment interaction and to evaluate the adaptability and stability of Galia melon hybrid. Nine Galia melon hybrids were tested (GPS 400, DRG 1531, DRG 1537, Solarbel, Solar King, Galileu, Supra, Num 1502 e Arava) in twelve environments of the Rio Grande Norte State (MO-00, MO-01, MO-02, BA-00, BA-01, BA-02, AS-00, AS-01, AS-02, AR-00, AR-01, AR-02) in the period from 2000, 2001 and 2002. The tests were conducted in randomized blocks with three replications. Data were submitted to the analysis of variance individually and jointly and the statistical methods Toler, Wrick and AMMI (Additive Main effect and Multiplicative Interaction) were used to study the adaptability and stability. The complex part is responsible for most of the genotype x
environment interaction for the yield and content of solids soluble of fruits. The environments associated with Mossoró and Assu are the most suitable for evaluation of melon Galia. For being stable, productive and to have elevated content of soluble solids, the hybrid DRG 1537 is the most promising for the cultivation in Agripole Mosoró-Assu / A diversidade de ambientes existente no Rio Grande do Norte devido às diferentes condições de clima e solo podem interferir na adaptabilidade, estabilidade e conseqüentemente, no desenvolvimento da cultura do meloeiro, com reflexos na produtividade e qualidade de frutos, uma vez que essas características são diretamente influenciadas pela correlação entre genótipos e ambientes. Os objetivos deste trabalho foram verificar a contribuição das partes simples e complexa da interação genótipo x ambiente e avaliar a adaptabilidade e estabilidade de híbridos de melão Galia. Foram testados nove híbridos de melão Galia (GPS 400, DRG 1531, DRG 1537, Solarbel, Solar King, Galileu, Supra, Num 1502 e Arava) em doze ambientes do Estado do Rio Grande Norte (MO-00, MO-01, MO-02, BA-00, BA-01, BA-02, AS-00, AS-01, AS-02, AR-00, AR-01, AR-02) no período de 2000, 2001 e 2002. Os ensaios foram conduzidos em blocos casualizados com três repetições. Os dados foram submetidos à análise de variância individual e conjunta e os métodos estatísticos Toler, Wrick e AMMI (Additive Main effect and Multiplicative Interaction) foram usados para avaliar a adaptabilidade e estabilidade. A parte complexa é a maior responsável pela interação genótipo
x ambiente para a produtividade e o teor de sólidos solúvel dos frutos. Os ambientes associados com Mossoró e Assu são os mais adequados para a avaliação de melão Galia. Por
ser estável, apresentar alta produtividade e ter elevado teor de sólidos solúveis, o híbrido DRG 1537 é o mais promissor para o cultivo no Agropolo Mosoró-Assu
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Caracterização morfo-agronômica, seleção de descritores e associação entre a divergência genética e a heterose em meloeiro / Morpho-agronomic characterization, selection of germplasm descriptors and association between genetic divergence and heterosis in melon plantsTorres Filho, José 16 September 2008 (has links)
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Previous issue date: 2008-09-16 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The objectives of the present work were to characterize melon plant accessions collected in small farms of the Brazilian Northeast, to select traits for the grouping of accessions and cultivars of melon, to investigate the effects of the genotype x environment interaction and the environment on the grouping of accessions and cultivars and to verify the association between genetic divergence and heterosis in melon of the type Honey Dew. Two experiments were carried out to characterize and to form groups of melon accessionscollected in Northeast Brazil and another experiment was conducted to evaluate seven lines of the type Honey Dew and your hybrids. The experiments werelaid out in randomized complete blocks design with two, two and three replications, respectively. Great variation was observed among the melon accessions for all the descriptors, especially in the fruit descriptors. Variation was verified among and within botanical groups, mainly in the group Cantalupensis. Generally speaking, the accessions were prolific and
productives, with fruits of intermediate to big size, with lower pulp firmness and content of soluble solids. The descriptors discard was necessary to eliminate the colinearity in the residual variance-covariance matrix. The discard of the descriptors and the grouping of the accessions were dependent of the evaluation conditions, mainly due to the year effects and the interaction accessions x years. The discarded descriptors in the evaluation were: fruit diameter and fruit mass in 2006; fruit lengthwise diameter, fruit mass and production in 2007; and weight of 100 seeds, fruit production and lengthwise diameter in the 2006-2007 joint analysis. The joint analyses, with and without discard, provided similar groupings, allowing the obtaining of five groups and discrimination between accessions and commercial cultivars. The genetic divergence was not correlated with any parameter for all the evaluated traits / Os objetivos do presente trabalho foram caracterizar acessos de meloeiro coletados em áreas de pequenos agricultores do Nordeste brasileiro, selecionar descritores para o agrupamento de acessos e cultivares, investigar os efeitos da interação genótipo x ambiente sobre o agrupamento de acessos e cultivares e verificar a associação entre divergência genética e heterose em meloeiro do tipo Honey Dew. Foram conduzidos
dois experimentos para caracterizar e agrupar acessos de meloeiro coletados no Nordeste brasileiro e um terceiro experimento de avaliação de sete linhagens do tipo Honey Dew e seus híbridos. Os experimentos foram conduzidos em blocos casualizados com duas, duas e três repetições, respectivamente. Observou-se grande variação entre os acessos para todos os descritores, em especial nos descritores de fruto. Constatou-se variação entre e dentro dos grupos botânicos estudados, principalmente no grupo Cantalupensis. De um modo geral, os acessos foram prolíficos, produtivos, com frutos de tamanho intermediário a grandes, com baixa firmeza da polpa e baixo teor de sólidos solúveis. O descarte de descritores foi necessário para eliminar os problemas de colinearidade na matriz de variânciacovariância residual. O descarte dos descritores e o agrupamento dos acessos foram das condições de avaliação, principalmente devido aos efeitos de ano e da interação acessos x anos. Os descritores descartados na avaliação foram diâmetro do
fruto (DF) e peso do fruto (PF), em 2006; diâmetro longitudinal (DL), peso do fruto (PF) e produção (PR), em 2007; e peso de cem sementes (PS), produção (PR) e
diâmetro longitudinal (DL) na avaliação conjunta 2006-2007. As análises conjuntas, com e sem descarte, proporcionaram agrupamentos semelhantes, permitindo a obtenção de cinco grupos e a discriminação entre acessos e materiais comerciais. A divergência genética não se correlacionou com a heterose para todas as características avaliadas
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