Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:02Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-26Bitstream added on 2014-06-13T19:33:13Z : No. of bitstreams: 1 prado_fd_me_botib.pdf: 676910 bytes, checksum: 6d6c9b4d7738938a01e94ca150d37e4a (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A hibridação artificial interespecífica de peixes é utilizada em diversos estabelecimentos voltados à piscicultura no país, com a finalidade de produzir indivíduos mais vantajosos e favoráveis para o cultivo. Porém, devido principalmente às dificuldades encontradas na identificação dos híbridos, esta prática pode determinar o surgimento de sérios problemas como a contaminação genética dos estoques de cultivo, a comercialização de produtos híbridos como espécies puras, a introdução de espécies exóticas e escapes de produtos de piscicultura para o ambiente natural e até eventos de introgressão genética e extinção das espécies nativas. Neste contexto, o presente trabalho teve por objetivo analisar geneticamente exemplares das linhagens parentais de Pseudoplatystoma corruscans (pintado) e Pseudoplatystoma reticulatum (cachara) e seus híbridos interespecíficos pintachara (macho de pintado x fêmea de cachara) e cachapinta (fêmea de cachara x macho de pintado), provenientes dos estoques de cultivo do CEPTAlICMBio, Pirassununga, SP, a fim de identificar e estabelecer marcadores genéticos para possibilitar sua identificação e diferenciação. Também foram analisadas geneticamente amostras de P. corruscans e P. reticulatum coletadas no Rio Paraguai, MS (bacia do Paraguai) e de P. corruscans capturados do rio Mogi- Guaçu, SP (bacia do Alto Paraná), a fim de identificar a possível ocorrência de híbridos entre estas espécies na natureza. As análises citogenéticas revelaram um número diploide de 2n=56 cromossomos para ambas as espécies parentais, com cariótipos caracterizados por cromossomos dos tipos 20m+12am+12st+12a e número fundamental (NF) igual a 100, indicando uma fórmula cariotípica conservada entre estas espécies. A análise dos padrões de heterocromatina pelo bandamento C revelou blocos heterocromáticos localizados nas porções... / Artificial interspecific hybridization of fish is used in various establishments linked to fish farming in the country, in order to produce individuais more advantageous and favorable for cultivation. However, due mainly to difficulties in the hybrid products identification, this practice may determine the onset of serious problems such as genetic contamination of the breeder stocks, marketing of hybrids as pure species, introduction of exotic species and escapes of farmed products to the natural environment and sometimes leading to events of genetic introgression and extinction of native species. In such context, the present study aimed to analyze genetically copies of the parental lines of Pseudoplatystoma corruscans (pintado) and Pseudoplatystoma reticulatum (cachara) and their interspecific hybrids pintachara (female of pintado x male of cachara) and cachapinta (female of cachara x male of pintado), from the stocks manteined in CEPTAlICMBio, Pirassununga, SP, in order to characterize and establish genetic markers to allow their identification and differentiation. Samples of P. corruscans and P. reticulatum collected in the Paraguay river, MS (Paraguay basin) and P. corruscans captured in Mogi-Guaçu river, SP (Alto Paraná basin), also were genetically analyzed in order to identify the possible occurrence of hybrids between these species in nature. The cytogenetic analysis revealed a diploid number of 2n = 56 chromosomes for both parental species with karyotypes characterized by the formula 20m+12am+12st+12a and fundamental number (NF) of 100, indicating a karyotypic formula conserved among these species. The analysis of the heterochromatin C-banding patterns revealed heterochromatic blocks located in the pericentromeric and terminal portions of some chromosomes, the NOR was sim pie and located in one chromosome pai r and 5S ribosomal genes located on two different subtelocentric... (Complete abstract click electronic access below)

A raça crioula Pé-duro do Piauí (Bos taurus) é extremamente bem adaptada às condições ambientais desfavoráveis da zona semi-árida do Nordeste Brasileiro e está em risco de extinção. Neste trabalho foi caracterizada geneticamente, por microssatélites, uma amostra (n=126) originária da Fazenda Experimental Octavio Domingues, da Embrapa Meio-Norte, no município de São João do Piauí. A variabilidade genética foi estimada através de freqüências gênicas, diversidade gênica, heterozigose esperada e observada, riqueza alélica, valor do Pic (conteúdo de informação de polimorfismo), coeficiente de endogamia e verificação do equilíbrio de Hardy-Weinberg. Os locos analisados foram SPS115, BM1824, BM2113, BMS4049, TGLA122, ETH225, ETH10, INRA23, UWCA46 e BMS348, identificando-se um total de 101 alelos. A diversidade gênica média foi de 75,6%, com valores extremos verificados nos locos TGLA122 (91,3%) e BMS4049 (45,4%). O valor médio da heterozigose esperada foi 75,5%, observada 60,0%, e Pic 72,3%. O coeficiente de endogamia Fis foi estatisticamente significativo (Fis=0,206; P<0,01). Foram observados também desvios do equilíbrio de Hardy-Weinberg em nove dos dez locos analisados. A partir dos dados obtidos foi possível observar que ainda existe diversidade genética nesta população, porém os desvios do equilíbrio, o valor significativo do Fis, e a heterozigose observada menor em todos os locos em relação à esperada, demonstraram a ocorrência de cruzamentos endogâmicos resultando em alto nível de homozigose nesta população. / The Pé-duro creole breed is well adapted to the unfavorable environmental conditions of the semiarid zone of Northeastern Brazil and it is in extinction danger. In this work we tried to characterize genetically a sample (n=126) collected at the Embrapa Meio-Norte, located in São João do Piauí city. We examined heterozygosity, polymorphism information content (Pic), allelic frequency and genetic diversity, allelic richness, inbreeding coefficient and Hardy-Weinberg equilibrium. Ten loci were used SPS115, BM1824, BM2113, BMS4049, TGLA122, ETH225, ETH10, INRA23, UWCA46 and BMS348 and a total of 101 alleles were identified. The largest genetic diversity was verified in the locus TGLA122 (91,3%), and the smallest in the locus BMS4049 (45,4%). The mean expected heterozygosity was 75,5%, the mean observed heterozygosity was 60,0%, and the mean Pic value was estimated as 72,3%. We also observed a significant inbreeding coefficient (Fis) for this population (Fis=0,206 P<0,01) and deviations from the Hardy-Weinberg equilibrium in nine of the ten analyzed loci. Considering the obtained data it was possible to infer that genetic diversity still exists in this population, however the deviations from Hardy-Weinberg equilibrium, significant inbreeding coefficient, and the smaller observed heterozygosity in all of the loci showed the occurrence of high degree of inbreeding in this population.

Orientador: Ananda Virginia de Aguiar / Resumo: Myracrodruon urundeuva é uma espécie madeireira natural com grande potencial de uso comercial no Brasil, principalmente nas regiões do Pantanal, do Cerrado e da Caatinga, onde ocorre a exploração de espécies nativas. A exploração intensiva tem causado grande perda de indivíduos e o isolamento de populações em ilhas, devido à fragmentação do habitat da espécie. Assim, a adoção de estratégias para conservação ex situ de espécie nativas torna-se indispensável. Duas propostas foram idealizadas neste trabalho. A primeira foi estimar a variabilidade genética e ganho genético com a seleção de um teste de progênies. O teste de progênie consorciado com as espécies Myracrodruon urundeuva, Terminalia argentea e Astronium fraxinifolium, foi instalado em 12 de julho de 1994 na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão (FEPE), do campus de Ilha Solteira (FEIS/UNESP) na cidade Selvíria – MS. O delineamento utilizado foi o de blocos completos casualizados, contendo 28 progênies, seis plantas por parcela e quatro repetições para as espécies instaladas. Os caracteres altura e diâmetro a altura do peito (DAP) foram mensurados aos 24 anos após o plantio. Verificou-se a existência de variação genética significativa entre as progênies para os caracteres analisados. A alta taxa de sobrevivência indica boa adaptação da espécie em testes consorciados. As estimativas do coeficiente de variação genética tiveram resultados de 19,41% e 17,26% para DAP e altura, em nível de indivíduo, e de 9,7% e 8,63%, entr... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Myracrodruon urundeuva is a natural timber species with great potential for commercial use in Brazil, especially in the Pantanal, Cerrado and Caatinga regions, where native species are exploited. Intensive exploitation has caused great loss of individuals and the isolation of populations on islands due to the fragmentation of the species' habitat. Thus, the adoption of strategies for ex situ conservation of native species becomes indispensable. Two proposals were conceived in this work. The first was to estimate the genetic variability and genetic gain with the selection of a progeny test. The progeny test consortium with the species Myracrodruon urundeuva, Terminalia argentea and Astronium fraxinifolium, was installed on July 12, 1994 at the Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão (FEPE), at the campus of Ilha Solteira (FEIS / UNESP) in the city Selvíria MS. The design was a randomized complete block, containing 28 progenies, six plants per plot and four replications for the species installed. The height and diameter of the chest height (dch) were measured at 24 years after planting. There was significant genetic variation between the progenies for the characters analyzed. The high survival rate indicates good adaptation of the species in intercropping tests. Estimates of the coefficient of genetic variation showed results of 19.41% and 17.26% for DBH and height, at the individual level, and of 9.7% and 8.63% among progenies. The individual heritabilities ranged from moderate... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Miguel Luiz Menezes Freitas / Resumo: Araucaria angustifolia (Bertol.) O. Kuntze ou pinheiro-do-paraná é uma espécie florestal fornecedora de madeira valiosa e sementes de alto valor nutritivo, mas considerada em risco de extinção. A manutenção de plantios com a finalidade de conservação da espécie é uma estratégia complementar para reduzir a possibilidade de erosão genética em seu habitat natural. Assim, este trabalho teve por objetivo avaliar a viabilidade técnica e econômica da conservação genética da Araucaria angustifolia a partir de um teste de procedências e progênies, que será transformado em uma área de produção de sementes, com a finalidade de manter uma representação da base genética da espécie e fornecer material genético de qualidade para fins de produção de madeira e sementes. Estabeleceu-se o experimento em abril de 1982, na Estação Experimental de Itapeva, do Instituto Florestal, no Estado de São Paulo. O delineamento experimental adotado foi em blocos de famílias compactas com três repetições, cinco procedências (parcelas), 14 a 26 progênies/procedência (subparcelas), 10 plantas por subparcela e espaçamento de 3,0 x 2,0 metros. Avaliou-se o experimento aos 33 anos de idade tendo sido considerado os seguintes caracteres: sobrevivência (%), altura total (m), diâmetro à altura do peito (DAP, cm) e volume (m³). A análise genético-estatística do experimento com o auxílio do software Selegen estimou os parâmetros genéticos, conforme a metodologia do modelo linear misto univariado aditivo REML/BLUP (Res... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Araucaria angustifolia (Bertol.) O. Kuntze is a kind forest species supplier wooden valuable and seeds of recognized nutritional value, however considered threatened on extinction. Plantations maintenance with species conservation purpose is a complementary strategy to reduce genetic erosion in natural areas. So, the aim of this work was to evaluate technical and economic viability of Araucaria angustifolia genetic conservation by the use. The analyzed provenance and progeny test was established in 1982 at Itapeva Experimental Station – São Paulo State, from Forestry Institute, following a compact family blocks design with 110 open-pollinated progenies, from five natural populations, three replicates, ten plants per subplot, spaced from 3,0 x 2,0 meters. At age 33 the trial was measured for following traits: total height, diameter at breast height (DBH), wood volume and survival. The variance components and genetic parameters estimates were performed by REML/BLUP methods (Restricted maximum likelihood/Best linear unbiased prediction) using Selegen software. The production and management scenarios were obtained by using SisAraucaria software. Sensitivity analysis and economic parameters estimates were obtained through several methods of economic evaluation using the Planin software. In general, genetic parameters indicated that the evaluated population has enough variability for both conservation and breeding, and it suggests a technical viability use in seedling seed orchard.... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Submitted by Francine Silva (francine.silva@unipampa.edu.br) on 2019-03-28T18:29:35Z No. of bitstreams: 1 Caracterização cromossômica e molecular de bubalinos da traça carabao, do tipo baio e híbridos, mantidos em conservação no Brasil.pdf: 10651952 bytes, checksum: 21aa47651797989917f55aadc9e21c83 (MD5) / Made available in DSpace on 2019-03-28T18:29:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Caracterização cromossômica e molecular de bubalinos da traça carabao, do tipo baio e híbridos, mantidos em conservação no Brasil.pdf: 10651952 bytes, checksum: 21aa47651797989917f55aadc9e21c83 (MD5) Previous issue date: 2013-03-04 / Os búfalos do tipo Baio e da raça Carabao encontrados na Ilha de Marajó-Pará/ Brasil constituem duas pequenas populações com número muito reduzido de exemplares, o que os torna extremamente suscetíveis à extinção. De acordo com estudos citogenéticos, estes animais são divididos em dois grupos: os búfalos de rio que apresentam 2n=50, e os búfalos de pântano com 2n=48. O cruzamento entre ambos resulta na formação de híbridos viáveis e férteis com 2n=49, que apresentam na descendência a formação de animais 2n=48, 49 ou 50. Neste estudo foi avaliado um total de 110 animais (45 do tipo Baio, 50 da raça Carabao e 15 descendentes de uma fêmea híbrida), todos pertencentes ao programa brasileiro de conservação dos recursos genéticos. Utilizaram-se técnicas de citogenética clássica e de biologia molecular, para investigar possíveis alterações cromossômicas, a hibridização e aspectos evolutivos entre os búfalos. Para os búfalos do tipo Baio foi observado 2n=50, para a raça Carabao 2n=48, em três exemplares se observou 2n=49 confirmando a ocorrência de hibridização entre os animais do programa. Para alguns descendentes da linhagem híbrida foi observado número diplóide e cariótipo típico de animais da raça Carabao. As análises através de marcadores microssatélites CSSM06, 8, 42, 66 identificaram 13, 14, 6 e dois, o locus Hel9 identificou tres animais respectivamente, como híbridos. Estes resultados foram corroborados com os dados de registro genealógico do programa de conservação. Além disso, caracterizaram-se também as regiões organizadoras do nucléolo- Ag-NORs e FISH 18s, sendo observada uma divergência do número de NORs entre o tipo Baio, presente nos cromossomos 3p, 4p, 6, 21, 23 e 24, e a raça Carabao 4p, 6, 20, 22 e 23, sendo esta resultante da perda do sítio presente no cromossomo 4p ancestral dos búfalos de rio. Para o híbrido F1 foram observados os 11 sítios NORs sendo expressos e em associação, correspondendo as NORs de seus parentais. As análises genéticas realizadas neste trabalho foram implementadas no programa conservação como ferramenta auxiliar para a seleção dos animais. Além disso, estes resultados contribuem com informações sobre aspectos evolutivos entre os búfalos e o fenômeno da hibridização. / The buffaloes type Baio and race Carabao found in island Marajó-Pará/Brazil are two small populations with very few copies, which makes them extremely susceptible to extinction. According to cytogenetic studies, these animals are divided into two groups of buffalo river that have 2n = 50 and swamp buffaloes with 2n = 48, respectively. The cross between both results in formation of hybrids with 2n = 49 viable and fertile, showing the formation in the offspring of animals 2n =48, 49 or 50. This study evaluated a total of 110 animals (45 of type Baio, 50 and 15 Carabao breed offspring of a female hybrid), all belonging to the Brazilian program of conservation genetic resources. We used techniques of classical cytogenetics and molecular biology, to investigate possible chromosomal changes, hybridization and evolutionary aspects of the buffalo. For the buffaloes type Baio was observed 2n = 50 to 2n = Carabao race 48, in tree was observed 2n = 49 confirming the occurrence of hybridization between animals of the program. For some descendants of the hybrid strain was observed number diploid karyotype and typical breed animals Carabao. The analyzes of microsatellite markers by CSSM06, 8, 42, 66 identified 13, 14, 6 and two Hel9 locus identified three animals, respectively, as hybrids. These results were corroborated with data from genealogical record of the conservation program. Moreover, also characterized the nucleolus organizer regions of Ag-NOR and FISH-18s, being observed a divergence in the number of NORs between type Baio, present on chromosomes 3p, 4p, 6, 21, 23 and 24, and race Carabao 4p, 6, 20, 22 and 23, this being due to the loss of this site on chromosome 4p ancestor of the buffalo river. For the F1 hybrid were observed NORs the 11 sites being expressed and in combination, corresponding NORs of their parents. Genetic analyzes performed in this study were implemented in the conservation program as an auxiliary tool for the selection of animals. Furthermore, these results contribute information on evolutionary aspects between the buffalo and the phenomenon of hybridization.

Submitted by Jose Arimateia Rabelo Machado (j.rabelomachado@yahoo.com.br) on 2018-10-03T17:20:19Z No. of bitstreams: 1 José_Arimatéia_Rabelo_Machado_TESE.pdf: 2024903 bytes, checksum: a132fde6707feeb4ce5332d54cd29e32 (MD5) / Approved for entry into archive by Cristina Alexandra de Godoy null (cristina@adm.feis.unesp.br) on 2018-10-03T19:14:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 machado_jar_dr_ilha.pdf: 2269083 bytes, checksum: 4b12567aa4c4c01a5e22ddb916e96652 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-03T19:14:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 machado_jar_dr_ilha.pdf: 2269083 bytes, checksum: 4b12567aa4c4c01a5e22ddb916e96652 (MD5) Previous issue date: 2018-08-23 / Araucaria angustifolia (Bertol.) O. Kuntze ou pinheiro-do-paraná é uma espécie florestal fornecedora de madeira valiosa e sementes de alto valor nutritivo, mas considerada em risco de extinção. A manutenção de plantios com a finalidade de conservação da espécie é uma estratégia complementar para reduzir a possibilidade de erosão genética em seu habitat natural. Assim, este trabalho teve por objetivo avaliar a viabilidade técnica e econômica da conservação genética da Araucaria angustifolia a partir de um teste de procedências e progênies, que será transformado em uma área de produção de sementes, com a finalidade de manter uma representação da base genética da espécie e fornecer material genético de qualidade para fins de produção de madeira e sementes. Estabeleceu-se o experimento em abril de 1982, na Estação Experimental de Itapeva, do Instituto Florestal, no Estado de São Paulo. O delineamento experimental adotado foi em blocos de famílias compactas com três repetições, cinco procedências (parcelas), 14 a 26 progênies/procedência (subparcelas), 10 plantas por subparcela e espaçamento de 3,0 x 2,0 metros. Avaliou-se o experimento aos 33 anos de idade tendo sido considerado os seguintes caracteres: sobrevivência (%), altura total (m), diâmetro à altura do peito (DAP, cm) e volume (m³). A análise genético-estatística do experimento com o auxílio do software Selegen estimou os parâmetros genéticos, conforme a metodologia do modelo linear misto univariado aditivo REML/BLUP (Restricted maximum likelihood/Best linear unbiased prediction). A viabilidade econômica foi avaliada a partir dos cenários de produção e manejo, obtidos com o auxílio do software SISAraucaria, e da estimação dos parâmetros econômicos pelo software Planin. Os parâmetros genéticos indicaram boas condições tanto para a conservação quanto para o melhoramento, sugerindo haver viabilidade técnica para a transformação do teste em uma área de produção de sementes. Os parâmetros econômicos indicaram viabilidade da conservação, com a exploração da madeira, apesar do baixo crescimento e manejo inadequado do experimento. A exploração conjunta de madeira e pinhão se revelou uma estratégia altamente rentável, viável e recomendável, considerando os parâmetros econômicos estimados. A produção de sementes com qualidade genética superior poderá subsidiar novos plantios com maior produtividade do que à encontrada na população atual. Conclui-se que a conservação genética da araucária pelo uso é uma estratégia de conservação ex situ viável técnica e economicamente. / Araucaria angustifolia (Bertol.) O. Kuntze is a kind forest species supplier wooden valuable and seeds of recognized nutritional value, however considered threatened on extinction. Plantations maintenance with species conservation purpose is a complementary strategy to reduce genetic erosion in natural areas. So, the aim of this work was to evaluate technical and economic viability of Araucaria angustifolia genetic conservation by the use. The analyzed provenance and progeny test was established in 1982 at Itapeva Experimental Station – São Paulo State, from Forestry Institute, following a compact family blocks design with 110 open-pollinated progenies, from five natural populations, three replicates, ten plants per subplot, spaced from 3,0 x 2,0 meters. At age 33 the trial was measured for following traits: total height, diameter at breast height (DBH), wood volume and survival. The variance components and genetic parameters estimates were performed by REML/BLUP methods (Restricted maximum likelihood/Best linear unbiased prediction) using Selegen software. The production and management scenarios were obtained by using SisAraucaria software. Sensitivity analysis and economic parameters estimates were obtained through several methods of economic evaluation using the Planin software. In general, genetic parameters indicated that the evaluated population has enough variability for both conservation and breeding, and it suggests a technical viability use in seedling seed orchard. The economic parameters indicated viability of conservation with wood exploitation, despite the low growth and the inadequate trial management. Exploitation of both: wood and seeds has proved to be a highly profitable, viable and recommended strategy facing the excellent estimates of economic parameters. The production of seeds with genetic quality may also support new plantations with higher productivity than those from current population. In conclusion, the araucaria genetic conservation by use is an technically and economic viable ex situ conservation strategy.

Submitted by MAIARA RIBEIRO CORNACINI null (maiara.cornacini@gmail.com) on 2016-10-18T17:57:05Z No. of bitstreams: 1 Dissertação CORNACINI, MAIARA RIBEIRO.pdf: 2933162 bytes, checksum: 4f4113567325d36125ed44efb332d836 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-10-21T18:47:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 cornacini_mr_me_ilha.pdf: 2933162 bytes, checksum: 4f4113567325d36125ed44efb332d836 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-21T18:47:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 cornacini_mr_me_ilha.pdf: 2933162 bytes, checksum: 4f4113567325d36125ed44efb332d836 (MD5) Previous issue date: 2016-08-10 / The aim is to propose a management plan for progeny and provenance tests of Astronium fraxinifolium Schott and Jacaranda cuspidifolia Mart. It will be based on knowledge of genetic variability in an effort to promote the conservation of their genetic potential for commercial and environmental purposes. The test was originally installed in 1996 in Selvíria, Mato Grossa do Sul (MS) using an experimental design of randomized complete block design. We applied a total of 30 treatments (progenies) of provenance in Ilha Solteira, São Paulo (SP) and 30 treatments of provenance in Selvíria, MS with five repetitions for A. fraxinifolium and 30 treatments and 10 repetitions for J. cuspidifolia. The experimental plots were installed in a linear array, with 10 plants per plot, spaced 3 × 1.5m in alternate plantings. The silvicultural traits of both species were measured from 18 years after planting and sex determination of A. fraxinifolium individuals. The estimates of variance components and genetic parameters were obtained by employing the genetic statistical software SELEGEN-REML / BLUP. To investigate the genetic diversity the Mahalanobis distances and grouping of Tocher optimization model was used. It detected significant differences among provenances for DAP and ALT, between and within progenies for all growth traits, except FOR within progenies in A. fraxinifolium. The heritability coefficient average level progenies ranged from 0.59 to 0.89 and individual heritability from 0.14 to 0.35. The accuracy was high (> 0.65) and the coefficient of genetic variations were higher than 5.6. From total number of A. fraxinifolium individuals of just 11% and 16% are in flowering from Ilha Solteira, SP and Selvíra, MS provenances, respectively; with a predominance of individuals with male flowers. The Mahaloanobis distance was found at a maximum distance of 31.75 and a low of 0.23 between progenies. The A. fraxinifolium progenies of Ilha Solteira and Selvíria were grouped into eight and four groups. J. cuspidifolia progenies were grouped into six groups. The selection strategy within progenies, with selection of 50% of individuals based on DAP trait, revealed low gains in the selection. However, it is more suitable for this test because it does not alter the genetic structure of the population nor does it reduce the likelihood of crossings between relatives. Therefore, this proposal for selective thinning is most appropriate as the flowering percentage of individuals is low, making it impractical sex determination of total individuals. Consequently, the estimates of the parameters accurately suggest such an application is at a high level of selective high intensity. / O objetivo do trabalho foi propor um desbaste seletivo visando o manejo de um teste de progênies e procedências de Astronium fraxinifolium Schott e Jacaranda cuspidifolia Mart com base no conhecimento da variabilidade genética, visando a conservação do seu potencial genético para fins comercial e ambiental. O teste foi instalado em 1996 em Selvíria-MS, sendo o delineamento experimental utilizado de blocos completos casualizados. Foram utilizados 60 tratamentos (progênies) sendo 30 da procedência de Ilha Solteira-SP e 30 da de Selvíria-MS com cinco repetições para A. fraxinifolium e 30 tratamentos e 10 repetições para J. cuspidifolia. As parcelas do experimento foram instaladas, obedecendo a uma disposição linear, com 10 plantas por parcela, no espaçamento de 3 × 1,5 m, em plantio alternado. Foram mensurados os caracteres silviculturais das duas espécies aos 18 anos após o plantio e a sexagem dos indivíduos de A. fraxinifolium. As estimativas de componentes de variância e parâmetros genéticos foram obtidas empregando-se o software genético-estatístico SELEGEN-REML/BLUP. Para investigar a divergência genética utilizou-se as distâncias de Mahalanobis e o agrupamento por otimização de Tocher. Detectou-se diferenças significativas entre procedências para os caracteres DAP (diâmetro a altura do peito) e ALT (altura total da planta), entre e dentro de progênies para todos os caracteres de crescimento, exceto FOR (forma de fuste) dentro de progênies em A. fraxinifolium. O coeficiente de herdabilidade em nível de média de progênies variou de 0,59 a 0,89 e a herdabilidade individual de 0,14 a 0,35. A acurácia foi alta (> 0,65) e os coeficientes de variação genética foram maiores que 5,6. A porcentagem de indivíduos em floração nas procedências de Ilha Solteira e Selvíria de A. fraxinifolium foram de 11% e 16%, respectivamente, com predominância de indivíduos com flores masculinas. As progênies de A. fraxinifolium de Ilha Solteira e Selvíria foram agrupadas em oito e quatro grupos e as progênies de J. cuspidifolia em seis grupos pela otimização de Tocher. A estratégia de seleção dentro de progênies, com seleção de 50% dos indivíduos com base no caráter DAP, revelou baixos ganhos na seleção, porém é a mais indicada para esse teste, pois não alterará a variabilidade genética da população e diminuirá a probabilidade de cruzamentos entre parentes. Essa proposta de desbaste seletivo é mais adequada visto que a porcentagem de indivíduos em florescimento é baixa, o que inviabiliza a sexagem completa do teste, e, consequentemente, as estimativas mais acuradas de parâmetros genéticos como o tamanho efetivo populacional.

Submitted by MARÍLIA FREITAS DE VASCONCELOS MELO null (mariliafvm@yahoo.com.br) on 2017-01-30T15:23:39Z No. of bitstreams: 1 TESE_FINAL_novas_normas_Marília.pdf: 1896101 bytes, checksum: 142600ba35ab52814844133ca6cc3e98 (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-02-03T11:57:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 melo_mfv_dr_bot.pdf: 1896101 bytes, checksum: 142600ba35ab52814844133ca6cc3e98 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-03T11:57:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 melo_mfv_dr_bot.pdf: 1896101 bytes, checksum: 142600ba35ab52814844133ca6cc3e98 (MD5) Previous issue date: 2016-12-15 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Estudos sobre ecologia e genética de populações são fundamentais para entender os efeitos da fragmentação sobre espécies florestais. Um estudo baseado em genética quantitativa e marcadores microssatélites foi realizado para investigar a diversidade genética, estrutura genética espacial, sistema de reprodução e a dispersão de pólen em uma população natural e em um teste de progênies de Genipa americana L. para fins de conservação e melhoramento genético. As coletas foram realizadas em duas populações: a primeira localizada no nordeste do Brasil, em uma área de transição entre a Mata Atlântica e a Caatinga (POP-SE) e a segunda no sudeste, em um Banco Ativo de Germoplasma estabelecido em área de transição entre a Mata Atlântica representada pela Florestal Estacional Semidecidual e o Cerrado (POP-SP). Foram coletados tecidos foliares de 30 árvores matrizes e 20 plantas/progênie em cada uma das populações. As análises do sistema de reprodução foram realizadas com base no modelo misto de reprodução e modelo de cruzamentos correlacionados. Como esperado em espécies dióicas, todas as progênies foram originadas de cruzamento (tm = 1). A taxa de cruzamento entre parentes (tm – ts) e a correlação de paternidade (rp) foram variáveis entre famílias (tm – ts= 0,03-0,19; rp= 0,04-0,40). O índice de fixação (F) foi significativamente menor em adultos que em progênies, indicando seleção contra indivíduos endogâmicos. A correlação de paternidade dentro de frutos (0,40) foi maior que entre frutos (0,26), indicando um menor número efetivo de doadores de pólen (Nep) dentro de frutos (2,5) que entre frutos (3,8). Devido a maior rp na POP-SE, o tamanho efetivo dentro de famílias nesta população foi menor (2,69) que na POP-SP (3,27). O coeficiente de correlação de Spearman mostrou que o aumento no Nep aumenta a diversidade genética e o Ne dentro de famílias. O padrão de dispersão de pólen foi fortemente leptocúrtico, sugerindo dispersão de pólen a longa distância (média = 179 m). Os resultados evidenciam a variabilidade genética entre os indivíduos e indicam a potencialidade dos mesmos para a conservação in situ, coleta de sementes para formação de bancos de germoplasma, bem como para a recuperação de áreas degradadas e futuros programas de melhoramento genético em áreas de transição entre diferentes biomas. / Studies about ecology and population genetics are essential to understand the effects of fragmentation on forest species. A study based on quantitative genetics and microsatellite markers was conducted to investigate the genetic diversity, spatial genetic structure, mating system and pollen dispersal in a natural population and onan progenies test of Genipa americana L. aiming conservation and breeding. Samples were collected in two populations: the first located in the northeast of Brazil, in a transition area between the Atlantic Forest and Caatinga (POP-SE) and the second in the southeast, in an Active Germplasm Bank established in area transition between the Atlantic represented by Forest Semideciduous and the Cerrado (POPSP). Leaf tissues were collected from 30 seed-trees and 20 plants/progeny in each of the populations. The analysis of the mating system were performed based on the mixed mating model and correlated crosses model. As expected in dioecious species, all offspring were originated from outcrossing ( m t = 1). The mating among relatives rate ( m s t t ) and paternity correlation ( p r ) were variable among families ( m s t t = 0.03-0.19; p r = 0.04-0.40), especially in NP. Fixation index ( F ) was generally significant lower in the adults than offspring, indicating selection against inbreed individuals. The paternity correlation within fruits (0.40) was higher than among fruits (0.26), indicating that lower effective number of pollen donors ( ep N ) within fruit (2.5) than among fruits (3.8). Due to the highest p r in NP, the effective size within families ( e N ) was lower in NP (2.69) than PT (3.27). The Spearman ranking correlation showed that the increase in ep N increase the genetic diversity and e N within families. The pollen dispersal pattern was strongly leptokurtic, suggesting long pollen dispersal distance (mean= 179 m). The results show the genetic variability among individuals and indicate the suitability of the same for conservation in-situ, seed collection for genebanks in training, as well as the recovery of degraded areas and future programs of breeding in transition areas between different biomes. / FAPESP: 13/19444-6

Orientador: Ananda Virginia de Aguiar / Resumo: The aim is to propose a management plan for progeny and provenance tests of Astronium fraxinifolium Schott and Jacaranda cuspidifolia Mart. It will be based on knowledge of genetic variability in an effort to promote the conservation of their genetic potential for commercial and environmental purposes. The test was originally installed in 1996 in Selvíria, Mato Grossa do Sul (MS) using an experimental design of randomized complete block design. We applied a total of 30 treatments (progenies) of provenance in Ilha Solteira, São Paulo (SP) and 30 treatments of provenance in Selvíria, MS with five repetitions for A. fraxinifolium and 30 treatments and 10 repetitions for J. cuspidifolia. The experimental plots were installed in a linear array, with 10 plants per plot, spaced 3 × 1.5m in alternate plantings. The silvicultural traits of both species were measured from 18 years after planting and sex determination of A. fraxinifolium individuals. The estimates of variance components and genetic parameters were obtained by employing the genetic statistical software SELEGEN-REML / BLUP. To investigate the genetic diversity the Mahalanobis distances and grouping of Tocher optimization model was used. It detected significant differences among provenances for DAP and ALT, between and within progenies for all growth traits, except FOR within progenies in A. fraxinifolium. The heritability coefficient average level progenies ranged from 0.59 to 0.89 and individual heritability from 0.14 to... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre

Orientador: Fábio Porto Foresti / Banca: José Augusto Senhorini / Banca: Celso Benites / Resumo: A hibridação artificial interespecífica de peixes é utilizada em diversos estabelecimentos voltados à piscicultura no país, com a finalidade de produzir indivíduos mais vantajosos e favoráveis para o cultivo. Porém, devido principalmente às dificuldades encontradas na identificação dos híbridos, esta prática pode determinar o surgimento de sérios problemas como a contaminação genética dos estoques de cultivo, a comercialização de produtos híbridos como espécies puras, a introdução de espécies exóticas e escapes de produtos de piscicultura para o ambiente natural e até eventos de introgressão genética e extinção das espécies nativas. Neste contexto, o presente trabalho teve por objetivo analisar geneticamente exemplares das linhagens parentais de Pseudoplatystoma corruscans (pintado) e Pseudoplatystoma reticulatum (cachara) e seus híbridos interespecíficos "pintachara" (macho de pintado x fêmea de cachara) e "cachapinta" (fêmea de cachara x macho de pintado), provenientes dos estoques de cultivo do CEPTAlICMBio, Pirassununga, SP, a fim de identificar e estabelecer marcadores genéticos para possibilitar sua identificação e diferenciação. Também foram analisadas geneticamente amostras de P. corruscans e P. reticulatum coletadas no Rio Paraguai, MS (bacia do Paraguai) e de P. corruscans capturados do rio Mogi- Guaçu, SP (bacia do Alto Paraná), a fim de identificar a possível ocorrência de híbridos entre estas espécies na natureza. As análises citogenéticas revelaram um número diploide de 2n=56 cromossomos para ambas as espécies parentais, com cariótipos caracterizados por cromossomos dos tipos 20m+12am+12st+12a e número fundamental (NF) igual a 100, indicando uma fórmula cariotípica conservada entre estas espécies. A análise dos padrões de heterocromatina pelo bandamento C revelou blocos heterocromáticos localizados nas porções... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Artificial interspecific hybridization of fish is used in various establishments linked to fish farming in the country, in order to produce individuais more advantageous and favorable for cultivation. However, due mainly to difficulties in the hybrid products identification, this practice may determine the onset of serious problems such as genetic contamination of the breeder stocks, marketing of hybrids as pure species, introduction of exotic species and escapes of farmed products to the natural environment and sometimes leading to events of genetic introgression and extinction of native species. In such context, the present study aimed to analyze genetically copies of the parental lines of Pseudoplatystoma corruscans (pintado) and Pseudoplatystoma reticulatum (cachara) and their interspecific hybrids "pintachara" (female of pintado x male of cachara) and "cachapinta" (female of cachara x male of pintado), from the stocks manteined in CEPTAlICMBio, Pirassununga, SP, in order to characterize and establish genetic markers to allow their identification and differentiation. Samples of P. corruscans and P. reticulatum collected in the Paraguay river, MS (Paraguay basin) and P. corruscans captured in Mogi-Guaçu river, SP (Alto Paraná basin), also were genetically analyzed in order to identify the possible occurrence of hybrids between these species in nature. The cytogenetic analysis revealed a diploid number of 2n = 56 chromosomes for both parental species with karyotypes characterized by the formula 20m+12am+12st+12a and fundamental number (NF) of 100, indicating a karyotypic formula conserved among these species. The analysis of the heterochromatin C-banding patterns revealed heterochromatic blocks located in the pericentromeric and terminal portions of some chromosomes, the NOR was sim pie and located in one chromosome pai r and 5S ribosomal genes located on two different subtelocentric... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre