A erva-mate, IIex paraguariensis St. Hil., como qualquer espécie vegetal está sujeita á doenças, que podem provocar prejuízos ou até mesmo inviabilizar seu cultivo. Entre estas, encontra-se a pinta-preta causada por Cylindrocladium spathulatum El GholI, Kimbrough, Barnard, Alfieri & Schoulties, principal doença foliar desta cultura. Ela pode causar perdas significativas, tanto em viveiro, quanto em plantios e, até o momento, tem sido controlada com fungicida mesmo sem existir produtos registrados. O principal objetivo deste trabalho foi selecionar e avaliar antagonistas visando o controle biológico da pinta-preta. Em uma primeira fase, foi feito o isolamento de antagonistas, em seguida foram feitos testes em laboratório, in vitro, e, após a seleção inicial, fez-se a avaliação do potencial antagônico dos melhores isolados em testes com folhas destacadas e em mudas, na casa-de-vegetação. Os experimentos foram conduzidos na Embrapa Florestas, Colombo/PR. Os microrganismos antagônicos residentes utilizados foram isolados de (1) solo infectado com o patógeno, proveniente de plantio comercial em São Mateus do Sul/PR; (2) lavagem de folhas de erva-mate nativa em Colombo/PR e (3) purificação de colônias de microrganismos surgidas em isolamento de lesões de pinta-preta. Os outros microrganismos foram procedentes de Jaguariúna/SP (isolados de Baclilus subtilis) e Bento Gonçalves/RS (isolados de Trichoderma). O experimento inicial foi executado em placas de Petri, acondicionadas em câmara de germinação "BOD" à temperatura de 22 ± 0,5°C e luz fria alternada (12/12 h), utilizando-se 30 isolados de fungos e bactérias, residentes ou não em erva-mate. Posteriormente, foram selecionados 3 isolados de bactérias e 3 de Trichoderma, que apresentaram maior percentual de inibição, em teste de produção de antibióticos e no teste de hiperparasitismo, respectivamente. Esses 6 isolados foram empregados nos testes subseqüentes com papel celofane, placas sobrepostas e inibição de germinação de esporos e, ainda, em folhas destacadas (laboratório) e em mudas (casa-de-vegetação). Concluiu-se que os métodos in vivo foram considerados mais adequados para a seleção de antagonistas que os métodos in vitro. Os isolados de bactérias, de um modo geral, foram mais eficientes que de Trichoderma. Os melhores resultados foram obtidos com o isolado AP-49 (B. subtilis) com 10% de incidência da doença, contra 90% de incidência na testemunha, em mudas. Estes resultados indicam a possibilidade do uso de antagonistas no controle da pinta-preta da erva-mate.

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2017-08-18T12:24:44Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DissertaçãoPPGBF_MarinaAraújo__VF_2016_MA.pdf: 3564525 bytes, checksum: 787b002a72b4c3884e6c55f35a8f508d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-18T12:24:45Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DissertaçãoPPGBF_MarinaAraújo__VF_2016_MA.pdf: 3564525 bytes, checksum: 787b002a72b4c3884e6c55f35a8f508d (MD5) Previous issue date: 2016-02-17 / CNPQ / Os fragmentos de Mata Atlântica do Nordeste brasileiro representam um abrigo para a diversidade de espécies e a redução de vários hectares de mata ao longo dos anos gera perda de diversidade, principalmente, da micobiota microscópica associada a esses ambientes. O desenvolvimento rural sustentável necessita de práticas menos agressivas ao ambiente e, dessa forma, os Sistemas Agroflorestais (SAFs), pela semelhança aos ecossistemas naturais em estrutura e diversidade, têm papel de destaque como alternativa para produção agrícola. Os ambientes de mata, assim como os SAFs, além de fornecerem diferentes substratos para a colonização fúngica, propiciam um ambiente com calor e umidade essenciais para o desenvolvimento de fungos. A micobiota microscópica em folhas em decomposição é composta principalmente por fungos conidiais. Esses fungos exibem grande diversidade de formas e adaptações, estando entre os principais decompositores da matéria orgânica. Dessa forma, o presente trabalho teve por objetivo realizar um estudo de diversidade de fungos conidiais e biomassa fúngica em folhedo de sistema agroflorestal, comparando-o com um fragmento de Mata Atlântica, na região Norte de Pernambuco. Coletas bimestrais foram realizadas na Mata Atlântica nativa de Monjope e no Sítio São João – Sistema agroflorestal (ambos em Abreu e Lima - PE), entre agosto de 2014 e maio de 2015. As amostras de folhedo foram submetidas à técnica de lavagem em água corrente, colocados em câmaras-úmidas e incubados em temperatura ambiente por um período de 45 dias, sendo observados diariamente sob estereomicroscópio. Lâminas semi-permanentes e permanentes foram confeccionadas com as estruturas reprodutivas para a identificação morfológica dos espécimes. As lâminas foram depositadas no Herbário URM da UFPE. A análise da biomassa de fungos no folhedo foi realizada pelo método de quantificação do ergosterol e a relação entre o teor de ergosterol e a ocorrência de fungos conidiais foi determinada. Foram registradas ocorrências de 65 táxons de fungos conidiais, incluindo uma nova espécie (Selenodriella amoena) e uma nova ocorrência para a América do Sul (Linodochium sideroxyli). A concentração de ergosterol foi diferente entre as duas áreas estudadas nos meses de out./14, jan./15 e maio/15, sendo maior no SAF em todos os períodos. O teor de ergosterol da biomassa de fungos no folhedo, em ambas as áreas, possui forte correlação com a ocorrência dos fungos conidiais. Este estudo contribui para ampliar o conhecimento da diversidade de fungos conidiais presentes em folhedo em Pernambuco. / The Brazilian Northeast Atlantic Forest fragments represent a refuge for species diversity and the reduction of several hectares of forest over the years generates loss of diversity, especially microscopic mycobiota associated with these environments. Sustainable rural development requires less aggressive practices to the environment and thus agroforestry systems (AFS), with their similarity to natural ecosystems in structure and diversity, have an important role as an alternative for agricultural production. The forest environments, as well as the SAF’s, provide various substrates for fungal colonization and an environment with heat and humidity essential for the development of fungi. Microscopic mycobiota in decaying leaves is mainly composed of conidial fungi. These fungi exhibit great diversity of shapes and adaptations, being among the major decomposers of organic matter. Thus, this study aimed to investigate conidial fungal diversity and fungal biomass in leaf litter of agroforestry system by comparing it with a fragment of Atlantic Forest in the northern region of Pernambuco. Every two months, samples were taken in the Monjope native Atlantic Forest and Sítio São João - Agroforestry system (both in Abreu e Lima - PE) between August 2014 and May 2015. The litter samples were submitted to the washing technique in running water, placed in humid chambers, and incubated at room temperature for a period of 45 days and observed daily under a stereomicroscope. Semi-permanent and permanent slides were prepared with the reproductive structures for morphological identification of specimens. The slides were deposited in the Herbarium URM UFPE. Analysis of the fungal biomass in leaf litter was carried out using the quantification of ergosterol and the relationship between the ergosterol content and the presence of fungal conidia was determined. The occurrence of 65 taxa of conidial fungi was recorded, including a new species (Selenodriella amoena) and a new record for South America (Linodochium sideroxyli). The concentration of ergosterol was different between the two study areas in the months of Oct. / 14, Jan. / 15 and May / 15, being higher in the SAF in all periods. The ergosterol content of the fungal biomass in leaf litter in both areas has strong correlation with the occurrence of conidial fungi. This study contributes to the understanding of the diversity of conidial fungi present in litter in Pernambuco.

Submitted by Jorge Silva (jorgelmsilva@ufrrj.br) on 2017-08-22T18:10:01Z No. of bitstreams: 1 2016 - Kerly Martinez Andrade.pdf: 5719602 bytes, checksum: 90b1873e2b692ed4bcabe9969709919b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-22T18:10:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016 - Kerly Martinez Andrade.pdf: 5719602 bytes, checksum: 90b1873e2b692ed4bcabe9969709919b (MD5) Previous issue date: 2016-09-05 / CAPES / The Atlantic Forest is one of the ecosystems richest in biological diversity of the planet and is directly responsible for the quality of life of thousands of Brazilians. Among the species present in the Atlantic including PNM Curi?, Paracambi, R.J., are present cercosporoid fungi, represented by the genus Cercospora. Are plant parasitic fungi, polyphagous and cosmopolitan, causing leaf spots, as well as in flowers, fruits and cereal seeds, vegetables, ornamental plants of forest trees and grasses. These fungi were quite challenged in recent years, mainly because of its immense morphological variation and studies based on nucleic acid sequences, have become widely used for the elucidation of several doubts in its taxonomy, then for the knowledge and description of new species in new hosts are so important to discuss their morphology as well as studies using molecular data for this group. This work was developed aiming to increase the knowledge of biodiversity of cercosporoid fungi associated to different botanical families from the Atlantic Forest in the state of Rio de Janeiro. From October, 2014 to May, 2016 several collections of plants with leaf spot symptoms were collected in Atlantic Forest areas, especially in the PNM Curi?, Paracambi, RJ. and areas of the municipality of Serop?dica, RJ. and taken to DENF laboratories (Mycology) / UFRRJ, and studied using optical, dissecting and scanning electron microscope techniques and several attempts of isolation in axenic culture media were made, for their in vitro characterization and extraction of DNA for molecular characterization studies. Collection of material was done at five different times in PNM Curi? and several other sporadic within the campus UFRRJ and Fazendinha EMBRAPA Agrobiology - Serop?dica. It was about 150 samples, of which 22 species are presented in this work, in Cercospora genres (2 species), Passalora (2 species) and Pseudocercospora (18 species). Ten species were isolated in PDA medium and had their molecular analysis performed with ITS (IT1-5.8S-ITS2). Based on morphometric data are proposed 21 likely new species and a known one found in B. nivea, which was confirmed with molecular data. These species will be presented as well as its taxonomic position discussed. / O bioma Mata Atl?ntica representa um dos ecossistemas com maior riqueza em diversidade biol?gica do planeta e ? diretamente respons?vel pela qualidade de vida de milhares de brasileiros. Entre as esp?cies presentes na Mata Atl?ntica incluindo PNM Curi?, Paracambi, R.J., est?o presentes os fungos cercospor?ides, representados pelo g?nero Cercospora. S?o fungos fitoparasitas, pol?fagos e cosmopolitas, causadores de manchas foliares, em flores, frutos e sementes de cereais, hortali?as, plantas ornamentais, de ess?ncias florestais e de gram?neas. Estes fungos foram bastante questionados nos ?ltimos anos, principalmente pela sua imensa varia??o morfol?gica e estudos baseados em sequ?ncias de ?cidos nucleicos, tornaram-se amplamente utilizados para a elucida??o de v?rias d?vidas taxon?micas logo, ? importante o conhecimento e descri??o de novas esp?cies em novos hospedeiros e discutir sua morfologia bem como realizar estudos com dados moleculares para este grupo. Este trabalho foi desenvolvido com o objetivo de ampliar o conhecimento da biodiversidade f?ngica de cercosp?roides associada a diferentes fam?lias bot?nicas representadas da Mata Atl?ntica, no Estado do Rio de Janeiro. Durante o per?odo de outubro de 2014-maio 2016, 150 plantas com sintomas de manchas foliares foram coletadas em ?reas de Mata Atl?ntica, em especial no PNM do Curi?, Paracambi-RJ, e ?reas do munic?pio de Serop?dica, RJ. Foram levados aos laborat?rios do DENF (Setor de Micologia)/ICBS/UFRRJ e estudados usando t?cnicas de microscopia ?ptica, estereosc?pica e eletr?nica de varredura. V?rias tentativas de isolamentos em meio ax?nico foram efetuadas, visando sua caracteriza??o in vitro e extra??o de DNA para estudos de caracteriza??o molecular (laborat?rios da EMBRAPA Agrobiologia). Foram efetuadas cinco coletas em diferentes ?pocas no PNM Curi? e v?rias outras espor?dicas dentro do Campus da UFRRJ, bem como Fazendinha da EMBRAPA Agrobiologia ? Serop?dica. Totalizaram-se cerca de 150 amostras, das quais 22 esp?cies foram estudadas e s?o apresentadas neste trabalho, nos g?neros Cercospora (2 esp?cies), Passalora (2 esp?cies) e Pseudocercospora (18 esp?cies). Dez esp?cies foram isoladas em meio BDA e tiveram sua an?lise molecular efetuada com ITS (IT1-5.8S-ITS2). Com base em dados morfom?tricos, s?o propostas 21 prov?veis novas esp?cies e uma j? conhecida encontrada em B. nivea, o qual teve a confirma??o com dados moleculares. Estas esp?cies ser?o apresentadas, bem como sua posi??o taxon?mica discutida.

Submitted by Ricardo Cedraz Duque Moliterno (ricardo.moliterno@uefs.br) on 2015-08-07T22:20:38Z No. of bitstreams: 1 Patr?cia Oliveira Fiuza_DISSERTA??O.pdf: 30896151 bytes, checksum: b11de629f19a7cd5583ce2b2f1afbd36 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-08-07T22:20:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Patr?cia Oliveira Fiuza_DISSERTA??O.pdf: 30896151 bytes, checksum: b11de629f19a7cd5583ce2b2f1afbd36 (MD5) Previous issue date: 2013-03-26 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Ingoldian fungi are aquatic hyphomycetes that presents conidia sigmoid or branch and occur in lotic and lentic environment, being easily found in foam of water bodies. Aiming to contribute to the knowledge of the biodiversity of Ingoldian fungi in semiarid region, was conducted an inventory in water bodies of areas of extreme biological importance of the Brazilian semiarid. In a single expedition, samples of foam and submerged leaves were collected in water bodies of four localities in semiarid region (Brejo Paraibano-PB, Serra da Jib?ia-BA, Chapada do Araripe and Serra de Ibiapaba-CE). The samples of foam were collected and packaged in plastic bottles of 250 mL and the submerged leaves were packaged in plastic bags. In ?Laborat?rio de Micologia?(LAMIC), the foam was homogenized and 200 ?L of each sample were transferred to 30 slides, which were exposed at room temperature to evaporation. After evaporation, was addition of one drop of lactic acid and sealed with nail polish. Samples of submerged leaves were subjected to the technique of washing in flowing water and cut into pieces of 1 cm?, that were placed in petri dishes containing distilled sterile water for observation of fungi. The bottles and slides were deposited in the ?Herb?rio da Universidade Estadual de Feira de Santana? (HUEFS). The pure cultures were deposited in the ?Cole??o de Cultura de Micro-organismos da Bahia? (CCMB). The first chapter presents all 27 taxa of Ingoldian fungi found in the study, 23 of these taxa present description, geographic distribution, taxonomic comments and illustration; 22 are new records: american continent (3), Neotropics (1), South America (3), Brazil (5), Brazilian semiarid region (7), Cear? (2) and Para?ba (1). The second chapter shows all species of the genus Campylospora with descriptions, comments, geographical distribution, a key to the genus and illustrations. The water body with the highest number of taxa of Ingoldian fungi was the river Miss?o velha. / Os fungos ingoldianos s?o hifomicetos aqu?ticos que apresentam con?dios sigmoides ou ramificados e ocorrem em ambientes l?ticos e l?nticos, sendo encontrados facilmente nas espumas de corpos d??gua. Visando contribuir com o conhecimento da biodiversidade de fungos ingoldianos na regi?o semi?rida foi realizado um invent?rio em corpos d??gua de ?reas de extrema import?ncia biol?gica do semi?rido brasileiro. Em uma expedi??o, amostras de espuma e folhas submersas foram coletadas em corpos d??gua de quatro localidades na regi?o semi?rida (Brejo Paraibano-PB, Serra da Jib?ia-BA, Chapada do Araripe e Serra de Ibiapaba-CE). As amostras de espuma foram coletadas e acondicionadas em frascos pl?sticos de 250 mL e as amostras de folhas submersas foram acondicionadas em sacos pl?sticos. No Laborat?rio de Micologia (LAMIC), a espuma foi homogeneizada e 200 ?L de cada amostra foram transferidos para 30 l?minas, as quais ficaram expostas ? temperatura ambiente para evapora??o. Ap?s a evapora??o, foi adicionada uma gota de ?cido l?ctico e vedada com esmalte. Amostras de folhas submersas foram submetidas ? t?cnica de lavagem em ?gua corrente e cortadas em peda?os de 1 cm?, os quais foram colocados em placas de Petri com ?gua destilada esterilizada para observa??o dos fungos. Os frascos e l?minas foram depositados no Herb?rio da Universidade Estadual de Feira de Santana (HUEFS). As culturas puras foram depositadas na Cole??o de Cultura de Microrganismos da Bahia (CCMB). O primeiro cap?tulo apresenta todos os 27 t?xons de fungos ingoldianos encontrados no estudo, 23 destes t?xons apresentam descri??o, distribui??o geogr?fica, coment?rios taxon?micos e ilustra??o; 22 representam novos registros: continente americano (3), Neotr?pico (1), Am?rica do Sul (3), Brasil (5), regi?o semi?rida brasileira (7), Cear? (2), Para?ba (1). O segundo cap?tulo apresenta todas as esp?cies do g?nero Campylospora, com descri??es, coment?rios taxon?micos, distribui??o geogr?fica, chave taxon?mica para o g?nero e ilustra??es. O corpo d? ?gua que apresentou o maior n?mero de t?xons de fungos ingoldianos foi o rio Miss?o Velha.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / According to the River Continuum Concept, in small rivers, corresponding to ~ 80% of river basins, the main energy source for the trophic chain is the material produced in riparian zones, especially leaves. This material goes through the process of decomposition, which is responsible for the nutrients cycling and maintenance of aquatic communities. In this context, the objective of this study is to investigate the effects of physical, chemical and physiological traits of plant species on microbial activity and fragmentation, and as a consequence on decomposition rates. In the first chapter we investigated the activity of Phylloicus fragmentation in relation to food resources with different leaf traits. We found that the shredders have their food activity stimulated by substrate with less amount of lignin, which facilitates fungus conditioning and promotes the palatability of the detritus. In the second chapter, we investigated the feeding preference and assimilation of C3 and C4 carbon by Phylloicus and Aegla longirostri. We found that the shredders consume more the C4 species, but do not alter its isotopic signature and the intense activity of the hyphomycetes in the leaves C4 stimulated the consumption by the shredders. In the third chapter we investigated the effect of nutrient enrichment on soil and water on leaf nutritional quality and decomposition rates. We showed that the fertilized trees promoted leaves more nutritious than leaves of unfertilized trees. In addition, we found that the effect of nutrient enrichment on water was stronger than the nutrient enrichment of leaves in the decomposition process. Within the three chapters, we verified that the activities of the shredders and fungi are influenced by the characteristics of the leaves and are related to the riparian vegetation, especially by C3 carbon. We verified that the structural compounds are determinant for the microbial colonization and consequently for the fragmentation and litter decomposition. We also verified that the enrichment of nutrients in the water may be more important for the process of leaf decomposition than the nutrients in the leaves. / De acordo com a teoria do Contínuo Fluvial, nos pequenos rios florestados, que correspondem a ~80% das bacias hidrográficas, a principal fonte de energia para a cadeia trófica é o material produzido nas zonas ripárias, especialmente folhas. Este material passa pelo processo de decomposição, que é responsável pela ciclagem de nutrientes e manutenção das comunidades aquáticas. Neste contexto, o objetivo deste estudo é investigar os efeitos dos traços físicos, químicos e fisiológicos das espécies vegetais na atividade de microrganismos e invertebrados decompositores, e como consequência nas taxas de decomposição. No primeiro capítulo investigamos a atividade de fragmentação de Phylloicus frente a recursos alimentares com características foliares diferentes. Nós constatamos que os fragmentadores têm sua atividade alimentar estimulada por substrato com menor quantidade de lignina, o que facilita o condicionamento por fungos e promove a palatabilidade do detrito. No segundo capítulo, investigamos a preferência alimentar e assimilação C3 e C4 por Phylloicus e Aegla longirostri. Constatamos que os fragmentadores consomem mais a espécie C4, porém não alteram sua assinatura isotópica. E a intensa atividade dos hifomicetos nas folhas C4 estimulou o maior consumo pelos fragmentadores. No terceiro capítulo investigamos o efeito do enriquecimento de nutrientes no solo e na água na qualidade nutricional das folhas e nas taxas de decomposição. Evidenciamos que as plantas fertilizadas geraram folhas mais nutritivas que as não fertilizadas. Além disso, averiguamos que o efeito do aumento de nutrientes na água foi mais forte do que o efeito de nutrientes das folhas no processo de decomposição. Com os três capítulos verificamos que as atividades dos fragmentadores e fungos são influenciadas pelas características das folhas e estão relacionadas com a vegetação ripária, especialmente por carbono C3. Constatamos que os compostos estruturais são determinantes para a colonização microbiana e por consequência para a fragmentação e decomposição foliar. Verificamos também que o enriquecimento de nutrientes na água pode ser mais importante para o processo de decomposição foliar do que os nutrientes nas folhas.