Orientador: Sergio Nascimento Stampar / Resumo: O estudo da conectividade entre as populações é de grande relevância para entender como variantes ambientais podem afetar estes eventos, reconhecendo os padrões de estrutura genética e filogeográficos. Grande parte das espécies marinhas possuem, ao menos, uma fase larval com alto potencial de dispersão, onde possivelmente possa resultar numa população homogênea e com maior conectividade, comparado a outros grupos de animais. Para a compreensão dos padrões variáveis, as análises moleculares trazem informações importantes sobre a variabilidade genética, evolução e mudanças demográficas na história. Por este motivo torna-se cada vez mais importante o uso destes dados em pesquisas que abordam conceitos populacionais. Os acompanhamentos dos cenários em organismos planctônicos ainda são escassos, mesmo com sua grande abundância no ambiente marinho. Sob o cenário da representativa espécie de medusa, endêmica do Atlântico Sul Ocidental, Lychnorhiza lucerna Haeckel 1880 (Scyphozoa; Rhizostomeae) diante de lacunas ainda existentes sobre a estrutura populacional foi analisado como as populações estão se comportando geneticamente ao longo de toda sua distribuição e para isto foram utilizados os marcadores COI, ITS-1 e 2 para inferir a divergência intra e inter-populacional. Os resultados obtidos indicaram um padrão histórico de alta conectividade entre as subpopulações de Lychnorhiza lucerna evidenciando a existência de uma Metapopulação em grande escala. / Abstract: The study of connectivity between populations is relevant to understand the environmental diversity impact on the populations, acknowledging both genetic structural and phylogeographic patterns. Most of the marine species exhibit at least one larval stage with a high dispersal potential that possibly results in a homogeneous population with a wide connectivity when compared to other groups of animals. Molecular analysis provide essential informations concerning the genetic variability, evolution and demographic changes along the history supporting the recognition of variable patterns. Thus, it is essential the use of these data in researches approaching population concepts. Even though planktonic organisms are very abundant in the marine environment, studies regarding the scenario comprising these organisms are scarce. Owing to existing gaps about that, populations of the remarkable medusa specie endemic in the South Western Atlantic, Lychnorhiza lucerna Haeckel 1880 (Scyphozoa; Rhizostomeae), were genetically assessed along the geographic distribution known . For this were used COI and ITS 1-2 molecular markers to conclude about intrapopulation/ interpopulation divergence. The results obteined indicated a historic pattern of high connectivity between subpopulations of Lychnorhiza lucerna evidencing a metapopulation existence on a large scale. / Mestre

O presente trabalho teve como objetivo conhecer os fatores que propiciam as grandes densidades ecológicas de capivaras, através da comparação das dinâmicas populacionais de dois agrupamentos, em diferentes localidades do município de Pirassununga, SP (Campus Administrativo da Universidade de São Paulo – USP/Pirassununga e o Centro de Pesquisa e Gestão de Recursos Pesqueiros e Continentais – CEPTA/Ibama), para que futuramente seja possível propor uma metodologia de manejo que promova o controle populacional dessa espécie no Estado de São Paulo. Para tanto, foi realizado o monitoramento populacional de ambos agrupamentos durante 15 meses, através da contagem direta dos animais, constituindo na principal fonte de informação para determinar as dinâmicas populacionais. Adicionalmente realizaram-se as capturas dos indivíduos de ambas populações pelo uso de bretes fixos, para que fossem feitas as pesagens, sexagens e marcações eletrônicas pelo uso de microchips e assim, conhecer a distribuição etária, bem como a proporção entre sexos. O uso de ceva no interior dos bretes, para a atração dos animais, possibilitou a realização das contagens diretas e das capturas e recapturas. Para a análise das dinâmicas populacionais foram realizadas as comparações descritivas e estatísticas das densidades ecológicas das populações e das respectivas classes etárias, além do cálculo da taxa de crescimento das mesmas. A alimentação em ceva apresentou-se influenciada pela hierarquia de dominância social, o que fez com que apenas as parcelas dominantes fossem capturadas. Percebeu-se, através das capturas, que o número de fêmeas apreendidas foi superior ao de machos nas parcelas dominantes das duas populações. Por meio das observações foram detectados indivíduos satélites e subagrupamentos, cuja ocorrência pode caracterizar um sistema biológico de metapopulação. A comparação descritiva e estatística das densidades ecológicas das populações, bem como a comparação das taxas de crescimento revelaram superioridade populacional do agrupamento do CEPTA/Ibama em relação ao Campus da USP/Pirassununga, provavelmente pelo maior número de picos de acasalamentos observados, os quais possivelmente são influenciados pelo tipo de habitat antropizado e abundante em recursos hídricos presente no CEPTA/Ibama. / The present research aimed the knowledge of the factors that allow the high ecological densities of capybaras through the population dynamics comparison of two capybara groups in the district of Pirassununga, SP (Campus Administrativo da Universidade de São Paulo – USP/Pirassununga and Centro de Pesquisa e Gestão de Recursos Pesqueiros e Continentais – CEPTA/Ibama), intending to propose forward a management methodology for capybara population control in the State of São Paulo. The populations monitoring was carried out through direct count of animals during 15 months, which played the main role to determine the population dynamics. Fixed traps were used to allow the weightings, sex definitions and identification through microchips, and also to know the age distribution and sex ratios. It was used bait inside the traps to attract animals and thus make direct counting and capture possible. To analyze population dynamics it was used the population ecological densities comparisons (statistically and descriptively) and also their rates of increase. It was detected social dominance hierarchy inside the traps, thus only the dominant part of population could be caught. Females represented the majority among captured animals. Satellites individuals and new groups were seen during observations and their existence might characterize a biological system of metapopulation. The descriptive and statistic comparisons of population ecological densities, as well as their rates of increase showed population superiority of CEPTA/Ibama’s group probably for its bigger reproduction effort detected, which possibly receives influence of anthropogenic and water abundant habitats of CEPTA/Ibama.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:31:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 972.pdf: 784590 bytes, checksum: bd3b6cf7e5feb50b5d709be904d4c669 (MD5) Previous issue date: 2006-03-24 / Onças-pardas (Puma concolor) são animais ameaçados devido à fragmentação, perda de habitats e ao crescente conflito com populações humanas em expansão. Utilizamos um método não invasivo de estudo, a análise genética de fezes, para determinar a presença e estimar o número populacional mínimo de onças-pardas (Puma concolor) em duas Unidades de Conservação ao nordeste do estado de São Paulo, Brasil: a Estação Ecológica do Jataí (EEJ) e o Parque Estadual do Vassununga (PEV). A partir da amplificação de uma porção do gene citocromo b do genoma mitocondrial e da comparação deste fragmento com seqüências de referência de outros carnívoros presentes na região, pudemos diagnosticar a espécie que originalmente depositou as fezes e, por meio de um painel de 4 loci de microssatélites, individualizar cada uma das amostras coletadas em campo. Dentre as 20 fezes coletadas, diagnosticamos 9 como realmente pertencentes à espécie e 2 como provenientes de jaguatiricas (L. pardalis), espécie simpátrica à P. concolor. Determinamos a presença de ao menos 9 indivíduos de P. concolor na região, e plotando os pontos de coleta das fezes sobre uma imagem de satélite, verificamos a ocorrência de 3 indivíduos na EEJ, 4 no PEV e dois nos entornos. A probabilidade de identidade (PID) foi de 0,0001 e a probabilidade de não detecção alélica (allelic dropout) de 10,6%. A determinação da presença, a estimativa do tamanho populacional mínimo e a distribuição de P. concolor nas áreas da EEJ e do PEV determinadas neste estudo podem fornecer subsídios para a implantação dos planos de manejo e conservação da espécie, assim como dessas áreas e de seus entornos.

Submitted by Stefany Archangelo de Angelis null (stefany.archangelis@hotmail.com) on 2018-03-13T14:41:37Z No. of bitstreams: 1 VERSÃO ficha catalografica_DISSERTAÇÃO STEFANY_OK.pdf: 2022875 bytes, checksum: 3f24d2ef22761a31bf2d4ab1b1d18584 (MD5) / Rejected by Disleide Silvia Valerio Gounella null (disleide@clp.unesp.br), reason: Boa tarde. Favor corrigir e completar os itens: - O nome do arquivo deve ser o título do trabalho; - Incluir palavras-chaves em inglês; - Incluir abstract; - Folha de aprovação com data. - As referência bibliográficas foram feitas baseadas nas Normas da ABNT? ABS. Disleide Silvia Valerio Gounella Bibliotecária CLP - São Vicente Fone: (13)3569-7154 Mailto: disleide@clp.unesp.br skype: disleidesilviavaleriogounella on 2018-03-15T18:32:55Z (GMT) / Submitted by Stefany Archangelo de Angelis null (stefany.archangelis@hotmail.com) on 2018-03-16T01:25:44Z No. of bitstreams: 1 Conectividade Populacional de Lychnorhiza lucerna (Cnidaria; Scyphozoa) no Atlântico Sul.pdf: 3463809 bytes, checksum: 5c128c22ffece0245d8284e53a0c5430 (MD5) / Rejected by Disleide Silvia Valerio Gounella null (disleide@clp.unesp.br), reason: xxxxxxxxxxxxxxxxxxxx on 2018-03-19T20:05:54Z (GMT) / Submitted by Stefany Archangelo de Angelis null (stefany.archangelis@hotmail.com) on 2018-03-19T20:07:48Z No. of bitstreams: 1 Conectividade Populacional de Lychnorhiza lucerna (Cnidaria; Scyphozoa) no Atlântico Sul.pdf: 3463809 bytes, checksum: 5c128c22ffece0245d8284e53a0c5430 (MD5) / Approved for entry into archive by Disleide Silvia Valerio Gounella null (disleide@clp.unesp.br) on 2018-03-19T20:26:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 angelis_sa_me_svic.pdf: 3463809 bytes, checksum: 5c128c22ffece0245d8284e53a0c5430 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-19T20:26:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 angelis_sa_me_svic.pdf: 3463809 bytes, checksum: 5c128c22ffece0245d8284e53a0c5430 (MD5) Previous issue date: 2018-02-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O estudo da conectividade entre as populações é de grande relevância para entender como variantes ambientais podem afetar estes eventos, reconhecendo os padrões de estrutura genética e filogeográficos. Grande parte das espécies marinhas possuem, ao menos, uma fase larval com alto potencial de dispersão, onde possivelmente possa resultar numa população homogênea e com maior conectividade, comparado a outros grupos de animais. Para a compreensão dos padrões variáveis, as análises moleculares trazem informações importantes sobre a variabilidade genética, evolução e mudanças demográficas na história. Por este motivo torna-se cada vez mais importante o uso destes dados em pesquisas que abordam conceitos populacionais. Os acompanhamentos dos cenários em organismos planctônicos ainda são escassos, mesmo com sua grande abundância no ambiente marinho. Sob o cenário da representativa espécie de medusa, endêmica do Atlântico Sul Ocidental, Lychnorhiza lucerna Haeckel 1880 (Scyphozoa; Rhizostomeae) diante de lacunas ainda existentes sobre a estrutura populacional foi analisado como as populações estão se comportando geneticamente ao longo de toda sua distribuição e para isto foram utilizados os marcadores COI, ITS-1 e 2 para inferir a divergência intra e inter-populacional. Os resultados obtidos indicaram um padrão histórico de alta conectividade entre as subpopulações de Lychnorhiza lucerna evidenciando a existência de uma Metapopulação em grande escala. / The study of connectivity between populations is relevant to understand the environmental diversity impact on the populations, acknowledging both genetic structural and phylogeographic patterns. Most of the marine species exhibit at least one larval stage with a high dispersal potential that possibly results in a homogeneous population with a wide connectivity when compared to other groups of animals. Molecular analysis provide essential informations concerning the genetic variability, evolution and demographic changes along the history supporting the recognition of variable patterns. Thus, it is essential the use of these data in researches approaching population concepts. Even though planktonic organisms are very abundant in the marine environment, studies regarding the scenario comprising these organisms are scarce. Owing to existing gaps about that, populations of the remarkable medusa specie endemic in the South Western Atlantic, Lychnorhiza lucerna Haeckel 1880 (Scyphozoa; Rhizostomeae), were genetically assessed along the geographic distribution known . For this were used COI and ITS 1-2 molecular markers to conclude about intrapopulation/ interpopulation divergence. The results obteined indicated a historic pattern of high connectivity between subpopulations of Lychnorhiza lucerna evidencing a metapopulation existence on a large scale.

Orientador: Ana Maria Lima de Azeredo-Espin / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-07T07:13:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Torres_TatianaTeixeira_D.pdf: 5404919 bytes, checksum: 33cdb805f7c8934dd855ce4d3d6ea798 (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: A importância cultural e econômica da produção animal na América Latina tem suas raízes na era colonial. Este continente possui uma das maiores populações de gado do mundo e países como o Brasil, a Argentina e o Uruguai têm um papel importante no cenário mundial como produtores e exportadores de uma grande variedade de produtos pecuários. Doenças parasitárias afetam profundamente a produtividade animal e a venda de animais vivos ou derivados e, conseqüentemente, representam um grande impacto no desenvolvimento do setor agropecuário nos países sul americanos. A mosca da bicheira, Cochliomyia hominivorax (Coquerel) é um dos principais agentes causadores de miíases traumáticas na região Neotropical. Larvas da mosca da bicheira alimentam-se de tecidos vivos de animais de sangue quente. Esta espécie foi erradicada da América do Norte e parte da América Central através da técnica do inseto estéril (SIT). Na América do Sul, no entanto, esta peste continua causando um grande prejuízo à pecuária e um projeto internacional está em andamento para se avaliar a execução de um programa de controle da mosca da bicheira neste continente. Neste sentido, o principal objetivo deste estudo foi gerar informações sobre padrões de variabilidade, estrutura genética e fluxo gênico de populações sul americanas de C. hominivorax. Estas são importantes informações para o investimento em programas de controle de insetos-praga. Os microssatélites são uma classe especial de marcadores moleculares tipicamente codominantes e multi-alélicos altamente polimórficos e com uma alta heterozigosidade esperada. Estas características fazem com estes marcadores sejam cada vez mais empregados para investigar questões acerca da variabilidade genética, fluxo gênico e sistemas de acasalamento, até mesmo em espécies com baixos níveis de variabilidade em outros marcadores. A principal limitação dos microssatélites é a necessidade de se desenvolver marcadores microssatélites de novo para cada nova espécie a ser estudada, o que pode ser uma tarefa cara e demorada, mas indispensável na maioria dos casos. Para investigar padrões de variabilidade genética e diferenciação populacional na atual distribuição de C. hominivorax, duas abordagens foram empregadas para isolar marcadores microssatélites a partir de bibliotecas genômicas. Inicialmente, 10 locos foram isolados a partir de uma biblioteca enriquecida em repetições (AC)n. A amplificação destes locos em 30 indivíduos de C. hominivorax, revelou uma média de 6,9 alelos por loco, com heterozigosidades esperadas variando de 0,3831 a 0,8022. Na segunda abordagem, sete novos marcadores polimóficos foram desenvolvidos utilizando uma estratégia diferente, na qual uma sonda (AG)n foi usada em vez de (GT)n na etapa de enriquecimento. A média de alelos encontrados nos sete novos locos foi de 7,8 alelos por loco, com heterozigosidades esperadas variando de 0,4220 to 0,9045. Os "primers" desenvolvidos para C. hominivorax foram utilizados com sucesso na amplificação heteróloga em outras espécies da família Calliphoridae, sugerindo que os locos caracterizados poderão ser úteis em estudos nessas espécies após a avaliação do conteúdo de polimorfismo. Estas duas abordagens também motivaram o desenvolvimento de um conjunto de ferramentas de bioinformática para a análise de seqüências contendo microssatélites, o FiRe ("Find Repeats"). Esta iniciativa representa uma importante contribuição para facilitar o isolamento e caracterização destes marcadores. Doze, dos 17 marcadores desenvolvidos, foram selecionados para caracterizar a variabilidade genética e a estrutura populacional de amostras de C. hominivorax da América do Sul. Em uma análise da estrutura espacial e temporal de populações geográficas do Uruguai, desvios significativos do equilíbrio de Hardy-Weinberg foram observados em todas as subpopulações. Vários pares de locos também apresentaram desequilíbrio de ligação independentemente nas subpopulações. Um baixo, mas significativo, nível de diferenciação foi observado entre as subpopulações, mas não foi detectado isolamento por distância. A análise temporal indicou um aumento na diferenciação populacional global após um ano e foi observada uma diferenciação populacional significativa entre subpopulações da mesma localidade em períodos diferentes. As diferenças observadas entre as populações locais são, provavelmente, um resultado de alterações demográficas em populações da mosca da bicheira. A análise conjunta de 21 populações geográficas da América do Sul (distantes de 15 a 5180 km entre si) revelou uma alta variabilidade genética. Desvios significativos do equilíbrio de Hardy-Weinberg e desequilíbrio de ligação entre pares de locos foram freqüentes nas amostras analisadas. Foi observada uma diferenciação populacional baixa, mas significativa, indicando uma homogeneidade entre as amostras analisadas. A correlação entre as distâncias genéticas e geográficas das amostras não foi significativa. As evidências encontradas apontam para uma expansão populacional recente da espécie no continente sul americano, mas as observações também podem ser uma evidência de uma dinâmica populacional envolvendo eventos freqüentes de extinção e recolonização, na qual cada subpopulação de C. hominivorax se comportaria como uma metapopulação. Independentemente de qual seja o cenário que melhor descreva a história evolutiva desta espécie, fica evidente o potencial de dispersão e adaptação desta espécie, o que terá profundas implicações em programas de controle da espécie. Estudos futuros poderão fornecer um quadro mais completo sobre a dinâmica das populações da mosca da bicheira, gerando informações fundamentais para a tomada de decisões no que concerne à erradicação desta importante praga da pecuária / Abstract: The cultural and economic importance of animal production in South America dates back to the colonial era. This continent has one of the largest percentages of the world's total cattle population and countries like Brazil, Argentina and Uruguay play a major role as exporters of a variety of livestock products. Diseases affecting livestock can have a significant impact on animal productivity, on trade of live animais, meat and other animal products, which, consequently, affects the overall process of the economic development of South American countries. The New World screw-worm (NWS), Cochliomyia hominivorax (Coquerel), is an important parasitic insect pest in Neotropical regions. NWS myiasis is caused by the larval stage of the fly infesting tissues of warm-blooded vertebrates. This species has been successfully eradicated from North and most of Central America by the sterile insect technique. In South America, however, this pest continues to affect the development of the livestock sector and an international effort is underway to evaluate the feasibility of eradicating the NWS from endemic areas of Central and South America. Therefore, the aim of this study was to provide some insight into the patterns of genetic variation, structure and gene flow of C. hominivorax populations from South America. Those are valuable information required prior to an investment on large-scale efforts aiming at controlling insect pests. Microsatellites stand out as co-dominant markers with a high number of alleles per locus, high polymorphism and high-expected heterozygosities. Due to those features, these markers have been increasingly used to investigate questions regarding population structure, gene flow and mC!ting system even in populations that have low levels of allozyme and mitochondrial variation. The major drawback of microsatellites is that they must often be isolated de novo for each species. In order to investigate patterns of genetic differentiation of C. hominivorax from its current distribution using microsatellite loci, two efforts were made to isolate these markers from enriched genomic libraries. Initially, a set of 10 polymorphic microsatellite loci was isolated from an AC-enriched genomic library. Amplification of the reported loci in 30 screw-worms revealed an average of 6.9 alleles per locus with expected heterozygosities ranging from 0.3831 to 0.8022. In the second effort, seven new pOlymorphic microsatellite markers were developed using a different protocol. An (AG)n probe was used instead of (GT)n in the enrichment step. The number of alleles found in the seven new loci ranged from 3 to 13 per locus, with the expected heterozygosities ranging from 0.4220 to 0.9045. Cross-species amplifications of the 17 microsatellite markers were successful in other Calliphoridae species, suggesting that these loci may be useful in those species after evaluating the extent of polymorphism. These efforts have also motivated the development of a web-based, user-friendly toolkit for microsatellite sequence characterization, the FiRe (Find Repeats). This initiative represents an important contribution to other efforts aimed at isolating and characterizing microsatellite markers. Twelve of the 17 isolated loci were used to characterize genetic variability and population structure across NWS South American populations. In the spatio-temporal analysis of C. hominivorax populations from Uruguay, significant departures from Hardy-Weinberg equilibrium were observed for ali populations. Linkage disequilibrium was also detected for severa I locus pairs. Low, but significant, levels of subdivision were recorded between populations, but no evidence of isolation by distance was observed. The temporal analysis indicated a population differentiation increase over time and ali pairwise comparisons between temporal subpopulations yielded significant estimates of population differentiation. The observed differences between local populations are probably a result of the occurrence of demographic changes that affected NWS populations. Analysis of populations from 21 geographical sites in South America (distances ranging from 15 to 5180 km) revealed a high genetic variability within NWS populations. Deviations from Hardy-Weinberg equilibrium and linkage disequilibrium were frequent. A strikingly low, but significant, genetic differentiation was observed, indicating a broad-scale genetic homogeneity in the continent. This low differentiation was coupled with a lack of isolation by distance. These results are consistent with the patterns expected from a species that has undergone range expansion. The pattern of genetic variation among populations could also be an evidence of colonization-extinction dynamics, where subpopulations of this species might usefully be viewed as a metapopulation. Whichever scenario best describes the population structure of NWS, it will have deep implications in contrai strategies. Further studies should complement these findings and provide support for decision makers in the planning and implementation of new area-wide contrai programs of this important livestock pest / Doutorado / Genetica Animal e Evolução / Doutor em Genetica e Biologia Molecular

Uma metapopulação pode ser definida como uma população regional de populações locais geograficamente distintas, interconectadas por migração. Dentro deste contexto, modelos de dinâmica metapopulacional espacialmente implícitos descrevem a taxa de variação da proporção de manchas ocupadas por uma ou mais espécies por meio de um balanço entre os processos de colonização de manchas vazias e extinção de manchas ocupadas. O modelo metapopulacional de Levins prevê que mesmo na presença de habitat adequado, uma espécie pode se extinguir regionalmente, de forma determinística, se a intensidade de extinção for maior do que a intensidade de colonização. Além disso, este modelo sugere a existência de uma quantidade limiar de habitat remanescente, abaixo do qual a extinção regional determinística da espécie ocorre. Características importantes da dinâmica espacial, tais quais, efeito Allee, efeito resgate, colonização externa, qualidade da matriz, efeito anti-resgate e heterogeneidade de manchas podem ser incluídas em variantes do modelo de Levins. Uma outra extensão natural desses modelos é o agrupamento das manchas com relação ao seu estado de ocupação em modelos de metapopulações de espécies interativas, dando origem aos modelos de metacomunidades. Estudos de dinâmica de metacomunidades permitem a análise das relações entre a diversidade de espécies e a heterogeneidade ambiental no nível da paisagem, bem como as implicações de interações diretas e indiretas para a estrutura de comunidades.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This dissertation evaluated the age-sex structure, group size and population density of Alouatta guariba clamitans in 40 forest fragments. We also present a Population Viability Analysis for the subspecies. The study was conducted at Campo de Instrução de Santa Maria (CISM), an area of 5,876 ha belonging to the Ministry of Defense (Brazilian Army) and surrounding areas, located in the municipality of Santa Maria (Rio Grande do Sul State, South Brazil). The fieldwork was conducted from March 2012 to February 2013, totaling 58 days and sampling effort of 431 hours. Our data suggest high mortality in the brown howler monkey populations at CISM. The record of low densities, low occupancy rates in fragments and small group size supports our conclusions. Statistical analyzes showed significant differences between the current population parameters and the previously registered. The PVA results suggest the fragment size and adult female survival as the best parameters contributing for the population growth. Yellow fever is an important threat, especially if the incidence of new outbreaks is high. For the long-term persistence of A. g. clamitans at CISM, the minimum viable population must be at least 573 individuals living in a minimum suitable forest area of 516 ha, which is perfectly plausible for the CISM area. In Rio Grande do Sul state there are practically no conservation units, especially in the western range of the distribution of the brown howler monkey and reinforces the important role of CISM in this scenario, although not a conservation unit. Therefore, if the metapopulation dynamics is granted, it is able to ensure regional long-term survival of A. g. clamitans, unless it suffers more intensely other impacts (such as a new yellow fever outbreak) in a near future. / A presente dissertação avaliou a abundância e densidade das populações, o tamanho e a composição sexo-etária de grupos sociais de Alouatta guariba clamitans em 40 fragmentos florestais no município de Santa Maria. Além disso, apresenta uma análise de viabilidade populacional para a subespécie. Este estudo foi conduzido no Campo de Instrução de Santa Maria (CISM), uma área com 5.876 ha pertencente ao Ministério da Defesa (Exército Brasileiro) localizada no município de Santa Maria (Depressão Central do Rio Grande do Sul), e em áreas particulares do seu entorno. Foram realizadas no período de março de 2012 a fevereiro de 2013 doze campanhas de censo, totalizando 58 dias de campo com esforço amostral de 431 horas. Nossos dados sugerem que houve alta mortalidade nas populações de bugios do CISM após o último levantamento populacional, realizado em 2004. Essa conclusão é apoiada principalmente pela constatação de baixas densidades, reduzidas taxas de ocupação dos fragmentos e grupos com tamanho inferior ao encontrado anteriormente na mesma área. As análises estatísticas mostram que os parâmetros populacionais atuais diferem significativamente dos registrados anteriormente. Os resultados da AVP sugerem que o tamanho do fragmento, a sobrevivência e disponibilidade de fêmeas adultas são os parâmetros que melhor contribuem para as tendências de crescimento populacional. A febre amarela é uma ameaça importante, especialmente se a incidência de novos surtos for alta e a atual composição populacional, de acordo com o modelo, não foi capaz de se recuperar adequadamente em 100 anos. Para a persistência de A. g. clamitans no CISM a população mínima viável deve ser de pelo menos 573 indivíduos em uma área >516 ha de habitat adequado. O que é perfeitamente viável para o CISM, uma vez que o fragmento SAR possui uma área de 977,3 ha. Além disso, no Rio Grande do Sul atualmente praticamente inexistem unidades de conservação, especialmente na metade oeste da distribuição do bugio ruivo. Isso ressalta o papel importante do CISM, ainda que não se trate de uma Unidade de Conservação, logo, se assegurada, a dinâmica de metapopulação é capaz de garantir a sobrevivência regional A. g. clamitans em longo prazo, a menos que a mesma venha a sofrer mais intensamente outros impactos (ex: novo surto de febre amarela) em um futuro próximo.

Made available in DSpace on 2015-03-04T18:50:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao.pdf: 667521 bytes, checksum: bb065dd72ee7f7268f022ef94b81d208 (MD5) Previous issue date: 2007-03-12 / Uma metapopulação pode ser definida como uma população regional de populações locais geograficamente distintas, interconectadas por migração. Dentro deste contexto, modelos de dinâmica metapopulacional espacialmente implícitos descrevem a taxa de variação da proporção de manchas ocupadas por uma ou mais espécies por meio de um balanço entre os processos de colonização de manchas vazias e extinção de manchas ocupadas. O modelo metapopulacional de Levins prevê que mesmo na presença de habitat adequado, uma espécie pode se extinguir regionalmente, de forma determinística, se a intensidade de extinção for maior do que a intensidade de colonização. Além disso, este modelo sugere a existência de uma quantidade limiar de habitat remanescente, abaixo do qual a extinção regional determinística da espécie ocorre. Características importantes da dinâmica espacial, tais quais, efeito Allee, efeito resgate, colonização externa, qualidade da matriz, efeito anti-resgate e heterogeneidade de manchas podem ser incluídas em variantes do modelo de Levins. Uma outra extensão natural desses modelos é o agrupamento das manchas com relação ao seu estado de ocupação em modelos de metapopulações de espécies interativas, dando origem aos modelos de metacomunidades. Estudos de dinâmica de metacomunidades permitem a análise das relações entre a diversidade de espécies e a heterogeneidade ambiental no nível da paisagem, bem como as implicações de interações diretas e indiretas para a estrutura de comunidades.