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Estudios genómicos y caracterización funcional de rizobios tipo Oregon noduladores de alfalfa y otras leguminosas

Torres Tejerizo, Gonzalo A. 24 June 2011 (has links)
Debido a sus características particulares fenotípicas y taxonómicas, los rizobios tipo Oregon han atraído la atención de los rizobiólogos desde su aislamiento original por Eardly et al. (1985) en Oregon, USA. Estos rizobios son tolerantes a la acidez, tienen un rango de hospedadores amplio (nodulan varias leguminosas), son muy competitivos para la nodulación de alfalfa en suelos ácidos y son ineficientes para la fijación de nitrógeno en asociación con la alfalfa. Todos estos factores señalan a este grupo de rizobios como un potencial factor de riesgo en los suelos agrícolas en los que coexisten y compiten con E. meliloti, el simbionte eficiente de alfalfa. Nueva información sobre la genética y fisiología de las bacterias tipo Oregon es necesaria para desarrollar mejores estrategias y herramientas (moleculares) para su detección, para comprender de modo más acabado su ecología en suelos de cultivo, y para minimizar los impactos sobre la simbiosis eficiente entre alfalfa y E. meliloti. Objetivos Generales: Abordar estudios genómicos y caracterizar funcionalmente a los rizobios tipo Oregon, noduladores de alfalfa y otras leguminosas, tolerantes a la acidez e ineficientes en la fijación biológica de nitrógeno. Objetivos Específicos: - Obtener el genoma completo de la cepa Rhizobium sp. LPU83, como el representante mejor caracterizado de los rizobios tipo Oregon. - Realizar el análisis funcional in silico del nuevo genoma y evaluar, comparativamente, marcadores cromosomales y plasmídicos respecto de sus homólogos en otros rizobios con el fin de establecer relaciones funcionales y filogenéticas con otras rizobacterias. - Analizar la información contenida en plásmidos, y su transmisibilidad por vía conjugativa. - Determinar la estructura de los factores de nodulación de las rizobios tipo Oregon como determinantes de especificidad para la nodulación de alfalfa. Explorar las relaciones estructurales de los factores de nodulación con los de otros rizobios, especialmente los noduladores de Medicago spp. y Phaseolus vulgaris.
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Filogenia das espécies americanas de Rhynchosia Lour. (Leguminosae, Papilionoideae, Phaseoleae) e estudos taxonômicos do gênero no Brasil

Bezerra, Luísa Maria de Paula Alves January 2018 (has links)
Orientador: Ana Paula Fortuna Perez / Resumo: Rhynchosia Lour. possui distribuição pantropical, apresentando dois principais centros de diversidade para as cerca de 230 espécies, um na África (ca.140 spp.) e outro nas Américas, onde é registrada a ocorrência de 55 espécies, das quais 19 ocorrem no Brasil. O mais recente tratamento taxonômico do gênero foi publicado por Grear em 1978, que tratou apenas as espécies americanas. Neste trabalho, Grear (l.c.) propôs duas seções (R. sect. Copisma (E.Mey.) Endl. e R. sect. Arcyphyllum (Elliott) Torr. & A. Gray. Nenhum trabalho molecular foi realizado para as espécies americanas de Rhynchosia para apoiar esta classificação taxonômica. Estudos de filogenia molecular existentes enfocam a tribo e nestes trabalhos Rhynchosia é apontado como monofilético e mais relacionado com Eriosema, apesar da baixa amostragem utilizada destes gêneros. Do ponto de vista morfológico Rhynchosia é bastante uniforme, dificultando a delimitação das espécies. Pode ser caracterizado por apresentar folhas unifolioladas ou trifolioladas com estípulas persistentes ou caducas, inflorescências racemosas laxas ou congestas, com flores amarelas, cálice com cinco lobos bem desenvolvidos, e fruto do tipo legume, com duas sementes. Considerando o pouco conhecimento sobre as relações filogenéticas em Rhynchosia, enfatizando que nenhum trabalho molecular com as espécies americanas foi realizado, e a riqueza de táxons do gênero existentes no Brasil, um estudo taxonômico para as espécies de Rhynchosia no Brasil e a fil... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Rhynchosia Lour. has a pantropical distribution, with two main centers of diversity for its about 230 species, one in Africa (ca. 140 spp.) and the other in the Americas, where 55 species are recorded, of witch 19 occur in Brazil. The most recent taxonomic treatment of the genus was published by Grear in 1978, which treated only the American species. In this work, Grear (l.c.) proposed two sections (R. sect. Copisma (E. Mey) Endl. and R. sect. Arcyphyllum (Elliott) Torr. & A. Gray. No molecular work was done for the American Rhynchosia species to support this taxonomic classification. Existing molecular phylogenetic studies are those focusing on the tribe and in these works Rhynchosia is designated as monophyletic and more related to Eriosema, despite the low sampling used for these genera. From the morphological point of view Rhynchosia it is quite uniform, making it difficult to delimit the species. It can be characterized by the presence of unifoliolate or trifoliolate leaves with persistent or deciduous stipules, lax or congested racemic inflorescences, yellow flowers, calyx with five well developed lobes, and a legume fruit with two seeds. Considering the little knowledge about the phylogenetic relationships in Rhynchosia, emphasizing that no comprehensive molecular work with the American species has been carried out so far, and the richness of taxa of the genus existing in Brazil, a taxonomic study for the species of Rhynchosia in Brazil and the phylogeny with molecular... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Estudos citogenéticos em espécies americanas de Lupinus L. : número cromossômico e comportamento meiótico

Conterato, Ionara Fatima January 2004 (has links)
O comportamento meiótico e viabilidade do pólen foram estudados em 23 acessos de sete taxa de Lupinus ocorrentes no Rio Grande do Sul. Para as espécies L. lanatus, L. rubriflorus, L. multiflorus, L. paranensis, L. bracteolaris, L. guaraniticus e Lupinus sp., o pareamento cromossômico foi regular com preferencial formação de bivalentes, mas a ocorrência de alguns poucos quadrivalentes foi observado em um acesso de Lupinus sp e presença de quadrivalentes, associações múltiplas e aderência cromossômica foi evidenciada em um acesso de.L. guaraniticus. O índice meiótico e a estimativa da viabilidade do pólen foram superiores a 90% em todos os acessos e espécies analisadas, como reflexo da regularidade meiótica, indicando serem plantas meióticamente estáveis. Números cromossômicos de (2n=36) foram determinados pela primeira vez para L. guaraniticus e L. paraguariensis e confirmados números de 2n=36 para L. lanatus, L. rubriflorus e 2n=34 para L. bracteolaris ocorrentes no Rio Grande do Sul. Em 13 acessos analisados de Lupinus sp provenientes do Peru e Bolívia foi observado 2n=48 cromossomos, e 2n=36 em dois acessos de Lupinus cf. bandelierae da Bolívia. No híbrido ornamental Lupinus Russel foi observado 2n=48 cromossomos. As duas espécies unifolioladas norte americanas L. cumulicula e L. villosus exibiram número cromossômico de 2n=52, diferindo dos demais números conhecidos para as Américas. Os dados cromossômico obtidos neste trabalho aliados aos da literatura reforçam a idéia de que os lupinos andinos formam um grupo citológico diferenciado dentro do gênero, que os lupinos do sudeste da América do Sul são também um grupo citologicamente diferente da maioria dos demais taxa americanos, e que os lupinos unifoliolados norte americanos e os brasileiros não são diretamente relacionados.
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Avaliação agronômica morfológica e molecular de progênies de policruzamento de trevo branco (Trifolium repens L.) em dois locais do Rio Grande do Sul / Agronomic, morphological e molecular evaluation of white clover (Trifolium repens L.) polycrosses progeny in two places of Rio Grande do Sul

Schneider, Raquel January 2010 (has links)
O trevo branco é uma das leguminosas forrageiras mais utilizadas em pastagens consorciadas durante o inverno e primavera no RS, mas apesar disso pode apresentar problemas de persistência, principalmente no verão. O objetivo desse trabalho foi selecionar genótipos mais produtivos e tolerantes à baixa disponibilidade hídrica, avaliando agronomicamente suas progênies e caracterizando-os morfologicamente e geneticamente com o auxílio de marcadores moleculares do tipo SSR. A avaliação agronômica realizou-se na EEA/UFRGS, em Eldorado do Sul e na Embrapa CPPSul, no município de Bagé. Foi avaliada a produção de matéria seca (MS) de 22 progênies e duas cultivares UFRGS e Jacuí de trevo branco, consorciadas com azevém (Lolium multiflorum Lam.) durante os anos de 2008 e 2009. As progênies foram caracterizadas utilizando-se nove marcadores morfológicos em vinte plantas de cada tratamento. As plantas mãe e as progênies foram caracterizadas geneticamente utilizando-se cinco primers SSR. A média de produção de MS de trevo branco durante os dois anos foi de 3671 e 2107 Kg/ha, em Eldorado do Sul e Bagé, respectivamente. A análise estatística separou os tratamentos em dois grupos em ambos locais pelo teste de Scott & Knott (P < 0,05). Em Eldorado do Sul e Bagé a cultivar Jacuí mais treze progênies formaram os grupos com maior produção. Sete progênies ficaram no grupo ―a‖ em ambos os locais, enquanto que somente a cultivar UFRGS e uma progênie apresentaram menores produções nos dois locais, havendo interação genótipo x ambiente. O grupo de descritores morfológicos utilizados permitiu uma boa caracterização dos genótipos avaliados, com a maioria das progênies apresentando pelo menos uma diferença morfológica em relação aos cultivares comerciais. Existe variabilidade genética no germoplasma analisado quanto às características morfológicas e moleculares. Neste trabalho foi verificado que é possível selecionar genótipos mais produtivos e mais resistentes as condições do verão, otimizando a utilização desta espécie. / White clover is a legume forage most widely used in pastures during the winter and spring in the RS, but nevertheless may have persistence problems, especially in summer. The aim of this work was to select higher forage yield and tolerance to low water availability genotypes, evaluating agronomically their progeny and characterizing them morphologically and genetically with the aid of SSR molecular markers. The agronomic evaluation was performed at the EEA / UFRGS, in Eldorado do Sul and Embrapa CPPSUL in the city of Bage. Was evaluated the DM yield of 22 progenies and the two white clover cultivars UFRGS and Jacuí, intercropped with ryegrass (Lolium multiflorum Lam.), during the years 2008 and 2009. The progenies were characterized using nine morphological markers in twenty plants of each treatment. The mother plants and progenies were genetically characterized using five SSR primers. The average DM yield of white clover during the two years was 3671 and 2107 kg / ha, in Eldorado do Sul and Bage, respectively. Statistical analysis separated the treatments into two groups in both locations by Scott & Knott (P <0.05) test. In Eldorado do Sul and Bage the cultivar Jacuí more thirteen progenies formed groups with higher production. Seven progeny were in the group "a" in both places, while only the cultivar UFRGS and one progenie had lower production in the two sites, there genotype-environment interaction. The group of morphological traits used to allow a good characterization of genotypes, with most of the progenies presenting at least one morphological difference compared to commercial cultivars. There is genetic variability in the germplasm analyzed for the morphological and molecular characteristics. This work verified that it is possible to select genotypes more productive and more resistant to summer conditions, optimizing the use of this specie.
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Estudos de diferentes métodos de melhoramento de pastagens no Alto Vale do Itajaí-SC Brasil, utilizando as leguminosas maku (Lotus uliginosus Schkuhr) e amendoim forrageiro (Arachis pintoi Kraprov

Debarba, Rômulo João January 2006 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Agroecossistemas. / Made available in DSpace on 2012-10-22T12:27:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 234075.pdf: 2570300 bytes, checksum: 8c27b0453f67f3f707a283607fcb7fef (MD5) / A região do Vale do Itajaí já foi uma das maiores produtoras de leite do Estado, chegando a ter uma média de produção de 2000 L/vaca/ano. A produção de leite a nível de Estado vem sofrendo incrementos, mas o número de produtores tem decaído ano após ano devido aos custos elevados de produção, principalmente pelo sistema produtivo utilizado. O melhoramento de pastagens apresenta-se como uma alternativa para a redução de desembolsos visando manter o agricultor na atividade. A produção de mudas em tubetes foi idealizada para maximizar o processo de melhoramento de pastagens com o objetivo de aumentar a velocidade de implantação e estabelecimento das leguminosas. O experimento foi implantado em uma pastagem de missioneira gigante (Axonopus catarinensis Valls), consistiu na comparação da implantação de mudas de leguminosas, maku (Lotus uliginosus Schkuhr) e amendoim forrageiro (Arachis pintoi Krapov & Gregory), produzidas em tubetes com a forma tradicional de implantação através de sementes. Os métodos de melhoramento foram avaliados através do estabelecimento das mudas e germinação das sementes a campo, percentual de sobrevivência a campo, composição botânica da pastagem, facilidade de implantação por agricultores. As mudas de maku apresentaram um maior percentual de estabelecimento e sobrevivência a campo comparado com os demais tratamentos obtendo um resultado de estabelecimento de 80,3 %, diferindo estatisticamente do tratamento maku semente. Os resultados obtidos nas avaliações de composição botânica nos métodos da transecta e do quadrado, foram respectivamente 3,7 % e 5,5 na média de notas ( as notas atribuídas variaram de zero a 100) para o tratamento maku introduzido via mudas sendo diferentes estatisticamente do tratamento maku introduzido via sementes, já método da freqüência amostral os resultados mostram a real situação do experimento . No desenvolvimento das leguminosas a campo, o maku via mudas teve o melhor desenvolvimento, em geral com 17,3 cm de diâmetro de touceira, sendo estatisticamente diferente dos demais tratamentos. Não houve diferenças estatísticas entre os tratamentos com amendoim forrageiro. Segundo os agricultores consultados, a metodologia de implantação reduz consideravelmente o trabalho de melhoramento, sendo o sacho um implemento multifuncional, podendo ser utilizado nas atividades hortícolas da propriedade. Com este método, são capazes de implantar mais de 3.000 mudas por dia. Os desembolsos com esta prática, quando não considerada a mão-de-obra de implantação, são menores do que o plantio direto de estolões. De forma geral, a espécie maku teve a tendência de ser melhor nas avaliações a campo devido ao seu hábito de crescimento e capacidade de competição com a grama missioneira gigante. Isso ocorre principalmente pelo fato da produção de mudas de maku em tubete ir a campo com um sistema radicular mais desenvolvido em relação ao método via sementes. Conclui-se, que os agricultores que utilizarem a produção de mudas de leguminosas em tubetes terão melhores resultados na redução de desembolsos. Há necessidade de mais avaliações ao longo do tempo, no mínimo 3 anos, os resultados são do ano de implantação. The area of Alto Vale do Itajaí was one of the largest producers of milk in the State of Santa Catarina, having an average production of 2000 L/Cow/Year. The milk production in the State is improving, but the number of producers has been declining year after year due to the high cost production, mainly because of the productive system. The improvement of pastures comes as an alternative to reduce the costs tryingto keep the farmer in this activity. The production of seedlings in test tubes was idealized to maximize the process of the pastures improvement with the objective to increase the speed implantation and establishment of the vegetables in the pasture. The experiment was developed in a pasture of missioneira gigante ( Axonopus catarinensis Valls), comparing the implantation of vegetables seedlings maku (Lotus uliginosus Schkuhr) and perennial peanut ( Arachis pintoi Krapov & Gregory), produced in test tubes with the traditional form of implantation through seeds. The methods of improvement were appraised through the establishment of the seedlings and germination of the seeds in the field, survival percentage in the field, botanical composition of the pasture and implantation facilities to the farmers. The maku seedlings presented the highest percentage of establishment and survival in the field comparing with the other treatments, obtaining a result of 80,3 %, differing statistically of the treatment of ther maku seed. The results obtained in the evalutions of botanical composition using the methods of transecta and the square, the result were 3,7 % and 5,5 % respectively in the average of notes (the attributed notes varied from zero to 100 %), for the treatment of the maku seed road seedling being different statistically of the treatment of maku implemented through seeds. However, the method of the amostral frequency show us the results of the real situation about the experiment. In the development of the vegetables in the field, the maku through seedlings had the best development, in general with 17,3 cm of diameter, being statistically different from the other treatments. There were not statistical differences among the treatments with perennial peanut. According to the consulted farmers, the implantation methodology reduces the work improvement considerably, being the #sacho# an multifunctional implement and could be used in the horticultural activities inn the property. With this method, they are able to implant more than 3.000 seedlings a day. The costs with this practice, when the implantation labor is not considered, are smaller than the direct planting of vegetable parts. In a general way, the species maku had the tendency of being better in the evaluations in the field due to its growth habit and competition capacity with the grass of missioneira gigante. That happens mainly for thje fact of the the production of vegetables seedlings in the test tubes will have better results inn the costs reduction. There is a necessity to have more evaluations along the time, at least 3 years, and these results are from one year of implantation.
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Adubação verde: uso por agricultores agroecológicos e o efeito residual no solo / Use of Green Manure by agroecological farmers and its residual effect on soil

Souza, Bianca de Jesus 27 February 2014 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-06-02T13:52:25Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 862692 bytes, checksum: f76b6da63ca9a5842052488fcbf61618 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-02T13:52:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 862692 bytes, checksum: f76b6da63ca9a5842052488fcbf61618 (MD5) Previous issue date: 2014-02-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A adubação verde é uma prática capaz de trazer diversos benefícios ao sistema produtivo. Um desses benefícios é a possibilidade de haver incorporação de nitrogênio atmosférico no solo pela utilização de leguminosas ou outras espécies fixadoras. Muitos agricultores reconhecem este potencial, mas alguns fatores podem limitar a adoção desta prática, o que merece ser mais bem avaliado. Pouco se sabe também sobre a dinâmica do N, no solo adicionado via adubação verde. Neste sentido, este trabalho foi realizado com os objetivos de identificar critérios de escolha e formas de uso e manejo de adubos verdes por agricultores agroecológicos da região sudeste de Minas Gerais, bem como avaliar o solo sob manejo de adubação verde com leguminosas, em diferentes épocas e diferentes profundidades. Entrevistas foram realizadas e os dados analisados por estatística descritiva, para identificação dos motivos que levam os agricultores à adoção e manutenção desta prática, além do manejo empregado. Paralelamente foram feitas análises de quatro profundidades (0-5; 5-10; 10-20; 20-40 cm) do solo de um experimento conduzido em vasos, onde anteriormente havia plantas de café Oeiras, adubadas com adubo mineral e diferentes doses de adubo verde. O delineamento adotado foi o de blocos casualizados com cinco tratamentos e quatro repetições. Os tratamentos constaram de: 30% de adubação mineral + 146 g de adubo verde com adição de 15 N no ano de 2009; 30% de adubação mineral + 146 g de adubo verde com adição de 15 N no ano de 2010; 30% de adubação mineral + 584 g de adubo verde com adição de 15 N no ano de 2009 e; 30% de adubação mineral + 584 g de adubo verde com adição de 15 N no ano de 2010 e uma testemunha (30% de adubação mineral;). As análises VI estatísticas foram realizadas aplicando Contraste Ortogonal com auxílio do programa Sisvar®. Após a análise dos dados, observa-se a importância das entidades de pesquisa e extensão em trabalho conjunto com os agricultores, que foram as principais responsáveis pelo início do uso da adubação verde para a região,e o principal fator limitante à adoção e manutenção desta prática é a alta demanda de mão de obra. Observou-se também que o incremento do solo com adubos verdes favoreceu um aumento no teor de carbono orgânico total e nitrogênio total em todas as profundidades avaliadas. Em relação ao comportamento do 15 N, observou-se que embora a aplicação de maior dose resulte em teores mais elevados de N derivado do adubo verde no solo, essa elevação é menor do que a esperada em função da dose, sugerindo que ocorre também maior absorção de N pelo cafeeiro e ou maior perda de N com a dose mais elevada. / Green manure can bring many benefits to the productive system, including the possible incorporation of atmospheric nitrogen in soil by use of legumes or other fixing species. Many farmers recognize this potential, but some factors that may limit such practice deserve closer investigation. Little is also known about the dynamics of N on soil that received green manure. Thus, this study aimed to identify selection criteria and forms of use and management of green manure by agro ecological farmers in the Southeastern Minas Gerais state, and evaluate the soil submitted to green manure management with legumes at different times and different depths. Interviews were conducted and the data were analyzed by descriptive statistics so as to identify the reasons that led farmers to adopt and maintain this practice and this type of management. At the same time, analyses were conducted at four depths (0-5; 5-10; 10-20; 20-40 cm) of the soil from an experiment conducted in vases, where Oeiras coffee plants had been previously cultivated and fertilized with mineral fertilizer and different doses of green manure. The experiment was arranged in a randomized block design with five treatments and four replications. The treatments consisted of: 30% of mineral fertilizer + 146 g of green manure with addition of 15 N, in 2009; 30% of mineral fertilizer + 146 g of green manure with addition of 15 N, in 2010; 30% of mineral fertilizer + 584 g of green manure with addition of 15 N,in 2009 and; 30% of mineral fertilizer + 584 g of green manure with addition of15N, in 2010; and a control (30% of mineral manure;). The statistical analyses were performed by applying Orthogonal Contrast with the aid of the Sisvar® system. After data analysis, we noticed the relevance of institutions of research VIII and extension that work with farmers, which were the main responsible for starting the use of green manure in the region. The high demand for labor is the greatest hindrance to the adoption and maintenance of this practice. It was also observed that soil improved by green manure led to increased levels of total organic carbon and total nitrogen at all depths assessed. As for the behavior of 15 N, it was found that the use of a higher dose results in higher contents of N derived from green manure in the soil, but this increase is smaller than that expected according to the dose, which suggests that increased N absorption by coffee and/or greater loss of N also occur, due to a higher dose. Keywords: legumes; agro ecology; biological fixation; nitrogen.
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Sementes de Lonchocarpus sericeus (Poir) Kunth ex Dc como repositório de inibidores de proteases: purificação e seus efeitos sobre o ciclo de vida do mosquito Aedes aegypti / Lonchocarpus sericeus seeds (Poir) Kunth ex DC as a source of protease inhibitors: Purification and its effects on Aedes aegypti life cycle.

Almeida Filho, Luiz Carlos Pereira January 2017 (has links)
ALMEIDA FILHO, Luiz Carlos Pereira. Sementes de Lonchocarpus sericeus (Poir) Kunth ex Dc como repositório de inibidores de proteases: purificação e seus efeitos sobre o ciclo de vida do mosquito Aedes aegypti. 2017. 93 f. Tese (Doutorado em Bioquímica)-Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2017. / Submitted by Coordenação PGBioquímica (pg@bioquimica.ufc.br) on 2017-09-19T18:55:28Z No. of bitstreams: 1 2017_tese_lcpalmeidafilho.pdf: 1954670 bytes, checksum: 5d3ac62feabd7a4aa5bff98f664a83af (MD5) / Approved for entry into archive by Jairo Viana (jairo@ufc.br) on 2017-09-20T18:20:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_tese_lcpalmeidafilho.pdf: 1954670 bytes, checksum: 5d3ac62feabd7a4aa5bff98f664a83af (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-20T18:20:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_tese_lcpalmeidafilho.pdf: 1954670 bytes, checksum: 5d3ac62feabd7a4aa5bff98f664a83af (MD5) Previous issue date: 2017 / Arboviroses such as chikungunya, dengue and zika represent a serious issue in public health due to the absence of an approved vaccine or specific antiviral drugs for its prevention and treatment. One of the ways to avoid the occurrence of these diseases is by combating the mosquito vector, Aedes aegypti. This insect belongs to Diptera order, which commonly has digestive enzymes similar to trypsin and chymotrypsin. Protease inhibitors are molecules that can block enzymatic activity leading to an impairment of digestion and nutrition. Together, these factors can lead the insects to death. In this context, we purified a new protease inhibitor from seeds of an underexploited plant, Lonchocarpus sericeus. This inhibitor was subjected to a biochemical characterization, evaluated for the inbitory activity upon the digestive proteases from Aedes aegypti larvae and its insecticidal effect upon egg hatchability and larvae development. The purified inhibitor (LsCTI) showed a single protein band on SDS-PAGE, the molecular mass determined by MALDI-TOF-MS was 8,870.45 Da. LsCTI was able to inhibit more than one serine protease. Kinetics analyzes revealed the type of noncompetitive inhibition and a low Ki for chymotrypsin (8.24 x 10-8 M). The stability of the inhibitory activity was remarkable for the thermal resistance, LsCTI supported heating at 100 ° C for 180 min without losing its activity. The IC50 value of LsCTI was 4.7 x 10-7 M. for Ae. aegypti midgut enzymes. LsCTI did not affect egg hatchability when tested at 0.3 mg.mL-1, but caused a high larval mortality rate (77%) and developmental delay (37%). Thus, LsCTI is a novel protease inhibitor with remarkable biochemical characteristics and a novel potential tool to control the Ae. Aegypti development. / Arboviroses como a chikungunya, dengue e zika representam um problema sério em saúde pública devido à ausência de uma vacina aprovada ou medicamentos antivirais específicos para sua prevenção e tratamento. Uma das maneiras de evitar a ocorrência dessas doenças é através do combate ao mosquito vetorial, Aedes aegypti. Este inseto pertence à ordem Diptera que comumente possui enzimas digestivas similares à tripsina e quimotripsina. Os inibidores de protease são moléculas que podem promover o bloqueio da atividade enzimática prejudicando a digestão e a nutrição. Juntos, esses fatores podem levar à morte de insetos. Neste contexto, purificamos um inibidor de protease de sementes de uma planta sub-explorada, Lonchocarpus sericeus. Este inibidor foi submetido a caracterização bioquímica e avaliado quanto a atividade inibitória sobre as proteases digestivas do intestino médio das larvas Ae. aegypti e seu efeito inseticida sobre a eclodibilidade de ovos, desenvolvimento desse mosquito. O inibidor purificado (LsCTI) mostrou uma única banda de proteína em SDS-PAGE, a massa molecular determinada por MALDI-TOF-MS foi de 8.870,45 Da. LsCTI foi capaz de inibir mais de uma protease serínica. As análises cinéticas revelaram o tipo de inibição não competitivo e o Ki baixo para a quimotripsina (8,24 x 10-8 M). A resistência térmica do inibidor foi notável, suportando aquecimento a 100 °C durante 180 min, sem perda de atividade. O valor da CI50 de LsCTI para as enzimas do intestino médio das larvas de Ae. aegypti foi 4,7 x 10-7 M. O LsCTI não afetou a eclodibilidade dos ovos quando testado a 0,3 mg.mL-1, mas causou alta taxa de mortalidade larval (77%) e atraso no desenvolvimento (37%). Assim o LsCTI é um novo inibidor de protease com características bioquímicas notáveis e uma nova ferramenta potencial para controlar o desenvolvimento do mosquito Ae. aegypti.
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Seleção de bactérias promotoras de crescimento para plantas forrageiras / Selection of plant growth promoting bacteria for forages

Machado, Rafael Goulart January 2015 (has links)
Bactérias promotoras de crescimento de plantas podem ser agentes importantes para a sustentabilidade econômica e ambiental de cultivos agrícolas, podendo ser inseridas em sistemas de sucessão/consorciação de pastagens nativas e cultivadas. Neste trabalho foram realizados estudos para se avaliar a capacidade de promoção de crescimento de plantas por rizóbios e bactérias associativas, quando inoculadas em pastagens nativas e cultivadas. Os objetivos do trabalho foram: estudar o efeito da inoculação de bactérias promotoras de crescimento em azevém; capim áries; capim sudão; milheto; sorgo; trevo branco; isolar, autenticar, selecionar e caracterizar rizóbios das leguminosas nativas adesmia e serradela; avaliar a capacidade promotora de crescimento de gramíneas cultivadas dentre os rizóbios selecionados de ademia e serradela, bem como caracterizar e agrupar estes rizóbios quanto à diversidade genotípica. Foram obtidos 148 rizóbios isolados de serradela, sendo os rizóbios UFRGS Om57, UFRGS Om59 e UFRGS Om148 os mais eficientes quanto à nodulação e fixação de N, bem como quanto ao incremento da massa seca da parte aérea de serradela. Com as inoculações dos isolados EEL46210 e EEL1010 em adesmia, foram observados incrementos de massa fresca total e comprimento da parte aérea, comparativamente ao tratamento Controle + N e as estirpes recomendadas SEMIA 3007, SEMIA 6437 e SEMIA 6438. Os isolados UFGRS Os57, UFRGS Os148, EEL46.210, SEMIA929 e SEMIA6437 estimulam aumento na massa seca radicular de capim sudão. Em milheto, a estirpe SEMIA 929 aumenta a massa seca da parte aérea e radicular, sendo o Índice de Eficiência Relativa (IER%) de 150 %. Em sorgo, a inoculação com o isolado UFRGS Om57 produz IER (%) de 179% e com EEL46210 de 124%, mostrando que ambos podem ser recomendados para a produção de inoculantes para a cultivar BRS810 de sorgo. Os isolados UFRGS Os57, UFRGS Os59, UFRGS Os148 e EEL 46.210, bem como as estirpes SEMIA905 e SEMIA929 pertencem ao gênero Bradyrhizobium sp., enquanto a estirpe SEMIA6437 pertence ao gênero Rhizobium sp. Observando-se a similaridade dos fragmentos da região 16S DNAr, infere-se que os isolados EEL 46210, UFRGS Os57, UFRGS Os59 e UFRGS Os148 diferem genotipicamente entre si, bem como também diferem das estirpes SEMIA 905, SEMIA 929 e SEMIA 6437. Nos estudos à campo se observa estímulos na massa seca da parte aérea de milheto inoculado com SEMIA222, VP16 e A. brasilense, após cultivo de azevém e trevo branco. Em trevo branco, também se observa estímulos na massa seca da parte aérea com a inoculação de A. brasiliense, VP16 e SEMIA222. Os rizóbios VP16 e SEMIA 222, bem como a mistura de A. brasilense (Abv5 e Abv6) são indicados como promotores de crescimento de milheto cultivar BRS1501. / Plant growth promoting bacteria can be important agents for economic and environmental sustainability of agricultural crops and may be inserted in succession systems of native and cultivated pastures. This work carried out studies to evaluate the growth-promoting ability of plants by rhizobia and associative bacteria when inoculated in native and cultivated pastures. The objectives were to study the effect of inoculation of plant growth promotion rhizobacteria in ryegrass, aries grass, sudan grass, millet, sorghum and white clover; isolate, authenticate, select and characterize the rhizobia adesmia and serradella native legumes; evaluate the growth promoting capacity of cultivated grasses among the rhizobia selected ademia and serradella and to characterize and group these rhizobia on the genotypic diversity. It was obtained 148 rhizobia isolated from root nodules of serradella. The rhizobia UFRGS Om57, UFRGS Om59 and UFRGS Om148 were the most efficient in nodulation and nitrogen fixation, as well as the increase of the dry mass of shoots serradella. With inoculations of EEL46210 and EEL1010 isolated on adesmia, were observed increments of total fresh mass and shoot length, compared to treatment Control + N and the recommended strains SEMIA 3007, SEMIA 6437 and SEMIA 6438. Thr rhizobia Isolates UFGRS Os57, UFRGS Os148, EEL46210, SEMIA929 and SEMIA6437 increased root biomass Sudan grass. In millet, the SEMIA 929 strain increases dry matter of shoot and root biomass, and the Relative Efficiency Ratio (RER%) there was greater than 150%. With the inoculation of the sorghum with UFRGS Om57, there was observed an RER (%) of 179%, whereas with isolated EEL46210 was found RER (%) of 124%. Both bacteria (UFRGS Om57 and EEL.46210) there are recommended for inoculant composition for cultivating sorghum BRS810. Isolated UFRGS Os57, UFRGS Os59, UFRGS Os148 and EEL 46,210, and SEMIA905 and SEMIA929 strains belong to the genus Bradyrhizobium sp., while SEMIA6437 strain belongs to the genus Rhizobium sp. With the similarity of 16S rDNA fragments there was inferred that the isolates EEL 46210, UFRGS Os57, UFRGS Os59 and UFRGS Os148 differ genotypically each other, and also differ from SEMIA 905, SEMIA 929 and SEMIA 6437. Studies carried on at field conditiosn showed stimuli in the dry weight of shoots of millet inoculated with SEMIA222, VP16 and A. brasilense, after grass crop and white clover. In white clover plants, it was also observed stimuli in shoot dry mass by inoculation of A. brasiliense, VP16 and SEMIA222 compared to control treatments. The VP16 and SEMIA 222 rhizobia, and the mixture of A. brasilense are indicated as growth promoters bacteria of millet BRS1501.
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Crescimento da Gliricidia sepium submetida a diferentes manejos de corte nas condições do semiárido cearense / Growth Gliricidia sepium submitted to different conditions cutting managements in semiarid cearense

Edvan, Ricardo Loiola January 2013 (has links)
EDVAN, Ricardo Loiola. Crescimento da Gliricidia sepium submetida a diferentes manejos de corte nas condições do semiárido cearense. 2013. 73 f. Tese (doutorado em zootecnia)- Universidade Federal do Ceará, Fortaleza-CE, 2013. / Submitted by Elineudson Ribeiro (elineudsonr@gmail.com) on 2016-04-22T19:15:18Z No. of bitstreams: 1 2013_tese_rledvan.pdf: 1440845 bytes, checksum: 12075601d9131f8589222557063dd008 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa (jairo@ufc.br) on 2016-05-27T17:52:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_tese_rledvan.pdf: 1440845 bytes, checksum: 12075601d9131f8589222557063dd008 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-27T17:52:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_tese_rledvan.pdf: 1440845 bytes, checksum: 12075601d9131f8589222557063dd008 (MD5) Previous issue date: 2013 / The objective was to evaluate the growth of Glirídica sepium under different managements cutting conditions semiarid of Ceará. The statistical design was a randomized block design with split plots. The plots consisted of four cut off frequencies (45, 60, 75 and 90 days) and three heights residue (30, 60 and 90 cm) with four replications, and the cut off frequency comprised the major portion of the residue height of the subplot. The experiment was conducted in the city of Fortaleza, Ceará. Planting took place in March 2010 at a spacing of 1.5 m x 1.0 m with an area of 600 m2 and experimental stand with 336 plants. Cutting standardization and application of treatments occurred in December 2010, from this date began the evaluation period of 375 days which was the amount of cuts varied with treatments, performing 8, 6, 5 and 4 cuts for treatments with cut off frequencies of 45, 60, 75 and 90 days, respectively. The analysis of the growth characteristics of Gliricidia was obtained by specific leaf area, leaf area index, relative growth rate, net assimilation rate, crop growth rate, stem diameter at ground level, diameter of shoots, number of sprouting, number of leaves, plant height, leaf/stem ratio, plant dry matter, leaf and stem dry mass of leaf and stem by cutting and total production of dry matter per cutting and full. Plants managed with cut off frequency of 90 days and a residue height of 90 cm had higher specific leaf area and leaf area index with 48.51 cm2.g-1 and 5.54, respectively. The highest growth rate cultural was 2.63 g.m-2.dia-1 obtained in the management of cutting frequency of 45 days and residue height of 90 cm. At the same management cut off was observed for the maximum relative growth rate which was 0.016 g.g-1.dia-1 and higher net assimilation rate with 1.32 g.m-2.dia-1, both rates were obtained in period of 3° to 4° cut (rainy season). The diameter of the bud for handling cut frequently with 90 days combined residue height of 90 cm was 0.31 cm larger than the diameter of the shoot in the management of cutting frequency of 45 days and residue height of 30 cm, with larger diameter of 0.96 cm shoot for the rainy season and 0.81 cm for the dry period, getting even, greater leaf area index during the rainy season and dry. The handling with cut off frequency of 90 days combined with residue height of 90 cm obtained higher dry matter accumulation by cutting forage during the rainy season and dry with 5.3 and 4.8 t.ha-1, and with full 10.7 t.ha-1 and 9.7, respectively. Plants subjected to the same management reached the highest yield of green mass and dry fodder by cutting, with a mean of 18.13 t.ha-1 and 5.09 t.ha-1 in each cut, respectively, producing 72 52 t.ha-1 fresh weight of total forage and 20.36 t.ha-1 dry weight of total forage. The cut off frequency and height of residue influence the growth and production of Gliricidia. The intensity of cut 90 cm provides better growth rates and when combined with a cut off frequency of 90 days is greater herbage mass production of Gliricidia. / Objetivou-se avaliar o crescimento da Glirídica sepium submetida a diferentes manejos de corte nas condições do semiárido cearense. O delineamento estatístico utilizado foi de blocos ao acaso em parcelas subdivididas. As parcelas constaram de quatro frequências de corte (45, 60, 75 e 90 dias) e três alturas de resíduo (30, 60 e 90 cm) com quatro repetições, sendo que a frequência de corte compreendeu a parcela principal e a altura de resíduo a subparcela. O experimento foi conduzido no município de Fortaleza, Ceará. O plantio foi realizado em março de 2010 em espaçamento de 1,5 m x 1,0 m com área experimental de 600 m2 e estande com 336 plantas. O corte de uniformização e aplicação dos tratamentos ocorreu em dezembro de 2010, a partir desta data iniciou-se o período de avaliação que foi de 375 dias a quantidade de cortes variou de acordo com os tratamentos, realizando-se 8, 6, 5 e 4 cortes para os tratamentos com as frequências de corte de 45, 60, 75 e 90 dias, respectivamente. A análise das características de crescimento da gliricídia foi obtida através da área foliar específica, índice de área foliar, taxa de crescimento relativo, taxa assimilatória líquida, taxa de crescimento da cultura, diâmetro do caule ao nível do solo, diâmetro dos brotos, número de brotação, número de folhas por broto, altura da planta, relação folha/caule, matéria seca da planta, da folha e do caule, produção de massa seca de folha e caule por corte e total e produção de massa de forragem por corte e total. As plantas manejadas com frequência de corte de 90 dias e altura de resíduo de 90 cm obtiveram maior área foliar específica e índice de área foliar com 48,51 cm2.g-1 e 5,54, respectivamente. A maior taxa de crescimento cultural foi de 2,63 g.m-2.dia-1 obtida no manejo de corte com frequência de 45 dias e altura de resíduo de 90 cm. No mesmo manejo de corte observou-se o valor máximo para taxa de crescimento relativo que foi de 0,016 g.g-1.dia-1 e maior taxa assimilatória líquida com 1,32 g.m-2.dia-1, ambas as taxas foram obtidas no período do 3° ao 4° corte (período chuvoso). O diâmetro do broto para o manejo de corte com frequência de 90 dias combinado com altura de resíduo de 90 cm foi 0,31 cm superior ao diâmetro do broto no manejo de corte com frequência de 45 dias e altura de resíduo de 30 cm, apresentando maior diâmetro de broto de 0,96 cm para o período das chuvas e de 0,81 cm para o período seco, obtendo ainda, maior índice de área foliar no período das chuvas e seco. O manejo com frequência de corte de 90 dias combinado com altura de resíduo de 90 cm obteve maior acúmulo de massa seca de forragem por corte no período das chuvas e seco com 5,3 e 4,8 t.ha-1, e total com 10,7 e 9,7 t.ha-1, respectivamente. As plantas submetidas a esse mesmo manejo atingiram a maior produção de massa verde e seca de forragem por corte, com média de 18,13 t.ha-1 e 5,09 t.ha-1 em cada corte, respectivamente, produzindo 72,52 t.ha-1 de massa verde de forragem total e 20,36 t.ha-1 de massa seca de forragem total. A frequência de corte e altura de resíduo influenciam o crescimento e produção da gliricídia. A intensidade de corte 90 cm proporciona melhores taxas de crescimento e quando combinada com a frequência de corte de 90 dias ocorre maior produção de massa de forragem da gliricídia.
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Mecanismos de estabilização de carbono em argissolo subtropical sob sistemas de manejo de longa duração / Mechanisms of carbon stabilization in a subtropical Acrisol under long-term management systems

Gomes, Murilo Veloso January 2018 (has links)
No Brasil, o acúmulo de carbono orgânico no solo (COS) tem sido obtido em plantio direto (NT), que faz parte do plano de agricultura de baixo carbono para a mitigação da emissão de gases do efeito estufa. Quando combinado com leguminosas de cobertura, o NT pode resultar ainda em maiores taxas de acúmulo de COS. Baseado num experimento de 30 anos, seis estudos foram realizados com o objetivo geral de avaliar o efeito de dois métodos de preparo (preparo convencional –CT e NT) com três sistemas de culturas [aveia/milho (O/M), ervilhaca/milho (V/M) e o consórcio aveia+ervilhaca/milho+caupi (OV/MC)] sobre os mecanismos de estabilização do C e consequente potencial de sequestro de COS em camadas superficias e subsuperficias de um Argissolo subtropical do Sul do Brasil. O primeiro estudo engloba uma metaanálise global avaliando o potencial do NT em acumular COS. Os resultados deste estudo mostraram um grande potencial de acumular COS em regiões tropicais e subtropicais, o que foi explicado pela alta precipitação média anual nessas regiões. O segundo e terceiro estudos mostraram um importante mas diferenciado papel do plantio direto e das leguminosas de coberturas sobre a estabilização do C no solo, sendo que o não revolvimento favoreceu a oclusão da matéria orgânica em macroagregados enquanto que as leguminosas favoreceram a associação organomineral em microagregados Neste estudo, a importância dos macroagregados sobre a associação organomineral foi enaltecida. Além disso, o quarto estudo revelou forte contribuição das leguminosas de cobertura sobre o potencial de acumular COS em NT, sendo que altas taxas de acúmulo de COS ocorreram durante um período mais longo em camadas subsuperficias do solo. No quinto estudo, uma combinação de fracionamento densimétrico e granulométrico com análises de carboidratos e n-alcanos foi realizada objetivando maior entendimento do papel das leguminosas de cobertura sobre o acúmulo de C em associações organomineral. Este estudo deu suporte à hipótese que o acúmulo de C adicional na fração argila em camadas superficiais e subsuperficias do NT com leguminosas de cobertura é microbiologicamente processado. No sexto estudo, encontramos que o maior teor de C na fração leve do solo sob plantio direto e leguminosas de cobertura favoreceu a comunidade de fungos que, por sua vez, mediou a melhora na agregação de solo. O acúmulo de constituintes da parede celular de fungos contribuiu, portanto, ao acúmulo de COS e agregação de solo sob plantio direto e leguminosas de cobertura. / In Brazil, soil organic carbon (SOC) accumulation have been observed under notillage (NT) which is part of a low carbon agriculture plan for mitigation of greenhouse gases emissions. When combined with legume cover crops, NT could result in even greater soil organic carbon (SOC) sequestration rate than NT alone. Using a 30-year experiment, we performed six studies for which the general objective was to evaluate the effect of two tillage (conventional system – CT and NT) with three cropping systems [oat/maize (O/M), vetch/maize (V/M) and the consortium oat+vetch/maize+cowpea (OV/MC)] on stabilization mechanisms of C and consequent SOC sequestration potential in both the superficial and sub-superficial soil layers of a subtropical Acrisol of Southern Brazil. Encompassing a meta-analysis evaluating the potential of NT in accumulate SOC around the world, the first study showed a great potential in tropical and subtropical regions to accumulate SOC that was explained by the high mean annual precipitation. In addition, the second and third studies showed the meaningful but differential roles of no-tillage and legume cover crops on C stabilization with the former favoring occlusion in soil macroaggregates and the latter, mineral-organic association in soil microaggregates. In these studies, we supported the importance of macroaggregates to the mineral-organic association The fourth study revealed the strong contribution of legume on the potential of SOC sequestration in NT, and high rates of C accumulation occurred over a longer period in sub-superficial soil layers. In the fifth study, we used density and particle size fractionation in combination with carbohydrate and nalkane analyses to provide better understanding of the effect of legume cover crop on C accumulation in mineral-organic association. This study gives support to the hypothesis that the additional clay-bound SOC accumulation at depth under NT with legume cover crops is microbially processed. In the sixth study, we found that the greater C content in light fraction under NT and legume cover crops favoured the fungal community which, in turn, mediated the improvement in soil aggregation. The accrual of fungal cell-wall constituents contributed therefore to SOC accumulation and soil aggregation under NT and legume cover crops.

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