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Diversidade e estrutura genética de populações naturais de Gossypium mustelinum Miers ex Watt

SILVA, Uiara Cavalcante 06 February 2012 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-22T14:12:14Z No. of bitstreams: 1 Uiara Cavalcante Silva.pdf: 1481908 bytes, checksum: fd082dc957b87d6e76fa41b38fce3ac3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-22T14:12:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Uiara Cavalcante Silva.pdf: 1481908 bytes, checksum: fd082dc957b87d6e76fa41b38fce3ac3 (MD5) Previous issue date: 2012-02-06 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / n Brazil three cotton species occur: G. barbadense, G. hirsutum and G. mustelinum, being the last wild and native of Brazil, found only in the semi-arid regions of Rio Grande do Norte and Bahia. The studied populations distribute themselves preferably near watercourses, like predominant vegetation of ciliary forest. The degradation of the environment by grazing of goats and anthropic activities, caused the reduction of these populations and consequently the variability. However, in spite of the low variability in these populations, this whole gene pool may in the future be useful in breeding programs. Therefore, the detailed knowledge of the structure of the existing variability is essential for a better use of this species as a resource of allelic variability. As commercial varieties have a narrow genetic base, due to the strong selection practiced for breeding and deriving mostly from only one species, G. hirsutum var. Latifolium, the use of new alleles is fundamental to increase allelic combinations, so that germplasm of wild species of the genus Gossypium, such as G. mustelinum, becomes an alternative for such an extension. In order to determine the variability and genetic structure of 16 natural populations of G. mustelinum, DNA extractions, PCR reactions with SSR markers were performed and the amplified alleles were used to estimate the allelic frequencies, the expected and observed heterosomy Genetic diversity analysis and Nei G statistics, as well as clustering analyzes, using the Nei and Neighbor-Joining distance. The distance between the genotypes was calculated based on the proportion of alleles using the MICROSAT program and the genotypes grouped from the UPGMA method in MEGA 4. To determine if the diversity of each of the populations was presented in an organized spatial structure, the matrix Genetic distance was compared to the physical distance matrix using the Mantel test. The results showed that the greatest diversity is found among populations, with a high level of intrapopulation inbreeding, probably due to the effects of genetic drift, evidenced by the high number of exclusive alleles. / No Brasil ocorrem três espécies de algodoeiro: G. barbadense, G. hirsutum e G. mustelinum, sendo a última silvestre e nativa do Brasil, encontrada, apenas no semi-árido dos Estados do Rio Grande do Norte e Bahia. As populações estudadas distribuem-se preferencialmente próximas de cursos de água, como vegetação predominante de mata ciliar. A degradação do ambiente por pastejo de caprinos e atividades antrópicas, provocou a redução dessas populações e consequentemente da variabilidade. Entretanto, apesar da reduzida variabilidade existente nessas populações, todo esse conjunto gênico poderá, futuramente, ser útil nos programas de melhoramento. Para tanto, o conhecimento detalhado da estruturação da variabilidade existente é essencial para melhor utilização dessa espécie como recurso de variabilidade alélica. Como as variedades comerciais apresentam base genética estreita, devido a forte seleção praticada para o melhoramento e derivarem em sua maioria de apenas uma espécie, a G. hirsutum var. latifolium, a utilização de novos alelos é fundamental para aumentar as combinações alélicas, de maneira que germoplasma de espécies silvestres do gênero Gossypium, como G. mustelinum, se torna uma alternativa para tal ampliação. Com o objetivo de determinar a variabilidade e estrutura genética de 16 populações naturais de G. mustelinum, foram feitas extrações de DNA, reações de PCR com marcadores SSR e os alelos amplificados foram empregados para estimar as frequências alélicas, a heterosigozidade esperada e observada, a análise de diversidade genética e as estatísticas G de Nei, como também, as análises de agrupamento, usando a distância de Nei e Neighbor-Joining. A distância entre os genótipos foi calculada com base na proporção de alelos usando o programa MICROSAT e os genótipos agrupados a partir do método de UPGMA no MEGA 4. Para determinar se a diversidade de cada uma das populações se apresentava numa estrutura espacial organizada, a matriz de distância genética foi comparada com a matriz de distância física usando o teste de Mantel. Os resultados demonstraram que a maior diversidade encontra-se entre as populações, com elevado nível de endogamia intrapopulacional, provavelmente devido aos efeitos de deriva genética, evidenciado pelo elevado número de alelos exclusivos.
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Propagação vegetativa de jabuticabeira

Sasso, Simone Aparecida Zolet 02 February 2009 (has links)
A jabuticabeira (Plinia sp.) é uma espécie de difícil propagação vegetativa e um protocolo eficiente para tal ainda não foi definido. O objetivo deste trabalho foi investigar a eficiência de técnicas de propagação vegetativa da espécie e desenvolver um protocolo eficiente para desinfestação e estabelecimento inicial de explantes in vitro. Testou-se o potencial de enraizamento de estacas lenhosas de P. cauliflora, utilizando quatro concentrações de ácido indolbutírico (AIB) (0, 2000, 4000 e 6000 mg L-1) e dois procedimentos (corte vertical e anelamento da estaca); e o potencial de enraizamento de estacas apicais herbáceas de P. cauliflora, utilizando cinco concentrações de AIB (0, 2000, 4000, 6000 e 8000 mg L-1) e em duas épocas de implantação (outubro e dezembro). O percentual de enraizamento das estacas foi avaliado após 180 dias da implantação dos experimentos. Foi testada também a compatibilidade de enxertia de três espécies de jabuticabeira (P. cauliflora, P. trunciflora, P. jaboticaba) sobre porta-enxertos de P. cauliflora, em duas épocas de implantação (maio e agosto). Avaliou-se o percentual de enxertos brotados e o número e tamanho de brotos, após 90 dias da implantação. Para alporquia, foram testados dois diâmetros de ramo (1,0-1,5 cm e 2,0-2,5 cm) e duas larguras do anelamento (1,5 cm e 3,0 cm), na espécie P. cauliflora. Avaliou-se o percentual de enraizamento e o número e tamanho de raízes, após 180 dias da implantação do experimento. Testou-se também o período de imersão (5, 10 e 15 minutos) em hipoclorito de sódio a 1,25% no estabelecimento in vitro de explantes caulinares e radiculares de seedlings de P. trunciflora. Avaliou-se o percentual de contaminação e o número de brotos e folhas dos explantes, após 45 dias de incubação. Observouse que o enraizamento de estacas lenhosas é dependente da aplicação de AIB, sendo que o maior percentual de enraizamento (50%) foi obtido na maior concentração de AIB (6000 mg L-1) conjugada com o corte vertical. Para as estacas herbáceas, o enraizamento foi baixo (máximo de 10%). Entretanto, há o potencial de enraizamento e, por isso, ajustes na técnica devem ser testados para maximizá-lo. A enxertia e a alporquia são técnicas recomendáveis para propagação da jabuticabeira, pois proporcionam alto percentual de formação de mudas. Há compatibilidade aparente entre as três espécies enxertadas sobre P. cauliflora. A utilização de garfos retirados de plantas em frutificação deve ser evitada, pois ocorre inibição da brotação posterior dos enxertos. Na alporquia, ramos de diâmetro superior a 2,0 cm, proporcionam enraizamento de 87,5% e maior número e tamanho de raízes, em relação a ramos de menor diâmetro. A utilização do menor tempo de imersão (cinco minutos) em hipoclorito de sódio 1,25% é eficiente para desinfestação dos explantes caulinares de seedlings de jabuticabeira e permite seu estabelecimento inicial in vitro, proporcionando o desenvolvimento de brotações. / The jabuticaba tree is a specie of difficult vegetative propagation and an efficient protocol has not been defined yet. The aim of this work was to test the efficiency of vegetative propagation techniques for jabuticaba tree and develop an efficient protocol for disinfection and initial establishment of in vitro explants. It was tested the rooting potential of wood cutting of P. cauliflora, utilizing four concentrations of Indolbutiric Acid - IBA (0, 2000 , 4000 and 6000 mg L-1) and two procedures (cross section and cuttings girdling); and the rooting potential of softwood terminal cuttings of P. cauliflora, utilizing five concentrations of IBA (0, 2000, 4000, 6000 and 8000 mg L-1) in two periods of implantation (October and December 2007). The rooting potential of cuttings was evaluated after 180 days of the beginning of the experiments. It was also tested the compatibility of grafting of three species of jabuticaba tree (P. cauliflora, P. trunciflora, P. jaboticaba) on rootstocks of P. cauliflora, and two periods (May and August). It was evaluated the survival percentage of grafting, number and size of shoots, after 90 days of the beginning of the experiment. For air layering techniques, it was tested two diameters of branch (1.0-1.5 cm and 2.0-2.5 cm) and two widths of girdling (1.5 cm and 3.0 cm) in P. cauliflora. It was evaluated the rooting percentage, and number and size of roots, 180 days after the beginning of the experiment. It was also tested the period of immersion (5, 10, 15 minutes) in 1,25% sodium hypochlorite solution in the in vitro establishment of shoot and root of the seedlings explants of P. trunciflora. After 45 days of incubation it was evaluated the percentage of contamination and number of shoots and leaves in each explant. It was observed that rooting of wood cutting is dependent of application of IBA, so the biggest rooting percentage (50%) was obtained in biggest concentration of IBA (6000mg L-1) associated with cross section. For the softwood terminal cuttings, the rooting was small (maximum of 10%). Meantime, exist the potential of rooting, and, changes of technique must be tested for maximization. The grafting and the air layering techniques are recommended for jabuticaba tree propagations, because this techniques provide high percentage of plants formation. There is visible compatibility between the three species grafted on rootstocks of P. cauliflora. The utilization of grafts collected from plants in fructification should be avoided, because they reduce the percentage of plants establishment. In air layering techniques, branches with diameter of 2.0 cm provides higher percentage of rooting and the biggest number and size of roots in relation of branches with small diameter (1.0 to 1.5 cm). The utilization of less time in immersion (five minutes) in 1,25% sodium hypochlorite solution is efficient for shoots explants disinfestations of jabuticaba tree seedlings and allows the initial in vitro establishment, providing development of shootings.
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Melhoramento genético de leguminosas de clima temperado - alfafa (Medicago sativa L) e cornichão (Lotus corniculatus L) para aptidão ao pastejo

Perez, Naylor Bastiani January 2003 (has links)
O presente trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar e selecionar genótipos de alfafa crioula e de cornichão cultivar São Gabriel para aptidão ao pastejo. Neste trabalho, foi proposto o termo aptidão ao pastejo em substituição à resistência ao pastejo. O procedimento padrão utilizado no processo de seleção e de caracterização dos genótipos constou de experimentos nos quais as plantas eram submetidas a uma pressão de pastejo elevada e contínua (3-5 cm de altura do resíduo). Houve diferença (P<0,05) na sobrevivência das diferentes populações de alfafa crioula, evidenciando variabilidade para a aptidão ao pastejo, o que não se evidenciou de forma consistente para o cornichão, que, no entanto, apresentou uma maior porcentagem de sobrevivência em comparação com a alfafa. A avaliação das características morfofisiológicas em alfafa não evidenciou diferenças (P>0,05) na contração das coroas, área da coroa e da raiz, área foliar residual e específica, número de hastes por planta, tipo de haste predominante (basilar ou axilar) e reservas orgânicas. Foram evidenciadas diferenças (P<0,05) no comprimento do entrenó e no índice de gemas específicas, proposto neste trabalho como descritor funcional da aptidão ao pastejo. Ensaios em casa-de-vegetação identificaram um marcador morfológico (altura do primeiro nó) nas plântulas de alfafa e de cornichão, capaz de separar precocemente os genótipos contrastantes quanto à aptidão ao pastejo. Foi comparada a efetividade das estirpes de rizóbio recomendadas para o cornichão com a de novas estirpes isoladas, demonstrando a possibilidade de obtenção de estirpes mais eficientes.
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Caracterização fenotípica e genética da resistência parcial à ferrugem da folha em aveia (Avena sativa L.) / Phenotipic and genetic caracterization of partial resistance to crown rust in oat (Avena sativa L.)

Zambonato, Felipe January 2011 (has links)
A ferrugem da folha (Pucccina coronata f. sp. avenae) é a moléstia que mais ocasiona danos de rendimento na cultura da aveia e a resistência genética quantitativa é uma das estratégias mais promissoras em busca de resistências mais duráveis. O objetivo deste trabalho foi de caracterizar fenotípica e geneticamente a resistência parcial à ferrugem da folha em genótipos brasileiros de aveia. Para isso foi efetuado um experimento preliminar com 40 linhagens derivadas de URS 21 no ano de 2009 e um ensaio utilizando as seis gerações básicas do cruzamento URS 21 x URS 22 (P1, P2, F1, F2, RC1, RC2) em 2010. Através da análise do progresso da severidade de plantas individuais foi determinada a área sob a curva de progresso da doença normalizada e corrigida (ASCPDNC) e posteriormente as estimativas genéticas das variâncias e herdabilidades no sentido amplo e restrito além do número de genes governando a característica. Os resultados evidenciam que as 40 linhagens apresentam elevado nível de resistência e não apresentam reduções no rendimento de grãos quando não efetuada a aplicação de fungicida. Por outro lado, o tratamento com fungicida proporcionou incremento no PH e PMG. Os genitores apresentaram valores de ASCPDNC diferentes, a geração F1 apresentou desvios em relação à média dos pais e na F2 a ASCPDN teve distribuição próxima a normal.Foi observada dominância parcial para a resistência apesar dos efeitos aditivos serem importantes e de maior magnitude. As herdabilidades para o caráter foram elevadas o que evidencia facilidade na seleção em gerações precoces e também que o caráter é transmitido para as próximas gerações. Foi estimado que 5 locos controlam o caráter resistência parcial à ferrugem da folha em aveia (Locos A, B, C, D e E), sendo que A e B possuem maior efeito e C, D e E menor efeito sobre o fenótipo. Além disso, o loco A representa um gene de suscetibilidade, sendo que a resistência é obtida na forma recessiva (“aa”) e que possui efeito controlador dos outros três locos. / Crown rust of oat, caused by Puccinia coronata f. sp. avenae, is the most important oat disease in terms of yield reduction. The partial type of genetic resistance is one of the most promising strategies for durable resistance for this disease. The objective of this work was to phenotypically and genotypically characterize the partial resistance to crown rust in Brazilian oat genotypes under field conditions. A preliminary field trial was carried out with 40 inbred lines derived of URS 21 in 2009 and then an experiment using six generations of the cross URS 21 x URS 22 (P1, P2, F1, F2, RC1, RC2) was installed in 2010. After measuring the severity of the disease in plants individually, the Area Under the Disease Progress Curve Normalized and Corrected (AUDPCNC) was determined and then the genetic estimates of the mean, variances, heritabilities (broad and narrow sense) and number of genes governing the characteristic were obtained. The results showed that the progenies of the cross involving the variety URS 21 had high level of resistance and no yield reduction were observed in the absence of fungicide. However, the treatment with fungicide increased the test weight and the 1000 seed weight. The AUDPCNC of the parents were different, the F1 generation showed a deviation from the mid-parent value and the F2 showed a distribution of frequencies close to the normal curve. According to the genetic analysis, there is a partial dominance for the resistance, although the additive effects were important and of high magnitude. The heritability was high, which means that the character is transmissible and selection on early generations is probable efficient. The data suggested five loci controlling the character partial resistance to oat crown ruts (loci A, B, C, D and E), A and B having major effects and C, D and E having minor effects over the phenotype. Furthermore, locus A represents a susceptibility gene, inherited on a recessive form (“aa”) and controlling the other loci.
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Eficiência no uso de nitrogênio ao longo dos estádios fenológicos e utilização de dados públicos na seleção genômica de milho tropical / Nitrogen Use Efficiency along growing stages and public dataset in genomic selection for tropical maize

Morais, Pedro Patric Pinho 24 June 2016 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-02-07T18:11:13Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1482756 bytes, checksum: 020874a6dbc4ae55faeacad2d2f1a8b1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-07T18:11:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1482756 bytes, checksum: 020874a6dbc4ae55faeacad2d2f1a8b1 (MD5) Previous issue date: 2016-06-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Este estudo foi feito com uma população de linhagens de milho tropical, visando inferir sobre a eficiência no uso de nitrogênio (EUN), assim como a aplicação de seleção genômica (GS) nesse conjunto. Para a EUN foram avaliadas 64 linhagens, em duas disponibilidades de adubação nitrogenada (N) (ideal e baixo N), para 16 características. Estas avaliações ocorreram em três estádios fenológicos de oito folhas completamente expandidas (V8), florescimento masculino (VT) e após a maturação fisiológica (MF). Nas análises dos dados foi usado equações de modelos mistos via REML/G-BLUP. Foram observados que há possibilidade de seleção de linhagens superiores quanto a EUN. Mas,os componentes da produtividade não apresentam comportamento diferenciado em função da disponibilidade de N. Características de raiz, reprodutivos e fisiológicas não são atrativas para seleção precoce de genótipos EUN. De forma semelhante, os estádios V8 e VT não se mostraram promissores para avaliação precoce da EUN, devendo essa ser praticada em função da produtividade de grãos. Por outro lado, constatou-se que a seleção indireta para EUN pode ser feita via número de espigas (NE), ou ainda, por meio de índice de seleção considerando NE e peso de espigas (PE). No estudo de GS, visando a aplicação dessa em programas de melhoramento de pequeno porte e, ou então, iniciando suas atividades, foi proposto um panorama hipotético: orçamento limitado e necessidade de acréscimo de variabilidade genética. Para isso, foram definidos 29 conjuntos de população de treinamento (PT)através de painéis de diversidade: USP (painel a ser predito), ASSO e NCRPIS (painéis públicos externos - preditores). Estes conjuntos foram agrupados divididos em quatro cenáriosdistintos, quanto a configuração usada na formação. Nas análisesforam usados 28.260 marcadores SNP para 2748 linhagens, via modelo G-BLUP, para características de altura de planta e de espiga. Os resultados indicaram que é possível o uso de informações de bancos públicos para formação de PT. Além disso, a estrutura populacional influenciou as capacidades preditivas da GS, principalmente quando populações de treinamento e validação (PV) são divergentes. Nos quatro cenários propostos, evidenciou-se que conjuntos demasiadamente pequenos ou grandes não proporcionam as melhores capacidades preditiva para GS. Entretanto, PT compostas por 250 indivíduos, escolhidas de forma otimizada (PTO) a partir de informações de bancos públicos, conduzem a capacidades preditivas satisfatórias (0,32). Contudo, a adição da PV na PTO, é o cenário que conduz às maiores capacidades preditivas (0,59). Sendo seu uso, sempre que possível, o recomendado. / This study was proceeded with a population of tropical maize inbred lines, aiming to infer about the nitrogen use efficiency (NUE) as well as the application of genomic selection (GS) in this set. For EUN, 64 inbred lines were evaluated in two nitrogen (N) fertilizing conditions (optimum and low N), taking into account 16 traits. These evaluations were performed in three phenological stages eight fully expanded leaves (V8), tasseling stage (VT) and after physiological maturity (MF). Data analysis was performed using mixed models via REML/G-BLUP. It was observed that there is a possibility of selecting inbred lines for NUE, and the yield components do not show differential behavior according with the N condition. Root, reproductive and physiological traits are not attractive for early selection in efficient nitrogen use genotypes. Similarly, V8 and VT stages do not appear promising for early NUE estimation, it has to be done taking into account the yield. Indirect selection for NUE can be done via number of ear (NE), or with selection index considering NE and ear weight (PE). Forthe GS study, aiming to use GS in small breeding programs and, or, starting its activities, a hypothetical scenariowas proposed: a limited budget and the need for genetic variability. For that,29 training sets (PT) were developed through diversity panels: USP (panel to be predicted), ASSO and NCRPIS (external public panels - predictors); they were clustered into four scenarios with different PT. In the analysis 28.260 SNP markers for 2748 inbred lines were used, via model G-BLUP for plant height and ear height. Through the study it was found that it is possible to use information from public banks for PT formation. The population structure has the capacity of affecting GS predictive abilities, especially when training set and validation (PV) hold low genetic relationship. In the four proposed scenarios, it was shown that too small or large sets do not provide best predictive abilities. But, training sets with 250 individuals, via use of optimized training set (PTO) from public dataset banks, is enough for getting estimates up to 0.32. However, adding PV into PTO is the best scenario, it got predictive ability estimates up to 0.59.It should be used whenever possible.
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Caracterização do germoplasma e estudo da compatibilidade interespecífica em Passiflora spp / Germplasm caracterization and interspecific compatibility studies in Passiflora spp

Soares, Wellington dos Santos 18 February 2016 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-02-10T17:32:23Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1954802 bytes, checksum: d53487d7b115bb1a5241de39e1acdab8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-10T17:32:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1954802 bytes, checksum: d53487d7b115bb1a5241de39e1acdab8 (MD5) Previous issue date: 2016-02-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A ampla variabilidade de Passiflora no Brasil é algo que vem sendo cada vez mais explorado, uma vez que várias espécies silvestres possuem alelos de interesse ao melhoramento, responsáveis por características como longevidade, adaptação às condições climáticas adversas, período de florescimento ampliado, maior concentração de componentes químicos de interesse para indústria farmacêutica e cosmética e resistência a doenças. Assim, o melhoramento do maracujazeiro pode seguir várias vertentes em função da região e da parte da planta a ser considerada, assim como flor e folha na área ornamental e medicinal, o fruto para indústria e consumo in natura, sendo esta última a mais habitual em programas de melhoramento da espécie, visando aumento da produtividade, a qualidade do fruto e resistência a doenças. Todavia, antes de se iniciar qualquer programa de melhoramento de maracujazeiro, primeiramente deve ser realizada a caracterização do germoplasma, sendo este um pré-requisito indispensável, para que seja feito o manuseio correto da variabilidade genética disponível dentro do programa de melhoramento. Os caracteres de interesse têm sido transferidos de uma espécie para outra mediante o processo de hibridação por cruzamentos interespecíficos, seguido de análise da segregação na progênie. Contudo tal processo nem sempre é viável, pois entre algumas espécies existem impedimentos no processo de fecundação e formação de sementes viáveis. Dentro deste contexto, os objetivos do trabalho foram realizar a caracterização morfológica e verificar a viabilidade da hibridação interespecífica (barreiras e desenvolvimento do tubo polínico) entre espécies de maracujá. O material vegetal foi composto por seis espécies de maracujá num total de 189 plantas, sendo realizada a caracterização morfológica com base em lista com 23 caracteres definidos pelo MAPA. Posteriormente foram realizadas análises de variância, herdabilidade (h 2 ) e teste de médias. Paralelamente, sete plantas foram escolhidas ao acaso e utilizadas para realização de cruzamentos interespecíficos como genitores femininos e masculinos. Tais plantas, ainda foram autofecundadas para evidenciar o mecanismo de autoincompatibilidade nas espécies. Foram avaliadas a percentagem de pegamento entre as espécies e dentro de cada espécie. Para evidenciar o desenvolvimento do tubo polínico no processo de fecundação, foi realizada uma análise histoquímica do estigma. Os estigmas foram coletados após 24 horas da realização do cruzamento. Para a caracterização, os descritores avaliados foram significativos com exceção do diâmetro do caule e diâmetro dos ramos. Em relação a caracterização do germoplasma, as análises de variâncias revelaram diferenças significativas, dentro de cada espécies para quase todas as características, evidenciando presença de variabilidade genética. Em relação a herdabilidade (h 2 ), que permite prever a possibilidade de sucesso na seleção refletindo a dimensão da variação fenotípica que pode ser herdada, apenas as espécies P. quadrangularis Linn (44.76), P. alata Curtis (46) e P. edulis Sims (33.17) apresentaram valores abaixo de 50%. Nas demais espécies os valores obtidos para h 2 mostram-se acima de 50%, indicando alta variabilidade genética. No que condiz aos descritores, o diâmetro do caule, é uma característica que pode ser descartada, uma vez que para nenhuma das espécies, houve significância. O tamanho da folha é altamente influenciado pela presença de lóbulos na espécie. Os carácteres morfológicos avaliados servirão como importantes ferramentas na avaliação de progênies vindas de cruzamentos interespecíficos. Posteriormente, avaliando os cruzamentos interespecíficos, pôde-se constatar que, entre as espécies ocorre incompatibilidade unilateral, sendo necessário a escolha de qual espécies serão utilizadas como genitor feminino ou masculino. Desse modo ocorre variação na taxa de pegamento não somente entre a espécies, mas dentro da espécie, sendo necessário utilizar um maior número de plantas. Nesse trabalho a viabilidade de cruzamento foi verificada entre as espécies: P. gibertii Brown x P. mucronata Lam.; P. edulis x P. cincinnata Mast; P. alata Curtis x P. mucronata Lam.; P. edulis x P. mucronata Lam.; P. gibertii Brown x P. alata Curtis; P. alata Curtis x P. gibertii Brown; P. alata Curtis x P. cincinnata Mast; P. cincinnata Mast x P. edulis; P. gibertii Brown x P. edulis; P. gibertii x P. cincinnata Mast; e P. alata Curtis x P. edulis. / The wide variability of Passiflora in Brazil is something that has been increasingly exploited, since many wild species have different alleles of interest to improve as longevity, adaptation to adverse weather conditions, extended flowering period, higher concentration of chemical components interest for pharmaceutical and cosmetic industry and disease resistance. Thus, the improvement of passionflower can follow various aspects depending on the region and part of the plant to be considered, as well as flower and leaf in ornamental and medicinal area, the fruit for industry and fresh consumption, the latter being the most common in breeding programs of the species, aiming at increasing productivity, fruit quality and disease resistance. However, before starting any passion fruit breeding program, it must first be carried out to characterize the germplasm, which is a prerequisite for it to be done the correct handling of the genetic variability available within the breeding program. Thus the traits of interest have been transferred from one species into another through the process of interspecific hybridization junctions, followed by analysis of the segregation in the progeny. However this process is not always feasible because some species there are impediments to fertilization process and formation of viable seed. Within this context, the objectives were to perform morphological and verify the viability of interspecific hybridization (barriers and development of the pollen tube) between passion fruit species. The plant material was composed of six species of passion fruit in a total of 189 plants, being held morphological characterization based on the list with 23 characters defined by MAPA. Subsequently were performed analyzes of variance, heritability (h 2 ) and mean test. At the same time, seven plants were chosen at random and used to perform interspecific crosses as female and male parents. Such plants were also selfed to highlight the self-incompatibility mechanism in species. the percentage of fixation between species and within species were evaluated. To show the development of the pollen tube in the fertilization process, immune histochemical analysis of stigma was performed. The stigmas were collected 24 hours after completion of the cross. To characterize the evaluated descriptors were significant except stem diameter and diameter of branches. For characterization of germplasm, the summaries of the analysis of variance revealed significant differences within each species for almost all characteristics showing presence of genetic variability. Regarding the heritability (h2), which allows one to predict the likelihood of success in the selection reflecting the size of the phenotypic variation that can be inherited, only the species P. quadrangularis Linn (44.76), P. alata (46) and P. edulis (33.17) had values below 50%. In other species, the values obtained are shown h2 above 50%, indicating high genetic variability. In that matches the descriptors, stem diameter, it is a feature which can be ruled out, since for either species, there was significant. The size of the sheet is highly influenced by the presence of lobes in the species. The assessed morphological characters will serve as important tools in evaluating progenies coming from interspecific crossings. Later, assessing the interspecific crosses it could be seen that, between species occurs unilateral incompatibility, requiring the choice of which species will be used as female or male parent. Thus there is a variation in the rate of fruit set not only between species, but within a species, it is necessary to use a larger number of plants. In this work the intersection of viability was observed between species: P. gibertii x P. mucronata Lam .; P. edulis x P. cincinnata Mast; P. alata x P. mucronata Lam .; P. edulis x P. mucronata Lam .; P. gibertii x P. alata; P. alata x P. gibertii; P. alata x P. cincinnata Mast; P. cincinnata Mast x P. edulis; P. gibertii x P. edulis; P. gibertii P. cincinnata Mast; and P. alata P. edulis.
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Diversidade genética e análise de dialelo para escolha de progenitores no melhoramento de Coffea arabica / Genetic diversity and diallel analysis for parent selection in Coffea arabica breeding

Correia, Alexsandra Medeiros 04 August 2016 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-02-13T09:34:30Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 715056 bytes, checksum: 716a63cd115d7d16af09417ac8b3ed71 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-13T09:34:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 715056 bytes, checksum: 716a63cd115d7d16af09417ac8b3ed71 (MD5) Previous issue date: 2016-08-04 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os programas de melhoramento genético do cafeeiro têm como principal objetivo a obtenção de cultivares com características agronômicas e tecnológicas de interesse, qualidade superior de bebida e resistência a pragas e doenças, aliadas a elevado potencial produtivo. Uma ferramenta útil para auxiliar a seleção de progenitores para os programas de melhoramento é o estudo da diversidade genética de cafeeiros, usando marcadores moleculares. Outra metodologia utilizada é o cruzamento dialélico. Dialelos têm sido aplicados para a obtenção de informações sobre o potencial genético de cultivares ou linhagens, bem como suas capacidades de combinação, que resultem em híbridos produtores de populações segregantes promissoras. Assim, o presente trabalho teve como objetivo aplicar essas duas metodologias, a análise da diversidade genética e o estudo de um dialelo circulante, para auxiliar os programas de melhoramento de Coffea arabica. Marcadores moleculares também foram utilizados para certificação de cruzamentos de interesse para o melhoramento. Dessa forma, 12 marcadores moleculares do tipo SSR (Simple Sequence Repeats) foram utilizados para acessar a diversidade genética de 76 potenciais progenitores e para a certificação de 48 cruzamentos de interesse. A análise da matriz de distância genética obtida e os dendrogramas resultantes permitiram identificar que os cruzamentos Catiguá MG2 x Acauã, Catiguá MG2 x Topázio MG 1190 , Catiguá MG2 x Arara, Catiguá MG2 x Bourbon Amarelo MG 0009 e Catiguá MG2 x Tupi Ferrero, são os que otimizam a distância genética entre os progenitores. Com os marcadores moleculares, foi possível identificar sete cafeeiros que não eram híbridos e sim resultantes de autofecundação do progenitor feminino. Na análise do dialelo circulante foram avaliados oito progenitores e 12 híbridos, com base em 10 características morfoagronômicas. Foram estimadas as capacidades gerais e específicas de combinação, bem como as médias dos progenitores, dos híbridos e dos híbridos preditos para cada característica. Para as principais características (Vigor Vegetativo e Produção), os cruzamentos que devem ser priorizados são entre os progenitores Catiguá MG2 e UFV 311-63 e entre Catiguá MG2 e Acauã Novo, com base na estimação dos parâmetros genéticos. Foi realizada uma análise de correlação para estudar a relação entre distância genética com base nos marcadores moleculares, diversidade genética fenotípica, média fenotípica e capacidade de combinação das plantas avaliadas no dialelo. Verificou-se uma maior correlação entre a distância genética molecular, média fenotípica das características avaliadas e capacidade de combinação quando comparada com a diversidade fenotípica. Além disso, as características mais fortemente correlacionadas com a diversidade genética molecular foram Vigor vegetativo e Produção. / The main objectives of coffee breeding programs is to obtain cultivars with good agronomic traits, better cup quality and resistance to pests and diseases combined with high yield potential. A useful tool to assist the selection of promising parents for these programs is the study of genetic diversity using molecular markers. Another method used is the diallel cross. Diallel shave been applied to obtain information on the genetic potential of cultivars, as well as its combination capacities that result in hybrids of promising segregating populations. Thus, this study aimed to apply these two methods, the analysis of genetic diversity and circulant diallel to assist Coffea arabica breeding programs. Molecular markers were also used for certification of hybrids. Twelve SSR (Simple Sequence Repeats) molecular markers were used to assess the genetic diversity of 76 potential parents and certificate 48 potential hybrids. The analysis of genetic distance matrix and the dendrograms showed that Catiguá MG2 x Acauã, Catiguá MG2 x Topazio MG 1190, Catiguá MG2 x Arara, Catiguá MG2 x Bourbon Amarelo and Catiguá MG2 x Tupi Ferrero are the crosses that optimize the genetic distance between parents. With molecular markers data, seven potential hybrids showed to be result of self-pollination and the remaining 41 plants were identified as true hybrids. The circulant diallel analyses were assessed with eight parents and 12 hybrids, using ten agronomic traits. The general and specific combining abilities were estimated, as well as the means of the parents, hybrids and predicted hybrids for each trait. For the main agronomic trait (vegetative vigor and yield), crossings that should be prioritized are between the parents Catiguá MG2 and UFV 311-63, and between Catiguá MG2 and Acauã Novo based on the genetic parameters estimation. A correlation analysis was performed to study the relationship between molecular genetic distance, phenotypic genetic diversity, phenotypic mean and combining ability of the plants evaluated in diallel. There was a greater correlation between genetic distance and phenotypic mean of the traits evaluated and combining ability, when compared to phenotypic distance. Furthermore, the most strongly correlated traits with genetic diversity were vegetative vigor and yield.
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Caracterização de genótipos de soja quanto à eficiência de uso de fósforo / Characterization of soybean genotypes to phosphorus use efficiency

Silva, Frederico Dellano Souza 01 September 2016 (has links)
Submitted by Gustavo Caixeta (gucaixeta@gmail.com) on 2017-03-06T18:13:06Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 391609 bytes, checksum: 827c54a2f79546afffd9ac3ddb0515ee (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-06T18:13:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 391609 bytes, checksum: 827c54a2f79546afffd9ac3ddb0515ee (MD5) Previous issue date: 2016-09-01 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A economia de fertilizantes fosfatados, de modo particular em solos tropicais, passa pela utilização de genótipos de plantas com maior eficiência de uso de fósforo (P). Os objetivos deste trabalho foram identificar genótipos de soja eficientes no uso de P, identificar a importância relativa dos componentes da eficiência de uso de P (EUP) para baixa e alta disponibilidade de P no solo e avaliar a diversidade genética entre os genótipos com base em características relacionadas com EUP. Foram utilizados vinte e sete genótipos de soja avaliados em duas condições contrastantes na disponibilidade de P (baixa e alta disponibilidade). Utilizou-se o delineamento inteiramente casualizado, em esquema fatorial com quatro repetições. As eficiências de uso (EUP), absorção (EAP) e utilização (EUtP) foram mensuradas, bem como as seguintes características relacionadas às mesmas: crescimento diário (CD), matéria fresca de parte aérea (MFPA), de raiz (MFR), e total (MFT), matéria seca de parte aérea (MSPA), de raiz (MSR) e total (MST), volume de raíz (VR), relação parte aérea/raíz (RPAR). Nesse trabalho foi detectada interação, genótipos x níveis de P, significativa, e o desdobramento para cada ambiente (baixo e alto nível de P) indicou a existência de variabilidade entre genótipos. Em condições de baixa disponibilidade de P, verificou-se que os valores de eficiência de uso são maximizados para genótipos de soja. Principalmente nesse ambiente, a eficiência de utilização foi o componente mais importante da eficiência de uso de P. Na condição de alta disponibilidade de P, o genótipo de soja NS7505IPRO destacou-se como eficiente no uso de P, enquanto que na condição de baixa disponibilidade, destacaram-se os genótipos AS3680IPRO e M7110IPRO. Os genótipos eficientes no uso de P na condição de baixa disponibilidade, AS3680IPRO e M7110IPRO, podem ser utilizados para geração de populações segregantes com uma elevada frequência de genes favoráveis à eficiência de uso de P. / The economy of phosphate fertilizers, particularly in tropical soils, involves the use of plant genotypes with higher phosphorus (P) use efficiency. The objectives of this study were to identify efficient soybean genotypes in P use, identify the relative importance of the P use efficiency (PUE) components for low and high availability of P in the soil and the genetic diversity among genotypes based on characteristics related to PUE. Twenty seven soybean genotypes used were evaluated in two contrasting conditions in the P availability (low and high availability). A completely randomized design in a factorial design, with four replications, was used. Use efficiency (PUE), absorption (PAE) and use (PUtE) were measured and the following characteristics related to the same: daily growth (DG), shoot fresh weight (SFW), root fresh weight (RFW) and total plant fresh weight (TFW), shoot dry weight (SDW), root dry weight (RDW) and total plant dry weight (TDW), root volume (RV), shoot-to-root ratio (RSR). In this work, was detected interaction genotype x P levels, significant, and the split for each environment (low and high P) indicated the existence of variability among genotypes. In low P condition, was found that the use efficiency values are maximized for soybean genotypes. Especially in this environment, PUtE was the most important component of PUE. In high P condition, the availability the soybean genotype NS7505IPRO stood out as efficient in the use of P, while in the low availability condition, stood out the AS3680IPRO and M7110IPRO genotypes. The efficient use of P genotypes in the low availability condition, and AS3680IPRO M7110IPRO can be used to generate segregating populations with a high frequency of favorable genes of PUE.
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Mapeamento de QTL ́S para características de qualidade da madeira e de crescimento em híbridos (Eucalyptus grandis x Eucalyptus urophylla) / Use of RAPD molecular markers for mapping and identification of QTL ́S related with the expression of wood quality characteristics in hybrids (Eucalyptus grandis x Eucalyptus urophylla)

Rocha, Rodrigo Barros 16 February 2004 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T16:58:58Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 877440 bytes, checksum: 7786ed59457e565fc3880bd95630df06 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T16:58:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 877440 bytes, checksum: 7786ed59457e565fc3880bd95630df06 (MD5) Previous issue date: 2004-02-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O presente trabalho teve como objetivo a caracterização e identificação de QTL ́s para características de crescimento e de qualidade da madeira em híbridos de eucalipto derivados do cruzamento E.grandis e E. urophylla. Para isto foi desenvolvido um mapa de ligação RAPD, pouco saturado, para os híbridos (LOD = 3 e r = 0,40) contendo 52 marcas e 12 grupos de ligação. Foram utilizados 90 indivíduos de população F1, “pseudotestcross” e 176 marcadores RAPD, a partir da amplificação com 63 oligonucleotídeos decâmeros de seqüência arbitrária. As características de qualidade da madeira densidade; rendimento de polpa; teor de extrativos; teor de lignina insolúvel, teor de lignina solúvel determinadas em espectrofotômetro de infravermelho e as características de crescimento, diâmetro altura do peito (D.A.P.); altura total, altura comercial; foram avaliadas quanto a presença de QTL ́s. As análises de QTL foram feitas utilizando os testes: de segregação do χ 2 , mapeamento por marca simples, mapeamento por intervalo simples e mapeamento por intervalo composto. Todas as análises geraram resultados consistentes que indicam 9 QTL ́s relacionados com a expressão de 7 das 8 características avaliadas, respectivamente: 1 QTL para densidade, 1 QTL para rendimento de polpa e 2 QTL ́s para teor de extrativos confirmados pelas metodologias de mapeamento por intervalo simples e composto e 1 QTL para teor de lignina solúvel, 2 QTL ́s para teor de lignina insolúvel, 1 QTL para D.A.P. e 1 QTL para altura total confirmados apenas pela metodologia de mapeamento por intervalo composto. A sobreposição de QTL ́s em determinadas regiões dos grupos de ligação pode ser resultado da existência de regiões do genoma mais importantes para o crescimento e desenvolvimento da planta sugerindo a existência de blocos gênicos de maior efeito relacionados com a regulação e controle das características estudadas. / The present work aimed to characterize and identify QTL ́s for wood quality and growth characteristics in E. grandis x E. urophylla hybrids. For this purpose a RAPD linkage map was developed for the hybrids (LOD = 3 and r = 0.40), containing 52 markers and 12 linkage groups. For the map development, 176 RAPD markers from 63 random primers were used in a F1 full siblings population of 90 plants. Characteristics related to wood quality such as: density, cellulose pulp yield, percentage of extractives, percentage of insoluble lignin, percentage of soluble lignin, determined in a near infrared spectrophotometer - NIRS and the growth characteristics: circumference at breast height (CBH), total height, and commercial height were used in the QTL analyses. QTL’s analyzes were performed using chi-square tests, single-marker analysis, interval mapping and composite interval mapping analyses. All approaches led to the identification of similar QTL ́s, respectively: one QTL associated with wood density, two for cellulose pulp yield and two for percentage of extractives, were detected and confirmed by the interval mapping and composite interval mapping. One QTL associated with percentage of soluble lignin, two for percentage of insoluble lignin, one for C.B.H. and one for total height confirmed only by the composite interval mapping methodology. The QTL ́s overlapping can be the result of major genes involved in the regulation and control of the growth traits by epistatic interactions with other genes.
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Seleção de progênies, estudo de diversidade genética e correlações em progênies de meio-irmãos de pupunheira para produção de palmito / Progenie selection, genetic diversity and correlation studies in half-sibs progenies of peach palm for heart of palm production

Rodrigues, Haroldo Silva 04 April 2017 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-09-01T13:24:58Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 695461 bytes, checksum: e1a93b07639fd203a2b6bf71faf6e3f1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-01T13:24:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 695461 bytes, checksum: e1a93b07639fd203a2b6bf71faf6e3f1 (MD5) Previous issue date: 2017-04-04 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / A falta de sementes melhoradas de pupunheira para produção de palmito é um grande impedimento para o aumento da produtividade e da qualidade desse produto. Visando fornecer material melhorado, a Embrapa vem realizando um trabalho de melhoramento de pupunheira para produção de palmito visando o norte do país. Além de fornecer sementes melhoradas, espera-se alcançar melhorias sócias e ambientais, principalmente para pequenos produtores. Foi instalado na Embrapa Amazônia Ocidental um experimento em delineamento de blocos casualisados, composto por 72 progênies de pupunheira e 36 repetições. Esse experimento foi iniciado em 2006 e foi analisado por cinco anos consecutivos. As variáveis mensuradas foram peso do palmito basal, peso do palmito apical, que compreende ao palmito de segunda, peso do palmito, correspondente ao palmito de primeira, número de toletes de 9 cm de comprimento, diâmetro do palmito e comprimento do palmito. Foram realizadas análises visando seleção das melhores progênies e dos melhores indivíduos via modelos mistos, utilizando REML / BLUP, análise de repetibilidade e diversidade genética, além de estudos de correlações e análise de correlações canônicas e rede de correlações entre caracteres relacionados à massa produzida e caracteres associados ao volume de palmito. Este estudo revelou a superioridade de algumas progênies, destacando-se a progênie 157, que segundo o estudo de diversidade, pode ser utilizada como base para futuros cruzamentos. Por outro lado, o estudo de repetibilidade indica que grande número de medições é necessário para obtenção de medidas confiáveis. Existe alta correlação entre algumas variáveis, sendo possível a obtenção de plantas de baixo porte e com grande potencial produtivo, facilitando a colheita do palmito. / The lack of improved seeds of peach palm for palmito production is a major impediment to increasing the productivity and quality of this product. In order to supply improved material, Embrapa has been carrying out a work to breed peach palm for palmito production in the north of the country. In addition, to providing improved seeds, it is expected to achieve social and environmental improvements, especially for small producers. It was installed in Embrapa Western Amazon an experiment in a randomized block design, composed of 72 progenies of peach palm and 36 replications. This experiment was started in 2006 and analyzed for five consecutive years. The variables measured are heart of palm basal weight, heart of palm apical weight, and heart of palm weight, billets number, heart of palm diameter, and heart of palm length. Analyzes were carried out in order to select the best progenies and the best individuals using mixed models, trough REML / BLUP, analysis of repeatability and genetic diversity, as well as studies of correlations, analysis of canonical correlations and correlation between characters related to mass produced and characters Associated with the volume of palm heart. This study revealed the superiority of some progenies, highlighting the progeny 157, which according to the study of diversity, can be used as a basis for future crosses. On the other hand the repeatability study indicates that large numbers of measurements are required to obtain reliable measurements. There is a high correlation between some variables, being possible to obtain plants of low size and with great productive potential, facilitating the harvest of the palm heart.

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