A presente dissertação procurou identificar, por meio de revisão de literatura, entrevista com especialistas e pesquisa de mercado, atributos do lombo suíno considerados importantes para o consumidor gaúcho. A pesquisa de mercado foi realizada através de survey via internet e obteve uma amostra de 392 consumidores, sendo que 50,8% pertencentes ao sexo masculino, 49,2% do sexo feminino e com idade predominante entre 21-30 anos (49,2%). Os resultados auferidos indicam que os consumidores gaúchos almejam um lombo suíno mais suculento, com menor fibrosidade, em porções menores nos pontos de venda e com maior diversidade de preparo. Também se identificou a importância da criação dos animais dentro das práticas de bem-estar animal e que são necessárias ações que visem melhorar a imagem do produto em termos de confiança e segurança alimentar. Na etapa seguinte, através de entrevistas com especialistas e com auxílio de uma matriz modificada do Desenho da Cadeia da Demanda (DCD) de Canever (2007), foram identificados os pontos críticos processuais que merecem maior atenção na cadeia produtiva estudada, no intuito de propor melhorias aos atributos identificados anteriormente. Os resultados apontam como pontos críticos processuais na cadeia produtiva integrada do lombo suíno os respectivos setores e ações: i) setor de produção: manejos dos animais em fase de crescimento/terminação e seleção genética; ii) transporte dos animais: cuidados operacionais e adequação do veículo; iii) setor de processamento: abate humanitário e embalagem; iv) setor de distribuição: campanha de informação ao consumidor e ações promocionais. / The present dissertation has sought to identify through literature rummage, interviews with experts and market research, attributes of pork loin considered "important" for the “Gaúcho” consumer. Market research has been conducted through survey via the Internet and has obtained answers of 392 consumers, of which 50.8% were male and 49.2% female, predominantly aged between 21-30 years (49.2 %). The results received indicate that “Gaúcho” consumers wish a juicier pork loin, with less fibrousness in smaller portions at points of sale and greater diversity of preparation. It has also identified the importance of breeding animals using practices in which are included animal welfare, being necessary actions to improve the product’s image in terms of trust and food safety. In the next stage, by interviewing experts and with the aid of a modified matrix of Design Chain Demand (DCD), from Canever (2007), it has been identified the critical procedural points that deserve more attention in the supply chain studied, in order to propose improvements to the attributes identified above. In summary, the results indicate as critical procedural points in the integrated pork loin supply chain the following sectors and actions: i) production sector: management of growing animals/finishing and genetic selection, ii) animals transportation: operational care and vehicle adequacy, iii) processing sector: packaging and humanitarian slaughter; iv) distribution sector: information campaign and promotional strategies.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-06T14:12:49Z No. of bitstreams: 1 Fernanda de Oliveira Lana.pdf: 4331332 bytes, checksum: 6fb6ebd6a4a539ee97e258da0a630aa7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-06T14:12:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Fernanda de Oliveira Lana.pdf: 4331332 bytes, checksum: 6fb6ebd6a4a539ee97e258da0a630aa7 (MD5) Previous issue date: 2016-12-13 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The silky shark, Carcharhinus falciformis, is a common species in the pelagic zone, with distribution in tropical and equatorial waters of all the oceans of the world. The objective of this study was to study the ecology of silky shark, including the study of the morphological characteristics, molecular identification and displacement, via electronic taggings of the silky shark in the Southwest and Equatorial Atlantic Ocean, particularly in relation to its distribution in the Saint Peter and Saint Paul Archipelago (SPSPA), in order to clarify their daily and seasonal movement patterns, as well as the local structure of their population. The morphological/anatomical characteristics that define this species was also analyzed in a comparative way with other species of the Carcharhinus genus that also occur in the study area (SPSPA). All tagged shark and collection of biological material were performed in the Southwest and Equatorial Atlantic Ocean, in the vicinity of the SPSPA, in the area between latitudes 00°55'3,72"N and longitudes 029°20'11,22"W. Silky sharks were tagged with three (3) different models of satellite transmitters, totaling ten (10) individuals: 5 MiniPAT (Pop-up archival tags), 3 PSAT (Pop-up Satellite Archival Transmitting Tag), and 2 SPOT (Smart Position or Temperature Transmitting Tag), in the period from 2010 to 2014, in the vicinity of SPSPA. The chondrocrania of Carcharhinus (including Nasolamia), despite being conservative, showed differences that can be taxonomically significant. The cranial components that presented specific consistent differences are: the shape of the rostral node and posterior margin of anterior fontanele, rostral dimension, presence or absence of rostral fenestra, epiphisial notch, epiphisial foramen and nasal flap; direction of the nasal capsules, shapes of the preorbital process and subetmoid fossa. According to Multiplex PCR-technique and to compare its genetic characteristics with the other species of the Carcharhinus genus that are recorded in the (SPSPA) and have close morphometric characteristics (eg C. falciformis, C. galapagensis e C obscurus). The results, based on 64 samples, showed that almost all samples were silky sharks. The tagged sharks showed a preference for warm waters of the mixed layer, where they remained most of the time, during the day. The preferred temperature range of the tagged animal was between 26-28°C, with a preferred depth between 1-10m. Exhibited an elevated residency to the SPSPA, so the present results clearly show the importance of the management measure for the conservation of silky sharks (ICCAT - Interministerial Normative Instruction nº 8 - 06/11/2014), particularly in the vicinity of oceanic islands, due to the strong association these sharks show to these structures. / O tubarão lombo-preto, Carcharhinus falciformis, é uma espécie comum na zona pelágica, com distribuição em águas tropicais e equatoriais de todos os oceanos do mundo. O presente trabalho teve por objetivo estudar a ecologia do tubarão lombo-preto, incluindo estudar as características morfológicas, a identificação molecular e o deslocamento, via marcações eletrônicas, do tubarão lombo-preto no Oceano Atlântico Sudoeste e Equatorial, em particular com relação à sua distribuição no Arquipélago São Pedro e São Paulo (ASPSP), com o objetivo de esclarecer o seu padrão de movimentação diária e sazonal, além da estrutura local de sua população. As características morfológicas/ anatômicas que definem essa espécie foram também analisadas de forma comparativa com as outras espécies do gênero Carcharhinus que também ocorrem na área de estudo (ASPSP). Todas as marcações dos tubarões e coleta de material biológico foram realizadas no Oceano Atlântico Sudoeste e equatorial, nas imediações do ASPSP, na área localizada entre as latitudes 00°55'3,72"N e longitudes 029°20'11,22"W. Tubarões lombo-preto foram marcados com 3 (três) modelos distintos de transmissores via satélite, totalizando 10 (dez) indíviduos: 5 MiniPAT (Pop-up Archival Tag), 3 PSAT (Pop-up Satellite Archival Transmitting Tag), e 2 SPOT (Smart Position or Temperature Transmitting Tag), no período de 2010 a 2014, nas imediações do ASPSP. O condrocranio de Carcharhinus (incluindo Nasolamia), apesar de ser conservador, mostrou diferenças que podem ser taxonomicamente significativas. Os componentes cranianos que apresentaram diferenças consistentes são: a forma do nó rostral e a margem posterior da fontanele anterior, dimensão rostral, presença ou ausência de fenestra rostral, entalhe epifisário, forame epifisário e aba nasal; direção das cápsulas nasais, formas do processo pré-orbital e fossa subetóide. De acordo com a técnica de Multiplex PCR e a comparação das características genéticas com outras espécies do gênero Carcharhinus que são registradas no ASPSP e apresentam características morfométricas próximas (por exemplo, C. falciformis, C. galapagensis e C Obscurus). Os resultados, baseados em 64 amostras, mostraram que quase todas as amostras eram tubarões lomo-preto. Os tubarões marcados mostraram preferência pelas águas quentes da camada mistura em que permaneceram a maior parte do tempo, durante o dia. A faixa de temperatura preferencial se situou entre 26-28°C, com uma profundidade preferencial entre 1-10m. Apresentaram uma elevada residência para o ASPSP, assim os presentes resultados mostram claramente a importância da medida de ordenamento para a conservação de tubarões lombo-preto (ICCAT - Instrução Normativa Interministerial nº 8 – 06/11/2014), particularmente na proximidade de ilhas oceânicas, devido à forte associação desses tubarões com essas estruturas.

Dez novilhos Nelores, com média de 36 meses, foram abatidos no Abatedouro-Escola da Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos da PCAPS-USP e lados alternados de suas carcaças foram resfriados pelo sistema tradicional, tendão de Aquiles do traseiro especial (TA), ou na forma horizontal (HO). As carcaças foram resfriadas por 48 horas, entre 0-2ºC. Foi avaliada a área de olho de lombo (AOL) e espessura de gordura subcutânea (EGS). Em seguida, foram retiradas amostras dos músculos Longissimus dorsi (LD), Quadríceps femoris (QF), Supraspinatus (SU), Psoas major (PM) e Semitendinosus (ST), embaladas a vácuo, maturadas por 5 dias em câmara de resfriamento e congeladas para posterior análises. Não houve diferença entre a EGS e a AOL para o LD dos tratamentos TA e HO. As amostras foram descongeladas em câmara fria vinte e quatro horas antes das análises e a seguir a maciez foi avaliada pelo método Warner Bratzler Shear Force. Não houve diferença na maciez dos músculos SU, PM e ST, independente do tratamento. Porém, a força de cisalhamento do QF (p=0,0291) foi menor para o HO (5,13 kg) do que para o TA (6,24 kg). O mesmo foi observado para o músculo LD (p=0,0068), com valores de força de cisalhamento de 6,38 kg para HO e 7,73 kg para TA. O LD e QF de carcaças mantidas na posição horizontal foram mais macios. Outras pesquisas que avaliem o índice de fragmentação miofibrilar e o comprimento do sarcômero devem ser realizadas. / Ten Nellore steer carcasses, with average age of 36 months were slaughtered at the meats lab of FZEA – USP and alternate right or left sides were placed in the cooler hung either by the Achilles tendon (TA) or horizontally placed over pallets, outside facing up (HO). Carcass were chilled for 48 hours at 0 – 2ºC. After the chilling period, loin eye area (LEA) and fat thickness (FT) were measured. One inch thick samples from each of the following muscles were removed, loin, tenderloin, eye round, knuckle and chuck tender and after 5 days in the cooler were frozen for future analysis. There was not a statistical difference for LEA and FT between treatments. After thawing the samples were analyzed for shear force through the Warner Bratzler device and there was not statistical difference for the tenderloin, eye round and chuck tender muscles between treatments. The shear force of the knuckle (5.13 Kg) was lower (p=0.029) for the HO treatment than for the TA (6,24 Kg). The loin also had a shear force of 6,4 Kg statistically lower (p=0.007) for the HO treatment when compared to 7.7 Kg for the TA treatment. The loin and knuckle of the carcasses cooled horizontally were more tender. Further studies evaluating MFI and sarcomere length must be done.

Submitted by Cibele Nogueira (cibelenogueira@ufgd.edu.br) on 2016-03-15T19:01:38Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) INGRIDFUZIKAWA.pdf: 456499 bytes, checksum: a70afbc10f813fb2edfa455dd99ebc9c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-15T19:01:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) INGRIDFUZIKAWA.pdf: 456499 bytes, checksum: a70afbc10f813fb2edfa455dd99ebc9c (MD5) Previous issue date: 2015-05-20 / Objective was to evaluate the performance and carcass characteristics of lambs "Pantaneiro" feedlot diet with 80% concentrate and 20% roughage and slaughtered at different slaughter weight (15, 20, 25, 30 and 35 kg). They were used 45 lambs "Pantaneiro", male, uncastrated, distributed in a randomized design with five treatments and nine repetitions. . When they reach the weight established by the treatments, the animals were slaughtered and the carcasses were cooled for 24 hours for further evaluation and division into cuts. The left half carcass was divided into seven commercial courts - neck, shoulder, rib fixed, floating rib, loin, leg and down. The shoulder cuts and leg were dissected to estimate the tissue composition. The data were submitted to regression analysis. Was no effect of body weight on carcass characteristics evaluated. In the performance there was a decrease in the efficiency ratios. In housing increased by perirenal fat (R2 = 0.76) and non carcass components (R2 = 0.95) and tissue composition observed lot of fat in the palette (R2 = 0.68) and ham (R2 = 0.63 It is concluded that body weight at slaughter affected the performance, carcass characteristics and body and tissue composition in lambs "Pantaneiro". / Objetivou-se avaliar o desempenho e as características das carcaças de cordeiros “Pantaneiro” terminados em confinamento com dieta de 80% de concentrado e 20% de volumoso e abatidos em diferentes pesos corporais (15, 20, 25, 30 e 35 kg). Foram utilizados 45 cordeiros “Pantaneiro”, machos, não castrados, distribuídos em um delineamento inteiramente casualizado com cinco tratamentos e nove repetições. Ao atingirem o peso estabelecido pelos tratamentos, os animais foram abatidos e as carcaças foram resfriadas por 24 horas para posterior avaliação e divisão em cortes. A meia-carcaça esquerda foi dividida em sete cortes comerciais – pescoço, paleta, costela fixa, costela flutuante, lombo, baixo e pernil. Os cortes paleta e pernil foram dissecados para estimar a composição tecidual. Os dados obtidos foram submetidos à análise de regressão. Houve efeito do peso corporal ao abate sobre as características avaliadas. No desempenho ocorreu diminuição nos índices de eficiência. Na carcaça houve aumento de gordura perirrenal (R2=0,76) e componentes não carcaça (R2=0,95) e na composição tecidual observou grande quantidade de gordura na paleta (R2=0,68) e pernil (R2=0,63). Conclui-se que o peso corporal ao abate afetou o desempenho, as características da carcaça e sua composição corporal e tecidual em cordeiros “Pantaneiro”.

O nome síndrome da cauda eqüina define as manifestações clínicas oriundas da disfunção sensorial e/ou motora causada pela lesão das raízes nervosas que formam a porção terminal da medula espinhal. É uma condição neurológica resultante da compressão, destruição ou deslocamento dos trajetos nervosos que constituem a cauda eqüina. Acomete freqüentemente os cães de raças de grande porte, como Labrador, Golden Retriever, Bernese Mountain dog, Rottweiler e Pastor Alemão, não possuindo predileção quanto ao sexo e idade. As causas são inúmeras, podendo estar relacionada a fatores adquiridos, mais comuns nas raças de grande porte; ou congênitos, os quais são mais freqüentes nas raças de pequeno porte. Em ambos os casos, a estenose lombo-sacra é a causa mais comum, correlacionando-se às alterações das partes moles e/ou tecidos ósseos no segmento lombo-sacro. Este estudo teve por objetivo realizar uma análise crítica da contribuição dos métodos de imagem, quais sejam exames: radiográfico simples e tomográfico, para avaliação do segmento lombo-sacro em 30 cães da raça Pastor Alemão. Sendo treze animais pertencentes ao grupo (A) sem manifestações clínicas e alterações radiográficas no segmento lombo-sacra; doze animais pertencentes ao grupo (B) sem manifestações clínicas com alterações radiográficas no segmento lombo-sacro e cinco animais pertencentes ao grupo (C) com manifestações clínicas e portadores de alterações radiográficas no segmento lombo-sacro. Todos os exames foram submetidos a um protocolo de avaliação tendo como principais mensurações radiográficas: ângulo lombo-sacro, ângulo formado entre as epífises de L7-S1, ângulo dos processos articulares de L7-S1, listese ventral de S1 em relação à L7, grau de intersecção do vértice dos ângulos mensurados e grau de movimento na região lombo-sacra. O deslocamento ventral de S1 em relação à L7 esteve presente na maioria dos animais nos três diferentes grupos não só na dorso-extensão, levantando a hipótese de no padrão racial estudado, certo grau de listese possa fazer parte do esperado para o segmento lombo-sacro. Foi constatado diferença estatística entre os animais, nos seguintes grupos e variáveis: ângulo formado entre as epífises de L7-S1 (grupo A e B), grau de intersecção do ângulo entre as epífises de L7-S1 (grupo A e B), ângulo lombo-sacro (grupo A e B) e grau de movimento no segmento lombo-sacro (grupo A e B, A e C). Desta maneira, o grau de movimento demonstrou-se como elemento relevante no critério de avaliação do segmento lombo-sacro. O exame tomográfico mostrou-se superior na avaliação do canal vertebral, foramens intervertebrais e processos articulares, os quais puderam ser avaliados com maior riqueza de detalhes. Concluiu-se com esta pesquisa que as duas modalidades de imagem se complementam, constituindo ferramentas importantes na avaliação clínico-cirúrgica do segmento lombo-sacro, auxiliando no diagnóstico, estabelecimento do prognóstico e da terapêutica a ser adotada. / The name cauda equina syndrome defines the clinical signs that come from the sensory and or motor neural dysfunction caused by the terminal part of the spinal cord and adjacent nerve roots damages. Its one neurological condition resulting from the compression, destruction and displacement of the nervous routes which form the cauda equina. This syndrome normally happens to large breed dogs like the Labrador retriever, Golden Retriever, Bernese mountain dog, Rottweiler and the German shepherd dogs, without preference of gender or age. There are countless causes, which can be related to acquired factors, more common in the large breed dogs; or congenital, which are more frequent in the small breed dogs. In both cases, the stenosis lumbosacral is the most frequent, correlating to the alterations of the soft tissues and/ or the bone tissues in the lumbosacral segment. The aim of this sudy was to analise critically the real contribution of diagnostic imaging (X-Ray and CT), of the lumbosacral region of 30 German shepherd dogs. There were thirteen animals that belonged to the group (A) without clinical signs and X-Ray alterations in the lumbosacral segment; twelve animals belonged to the group (B) without clinical signs, with X-Ray alterations in the lumbosacral segment; five animals belonged to the group (C) with clinical signs and they had X-Ray alterations in the lumbosacral segment. All exams were submitted to one evaluation report which had as main radiographic measurements: lumbosacral angle, endplate angle L7 S1, articular process angle L7 S1 , ventral displacement of S1 to L7, the point of intersection of the measured angles and the mobility of the lumbosacral junction. The ventral displacement of S1 related to L7 was present in most of the animals in the three different groups not only in the extension position, raising the hypothesis about the racial standard established, a certain degree of ventral displacement of the sacrum might be part of the expected for the lumbosacral segment. It was noticed a statistical difference among the animals in the following groups and variables: endplate angle L7 S1 (groups A and B), the point of intersection of the endplate angle L7 S1 (groups A and B), lumbosacral angle (groups A and B) and the mobility of the lumbosacral junction (groups A and B, A and C). This way, the mobility showed itself as an relevant element in the criterion of evaluation of the lumbosacral segment. The CT examination showed being superior in the evaluation of the vertebral canal, intervertebral foramen and the articular processes, which could be evaluated with a greater number of details. It was concluded with this research that the two modalities of images complement each other, becoming important tools in the clinical- surgical evaluation in the lumbosacral segment, helping in the diagnosis, prognostic and therapeutic to be adopted.

Dez novilhos Nelores, com média de 36 meses, foram abatidos no Abatedouro-Escola da Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos da PCAPS-USP e lados alternados de suas carcaças foram resfriados pelo sistema tradicional, tendão de Aquiles do traseiro especial (TA), ou na forma horizontal (HO). As carcaças foram resfriadas por 48 horas, entre 0-2ºC. Foi avaliada a área de olho de lombo (AOL) e espessura de gordura subcutânea (EGS). Em seguida, foram retiradas amostras dos músculos Longissimus dorsi (LD), Quadríceps femoris (QF), Supraspinatus (SU), Psoas major (PM) e Semitendinosus (ST), embaladas a vácuo, maturadas por 5 dias em câmara de resfriamento e congeladas para posterior análises. Não houve diferença entre a EGS e a AOL para o LD dos tratamentos TA e HO. As amostras foram descongeladas em câmara fria vinte e quatro horas antes das análises e a seguir a maciez foi avaliada pelo método Warner Bratzler Shear Force. Não houve diferença na maciez dos músculos SU, PM e ST, independente do tratamento. Porém, a força de cisalhamento do QF (p=0,0291) foi menor para o HO (5,13 kg) do que para o TA (6,24 kg). O mesmo foi observado para o músculo LD (p=0,0068), com valores de força de cisalhamento de 6,38 kg para HO e 7,73 kg para TA. O LD e QF de carcaças mantidas na posição horizontal foram mais macios. Outras pesquisas que avaliem o índice de fragmentação miofibrilar e o comprimento do sarcômero devem ser realizadas. / Ten Nellore steer carcasses, with average age of 36 months were slaughtered at the meats lab of FZEA – USP and alternate right or left sides were placed in the cooler hung either by the Achilles tendon (TA) or horizontally placed over pallets, outside facing up (HO). Carcass were chilled for 48 hours at 0 – 2ºC. After the chilling period, loin eye area (LEA) and fat thickness (FT) were measured. One inch thick samples from each of the following muscles were removed, loin, tenderloin, eye round, knuckle and chuck tender and after 5 days in the cooler were frozen for future analysis. There was not a statistical difference for LEA and FT between treatments. After thawing the samples were analyzed for shear force through the Warner Bratzler device and there was not statistical difference for the tenderloin, eye round and chuck tender muscles between treatments. The shear force of the knuckle (5.13 Kg) was lower (p=0.029) for the HO treatment than for the TA (6,24 Kg). The loin also had a shear force of 6,4 Kg statistically lower (p=0.007) for the HO treatment when compared to 7.7 Kg for the TA treatment. The loin and knuckle of the carcasses cooled horizontally were more tender. Further studies evaluating MFI and sarcomere length must be done.

O objetivo deste trabalho foi estudar o transcriptoma do músculo Longissimus dorsi (LD) de bovinos da raça Nelore associado as características de área de olho de lombo (AOL) e espessura de gordura subcutânea (EGS), a fim de encontrar genes diferencialmente expressos (GDE), conjuntos de genes co-expressos, vias metabólicas e processos biológicos que regulam essas características. Foram utilizados dados de 385 bovinos Nelore castrados para obtenção das medidas fenotípicas de AOL e EGS, mensuradas entre a 12ª e 13ª costelas do músculo LD. Estes animais foram separados em dois grupos extremos, alto e baixo, contendo seis animais cada, baseados nos valores genômicos estimados (GEBV), para AOL e para EGS. Estes conjuntos de 12 animais foram submetidos à análise de expressão diferencial afim de encontrar GDE entre os grupos. Em seguida, a análise de enriquecimento funcional a partir da lista de GDE foi executada por meio do DAVID (Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery) e da combinação do BiNGO (Biological Networks Gene Ontology) e REVIGO (Reduce + Visualise Gene Ontology). Para AOL, foram identificados 101 GDE entre os grupos de alto e baixo GEBV. Desses, 72 genes apresentaram-se down-regulated e 29 up-regulated no grupo baixo. Para EGS, foram encontrados 18 GDE, dos quais treze apresentaram-se up-regulated e cinco down-regulated no grupo baixo. Dentre as vias metabólicas e processos biológicos encontrados para essas características, destacam-se a via de sinalização MAPK (bta04010) e a via da endocitose (bta04144) - AOL - e, os processos de biossíntese de andrógenos (GO:0006702) e via de sinalização canônica Wnt (GO:0060070) - EGS. Para encontrar conjuntos de genes co-expressos associados aos tratamentos (AOL e EGS), foi utilizado o pacote WGCNA (Weighted Correlation Network Analysis) do R, com dados de contagens de transcritos de 43 animais. Foram identificados 37 módulos, dentre eles, os módulos Azul, Verde-escuro e Salmon apresentaram correlação significativa de 0,3 com a EGS (P<0,10). Os genes destes módulos foram selecionados para análise de enriquecimento funcional quando seus valores de filiação ao módulo foram superiores a 0,7. O módulo azul apresentou o maior número de genes co-expressos, com 953 genes submetidos à análise de enriquecimento funcional. Foram encontradas seis vias metabólicas e 101 termos do Gene Ontology para este módulo, conforme análise do DAVID, além de 108 processos biológicos identificados pelo BiNGO/REVIGO. Os resultados do presente estudo enfatizam a complexidade da regulação gênica do músculo LD de bovinos Nelore associado às características de AOL e EGS. Estes resultados nos auxiliam a compreender melhor os diversos processos moleculares envolvidos na deposição muscular e de gordura de cobertura, características de carcaça economicamente importantes para a produção da carne bovina. / The aim of this work was to study the Longissimus dorsi (LD) muscle transcriptome of Nellore cattle associated with ribeye area (REA) and backfat thickness (BFT) to find differentially expressed genes (DEG), coexpressed gene modules, metabolic pathways, and biological processes that regulate these traits. Data from 385 Nellore steers were used to obtain the phenotypic measures of REA and BFT, measured between the 12th and 13th ribs of the LD muscle. These animals were divided into two extreme groups, high and low, with six animals each, based on the estimated genomic breeding values (GEBV) for REA and for BFT. These sets of 12 animals were submitted to differentially expressed gene analysis to find DEG between the groups. Then, the functional enrichment analysis from the list of DEG was performed by DAVID (Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery) and the combination of BiNGO (Biological Networks Gene Ontology) and REVIGO (Reduce + Visualize Gene Ontology). For REA, 101 DEG were identified between the high and low GEBV groups. Of those, 72 genes were down-regulated and 29 up-regulated in the low group. For BFT, 18 DEG were found, of which thirteen were up-regulated and five were down-regulated in the low group. Among the metabolic pathways and biological processes found for these traits, the MAPK signaling pathway (bta04010) and the endocytosis pathway (bta04144) - for REA -, the androgen biosynthetic processes (GO: 0006702) and the canonical Wnt signaling pathway (GO: 0060070) - for EGS - can be highlighted. To find coexpressed gene modules associated with the traits (REA and BFT), we used the WGCNA (Weighted Correlation Network Analysis) package from R, with data from transcript counts of 43 animals. A total of 37 modules were founded. Among them, the Blue, Dark Green and Salmon modules had a significant correlation of 0.3 with BFT (P<0.10). The genes of these modules were selected for functional enrichment analysis when their module membership values were higher than 0.7. The blue module had the highest number of co-expressed genes, with 953 genes submitted to functional enrichment analysis. Six metabolic pathways and 101 Gene Oontology terms were founded for this module by DAVID analysis, in addition, 108 biological processes were identified by BiNGO/REVIGO. The results of the present study emphasize the complexity of gene regulation in the LD muscle of Nellore cattle associated with REA and BFT. These results can help us to better understand the different molecular processes involved in muscle and fat deposition, which are economically important carcass traits for beef production.

Este trabalho foi desenvolvido visando a estimativa de parâmetros genéticos para características de carcaça obtidas por ultrassonografia em bovinos da raça Nelore. Foram analisadas as informações de 13.256 animais, machos e fêmeas, com idade entre 10 e 25 meses, provenientes de cinco propriedades distintas, pertencentes ao programa de melhoramento genético da Associação Nacional de Criadores e Produtores (ANCP). As características de carcaça avaliadas por ultrassonografia foram área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS), espessura de gordura na garupa (EGG), percentagem de gordura intramuscular (PGIM), além do peso na data da avaliação e das estimativas do peso e da percentagem da porção comestível (PESPC e PERPC, respectivamente). Foram estimadas a herdabilidade, correlações genéticas e fenotípicas, além da tendência genética observada no período avaliado. As herdabilidades observadas foram de moderada magnitude (0,18 a 0,37), suportando a recomendação de seleção para as características de carcaça. As correlações da gordura intramuscular com as demais variáveis foram, em sua maioria, próximas de zero, com exceção para as correlações com a área de olho de lombo e com o peso da porção comestível, cujos valores negativos devem ser considerados nos critérios de seleção. O efeito da idade sob as características permite afirmar que as avaliações por ultrassonografia podem ser obtidas em idade precoce. Os resultados indicaram ainda que a inclusão das DEPs de carcaça tem proporcionado melhorias na área de olho de lombo e nas espessuras de gordura, no entanto a percentagem da gordura intramuscular e o rendimento dos cortes cárneos não apresentaram progresso uniforme na população e período avaliados. / This work was developed aiming to estimate genetic parameters for carcass traits obtained by ultrasound in Nelore cattle. The information of 13,256 animals were analyzed, male and female, with ages between 10 and 25 months, from five distinct properties, belonging to the genetic improvement program of the Associação Nacional de Criadores e Produtores (ANCP). The carcass characteristics evaluated by ultrasonography were: rib eye area (REA), subcutaneous back fat thickness (BF), rump fat thickness (RF), percentage of intramuscular fat (IMF), also the weight on the valuation date, estimates of weight and percentage of retail product. Heritability, genetic and phenotypic correlations were estimated, in addition to the genetic tendency observed during the study period. Observed heritability had moderate magnitude (0,18 to 0,37), corroborating the selection recommendation for carcass traits. The percentage of intramuscular fat correlations with other features were mostly close to zero, except for correlations with the loin eye area and the weight of retail product, whose negative values should be considered in the selection criteria. The effect of age on the observed features suggest that the ultrasound evaluation can be held at an early age. The results also indicated that the inclusion of expected progeny differences (EPDs) has provided improvements in REA and BF, however the intramuscular fat and yield of meat cuts showed no uniform progress in the population and the evaluated period.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-14T16:23:03Z No. of bitstreams: 1 Jones Santander Neto.pdf: 1353954 bytes, checksum: 3ab25dad19a919fb57b060eb783f2097 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-14T16:23:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jones Santander Neto.pdf: 1353954 bytes, checksum: 3ab25dad19a919fb57b060eb783f2097 (MD5) Previous issue date: 2011-07-08 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / From October 2007 to March 2011, 105 silky sharks, Carcharhinus falciformis (Muller e Henle, 1839), (68–274.2 cm in total length, TL) were collected from industrial fleet (longline) carried out on Southwestern Tropical Atlantic (010º W/ 035º W, 05º N/ 30º S). Vertebral sections from 34 males (105–268.2 cm TL), 35 females (85–274.2 cm TL), and 36 individuals of unknown sex (68.8-256.1 cm TL) were analyzed. One 68.8 cm TL individual did not have birth ring. The index of average percentage of error (IAPE) estimated from two readings ranged from 0 to 7.69 (mean=3.88%) in the vertebrae of specimens with 1 and 14 band pairs, respectively. There were no differences (p 0.05) in the monthly marginal increment (MIR) analysis between months then we considered an annual ring deposition as other species of the Carcharhinidae family, including Carcharhinus falciformis. Ages range from 0 to 20 years. There were no differences (p 0.05) in growth between sexes. Models derived from von Bertalanffy, particularly the VBGM two phase, best represented growth for the species, which was evidenced by the lowest Akaike information criterion value. Growth parameters estimated for both sexes were L = 303 cm, k = 0.086, t0= -4.71, h=0.17, and th=11.62 with the VBGM two phase model, and L = 292 cm, k = 0.089, and t0= -4.87 with the VBGM. The VBGM was used to other analysis. Males and females mature at 10.8 and 12.5 years of age, repectively, and the age that attain 95% of the L is 30.3 years. / Tubarões lombo preto, Carcharhinus falciformis (Muller e Henle, 1839) foram capturados entre outubro de 2007 a março de 2011 pela frota industrial atuando com espinhel pelágico no Atlântico sudoeste Tropical (010º W/ 035º W, 05º N/ 30º S). Foram coletadas vértebras de 105 exemplares, sendo 34 machos (105–268,2 cm CT), 35 fêmeas (85–274,2 cm CT) e 36 indivíduos de sexo não identificado (68,8-256,1 cm CT). Um indivíduo em vida livre medindo 68,8 cm CT não apresentou marca de nascimento. O índice de porcentagem de erro médio (IAPE) estimado entre dois leitores variou de 0% a 7,69% (média= 3,88%) nas vértebras de espécimens com 1 e 14 pares de bandas, respectivamente. Ao analisar o incremento marginal relativo (IMR) não se verificou diferenças (p 0,05) entre os meses, logo assumiu-se a deposição de um anel anual como utilizado para as demais espécies da família Carcharhinidae, inclusive C. falciformis. Idades variaram de 0 a 20 anos. Não houve diferenças (p 0,05) no crescimento entre os sexos. Modelos derivados de von Bertalanffy, particularmente VBGM duas fases, melhor representou o crescimento para a espécie, que foi evidenciado pelo menor valor do critério de informação de Akaike. Parâmetros de crescimento estimado foram L = 303 cm, k = 0,086, t0= 4,71, h=0,17 e th=11,62 com o VBGM duas fases e L = 292 cm, k = 0,089, and t0= -4,87 com o VBGM. O VBGM foi utilizado para as demais análises. Machos e fêmeas maturam com 10,8 e 12,5 anos, respectivamente e a idade com que atingem 95% do L é 30,3 anos.

Le complexe lombo-pelvi-fémoral est une zone charnière du corps humain. Son rôle d'équilibration a étédémontré à de nombreuses reprises alors que sa fonction motrice, lors de mouvements explosifs requérant uneextension totale de la chaine articulaire, a été peu étudiée. Ainsi, l'objectif de ce travail a été d'évaluer le rôle moteurdu complexe lombo-pelvi-fémoral lors d'un mouvement de squat jump. A cet effet, une approche expérimentale(cinématique, dynamique et électromyographique) couplée à un modèle de simulation du système musculo-squelettiqueont été appliqués à l'analyse du squat jump dans le plan sagittal. Les résultats montrent, dans un premier temps, que lesétudes ne prenant pas en compte le complexe lombo-pelvi-fémoral conduisent à des erreurs de surestimation du travailmécanique attribué à l'articulation de la hanche lors de squat jumps avec ou sans balancé de bras. Dans un secondtemps, il apparaît que l'extension du rachis lombaire permise par l'erector spinae participe à l'atteinte d'une hauteurmaximale de saut. Ceci confirme l'hypothèse du rôle moteur du complexe lombo-pelvi-fémoral, soulignant égalementla contribution effectrice du muscle erector spinae, qui est accrue avec l'augmentation de sa force maximale et lorsd'une flexion initiale du tronc importante. En conclusion, il semble pertinent d'intégrer le complexe lombo-pelvifémoraldans l'analyse du squat jump en vue d'ouvrir de nouvelles perspectives d'entrainement visant à l'améliorationde la détente verticale.