Thesis (PhD (Botany and Zoology)) -- University of Stellenbosch, 2008. / Afrosoricida is a 65 million years old (my) eutherian order that together with the Tubulidentata (aardvark) and Macroscelidea (elephant shrews) form the Afroinsectiphillia, a subclade of Afrotheria. It includes two families – Chrysochloridae (nine genera of golden moles) and Tenrecidae (11 genera of tenrecs) – that collectively represent ~59% of the afrotherian generic diversity. This study presents the first comprehensive cytogenetic comparison between members of these two families (seven genera and 11 species/subspecies of golden moles, and two genera and 11 species of tenrecs) using G- and C-banding and chromosome painting. All detected rearrangements are interpreted in a strict cladistic framework. In the case of Chrysochloridae, this provides evidence for a sister relationship between Chrysochloris and Cryptochloris, the monophyly of the Amblysomus genus, and for the elevation of A. hottentotus meesteri to specific rank. The detection of telomeric-like repeats in the centromeres of all chromosomes of the Amblysomus species/subspecies but not in those of A. h. meesteri further strengthens its recognition as a distinct species. Parsimony analysis of chromosomal rearrangements within Tenrecidae, the second Afrotheria assemblage studied, showed that rearrangements which could be interpreted as Whole Arm Reciprocal Translocations (WARTs) were more likely to be the result of Robertsonian translocations. Four interspecific associations are recovered within Microgale that are consistent with morphological and molecular characters. It was also possible to infer ancestral karyotypes for the Chrysochloridae, Oryzorictinae and the two tenrecid genera, Oryzorictes and Microgale. Given the relatively high karyotypic diversity observed among some Microgale species and the prevailing debates on chromosomal evolution and regional palaeoenvironmental fluctuations, it is suggested that Microgale be added to the list of taxa where structural rearrangements are likely to have played a role in speciation. Using Genbank sequences and a relaxed Bayesian clock method, we estimate the age of the family Chrysochloridae at ~28.5 my and that of the genus Microgale at ~9.9 my. Based on these dates, it can be shown that most of the evolutionary branches are characterized by a slow rate of chromosomal change, but that markedly high rates are observed in some Microgale species and to a lesser extent in the lineage leading to A. robustus. The rates of chromosomal evolution and other cytogenetic features highlighted in this study are discussed in light of recent advances in understanding the molecular mechanims that underpin changes to genomic architecture.

Esta dissertação de mestrado propõe o estudo e a implementação de um método de deformação usando modelos tridimensionais sem o uso de malhas baseado na técnica Smoothed Particles Hydrodynamics (SPH), que consiste num sistema de resolução de equações diferenciais para aplicação de conceitos físicos para simular deformação de tecidos moles. A opção pelo método sem malha para processo de deformação é apresentado nesta dissertação como alternativa a um dos métodos mais comuns em simulação de deformação de tecidos, o método massa-mola, explorando questões referentes ao uso de recursos computacionais. Para chegada a definição do método foram analisados os temas envolvendo métodos de deformação, modelos baseados em pontos e o SPH como plataformas para alcançar o desenvolvimento do método proposto pela dissertação. Como forma de comprovar as propriedades do método desenvolvido foi realizada a implementação e testes levando em consideração os modelos de deformação e a interação em tempo real num ambiente de simulação que contempla a deformação de uma mama, levando em conta a comparação com o método massa-mola, o uso de recursos do próprio método em função do aumento de detalhe e do uso de objeto com múltiplas propriedades / This master thesis proposes a study and implementation of deformation method using tridimensional models without edge composed meshes based on Smoothed Particles Hydrodynamics (SPH) technique, that consists on diferential equation solving system to reproduce physical concepts to simulate soft tissue deformation. The option for a meshless method to deformation process is shown in this thesis as an alternative to a very common method in tissue deform simulation, the mass-spring method, reviewing a comparison based on computational resources. To achieve a method definition were analyzed fields of study involving deformation methods, point-based models and SPH as platforms to build and deploy the proposed method for this thesis. To show the characteristics for this developed deformation method was realized the implementation and tests based on deformation models and real time interaction on a simulation environment that includes a breast deformation, taking in account the comparison to mass-spring, number of points of the cloud model and multiple properties

Metastases pulmonares isoladas de sarcomas de partes moles ocorrem em 20%-50% dos pacientes, e 70% destes pacientes apresentarão doença limitada aos pulmões. A ressecção cirúrgica é bem aceita como tratamento padrão nas metastases de sarcomas de partes moles confinadas aos pulmões, com muitos estudos relatando sobrevida em cinco anos de 305-40%, ssndo que o fator preditor de sobrevida é a ressecção completa. O objetivo deste estudo é determinar as variáveis clínicas e demográficas relacionadas ao tratamento e associadas com a sobrevida global a longo prazo (90 meses) nos pacientes submetidos a metastasectomia pulmonar de sarcomas de partes moles. Uma revisão retrospectiva foi realizada nos pacientes com metastases pulmonares que foram submetidos à toracotomia para ressecção das metástases, após o tratamento do tumor primário. Os dados foram coletados de acordo com as características do tumor primário, dados demográficos, tipo de tratamento e evolução. Pacientes (n=77) com sarcomas de partes moles previamente tratados foram submetidos a um total of 122 toracotomias e 273 nódulos ressecados. O seguimento mediando de todos os pacientes foi de 36.7 meses (variação: 10-138 meses). O índice de complicações pós-peratórias foi 9.1%, e a mortalidade em 30 dias de 0%. A sobrevida global em 90 meses para todos os pacientes foi de 34.7%. A análise multivariada identificou o número de metástases, o intervalo livre de doença, e ressecção completa, como fatores prognósticos independentes para a sobrevida global. Estes resultados confirmam que a metastasectomia pulmonar é um procedimento seguro e com potencial curativo para pacientes com tumors primários tratados. Um grupo seleto de pacientes pode apresentar uma sobrevida a longo prazo interessante após a ressecção pulmonar / Isolated pulmonary metastases from soft tissue sarcomas occur in 20%-50% of these patients, and 70% of these patients will have disease limited only to the lungs. Surgical resection is well accepted as a standard approach to treat metastases from soft tissue sarcomas isolated to the lungs, with many studies reporting overall 5-year survival ranging from 30% to 40%, and the most consistent predictor of survival in these patients is complete resection. The aim of this study is to determine demographics and clinical treatment-related variables associated with long-term (90-month) overall survival in patients with lung metastases undergoing pulmonary metastasectomy from soft tissue sarcomas. A retrospective review was performed of patients who were admitted with lung metastases and underwent thoracotomy for resection, after treatment of the primary tumor. Data were collected regarding primary tumor features, demographics, treatment, and outcome. Patients (n=77) with preview soft tissue sarcomas treated, were submitted to a total of 122 thoracotomies and 273 nodules resected. Median follow-up time of all patients was 36.7 months (range: 10-138 months). The postoperative complication rate was 9.1%, and the 30-day mortality rate was 0%. The 90-month overall survival rate for all patients was 34.7%. Multivariate analysis identified the number of metastases resected, disease-free interval, and complete resection as the independent prognostic factors for overall survival. These results confirm that lung metastasectomy is a safe and potentially curative procedure for patients with treated primary tumors. A select group of patients can achieve long-term survival after lung resection

Os aterros reforçados sobre solo mole de resistência crescente com a profundidade, podem apresentar problemas durante o processo construtivo com respeito às rupturas e aos recalques inesperados. O presente trabalho visa avaliar o comportamento dos aterros reforçados a través de um estudo numérico, levando aos aterros até a ruptura sob condição não-drenada devido ao carregamento rápido, com o objetivo de estimar a influência da rigidez do reforço nas deformações, além disso, estudar o mecanismo da interação solo-reforço para um aterro reforçado. Foi utilizada a metodologia apresentada por Hinchberger & Rowe (2003), que leva em conta os recalques imediatos durante e após a construção. As análises numéricas de tensão-deformação foram realizadas pelo software PHASE 2, a calibração do programa foi feita com a literatura de aterros reforçados. Pretendeu-se mostrar a influência de uma camada superficial de areia sobre a argila mole na altura de ruptura e na deformação do reforço. Pelo método de elementos finitos foi definida uma metodologia para calcular as deformações do reforço para uma altura determinada e avaliar a estabilidade mediante o método de equilíbrio limite. Além disso, essa metodologia pode ser empregada para dimensionar o reforço requerido para um determinado fator de segurança. / Reinforced embankments on soft clayey soil where the strength increases with depth may present problems during construction process relative to failure and unexpected settlements. This study aims to evaluate the embankments behavior with a numerical study; the embankments were taken to failure in the undrained shear strength condition due to rapid upload to study the effect of reinforcement tensile stiffness on the reinforcement strains. Besides, it aimed to study the mechanism of soil-reinforcement interaction for a reinforced embankment. The method of Hinchberger & Rowe (2003) was used, which considers the displacements before and post construction. The numeric analysis of stress-strain was performed by the software PHASE 2; the calibration of the software was made according to published reinforced embankment literature. The study intends to show the influence of a sand layer above the clayey soil, on the failure height and reinforcement strains. Based on finite elements methods, a methodology was defined to estimate the reinforcement strains for a required design height and to study the stability by performing limit equilibrium analysis. Furthermore, this methodology could be used to specify the required reinforcement stiffness for a specific factor of safety.

As aves representam a grande maioria das espécies da fauna silvestre mantidas como animais de companhia em nosso meio e respondem diretamente pela crescente demanda pelo atendimento médico veterinário. O avanço na área da anestesiologia viabilizou a realização de procedimentos cirúrgicos mais longos e complexos e contribuiu para o desenvolvimento e aprimoramento da técnica operatória em aves, contudo, dados nacionais de casuística relacionados às afecções cirúrgicas de aves ainda são inexistentes. Assim, este estudo avaliou retrospectivamente as operações realizadas em aves no Serviço de Cirurgia de Pequenos Animais do Hospital Veterinário da Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo, entre janeiro de 2000 a junho de 2008, com o objetivo de identificar as afecções cirúrgicas, apresentar sua ocorrência e distribuição de freqüência segundo as ordens e espécies acometidas, avaliar as técnicas operatórias empregadas e comparar os dados obtidos com os achados da literatura. De um total de 90 operações realizadas para diagnóstico e/ou tratamento de afecções, 27 foram ortopédicas e 63 de tecidos moles. Quanto ao percentual de operações ortopédicas realizadas segundo as diferentes ordens, observou-se: Psittaciformes 85,19%, Piciformes 7,41%, Anseriformes 3,70% e Falconiformes 3,70%. Para as operações de tecidos moles os psitaciformes representaram 92,06%, columbiformes 3,17%, passeriformes 3,17% e anseriformes 1,59%. Entre os tipos de afecções ortopédicas encontradas as fraturas apresentaram a maior ocorrência (88,89%), seguidas de luxação (3,70%), avulsão traumática de extremidade (3,70%) e artrite/osteomielite (3,70%), o membro pélvico foi o mais acometido e o tibiotarso o osso mais fraturado. Dentre as afecções cirúrgicas de tecidos moles as neoplasias apresentaram a maior ocorrência (30,16%), seguida das neoformações cutâneas ou de anexos não neoplásicos (17,46%), neoformações cutâneas sem diagnóstico (7,94%), distocia (7,94%), fístula de papo (7,94%), hérnia abdominal (4,76%), sinusite (4,76%), gangrena de extremidade de membros (3,17%), perfuração de esôfago (3,17%), prolapso de cloaca (3,17%), Necrose avascular de dígito (1,59%), ferida na região da quilha (1,59%), perfuração de cavidade celomática (1,59%), neoformação em cavidade celomática sem diagnóstico (1,59%), corpo estranho em trato gastrointestinal (1,59%) e otite (1,59%). O lipoma foi a neoplasia e o cáseo a neoformação não neoplásica mais freqüentes. A distribuição das afecções cirúrgicas segundo as espécies acometidas mostrou o grupo dos papagaios, representado em sua maioria por espécies do gênero Amazona, como prevalente. A fixação interna com pino intramedular foi a técnica operatória mais utilizada nas afecções cirúrgicas ortopédicas e apresentou elevado índice de retorno à função para tratamento das fraturas. A exérese foi a técnica operatória mais utilizada nas afecções cirúrgicas de tecidos moles e mostrou índices elevados de cura e baixa ocorrência de recidivas. O conhecimento das afecções cirúrgicas e das espécies de aves mais acometidas, bem como dos resultados obtidos com as técnicas operatórias empregadas, acrescentam informações para aqueles que já atuam nesta área e servem como indicador de estudo para futuros cirurgiões de aves / Birds represent one of the main wildlife species kept as pets in our country and respond directly by the growing demand for health care veterinarian. Advancement in the field of anesthesiology has enabled the surgical procedures longer and more complex and contributed to the development and refinement of surgical technique in birds. However, national data series related to surgical disorders in birds are still poor. This study assessed retrospectively the avian operations at the Service of Small Animal Surgery - Veterinary Hospital of the School of Veterinary Medicine and Animal Science of the University of São Paulo, from January 2000 to June 2008. The focus was to identify the surgical disorders, occurrence and frequency distribution according to orders and species affected, also we evaluated the surgical techniques employed and compared the results with the literature findings. A total of 90 operations were performed for diagnosis or treatment of surgical disorders. Of these 27 were orthopedic and 63 soft tissue surgeries. Considering the orthopedic surgeries performed according to orders we observed: Psittaciformes 85,19%, Piciformes 7,41%, Anseriformes 3,70% and Falconiformes 3,70%. And for the soft tissues operations the Psittaciformes represented 92,06%, Columbiformes 3,17%, Passeriformes 3,17% and Anseriformes 1,59%. Fractures presented the highest incidence among orthopedic disorders (88,89%), followed by luxation (3,70%), traumatic avulsion of the end (3,70%) and arthritis/osteomyelitis (3,70%). The pelvic limb was the most affected member and the tibiotarsus was the most commonly fractured bone. Among the surgical disorders of soft tissue, neoplasms accounted for 30,16%, followed by cutaneous neoformation or annexes nonneoplastic (17,46%), cutaneous neoformations undiagnosed (7,94%), dystocia (7,94%), fistula crop (7,94%), abdominal hernia (4,76%), sinusitis (4,76%), gangrene of the extremity members (3,17%), esophageal perforation (3,17%), prolapse of cloaca (3,17%), \"avascular necrosis of digit (1,59%), wound in the region of the keel (1,59%), perforation of the coelomic cavity (1,59%), neoformation in the coelomic cavity without a diagnosis (1,59%), foreign body in the gastrointestinal tract (1,59%) and otitis (1,59%). Lipoma and caseous were the most frequent cancer and non-neoplastic neoformation observed, respectively. The distribution of surgical disorders according to species affected showed that the \"group of parrots\", mainly represented by species of Amazonas genus, was prevalent. Internal fixation with intramedullary pin was the technique most often used in orthopedic surgical disorders and showed a high rate of recovery of limb function. The excision was the technique mostly used in the surgical disorders of soft tissue and presented high rates of cure and low recurrence. Knowledge of surgical and bird species most affected, and the results obtained with the surgical techniques employed, add information for those who works in this area and will be an indicator for future surgeons of birds

Neste trabalho apresentou-se a simulação numérica de aterros reforçado sobre argila mole com uso de drenos verticais pré-fabricados. O objetivo foi analisar o comportamento de um aterro reforçado com geossintético aliado ao uso de drenos verticais pré-fabricados. As análises numéricas de tensão-deformação foram realizadas pelo software PLAXIS 8.2. 2D. Pretendeu-se analisar as influências da rigidez do reforço, espaçamento entre drenos, velocidade de construção, construção do aterro em etapas, no comportamento dos aterros, como recalques verticais, deformações laterais e deformação do reforço. Foi utilizada a metodologia apresentada por Li & Rowe (2001), para a validação da modelagem dos aterros. A calibração do programa foi feita com a literatura de aterros reforçados. Nos resultados apresentados foram verificadas vantagens, como por exemplo: aceleração dos recalques e possibilidade da construção de aterros mais altos. O MEF mostrou que pode ser útil na escolha do reforço mais adequado para a condição de obra desejada, juntamente com espaçamento entre drenos. Foi possível verificar que a combinação de ambos os elementos pode ser bastante vantajosa em relação à utilização de apenas um deles. As deformações do reforço determinadas pelo MEF podem ser usadas para escolher o reforço adequado para um aterro sobre solo mole. Através dos resultados do método de elementos finitos pretendeu-se definir uma metodologia para calcular as deformações do reforço para uma altura de aterro determinada. / This paper presents the numerical simulation of reinforced embankment on soft clay with the use of prefabricated vertical drains. The objective is to analyze the behavior of a geosynthetic reinforced embankment along with the use of prefabricated vertical drains. The numerical analyzes of the stress-strain were performed by software PLAXIS 8.2. 2D. It was intended to analyze the influence of the stiffness of the reinforcement spacing between drains, construction speed, construction of the embankment in stages, the behavior of the landfill as settlements vertical, lateral deformations and deformation strengthening. We used the method presented by Li & Rowe (2001), to validate the modeling of landfills. The calibration was performed with the program literature reinforced embankments. In the following results were observed advantages such as: speeding up the possibility of repression and construction of embankments higher. MEF showed that may be helpful in selecting the most suitable for enhancing the desired work condition, with the spacing between drains. It can be seen that the combination of both elements can be quite advantageous over the use of just one. The deformation of the reinforcement determined by MEF can be used to choose the proper reinforcement for an embankment on soft soil. Through the results of the finite element method was intended to define a methodology to calculate the deformations of the reinforcement to a height of embankment determined.

O propósito do presente estudo foi avaliar, radiograficamente, a relação entre lábios, pogônio mole, maxila, mandíbula e incisivos em indivíduos com perfil facial equilibrado. Foram avaliados 30 brasileiros do gênero feminino, entre 19 e 31 anos de idade, dos quais foram obtidas telerradiografias em norma lateral, na posição natural da cabeça orientada. A análise cefalométrica foi realizada avaliando-se o nariz, os lábios e o pogônio mole em relação à linha vertical verdadeira que passa pelo ponto subnasal (SnV), a maxila e a mandíbula em relação à base do crânio e os incisivos em relação às suas bases ósseas. Os resultados demonstraram que o lábio superior se apresentou ligeiramente à frente da linha SnV, o lábio inferior se posicionou sobre a linha e o pogônio mole atrás da mesma. Já a maxila se apresentou ligeiramente protruída enquanto que a mandíbula encontrou-se bem posicionada em relação à base do crânio, deste modo, a relação maxílo-mandibular se mostrou um pouco aumentada. Embora os incisivos superiores tenham apresentado inclinações normais, os inferiores se encontraram ligeiramente vestibularizados. Foram, também, observadas correlações positivas estatisticamente significativas entre: o comprimento mandibular e a projeção do lábio inferior; a projeção do pogônio duro e a projeção do pogônio mole; a relação maxilo-mandibular e a relação labial no sentido antero-posterior; a projeção dos lábios e a projeção do pogônio mole. Foi observada, ainda, correlação negativa estatisticamente significativa entre: a inclinação do incisivo inferior e a projeção do lábio inferior; a inclinação do incisivo inferior e a projeção pogônio mole. / The purpose of this study was to radiographically evaluate the relations hip between lips, soft pogonion, maxilla, mandible and incisors in individuals with a balanced facial profile. Thirty Brazilian women aged 19 to 31 years were evaluated, from whom teleradiographs (lateral view) were taken in the natural position of the oriented head. The cephalometric analysis was performed evaluating the nose, the lips and the soft pogonion in relation to the vertical line which passes by the subnasal point (SnV), the maxilla and the mandible in relation to the base of the skull and the incisors in relation to their bone bases. The results demonstrated that the upper lip was slightly forward to SnV line, the lower lip was positioned on the line and the soft pogonion was behind the line. The maxilla was slightly protruded, whereas the mandible waswell positioned in relation to the base of the skull, therefore the maxillomandibular relationship was somewhat augmented. Although the upper incisors had normal inclinations, the lower incisors were slightly protruded. Statistically significant positive correlations were also observed between the mandibular length and the projection of the lower lip; the projection of the hard pogonion and the projection of the soft pogonion; the maxillomandibular relationship and the lip relationship in the anteroposterior direction and between the projection of the lips and the projection of the soft pogonion. A statistically significant negative correlation was also found between the inclination of the lower incisor and the projection of the lower lip and between the inclination of the lower incisor and the projection of the soft pogonion.

As aves representam a grande maioria das espécies da fauna silvestre mantidas como animais de companhia em nosso meio e respondem diretamente pela crescente demanda pelo atendimento médico veterinário. O avanço na área da anestesiologia viabilizou a realização de procedimentos cirúrgicos mais longos e complexos e contribuiu para o desenvolvimento e aprimoramento da técnica operatória em aves, contudo, dados nacionais de casuística relacionados às afecções cirúrgicas de aves ainda são inexistentes. Assim, este estudo avaliou retrospectivamente as operações realizadas em aves no Serviço de Cirurgia de Pequenos Animais do Hospital Veterinário da Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo, entre janeiro de 2000 a junho de 2008, com o objetivo de identificar as afecções cirúrgicas, apresentar sua ocorrência e distribuição de freqüência segundo as ordens e espécies acometidas, avaliar as técnicas operatórias empregadas e comparar os dados obtidos com os achados da literatura. De um total de 90 operações realizadas para diagnóstico e/ou tratamento de afecções, 27 foram ortopédicas e 63 de tecidos moles. Quanto ao percentual de operações ortopédicas realizadas segundo as diferentes ordens, observou-se: Psittaciformes 85,19%, Piciformes 7,41%, Anseriformes 3,70% e Falconiformes 3,70%. Para as operações de tecidos moles os psitaciformes representaram 92,06%, columbiformes 3,17%, passeriformes 3,17% e anseriformes 1,59%. Entre os tipos de afecções ortopédicas encontradas as fraturas apresentaram a maior ocorrência (88,89%), seguidas de luxação (3,70%), avulsão traumática de extremidade (3,70%) e artrite/osteomielite (3,70%), o membro pélvico foi o mais acometido e o tibiotarso o osso mais fraturado. Dentre as afecções cirúrgicas de tecidos moles as neoplasias apresentaram a maior ocorrência (30,16%), seguida das neoformações cutâneas ou de anexos não neoplásicos (17,46%), neoformações cutâneas sem diagnóstico (7,94%), distocia (7,94%), fístula de papo (7,94%), hérnia abdominal (4,76%), sinusite (4,76%), gangrena de extremidade de membros (3,17%), perfuração de esôfago (3,17%), prolapso de cloaca (3,17%), Necrose avascular de dígito (1,59%), ferida na região da quilha (1,59%), perfuração de cavidade celomática (1,59%), neoformação em cavidade celomática sem diagnóstico (1,59%), corpo estranho em trato gastrointestinal (1,59%) e otite (1,59%). O lipoma foi a neoplasia e o cáseo a neoformação não neoplásica mais freqüentes. A distribuição das afecções cirúrgicas segundo as espécies acometidas mostrou o grupo dos papagaios, representado em sua maioria por espécies do gênero Amazona, como prevalente. A fixação interna com pino intramedular foi a técnica operatória mais utilizada nas afecções cirúrgicas ortopédicas e apresentou elevado índice de retorno à função para tratamento das fraturas. A exérese foi a técnica operatória mais utilizada nas afecções cirúrgicas de tecidos moles e mostrou índices elevados de cura e baixa ocorrência de recidivas. O conhecimento das afecções cirúrgicas e das espécies de aves mais acometidas, bem como dos resultados obtidos com as técnicas operatórias empregadas, acrescentam informações para aqueles que já atuam nesta área e servem como indicador de estudo para futuros cirurgiões de aves / Birds represent one of the main wildlife species kept as pets in our country and respond directly by the growing demand for health care veterinarian. Advancement in the field of anesthesiology has enabled the surgical procedures longer and more complex and contributed to the development and refinement of surgical technique in birds. However, national data series related to surgical disorders in birds are still poor. This study assessed retrospectively the avian operations at the Service of Small Animal Surgery - Veterinary Hospital of the School of Veterinary Medicine and Animal Science of the University of São Paulo, from January 2000 to June 2008. The focus was to identify the surgical disorders, occurrence and frequency distribution according to orders and species affected, also we evaluated the surgical techniques employed and compared the results with the literature findings. A total of 90 operations were performed for diagnosis or treatment of surgical disorders. Of these 27 were orthopedic and 63 soft tissue surgeries. Considering the orthopedic surgeries performed according to orders we observed: Psittaciformes 85,19%, Piciformes 7,41%, Anseriformes 3,70% and Falconiformes 3,70%. And for the soft tissues operations the Psittaciformes represented 92,06%, Columbiformes 3,17%, Passeriformes 3,17% and Anseriformes 1,59%. Fractures presented the highest incidence among orthopedic disorders (88,89%), followed by luxation (3,70%), traumatic avulsion of the end (3,70%) and arthritis/osteomyelitis (3,70%). The pelvic limb was the most affected member and the tibiotarsus was the most commonly fractured bone. Among the surgical disorders of soft tissue, neoplasms accounted for 30,16%, followed by cutaneous neoformation or annexes nonneoplastic (17,46%), cutaneous neoformations undiagnosed (7,94%), dystocia (7,94%), fistula crop (7,94%), abdominal hernia (4,76%), sinusitis (4,76%), gangrene of the extremity members (3,17%), esophageal perforation (3,17%), prolapse of cloaca (3,17%), \"avascular necrosis of digit (1,59%), wound in the region of the keel (1,59%), perforation of the coelomic cavity (1,59%), neoformation in the coelomic cavity without a diagnosis (1,59%), foreign body in the gastrointestinal tract (1,59%) and otitis (1,59%). Lipoma and caseous were the most frequent cancer and non-neoplastic neoformation observed, respectively. The distribution of surgical disorders according to species affected showed that the \"group of parrots\", mainly represented by species of Amazonas genus, was prevalent. Internal fixation with intramedullary pin was the technique most often used in orthopedic surgical disorders and showed a high rate of recovery of limb function. The excision was the technique mostly used in the surgical disorders of soft tissue and presented high rates of cure and low recurrence. Knowledge of surgical and bird species most affected, and the results obtained with the surgical techniques employed, add information for those who works in this area and will be an indicator for future surgeons of birds

Esta dissertação de mestrado propõe o estudo e a implementação de um método de deformação usando modelos tridimensionais sem o uso de malhas baseado na técnica Smoothed Particles Hydrodynamics (SPH), que consiste num sistema de resolução de equações diferenciais para aplicação de conceitos físicos para simular deformação de tecidos moles. A opção pelo método sem malha para processo de deformação é apresentado nesta dissertação como alternativa a um dos métodos mais comuns em simulação de deformação de tecidos, o método massa-mola, explorando questões referentes ao uso de recursos computacionais. Para chegada a definição do método foram analisados os temas envolvendo métodos de deformação, modelos baseados em pontos e o SPH como plataformas para alcançar o desenvolvimento do método proposto pela dissertação. Como forma de comprovar as propriedades do método desenvolvido foi realizada a implementação e testes levando em consideração os modelos de deformação e a interação em tempo real num ambiente de simulação que contempla a deformação de uma mama, levando em conta a comparação com o método massa-mola, o uso de recursos do próprio método em função do aumento de detalhe e do uso de objeto com múltiplas propriedades / This master thesis proposes a study and implementation of deformation method using tridimensional models without edge composed meshes based on Smoothed Particles Hydrodynamics (SPH) technique, that consists on diferential equation solving system to reproduce physical concepts to simulate soft tissue deformation. The option for a meshless method to deformation process is shown in this thesis as an alternative to a very common method in tissue deform simulation, the mass-spring method, reviewing a comparison based on computational resources. To achieve a method definition were analyzed fields of study involving deformation methods, point-based models and SPH as platforms to build and deploy the proposed method for this thesis. To show the characteristics for this developed deformation method was realized the implementation and tests based on deformation models and real time interaction on a simulation environment that includes a breast deformation, taking in account the comparison to mass-spring, number of points of the cloud model and multiple properties

Os sarcomas de partes moles constituem um grupo diverso de neoplasias que podem surgir nos tecidos conjuntivos praticamente de qualquer região do corpo. A ressonância magnética (RM) é atualmente o exame de escolha para detecção, estadiamento regional e acompanhamento desses tumores. A segmentação das lesões a partir das imagens de RM da rotina permite extrair dados quantitativos, que tem potencial para adicionar informações a análise. O propósito do estudo é avaliar a reprodutibilidade da segmentação manual de sarcomas de partes moles em imagens de RM de pacientes com diagnóstico definitivo confirmado por meio da histopatologia. Como objetivo secundário foi realizada a comparação da segmentação manual e semiautomática a fim de validar a segmentação semiautomática como método alternativo para segmentação desses tumores. Foi estudada uma coorte retrospectiva de 15 pacientes consecutivos com diagnóstico confirmado de sarcoma de partes moles acompanhados em nosso serviço, no período de janeiro de 2006 até janeiro de 2016, com imagens de RM adquiridas previamente ao tratamento e disponíveis para análise no formato DICOM. Foi utilizado o software 3D Slicer para realizar as segmentações pelos métodos manual e semiautomático. Três radiologistas fizeram as segmentações de forma independente e às cegas para permitir avaliação interobservador. Os resultados obtidos demonstram haver alta reprodutibilidade intraobservador com coeficiente de similaridade de Dice entre as segmentações variando de 0,849 a 0,979 e as distâncias Hausdorff variando de 3,53 mm a 20,96 mm e uma boa reprodutibilidade interobservador com coeficientes de similaridade de Dice variando de 0,741 a 0,972 e distâncias Hausdorff variando de 5,83 a 60,84 mm. Foi encontrada uma concordância substancial entre as segmentações realizadas pelo método semiautomático quando comparadas com as segmentações realizadas pelo método manual com coeficientes de similaridade de Dice variando de 0,871 a 0,973 e distâncias Hausdorff variando de 5,43 mm a 31,75 mm. Em relação ao tempo de segmentação não houve diferença estatisticamente significativa do método semiautomático quando comparado ao método manual (p>0,05). Também foram calculados os volumes obtidos nas diferentes segmentações e houve concordância quase perfeita entre as duas segmentações manuais realizadas pelo radiologista 1, entre as segmentações realizadas pelo radiologista 1 e pelo radiologista 2, entre as segmentações realizadas pelo radiologista 1 e pelo radiologista 3, e entre a segmentação manual e semiautomática realizadas pelo radiologista 1, sendo obtidos coeficientes de correlação intraclasse (ICC) entre 0,9927 e 0,9990. Os resultados obtidos demonstram boa reprodutibilidade intra e interobservador da segmentação manual utilizando o software 3D Slicer validando dessa forma esse método como ferramenta confiável para servir de padrão de referência em futuros estudos quantitativos desses tumores. Foi encontrada concordância quase perfeita entre as segmentações realizadas pelo método semiautomático quando comparadas com as segmentações realizadas pelo método manual, mas nossos resultados não demonstraram diferença significativa de tempo de segmentação do método semiautomático em relação ao método manual. / Soft tissue sarcomas constitute a diverse group of neoplasms that can arise in the connective tissues from virtually any region of the body. Magnetic resonance imaging (MRI) is currently the examination of choice for detection, regional staging and followup of these tumors. The segmentation of the lesions from the routine MR images allows the extraction of quantitative data, which has the potential to add information to the analysis. The purpose of the study is to evaluate the reproducibility of manual segmentation of soft tissue sarcomas in MRI images of patients with definitive diagnosis confirmed by histopathology. As a secondary objective, a comparison of manual and semiautomatic segmentation was performed to validate semiautomatic segmentation as an alternative method for segmentation of these tumors. We studied a retrospective cohort of 15 consecutive patients with confirmed diagnosis of soft tissue sarcoma accompanied at our service from January 2006 to January 2016 with MR images acquired prior to treatment and available for analysis in the DICOM format. The software was used 3D Slicer to perform segmentation by manual and semiautomatic methods. Three radiologists did the segmentations independently and blindly to allow inter-observer evaluation. The results obtained show high intraobserver reproducibility with Dice similarity coefficient between the segmentations ranging from 0.849 to 0.979 and Hausdorff distances ranging from 3.53 mm to 20.96 mm and good interobserver reproducibility with Dice similarity coefficients ranging from 0.741 to 0.972 and Hausdorff distances varying from 5.83 to 60.84 mm. A substantial agreement was found between the segmentations performed by the semiautomatic method when compared to the segmentations performed by the manual method with Dice similarity coefficients ranging from 0.871 to 0.973 and Hausdorff distances ranging from 5.43 mm to 31.75 mm. Regarding the segmentation time, there was no statistically significant difference of the semiautomatic method when compared to the manual method (p> 0.05). The volumes obtained in the different segmentations were also calculated and there was almost perfect agreement between the two manual segmentations performed by the radiologist 1, between the segmentations performed by radiologist 1 and radiologist 2, between the segmentations performed by radiologist 1 and radiologist 3, and between The manual and semi-automatic segmentation performed by the radiologist 1, and intraclass correlation coefficients (ICC) between 0.9927 and 0.9990 were obtained. The results obtained demonstrate good intra and interobserver reproducibility of the manual segmentation using 3D Slicer software, thus validating this method as a reliable tool to serve as a reference standard in future quantitative studies of these tumors. Almost perfect agreement was found between the segmentations performed by the semiautomatic method when compared to the segmentations performed by the manual method, but our results did not show a significant difference in segmentation time of the semiautomatic method in relation to the manual method.