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Développement d'approches de capture par affinité des virus à partir d'alimentsLévesque, Anthony 29 February 2024 (has links)
Le virus de l'hépatite A et les norovirus humains sont les principaux agents viraux causant des maladies d'origine alimentaire mondialement. Contrairement aux bactéries, une contamination des aliments par ces virus n'est pas facilement détectable et ceux-ci y sont présents en très faible quantité. Malheureusement, une faible concentration de ces virus sur les aliments suffit à provoquer une infection. Afin d'effectuer une détection sensible et éviter des éclosions, il est primordial d'effectuer une concentration de ces virus. L'objectif de ce projet était donc de développer deux méthodes de concentration, l'une possédant une affinité spécifique basée sur les anticorps spécifiques et l'autre possédant une affinité à large spectre utilisant l'apolipoprotéine H. La méthode basée sur les anticorps a été élaborer à partir d'autres méthodes similaires présenté dans la littérature. La méthode basée sur l'apolipoprotéine H, pour sa part, est méthode élaborer et optimiser durant ce projet de recherche. La caractérisation de l'affinité de l'apolipoprotéine H et son utilisation dans une méthode de concentration virale étant très peu détaillé par la communauté scientifique. Étant donné que les résultats obtenus pour la méthode de concentration basée sur les anticorps spécifiques étaient insatisfaisants. En effet, la sensibilité de la méthode ainsi que ça répétabilité était faible. Les efforts ont été dirigés vers la méthode de concentration basée sur l'apolipoprotéine H qui présentait des résultats prometteurs. À ce jour, aucune étude n'a démontré une affinité entre le virus de l'hépatite A et l'apolipoprotéine H et l'applicabilité de cette méthode à concentrer ces virus dans les aliments. Dans ce projet de recherche, la méthode basée sur l'apolipoprotéine H a été testée sur des fraises et des framboises fraîches et congelées contaminés expérimentalement par le virus de l'hépatite A et le norovirus humain GII.4 et comparée à la méthode référence ISO 15216 : 1. / Hepatitis A virus and human noroviruses are the major viral agents causing foodborne illness worldwide. Unlike bacteria, food contamination by these viruses is not easily detectable and they are present in very small quantities. Unfortunately, a low concentration of these viruses on food is enough to cause infection. In order to carry out a sensitive detection and avoid outbreaks, it is essential to carry out a concentration of these viruses. The objective of this project was therefore to develop two concentration methods, one with specific affinity based on specific antibodies and the other with broad-spectrum affinity using apolipoprotein H. The antibody-based method has been developed from other similar methods presented in the literature. The method based on apolipoprotein H, for that part, is a method developed and optimized during this research project. The characterization of the affinity of apolipoprotein H and its use in a method of viral concentration being very little detailed by the scientific community. Since the results obtained for the concentration method based on specific antibodies were unsatisfactory. Indeed, the sensitivity of the method as well as its repeatability was low. Efforts were directed towards the concentration method based on apolipoprotein H which showed promising results. To date, no study has demonstrated an affinity between the hepatitis A virus and apolipoprotein H and the applicability of this method to concentrate these viruses in food. In this research project, the method based on apolipoprotein H was tested on fresh and frozen strawberries and raspberries experimentally contaminated with the hepatitis A virus and the human norovirus GII.4 and compared with the ISO reference method. 15216: 1.
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Impact des biofilms de bactéries associées à la flore commensale des végétaux sur la résistance des norovirusPéloquin, Laurence 12 November 2023 (has links)
Thèse ou mémoire avec insertion d’articles. / La consommation d'aliments contaminés par le norovirus humain, tels que les baies et les légumes feuillus, est une cause majeure de gastro-entérite épidémique dans le monde. Par conséquent, les stratégies de contrôle visant à limiter l'adhésion du norovirus à la surface des produits végétaux ont fait l'objet de plusieurs études. Pendant la dernière décennie, les interactions entre les virus entériques et les bactéries commensales de l'intestin des mammifères ont été étudiées. Cependant, peu de travaux ont été réalisés sur les communautés bactériennes associées à la surface des baies et des légumes feuillus et leur rôle dans la transmission du norovirus humain. D'ailleurs, certaines bactéries de la flore commensale des végétaux sont connues pour leur capacité à former des biofilms dans lesquels des substances analogues aux récepteurs des norovirus sont sécrétées. La présence de biofilms bactériens pourrait ainsi contribuer à l'adhésion du norovirus à la surface des végétaux et favoriser sa persistance. Puisque les produits végétaux sont délicats et susceptibles d'être endommagés, les traitements conventionnels ne sont pas toujours appropriés pour inactiver les virus sans compromettre la qualité des aliments. Dans ce mémoire, neuf bactéries associées à la surface des baies et des légumes feuillus sous forme de biofilms ont été étudiées selon leur effet protecteur sur la persistance de deux virus modèles du norovirus humain, le norovirus murin (MNV-1) et le virus Tulane, après un traitement d'inactivation par la lumière pulsée à une fluence de 11,52 J/cm². Aucune différence significative n'a été détectée dans les réductions du titre viral de MNV-1 en présence de biofilms par rapport au MNV-1 seul après le traitement par la lumière pulsée. Le virus Tulane a montré une résistance plus élevée au traitement par la lumière pulsée lorsqu'il était en présence des biofilms formés par Enterobacter cloacae, Escherichia coli, Kocuria kristinae, Pantoae agglomerans et Pseudomonas fluorescens. / Consumption of contaminated food with human norovirus, such as fresh berries and leafy vegetables, is a major cause of epidemic gastroenteritis worldwide. Consequently, several studies have focused on strategies to prevent norovirus attachment to fresh produce. Over the last decade, interactions between enteric viruses and commensal bacteria of the mammalian gut have been investigated, but limited work has been done on the bacterial communities associated with the surface of fresh produce and their role in norovirus transmission. Some bacterial species can form a matrix of extracellular polymeric substances, called biofilm, in which molecules like norovirus receptors can be secreted. Thus, bacterial biofilms associated with the surface of berries and leafy vegetables could interplay with norovirus through direct interactions and modulate its attachment and persistence. Since fresh produce are susceptible to damage, conventional treatments are not always appropriate to inactivate viruses without compromising food quality. Therefore, there is an urgent need to understand how norovirus interacts with epiphytic bacteria, and more specifically with bacterial biofilms. Nine bacterial species were studied in terms of their protective effect on the persistence and infectivity of two norovirus surrogates, murine norovirus 1 (MNV-1) and Tulane virus, when subjected to a pulsed light inactivation treatment at a fluence of 11.52 J/cm². No significant difference was detected in reductions of MNV-1 when attached to bacterial biofilms compared with the control whereas Tulane virus showed a significantly higher resistance to pulsed light treatment when attached to biofilms formed by Enterobacter cloacae, Escherichia coli, Kocuria kristinae, Pantoae agglomerans, and Pseudomonas fluorescens.
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Concentration immuno-magnétique et détection moléculaire des norovirus dans les alimentsRoy, Sophie 19 April 2018 (has links)
Les norovirus sont les principaux agents responsables des gastroentérites aiguës d'origine virale à travers le monde, pouvant être transmis par des aliments contaminées. La quantité de particules virales retrouvée dans les aliments dépasse rarement la dose minimale infectieuse. Une étape de concentration s'avère nécessaire pour la détection de ces virus dans les aliments. L'objectif de ce projet était de développer et de valider une méthode de concentration immuno-magnétique combinée à l'amplification en temps réel pour une détection spécifique et sensible des norovirus. Une séquence peptidique caractéristique de la capside virale a été sélectionnée pour la production d'anti-norovirus spécifiques du génogroupe II. Les anticorps couplés à des billes magnétiques ont été utilisés pour concentrer les norovirus à partir d'aliments artificiellement contaminés. Les norovirus capturés ont été lysés et l'ARN viral libéré a été détecté par RT-PCR en temps réel. Les norovirus ont été détectés à une concentration de 20 unités RT-PCR.
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Rôle des antigènes tissulaires de groupes sanguins humains A, B, H et Lewis dans l'évolution des Norovirus GII.4 / Role of the A, B, H and Lewis histo-blood group antigens in the evolution of GII.4 norovirusesRougemont, Alexis, de 07 April 2011 (has links)
Les norovirus sont l'une des causes principales de gastroentérite. Depuis 2002, des variants de norovirus GII.4 successifs ont circulé dans la population par cycle de 2-3 ans, ce qui suscite des interrogations quant au rôle de leurs ligands, les antigènes tissulaires de groupes sanguins (HBGA), dans leur évolution. Nous avons analysé l'interaction entre des variants de GII.4 représentatifs et des HBGA, et déterminé le rôle d’acides aminés (aa) clés. Par mutagénèse dirigée, nous avons montré qu’une configuration stricte des aa directement impliqués dans l’accroche est indispensable. La suppression de la thréonine 395, caractéristique des variants après 2002, confère la capacité de se lier à Lex et Si-Lex, démontrant que les aa en dehors du site de liaison peuvent modifier les propriétés d’attachement. L'analyse de l'accroche de VLP de 6 variants isolés de 1987 à 2007 à des échantillons de salive phénotypés et des HBGA synthétiques montre que tous les variants sont capables de s’attacher à la salive des sécréteurs indépendamment du phénotype ABO et aux oligosaccharides propres au phénotype sécréteur. Deux variants récents ont pu également s’accrocher aux sucres présents dans la salive des nonsécréteurs Le(+). Nos données suggèrent que la capacité de se lier à Lex et Si-Lex serait une conséquence de la variation génétique des aa situés à proximité du site de liaison. L'analyse des propriétés d’attachement par résonance plasmonique de surface a montré que seuls les variants après 2002 présentent une affinité forte pour les antigènes A et B, suggérant que l’accélération évolutive des GII.4 pourrait être liée à une affinité accrue des variants pour les HBGA après 2002. / Noroviruses are one of the leading causes of gastroenteritis worldwide. Since 2002 successive GII.4 variants have circulated in the population before being replaced every 2-3 years, which raises questions about the role of their histo-blood group antigen (HBGAs) receptors in their evolution. We analyzed the interaction between representative GII.4 variants and HBGAs and determined the role of selected amino acids (aa) in the binding profiles. By mutagenesis, we showed that there was a strict structural requirement for the aa directly implicated in HBGA bindings. The ablation of the threonine 395 residue, an epidemiological feature of the post 2002 variants, allowed to gain the capacity to bind to the Lewis x and sialyl-Lewis x antigens, demonstrating that aa residues outside the HBGA binding site can modify the binding properties. The analysis of the attachment of VLPs from 6 variants isolated from 1987 to 2007 to phenotyped saliva samples and synthetic HBGAs shows that all variants could attach to saliva of secretors irrespective of the ABO phenotype and to oligosaccharides characteristic of the secretor phenotype. Interestingly, two recent variants additionally bound to carbohydrates present in the saliva of Lewis-positive non-secretors. Our data suggest that GII.4 binding to Lex and Si-Lex antigens might be a by-product of the genetic variation of the aa located in the vicinity of the binding site. Analysis of the binding properties by surface plasmon resonance showed that only post 2002 variants presented a strong affinity for A and B antigens, suggesting that the GII.4 evolution could be related to an increased affinity for HBGAs for the post 2002 variants.
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Modéliser la diffusion des infections nosocomiales : l'importance des données de réseaux au sein des établissements de soins / Multiscale modeling of the spread of resistant bacteria in healthcare settingsAssab, Rania 10 December 2018 (has links)
Chaque année les infections nosocomiales touchent plus de 4 millions de patients en Europe, avec un impact important en termes de mortalité, de morbidité et de coût. Parmi ces infections, celles causées par des bactéries multi-résistantes aux antibiotiques (BMR) jouent un rôle majeur. La modélisation mathématique des épidémies est un outil essentiel qui permet de mieux comprendre la dynamique de diffusion des BMR et d’évaluer l’efficacité des mesures de prévention.L'objectif principal de ce projet est d'étudier la dynamique de propagation de BMR au sein d'un réseau d'hôpitaux, en prenant en compte différentes échelles : intra-service, inter-services et inter-hôpitaux. Il s'agit de mettre en place une recherche méthodologique basée sur la modélisation mathématique et informatique et validée par des données recueillies au sein du réseau de soins Paris Île de France Ouest (PIFO), afin de mieux comprendre le rôle joué par chaque hôpital dans l'émergence et la sélection de BMR, de quantifier le risque de leur dissémination (y compris dans la population générale), et d'identifier des mesures de contrôle efficaces. Ce travail s'appuiera sur des méthodes d'inférence statistiques, d'analyse de sensibilité et d'analyses d'incertitude. / Each year nosocomial infections affect more than 4 million patients in Europe, with a significant impact in terms of mortality, morbidity and cost. Of these infections, those caused by multi-resistant bacteria (BMR) play a major role. Mathematical modeling of epidemics is an important tool to better understand the dynamics of dissemination of BMR and evaluate the effectiveness of prevention measures.The main objective of this project is to study the BMR propagation dynamics within a network of hospitals, taking into account different levels: intra-ward and inter-wards and inter-hospitals. This is to establish a research methodology based on mathematical and computer modeling and supported by data collected in the Paris Île de France Ouest (PIFO), to better understand the role played by each hospital in the emergence and selection of BMR, to quantify the risk of their dissemination (including in the general population), and to identify effective control measures. This work will be based on statistical inference methods, analytical sensitivity and uncertainty analysis.
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Tidsserieanalys av aktiv norovirus-infektion med RT-qPCR / Time-series analysis of active norovirus-infection with RT-qPCRDahlin, Henrik January 2019 (has links)
Norovirus som orsakar vinterkräksjukan är en av de vanligaste vintersjukdomarna i Sverige. Sjukdomstiden varar generellt i en till tre dagar med symptomen kräkning och/eller diarré. Till den totala sjukdomsbilden världen över gällande akut gastroenterit, bidrar norovirus med 18 %. Trots att sjukdomen är mycket vanlig är kunskapen om norovirusets förfarande till stor del okänd.Syftet med studien var att göra en tidsserieanalys, även så kallad One-Step Growth analys, av koncentrationen minus-RNA i celler som infekterats med olika koncentrationer av murint norovirus (MNV). För att detektera minus-RNA användes RT-qPCR med SYBR Green. Målet var att se om startkoncentrationerna av virus vid någon tidpunkt korrelerar med mängden minus-RNA i cellerna. Efter 4 och 8 timmar fanns ett exponentiellt samband mellan den initiala viruskoncentrationen och minus-RNA-uttrycket i cellerna. Koncentrationen minus-RNA i de infekterade cellerna ökade mellan de undersökta tiderna 4, 8 och 24 timmar. Vidare visade resultaten att det krävs 4 timmar för att minus-RNA skulle vara kvantifierbar vid en högre infektionskoncentration av viruspartiklar, medan det krävs 24 timmar för den lägre infektionskoncentrationen av viruspartiklar. / Norovirus causes winter vomiting disease and is one of the commonest cause of winter illness in Sweden. The disease period generally lasts one to three days with symptoms like vomiting and/or diarrhea. To the disease burden of acute gastroenteritis worldwide, norovirus contributes with 18 %. Even though the illness is very common, the knowledge about norovirus is poor and largely unknown.The purpose of the study was to do a time series analysis, a so-called One-Step Growth analysis, of the minus-RNA concentration in cells infected with different concentrations of murine norovirus (MNV). For the detection of minus-RNA RT-qPCR was used with SYBR Green. The goal was to correlate start concentration of virus at any time with the amount of minus-RNA in the cells. At 4 and 8 hours there was an exponential connection by the initial virus concentration and minus-RNA development in the cells. The concentration of minus-RNA in the infected cells increased between 4, 8 and 24 hours. Further, the results can be interpreted as requiring 4 hours for the higher concentrations to become quantifiable, while requiring 24 hours for the lower concentrations to become quantifiable.
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Untersuchungen zur Tenazität des Norovirus-Surrogates Felines Calicivirus unter dem Einfluss von D/L-Milchsäure, Natriumchlorid und Natriumnitrit sowie zum Verhalten in Rohwürsten: Untersuchungen zur Tenazität des Norovirus-Surrogates Felines Calicivirus unter dem Einfluss von D/L-Milchsäure, Natriumchlorid und Natriumnitrit sowie zum Verhalten in RohwürstenHeinze, Janin 16 March 2010 (has links)
Noroviren gelten neben Rotaviren, Salmonellen und Campylobacter spp. derzeit als Hauptursache infektiöser meldepflichtiger Gastroenteritiden des Menschen in Deutschland. Im Jahr 2008 wurden 212.692 Fälle norovirusbedingter Erkrankungen gemeldet (RKI 2009b). Dabei spielen lebensmittelassozierte Infektionen eine bedeutende Rolle. Besonders rohe und unerhitzt verzehrte Produkte bergen ein Risikopotential. Neben Muscheln, Salaten und Früchten konnten die Erreger auch aus Rohwurstprodukten isoliert werden. Aus mikrobiologischer Sicht sind Rohwürste bereits als Risikoprodukte bekannt. Bisher existieren jedoch nur unzureichende wissenschaftliche Ergebnisse über die Infektionsgefahr durch Viren in Lebensmitteln.
In der vorliegenden Arbeit wurde die Tenazität und Inaktivierungskinetik von Noroviren anhand des Norovirus-Surrogates Felines Calicivirus untersucht. Zunächst wurde in Suspensionsversuchen der Einfluss verschiedener Konzentrationen von D/L-Milchsäure (0,1; 0,15; 0,2; 0,3 und 0,4 %), Natriumchlorid (2; 6; 12 und 20 %) und Natriumnitrit (100; 150 und 200 ppm) über einen Zeitraum von 7 Tagen bei 4 und 20 °C auf das Virus geprüft. Anschließend wurden Versuchsreihen mit artifiziell kontaminierten Rohwürsten durchgeführt.
Der Infektiositätsnachweis erfolgte im Crandell-Reese-Feline-Kidney-Zellkultursystem.
In den Suspensionsversuchen zeigte sich eine konzentrations-, zeit- und temperaturabhängige Wirkung der geprüften Parameter. Signifikante Infektiositätsreduktionen ergaben sich bei 20 °C- Lagerung für D/L-Milchsäure-Konzentrationen ab 0,15 % und bei 4 °C -Lagerung ab 0,3 %. Natriumchlorid bewirkte signifikante Titerreduktionen bei 20 °C-Lagerung ab einer NaCl-Konzentration von 2 %, jedoch nicht unter Kühlbedingungen. Die Reduktion der Virusinfektiosität nahm mit steigender Natriumchlorid- bzw. D/L-Milchsäurekonzentration zu. Für praxisübliche Konzentrationen von Natriumnitrit konnte keine zusätzliche Reduktion der Infektiosität nachgewiesen werden.
In den Versuchsreihen mit kurz- und langgereiften Rohwürsten erwies sich FCV als sehr stabil. In beiden Produkten konnte bis zum Ende des Versuchszeitraumes nach 21 bzw. 56 Tagen infektiöses Virus nachgewiesen werden. Somit könnten Rohwurstprodukte bei einer möglichen Kontamination mit Noroviren zum Zeitpunkt des Verzehrs ein Gesundheitsrisiko für den Verbraucher darstellen. Jedoch zeigten sich auch deutliche temperatur- und zeitabhängige Wirkungen. Ein positiver Einfluss auf die Inaktivierung ist durch die Anwendung von Reife- und Lagerungstemperaturen um 22 °C zu erwarten. Es kam zu einer kontinuierlichen Virustiterreduktion von insgesamt 1,6 log10 TCID50 / g (für kurzgereifte Produkte) bzw. 3,1 log10 TCID50 / g (für langgereifte Produkte). Eine Beeinflussung der Tenazität des Norovirus-Surrogates FCV durch spezifische Herstellungs- und Lagerungsbedingungen ist somit möglich. Insbesondere die gezielte Kombination einzelner Faktoren miteinander, wie NaCl- und Milchsäuregehalt der Rohwurst, in Verbindung mit spezifischer Lagerungstemperatur und –dauer führt zu effektiver Infektiositätsminderung potentiell enthaltener Viren. Die so erzielte Risikominimierung durch Kombination ausgewählter Parameter bedeutet für die Rohwurstproduktion eine sowohl effiziente, als auch praktikable Möglichkeit, die Lebensmittelsicherheit in Bezug auf virale Infektionserreger deutlich zu erhöhen.
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Epidemiologic and molecular studies of human norovirus genogroup II strains in Hong Kong. / CUHK electronic theses & dissertations collectionJanuary 2007 (has links)
Norovirus (NoV) is a leading causative agent of non-bacterial gastroenteritis in humans worldwide. NoV is genetically classified into five distinct genogroups in which genogroups I (GI), II, and rarely IV infect humans. Each genogroup is further subdivided into different genotypes. Previous local surveillance studies demonstrated that NoV GII, in particular the genotype 4 (GII/4) strain, is the predominant genogroup circulating in Hong Kong since 2001. Similar epidemiologic observations were also reported in the US, Europe, UK, Australia, and Japan, highlighting the enormous pandemic and epidemic potential of this genogroup. However, explanation for its predominance has been lacking. In this study, we demonstrated that NoV GII, comprised mostly of the GII/4 strain, showed an increased median viral RNA level in fecal specimens which was at least 100-fold higher than that of GI. The high level of viral shedding may confer greater opportunity for transmission of GII strains through the fecal-oral route. We also demonstrated that fecal viral RNA level correlated positively and independently with diarrhea duration in NoV GII/4 infections. The median fecal viral level in patients with protracted (last for ≥4 days) diarrhea was 100-fold higher than that in patients with only limited diarrhea. Longer infectivity period may also confer greater opportunity for virus transmission through the fecal-oral route. Higher chance of transmission may result in more efficient person-to-person transmission and rapid dissemination, maintaining a high level of NoV GII persistence in the community. In summer 2006, a territory-wide gastroenteritis outbreak attributed to NoV has occurred with more than 3,000 cases of laboratory-confirmed NoV infections in Hong Kong. Phylogenetic analysis showed that the virus causing this unprecedented outbreak was a novel NoV GII/4 variant distinct from all previously reported global pandemic and local epidemic strains. In this 2006 variant, we identified two hypervariable regions when compared with previous local epidemic strains in 2005: protruding domain 2 (P2 domain) of viral protein 1 (VP1) and VP1-binding domain of VP2. We mapped frequent amino acid substitutions to the modeled antigenic loop regions of P2 domain. We also identified in carboxyl-terminus of VP1 an epidemiologically important, putative conformational epitope that alternates between two 3-amino acid signatures during pandemic NoV GII/4 strains evolution since 1995. Our findings reflect the rapid evolution of NoV GII/4 under immunological pressure and suggest that immune evasion might be a potential mechanism for pandemic NoV GII/4 strains emergence. Taken together, high level of fecal viral shedding, longer infectivity period, and periodic emergence of novel variant may underlie the global predominance of NoV GII. Further investigations are warranted to better understand the public health and biological importance of NoV GII. / Chan, Chi Wai. / Adviser: Wai K. Leung. / Source: Dissertation Abstracts International, Volume: 69-02, Section: B, page: 0818. / Thesis (Ph.D.)--Chinese University of Hong Kong, 2007. / Includes bibliographical references (leaves 124-143). / Electronic reproduction. Hong Kong : Chinese University of Hong Kong, [2012] System requirements: Adobe Acrobat Reader. Available via World Wide Web. / Electronic reproduction. [Ann Arbor, MI] : ProQuest Information and Learning, [200-] System requirements: Adobe Acrobat Reader. Available via World Wide Web. / Abstract also in Chinese. / School code: 1307.
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Modulators of innate gut immunity to enteric viral infections : murine norovirus (MNV) as a modelEisa, Osama Eltayeb Idris January 2018 (has links)
Challenged by a huge and diverse antigenic stimulus, the intestinal mucosa has developed a unique immune system that mainly functions to maintain tolerance to innocuous antigens while retaining the ability to respond swiftly to pathogenic threats. Central to this specialised immune system are the Intraepithelial Lymphocytes (IELs). These cells are uniquely located between Intestinal Epithelial Cells (IECs) ready to respond to exogenous antigens in the intestinal lumen. The intestinal immune system is constantly influenced, not only by the commensal microbiota, but also by the nutritional status of the host and the availability of certain essential micronutrients that are derived from a healthy-balanced diet. Additionally, age has a significant impact on the efficiency of gut immunity in responding to infectious pathogens, as reflected by the increased burden of gastrointestinal infections at the extremes of age. In this thesis, using the Murine Norovirus (MNV) oral infection model, I aimed to characterize intestinal mucosal antiviral-responses with specific focus on the role of IELs, the impact of aging and the influence of certain micronutrients whose effects are mediated through the Aryl Hydrocarbon Receptor (AhR). Employing different knock-out and adoptive transfer experiments, I concluded that, at least in our experimental conditions and in a viral strain-specific manner, the activated IELs are not essential and may play a minor role in the protective response against MNV infection. This work also demonstrated that various MNV virus strains activate IELs differentially and for the first time (to our knowledge) revealed distinct abilities of these different Norovirus variants to infect IECs. Recognising an impaired response in old (2-year) mice, we were also able to identify a specific defect in the IFN-Lambda response of aged IECs. Furthermore, using the model of MNV infection to investigate the role of AhR signalling, the data I generated suggested a direct link between constitutive AhR signalling and innate interferon-mediated responses. These findings have uncovered a potential preventive/therapeutic targets for enhancing anti-viral responses.
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UTILIZATION OF EMULSION CHEMISTRIES FOR DELIVERY AND ANTIVIRAL APPLICATION OF CARVACROLHsu, Hao-yuan 08 April 2020 (has links)
Human norovirus (HuNoVs) are the most common enteric pathogen around the world that cause ~50% of foodborne illness of disease outbreaks annually. HuNoVs are the member of the Caliciviridae family, which consist of small (38 nm), unenveloped, single stranded RNA (ssRNA) viruses. Norovirus are divided into 5 genogroup (GI, GII, GIII, GIV, GV, GVI and GVII). The GI, GII, and GIV cause human illness, in addition, GII.4 genotype cause the most human disease. Due to HuNoVs are difficult cultured in vitro, the cultivable HuNoVs surrogates have been widely studied. Recently, some studies have been conducted with HuNoVs surrogates, for example bacteriophage MS2. MS2 is conservative surrogate for nonenveloped viruses which there is a close relationship to the behavior of HuNoVs, thus we can examine the infection control measures for HuNoVs. Despite plenty of treatment method been done on testing antiviral effect on bacteriophage MS2, for example UV inactivation, steam ultrasound and antimicrobial etc., plant-based nanoemulsion treatment has yet to be explored. Carvacrol is a major component of oregano essential oil and is responsible for their antimicrobial activity on the growth of various microorganism. In this study, carvacrol nanoemulsions were formed by using the spontaneous emulsification for testing the nanoemulsion stability (14 days shelf life study on its droplet size and particle charge) and antimicrobial activity.
In carvacrol nanoemulsion 14 days shelf life test, the droplet size and particle charge stay stable at three different treatment environments (4°C, 20°C and 37°C). The results proved that nanoemulsion (was formed with surfactant agents and medium-chain triglycerides) is stable system that gives consistent droplet size and charge. Although, the low antimicrobial activity was investigated at carvacrol nanoemulsion, the strong antimicrobial effects have been found when carvacrol or carvacrol combined with ionic surfactant of treatment on MS2 and Escherichia coli. Taken together, in the wake of growing consumer demand for different “natural” products in a number of industries, our study broadly informs the development and study of functionalized carvacrol active compound that can not only provide beneficial health for human but can also examine antimicrobial efficacy of control measures for public health.
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