Seminario de Título entregado a la Universidad de Chile en cumplimiento parcial de los requisitos para optar al Título de Ingeniero en Biotecnología Molecular. / En las últimas dos décadas se ha registrado un incremento significativo en la detección de cepas hipervirulentas y multi-resistentes del patógeno bacteriano Klebsiella pneumoniae, lo cual estaría ligado con el alto dinamismo y la rápida evolución de su genoma. Dentro de los elementos genéticos móviles (EGMs) que determinan dicho dinamismo se encuentran las islas genómicas (IGs), que corresponden a fragmentos de DNA de hasta 200 kb que se integran preferentemente en genes que codifican tRNAs (tDNAs). Se ha demostrado que las IGs de K. pneumoniae y otras enterobacterias portan una gran variedad de genes relacionados con virulencia y resistencia a antibióticos, por lo que su identificación y caracterización a partir del creciente número de genomas secuenciados de esta especie resulta altamente relevante. En esta dirección, el presente trabajo describe el desarrollo de una herramienta para identificar IGs asociadas a tDNAs que se basa en el análisis del contexto genómico de dichos genes, es decir, la organización e identidad de los genes que se encuentran adyacentes en el cromosoma. En una primera etapa, el programa identifica los tDNAs y su contexto para luego clasificarlos y nombrarlos. En una segunda etapa, el programa analiza la continuidad del contexto genómico conservado de cada tDNA y determina la presencia de IGs cuando una disrupción es identificada. El programa creado, se utilizó para analizar el genoma de 50 cepas de K. pneumoniae, donde los resultados obtenidos fueron comparados con la identificación de IGs realizada manualmente y curada en un estudio previo realizado por nuestro grupo. Como resultado, se logró identificar correctamente un 99,3% de todos los tDNAs presentes en dichas cepas, además de 303 IGs de un total de 308 IGs detectadas manualmente. Adicionalmente, el programa mostró un desempeño satisfactorio, aunque mejorable en la detección de integrasas y repetidos directos, detectando ambos elementos en 148 de las IGs identificadas. Finalmente, se comparó el desempeño del programa desarrollado y otros programas para la identificación de IGs en la detección y delimitación de la isla GIE492 caracterizada experimentalmente en un trabajo previo de nuestro grupo, determinando que la detección hecha por el programa desarrollado por nuestro grupo es más sensible y precisa que cualquiera de los otros programas utilizados. / In the last two decades, there has been a significant increase in the detection of hypervirulent and multi-resistant strains of the bacterial pathogen Klebsiella pneumoniae, which would be related to the high dynamism and rapid evolution of its genome. Within the mobile genetic elements (EGMs) that determine this dynamism are Genomic Islands (IGs), which correspond to DNA fragments up to 200 kb that are preferentially integrated into genes encoding tRNAs (tDNAs). It has been shown that IGs from K. pneumoniae and other species from Enterobacteriaceae carry a wide variety of genes related to virulence and antimicrobial drug resistance. Thus, their identification and characterization among the increasing number of sequenced genomes from this species is highly relevant. In this direction, this work describes the development of a bioinformatics tool intended to identify IGs associated to tDNAs based on the analysis of the genomic context of these genes, that is, the organization and identity of the genes that are adjacent to tDNAs in the chromosome. In the first step, the program identifies all the tDNAs and their contexts to classify and name them. In a second step, the program analyzes the continuity of the conserved genomic context for each tDNA, determining the presence of a putative IG when a disruption of such continuity is detected. Our program was used to analyze the genome of a set of 50 K. pneumoniae strains, where the results obtained were compared with the identification of IGs performed and cured manually in a previous study conducted by our group. As a result, 99.3% of all the tDNAs present in the strains were correctly identified. Also, the software predicted 303 IGs from a total of 308 IGs detected manually. Additionally, the program showed a good performance in the identification of integrases and direct repeats, detecting both elements in 148 of the IGs, although there is still room for improvement. Finally, we compared the performance of our software and other programs for the identification of IGs, in the detection and precise delimitation of the xi GIE492 island, which was characterized experimentally in a previous work of our group. We determined that the detection made by our program was more sensitive and precise than any of the other programs tested.

En las zonas áridas la vegetación frecuentemente se distribuye en el espacio formando islas arbustivas (islas) dispersas en una matriz de suelo desnudo (interislas), condición que se observa en el noreste de la Región Patagónica. El efecto facilitador de los arbustos sobre otras formas de vida podría explicar la formación de las islas, aunque en ambientes no tan limitados en recursos el origen de las islas podría deberse al pastoreo. En este último caso las islas constituirían igualmente un ambiente favorable para la persistencia de los pastos, particularmente en condiciones de sequía. De esta manera, si la causa de la formación de islas es el pastoreo, es de esperar que su exclusión favorezca la recuperación de la vegetación y del suelo en los espacios interislas. El presente trabajo se realizó en el noreste de la Región Patagónica. Los objetivos fueron 1) determinar las variaciones espaciales de la cobertura vegetal y del microrelieve del suelo en áreas con intensidad de pastoreo alta, moderada o sin pastoreo; 2) comparar el crecimiento de una gramínea perenne y de un arbusto creciendo juntos o en forma separada, y la persistencia de gramíneas perennes creciendo en islas o interislas; 3) evaluar la dinámica del banco de semillas del suelo en islas e interislas; y 4) evaluar la recuperación de la vegetación y de las propiedades fisicoquímicas del suelo en espacios interislas de áreas excluidas al pastoreo por 10 años. Se seleccionaron tres sitios representativos de la región de estudio, y en cada sitio áreas con intensidad de pastoreo alta, media o sin pastoreo. La toma de datos involucró relevamientos de vegetación y ensayos manipulativos a campo. En las áreas con mayor intensidad de pastoreo se observó una menor cobertura de vegetación en los espacios interislas, mayor cobertura de arbustos, y montículos de suelo más elevados en las islas. Con precipitaciones normales la interacción gramíneaarbusto fue neutra o negativa; mientras que, en condiciones de sequía la persistencia de las gramíneas perennes fue similar o menor en las islas que en los interislas. La densidad de semillas en el banco del suelo fue superior en las islas que en los interislas, particularmente en condiciones de sequía y alta intensidad de pastoreo. Luego de 10 años de exclusión del pastoreo se observó recuperación de la vegetación en los espacios interislas, aunque no en las propiedades fisicoquímicas del suelo. Los resultados obtenidos en el noreste de la Región Patagónica fueron consistentes con las hipótesis de que la formación de islas arbustivas es consecuencia del pastoreo del ganado y no del predominio de interacciones positivas arbustopasto, que la exclusión del pastoreo promueve una lenta recuperación de la vegetación en los espacios interislas de ambientes degradados, y que las islas arbustivas constituyen ambientes de preservación del banco de semillas del suelo en situaciones de pastoreo y sequía. En cambio, los resultados no corroboraron la hipótesis de que en situaciones de sequía y pastoreo las islas arbustivas sirven de refugio a las plantas de gramíneas contribuyendo a la persistencia de las mismas. / In arid lands the vegetation is frequently arranged in a two-phase mosaic composed of shrub patches with high plant cover interspersed in a low-cover matrix, condition that is observed in the north-eastern of the Patagonia Region. Facilitation between life-forms may explain patchiness, although in less water-limited environments patchiness may originate from livestock grazing. In the last case shrub patches may equally provide favourable conditions for grass persistence, particularly under drought conditions. Thereby, if grazing induces patchiness, then its exclusion should favour vegetation and soil recovery in interpatch spaces. The present work was conducted in the northeastern of the Patagonia Region. The objectives were 1) to determine spatial variations of vegetation cover and soil microrelief on ungrazed areas and areas with high or moderate grazing intensity; 2) to compare the growth of a shrub and a perennial grass in the absence or in the presence of the other life form, and the persistence of perennial grasses growing in shrub patches or in interpatch spaces; 3) to evaluate soil seed bank dynamic in shrub patches and in interpatch spaces; and 4) to evaluate vegetation and soil physicochemical properties recovery in interpatch spaces of 10 years old livestock exclosures. Three representative sites of the study region were selected, and in each of them areas with either no grazing, moderate grazing or severe grazing. Data collection involved vegetation surveys and field manipulative trials. Heavily grazed areas had the lowest interpatch vegetation cover, and the highest shrub cover and soil mound height in shrub patches. With normal rainfall shrub-grass interactions were neutral or negative, whereas under drought conditions perennial grass persistence was similar or lower in shrub patches than in interpatch spaces. Seed density in the soil bank was higher in shrub patches than in interpatch spaces, particularly under drought conditions and heavy grazing. After 10 years of grazing exclusion there was a recovery of vegetation, but not in soil physicochemical properties, in interpatch spaces. The results from the northeastern Patagonia Region were consistent with the hypothesis that vegetation patchiness is induced by livestock grazing rather than by positive interactions between shrub and grasses, that livestock exclusion promotes a slow recovery of interpatch vegetation in degraded sites, and that shrub patches contribute to the preservation of the soil seed bank under drought and grazing conditions. Contrarily, the results did not support the hypothesis that shrub patches constitute associational refuges for perennial grasses contributing to their persistence under drought and grazing conditions.

El estado actual de la controversia de soberanía sobre el territorio de las islas Malvinas, Georgias del Sur, Sándwich del Sur y sus espacios marítimos circundantes, es de congelamiento. Desde 1982 a la fecha, el reclamo del Estado argentino a su par británico para que éste negocie la transferencia de la posesión de las islas sudatlánticas, no ha tenido éxito. Gran Bretaña sostiene que es la legítima poseedora del territorio y que la defensa de la libre determinación de la población de las islas prima sobre cualquier otra consideración. Por su parte, la Argentina argumenta que, conforme al derecho internacional público, es la única titular de la soberanía, que los isleños e isleñas no tienen la facultad de dirimir la controversia, que es exclusiva entre dos Estados, y que el Reino Unido está obligado a negociar la transferencia territorial, conforme lo establecido por la Asamblea General de las Naciones Unidas. Esta investigación parte de la hipótesis de que la estrategia de resolución del conflicto que ha privilegiado la Argentina en este período –la negociación y la argumentación con base en el derecho internacional-, no es adecuada para recuperar la soberanía, conforme a la actitud de su contraparte y las condiciones estructurales de la negociación como método de resolución. En esa línea, el objetivo de esta tesis es describir la política exterior que ha adoptado la República Argentina en las últimas cuatro décadas respecto de la cuestión Malvinas, y las respuestas que ha obtenido de la otra parte de la controversia, el Reino Unido. Por último, siguiendo lo sucedido en un caso análogo al de Malvinas, el del archipiélago de Chagos, se propondrá una estrategia diferente para modificar el statu quo del conflicto: recurrir a la Corte Internacional de Justicia. / The current state of the sovereignty dispute over the territory of the Malvinas, South Georgia, South Sandwich Islands and their surrounding maritime spaces is frozen. From 1982 to date, the claim of the Argentine State to its British counterpart so that it negotiates the transfer of possession of the South Atlantic islands, has not been successful. Great Britain maintains that it is the legitimate owner of the territory and that the defense of the self-determination of the population of the islands takes precedence over any other consideration. For its part, Argentina argues that, in 6 accordance with public international law, it is the sole holder of sovereignty, that the islanders do not have the power to settle the dispute, that it is exclusive between two States, and that the United Kingdom is obliged to negotiate the territorial transfer, as established by the General Assembly of the United Nations. This research is based on the hypothesis that the conflict resolution strategy that Argentina has favored in this period -negotiation and argumentation based on international law- is not adequate to recover sovereignty, according to the attitude of its counterparty and the structural conditions of the negotiation as a method of resolution. In this line, the objective of this thesis is to describe the foreign policy that the Argentine Republic has adopted in the last four decades regarding the Malvinas issue, and the responses that it has obtained from the other party to the controversy, the United Kingdom. Finally, following what happened in a case similar to that of Malvinas, that of the Chagos archipelago, a different strategy will be proposed to modify the status quo of the conflict: resort to the International Court of Justice.

Geólogo / La isla Floreana es una de las pocas fuentes de xenolitos de rocas ultramáficas en el sistema de islas volcánicas que forman el punto caliente del archipiélago de Galápagos. En este estudio se presenta un análisis petrogenético de cinco xenolitos de rocas ultramáficas representativos de los que se encuentran en dicha isla. Estos incluyen tres wehrlitas, una dunita y una hazburgita. El estudio comprende un análisis petrográfico detallado de las texturas de los minerales silicatados y sulfuros asociados, así como, datos cuantitativos de su composición química de elementos mayores y trazas. Asimismo, se presentan y discuten los primeros datos de concentraciones de metales nobles (elementos del grupo del platino y oro) en sulfuros de la litosfera bajo el archipiélago de las islas Galápagos. Los granos individuales de sulfuros fueron analizados in situ mediante ablación laser acoplada a fuente inductiva de plasma con arsenal multicolector (LA-ICP-MS). En base a su mineralogía, petrografía y química mineral, los xenolitos de rocas ultramáficas estudiados se clasificaron en: (1) grupo Al-augita, evidenciando composiciones similares a los cristales presentes en las lavas de la isla; y (2) grupo Cr-diópsido correspondientes a peridotitas con una química típica de punto caliente oceánico. Se estimaron sus condiciones P-T, obteniendo temperaturas entre 800 y 1100°C y presiones entre 3 y 12 kbar. Se interpreta que todas las muestras estudiadas se formaron en la litosfera de Floreana, pero a diferentes profundidades, encontrando tres xenolitos corticales o pertenecientes a la transición manto-corteza, un xenolito mantélico y un xenolito asociado a un reservorio magmático profundo. Los sulfuros identificados en las rocas estudiadas pertenecen al sistema composicional Fe-Ni-Cu-Co, cuyas temperaturas de equilibrio se estiman entre 900 y 1100 °C, consistente con las temperaturas calculadas en silicatos. Estos sulfuros contienen bajas concentraciones de metales nobles, lo cual fue atribuido a metasomatismo. En las wehrlitas protogranulares los patrones de metales nobles sugieren que los sulfuros precipitaron desde fluidos metasomáticos, mientras que en la wehrlita poikilitica los sulfuros tendrían un origen relacionado con fluidos residuales enriquecidos en elementos calcófilos, destacando la presencia de un grano enriquecido en Au.

Memoria (licenciado en ciencias jurídicas y sociales) / Autor no autoriza el acceso a texto completo de su documento

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La fauna de Anélidos Poliquetos de los fondos de sustratos blandos de las islas Chafarinas ha sido estudiada mediante muestreo con draga ancla bilateral tipo Holme. Del conjunto de individuos examinados, han sido identificados 194 taxones (dos a nivel genérico), distribuidos en 128 genéros. Se ha realizado un estudio monográfico para cada una de las especies, incluyendo su perfil biocenológico, elaborado a partir de la recopilación selectiva de la información bibliográfica y nuestras propias observaciones. Entre los resultados faunísticos del presente estudio, podemos destacar:1) Son citadas por primera vez para la cuenca mediterránea las especies: Pisione guanche, Glycera dayi, Nephtys kersivalensis, Lumbrinerides aberrans, Diplocirrus capensis y Ampharete lindstroemi.2) Se actualiza el catálogo de la fauna de Anélidos Poliquetos de las islas Chafarinas, incrementándolo en 118 nuevas especies quedando establecido en 377 especies. 3) Son señaladas por primera vez para el sector del Mar de Alborán, un género (Euchone) y 86 especies.4) El análisis de agrupamiento automático de las estaciones de muestreo en función de la fauna de Poliquetos y de los parámetros granulométricos, ha permitido establecer las principales comunidades bentónicas de los fondos blandos de las islas Chafarinas: Fangos Terrígenos Costeros (FTC), Arenas Fangosas con Nephtys hombergii (AFNh) Arenas Finas Bien Calibradas (AFBC), Detrítico Costero (DC), Detrítico enfangado (DE) y Arenas Gruesas y finas gravas Bajo Corrientes de Fondo (AGBCF). La diversidad calculada para las diferentes comunidades pone de manifiesto que las mejor estructuradas son las de fondos detríticos, tanto costeros como enfangados. Por otro lado, los valores más bajos de diversidad obtenidos para la comunidad de las Arenas Finas Bien Calibradas, podrían estar relacionados con las elevadas condiciones hidrodinámicas e importantes episodios de inestabilidad sedimentaria producidos por el enfangamiento a que se está viendo sometido esta comunidad. La estructura trófica de las comunidades de los fondos de sustrato suelto de las islas Chafarinas, muestra un abanico de todos los grupos tróficos, dominando claramente en el conjunto los Detritívoros susbsuperficiales y los Omnívoros. Por el contrario, los Herbívoros presentan los valores más bajos, al igual que los Mixtos y los Sestonófagos. Los Detritívoros subsuperficiales alcanzan sus mayores valores en las comunidades de Arenas Finas Bien calibradas, las Arenas Fangosas y el Detrítico enfangado, donde encuentran las condiciones ambientales idóneas para su tipo de alimentación. Siendo más escasos, aunque también presentes, en los fondos mixtos del Detrítico. Por su parte los Omnívoros dominan en los fondos Detríticos, aunque no presentan variaciones importantes en las demás comunidades. Por último, el grupo de los Carnívoros muestra unos porcentajes muy similares en todas las comunidades, alcanzando su valor máximo en la comunidad del Detrítico Enfangado. Del análisis global de los datos biogeográficos de la fauna de Poliquetos de sustratos blandos de las Chafarinas, destaca que los grupos dominantes están compuestos por especies Circunglobales y Atlanto-Mediterráneas. En el diagrama porcentual de contingentes biogeográficos por comunidades, en general se mantienen los porcentajes descritos para el estudio global, si bien en algunas comunidades aumenta el porcentaje de especies Atlanto-Mediterráneas, como cabría esperar teniendo en cuenta la ubicación de estas islas. Los valores del índice de calidad ambiental aplicado a la fauna anelidiana de sustratos blandos de las islas, ponen de manifiesto el elevado grado de enfangamiento que está sufriendo el archipiélago y que afecta al desarrollo y evolución de las diferentes comunidades. Este efecto, se traduce a nivel faunístico en un contingente considerable de especies tolerantes al enriquecimiento orgánico y a elevados porcentajes de finos. / The Annelida polychaete fauna of Chafarinas Islands soft bottoms has been studied by a sampling bilateral Holme type anchor-dredge. From all individuals examined, 194 taxa have been identified (two of them at a generic level), distributed in 128 genus. A monographic study has been done for each species, including its biocenologycal profile, based on the selective collection of bibliographic information and our own observations. Among the faunistical results of this study, we can highlight: 1) The next species are cited for the first time for the Mediterranean basin: Pisione guanche, Glycera dayi, Nephtys kersivalensis, Lumbrinerides aberrans, Diplocirrus capensis and Ampharete lindstroemi. 2) The catalogue of Annelida polychaetes fauna of the Chafarinas Islands is updated, being added 118 new species what makes it established in 377 species.3) A genus (Euchone) and 86 species are identified for the first time for the Alboran Sea sector. 4) The automatic cluster analysis of the sampling stations depending on the polychaetes fauna and the granulometric parameters, has allowed to establish the main benthic communities of soft bottoms of the Chafarinas Islands: Terrigeneous Coastal Mud (FTC), Muddy Sands with Nephtys hombergii (AFNh) Fine Well-Calibrated Sands (AFBC), Coastal Detritic (DC), Muddy Detritic (DE) and Coarse Sand and Fine Gravel under bottom currents (AGBCF). The diversity calculated for the different communities shows that detritic bottoms both coastal and muddy are the best structured. On the other hand, the lowest diversity values obtained for fine well-calibrated sands community, could be related to the high hydrodynamic conditions and the significant instability episodes produced by the high amount of muds that arrive to this community.

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Esta tesis doctoral tiene por objetivo principal la caracterización de las comunidades humanas que habitaron el archipiélago balear entre los siglos VI y II a.C., durante el conocido como periodo postalayótico en las islas de Mallorca y Menorca, y la fase púnica de la ciudad-estado de Ybshm en la actual Ibiza. Los grupos domésticos son la unidad principal de análisis de este trabajo, interpretados mediante una posición teórica donde la cotidianidad es eje fundamental, y una metodología basada en el estudio de las viviendas, los escenarios más elocuentes de la vida cotidiana. El análisis de las formas constructivas, sus articulaciones espaciales y funcionalidades derivadas de las áreas de actividad identificadas permite trascender la materialidad doméstica y alcanzar una interpretación histórica íntegra de estos grupos. Dentro de esta lectura social y económica, se presta especial atención al papel que tuvo la relación entre las comunidades autóctonas de las islas orientales del archipiélago con la sociedad púnica mediterránea.