Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas. Programa de Pós-Graduação em Química. / Made available in DSpace on 2012-10-24T07:40:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 266273.pdf: 1432106 bytes, checksum: a3a0e6a1397546d97078960a9bc7a55f (MD5) / Um estudo fitoquímico de L. corniculatus foi realizado e biomonitorado através de bioensaios de atividade antioxidante, antibacteriana e anti-inflamatória. O estudo fitoquimico foi efetivado através de sucessivas cromatografias em coluna de sílica gel e monitoradas por cromatografia em camada delgada, sendo as estruturas elucidadas através de técnicas de IV, RMN de 1H e 13C e COSY. A atividade antioxidante in vitro foi avaliada nos modelos como a capacidade sequestrante DPPH, potencial redutor e peroxidação lipídica. O efeito antibacteriano foi avaliado através do método de microdiluição o qual produz a Concentração Inibitória Mínima e a Concentração Bactericida Mínima. Finalmente, o efeito anti-inflamatório de Lotus corniculatus foi analisado no modelo in vivo da pleurisia induzida pela carragenina em camundongos, que é um modelo de inflamação aguda. Foram isolados três compostos: dois terpenos, o ?-sitosterol e o ácido oleanólico e um flavonóide glicosilado canferitrina. Após realizados os ensaios de atividades biológicas, nossos resultados demonstraram que Lotus corniculatus cv. São Gabriel possui importante propriedade antibacteriana e anti-inflamatória. Estes efeitos podem ser atribuídos aos compostos isolados como o ácido oleanolico, ?-sitosterol e principalmente ao canferitrina o qual demonstrou o melhor efeito farmacológico.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-05-29T11:52:45Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 781948 bytes, checksum: 47b21c6bb991b44a3291664119cfecaf (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-29T11:52:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 781948 bytes, checksum: 47b21c6bb991b44a3291664119cfecaf (MD5) Previous issue date: 2017-02-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O tipo de manejo realizado no solo modifica a população das plantas espontâneas. Entre os manejos, o consórcio de culturas apresenta-se como alternativa para produção de milho verde no Brasil, principalmente no sistema orgânico. O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito do consórcio com leguminosas e cobertura com palha de café na supressão de plantas espontâneas e produtividade do milho verde. O experimento foi implantado com os seguintes tratamentos: T1- Milho consorciado com feijão comum + roçada, T2- Milho consorciado com crotalária + roçada, T3- Milho consorciado com feijão-de-porco + roçada, T4- Milho em monocultivo com palha de café aplicada em superfície + capina manual, T5- Milho em monocultivo e capina manual e T6- Milho consorciado com feijão guandu-anão + roçada. Os tratamentos foram dispostos no delineamento em blocos casualizados com cinco repetições. Foi realizada análise fitossociológica das plantas espontâneas nos estádios V4, V8 e R1 da cultura do milho para determinação da importância relativa (IR%). Avaliou-se, ainda, o índice de clorofila (SPAD) no milho e as características agronômicas de milho verde (altura da inserção da primeira espiga, a altura da planta, comprimento das espigas) além da produtividade de espigas comerciais com palha e sem palha de milho verde. No sistema orgânico de milho verde, a tiririca foi a planta espontânea com maior importância relativa durante todos os estádios fenológicos avaliados. O plantio de milho em monocultivo sobre palha de café aplicada em superfície é uma alternativa de supressão de plantas espontâneas em sistema de plantio de milho orgânico. As características agronômicas foram influenciadas pelos tratamentos, sendo maiores no plantio do milho em monocultivo sobre palha de café aplicada em superfície. O plantio do milho em monocultivo sobre palha de café em superfície apresenta-se como uma prática agronômica que aumenta a produção de milho verde orgânico. / The type of management carried out in the soil modifies the population of weeds. Among managements, intercropping presents as an alternative for production of fresh corn in Brazil, mainly in organic system. The objective of this work was to evaluate the effect of corn intercropping with legumes and coffee husk as covering on the suppression of weeds and yield of fresh maize. The experiment was implemented with the following treatments: T1- Corn intercropped with common bean + weed mowing, T2- Corn intercropped with crotalaria + weed mowing, T3- Corn intercropped with jack beans + weed mowing, T4- Corn grown on soil covered with coffee husk + manual weeding, T5- Corn grown under conventional tillage and manual weeding, and T6 - Corn intercropped with pigeon pea + weed mowing. The treatments were arranged in a randomized complete block design with five replicates. Phytosociological analysis of weeds was performed at V4, V8 and R1 stages of the corn crop to determine the relative importance (IR%). Also, It was evaluated the chlorophyll index (SPAD) and the agronomic characteristics of fresh corn (height of the first ear insertion, plant height, ear length), as well as the yield of commercial fresh corn with and without husk. In the organic system of fresh corn, nut-grass was the weed with higher relative importance during all the evaluated phenological stages. Corn in monoculture grown on soil covered with coffee husk is an alternative to suppress weeds in organic corn crop system. The agronomic characteristics were influenced by the managements, especially the one of corn with coffee husk applied on the soil. Corn in monoculture grown on soil covered with coffee husk presents as an agronomic practice to increase production of fresh organic corn.

BENEVIDES, Raquel Guimarães. Caracterização bioquímica e estrutural de uma lectina recombinante de sementes de Platypodium elegans Vogel. 2011. 281 f. Tese (Doutorado em bioquímica)- Universidade Federal do Ceará, Fortaleza-CE, 2011. / Submitted by Elineudson Ribeiro (elineudsonr@gmail.com) on 2016-07-28T13:36:10Z No. of bitstreams: 1 2011_tese_rgbenevides.pdf: 11384028 bytes, checksum: c53d0f90cf10f6c4617f71ad7c4468d9 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa (jairo@ufc.br) on 2016-08-02T15:27:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_tese_rgbenevides.pdf: 11384028 bytes, checksum: c53d0f90cf10f6c4617f71ad7c4468d9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-02T15:27:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_tese_rgbenevides.pdf: 11384028 bytes, checksum: c53d0f90cf10f6c4617f71ad7c4468d9 (MD5) Previous issue date: 2011 / Lectinas vegetais são excelentes modelos para se estudar as bases moleculares do reconhecimento proteína-açúcar.Uma atividade lectínica com especificidade para manose e glicose foi detectada em sementes de Platypodium elegans, uma leguminosa da subtribo Dalbergiae. O gene da lectina PELa foi clonado, resultante em uma proteína de 261 resíduos de aminoácidos pertencente à família de lectinas de leguminosas, com similaridade com a lectina de Pterocarpus angolensis (PAL). A lectina recombinante foi expressa em células de E. coli e refoldada à partir de corpos de inclusão. Uma análise da especificidade por Glycan array evidenciou uma preferência bastante não-usual para N-glicanos do tipo complexos com ramificações assimétricas. Um braço curto consistindo em um resíduo de manose é preferido no braço 1-6 do N-glicano, enquanto uma extensão por GlcNAc, Gal e NeuAc são favoráveis no braço 1-3. Valores de afinidade foram obtidos por microcalorimetria usando heptassacarídeos simétricos e assimétricos ligados a Asn preparados por método semi-enzimático. Uma alta afinidade de 5 µM foi obtida para ambos os ligantes. Duas estruturas cristalinas de PELa, uma em complexo com um trimanose ramificado e outra com um heptassacarídeo complexo simétrico ligado a Asn foram resolvidas a resoluções de 2,1 e 1,65 Å, respectivamente. A lectina mostrou adotar uma organização dimérica canônica típica de lectinas de leguminsas. O trimanose faz uma ponte entre os sítios de ligação a carboidrato de dímeros vizinhos, resultando na formação de cadeias infinitas no cristal. O heptassacarídeo liga-se com o braço 1-6 no sítio primário de ligação e com contatos extensivos adicionais em ambos os braços. O GlcNAc do braço 1-3 está ligado em uma conformação restrita que pode justificar a alta afinidade que é observada em chips para oligossacarídeos com braço 1-3 curto que não apresentam esse monossacarídeos. / Lectin activity with specificity for mannose and glucose has been detected in the seed of Platypodium elegans, a legume from the Dalbergiae tribe. The gene of the lectin PELa has been cloned and the resulting 261 amino acid protein belongs to the legume lectin family with similarity with Pterocarpus angolensis agglutinin (PAL) from the same tribe. The recombinant lectin has been expressed in E. coli and refolded from inclusion bodies. Analysis of specificity by Glycan Array evidenced a very unusual preference for complex type N-glycans with asymmetrical branches. A short branch consisting of one mannose residue is preferred on the 6- arm of the N-glycan, while extension by GlcNAc, Gal and NeuAc are favorabl e on the 3-arm. Affinities have been obtained by microcalorimetry using symmetrical and asymmetrical Asn- linked heptasaccharide prepared by semi-enzymatic method. Strong affinity of 5 μM was obtained for both ligands. Crystal structures of PELa complexed with branched trimannose and symmetrical complex type Asn-linked heptasaccharide have been solved at 2.1 and 1.65 Å resolution respectively. The lectin adopts the canonical dimeric organization of legume lectins. The trimannose bridges the binding sites of two neighbouring dimers, resulting in the formation of infinite chains in the crystal. The Asn-linked heptasaccharide binds with the 6-arm in the primary binding site and extensive additional contacts on both arms. The GlcNAc on the 3 -arm is bound in a constrained conformation that may rationalize the higher affinity that is observed on chips for oligosaccharide with shorter 3-arm that do not present this monosaccharide.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-10-18T17:52:02Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 3384877 bytes, checksum: c903ce2e1fb789f2df05b231be5b529e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-18T17:52:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 3384877 bytes, checksum: c903ce2e1fb789f2df05b231be5b529e (MD5) Previous issue date: 2005-02-21 / Este trabalho consiste do estudo taxonômico da família Leguminosae dos Campos Rupestres do Parque Estadual do Itacolomi (PEI), da distribuição geográfica e preferência por hábitat dos táxons, da comparação dos hábitats encontrados, da análise da similaridade florística entre áreas de campo rupestre e de aspectos reprodutivos de algumas espécies. As coletas foram mensais, no período compreendido entre setembro de 2003 e outubro de 2004. A área de estudo abrangeu oito trilhas: Estrada de Cima, Estrada de Baixo, Morro do Cachorro, Baú, Calais, Tesoureiro, Serrinha e Sertão. Após as coletas, os materiais foram herborizados de acordo com as técnicas usuais e incluídos no acervo do Herbário VIC do Departamento de Biologia Vegetal, da Universidade Federal de Viçosa, duplicatas foram enviadas para os Herbários OUPR e RB. A determinação dos táxons específicos e infra-específicos foi realizada mediante literatura especializada, consultas a especialistas e visitas a herbários. Foram encontrados 46 táxons específicos e infra-específicos de Leguminosae, reunidos em 24 gêneros. A subfamília mais representativa foi Papilionoideae, com 28 táxons. Caesalpinioideae apresentou 10 táxons e Mimosoideae, nove. Os gêneros Chamaecrista, Mimosa e Desmodium foram os que mais se destacaram em número de táxons, com sete, seis e cinco, respectivamente. Foram elaboradas chaves para identificação dos táxons, além de diagnoses, ilustrações e comentários sobre a distribuição geográfica, fenologia e taxonomia dos mesmos. Dos 46 táxons estudados 67,4% possuem distribuição na América Tropical, destes, 58,1% são exclusivos da flora brasileira e 33,3%, endêmicos da Cadeia do Espinhaço. A comparação da flora de Leguminosae dos Campos Rupestres de Minas Gerais, Bahia e Goiás mostrou baixa similaridade entre essas áreas. Os táxons de maior ocorrência nos hábitats do PEI foram Dalbergia villosa var. villosa, Senna reniformis, Mimosa aurivillus var. calothamnos, Desmodium adscendens, Periandra mediterranea e Stylosanthes montevidensis. Entre os hábitats, os campos graminosos e os escrubes, ambos sobre filito, foram os mais similares nas análises de agrupamento. Esses hábitats também apresentaram a maior riqueza de espécies. Foi observada correlação positiva entre a floração e a precipitação e a maioria dos táxons, em que foi estudada a biologia floral, são melitófilos e apresentam auto-incompatibilidade espontânea. / This work consists of the taxonomic study of the Leguminosae family in “Campos Rupestres” of the Itacolomi State Park (PEI), the geographic distribution and taxon habitat preference, the comparison of the different habitats, the analysis of floristic similarity among areas of “Campos Rupestres” and reproductive aspects of some species. The collection was carried out monthly, from September 2003 to October 2004. The study area is comprised of eight tracks: “Estrada de Cima”, “Estrada de Baixo”, “Morro do Cachorro”, “Baú”, “Calais”, “Tesoureiro”, “Serrinha” and “Sertão”. Following field collection, the specimens were preserved according to usual techniques and included in the collection of the VIC Herbarium of the Departamento de Biologia Vegetal, at Universidade Federal de Viçosa, the duplicates were sent to OUPR and RB herbaria. Specific and infraspecific taxon determination was carried out by means of specialized literature, consultation with specialists and visits to herbaria. 46 specific and infraspecific taxons of Leguminosae, grouped into 24 genus, were found. The most representative subfamily was Papilionoideae, with 28 taxons. 10 taxons were Caesalpinioideae and nine Mimosoideae. The genus Chamaecrista, Mimosa and Desmodium stood out in terms of taxon number, with seven, six and five, respectively. Keys for taxon identification were developed, as well as diagnoses, illustrations and comments on the geographic distribution, phenology and taxonomy. Out of the 46 taxons studied, 67.4% are distributed in Tropical America, and out of these 58.1% are exclusively Brazilian flora and 33.3% endemic of Espinhaço Range. The comparison of the Leguminosae flora of “Campos Rupestres” in Minas Gerais, Bahia and Goiás showed low similarity among these areas. Taxons of frequent occurrence in PEI habitats were Dalbergia villosa var. villosa, Senna reniformis, Mimosa aurivillus var. calothamnos, Desmodium adscendens, Periandra mediterranea and Stylosanthes montevidensis. Among habitats, the “Campos Graminosos Secos” and “Escrubes”, both on philite, were the most similar by the cluster analyses. These habitats also presented the highest species wealth. Positive correlation between blossoming and rainfall was verified, and most taxons, in which the floral biology was studied, are melittophilic and show spontaneous self-incompatibility. / Dissertação importada do Alexandria

Trifolium polymorphum, T. argentinense, ambas espécies anficárpicas, e T. riograndense são leguminosas ocorrentes nas pastagens naturais do Rio Grande do Sul, com potencial forrageiro. O objetivo deste trabalho foi aprofundar o conhecimento sobre estas espécies, visando sua futura utilização e preservação. Sementes de 75 acessos das três espécies foram coletadas em vários locais do Estado, de acordo com área de distribuição das mesmas. O número cromossômico foi determinado para 60 acessos de T. riograndense, 14 de T. polymorphum e, pela primeira vez, para um acesso de T. argentinense, sendo todos diplóides, com 2n=2x=16 cromossomos. As sementes subterrâneas de T. argentinense foram maiores (2,10mm) mais pesadas (0,0029g), mas em menor número (1,10) quando comparadas às sementes aéreas (1,80mm, 0,0016g, 1,63, respectivamente). Uma caracterização morfológica, considerando diversas variáveis, foi realizada em 29 acessos de T. riograndense. Dez indivíduos por acesso foram cultivados em floreiras, numa área experimental, em um delineamento completamente casualizado, sendo realizadas duas avaliações. Os resultados da distância Euclidiana mostraram que os acessos 29 (Muitos Capões) e 53 (Lageado Grande) da região dos Campos de Cima da Serra foram os mais divergentes (2,30), evidenciando a grande variabilidade genética para T. riograndense nesta região. Os acessos menos divergentes (0,19) foram aqueles da região do Planalto Médio, onde a agricultura é intensiva, indicando uma redução da variabilidade genética da espécie nessa região. A produção de matéria seca foi o caráter que mais contribuiu para a divergência dos acessos (20,80%), seguida pelo número de estolões secundários (12,30%), área foliar (11,07%) e número de nós por estolão primário (10,93%). A análise de correlação linear simples mostrou correlação positiva e altamente significativa entre comprimento de estolão e diâmetro da planta, área foliar e tamanho do pecíolo na primeira avaliação e matéria seca total e estolões secundários. Os resultados evidenciaram a grande variabilidade genética existente neste germoplasma nativo, justificando sua caracterização, seleção, avaliação e conservação. A ausência de variabilidade no número cromossômico poderá facilitar eventuais cruzamentos. / Trifolium polymorphum, T. argentinense, both amphicarpic species, and T. riograndense are legumes occurring in the native pastures of Rio Grande do Sul, with forage potential. The objective of the present work was to deepen the knowledge about these species aiming at their future utilization and preservation. Seeds of 75 accessions of the three species were collected at several locations of the State according to the species distribution. The chromosome number was determined for 60 accessions of T. riograndense, 14 of T. polymorphum and, for the first time, for one accession of T. argentinense, all of them diploid, with 2n=2x=16 chromosomes. Subterranean seeds of T. argentinense were bigger (2.10mm), heavier (0.0029g), but fewer(1.10) when compared to the aerial seeds (1.80mm, 0.0016g, 1.63, respectively). A morphological characterization, considering several characteristics, was performed in 29 accessions of T. riograndense. Ten individuals per accession were cultivated in pots, in an experimental area, in a completely randomized design, with two evaluations. Results from Euclidian distance showed that accessions 29 (Muitos Capões) and 53 (Lageado Grande), from Campos de Cima da Serra regiom, were the most divergent (2.30), pointing out the great genetic variability of T. riograndense in this region. The less divergent accessions (0.19) were those from the Planalto Médio region, where agriculture is intensive, indicating a reduction of the species variability in this region. Dry matter production was the character that most contributed to accessions divergence (20.80%), followed by number of seconday stolons (12.30%), leaf area (11.07%) and number of nodes per primary stolon (10.93%). Simple linear correlation analysis showed positive an highly significant correlation between stolon length and plant diameter and leaf area and petiole length, in the first evaluation, na total dry matter and secondary stolons. The results show the great genetic variability of this native germplasm, justifying its characterization, selection, evaluation and conservation. The absence of variability in chromosome number may facilitate possible crosses.

O trevo branco (Trifolium repens L.) é uma das mais importantes leguminosas forrageiras de regiões temperadas do mundo, sendo uma das espécies mais utilizadas em pastagens durante o inverno e primavera no Rio Grande do Sul, mas que apresenta problemas de persistência, principalmente no verão, devido às altas temperaturas e à baixa disponibilidade de água nesse período. O objetivo desse trabalho foi analisar a diversidade genética entre os acessos da coleção nuclear de trevo branco proveniente do Departamento de Agricultura dos Estados Unidos (USDA) através de marcadores isoenzimáticos e microssatélites, além de avaliar o efeito da disponibilidade hídrica (90 e 50% da umidade de capacidade de campo do solo) sobre características morfofisiológicas de uma subamostra da coleção. Os acessos foram analisados através de 18 bandas isoenzimáticas (esterase) e nove locos microssatélites (SSR), os quais foram eficientes para detectar a alta diversidade genética existente entre os acessos. Um total de 70 fragmentos de microssatélites foram analisados, obtendo-se uma média de 7,8 alelos por loco e um conteúdo de informação de polimorfismo (PIC) variando de 0,26 a 0,86, com média de 0,67. A distância genética média através do coeficiente de Nei para os dados de esterase foi 0,73, variando de 0 a 1,79, evidenciando cinco grupos formados para os 47 acessos analisados, enquanto que para os SSR a distância média foi de 0,68, variando de 0,18 a 2,25, classificando os 81 acessos em sete grupos. Em relação à tolerância à seca, verificou-se interação genótipo x nível de água para 12 das 23 variáveis medidas na primeira avaliação e 19 das 32 variáveis analisadas na segunda. Os acessos que se destacaram sob déficit hídrico foram o 75 e o 74, os quais triplicaram e dobraram, respectivamente, a eficiência do uso da água, apresentando maior média de comprimento de entrenós e conseqüentemente, maiores produções de matéria seca de parte aérea. Portanto, esse trabalho representa uma contribuição no estudo da variabilidade genética e na caracterização dos acessos que compõem a coleção nuclear da espécie, tanto através de marcadores bioquímicos e moleculares, como através de marcadores morfofisiológicos sob condições de estresse hídrico. / White clover (Trifolium repens L.) it is one of the most important forage legumes in temperate regions of the world, being one of the most used species in pastures during the winter and spring in Rio Grande do Sul, which has persistence problems, mainly in the summer, due to the high temperatures and the low water availability in that period. The work was aimed to analyze the genetic diversity among the accessions from the white clover core collection obtained from the United States Department of Agriculture (USDA) through isozymes and microsatellite markers, besides evaluating the effect of water availability (90 and 50% of the soil moisture field capacity) on morphophysiological traits of a sample of the collection. The accessions were analyzed through 18 isozyme bands (esterase) and nine microsatellites loci (SSR), which were efficient to detect the high existent genetic diversity among the accessions. A total of 70 SSR fragments was analyzed, obtaining an average of 7,8 alleles per locus and, a PIC varying from 0,26 to 0,86, with average of 0,67. The medium genetic distance through Nei's coefficient for the esterase data was 0,73, varying from 0 to 1,79, evidencing five groups formed for the 47 analyzed accessions, while for SSR the medium distance was 0,68, varying from 0,18 to 2,25, classifying the 81 accessions in seven groups. In relation to drought tolerance, there was interaction genotype x level of water for 12 of the 23 measured variables in the first evaluation, and 19 of the 32 variables analyzed in the second. The best accessions under water deficit were 75 and 74, which triplicate and double, respectively, the water use efficiency, showing larger internodes length and consequently larger productions of MSPA. Therefore this work represents a contribution to the study of the genetic variability and to the characterization of the accessions of the core collection of the specie, through biochemical and molecular markers, as well as through morphophysiological markers under water stress conditions.

O trevo vermelho (Trifolium pratense L.) é uma leguminosa forrageira muito importante no Rio Grande do Sul, constituindo uma boa alternativa dentre as espécies forrageiras de inverno. Entretanto, como não existem cultivares desenvolvidas para as condições ambientais do Estado, a produção e, principalmente, a persistência dessas pastagens são comprometidas. Por isso o Departamento de Plantas Forrageiras e Agrometeorologia da UFRGS conduz um programa de melhoramento genético da espécie, buscando o desenvolvimento de populações melhor adaptadas às condições locais. O objetivo do trabalho foi avaliar, em dois ambientes contrastantes, Eldorado do Sul e Veranópolis, três populações de trevo vermelho selecionadas pelo referido programa, comparando-as com uma cultivar padrão. Em Eldorado do Sul foram implantados dois experimentos, um em 1999 e outro em 2000, enquanto em Veranópolis foi instalado apenas um, em 2000. Quanto à produção de matéria seca, os resultados variaram conforme o ano e o local. De modo geral, a cultivar padrão foi mais produtiva no primeiro corte, enquanto as populações selecionadas produziram mais forragem no final das estações de crescimento. Somente em Veranópolis o experimento foi avaliado por mais de um ano, com as populações selecionadas apresentando maior estabilidade produtiva que a cultivar padrão e produzindo mais forragem na segunda estação de crescimento. Em geral, as populações selecionadas também apresentaram maior persistência que o padrão. Ambos os locais mostraram-se favoráveis à avaliação e seleção para persistência do trevo vermelho, porém Veranópolis foi o mais adequado para a avaliação da produção de matéria seca.

TEIXEIRA, C. S. Determinação da estrutura tridimensional de uma lectina da semente de Camptosema pedicellatum Benth por cristalografia de raios X. 2012. 87 f. Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Centro de Ciências, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2012. / Submitted by Francisco Lacerda (lacerda@ufc.br) on 2014-11-10T19:13:39Z No. of bitstreams: 1 2012_dis_csteixeira.pdf: 2144291 bytes, checksum: 51a622ff983208ea3d670a7e5df47779 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa(jairo@ufc.br) on 2015-01-16T20:52:11Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_dis_csteixeira.pdf: 2144291 bytes, checksum: 51a622ff983208ea3d670a7e5df47779 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-01-16T20:52:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_dis_csteixeira.pdf: 2144291 bytes, checksum: 51a622ff983208ea3d670a7e5df47779 (MD5) Previous issue date: 2012 / Letinas tem sido usadas como modelo de bases moleculares em estudo da interação e especificidade de proteína-carboidrato por serem capazes de decifrar o glicódigo de estruturas celulares. O objetivo do presente estudo foi purificar e resolver a estrutura primária completa usando espectrometria de massas tandem e a estrutura tridimensional da lectina de Camptosema pedicellatum (CPL) complexada com 5-bromo-4-cloro-3-indol-α-D-manose (X-Man) por cristalografia de raios X. CPL foi purificada em um único passo por cromatografia de afinidade. Os resultados de espectrometria de massas revelou que CPL apresenta uma combinação de cadeias com pesos de 25.298 ± 2 Da (cadeia-α), 12.835 ± 2 Da (cadeia-β) e 12.481 ± 2 Da (cadeia-γ). A estrutura cristalina resolvida da CPL apresenta uma mutação conservativa no subsítio hidrofóbico, um componente do domínio de reconhecimento a carboidrato (CDR), indicando a relevância da interação hidrofóbica no estabelecimento de interações com os carboidratos. A substituição e análise da interação da CPL com o X-Man também revelou que o efeito hidrofóbico causado por uma pequena mudança no subsítio hidrofóbico interfere na formação de pontes de hidrogênio devido a orientação espacial do grupo indol no CDR.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2017. / Made available in DSpace on 2017-12-05T03:14:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 348750.pdf: 1454780 bytes, checksum: 26c81ce3f4363786a7aec4b40f4060fb (MD5) Previous issue date: 2017 / Phellinotus, um gênero de Hymenochaetaceae representa um táxon restrito à região Neotropical. Atualmente, duas espécies são descritas para o gênero, P. neoaridus, com populações atualmente somente registradas no semi-árido brasileiro e associadas exclusivamente a espécies do gênero Caesalpinia (Fabaceae) e P. piptadeniae, com populações possívelmente distribuídas ao longo de diferentes grupos florísticos (GF) das florestas tropicais sazonalmente secas da América do Sul e associado a diferentes gêneros de leguminosas, como Piptadenia, Senegalia, Mimosa, Pithecellobium, Libidibia e Pityrocarpa. Até o momento, apenas as populações de P. piptadeniae ocorrentes no GF Caatinga foram testadas filogenéticamente. No presente trabalho, com o intuito de delimitar filogeneticamente P. piptadeniae considerando os diferentes hospedeiros e sua distribuição geográfica, foram realizadas reconstruções filogenéticas baseadas nos marcadores moleculares nucleares ITS e nLSU do rDNA, incluindo espécimes pertencentes a todas as populações conhecidas do táxon, assim como espécimes adicionais. Os resultados demonstram que P. piptadeniae possui duas populações ocorrentes de forma alopátrica no GF Caatinga e florestas estacional semidecidual e ombrófila densa na porção sul da Mata Atlântica. Os espécimes do GF Caatinga e GF Costa Central dos Andes e um único exemplar coletado no GF Missiones (nordeste da Argentina), previamente determinados como P. piptadeniae, ficaram agrupados em um clado distinto de P. piptadeniae e aqui é proposta como a espécie nova P. teixeirae sp. nov. Ad int. Adicionalmente, uma nova espécie de Phellinotus é descrita, P. magnoporatu sp. Noc. Ad Int., um táxon até o momento registrado somente no GF Costa Central dos Andes. Baseando-se nos resultados das análises filogenéticas, um estudo preliminar da filogeografia de P. piptadeniae foi realizado, utilizando-se o marcador molecular ITS. Nossos resultados evidenciam que as populações de P. piptadeniae associadas à P. gonoacantha, que ocorrem na Mata Atlântica, juntamente com novos registros de populações localizadas na porção central do Cerrado, possuem alta diversidade genética em comparação com as populações associada aos demais hospedeiros conhecidos. Adicionalmente, sinais de recente expansão demográfica foram evidenciados através do marcador nuclear ITS. / Abstract : The Hymenochaetoid genus Phellinotus, represents a restricted taxa to the Neotropical Region. Currentlly, two species are described from the genus, ?P. neoaridus, with populations occurring on the brasilian semi-arid region and excluvelly associated to species of Caesalpinia (Fabceae) and P. piptadeniae, with populations possibly distributed througouth different floristic groups (FG) of the Seazonally Dry Tropical Forests of South America and associated to different genera of Fabeceae, as Piptadenia, Senegalia, Mimosa, Pithecellobium, Libidibia and Pityrocarpa. At this moment only the populations of P. piptadeniae that occur on the Caatinga FG were phylogenetucally tested. In this work, to address the phylogeny of P. piptadeniae considering different hosts and full geographical distribution, were performed phylogenetical reconstructions based on nuclear molecular markers ITS and LSU of rDNA, including specimes belong to all know populations to this taxon, and additional specimens. Our results show that P. piptadeniae has two populations that allopathically occur in the Caatinga FG and in the Semidecidious Forest of south portion of Atlantic Forest. Specimens collected on the Caatinga FG and Central Andes Coast FG and only one specimens collected on Missiones FG (northeast of Argentina), previously identified as P. piptadeniae, clustered on distinct clade of P. piptadeniae, and here we propose a new taxa P. teixeirae sp. nov. Ad int. Additionaly, a new species of Phellinotus are proposed, P. magnoporatus sp. Nov. Ad int., a species at this moment recorded only on Central Andes Coast FG. Based in our results of phylogenetic analisis, a preliminary phylogeographic study of P. piptadeniae was conducted based on the ITS marker. Ouer results indicate that populations of P. piptadeniae associated to P. gonoacantha, and that occur in Atlantic Forest, together the populations located on the central portion of Cerrado, has high genetic diversity em comparison with populations associated to the other know hosts. Adictionally, signs of recent demographic expancion were evidenced trougthout the nuclear marker ITS.

Comportamento meiótico e fertilidade do pólen foram estudados em um total de 49 acessos de 14 taxa do gênero Leucaena, leguminosas arbóreas fixadoras de nitrogênio nativas da América Centrai. As dipióides L. macrophytia, L. pulverulenta, L. retusa, L. salvadorensis, L. shannonii e L. trichandra apresentaram pareamento cromossõmico regular, preferencialmente em bivalentes, mas quadrivaientes e outras anormalidades foram observados em freqüências variadas. Nas tetrapióides L. confertiflora, L. diversifoiia, L. invoiucrata, L. feucocephaia, L. paiiida e no híbrido L. x spontanea a associação cromossomica mais comum também foram bivalentes, mas quadrivalentes e outras anormalidades foram observadas em freqüências variadas. O acesso L. ? hybrid apresentou predominantemente várias irregularidades, como univaientes, muitivalentes e aderências cromossõmicas. Nas espécies dipióides a ocorrência de quadrivalentes pode apoiar sua origem paleopoliplóide. A presença de quadrivalentes nas espécies polipioides apóia urna origem aiotetrapióide "segmentar', mas a autopoiipioidia com subseqüente diploidização não pode ser totalmente descartada. O índice meiótico foi superior a 80% na maioria dos acessos, refletindo a regularidade meiótica. A fertilidade do pólen variou de 71 a 98%, com algumas exceções. A presença de até 19% de díades e tríades e de macropóiens em espécies dipióides e tetrapioides (até de 7% em L. trichandra) demonstram que gametas não reduzidos não são raros em Leucaena. Estes resultados apresentam peia primeira vez uma análise meiótica detalhada e abrangente para Leucaena e demonstram como a citogenética clássica pode fornecer dados importantes para estudos taxonõmicos, evolutivos e no melhoramento de plantas. / Meiotic behavior and poiien tertffity were studied in a total of 49 accessions of 14 taxa of the Central American nitrogen fixing muitipurpose tree genus Leucaena. The dipioid L. macrophylla, L. pulverulenta, L. recusa, L. saivadorensis, L. shannonii and L. trichandra presented regular chromosome pairing, mostiy in bivalents, but quadrivaients and other abnormaiities were observed in varying frequencies. In tetrapioid L. confertitiora, L. diversifolia, L. involucraã, L ieucocephaia, L. pallida and the hybrid L. x spontanea bivalents were also the most common chromosome associations, but quadrivaients and others abnormaiities were observed in varying frequencies. The L. ? hybrid accession presented a predominance of severa! irreguiarities, such as univalents, muitivalents and chromosome stickiness. In dipioid species the commom occurrence of quadrivalents couid support their paleopoiypioid origin. The presence of quadrivaients in poiypioid species supports a segmentai aiiotetrapioid origin, but autopolypioidy with subsequent diplodization cannot be ruled out. Meiotic indexes were mostiy over 80% refiecting the rather regular meiotic behavior. Poilen fertility ranged from 71 to 98%, with some exceptions. The presence of up to 19% dyads and triads and of "giant" poiien grains in dipioid and tetraploid species (up to 7% in L. trichandra) shows that unreduced gametes are not uncommon in Leucaena. These resuits present for the first time a detaiied and comprehensive meiotic analysis for these Leucaena species and show how ciassicai cytogenetics may generate important data to be used in taxonomy, evolutionary studies and plant breeding.