Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-11-21T12:53:38Z No. of bitstreams: 1 Dissertação- Helaine Virgolino.pdf: 2278711 bytes, checksum: 97565d221d2c544a06d4047f136b653c (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-11-21T12:53:59Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação- Helaine Virgolino.pdf: 2278711 bytes, checksum: 97565d221d2c544a06d4047f136b653c (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-11-21T12:54:30Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação- Helaine Virgolino.pdf: 2278711 bytes, checksum: 97565d221d2c544a06d4047f136b653c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-21T12:54:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação- Helaine Virgolino.pdf: 2278711 bytes, checksum: 97565d221d2c544a06d4047f136b653c (MD5) Previous issue date: 2013-04-15 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The infection caused by the hepatitis B virus (HBV) has a worldwide distribution and represents a major public health problem. Hepatitis B also sets a risk in transfusion therapy given the potential transmission parenterally. In serological screening for HBV markers are used to detect the virus surface antigen (HBsAg) and antibody to the core antigen (anti-HBc). The occult hepatitis B (characterized by the presence of HBV DNA in HBsAg negative samples), has been a challenge for serological screening of blood donors in the state of Amazonas where there are more than 22% of donations reactive for anti-marker HBc in isolation. Moreover, conclusive studies on the frequency of occult hepatitis B are scarce in the state of Amazonas. As the area of high prevalence of HBV infection, it is necessary to investigate the frequency of hepatitis B hidden. In this context, the present study aimed to evaluate the presence of hepatitis B hidden in samples anti-HBc positive with or without the presence of the marker anti-HBs in serological screening of donor blood from Units collections Transfusion (UCT's) in regional health Alto Solimoes and Amazonas, from June/2011 to June/2012. We used qualitative and quantitative methods of serological markers for infection and molecular detection, quantification of viral load and genotyping of HBV. The prevalence of anti-HBc reactive within the State of Amazonas among blood donors was 22, 19%. We analyzed 112 samples reactive anti-HBc and HBsAg negative, of these, 04 were positive for HBV DNA. The higher frequency of blood donors with reactive serology for hepatitis B from the regional Alto Solimoes and Amazonas have the serological profile anti- HBc and anti-HBs reactive and are not first-time donors. The prevalence of occult heptatite B in donors from the regional health Alto Solimoes and Amazonas are 3.57%. The presence of the marker in anti-HBs titers (above 100 mIU / ml) is not associated with the absence of occult hepatitis B in blood donors of the regional health Alto Solimoes and Amazonas. No association was found between viral load and hepatitis B serologic profile of blood donors HBV DNA positive. Could not describe the genotypes of samples positive for HBV DNA. The risk of occult infection with hepatitis B virus (OIB) is real and can be seen in countries where the technique was implemented and also through the data of this study. The occurrence of OIB in blood donors in the Amazon region leads to the questioning of the algorithm currently obeyed. You can also establish new strategies to contemplate transfusion safety, blood needs in the state and dispose of blood products. / A infecção causada pelo vírus da hepatite B (VHB) tem uma distribuição mundial e representa um importante problema de saúde pública. A hepatite B ainda configura um risco na terapia transfusional tendo em vista o potencial de transmissão parenteral. Na triagem sorológica para o VHB são utilizados marcadores que detectam o antígeno de superfície do vírus (HBsAg) e o anticorpo contra o antígeno do core (anti-HBc). A hepatite B oculta (caracterizada pela presença de DNA do VHB, em amostras HBsAg negativas), tem sido um desafio na triagem sorológica de doadores de sangue do interior do Estado do Amazonas onde existem mais de 22% de doações reativas para o marcador anti-HBc de forma isolada. Além disso, estudos conclusivos sobre a frequência da hepatite B oculta são escassos no Estado do Amazonas. Sendo a região de alta prevalência da infecção do VHB, faz-se necessária a investigação da frequência da hepatite B oculta. Neste contexto, o presente estudo teve como objetivo avaliar a presença da hepatite B oculta em amostras anti-HBc positivas com ou sem a presença do marcador anti-HBs na triagem sorológica de doadores de sangue oriundo das Unidades de Coletas Transfusionais (UCT’s) nas regionais de saúde do Alto Solimões e Amazonas, no período de junho/2011 a junho/2012. Foram utilizados métodos sorológicos qualitativos e quantitativos dos marcadores para a infecção e moleculares para detecção, quantificação da carga viral e genotipagem do VHB. A prevalência do anti-HBc total reativo no interior do Estado do Amazonas entre os doadores de sangue foi de 22, 19 %. Foram analisadas 112 amostras anti-HBc reativas e HBsAg negativas, destas, 04 foram positivas para o DNA-VHB. A maior frequência dos doadores de sangue com sorologia reativa para hepatite B oriundos das regionais Alto Solimões e Amazonas apresentam o perfil sorológico anti-HBc e anti-HBs reativos e não são doadores de primeira vez. A prevalência de heptatite B oculta encontrada em doadores oriundos das regionais de saúde Alto Solimões e Amazonas foi de 3,57%. A presença do marcador anti-HBs em títulos elevados (acima de 100 mUI/ml) não foi associada à ausência da hepatite B oculta em doadores de sangue das regionais de saúde Alto Solimões e Amazonas. Não houve associação entre a carga viral encontrada e o perfil sorológico para hepatite B dos doadores de sangue DNA VHB positivos. Não foi possível descrever os genótipos das amostras positivas para o DNA VHB. O risco da IOB pode ser comprovado nos Países onde a técnica de detecção de ácido nucleico (NAT) foi implantada e também através dos resultados deste estudo. A ocorrência de infecção oculta pelo vírus da hepatite B leva ao questionamento do algorítimo atualmente estabelecido para triagem de doadores de sangue na região Amazônica. Seria possível também estabelecer novas estratégias para contemplar segurança transfusional, escassez de sangue no interior do estado e grande descarte de hemocomponentes.

A demanda por abordagens eficientes para o problema de reconhecer a estrutura de cada gene numa sequência genômica motivou a implementação de um grande número de programas preditores de genes. Fizemos uma análise dos programas de sucesso com abordagem probabilística e reconhecemos semelhanças na implementação dos mesmos. A maior parte desses programas utiliza a cadeia oculta generalizada de Markov (GHMM - generalized hiddenMarkov model) como um modelo de gene. Percebemos que muitos preditores têm a arquitetura da GHMM fixada no código-fonte, dificultando a investigação de novas abordagens. Devido a essa dificuldade e pelas semelhanças entre os programas atuais, implementamos o sistema MYOP (Make Your Own Predictor) que tem como objetivo fornecer um ambiente flexível o qual permite avaliar rapidamente cada modelo de gene. Mostramos a utilidade da ferramenta através da implementação e avaliação de 96 modelos de genes em que cada modelo é formado por um conjunto de estados e cada estado tem uma distribuição de duração e um outro modelo probabilístico. Verificamos que nem sempre um modelo probabilísticomais sofisticado fornece um preditor melhor, mostrando a relevância das experimentações e a importância de um sistema como o MYOP. / The demand for efficient approaches for the gene structure prediction has motivated the implementation of different programs. In this work, we have analyzed successful programs that apply the probabilistic approach. We have observed similarities between different implementations, the same mathematical framework called generalized hidden Markov chain (GHMM) is applied. One problem with these implementations is that they maintain fixed GHMM architectures that are hard-coded. Due to this problem and similarities between the programs, we have implemented the MYOP framework (Make Your Own Predictor) with the objective of providing a flexible environment that allows the rapid evaluation of each gene model. We have demonstrated the utility of this tool through the implementation and evaluation of 96 gene models in which each model has a set of states and each state has a duration distribution and a probabilistic model. We have shown that a sophisticated probabilisticmodel is not sufficient to obtain better predictor, showing the experimentation relevance and the importance of a system as MYOP.

Introdução. A infecção causada pelo vírus da hepatite B (HBV) é um dos agravos de maior prevalência no mundial. Segundo a Organização Mundial da Saúde (OMS) existem mais de 350 milhões de portadores crônicos da doença. A infecção pelo HBV é rotineiramente identificada quando há a presença do HBsAg circulante. Entretanto, em alguns casos o HBV-DNA tem sido detectado em indivíduos HBsAg negativos, positivos ou negativos para anti-HBc e anti-HBs. Essa apresentação sorológica e molecular é denominada infecção oculta pelo HBV (OBI). Geralmente a concentração do HBV-DNA no soro será abaixo de 200 UI/mL. Objetivo: Determinar a prevalência da OBI, em doadores de sangue do Estado do Amapá no ano de 2014. Material e Métodos. Foram analisadas um total de 62 amostras de doadores de sangue do estado do Amapá, no ano de 2014, que apresentavam o perfil sorológico: HBsAg negativo, anti-HBc positivo e com anti-HBs negativo ou positivo. Os marcadores sorológicos HBsAg e anti-HBc foram determinados através do imunoensaio quimioluminescente. As amostras selecionadas para a detecção do HBV-DNA foram testadas utilizando as metodologias de Real-Time PCR Kit NAT HIV/HCV/HBV (Bio-Manguinhos®) e PCR \"in house\". Resultados. Do total de 13.261 doadores triados para infecções transmissíveis pelo sangue, 283 apresentaram resultados reagentes para os marcadores da hepatite B, nos quais: 35 (0,3%) foram HBsAg e 248 (1,9%) para anti-HBc reagentes. Um total de 62 amostras foram testadas pelos métodos moleculares. Todas as amostras apresentaram resultado HBV-DNA não-detectável. Conclusão: O índice de inaptidão sorológica no ano de 2014 no HEMOAP foi de 1,9% para anti-HBc e 0,3% para HBsAg. A população estudada foi constituída predominantemente por adultos com idade entre 29-65 anos, do sexo masculino, casados e naturais de municípios do estado do Amapá / Introduction. The infection caused by the hepatitis B virus (HBV) is one of the most prevalent diseases in the world. According to the World Health Organization (WHO) there are more than 350 million chronic carriers of the disease. HBV infection is routinely identified when there is presence of circulating HBsAg. However, in some cases HBV-DNA has been detected in HBsAg negative individuals, positive or negative for anti-HBc and anti-HBs. This serological and molecular presentation is termed HBV-occult infection (OBI). Usually the concentration of HBV-DNA in serum will be below 200 IU / mL.Objective: To determine the prevalence of OBI in blood donors, in the State of Amapá, in the 2014. Material and methods. A total of 62 samples of blood donors from the State of Amapá in the year 2014 were analyzed, presenting the serological profile: HBsAg negative, anti-HBc positive and with negative or positive anti-HBs. Serum markers HBsAg and anti-HBc were determined by the chemiluminescent immunoassay. Samples selected for HBV-DNA detection were tested using the Real-Time PCR Kit Kit HIV / HCV / HBV (Bio-Manguinhos®) and in-house PCR. Results. Of the total of 13,261 donors screened for blood-borne infections, 283 presented reactive results for hepatitis B markers, in which: 35 (0.3%) were HBsAg and 248 (1.9%) for anti-HBc reagents. All samples showed nondetectable HBV-DNA result. Conclusion: The serological disability index in the year 2014 in HEMOAP was 1.9% for anti-HBc and 0.3% for HBsAg. The studied population consisted predominantly of adults aged 29-65 years, males, married and natural of cities of the state of Amapá

Introducción:Fuera de toda duda la utilidad de los programas de screening del Cáncer Colo Rectal (CCR) basados en la detección de sangre oculta en heces en su misión de conseguir una disminución de la mortalidad por ésta patología, los esfuerzos deben ahora dirigirse hacia la forma de aumentar la participación de la población general en éstos estudios.Objetivos:El objetivo de éste estudio ha sido demostrar si es posible conseguir un aumento significativo de la participación mediante la invitación a la población diana por medio del contacto directo comparado frente al método estándar de invitación por carta. Pacientes y Método: Se ha realizado un ensayo controlado con dos grupos. Como sujetos de estudio se han utilizado a todas las personas de ambos sexos de edad comprendida entre los 50-74 años integradas en un Centro de Asistencia Primaria, pertenecientes a una mútua de empleados municipales de Barcelona (PAMEM) . Como criterio de exclusión solo ha sido utilizado la existencia de antecedentes personales de CCR (n=2026). Un grupo ha recibido la invitación y dos receptáculos para la recogida de muestras de heces a través del correo (Grupo Estándar, n=1060), mientras que el otro grupo (Grupo de Contacto Directo, n=966), ha recibido la visita de una persona no sanitaria que le ha entregado la misma documentación que al Grupo Estándar. La prueba de cribado ha consistido en un método inmunológico para la detección de sangre oculta en heces ("Hexagon Obti test"-Human H.), que no precisa dieta previa. Se han recogido muestras en dos dias sucesivos. Se ha realizado una llamada telefónica de refuerzo. Se han determinado la tasa de participación y el nivel de cumplimiento de la prueba de cribado, y posterior análisis de éstas variables principales en función de la forma de invitación (dieferencias entre grupos), sexo, y edad.Resultados: Ha existido un aumento significativo de la participación en el Grupo de Contacto Directo (558/966, 57,8%) en relación con el Grupo Estándar (387/1060, 36,5%) con una p<0,005.. El cumplimiento de la prueba de cribado, también ha sido mayor en el Grupo de Contacto Directo (417/556), 75,1%) en relación con el Grupo Estándar (263/387, 68%) con una p<0,014. No ha habido diferencias por grupo de edad ni sexo, ni en la participación ni en el cumplimiento.Conclusiones: Es posible aumentar la participación y el cumplimiento de la prueba de cribado en los programas de detección precoz del CCR, mediante la invitación por contacto directo efectuada por una persona no sanitaria. / Purpose of the Study: The reduction in mortality associated with Colo Rectal Cancer (CRC) provides scientific evidence for the effectiveness of CRC screening programs based on the detection of faecal occult blood. However, participation in such populational screening programs must be increased in order to obtain the desirable levels of effectiveness.The objective of the present study was to analyze participation through the invitation of the target population by means of direct contact compared with the standard method of invitation by letter.Method: A controlled trial with two groups was carried out. All individuals of both sexes aged between 50 and 74 years enlisted in one Primary Health Care Centre affiliated to a private health insurance scheme for municipal employees in Barcelona (PAMEM) were included. Subjects were excluded if they had a clinical history of CRC (n=2026).One group received the invitation and two containers for the collection of faecal specimens by post (the Standard group, n=1060), while the other group (Direct Contact group, n=966) were visited by a non-health professional (previously trained to transmit the required message) who supplied them with the same documentation as the Standard group. A reminder telephone call was made to subjects who did not respond to the initial contact.The screening test consisted of an immunological method for the detection of faecal blood which does not require any prior specific dietary measures (the "Hexagon Obti test" - Human H). Specimens were collect on two successive days.Participation rates and the level of compliance with the screening test were determined, and these variables subsequently analyzed as a functions of the method of invitation (group differences), sex and age.Results: A significantly higher participation was observed in the Direct Contact group (558/966, 57.8%) compared to the Standard group (387/1060, 36,5%) with a p<0.005. Compliance with the screening test was also higher in the Direct Contact group (417/556, 75.1%) compared to the Standard group (263/387, 68%) with a p<0.014. There were no differences in terms of either age group or sex for the participation, nor for level of compliance.Conclusions: Participation and level of screening test compliance can be raised in CRC screening programs, by means of an invitation made through direct contact by a non-health professional.

Orientador: Egberto Ribeiro Turato / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-14T16:32:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Packer_MilenePescatori_M.pdf: 419054 bytes, checksum: 4c762c969689734886832bbc0d1ec1ea (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: Discutir as vivências relatadas por moradores de rua, com história de uso abusivo de álcool, que passaram a morar em instituição confessional do Município de Campinas, dentro de um programa de acolhimento e de cuidados gerais. Sujeitos e Métodos: Foi empregado o método de pesquisa clínico-qualitativo com entrevista semi-dirigida com questões abertas. A coleta dos dados foi na Fraternidade Toca de Assis. A pesquisa contou com nove sujeitos ex-moradores de rua, sendo usado o critério da saturação para o fechamento da amostra. Foi utilizada a técnica de análise do conteúdo temático para a formação das categorias aprovadas pelos pares. Resultados: Foram extraídos três artigos: "Facilitações e barreiras em pesquisa de campo a propósito do emprego de métodos qualitativos em instituição informal de saúde"; "Pra suprir um vazio no estômago": o uso do álcool segundo relatos de ex-moradores de rua"; "Virei um mendigo": relatos de exmoradores de rua acolhidos em uma Instituição Confessional no Brasil". Discussão: A escolha de um campo que escapa ao habitual dos profissionais institucionalizados na saúde permitiu uma discussão acerca dos desafios da entrada em campo, assim como da coleta dos dados. Consideramos que o relato desta experiência acrescentaria os elementos teóricos à metodologia escolhida. No relato da experiência de vida dos sujeitos da pesquisa foi enfática a relação pessoal desses sujeitos com o fenômeno do uso abusivo do álcool e o processo de desconstrução psicológica da identidade. Conclusões: É possível ser construída uma nova vida, principalmente pelos próprios ex-moradores de rua. Depreende-se que parecem querer sair das ruas, mesmo que isso lhes pareça algo distante. / Abstract: Discuss the experiences of homeless with abuse of alcohol in an institution Confessional. Subjects and Methods: Clinical-qualitative research with semi-structured Interview to open question. Data collection was in the Fraternity Toca de Assis. The research subjects had nine homeless, and used the criterion of saturation for the closing of the sample. Used the technique of analysis of thematic content for the formation of the categories approved by peers. Results: Extracted three papers: "Facilities and barriers in field research by the way of the use of qualitative methods in health informal institution"; "to fill an empty stomach.": the use of alcohol according to reports from ex-homeless"; "turned a beggar": reports of ex-homeless sheltered in a Confessional Institution in Brazil". Discussion: The choice of a field beyond the usual of institutionalized health professionals led a discussion about the challenges of entering the field, as well as data collection. We believe that reporting this experience add elements to the methodology chosen theorists. In reporting the experience of life of research subjects was emphatically a personal relationship with the subject the phenomenon of abuse of alcohol and the process of psychological deconstruction of identity. Conclusions: It can be built a new life mainly by the homeless. It seems that they want to leave the streets, even if this seems distant. / Mestrado / Ciencias Biomedicas / Mestre em Ciências Médicas

Submitted by JÚLIO HEBER SILVA (julioheber@yahoo.com.br) on 2017-12-07T17:53:18Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Kamilla Nogueira Pimentel - 2016.pdf: 2443751 bytes, checksum: ca63d8c5718f805e8ab1913299696b99 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-12-08T10:35:41Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Kamilla Nogueira Pimentel - 2016.pdf: 2443751 bytes, checksum: ca63d8c5718f805e8ab1913299696b99 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-08T10:35:41Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Kamilla Nogueira Pimentel - 2016.pdf: 2443751 bytes, checksum: ca63d8c5718f805e8ab1913299696b99 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-09-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The hepatitis B virus infection (HBV) and diabetes mellitus type II represent serious public health problems and, the synergism between these two diseases, can affect the prognosis of the patients with increased risk of developing chronic liver disease, cirrhosis and hepatocellular carcinoma. The aims of the present study were to investigate the HBV occult infection and to evaluate the vaccine response in patients with diabetes mellitus type II, in Goiânia-Goiás. This study is part of the research "Investigation of the serological, epidemiological and molecular profile of the hepatitis B virus infection in patients with diabetes mellitus type 2 in Goiânia-Goiás" which was developed in five public health units Goiânia. After serologic screening of the population (n = 605), 108 anti-HBc positive patients/HBsAg negative were selected for the HBV-DNA research. For this, after extraction of viral genome, a semi-nested PCR was performed with primers complementary to region pre-S/S of HBV. Among the patients recruited in the units of the Family Health Program (N = 215) those susceptible to HBV infection (N = 172) were selected and invited to participate of the cohort about vacinal response. Thus, 128, 99 and 87 individuals agreed to receive the first, second, and third doses of recombinant vaccine Butang®, respectively. The subjects who received three doses of the vaccine and who agreed to participate in a new blood collection (N = 69) were evaluated for the quantitative detection of anti-HBs marker by enzyme-linked immunosorbent assay microparticle (MEIA) using the AxSYM system automation and AxSYM kits AUSAB (Brazil Abbot Laboratories). It was not found occult HBV infection in diabetic patients in Goiânia- Goiás, which is similar to that found in other population groups in Brazil. In relation to the vaccine response, of the 69 samples analyzed, was observed that 53.6% of patients were able to respond to vaccination, and the geometric mean of anti-HBs titres was 13.76 mIU/mL. The seroprotection rate found in diabetic patients in Goiânia- GO was considered low compared to the healthy adult population. Thus, the data obtained in this study may help in the planning of specific prevention actions of hepatitis B in a population that usually have comorbidities. / A infecção pelo vírus da hepatite B (HBV) e a diabetes mellitus tipo II representam sérios agravos de saúde pública e, quando associadas, podem piorar o prognóstico do paciente, com maior risco de desenvolvimento de doença hepática crônica, cirrose e carcinoma hepatocelular. Os objetivos deste estudo foram investigar o índice de infecção oculta pelo HBV e avaliar a resposta vacinal em pacientes com diabetes mellitus tipo II, em Goiânia-Goiás. Este estudo é parte do projeto intitulado “Investigação do perfil sorológico, epidemiológico e molecular da infecção pelo vírus da hepatite B em pacientes com diabetes mellitus tipo 2 em Goiânia-Goiás” desenvolvido em cinco unidades de saúde pública de Goiânia. Assim, após a triagem sorológica da população (n=605), foram selecionados 108 pacientes anti-HBc positivos/HBsAg negativos para a pesquisa do HBV-DNA. Para isso, após a extração do genoma viral, foi realizada uma semi-nested PCR utilizando primers complementares à região Pré-S/S do HBV. Para a avaliação da resposta vacinal, foram selecionados os pacientes atendidos nas unidades do Programa de Saúde da Família (N=215), sendo aqueles suscetíveis à infecção pelo HBV (N=158) convidados a fazer parte da coorte. Assim, 128, 99 e 87 indivíduos aceitaram receber a primeira, segunda e terceira doses da vacina recombinante Butang®, respectivamente. Os indivíduos que receberam as três doses da vacina e que aceitaram participar de uma nova coleta sanguínea (N=69) foram avaliados para a detecção quantitativa do marcador anti-HBs pelo ensaio imunoenzimático de micropartícula (MEIA), utilizando o Sistema AxSYM de automação e kits AxSYM AUSAB (Abbot Laboratórios do Brasil). Não foi detectada infecção oculta pelo HBV nos pacientes diabéticos de Goiânia-GO, sendo este resultado semelhante ao encontrado em outros grupos populacionais do Brasil. Em relação à resposta vacinal, das 69 amostras analisadas, 53,6% de pacientes foram capazes de responder à vacinação, sendo que a média geométrica de títulos de anti-HBs foi de 13,76 mUI/mL. A taxa de soroproteção encontrada nos pacientes diabéticos em GoiâniaGO foi considerada baixa se comparada à população adulta saudável. Dessa forma, os dados deste estudo servirão como base para o planejamento de ações específicas de prevenção da hepatite B em uma população que, geralmente, já apresenta comorbidades associadas.

Introdução. A infecção causada pelo vírus da hepatite B (HBV) é um dos agravos de maior prevalência no mundial. Segundo a Organização Mundial da Saúde (OMS) existem mais de 350 milhões de portadores crônicos da doença. A infecção pelo HBV é rotineiramente identificada quando há a presença do HBsAg circulante. Entretanto, em alguns casos o HBV-DNA tem sido detectado em indivíduos HBsAg negativos, positivos ou negativos para anti-HBc e anti-HBs. Essa apresentação sorológica e molecular é denominada infecção oculta pelo HBV (OBI). Geralmente a concentração do HBV-DNA no soro será abaixo de 200 UI/mL. Objetivo: Determinar a prevalência da OBI, em doadores de sangue do Estado do Amapá no ano de 2014. Material e Métodos. Foram analisadas um total de 62 amostras de doadores de sangue do estado do Amapá, no ano de 2014, que apresentavam o perfil sorológico: HBsAg negativo, anti-HBc positivo e com anti-HBs negativo ou positivo. Os marcadores sorológicos HBsAg e anti-HBc foram determinados através do imunoensaio quimioluminescente. As amostras selecionadas para a detecção do HBV-DNA foram testadas utilizando as metodologias de Real-Time PCR Kit NAT HIV/HCV/HBV (Bio-Manguinhos®) e PCR \"in house\". Resultados. Do total de 13.261 doadores triados para infecções transmissíveis pelo sangue, 283 apresentaram resultados reagentes para os marcadores da hepatite B, nos quais: 35 (0,3%) foram HBsAg e 248 (1,9%) para anti-HBc reagentes. Um total de 62 amostras foram testadas pelos métodos moleculares. Todas as amostras apresentaram resultado HBV-DNA não-detectável. Conclusão: O índice de inaptidão sorológica no ano de 2014 no HEMOAP foi de 1,9% para anti-HBc e 0,3% para HBsAg. A população estudada foi constituída predominantemente por adultos com idade entre 29-65 anos, do sexo masculino, casados e naturais de municípios do estado do Amapá / Introduction. The infection caused by the hepatitis B virus (HBV) is one of the most prevalent diseases in the world. According to the World Health Organization (WHO) there are more than 350 million chronic carriers of the disease. HBV infection is routinely identified when there is presence of circulating HBsAg. However, in some cases HBV-DNA has been detected in HBsAg negative individuals, positive or negative for anti-HBc and anti-HBs. This serological and molecular presentation is termed HBV-occult infection (OBI). Usually the concentration of HBV-DNA in serum will be below 200 IU / mL.Objective: To determine the prevalence of OBI in blood donors, in the State of Amapá, in the 2014. Material and methods. A total of 62 samples of blood donors from the State of Amapá in the year 2014 were analyzed, presenting the serological profile: HBsAg negative, anti-HBc positive and with negative or positive anti-HBs. Serum markers HBsAg and anti-HBc were determined by the chemiluminescent immunoassay. Samples selected for HBV-DNA detection were tested using the Real-Time PCR Kit Kit HIV / HCV / HBV (Bio-Manguinhos®) and in-house PCR. Results. Of the total of 13,261 donors screened for blood-borne infections, 283 presented reactive results for hepatitis B markers, in which: 35 (0.3%) were HBsAg and 248 (1.9%) for anti-HBc reagents. All samples showed nondetectable HBV-DNA result. Conclusion: The serological disability index in the year 2014 in HEMOAP was 1.9% for anti-HBc and 0.3% for HBsAg. The studied population consisted predominantly of adults aged 29-65 years, males, married and natural of cities of the state of Amapá

A demanda por abordagens eficientes para o problema de reconhecer a estrutura de cada gene numa sequência genômica motivou a implementação de um grande número de programas preditores de genes. Fizemos uma análise dos programas de sucesso com abordagem probabilística e reconhecemos semelhanças na implementação dos mesmos. A maior parte desses programas utiliza a cadeia oculta generalizada de Markov (GHMM - generalized hiddenMarkov model) como um modelo de gene. Percebemos que muitos preditores têm a arquitetura da GHMM fixada no código-fonte, dificultando a investigação de novas abordagens. Devido a essa dificuldade e pelas semelhanças entre os programas atuais, implementamos o sistema MYOP (Make Your Own Predictor) que tem como objetivo fornecer um ambiente flexível o qual permite avaliar rapidamente cada modelo de gene. Mostramos a utilidade da ferramenta através da implementação e avaliação de 96 modelos de genes em que cada modelo é formado por um conjunto de estados e cada estado tem uma distribuição de duração e um outro modelo probabilístico. Verificamos que nem sempre um modelo probabilísticomais sofisticado fornece um preditor melhor, mostrando a relevância das experimentações e a importância de um sistema como o MYOP. / The demand for efficient approaches for the gene structure prediction has motivated the implementation of different programs. In this work, we have analyzed successful programs that apply the probabilistic approach. We have observed similarities between different implementations, the same mathematical framework called generalized hidden Markov chain (GHMM) is applied. One problem with these implementations is that they maintain fixed GHMM architectures that are hard-coded. Due to this problem and similarities between the programs, we have implemented the MYOP framework (Make Your Own Predictor) with the objective of providing a flexible environment that allows the rapid evaluation of each gene model. We have demonstrated the utility of this tool through the implementation and evaluation of 96 gene models in which each model has a set of states and each state has a duration distribution and a probabilistic model. We have shown that a sophisticated probabilisticmodel is not sufficient to obtain better predictor, showing the experimentation relevance and the importance of a system as MYOP.

Entre outubro de 2009 e dezembro de 2012, foi realizado estudo no Laboratório de Hidrologia Florestal Walter Emmerich (L.H.F.W.E.), para avaliar o potencial hidrológico dos nevoeiros e a precipitação oculta em ambiente de Floresta Ombrófila Densa Montana, na Serra do Mar, em Cunha, a leste do Estado de São Paulo. Os objetivos específicos da pesquisa foram: 1) avaliar o desempenho de coletores de água de nevoeiro; 2) verificar o potencial de coleta de água de nevoeiro no laboratório; 3) analisar o potencial de coleta de água de nevoeiro em três setores da microbacia experimental D; 4) averiguar a distribuição espacial e temporal de ocorrência dos nevoeiros na microbacia D e 5) estimar a contribuição da precipitação oculta na floresta da microbacia D. Para alcançar os três primeiros objetivos foram usados coletores passivos tipo harpa, nas formas cilíndrica e plana. Para estudar a distribuição de nevoeiros, foram feitas observações diárias de três referências visuais situadas a distâncias conhecidas no interior da microbacia D. O método da medição da precipitação efetiva foi empregado para estimar a precipitação oculta na floresta. Sobre a distribuição espacial e temporal da ocorrência de nevoeiros na microbacia D, os resultados mostraram que os episódios de nevoeiro foram mais comuns à tarde, como decorrência da brisa marítima proveniente do Oceano Atlântico. Para 61,3% do tempo, em média, foi observada a presença de nevoeiro em algum setor da microbacia, com a ocorrência dos nevoeiros diminuindo de montante para jusante da área. No que concerne ao desempenho dos equipamentos, a média de coleta diferiu de coletor para coletor, exceto entre o coletor cilíndrico descoberto e o coletor plano, que interceptaram mais água que os coletores cilíndricos cobertos. O coletor plano foi o único a interceptar água em todos os episódios amostrados. Sobre o potencial de coleta de água de nevoeiros no laboratório, concluiu-se que é reduzido e resulta da combinação de três fatores: a grande ocorrência de nevoeiros de radiação, a curta duração dos ix episódios dos nevoeiros orográficos e a baixa intensidade dos ventos na região. No que concerne ao potencial de coleta de água de nevoeiro em três setores da microbacia D, árvores localizadas próximas aos coletores funcionaram como obstáculo à livre circulação dos nevoeiros orográficos, induzindo os coletores a interceptar exíguos volumes de água. Considerando apenas os eventos de nevoeiro sem chuva, a precipitação oculta foi de 2,3 mm, correspondendo a 0,12% da precipitação pluviométrica anual. Para os eventos de chuva com a presença de nevoeiro, a precipitação oculta gerou um total de 5,1 mm de água adicional ao piso da floresta, correspondendo a 0,27% da precipitação pluviométrica. Concluiu-se que a precipitação oculta na floresta não é um processo importante para a entrada de água na microbacia D. / Between October 2009 and December 2012 a study was conducted at the Walter Emmerich Hydrologic Laboratory (LHFWE) to assess the hydrological potential of fog and occult precipitation in the Montane Dense Ombrophilous Forest environment located in the Parque Estadual da Serra do Mar - Núcleo Cunha, east of the State of São Paulo, Brazil. The specific multiple objectives of the research were: 1) evaluate the performance of passive fog collectors, 2) evaluate the potential for collecting fog water in the laboratory, 3) evaluate the potential of collecting fog water in three sectors of experimental catchment \"D\", 4) determine the spatial and temporal distributions of fog occurrence in catchment \"D\", 5) estimate the contribution of occult precipitation in the rainforest in catchment \"D\". To achieve the first three objectives, cylindrical and flat harp collectors were used. To study the spatial and temporal distributions of fog occurrence, we made daily observations of three visual references located at known distances within the catchment. Net precipitation was measured and used to estimate the occult precipitation in the rainforest. Regarding the spatial and temporal distributions of fog occurrence, the results showed that episodes of fog were more common in the afternoon as a result of the sea breeze from the Atlantic Ocean. For 61.3% of the time on average, we observed the presence of fog in some sector of the catchment, with its occurrence decreasing in areas located from upstream to downstream. Concerning the comparison of the performance of the collectors, the average volume of water collected differed from collector to collector, except between cylindrical collector uncovered and flat collector, which captured more water than the cylindrical collectors covered to prevent rainwater input. The flat collector was the only gauge to intercept water in all episodes. The high incidence of fog radiation, the short duration of orographic fog, and the low intensity of winds combined to reduce the potential for harvesting fog water in the laboratory. Regarding the potential for collecting fog water in three sectors of the catchment \"D\", xi trees located next to collectors operated as an obstacle to the free movement of orographic fog inducing gauges to intercept exiguous volumes of water. Considering only fog, but no rain, occult precipitation was 2.3 mm, corresponding to 0.12% of annual rainfall. For rainfall events with the presence of fog, occult precipitation generated a total of 5.1 mm of additional water to the floor of the forest, equivalent to 0.27% of the rainfall. It was therefore concluded that occult precipitation in rainforest did not significantly contribute to water entering catchment \"D\".

In this thesis we study three different stochastic processes describing the brain activity. The first one is a continuous time version of the stochastic chains with memory of variable length. These stochastic chains take values in the set of neurons and assign, at time t, the value of the last neuron which spiked up to time t. Moreover, we assume neurons interact through a phenomena called chemical synapses. Briefly this means that when a neuron spikes, it loses all its membrane potential and at same time changes the membrane potential of the neurons which are influenced by it. Under this approach we proved the positive recurrent of the process and presented a perfect simulation algorithm able to generate a finite sample of the process under its invariant measure. In the second model we continue considering the chemical synapses interaction and add also an interaction through electrical synapses. The last one happens duo to the presence of specific channels which allow the passage of ions along the the membrane of two neurons and, as consequence, we have a sharing of potential between the neurons. Moreover, we consider also the constant lost of potential of the neurons for the environment which push each neuron to a resting state. For this model we study the long-run behaviour of the process with a finite number of neurons, the hydrodynamic limit for the system and investigate the possible invariant distributions for the limiting process. In the last model considered here we study the brain activity measured through EEG data. We investigate the predictive coding principle which says that neural networks are able to learn the statistical regularities inherent in a stimuli and reduce redundancy by removing the predictable components of the input. To test this conjecture we propose procedures to perform statistical model selection on the EEG data in order to retrieve structural features of stochastic sources. This is done through a case study in which the EEG data is recorded under the effect of two different stochastic rhythmic sources produced by two different context tree models. We present a suitable class of stochastic processes, called here as hidden context tree models, to model EEG signals evoked by rhythmic structures. Then, we propose a consistent statistical procedure to perform statistical model selection in this class and in our case study. / Nessa tese estudamos três diferentes processos estocásticos descrevendo a atividade cerebral. O primeiro processo é uma versão a tempo contínuo das cadeias estocásticas com memória de alcance variável. Essas cadeias tomam valores no conjunto dos neurônios e assumem, no instante t, o valor do último neurônio a disparar antes de t. Além disso, assumimos que os neurônios interagem entre si através de fenômenos chamados sinapses químicas. Resumidamente isso significa que quando um neurônio dispara perde todo seu potencial de membrana e, simultaneamente, muda o potencial de membrana dos neurônios que influencia. Para esse processo estocástico provamos a recorrência positiva e apresentamos um algoritmo de simulação perfeita capaz de gerar uma amostra finita cuja distribuição é a medida invariante do processo. Na segunda classe de modelos continuamos considerando as sinapses químicas e adicionamos ainda interação por sinapses elétricas. A última acontece devido a presença de canais específicos entre dois neurônios que permitem a passagem de íons ao longo de suas membranas, como consequência, temos um compartilhamento de potencial entre os neurônios. Além disso, consideramos também a constante perda de potencial dos neurônios para o meio que age empurrando o potencial de cada neurônio a um estado de repouso. Com esses modelos estudamos o comportamento a longo prazo do processo com um número finito de neurônios, o limite hidrodinâmico desse sistema e investigamos a possível distribuição invariante para o processo limite. Na última classe considerada aqui estudamos a atividade cerebral medida através de dados de EEG. Nós investigamos o princípio do código preditivo que afirma que redes neurais são capazes de aprender as regularidades estatísticas inerentes em um estímulo e reduzir a redundância removendo as componentes previsíveis. Para testar essa conjectura, propomos um procedimento para realizar seleção estatística de modelos em dados de EEG afim de recuperar características estruturais de fontes estocásticas. Isso é feito através de um caso de estudo em que dados de EEG são coletados sob o efeito de duas fontes rítmicas estocásticas distintas produzidas por duas árvores de contextos distintas. Nós apresentamos uma classe de modelos adequada, chamada aqui de modelos de árvore de contextos oculta, para modelar sinais de EEG evocados por estruturas rítmicas. Finalmente, propomos um procedimento estatístico consistente para fazer seleção estatística de modelos nessa nova classe assim como no nosso caso de estudo.