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Rastreabilidade no comércio de espécies ornamentais marinhas /

Cohen, Felipe Pereira de Almeida. January 2013 (has links)
Orientador: Wagner Cotroni Valenti / Coorientador: Ricardo Jorge Guerra Calado / Banca: Roberto Munehisa Shimizu / Banca: Sérgio Luiz de Siqueira Bueno / Resumo: Na última década, o comércio de espécies ornamentais marinhas sofreu uma expansão significativa em todo o mundo. Porém, esta indústria ainda depende de um grande número de práticas insustentáveis e precisa mudar urgentemente suas operações para evitar um colapso. Sob este cenário, a rastreabilidade e a certificação surgem como ferramentas importantes de gestão que podem ajudar esta indústria a seguir em direção à sustentabilidade. Esta indústria se baseia no comércio de milhares de espécies de pequeno porte, que são comercializadas vivas, de forma unitária, com alto valor de mercado. Estas características, juntamente com uma cadeia de abastecimento complexa e fragmentada, tornam a rastreabilidade de espécies ornamentais marinhas uma tarefa desafiadora. Neste estudo, apresentamos os métodos comumente usados para rastrear organismos aquáticos e discutimos suas adequações para espécies ornamentais marinhas. Foram analisados os métodos: certificação e etiquetas verdes, marcadores internos (fios codificados, implantes visíveis e transponder integrado passivo), marcadores externos (recorte de nadadeira, etiquetas externas e marcações térmicas e químicas), métodos analíticos (perfil de ácidos graxos, perfil de elementos químicos e isótopos estáveis), métodos moleculares (códigos de barras genético e códigos de barras microbiológico), cultivo de espécimes híbridos e comércio de espécies novas ou raras. O uso de impressões digitais bacterianas parece ser o método mais promissor para rastrear com sucesso os ornamentais marinhos, mas é mais provável que uma combinação de dois ou mais métodos de rastreabilidade precise ser implementada para suprir as características peculiares exibidas pelo comércio vivo de espécies ornamentais marinhas / Abstract: In the last decade, the trade of marine ornamental species has experienced a significant expansion worldwide; however, this industry still relies on a large number of unsustainable practices (e.g., cyanide fishing and overexploitation of target species) and needs to shift urgently its operations to avoid collapsing. Under this scenario, traceability and certification emerge as important management tools that may help this industry to shift towards sustainability. This industry relies on the trade of thousands of small sized species that are traded live on a unitary basis, with high market value. These features, along with a fragment and complex supply chain, make the traceability of marine ornamental species a challenging task. In this study we present the most commonly used methods to trace aquatic organisms and discuss their suitability to trace marine ornamental species. The following methods were analyzed: certification and eco-labeling, internal markers (coded wire tags, visible implants, and passive integrated transponder), external markers (fin clipping, external tags, and thermal and chemical branding), analytical methods (fatty acids, elemental fingerprint, and stable isotopes), molecular methods (DNA barcodes and microbiological barcodes), breeding of hybrid specimens and trading new or rare species. The use of bacterial fingerprints appears to be the most promising method to successfully trace marine ornamentals, but it is most likely that a combination of two or more traceability methods need to be implemented to cover all the unique features displayed by the live trade of marine ornamental species / Mestre
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Análise do período de defeso do camarão marinho Artemesia longinaris através da maturidade ovariana anual /

Siebert, Tiago Henrique. January 2013 (has links)
Orientador: Irene Bastos Franceschini Vicentini / Coorientador: Rogério Caetano da Costa / Banca: Maíra Aparecida Stefanini / Banca: Bruno Cesar Schimming / Resumo: O Artemesia longinaris é endêmica nas águas costeiras do Atlântico Sul, e ocorre a partir da costa do Rio de Janeiro até Puerto Rawson, Argentina. Assim, considerando a exploração das espécies naturais, é necessário estudar a dinâmica reprodutiva para a renovação do estoque natural da espécie, e contribuir para a adequação do fechamento da pesca. O objetivo deste estudo foi caracterizar morfologicamente os diferentes estágios de desenvolvimento dos ovócitos, a maturação dos ovários durante todo o ano, e a avaliação do fechamento de pesca atual para a espécie na região de Macaé / RJ. Para a análise de microscopia de luz (histologia e histoquímica), seis animais de cada estágio de maturação gonadal (rudimentar - RU, em desenvolvimento - ED e desenvolvidos -D) foram coletados na região de Macaé, RJ. Os ovários foram dissecados e fixados em solução de Bouin, incluídos em historesina, corados com hematoxilina / eosina e reação ao ácido periódico de Schiff (PAS). Para a avaliação do período de pesca, usamos fêmeas com gônadas desenvolvidas (D) na primavera, verão, inverno e outono. O número de ovócitos maduros encontrados em cada espécime estudado foi contado ao longo do ano usando o software ImageJ®. Em seguida, o número médio de ovócitos maduros encontrados foi avaliado em cada estação do ano, com o programa SigmaPlot® versão 12. O ovário de A. longinaris apresenta quatro estágios de maturação: rudimentar, desenvolvimento inicial, desenvolvimento avançado e desenvolvido. As células germinativas apresentam cinco fases de desenvolvimento: ovogônias, ovócitos pré-vitelogênicos, ovócitos em vitelogênese inicial, ovócitos em vitelogênese avançado e ovócitos maduros. Novembro apresentou a maior média de ovócitos maduros nos ovários desenvolvidos. Assim a avaliação do... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Artemesia longinaris is endemic in the coastal waters of the South Atlantic, and occurs from the coast of Rio de Janeiro to Puerto Rawson, Argentina. Thus, considering the exploitation of natural species, it is necessary to study the reproductive dynamics for the renewal of the natural stock of the specie, and contribute to the adequacy of the fishing closure. The aim of this study was to characterize morphologically the different developmental stages of oocytes, ovarian maturation throughout the year, and the evaluation of current fishing closure for the species in the region of Macaé/RJ. For analysis of light microscopy (histology and histochemistry), 6 animals of each stage of gonadal maturation (rudimentary - RU, in development - ED and developed -D) were collected in the region of Macaé, RJ. The ovaries were dissected and fixed in Bouin's solution, embedded in historesin, stained with hematoxylin/eosin and reacted to Periodic acid Schiff (PAS). For the evaluation of the fishery period, we used females with developed gonads (D) in spring, winter, summer and autumn. The number of mature oocytes found in each specimen studied was counted over the year using the ImageJ software®. Then, the average number of mature oocytes found was evaluated in each season, with the program SigmaPlot® version 12. The ovary of A. longinaris presents four stages of maturation: rudimentary, initial development, advanced development and developed. The germinal cells present five development phases: oogonia, pre-vitellogenic oocytes, initial-vitellogenic oocyte, advanced vitellogenic oocyte, and mature oocyte. November had the highest average of mature oocytes in the ovaries developed. The annual reproductive cycle assessment indicated that the most appropriate period for fishing closures for this species is from November to January... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Levantamento de cnidários associados a acidentes humanos no Litoral Norte do Estado de São Paulo

Mendes, Patrícia da Rocha [UNESP] 25 February 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-25Bitstream added on 2014-06-13T21:00:29Z : No. of bitstreams: 1 mendes_pr_me_botib.pdf: 1465265 bytes, checksum: bbb67eb612b94d3451a49d78c65fbdd4 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O presente trabalho relata a composição, abundância e distribuição dos cnidários nas diferentes estações do ano, caracterizando as espécies dominantes da comunidade nas regiões amostradas, da costa do litoral norte do Estado de São Paulo (Ubatuba 23º26’ 15’’S e 45º03’45’’W; Caraguatatuba 23º61’39”S e 45º32’56’’W; São Sebastião 23º84’ 94’’S e 45º24’81’’W), no período compreendido entre fevereiro de 2001 a dezembro de 2002. Foram encontradas 6 espécies de cnidários potencialmente causadores de acidentes, sendo 2 cubozoários: Tamoya haplonema (Müeller, 1859) e Chiropsalmus quadrumanus (Müeller, 1859); 2 hidrozoários: Nemalecium lighti (Hargitt, 1924) e Olindias sambaquiensis (F. Müller, 1861) e 2 cifozoários: Chrysaora lactea Eschscholtz, 1829 e Lychnorhiza lucerna Haeckel, 1880. As espécies de maior abundância e freqüência na comunidade foram C. lactea e O. sambaquiensis. Estas espécies também tiveram mais representatividade em análises de abundância além de sua distribuição espacial e temporal. T. haplonema foi uma espécie de ocorrência exclusiva apenas em outono e inverno e C. lactea foi uma espécie abundante de ocorrência no ano todo, com mais representantes nas estações de outono e inverno. Outro objetivo do estudo foi o registro de acidentes causados por algumas espécies de cnidários em banhistas da região de Ubatuba, além da identificação da espécie e associação às lesões dermatológicas e à provável etiologia dos acidentes, além da correlação da quantidade dos animais com a ocorrência de acidentes registrados em meses de veraneio. Foram registrados cento e vinte e oito pacientes, e desta forma, analisados sinais e sintomas, manifestações sistêmicas e extensões das lesões no corpo da vítima, comprovou-se uma associação entre as marcas cutâneas e a provável etiologia e gravidade dos acidentes. Além disso.... / Not available
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Aspecto da ecologia de pescadores residentes na península de Maraú - BA : pesca, uso de recursos marinhos e dietas

Pacheco, Rodrigo Stolze 03 1900 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Ecologia, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2006. / Submitted by Kathryn Cardim Araujo (kathryn.cardim@gmail.com) on 2009-11-17T11:12:50Z No. of bitstreams: 1 2006_Rodrigo Stolze Pacheco.pdf: 1448478 bytes, checksum: 19a94bfa3e2a2c7df992158b17b16c3f (MD5) / Approved for entry into archive by Tania Milca Carvalho Malheiros(tania@bce.unb.br) on 2009-11-17T12:56:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2006_Rodrigo Stolze Pacheco.pdf: 1448478 bytes, checksum: 19a94bfa3e2a2c7df992158b17b16c3f (MD5) / Made available in DSpace on 2009-11-17T12:56:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2006_Rodrigo Stolze Pacheco.pdf: 1448478 bytes, checksum: 19a94bfa3e2a2c7df992158b17b16c3f (MD5) Previous issue date: 2006-03 / A freqüente ocorrência de ambientes estuarinos e de manguezais proporciona sustento a um elevado número de pescadores no litoral brasileiro. Uma das atuais abordagens da ecologia humana foca-se nos recursos utilizados pelas populações humanas, e alguns conceitos da ecologia (e.g. nicho) vêm sendo utilizados para entender essas relações de uso. O objetivo geral do presente trabalho é analisar alguns aspectos ecológicos relacionados à pesca, ao uso de recursos marinhos e à dieta da população de pescadores residente na Ilha do Tanque, situada na Península de Maraú – BA. O trabalho foi dividido em duas partes: na primeira foi feita a caracterização da população em estudo e da pesca local; e na segunda foi analisada a alimentação local com especial atenção aos itens de origem animal. O trabalho de campo estendeu-se de dezembro de 2004 a novembro de 2005, em que foram realizadas entrevistas semi-estruturadas, inquérito nutricional domiciliar e acompanhamento dos desembarques de pesca. Os resultados mostraram que a pesca desenvolvida na Ilha do Tanque é tipicamente masculina. Além da pesca, os entrevistados têm outras atividades que acabam complementando a renda da família. As principais tecnologias utilizadas pelos pescadores foram: manzuá, redes de arrasto e “mariquita”. O principal produto da pesca no Tanque é o “catado” de siris. Foi possível ainda observar a utilização de 27 pontos de pesca, nos quais há evidências de territorialidade e que podem servir para uma proposta futura de manejo dos recursos locais. Pescadores de manzuás são os que utilizam o maior número de locais de pesca. Os pescadores que foram observados durante esse estudo, se comportaram como o previsto pelo modelo de forrageio ótimo a partir de um local central, uma vez que a produção média de pescado capturado aumentou à medida que os pescadores freqüentaram pontos de pesca mais distantes. Quanto à dieta dessa população, foi observado que mesmo com a adoção de costumes urbanos, itens locais ainda são importantes fontes de proteína animal na dieta local, e influenciam a amplitude de nicho dessa população. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The frequent occurrence of estuaries and mangroves provides livelihood for several fishermen in the Brazilian Coast. One current issue in human ecology approaches is related to resources use by human populations and some ecological concepts (e.g. niche) showed to be useful to understand these relationships of use. The main objective of this research is to analyze some ecological aspects related to fishing, the use of seafood resources and the diet of fishermen residents in Ilha do Tanque at “Península de Maraú” – BA. This study was divided in two sections: first, we described the characteristics of the local population and its fishing activity; in the second section, we analysed the local diet, specially the items of animal origin. The field work started on December 2004 and finished on November 2005. During this period, it was conducted semi-structured interviews, and houses were randomly chosen to observe the diet and fishing trips details. Fishing is a typical masculine activity in Ilha do Tanque. Besides fishing activity, the interviewed fishermen supplemented their income with other activities. The most frequent fishing gear used by the fishermen were: “manzuá”, “redes de arrasto” and “mariquita”. The most important fishing product in Tanque is the “catado” of crab. It was also possible to observe that the fishermen have 27 fishing spots, with some territoriality and this result would be useful for future management propositions of local resources. The fishermen who fish with “manzuás” used more fishing spots than those that used other fishing gears. The medium production of fish caught increased as the fishermen frequented fishing spots more far away from the Island. This strongly suggests that, these fishermen behaved as the optimal foraging model from a central place foraging. Analyses of the diet of this population showed that they adopted urban costumes. However, local items were still important animal source of proteins and influences their niche breadth.
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Taxonomia molecular dos Nematoda marinhos de regiões no Pacífico e Atlântico Sul

Renato Rodrigues da Silva, Neyvan 31 January 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:49:10Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo126_1.pdf: 5361968 bytes, checksum: 5b5b15ceb3a451a8c287f6b4b77e6338 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Petróleo Brasileiro S/A / O filo Nematoda apresenta uma grande diversidade e elevada abundância em ambientes aquáticos (marinhos e água doce) e terrestres. A identificação do grupo usando caracteres morfológicos consome tempo, principalmente devido à alta plasticidade fenotípica entre as populações. Alguns métodos moleculares como DNA barcoding oferecem um alternativa eficiente no estudo da biodiversidade das comunidades dos Nematoda marinhos. Os objetivos desse estudo foram: (1) revisão molecular discutindo os conceitos de taxonomia de DNA, código de barras e taxonomia integrativa; (2) aplicação dos marcadores moleculares nucleares e mitocondriais; (3) fazer um inventário molecular através das sequências depositadas em bancos de dados públicos, estimando a porcentagem dos genes mais usados para DNA barcoding com os Nematoda marinhos, produzir novas sequências de DNA de Nematodade três regiões: Bacia de Campos (RJ), Baja Califórnia (Mex) e Bolsa Chica (CA/USA) e (4) elaborar uma visão conceitual do Cartão de Identificação dos Nematoda (NIC) integrado com bancos de dados apresentando-se como uma ferramenta útil para estudos ecológico-moleculares. Os resultados apontaram que mais de 600 espécies do filo Nematoda já foi sequenciado, a maioria parcialmente, depositadas em bancos genéticos públicos com respectivos números de acesso e genes. Observou-se que o gene 18S é o mais utilizado na produção de sequências barcode com aproximadamente 72%, enquanto que citocromo oxidase e região intergênica são frequentemente menos sequenciados. A partir das árvores filogenéticas construídas, o marcador Minibarcode não se mostrou útil para taxonomia molecular dos Nematoda marinhos. Nesse estudo produziu-se 20 sequências de 18S e 42 de 28S, pertencentes a 36 espécies, correspondendo a 27 gêneros e 15 famílias. Além disso, 14 espécies foram identificadas como novos registros de sequências para Genbank. Em adição, o conceito NIC tem o objetivo de promover ligação entre os diversos tipos de bancos de dados públicos a partir da criação de um site . A técnica de DNA barcoding nos Nematoda marinhos tem crescido rapidamente nos últimos anos, devido à necessidade de aprimoramento das ferramentas de biodiversidade e ecológicas em programas de monitoramento. Foi feita a descrição de Cornurella gen nv da Bacia de Campos (RJ) apresentando caracteres morfológicos da família Desmodoridae (Nematoda). Estudos futuros usando uma combinação de taxonomia integrativa e NIC são necessários para melhorar a informação disponível, com o intuito de caracterizar melhor a diversidade dos Nematoda marinhos
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Hidrólise enzimática de nitrilas pelo fungo de origem marinha Aspergillus sydowii CBMAI 934 / Enzymatic hydrolysis of nitriles by the fungus of marine origin Aspergillus sydowii CBMAI 934

Juliêta Rangel de Oliveira 14 December 2012 (has links)
No presente estudo, uma triagem foi realizada com 12 fungos marinhos Penicillium miczynskii CBMAI 930, Penicillium raistriicki CBMAI 931, Aspergillus sydowii CBMAI 933, Aspergillus sydowii CBMAI 934, Aspergillus sydowii CBMAI 935, Bionectria sp. CBMAI 936, Penicillium oxalicum CBMAI 1185, Penicillium citrinum CBMAI 1186, Penicillium decaturense CBMAI 1234, Penicillium raistriicki CBMAI 1235, Cladosporium sp. CBMAI 1237 e Aspergillus sydowii CBMAI 1241 para avaliar o potencial enzimático destes micro-organismos frente à fenilacetonitrila 1. Estes micro-organismos foram isolados de esponjas e alga coletadas do litoral norte do estado de São Paulo. A triagem foi realizada em meio sólido mineral suplementado com glicose e fenilacetonitrila 1 como única fonte de nitrogênio. Dentre os fungos, 8 adaptaram-se muito bem ao substrato 1 nas respectivas quantidades 5 µL (0,04 mmol), 10 µL (0,08 mmol) e 15 µL (0,12 mmol). Em seguida, a triagem foi realizada em meio líquido (20 µL (0,17 mmol), 40 µL (0,35 mmol) e 60 µL (0,50 mmol) de fenilacetonitrila 1 e obteve um bom crescimento de massa micelial dos fungos. Experimentos realizados na ausência de fenilacetonitrila 1, tanto em meio sólido, quanto em meio líquido, não promoveram o crescimento microbiano, evidenciando que as enzimas capazes de hidrolisarem nitrilas presente no sistema catalítico são construtivas. A fenilacetonitrila 1 foi biotransformada ao ácido 2-(2-hidroxifenil)acético 1b (51% pelo fungo A. sydowii CBMAI 934) por todos os fungos adaptados. Devido ao bom crescimento do fungo A. sydowii CBMAI 934 em meio mineral sólido e líquido na presença de fenilacetonitrila 1, este fungo foi selecionado para promover reações de hidrólise frente a diferentes organonitrilas, arilcetonitrilas: 4-fluorofenilacetonitrila 2, 4-clorofenilacetonitrila 3, 4-metoxifenilacetonitrila 4, 2-metilfenilacetonitrila 5, 3-metilfenilacetonitrila 6, 4-metilfenilacetonitrila 7 aos seus correspondentes ácidos carboxílicos 4-fluorofenilacético 2a (51%), 4-clorofenilacético 3a (55%), 4-metoxifenilacético 4a (43%), 2-metilfenilacético 5a (76%), 3-metilfenilacético 6a (52%) e 4-metilfenilacético 7a (46%), em nitrila alifática, 2-(1-ciclo-hexen-1-il)acetonitrila 8 ao ácido 2-(1-ciclo-hexen-1-il)acético 8a (28%) e nitrila hetero-aromática, 2-cianopiridina 19 a 2-piridinamida 19a. As reações foram acompanhadas por GC-FID e os produtos de biotransformações foram isolados e caracterizados por GC-MS, HRMS, RMN de 1H e de 13C. Este trabalho envolveu o primeiro estudo frente à biotransformação de nitrilas por micro-organismos de origem marinha. / In the present study, a screening of 12 marine fungi Penicillium miczynskii CBMAI 930, Penicillium raistriicki CBMAI 931, Aspergillus sydowii CBMAI 933, Aspergillus sydowii CBMAI 934, Aspergillus sydowii CBMAI 935, Bionectria sp. CBMAI 936, Penicillium oxalicum CBMAI 1185, Penicillium citrinum CBMAI 1186, Penicillium decaturense CBMAI 1234, Penicillium raistriicki CBMAI 1235, Cladosporium sp. CBMAI 1237 and Aspergillus sydowii CBMAI 1241 was done in order to evaluate the enzymatic potential of these microorganisms in phenylacetonitrile 1. These microorganisms were isolated from sponges and algae collected at the north shore of Sao Paulo State. The screening was carried out in solid mineral medium supplemented with glucose and phenylacetonitrile 1 as the only source of nitrogen. Among the fungi, 8 adapted to the subtract really well 5 µL (0,04 mmol), 10 µL (0,09 mmol) and 15 µL (0,13 mmol). Afterwards, a screening was carried out in liquid medium 20 µL (0,17 mmol), 40 µL (0,35 mmol) and 60 µL (0,50 mmol) of phenylacetonitrile 1) and a great mass of the fungi was obtained. The phenylacetonitrile 1 was biotransformed in the acid 2-(2-hydroxyphenyl)acetic 1b (51% by the fungus A. sydowii CBMAI 934) by all the adapted fungi. Experiments carried out without phenylacetonitrile 1, both in solid and liquid media did not show microbial growth. Enzymes which hydrolyzed nitriles present in the catalytic system were constructive. Due to the good growth rate of the fungus A. sydowii CBMAI 934 in solid and liquid mineral media in presence of phenylacetonitrile 1, this fungus was selected to promote hydrolysis reactions in different organonitriles, arylacetonitriles: 4-fluorophenylacetonitrile 2, 4-chlorophenylacetonitrile 3, 4-methoxyphenylacetonitrile 4, 2-methylphenylacetonitrile 5, 3-methylphenylacetonitrile 6, 4-methylphenylacetonitrile 7 in their corresponding carboxylic acids 4-fluorophenylacetic 2a (51%), 4-chlorophenylacetic 3a (55%), 4-methoxyphenylacetic 4a (43%), 2-methylphenylacetic 5a (76%), 3-methylphenylacetic 6a (52%) and 4-methylphenylacetic 7a (46%), aliphatic nitrile 2-(1-cyclohexen-1-yl)acetonitrile 8 to 2-(1-cyclohexen-1-yl)acetic acid 8a (28%) and heteroaromatic nitrile 2-cyanopiridine 19 to 2-pyridinecarboxamides 19a. The reactions were monitored by GC-FID and the biotransformation products were isolated and characterized by GC-MS, HRMS and 1H and 13C NMR. This work involved the first study on the biotransformation of nitriles by marine microorganisms.
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Biotransformação / Biodegradação do Antibiótico Norfloxacino por Fungos de Ambiente Marinho / Biotransformation / biodegradation of norfloxacin antibiotic by marine-derived fungi

Aline Teixeira do Brasil Morais Trimidi 08 August 2018 (has links)
A ocorrência de fármacos no meio ambiente têm despertado o interesse de pesquisadores, uma vez que podem causar efeitos adversos à comunidade biótica. O norfloxacino (NOR) é um fármaco amplamente empregado no tratamento de infecções bacterianas tanto em humanos como em animais, e devido as suas propriedades físico-químicas, tem sido alvo de estudos envolvendo o seu monitoramento e efeitos toxicológicos em micro-organismos, principalmente em ambientes aquáticos. Neste contexto, o presente trabalho teve como objetivo a investigação da biotransformação/biodegradação do fármaco NOR por fungos derivados de ambiente marinho. Primeiramente, foi realizada uma triagem a partir de 7 cepas fúngicas, das quais 4 foram selecionadas - Penicillium raistrickii CBMAI 931, Cladosporium sp. CBMAI 1237, Aspergillus sydowii CBMAI 1241 e Penicillium raistrickii CBMAI 1235 - para avaliar a influência da adição do fármaco na inoculação dos mesmos. Os experimentos foram realizados na presença do fármaco (0,1 mg mL-1), e em caldo nutritivo (malte 2% em água do mar artificial) por 35 dias (32°C, 130 rpm). A adição do fármaco no dia, e após a inoculação, não influenciou no crescimento dos fungos. No entanto, a formação de produtos de biotransformação foi observada para o experimento com adição do NOR no dia da inoculação, os quais foram identificados por LC-QqTOF, baseando-se na similaridade entre as massas obtidas experimentalmente e teórica, assim como os produtos já reportados na literatura. A porcentagem de biodegradação do fármaco foi determinada para o experimento com adição do fármaco após a inoculação, para os fungos: P. raistrickii CBMAI 931 (34,07%) e A. sydowii CBMAI 1241 (58,91%). Para os experimentos realizados em meio mineral (59,35%) e na presença de um consórcio de fungos (57,05%), não foram observadas diferenças significativas. Não foi possível elucidar a estrutura do produto isolado na presença do fungo A. sydowii CBMAI 1241, devido a sua baixa concentração e a possibilidade de conjugação com substâncias endógenas. Um método analítico foi desenvolvido e validado para a determinação da porcentagem de biodegradação do fármaco nos experimentos com os fungos marinhos. / The occurrence of drugs on the environment has called attention to researchers, since they can cause adverse effects to the biotic community. The norfloxacin (NOR) is a compound widely used for treatment of serious bacterial infections in human and animals. Due to the physicochemical properties of this compound it has been focus of studies concerning about its monitoring and toxicological effects on microorganisms, mainly in aquatic environment. Thus, in the present study the biotransformation/biodegradation of NOR by marine-derived fungi was investigated. Firstly, it was performed a screening with 7 strain of marine fungi, in a which 4 were selected - Penicillium raistrickii CBMAI 931, Cladosporium sp. CBMAI 1237, Aspergillus sydowi CBMAI 1241 and Penicillium raistrickii CBMAI 1235 - to evaluate the influence of NOR addition in the inoculation. The experiments were carried out in the presence of NOR (0,1 mg mL-1) in nutritive broth (malt 2% in artificial sea water) for 35 days (32°C, 130 rpm). The NOR addition on the first day and after inoculation, did not affect the fungal growth. Nevertheless, the formation of biotransformation products was observed to the experiment with addition on the first day. These products were identified by LC-QqTOF, based on the similarity between experimental and theoretical mass, as the products already reported on the literature. The percentage of drug biodegradation was determined for the fungi P. raistrickii CBMAI 931 (34,07%) and A. sydowi CBMAI 1241 (58,91%) for the experiment carried out with NOR addition after inoculation. For the experiments performed in mineral medium (59,35%) and in the presence of fungal consortium (57,05%) no differences were observed for the biodegradation. It was not able to elucidate the structure of isolated product, in the presence of A. sydowii CBMAI 1241, due to its low concentration and probable conjugation with endogenous substances. The analytical method was developed and validated to determine the percentage of drug biodegradation in the experiments with marine fungi.
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Investigação da origem metabólica de derivados da esculetina ativos contra o vírus da SARS / Investigation of the metabolic origin of esculetin derivatives active against the SARS virus

Marilia Cardoso Milanetto 10 December 2008 (has links)
Recentemente foram isolados da esponja marinha Axinella cf. corrugata dois compostos derivados da esculetina: o éster metílico do ácido 4-esculetínico e o éster etílico do ácido 4-esculetínico. Este último apresentou importante atividade contra o vírus da SARS. Este projeto teve como meta isolar e cultivar as linhagens de fungos associadas à esponja Axinella cf. corrugata, bem como analisar seus extratos por HPLC-PDA-MS, objetivando a possível detecção desses compostos (ou derivados) nesses extratos. Avaliações preliminares levaram à obtenção de 11 amostras potencialmente relacionadas a esses compostos. Dentre elas, uma apresentou espectros no UV e de massas muito similares aos obtidos para o aduto de sódio do éster metílico do ácido 4-esculetínico. No entanto análises espectroscópicas mais detalhadas por RMN - 1H, RMN - 13C, HSQC, HMBC e COSY da amostra purificada permitiram identificar o composto isolado, a 1,3,6-trihidroxi-8-metil-9H-xanten-9-ona. Simultaneamente às análises químicas, os extratos obtidos a partir das linhagens fúngicas isoladas da esponja Axinella cf. corrugata tiveram suas atividades biológicas avaliadas frente a microrganismos e células tumorais humanas, resultando em mais de 20% dos extratos com alguma atividade biológica. / Recently two compounds derived from esculetin have been isolated from the marine sponge Axinella cf. corrugata: the methyl ester of esculetin-4-carboxylic acid and the ethyl ester of esculetin-4-carboxylic acid. The latter displayed antiviral activity against the SARS virus. This project aimed the isolation and the growth of fungal strains associated to the sponge Axinella cf. corrugata, and the subsequent analysis of the fungal extracts by HPLC-PDA-MS, aiming the possible detection of the esculetin compounds (or derivatives) in those extracts. Preliminary analysis yielded 11 samples potentially related to these compounds. Among these extracts, one presented UV and MS spectra very similar to the spectra obtained for the sodium adduct of the methyl ester of esculetin-4-carboxylic acid. However, a detailed spectroscopic analysis of a pure compound isolated by RMN - 1H, RMN - 13C, HSQC, HMBC e COSY allowed the identification of the compound, which is 1,3,6-trihydroxy-8-methyl-9H-xanthen-9-one. Simultaneously to the chemical analysis of the fungal crude extracts, the biological activities of the obtained extracts were evaluated against microrganisms and human tumoral cell lines. More than 20% of the extracts displayed some biological activity.
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Redução de derivados de acetofenonas e resolução de feniletanóis por biocatálise e imobilização de fungos marinhos / Reduction of acetophenones derivatives and resolution phenylethanol by biocatalysis and immobilization of marine fungi

Lenilson Coutinho da Rocha 10 October 2012 (has links)
Este trabalho envolveu reações de biocatálise com objetivo de obter compostos enantiomericamente puros. Assim foram realizadas reações de redução de derivados de acetofenonas, resolução enzimática de alcoóis e azido-alcoóis e imobilização de células fúngicas em suportes sólidos para aplicação em biocatálise. Foi realizada a redução enantiosseletiva da 1-(4-metoxifenil)etanona (1) através da triagem com nove fungos marinhos (Aspergillus sydowii CBMAI 935, A. sydowii CBMAI 934, A. sclerotiorum CBMAI 849, Bionectria sp. CBMAI 936, Beauveria felina CBMAI 738, Cladosporium cladosporioides CBMAI 857, Mucor racemosus CBMAI 847, Penicillium citrinum CBMAI 1186, P. miczynskii CBMAI 930). Os fungos A. sydowii CBMAI 935 e Bionectria sp. CBMAI 936 catalisaram a biorredução estereosseletiva da 1-(4-metoxifenil)etanona (1) para o correspondente (R)-1-(4-metoxifenil)etanol (1a) com excelentes excessos enantioméricos (>99%). Os fungos B. felina CBMAI 738 e P. citrinum CBMAI 1186 catalisaram a biorredução estereosseletiva da cetona 1 para o correspondente S-álcool 1a com 69% de excesso enantiomérico. Os fungos marinhos (A. sclerotiorum CBMAI 849, A. sydowii CBMAI 934, B. felina CBMAI 738, M. racemosus CBMAI 847, P. citrinum CBMAI 1186, P. miczynskii CBMAI 931, P. miczynskii CBMAI 830, P. oxalicum CBMAI 1185, Trichoderma sp. CBMAI 932) foram utilizados na bioconversão assimétrica das iodoacetofenonas 2-4 para os correspondentes iodofeniletanois 2a-4a. Todos os fungos marinhos produziram exclusivamente (S)-o-iodofeniletanol (2a) e (S)-m-iodofeniletanol (3a) com diferentes valores de excessos enantioméricos (62-99%). Os fungos B. felina CBMAI 738, P. miczynskii CBMAI 830, P. oxalicum CBMAI 1185 e Trichoderma sp. CBMAI 932 produziram o correspondente (R)-p-iodofeniletanol (4a) com excessos enantioméricos de 32-99%. A bioconversão da p-iodoacetofenona (4) com células microbianas do P. oxalicum CBMAI 1185 mostrou uma competição entre a reação de redução e oxidação. Também foram realizadas as reduções das ceto-azidas 13-16 com fungos marinhos fornecendo bons resultados de seletividade (28-99% ee). As células microbianas dos fungos A. sclerotiorum CBMAI 849 e P. citrinum CBMAI 1186 foram imobilizadas em suportes de sílica gel, xerogel de sílica e quitosana. As células do P. citrinum CBMAI 1186 imobilizadas em quitosana catalisaram a redução da 1-(4-metoxifenil)-etanona (1) para o correspondente (S)-1-(4-metoxifenil)-etanol (1a) com excelente excesso enantiomérico (>99%). O fungo P. citrinum CBMAI 1186 imobilizado em quitosana também catalisou a biorredução de 2-cloro-1-feniletanona (7) para o 2-cloro-1-feniletanol (7a), mas neste caso, sem seletividade. Neste trabalho também foram realizadas as resoluções quimio-enzimáticas dos (±)-o-iodofeniletanol (2a), (±)-m-iodofeniletanol (3a), (±)-p-iodofeniletanol (4a), (±)-2-azido-1-feniletanol (13a), (±)-2-azido-1-(4-metoxifenil)etanol (14a), (±)-2-azido-1-(4-bromofenil)etanol (15a), (±)-2-azido-1-(4-nitrofenil)etanol (16a) e (±)-2-azido-1-(4-clorofenil)etanol (17a) com a lipase CALB. Os (S)-m-iodofeniletanol (3a) e (S)-p-iodofeniletanol (4a) foram obtidos com excelentes excessos enantioméricos (>99%) e posteriormente foram utilizados na síntese de compostos bifenílcos quirais por reação de acoplamento Suzuki fornecendo bons rendimentos (63-65%). A resolução quimio-enzimática dos azido-alcoóis 13a-17a foram realizadas com lipase Candida atarctica e os (R)-2-azido-1-feniletanol (13a), (R)-2-azido-1-(4-metoxifenil)etanol (14a), (R)-2-azido-1-(4-bromofenil)etanol (15a), (R)-2-azido-1-(4-nitrofenil)etanol (16a) obtidos foram utilizados na síntese dos triazóis quirais (R)-2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-il)-1-feniletanol (13), (R)-2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-il)-1-(4-metoxifenil)etanol (14), (R)-2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-il)-1-(4-bromofenil)etanol (15) e (R)-2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-il)-1-(4-nitrofenil)etanol (16) e (R)-2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-il)-1-(4-clorofenil)etanol (17), obtidos com ótimos rendimentos (79-85%). / This work involved reactions of biocatalysis in order to obtain enantiomerically pure compounds. Thus reactions were performed reduction of acetophenones derivatives, enzymatic resolution of azido-alcohols, secondary alcohols and immobilization of fungal cells on solid supports for use in biocatalysis. We performed the enantioselective reduction of 1-(4-methoxyphenyl)ethanone (1) by screening with nine marine fungi (Aspergillus sydowii CBMAI 935, A. sydowii CBMAI 934, A. sclerotiorum CBMAI 849, Bionectria sp. CBMAI 936, Beauveria felina CBMAI 738, Cladosporium cladosporioides CBMAI 857, Mucor racemosus CBMAI 847, Penicillium citrinum CBMAI 1186, P. miczynskii CBMAI 930). The fungi A. sydowii CBMAI 935 and Bionectria sp. 936 CBMAI catalyzed stereoselective bioreduction of 1-(4-methoxyphenyl)ethanone (1) to the corresponding (R)-1-(4-methoxyphenyl)ethanol (1a) with excellent enantiomeric excess (>99%). Fungi B. felina CBMAI 738 and P. citrinum 1186 CBMAI catalyzed stereoselective bioreduction of ketone 1 to the corresponding S-alcohol 1a with 69% enantiomeric excess. The marine fungi (A. sclerotiorum CBMAI 849, A. sydowii CBMAI 934, B. felina CBMAI 738, M. racemosus CBMAI 847, P. citrinum CBMAI 1186, P. miczynskii CBMAI 931, P. miczynskii CBMAI 830, P. oxalicum CBMAI 1185, Trichoderma sp. CBMAI 932) were used in the bioconversion of asymmetric iodoacetophenones 2-4 to the corresponding iodophenylethanols 2a-4a. All marine fungi produced exclusively (S)-o-iodophenylethanol (2a) and (S)-m-iodophenyletanol (3a) with different values of enantiomeric excess (62-99%). Fungi B. felina CBMAI 738, P. miczynskii CBMAI 830, P. oxalicum CBMAI 1185 and Trichoderma sp. CBMAI 932 produced the corresponding (R)-p-iodophenylethanol (4a) with enantiomeric excess of 32-99%. The bioconversion of p-iodoacetophenone (4) with microbial cells of P. oxalicum CBMAI 1185 showed a competition between oxidation and reduction reaction. Were also performed reductions of azido-ketones 13-16 with marine fungi providing good results of selectivity (28-99% ee). Microbial cells of fungi A. sclerotiorum CBMAI 849 and P. citrinum CBMAI 1186 were immobilized on supports of silica gel, silica xerogel and chitosan. Whole cells of P. citrinum 1186 CBMAI immobilized on chitosan catalyzed the reduction of 1-(4-methoxyphenyl)ethanone (1) to the corresponding (S)-1-(4-methoxyphenyl)ethanol (1a) with excellent enantiomeric excess (>99%). The fungus P. citrinum 1186 CBMAI immobilized on chitosan also catalyzed the bioreduction of 2-chloro-1-phenylethanone (7) to 2-chloro-1-phenylethanol (7a), but in this case without selectivity. In this work were also performed chemo-enzymatic resolutions of (±)-o-iodophenylethanol (2a), (±)-m-iodophenylethanol (3a), (±)-p-iodophenylethanol (4a), (±)-2-azido-1-phenylethanol (13a), (±)-2-azido-1-(4-methoxyphenyl)ethanol (14a), (±)-2-azido-1-(4-bromophenyl)ethanol (15a), (±)-2-azido-1-(4-nitrophenyl)ethanol (16a) and (±)-2-azido-1-(4-chlorophenyl)ethanol (17a) with the lipase Candida atarctica. The (S)-m-iodophenylethanol (3a) and (S)-p-iodophenylethanol (4a) were obtained with excellent enantiomeric excess (>99%) and were subsequently used in the synthesis of chiral biphenyl compounds by the Suzuki reaction with good yields (63-65%). Chemoenzymatic resolution of azido-alcohols 13a-17a were carried out using lipase CALB and (R)-2-azido-1-phenylethanol (13a), (R)-2-azido-1-(4-methoxyphenyl)ethanol (14a), (R)-2-azido-1-(4-bromophenyl)ethanol (15a), (R)-2-azido-1-(4-nitrophenyl)ethanol (16a) obtained were used in the synthesis of chiral triazoles (R)-2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-yl)-1-phenylethanol (13), (R)-2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-yl)-1-(4-methoxyphenyl)ethanol (14) (R)-2-(1H-benzo [d][1,2,3]triazol-1-yl)-1-(4-bromophenyl)ethanol (15) and (R)-2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-yl)-1-(4-nitrophenyl)ethanol (16) and (R)-2-(1H-benzo[d] [1,2,3]triazol-1-yl)-1-(4-chlorophenyl)ethanol (17) obtained in good yields (79-85%).
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Metabólitos secundários bioativos e mediadores de relação predador/presa de invertebrados marinhos / Bioactive secondary metabolites and predator/preys relationship mediators from marine invertebrates

Fábio Renato Pereira 24 January 2012 (has links)
A presente investigação teve por objetivo o isolamento de metabólitos secundários biologicamente ativos de nudibrânquios, moluscos conhecidos por produzirem ou acumularem substâncias a partir de suas presas. Foram investigados extratos de quatro espécies de nudibrânquios marinhos juntamente com suas respectivas presas. Além disso, também foi investigado o extrato ativo da esponja marinha Agelas sventres. O estudo realizado com o extrato bruto da esponja marinha Agelas sventres levou ao isolamento de uma série de alcalóides bromopirrólicos, compostos tipicamente encontrados em esponjas do gênero Agelas. Dentre os compostos isolados, a oroidina apresentou atividade inibitória frente à enzima Pdr5p de Saccharomyces cerevisiae. O estudo do nudibrânquio Tambja stegosauriformis e de sua presa, o briozoário Bugula sp., levou ao isolamento de diversos alcalóides da classe das tambjaminas. As tambjaminas C, D, K e o produto de hidrólise da tambjamina B foram observados nos dois animais; o produto de hidrólise da tambjamina A foi encontrado apenas no extrato do nudibrânquio, enquanto que a tambjamina A e um isômero da tambjamina J foram encontrados apenas no extrato do briozoário. O estudo do nudibrânquio Okenia zoobotryon e de sua presa, o briozoário Zoobotryon verticillatum, resultou no isolamento de um único alcalóide indólico conhecido, 2,5,6-tribromo-Nmetilgramina, presente nos dois animais. Resultados semelhantes foram obtidos a partir da investigação do extrato do nudibrânquio Hypselodoris lajensis e de sua presa, uma esponja do gênero Dysidea, com o isolamento de um único diterpeno, a lactona da furodisinina. Embora ambas substâncias sejam conhecidas, este foi o primeiro isolamento destes compostos a partir de espécies de nudibrânquios. Finalmente, a partir do extrato do nudibrânquio Pleurobranchus areolatus foram isoladas duas novas dicetopiperazinas modificadas, estruturalmente semelhantes às rodriguesinas A e B, outras dicetopiperazinas isoladas a partir da ascídia Didemnum sp., provável presa desta espécie de nudibrânquio. Vale ressaltar a utilização de análises por LC-UV-MS e MS/MS neste trabalho, que auxiliaram na identificação uma série de compostos presentes nos extratos estudados no presente trabalho, mesmo em quantidades muito pequenas. / Abstract The present investigation aimed the isolation of biologically active secondary metabolites from different species of nudibranchs, mollusks that can produce or accumulate substances from their preys. We investigated the extracts of four nudibranchs species and their respective preys. The active extract of the marine sponge Agelas sventres, has also been investigated. From the extract of the marine sponge Agelas sventres we could isolate a series of bromopyrrolic alkaloids, substances that are typically found in sponges of Agelas genus. Among the isolated compounds, oroidin was found to inhibit the activity and function of the Pdr5p enzyme from Saccharomyces cerevisiae. From the extract of the nudibranch Tambja stegosauriformis and its prey, the bryozoan Bugula sp., several known tambjamines alkaloids were isolated. The tambjamines C, D, K, and the aldehyde of the tambjamine B were found in both animals; aldehyde of tambjamine A was identified only in the nudibranch extract, whereas tambjamine A and an isomer of tambjamine J were found on the bryozoan. The study of the extract of the nudibranch Okenia zoobotryon and its prey, the bryozoan Zoobotryon verticillatum, resulted in the isolation of a single known brominated indole alkaloid, 2,5,6-tribromo-N-metilgramine, present on both animals. Similar results were obtained in the study of extract of the nudibranch Hypselodoris lajensis along with its prey, a Dysidea sponge, that led to the isolation of a single diterpene, the furodysinin lactone. Although both compounds are known, this is the first report on the isolation of those compounds from nudibranch species. Finally, the investigation of the extract from the nudibranch Pleurobranchus areolatus provided two new modified diketopiperazines, closely related to modified diketopiperazines, the rodriguesins A and B, isolated from the ascidian Didemnum sp. It is important to note the use of LC-UV-MS and MS/MS analysis in this work, which were important in the identification of several compounds present in the studied extracts in very small amounts.

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