Este trabalho envolveu reações de biocatálise com objetivo de obter compostos enantiomericamente puros. Assim foram realizadas reações de redução de derivados de acetofenonas, resolução enzimática de alcoóis e azido-alcoóis e imobilização de células fúngicas em suportes sólidos para aplicação em biocatálise. Foi realizada a redução enantiosseletiva da 1-(4-metoxifenil)etanona (1) através da triagem com nove fungos marinhos (Aspergillus sydowii CBMAI 935, A. sydowii CBMAI 934, A. sclerotiorum CBMAI 849, Bionectria sp. CBMAI 936, Beauveria felina CBMAI 738, Cladosporium cladosporioides CBMAI 857, Mucor racemosus CBMAI 847, Penicillium citrinum CBMAI 1186, P. miczynskii CBMAI 930). Os fungos A. sydowii CBMAI 935 e Bionectria sp. CBMAI 936 catalisaram a biorredução estereosseletiva da 1-(4-metoxifenil)etanona (1) para o correspondente (R)-1-(4-metoxifenil)etanol (1a) com excelentes excessos enantioméricos (>99%). Os fungos B. felina CBMAI 738 e P. citrinum CBMAI 1186 catalisaram a biorredução estereosseletiva da cetona 1 para o correspondente S-álcool 1a com 69% de excesso enantiomérico. Os fungos marinhos (A. sclerotiorum CBMAI 849, A. sydowii CBMAI 934, B. felina CBMAI 738, M. racemosus CBMAI 847, P. citrinum CBMAI 1186, P. miczynskii CBMAI 931, P. miczynskii CBMAI 830, P. oxalicum CBMAI 1185, Trichoderma sp. CBMAI 932) foram utilizados na bioconversão assimétrica das iodoacetofenonas 2-4 para os correspondentes iodofeniletanois 2a-4a. Todos os fungos marinhos produziram exclusivamente (S)-o-iodofeniletanol (2a) e (S)-m-iodofeniletanol (3a) com diferentes valores de excessos enantioméricos (62-99%). Os fungos B. felina CBMAI 738, P. miczynskii CBMAI 830, P. oxalicum CBMAI 1185 e Trichoderma sp. CBMAI 932 produziram o correspondente (R)-p-iodofeniletanol (4a) com excessos enantioméricos de 32-99%. A bioconversão da p-iodoacetofenona (4) com células microbianas do P. oxalicum CBMAI 1185 mostrou uma competição entre a reação de redução e oxidação. Também foram realizadas as reduções das ceto-azidas 13-16 com fungos marinhos fornecendo bons resultados de seletividade (28-99% ee). As células microbianas dos fungos A. sclerotiorum CBMAI 849 e P. citrinum CBMAI 1186 foram imobilizadas em suportes de sílica gel, xerogel de sílica e quitosana. As células do P. citrinum CBMAI 1186 imobilizadas em quitosana catalisaram a redução da 1-(4-metoxifenil)-etanona (1) para o correspondente (S)-1-(4-metoxifenil)-etanol (1a) com excelente excesso enantiomérico (>99%). O fungo P. citrinum CBMAI 1186 imobilizado em quitosana também catalisou a biorredução de 2-cloro-1-feniletanona (7) para o 2-cloro-1-feniletanol (7a), mas neste caso, sem seletividade. Neste trabalho também foram realizadas as resoluções quimio-enzimáticas dos (±)-o-iodofeniletanol (2a), (±)-m-iodofeniletanol (3a), (±)-p-iodofeniletanol (4a), (±)-2-azido-1-feniletanol (13a), (±)-2-azido-1-(4-metoxifenil)etanol (14a), (±)-2-azido-1-(4-bromofenil)etanol (15a), (±)-2-azido-1-(4-nitrofenil)etanol (16a) e (±)-2-azido-1-(4-clorofenil)etanol (17a) com a lipase CALB. Os (S)-m-iodofeniletanol (3a) e (S)-p-iodofeniletanol (4a) foram obtidos com excelentes excessos enantioméricos (>99%) e posteriormente foram utilizados na síntese de compostos bifenílcos quirais por reação de acoplamento Suzuki fornecendo bons rendimentos (63-65%). A resolução quimio-enzimática dos azido-alcoóis 13a-17a foram realizadas com lipase Candida atarctica e os (R)-2-azido-1-feniletanol (13a), (R)-2-azido-1-(4-metoxifenil)etanol (14a), (R)-2-azido-1-(4-bromofenil)etanol (15a), (R)-2-azido-1-(4-nitrofenil)etanol (16a) obtidos foram utilizados na síntese dos triazóis quirais (R)-2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-il)-1-feniletanol (13), (R)-2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-il)-1-(4-metoxifenil)etanol (14), (R)-2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-il)-1-(4-bromofenil)etanol (15) e (R)-2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-il)-1-(4-nitrofenil)etanol (16) e (R)-2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-il)-1-(4-clorofenil)etanol (17), obtidos com ótimos rendimentos (79-85%). / This work involved reactions of biocatalysis in order to obtain enantiomerically pure compounds. Thus reactions were performed reduction of acetophenones derivatives, enzymatic resolution of azido-alcohols, secondary alcohols and immobilization of fungal cells on solid supports for use in biocatalysis. We performed the enantioselective reduction of 1-(4-methoxyphenyl)ethanone (1) by screening with nine marine fungi (Aspergillus sydowii CBMAI 935, A. sydowii CBMAI 934, A. sclerotiorum CBMAI 849, Bionectria sp. CBMAI 936, Beauveria felina CBMAI 738, Cladosporium cladosporioides CBMAI 857, Mucor racemosus CBMAI 847, Penicillium citrinum CBMAI 1186, P. miczynskii CBMAI 930). The fungi A. sydowii CBMAI 935 and Bionectria sp. 936 CBMAI catalyzed stereoselective bioreduction of 1-(4-methoxyphenyl)ethanone (1) to the corresponding (R)-1-(4-methoxyphenyl)ethanol (1a) with excellent enantiomeric excess (>99%). Fungi B. felina CBMAI 738 and P. citrinum 1186 CBMAI catalyzed stereoselective bioreduction of ketone 1 to the corresponding S-alcohol 1a with 69% enantiomeric excess. The marine fungi (A. sclerotiorum CBMAI 849, A. sydowii CBMAI 934, B. felina CBMAI 738, M. racemosus CBMAI 847, P. citrinum CBMAI 1186, P. miczynskii CBMAI 931, P. miczynskii CBMAI 830, P. oxalicum CBMAI 1185, Trichoderma sp. CBMAI 932) were used in the bioconversion of asymmetric iodoacetophenones 2-4 to the corresponding iodophenylethanols 2a-4a. All marine fungi produced exclusively (S)-o-iodophenylethanol (2a) and (S)-m-iodophenyletanol (3a) with different values of enantiomeric excess (62-99%). Fungi B. felina CBMAI 738, P. miczynskii CBMAI 830, P. oxalicum CBMAI 1185 and Trichoderma sp. CBMAI 932 produced the corresponding (R)-p-iodophenylethanol (4a) with enantiomeric excess of 32-99%. The bioconversion of p-iodoacetophenone (4) with microbial cells of P. oxalicum CBMAI 1185 showed a competition between oxidation and reduction reaction. Were also performed reductions of azido-ketones 13-16 with marine fungi providing good results of selectivity (28-99% ee). Microbial cells of fungi A. sclerotiorum CBMAI 849 and P. citrinum CBMAI 1186 were immobilized on supports of silica gel, silica xerogel and chitosan. Whole cells of P. citrinum 1186 CBMAI immobilized on chitosan catalyzed the reduction of 1-(4-methoxyphenyl)ethanone (1) to the corresponding (S)-1-(4-methoxyphenyl)ethanol (1a) with excellent enantiomeric excess (>99%). The fungus P. citrinum 1186 CBMAI immobilized on chitosan also catalyzed the bioreduction of 2-chloro-1-phenylethanone (7) to 2-chloro-1-phenylethanol (7a), but in this case without selectivity. In this work were also performed chemo-enzymatic resolutions of (±)-o-iodophenylethanol (2a), (±)-m-iodophenylethanol (3a), (±)-p-iodophenylethanol (4a), (±)-2-azido-1-phenylethanol (13a), (±)-2-azido-1-(4-methoxyphenyl)ethanol (14a), (±)-2-azido-1-(4-bromophenyl)ethanol (15a), (±)-2-azido-1-(4-nitrophenyl)ethanol (16a) and (±)-2-azido-1-(4-chlorophenyl)ethanol (17a) with the lipase Candida atarctica. The (S)-m-iodophenylethanol (3a) and (S)-p-iodophenylethanol (4a) were obtained with excellent enantiomeric excess (>99%) and were subsequently used in the synthesis of chiral biphenyl compounds by the Suzuki reaction with good yields (63-65%). Chemoenzymatic resolution of azido-alcohols 13a-17a were carried out using lipase CALB and (R)-2-azido-1-phenylethanol (13a), (R)-2-azido-1-(4-methoxyphenyl)ethanol (14a), (R)-2-azido-1-(4-bromophenyl)ethanol (15a), (R)-2-azido-1-(4-nitrophenyl)ethanol (16a) obtained were used in the synthesis of chiral triazoles (R)-2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-yl)-1-phenylethanol (13), (R)-2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-yl)-1-(4-methoxyphenyl)ethanol (14) (R)-2-(1H-benzo [d][1,2,3]triazol-1-yl)-1-(4-bromophenyl)ethanol (15) and (R)-2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-yl)-1-(4-nitrophenyl)ethanol (16) and (R)-2-(1H-benzo[d] [1,2,3]triazol-1-yl)-1-(4-chlorophenyl)ethanol (17) obtained in good yields (79-85%).

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:22Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-25Bitstream added on 2014-06-13T20:48:47Z : No. of bitstreams: 1 siebert_th_me_jabo.pdf: 780967 bytes, checksum: 77d072c9560fa467e35c57e133f297b6 (MD5) / O Artemesia longinaris é endêmica nas águas costeiras do Atlântico Sul, e ocorre a partir da costa do Rio de Janeiro até Puerto Rawson, Argentina. Assim, considerando a exploração das espécies naturais, é necessário estudar a dinâmica reprodutiva para a renovação do estoque natural da espécie, e contribuir para a adequação do fechamento da pesca. O objetivo deste estudo foi caracterizar morfologicamente os diferentes estágios de desenvolvimento dos ovócitos, a maturação dos ovários durante todo o ano, e a avaliação do fechamento de pesca atual para a espécie na região de Macaé / RJ. Para a análise de microscopia de luz (histologia e histoquímica), seis animais de cada estágio de maturação gonadal (rudimentar - RU, em desenvolvimento - ED e desenvolvidos -D) foram coletados na região de Macaé, RJ. Os ovários foram dissecados e fixados em solução de Bouin, incluídos em historesina, corados com hematoxilina / eosina e reação ao ácido periódico de Schiff (PAS). Para a avaliação do período de pesca, usamos fêmeas com gônadas desenvolvidas (D) na primavera, verão, inverno e outono. O número de ovócitos maduros encontrados em cada espécime estudado foi contado ao longo do ano usando o software ImageJ®. Em seguida, o número médio de ovócitos maduros encontrados foi avaliado em cada estação do ano, com o programa SigmaPlot® versão 12. O ovário de A. longinaris apresenta quatro estágios de maturação: rudimentar, desenvolvimento inicial, desenvolvimento avançado e desenvolvido. As células germinativas apresentam cinco fases de desenvolvimento: ovogônias, ovócitos pré-vitelogênicos, ovócitos em vitelogênese inicial, ovócitos em vitelogênese avançado e ovócitos maduros. Novembro apresentou a maior média de ovócitos maduros nos ovários desenvolvidos. Assim a avaliação do... / Artemesia longinaris is endemic in the coastal waters of the South Atlantic, and occurs from the coast of Rio de Janeiro to Puerto Rawson, Argentina. Thus, considering the exploitation of natural species, it is necessary to study the reproductive dynamics for the renewal of the natural stock of the specie, and contribute to the adequacy of the fishing closure. The aim of this study was to characterize morphologically the different developmental stages of oocytes, ovarian maturation throughout the year, and the evaluation of current fishing closure for the species in the region of Macaé/RJ. For analysis of light microscopy (histology and histochemistry), 6 animals of each stage of gonadal maturation (rudimentary - RU, in development - ED and developed -D) were collected in the region of Macaé, RJ. The ovaries were dissected and fixed in Bouin's solution, embedded in historesin, stained with hematoxylin/eosin and reacted to Periodic acid Schiff (PAS). For the evaluation of the fishery period, we used females with developed gonads (D) in spring, winter, summer and autumn. The number of mature oocytes found in each specimen studied was counted over the year using the ImageJ software®. Then, the average number of mature oocytes found was evaluated in each season, with the program SigmaPlot® version 12. The ovary of A. longinaris presents four stages of maturation: rudimentary, initial development, advanced development and developed. The germinal cells present five development phases: oogonia, pre-vitellogenic oocytes, initial-vitellogenic oocyte, advanced vitellogenic oocyte, and mature oocyte. November had the highest average of mature oocytes in the ovaries developed. The annual reproductive cycle assessment indicated that the most appropriate period for fishing closures for this species is from November to January... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:22Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-05Bitstream added on 2014-06-13T20:09:25Z : No. of bitstreams: 1 cohen_fpa_me_jabo.pdf: 309798 bytes, checksum: 0fd5225b1c906910cfb42403e27f7e2b (MD5) / Na última década, o comércio de espécies ornamentais marinhas sofreu uma expansão significativa em todo o mundo. Porém, esta indústria ainda depende de um grande número de práticas insustentáveis e precisa mudar urgentemente suas operações para evitar um colapso. Sob este cenário, a rastreabilidade e a certificação surgem como ferramentas importantes de gestão que podem ajudar esta indústria a seguir em direção à sustentabilidade. Esta indústria se baseia no comércio de milhares de espécies de pequeno porte, que são comercializadas vivas, de forma unitária, com alto valor de mercado. Estas características, juntamente com uma cadeia de abastecimento complexa e fragmentada, tornam a rastreabilidade de espécies ornamentais marinhas uma tarefa desafiadora. Neste estudo, apresentamos os métodos comumente usados para rastrear organismos aquáticos e discutimos suas adequações para espécies ornamentais marinhas. Foram analisados os métodos: certificação e etiquetas verdes, marcadores internos (fios codificados, implantes visíveis e transponder integrado passivo), marcadores externos (recorte de nadadeira, etiquetas externas e marcações térmicas e químicas), métodos analíticos (perfil de ácidos graxos, perfil de elementos químicos e isótopos estáveis), métodos moleculares (códigos de barras genético e códigos de barras microbiológico), cultivo de espécimes híbridos e comércio de espécies novas ou raras. O uso de impressões digitais bacterianas parece ser o método mais promissor para rastrear com sucesso os ornamentais marinhos, mas é mais provável que uma combinação de dois ou mais métodos de rastreabilidade precise ser implementada para suprir as características peculiares exibidas pelo comércio vivo de espécies ornamentais marinhas / In the last decade, the trade of marine ornamental species has experienced a significant expansion worldwide; however, this industry still relies on a large number of unsustainable practices (e.g., cyanide fishing and overexploitation of target species) and needs to shift urgently its operations to avoid collapsing. Under this scenario, traceability and certification emerge as important management tools that may help this industry to shift towards sustainability. This industry relies on the trade of thousands of small sized species that are traded live on a unitary basis, with high market value. These features, along with a fragment and complex supply chain, make the traceability of marine ornamental species a challenging task. In this study we present the most commonly used methods to trace aquatic organisms and discuss their suitability to trace marine ornamental species. The following methods were analyzed: certification and eco-labeling, internal markers (coded wire tags, visible implants, and passive integrated transponder), external markers (fin clipping, external tags, and thermal and chemical branding), analytical methods (fatty acids, elemental fingerprint, and stable isotopes), molecular methods (DNA barcodes and microbiological barcodes), breeding of hybrid specimens and trading new or rare species. The use of bacterial fingerprints appears to be the most promising method to successfully trace marine ornamentals, but it is most likely that a combination of two or more traceability methods need to be implemented to cover all the unique features displayed by the live trade of marine ornamental species

Submitted by Gerson Rodrigues Raggi Pereira (geraggi@gmail.com) on 2017-03-08T21:11:23Z No. of bitstreams: 1 Dissertação.pdf: 2124960 bytes, checksum: 870e955bc4b41cfb8cf7165c2948e315 (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-03-13T20:09:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 pereira_grr_me_svic.pdf: 2124960 bytes, checksum: 870e955bc4b41cfb8cf7165c2948e315 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-13T20:09:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 pereira_grr_me_svic.pdf: 2124960 bytes, checksum: 870e955bc4b41cfb8cf7165c2948e315 (MD5) Previous issue date: 2017-01-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Organismos marinhos são importantes fontes de novos produtos naturais e compostos bioativos com funções variadas. Entre as principais fontes de novas moléculas esta o filo dos Cnidários, com uma importante contribuição no numero de compostos descritos nos últimos anos. Bunodossoma caissarum é uma espécie de anêmona endêmica do Brasil, cujo perfil químico foi analisado. Para essa análise foram realizados uma extração hidroalcoólica e o isolamento de determinadas moléculas com técnicas cromatográficas. Os compostos isolados foram aqueles que apresentaram absorbância no comprimento de onda no UV em 310 nm e foram identificados a partir de técnicas de espectrometria de massas e ressonância magnética. Entre as substâncias encontradas estão sais piridinicos, núcleos imidazóis, caissarona e a etilglicose, moléculas com importantes papeis fisiológicos. / Marine organisms are importante sources of new natural products and bioactive compounds with various functions. The phylum Cnidaria is among the main sources of new molecules, with na importante contribution to the number of compounds described in the last years. The anemone species Bunodossoma caissarum is endemic to Brazil and had it's chemical profile analyzed. For the purpose of this analysis were done a hydroalcoolic extraction and the isolation of certain molecules by chomatographic techniques. The isolated compounds were those that displayed absorbance in the 310nm wavelength of the UV spectrum and were identified on the basis of mass spectrometry and magnetic ressonance. Among the substances found are pyridinic salts, imidazole nucleus, caissarone and ethyl glucose, which are molecules with important physiological roles.

Made available in DSpace on 2015-09-25T12:22:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Ellori Laise Silva Mota.pdf: 3008500 bytes, checksum: b9be045a6472180c5df2b39ef5340e34 (MD5) Previous issue date: 2014-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Of he more than 100,000 species of marine gastropods currently described, at least 60,000 are shelled, which due to its aesthetic value are involved in the international shell trade, which is poorly documented, and mainly, unquantified. The great majority of molluscs species traded for ornamental purposes are gastropods, large species as Cassis tuberosa, which is among the main targets of the ornamental trade. Thus, being a widely exploited species the ecological role of C. tuberosa in marine ecosystems may be compromised by their removal from the environment. In sandy beach environments analyzed in this study, the population of C. tuberosa is structurally young, which to characterize this area as important on the recruitment of this species. In reef areas studied, the gastropod population is predominantly adult, featuring an important area on the development of the specie, which may contribute to the reproductive stage and hence population growth. The absence of C. tuberosa capture both the sandy plain environment and the reefs to justifies the population density of this gastropod that can be consider high in the studied areas. On a conservation perspective, we suggest that the environments analyzed in this study are potential sites for monitoring of natural populations of C. tuberosa and the development of more detailed population and ecological studies that collaborate to the elaboration of management plans for this species. / Das mais de 100.000 espécies de gastrópodes marinhos descritas atualmente, pelo menos 60.000 possuem concha, que devido ao seu valor estético têm movimentado um comércio internacional ainda pouco documentado, e, sobretudo, pouco quantificado. A grande maioria das espécies de moluscos comercializadas para fins ornamentais são gastrópodes e entre estes, espécies de grande porte como Cassis tuberosa, que está entre os principais alvos do comércio ornamental. Assim, por ser uma espécie amplamente explorada o papel ecológico de C. tuberosa nos ecossistemas marinhos pode estar sendo comprometido pela sua remoção do ambiente. Nos ambientes de praia arenosa analisados neste estudo, a população de Cassis tuberosa é estruturalmente jovem, o que caracteriza assim uma área de importância no recrutamento desta espécie. Nas áreas recifais estudadas, a população do gastrópode é predominantemente adulta, caracterizando uma área importante no desenvolvimento da espécie, podendo favorecer o estágio reprodutivo e consequentemente o crescimento da população. A ausência de captura de C. tuberosa tanto no ambiente de planície arenosa quanto nos recifes justifica a densidade populacional deste gastrópode, que pode ser considerada alta nas áreas estudadas. Em uma perspectiva de conservação, sugerimos que os ambientes tratados neste estudo sejam locais em potencial para monitoramento de populações naturais de C. tuberosa e para o desenvolvimento de estudos populacionais e ecológicos mais detalhados que colaborem para elaboração de planos de manejo para esta espécie.

O Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC) é um sistema genético reconhecidamente polimórfico em populações humanas. Em porções específicas dos genes que compõem o MHC de populações humanas também foi evidenciada a ação da seleção natural em nível molecular. Em várias espécies de vertebrados onde estes genes foram estudados diferentes níveis de variação, composição gênica e organização foram detectados, mantendo, entretanto, as características que os tornam tão interessante de ser estudados. Para mamíferos marinhos, as questões sobre a variação no MHC servem de pano de fundo para o entendimento sobre o sistema imunológico destas espécies e suas particularidades em relação ao ambiente marinho e a evolução destes genes em organismos não-modelos. No presente trabalho, duas espécies de cetáceos, a toninha ou franciscana (Pontoporia blainvillei) e a baleia-franca-austral (Eubalaena australis), foram investigadas quanto aos níveis de variação no gene DQB1 do MHC. O segundo exon da cadeia beta do gene DQ foi amplificado em 25 amostras de toninha e 18 amostras de baleia franca. Os fragmentos de 212pb (pares de base) resultantes do processo de amplificação foram clonados e, tiveram analisados por seqüenciamento 171pb correspondentes ao sítio de ligação ao peptídeo antigênico (PBR). Uma amostra de toninha e um par mãe-filhote de baleia-franca-austral foram analisadas quanto à expressão do gene DQB a partir de amostras de pele. A evidência de seleção natural a nível molecular nesta porção do gene é confirmada por um excesso de substituições não sinônimas em relação às substituições sinônimas (em um contexto de neutralidade as substituições sinônimas acumulam-se na mesma taxa de mutações) através da razão dN (não sinônimas) e dS (sinônimas). Para confirmar os desvios da neutralidade (Ho= dN/dS=1), foi usada a estatística z. Os valores de dN/dS para toninha e baleia-franca-austral foram, respectivamente, dN/dS = 2,32 (p=0,014) e dN/dS =3,75 (p= 0,001). Estes valores, as características das seqüências e a evidência de expressão desses genes na pele de cetáceos estão de acordo com os pressupostos de seleção positiva para esta região do gene e sugerem funcionalidade para estes genes nestas duas espécies. Há evidências de mais de uma cópia do gene para baleia-franca-austral. Foram descritos 6 alelos para toninha e 17 alelos para baleia-franca-austral sendo que um dos alelos é compartilhado entre as duas espécies, sugerindo que essa linhagem alélica é anterior à divergência entre odontocetos e misticetos. Paralelamente a este trabalho, o cariótipo de toninha foi descrito através de um processo de cultivo celular a partir da córnea de dois exemplares recém-mortos. Seu número cromossômico 2n=44 corrobora a estabilidade cariotípica descrita para cetáceos. / The Major Histocompatibility Complex is a highly polimorphic genetic system described to human populations. It is clear that a particular region from these genes is under natural selection which results in different patterns of variation from those expected under neutrality. In other vertebrates these genes were studied, these special characteristics seems to be preserved despite specific genomic organization and variation levels. In marine mammals, questions adressed to MHC molecular variation are focused in questions concerned on environmental restrictions and molecular evolution in non-model organisms. In the present study, two marine mammal species were surveyed concerning genetic variability using the gene DQB exon 2. Samples from 25 franciscana dolphins (Pontoporia blainvillei) and 18 southern right whales (Eubalaena australis) were used to amplify a 212bp (base pair) fragment from DQB exon 2. The 171bp resulting fragment was sequenced and analized in relation to the molecular level evidence of selection. Rates of nonsynonymous (dN) and synonymous (dS) base pair substitution and departures from neutrality for dN/dS (z statistics) were calculated. For both species examined, molecular evidence of selection was confirmed. The dN/dS ratios to franciscana and southern right whale were 2.32 (p=0.014) and 3.75 (p=0.001), respectively. These values, combined to data on DQB gene expression in franciscana and southern right whale skin and less restrictive aminoacid usage in both species, suggest a functional signature to sequences cetacean derived. Additionally, 6 alleles were described to franciscana dolphins and 17 to southern right whales. One more evidence of selection acting in this particular genomic region is provided from the fact that both species share one allele, suggesting that this allelic lineage was present before the splitting between mysticeti and odontoceti. To provide addtional information on franciscana dolphins the karyotype of P. blainvillei is presented. The karyotype was obtained from corneal culture of two dead animals. The diploid number 44 confirms the clear prevalence of this pattern among cetaceans.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Engenharia Ambiental. / Made available in DSpace on 2012-10-23T04:01:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 248388.pdf: 20565821 bytes, checksum: 1a36f1b883bce1e69de9f44b8c44ddec (MD5) / Este trabalho teve como principal objetivo determinar a concentração de elementos-traço (Cr, Cu, Pb, Ni e Cd) biodisponíveis no sedimento marinho em dezoito pontos de coleta ao longo do litoral de Santa Catarina. As amostras foram coletadas em pontos prédeterminados entre Laguna e São Francisco do Sul. Processadas pelo método de digestão ácida total e parcial, posteriormente analisadas pelo método de absorção atômica de chama e forno de grafite. Os resultados obtidos mostraram presença de elementos-traço em todas as amostras analisadas, destacando-se as concentrações de chumbo e níquel as quais chegam a superar, em alguns casos, os valores de referência e da literatura. A análise do perfil das concentrações dos elementos-eraço nos pontos de coleta das amostras ao longo do litoral catarinense mostrou que a foz do Rio Itajaí é o ponto de maior concentração de cobre total e biodisponível (14,18mg/kg e 6,38mg/kg), respectivamente. Além disso, na região de Itajaí foi encontrada a maior concentração biodisponível de cromo (1,81mg/kg), além da maior concentração total e a segunda concentração biodisponível de cádmio 2,03mg/kg. Na Baía de Babitonga foram encontradas as maiores concentrações totais e biodisponíveis de chumbo (36,21mg/kg, 26,48mg/kg, respectivamente), e também a maior concentração biodisponível de níquel (25,63mg/kg). A segunda maior concentração total de níquel (35,56mg/kg) foi observada na Baía de Zimbros onde também foi encontrada a maior concentração de cromo total (54,45mg/kg). As maiores médias das concentrações de todos os elementos-traço analisados foram observadas no litoral norte do estado. Os resultados foram submetidos à análise de variância (ANOVA) para se verificar a existência de diferenças estatísticas significativas entre as médias das repetições para cada amostra analisada, ao nível de significância de p < 0,0001. O teste de Tukey foi ap licado quando necessário. Este trabalho mostra também as possíveis fontes Antropogênicas para cada um dos elementos-traço analisados, em cada ponto de coleta. The present study aimed to quantify trace metals (Cr, Cu, Pb, Ni and Cd) concentrations and bioavailability in marine sediment of eighteen locations along Santa Catarina coast. Samples were collected in predetermined points between Laguna and São Francisco do Sul, processed by total and partial acid digestion method and analyzed through graphite furnace atomic absorption. The results have shown the presence of heavy metals in all analyzed samples. It was observed that lead and nickel concentrations were higher than reference values in some cases. Considering the analyzed locations, Itajaí showed the highest total and bioavailable copper levels (14,18mg/kg and 6,38mg/kg respectively). Besides, it presented the highest bioavailable chromium concentration (1,81mg/kg) and the second highest bioavailable cadmium concentration (2,03mg/kg). In Babitonga bay the highest total and bioavailable lead concentrations were found, being 36,21mg/kg, 26,48mg/kg respectively. Moreover, the most elevated bioavailable and second highest nickel concentration were also found 25,63mg/kg and 35,56mg/kg, respectively. In Zimbros bay, the highest chromium concentration was found, being 54,45mg/kg. In general, the most elevated heavy metals concentrations were found in the north coast. The results were obtained through Analyses of Variance (ANOVA) to verify statistical differences among data averages from each sample analyzed. The significance level adopted was 1% (p < 0,0001). Tukey test was used when necessary. The present study also gives information towards anthropogenic sources of heavy metals contamination at each point analyzed.

O Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC) é um sistema genético reconhecidamente polimórfico em populações humanas. Em porções específicas dos genes que compõem o MHC de populações humanas também foi evidenciada a ação da seleção natural em nível molecular. Em várias espécies de vertebrados onde estes genes foram estudados diferentes níveis de variação, composição gênica e organização foram detectados, mantendo, entretanto, as características que os tornam tão interessante de ser estudados. Para mamíferos marinhos, as questões sobre a variação no MHC servem de pano de fundo para o entendimento sobre o sistema imunológico destas espécies e suas particularidades em relação ao ambiente marinho e a evolução destes genes em organismos não-modelos. No presente trabalho, duas espécies de cetáceos, a toninha ou franciscana (Pontoporia blainvillei) e a baleia-franca-austral (Eubalaena australis), foram investigadas quanto aos níveis de variação no gene DQB1 do MHC. O segundo exon da cadeia beta do gene DQ foi amplificado em 25 amostras de toninha e 18 amostras de baleia franca. Os fragmentos de 212pb (pares de base) resultantes do processo de amplificação foram clonados e, tiveram analisados por seqüenciamento 171pb correspondentes ao sítio de ligação ao peptídeo antigênico (PBR). Uma amostra de toninha e um par mãe-filhote de baleia-franca-austral foram analisadas quanto à expressão do gene DQB a partir de amostras de pele. A evidência de seleção natural a nível molecular nesta porção do gene é confirmada por um excesso de substituições não sinônimas em relação às substituições sinônimas (em um contexto de neutralidade as substituições sinônimas acumulam-se na mesma taxa de mutações) através da razão dN (não sinônimas) e dS (sinônimas). Para confirmar os desvios da neutralidade (Ho= dN/dS=1), foi usada a estatística z. Os valores de dN/dS para toninha e baleia-franca-austral foram, respectivamente, dN/dS = 2,32 (p=0,014) e dN/dS =3,75 (p= 0,001). Estes valores, as características das seqüências e a evidência de expressão desses genes na pele de cetáceos estão de acordo com os pressupostos de seleção positiva para esta região do gene e sugerem funcionalidade para estes genes nestas duas espécies. Há evidências de mais de uma cópia do gene para baleia-franca-austral. Foram descritos 6 alelos para toninha e 17 alelos para baleia-franca-austral sendo que um dos alelos é compartilhado entre as duas espécies, sugerindo que essa linhagem alélica é anterior à divergência entre odontocetos e misticetos. Paralelamente a este trabalho, o cariótipo de toninha foi descrito através de um processo de cultivo celular a partir da córnea de dois exemplares recém-mortos. Seu número cromossômico 2n=44 corrobora a estabilidade cariotípica descrita para cetáceos. / The Major Histocompatibility Complex is a highly polimorphic genetic system described to human populations. It is clear that a particular region from these genes is under natural selection which results in different patterns of variation from those expected under neutrality. In other vertebrates these genes were studied, these special characteristics seems to be preserved despite specific genomic organization and variation levels. In marine mammals, questions adressed to MHC molecular variation are focused in questions concerned on environmental restrictions and molecular evolution in non-model organisms. In the present study, two marine mammal species were surveyed concerning genetic variability using the gene DQB exon 2. Samples from 25 franciscana dolphins (Pontoporia blainvillei) and 18 southern right whales (Eubalaena australis) were used to amplify a 212bp (base pair) fragment from DQB exon 2. The 171bp resulting fragment was sequenced and analized in relation to the molecular level evidence of selection. Rates of nonsynonymous (dN) and synonymous (dS) base pair substitution and departures from neutrality for dN/dS (z statistics) were calculated. For both species examined, molecular evidence of selection was confirmed. The dN/dS ratios to franciscana and southern right whale were 2.32 (p=0.014) and 3.75 (p=0.001), respectively. These values, combined to data on DQB gene expression in franciscana and southern right whale skin and less restrictive aminoacid usage in both species, suggest a functional signature to sequences cetacean derived. Additionally, 6 alleles were described to franciscana dolphins and 17 to southern right whales. One more evidence of selection acting in this particular genomic region is provided from the fact that both species share one allele, suggesting that this allelic lineage was present before the splitting between mysticeti and odontoceti. To provide addtional information on franciscana dolphins the karyotype of P. blainvillei is presented. The karyotype was obtained from corneal culture of two dead animals. The diploid number 44 confirms the clear prevalence of this pattern among cetaceans.

Submitted by Everaldo Pereira (pereira.evera@gmail.com) on 2017-04-20T12:52:40Z No. of bitstreams: 1 TESE_DOUTORADO_ALINA.pdf: 2900649 bytes, checksum: 591788370f1a1b0a746c779627d228b7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-20T12:52:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE_DOUTORADO_ALINA.pdf: 2900649 bytes, checksum: 591788370f1a1b0a746c779627d228b7 (MD5) / Diante da indiscutível degradação dos hábitats marinhos, cada dia mais é consenso de que manutenção da diversidade biológica marinha depende de uma ação integrada, onde o ambiente e organismos sejam protegidos. O estabelecimento de Áreas Marinhas Protegidas parece ser uma das alternativas mais eficientes de conservação, e em especial para a manutenção e reabilitação dos estoques pesqueiros. Entretanto, a eficiência das AMPs, está diretamente relacionada com a escolha adequada, do ponto de vista geográfico-ecológico da área a ser protegida. O presente trabalho teve como objetivo principal identificar e compreender os aspectos geológicos que controlam a ocorrência das espécies de peixes de plataforma continental, que vivem associados com fundos consolidados. As áreas de pesca tradicionalmente utilizadas na região da costa do dendê foram utilizadas como referencial para estimativas dos parâmetros polulacionais das regiões da plataforma continental mais importantes do ponto de vista ecológicos e passíveis de serem consideradas locais adequados para o estabelecimento das AMP’s. A metodologia utilizada neste trabalho incluiu: (i) localização com GPS das principais áreas de pesca da costa do dendê; (ii) análise de 13 Perfis topográficos realizados com perfilador de sub-superfície; (iii) coleta de 30 amostras de sedimento superficial do fundo (iv) coleta de 30 amostras de macrobentos (v) análise de dados referentes a 57 desembarques amostrados no município de Valença. Entre os principais resultados ficou evidenciado que: (i) a fisiografia da plataforma continental em sua porção mais externa e região de quebra é o fator determinante para a utilização destas áreas pelas espécies de peixes explorados na região; (ii) nas estações de amostragem o cascalho e areia de origem biodedrítica predominaram como principais tipos texturais e composicionais; (iii) a textura do sedimento superficial parece ser o principal fator de controle das comunidades bentônicas; (iv) a predominância de algas coralinas na composição do sedimento indica que os microhabitats proporcionados pelos seus “talos” influenciam positivamente a grande diversidade apresentadas pelas comunidades macrobentônicas. A região externa da plataforma e início do talude onde ocorreu uma topografia acidentada associada com cascalho e areia biodedrítica, foram as regiões que apresentaram as características ambientais mais adequadas para as espécies demersais que dominam as capturas na costa do dendê e, portanto, mais adequadas para o estabelecimento de Áreas Marinhas Protegidas. / Abstract - Nowadays there is a consensus that in order to maintain the biologic diversity, an integrated action in which the environment and organisms are protected is needed. The creation of marine protected areas seems to be an efficient alternative to preserve biological diversity and maitain and rehabilitate fish stocks. The efficiency of MPA’s is directly related to an adequate identification, from a physigraphic and ecological point of view of the area to be protected. This reserch had as its major goal the identification and understanding of the geological aspects that control the distribution of fish species inhabiting the continental sheld hard bottoms of the Dende coast. Traditional fishing areas of the Dende coast (State of Bahia) were used to identify the most important geological features to be considered in the identification of places for creation of MPA’s. The methodology used included: (i) GPS fixing of the most important fishing areas of the Dende coast, (ii) analysis of bathymetric profiles, (iii) collection of sediment and macrozoobenthos samples, (iv) analysis of fishlanding statistics. Main results show that: (i) the physiography of the outer shelf/upper slope is a determinant factor controlling the distribution of the fish species commertially exploited in the region, (ii) the surface sediment at traditional fishing areas are made up of sands and gravels of biogenic origin, (iii) the texture of surface sediments exerts an important control in the distribution of macrozoobentos, (iv) the dominance of coralline algae fragments in the surface sediments indicates that the micro-habitat created by these fragments positively influence the diversity of the macrozoobentos communities. The outer shelf/upper slope with their diverse topography, in association with biogenic gravels and sands were found to be the regions presenting the most favorable conditions for the demersal fish species that dominate the captures at the Dende coast, and therefore are the most adequate areas for creation of MPA’s.

ABREU NETO, J. C. de. Análise textural e geoquímica dos argilominerais do talude continental do oeste do Ceará. 77 f. 2012. Dissertação (Mestrado em Geologia) - Centro de Ciências, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2012. / Submitted by Aline Nascimento (vieiraaline@yahoo.com.br) on 2013-05-22T20:12:54Z No. of bitstreams: 1 2012_dis_jcdeabreuneto.pdf: 9392845 bytes, checksum: 1acbd2affecbff4402f1351f0ea4086d (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Nascimento(vieiraaline@yahoo.com.br) on 2013-05-22T20:13:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_dis_jcdeabreuneto.pdf: 9392845 bytes, checksum: 1acbd2affecbff4402f1351f0ea4086d (MD5) / Made available in DSpace on 2013-05-22T20:13:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_dis_jcdeabreuneto.pdf: 9392845 bytes, checksum: 1acbd2affecbff4402f1351f0ea4086d (MD5) Previous issue date: 2012 / This research was conducted on the continental slope of Camocim region, 80 km from the mainland. Its main objective was to characterize the core SIS-134, collected at a depth of 1350 m, about the texture, color, chemical composition and mineralogy, in search of help to classify the sediments of submerged areas. The studies were based on literature references and used methodologies for geochemical analysis and characterization of clay by XRD and X-ray fluorescence techniques. The geology of the continental slope is part of the passive margin, and its evolution occurred during the rifting of the ocean basin, being modeled by the action of plate tectonics, the variations of the mean sea level, fluvial deposition, the tides, ocean currents, waves, among others. There was a predominance of muddy sediments in all sections analyzed, with levels ranging from 75.3% to 90.8%, the lowest value found in the bottom of the core, indicating that the area comprises a low energy environment where is deposited only sediment of finer grain size. The clay minerals found correspond to groups of smectite, kaolinite and illite. Values were 42.36% illite the top, in the middle 51.32% and 60.9% on the basis of the core, which may indicate that in the past there was a strong influence of a river environment. The smectite in the sections got the top, middle and base levels of 12.06%, 1.09% and 4.9% respectively. The kaolinite is presented in the core at levels of 45.58%, 47.59% and 34.2% respective to the top, middle and base. In the chemical composition of the core, there was a predominance of CaO3, followed by SiO3, Al2O3, Fe2O3, and that reinforces the influence of the continental slope sedimentation. The content CaO3 appeared high in almost all the testimony, and the highest values found in the top and middle sections with 95.2% and the lowest values were found at the base of the core with 40.5% and 57.1%. The organic matter content, which ranged from 7.03% to 36.21% is explained by the slow deposition and low energy environment. The results generated a higher based on studies of the deep sea and its dynamics / Esta pesquisa foi realizada no talude continental da região de Camocim, a 80 km do continente. Seu objetivo principal foi caracterizar o testemunho SIS-134, coletado a uma profundidade de 1350 m, quanto a textura, cor, composição química e mineralogia, na busca de auxiliar na classificação dos sedimentos das zonas submersas. Os estudos foram baseados em referencial bibliográfico e utilizadas metodologias de análise geoquímica e caracterização dos argilominerais por técnicas de DRX e fluorescência de raios-X. A geologia do talude continental faz parte da margem passiva, tendo sua evolução ocorrida no período de rifteamento da bacia oceânica, sendo modelado pela atuação do tectonismo, das variações do nível médio do mar, da deposição fluvial, das maré, correntes oceânicas, ondas, entre outros. Houve predominância de sedimentos lamosos em todas as seções analisadas, com teores variando de 75,3% a 90,8%, sendo o menor valor encontrado na base do testemunho, indicando que a área compõe um ambiente de baixa energia onde se depositam somente os sedimentos de granulometria mais fina. Os argilominerais encontrados correspondem aos grupos da esmectita, caulinita e ilita. Os valores de ilita foram de 42,36% no topo, 51,32% no meio e 60,9% na base do testemunho, o que pode indicar que no passado houve uma maior influência da ação fluvial na sedimentação deste ambiente. A esmectita obteve nas seções topo, meio e base, teores de 12,06%, 1,09% e 4,9% respectivamente. A caulinita se apresentou no testemunho com teores de 45,58%, 47,59% e 34,2% respectivos a topo, meio e base. Na composição química do testemunho, foi verificada a predominância de CaO3, seguido de SiO3, Al2O3, e Fe2O3, que reforça a influência da sedimentação continental do talude. O teor de CaO3 se apresentou elevado em quase todo o testemunho, sendo os maiores valores encontrados nas seções topo e meio com 95,2% e os menores valores foram encontrados na base do testemunho com 40,5% e 57,1%. O teor de matéria orgânica variou de 7,03% a 36,21%, que se justifica pela baixa energia e lenta deposição do ambiente. Os resultados geraram uma maior base nos estudos sobre o mar profundo e sua dinâmica