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Desenvolvimento de um método de classificação taxonômica de dados de metagenomasPilan, José Rafael January 2017 (has links)
Orientador: José Luiz Rybarczyk Filho / Resumo: Na análise de dados metagenômicos temos duas perguntas básicas que podemos fazer: “Quem são?” e “O que estão fazendo?” os microorganismos de uma determinada amostra. Para responder a primeira pergunta utiliza-se a análise taxonômica de microorganismos. Existem diversos software que utilizam diferentes metodologias para atingir essa finalidade. Esses métodos são divididos em duas categorias principais: composicional e alinhamento por similaridade. O que diferencia os métodos são principalmente o tempo para ser realizada a análise, poder computacional e eficiência na identificação dos reads. Nesse trabalho propomos um novo método por composição que utiliza cinco assinaturas genômicas e suas combinações para identificação dos reads: concentração de GC (Guanina/Citocina), entropia de dipletes, entropia de tripletes, entropia de tetrapletes e abundância total de dinucleotı́deos. Utilizamos um conjunto de dados referente a 3055 genomas completos de bactérias provenientes do NCBI (National Center for Biotechnology Information)que foram fragmentados em dois grupos: teste e controle. Os grupos foram fragmentados em tamanhos de 50-1000pb com partições de tamanho 50pb, buscando se aproximar dos tamanhos de reads normalmente gerados pelos equipamentos de sequenciamento de nova geração. O desempenho da metologia foi avaliado por medidas de sensibilidade, especificidade, precisão e média harmônica em comparação aos resultados do grupo teste com o grupo controle. Dentre as combinações anal... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre
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Análise da resistência a cobre e zinco sobre o crescimento e expressão gênica em Xylella fastidiosa em condições de biofilme /Rodrigues, Carolina Munari. January 2007 (has links)
Resumo: Baseado nas informações geradas após o seqüenciamento do genoma, foi desenvolvido uma série de meios de cultura de composição definida (XDM1, XDM2, XDM3, XDM4 e XDM5). Portanto, um dos objetivos do presente trabalho foi estabelecer a curva de crescimento da X. fastidiosa no meio definido XDM2. Foi utilizada a estirpe 9a5c de X. fastidiosa mantida nesse mesmo meio de cultura. A medida da taxa de crescimento bacteriano foi realizada através de leituras de densidade óptica durante dezesseis dias com intervalos de 48 horas. A avaliação da viabilidade celular foi realizada através da contagem de unidade formadora de colônia (UFC) por diluição seriada. As duas avaliações apresentaram uma alta correlação (R2= 0,91) verificada através de regressão exponencial. O início da fase estacionária foi obtido após 10 dias de crescimento. De posse dos dados de UFC, foi possível calcular o tempo de geração da X. fastidiosa no meio XDM2, de aproximadamente 21 horas. Comparando o tempo de geração obtido na curva de crescimento em meio PW (11,37h), foi comprovado que a bactéria apresenta um crescimento mais rápido em meio PW do que no meio definido XDM2. Outro aspecto interessante revelado no estudo do genoma funcional da X. fastidiosa está relacionado à expressão de genes associados à patogenicidade. O principal mecanismo de patogenicidade é a formação de biofilme no xilema da planta hospedeira conduzindo ao bloqueio dos vasos do xilema. Análise da expressão diferencial de genes desse fitopatógeno em condição de virulência e durante a formação do biofilme revela padrões de genes associados à adaptação e competitividade no ambiente do hospedeiro. Esses genes possivelmente são ativados no biofilme maduro e são essenciais para sua manutenção na planta. Além disso, sabe-se que bactérias que formam biofilme apresentam resistência crescente a compostos... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Based on informations generated after the genome sequencing, a series of culture media of defined composition were developed (XDM1, XDM2, XDM3, XDM4 e XDM5). Therefore, one of the objectives of the present work was to establish the growth curve of X. fastidiosa in the defined medium XDM2. For this, we utilized the 9a5c strain of X. fastidiosa maintained in this medium. The measurement of the bacterial growth rate was done by optical density analysis during sixteen days with intervals of 48 hours. The evaluation of cellular viability was carried out counting the colony units forming (CFU) by serial dilution. Both evaluations presented a high correlation (R2 = 0,91) verified by exponential regression. The beginning of the stationary phase was observed after ten days of growth. With the data of CFU, it was possible to calculate the generation time of X. fastidiosa in XDM2 medium, estimated to be of approximated 21 hours. Comparing the generation time obtained for the growth curve in PW medium (11,37 hours), we proved that the bacteria grow faster in PW compared with the defined medium XDM2. Another interesting aspect reveled by the study of functional genome of X. fastidiosa is related to the expression of genes associated with pathogenicity. The main mechanism of its pathogenicity is the formation of a biofilm in the xylem of the host plant, causing the blockage of the xylem vessels. Analysis of the differential expression of genes of this phytophatogen in condition of virulence and during the biofilm formation reveals standards associated to adaptation and competition in the host environment. These genes are possibly activated in the mature biofilm and are essential for its maintenance in the plant. Besides, it is known that bacteria that form biofilm present elevated resistance to antimicrobial compounds while biofilm is structured, like antibiotics, heavy metals... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Marcos Antonio Machado / Coorientador: Alessandra Alves de Souza / Banca: Ivan Maia de Godoy / Banca: Henrique Ferreira / Mestre
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Eficácia da biomembrana de látex natural incorporada com extrato de Stryphnodendron barbatimam mart na cicatrização de úlceras cutâneas /Silva, Rosângela Gonçalves da. January 2015 (has links)
Orientador: Rondinelli Donizetti Herculano / Banca: Marco Andrey Cipriani Frade / Banca: Aldo Eloizo Job / Resumo: A biomembrana de látex da seringueira (Hevea brasiliensis) tem sido utilizada como curativo para úlceras cutâneas e os estudos de sua utilização como sistema de liberação prolongada para carrear compostos bioativos capazes de acelerar e estimular o processo de cicatrização tecidual estão em ascendência. A cicatrização lenta caracteriza a cronicidade da lesão e se dá na ocorrência da ausência ou insuficiência do fechamento da ferida, excedendo o período fisiológico da cicatrização de 2 a 3 semanas. As razões para esta alteração são os distúrbios locais ou sistêmicos (DEALEY, 2008). O objetivo deste estudo foi avaliar a eficácia e segurança do tratamento das úlceras crônicas com a utilização da biomembrana de látex natural da seringueira Hevea brasiliensis incorporada com extrato de Stryphnodendron barbatimam Mart (barbatimão). Foram selecionados 45 pacientes com úlceras crônicas de diferentes etiologias com idade entre 35 e 90 anos, cadastrados no Sistema Único de Saúde (SUS) e em sua respectiva unidade de atendimento. Estes sujeitos foram divididos em três grupos de 15 indivíduos cada e foram tratados por um período mínimo de 30 dias que se iniciou em abril de 2014, sendo apresentados como: grupo teste G1- Biomembrana de látex natural incorporada com extrato de barbatimão, tendo ocorrido 1 exclusão; grupo controle G2- Biomembrana de látex natural, tendo ocorrido 7 exclusões; e grupo controle G3- extrato de barbatimão, tendo ocorrido 10 exclusões. Além dos curativos, foram realizadas coleta de amostras para semeadura em meios seletivos, demonstrando que mesmo com a presença de microrganismos não houve interferência na cicatrização. Os curativos realizados com biomembrana incorporada apresentaram melhores resultados na cicatrização, além de controle e até redução da colonização microrgânica ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Latex biomembrane derived from the (Hevea brasiliensis) rubber tree has been used as dressing for cutaneous ulcers and studies on its utilization as an extended liberation system to carry bioactive compounds capable of accelerating and activating the process of tissue wound healing, are increasingly being undertaken. The slow healing features the chronicity of the wound and it occurs in the wound closure absence or failure, exceeding the physiological healing period of 2 to 3 weeks. The reasons for such change are local and systemic disorders. This study was carried out to assess the effectiveness and safety of chronic ulcer treatment by using the natural latex biomembrane derived from the Hevea brasiliensis rubber tree incorporated with the Stryphnodendron barbatimam Mart (barbatimão) extract. In the research 45 patients were selected, they were suffering from chronic ulcers of different etiologies, age between 35 and 90, registered in the National Health System (SUS) and under the care of their respective health care unit. Those subjects were divided into three groups comprising 15 patients each who were treated along a minimum period of 30 days which began in April 2014, and they were characterized as G1 test group- natural latex biomembrane combined with barbatimão extract, with 1 exclusion; G2- natural latex biomenbrane, with 7 exclusions; and G3- barbatimão extract, with 10 exclusions. Besides the dressings, sample collections were carried out for sowing in selective environments, showing that despite the presence of microorganisms there was no interference in wound healing. The dressings made from combined biomembrane yielded better results not only in wound healing, but also in controlling and reducing microorganism colonies, in comparison with the other control groups. The results found surely provide subsidies for future ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Diseño de un sistema de control de gestión estratégico para Construyendo Mis SueñosCadena Flández, Michelle Alejandra January 2018 (has links)
Memoria para optar al título de Ingeniera Civil Industrial / Construyendo Mis Sueños es una organización sin fines de lucro que diseña, desarrolla y transfiriere herramientas que apoyan el desarrollo del sector de la microempresa en Chile, con especial énfasis en aquellas personas y comunidades que viven en condiciones de vulnerabilidad social y económica. El principal objetivo que tiene CMS es potenciar el microemprendimiento empoderando a las personas y cerrando las brechas de desigualdad que existen.
La organización tiene cuatro tipos de actividades que permiten avanzar hacia el objetivo principal. En primer lugar, CMS implementa programas de formación, capacitación, diagnóstico y asesoría a ciertos grupos de emprendedores con características similares. Además, opera cuatro de los 51 Centros de Desarrollo de Negocios de SERCOTEC, cuya función es brindar apoyo a pequeños empresarios. En tercer lugar, dicta varios cursos en la Universidad de Chile, en los cuales los alumnos aprenden de la microempresa y trabajan con microemprendedores de los CDN. Finalmente, CMS desarrolla material educativo de gestión de emprendimiento, que facilita la capacitación y asistencia técnica que se les brinda a los emprendedores.
En la actualidad, el sector de la microempresa en Chile está creciendo a una tasa de más del 6% anual, cada año hay más y más personas que requieren capacitarse para poder desenvolverse óptimamente en el ecosistema. Para poder hacerse cargo de lo anterior, CMS necesita tener clara su estrategia y las metas que permitirán alcanzarla, de lo contrario no podrá responder a los requerimientos de la situación actual en el país ni tampoco lograr un real impacto económico y social en los microemprendedores que lo necesiten.
La solución propuesta para hacerse cargo de lo expuesto es diseñar un sistema de control de gestión a nivel estratégico que permitirá mejorar la gestión de la organización y aumentar los estándares de calidad. Este SCG se diseñó en base a los principios del Balanced Scorecard que propusieron David Norton y Robert Kaplan el año 1992.
Para lograr lo anterior, se realiza un análisis exhaustivo del entorno en que se encuentra CMS y del ambiente interno de la organización, utilizando los principios del análisis FODA. Gracias a ello, es posible redefinir la estrategia de la organización y los objetivos específicos para alcanzarla.
Teniendo los objetivos claros, se procede a la definición de los indicadores que medirán el nivel de avance del cumplimiento de éstos, utilizando metas claras y concretas. Además, se proponen formas de alcanzar estas metas correcta y óptimamente.
Finalmente, se considera que el resultado de este trabajo cumple con los objetivos planteados y permitirá a la organización gestionarse de mejor forma y entregar el mejor servicio posible a sus clientes, por lo que se realizan recomendaciones para poder implementar adecuadamente el sistema propuesto.
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La potestad tributaria municipal en la provincia de Buenos AiresCatalano, Constantino Iván 04 December 2013 (has links)
El régimen municipal de la provincia de Buenos Aires, a nivel constitucional, data del año 1933, dado que en la reforma constitucional de 1994 el capítulo correspondiente no fue modificado. En el plano legal, si bien con modificaciones habituales, del año 1958, en que se dicta la Ley Orgánica de la Municipalidades (decreto ley 6769).
En el tiempo transcurrido, no sólo se ha consolidado la idea de autonomía municipal, desde la tesis doctoral de Lisandro de la Torre a la incorporación a la Carta Magna Nacional, sino que -además- ha cambiado la realidad institucional, política, social, económico-financiera de los municipios bonaerenses. Ello enfrenta al gobierno estadual, a los locales y a los ciudadanos con una concepción desactualizada del municipio y de sus competencias y atribuciones.
Una de las circunstancias que se ha modificado es la vinculada a los recursos económicos que los gobiernos municipales necesitan para cumplir con sus funciones, que han aumentado, en variedad y cantidad y en recursos insumidos para su prestación. Sin embargo, éstos deben afrontar sus gastos con una estructura tributaria propia de una concepción municipal antigua, que les asigna una restringida potestad de crear tributos.
Con la sanción de la ley 13.010 en el año 2003, la Legislatura de la Provincia dispuso la descentralización de la administración de ciertos impuestos a los municipios, lo que modificó varios aspectos de la distribución de recursos entre la provincia y los gobiernos locales; generó un aumento en los recursos totales que reciben los municipios del gobierno provincial; una modificación en los criterios de reparto de una parte de los fondos; y les confirió responsabilidades en la recaudación de algunos tributos.
En el presente trabajo se estudia este sistema de descentralización tributaria instaurado en la provincia de Buenos Aires y las transformaciones que originó en el reparto de recursos a los municipios.
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Operación Turística (TU20), ciclo 2013-2Valer, Laura 23 July 2013 (has links)
El curso descubre como se desarrolla la actividad turística nacional de la mano de las instituciones,organismos y gremios (privados-públicos) más representativos del sector turismo. Asimismo, identifica, analiza y valora la importancia de la labor de los diferentes agentes de la supraestructura turística y sus principales funciones dentro del ámbito.
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Operación Turística (TU20), ciclo 2014-1Valer, Laura 06 March 2014 (has links)
El material brinda a los alumnos los conocimientos básicos para conocer y entender cómo se desarrolla la operación turística considerando los elementos y actores claves que participan en ella sin dejar de lado la coyuntura actual. Asimismo, presenta a las instituciones, organismos y gremios más importantes que regulan y contribuyen al desarrollo de la actividad turística.
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Caracterização morfológica e diversidade de Nostocales com ramificações verdadeiras da Mata Atlântica Paulista em ênfase em organismos aerofíticos /Ferreira, Viviani. January 2008 (has links)
Orientador: Luis Henrique Zanini Branco / Banca: Marli de Fátima Fiore / Banca: Célia Leite Sant'Anna / Resumo: As Cyanobacteria são dominantes em diversos tipos de ambientes, são especialmente bem distribuídas e abundantes em ambientes terrestres e possuem importante função ecológica no ecossistema. Em ambientes aerofíticos, atuam como colonizadores primários e na economia na produção de compostos de interesse industrial como auxinas, antivirais, antifúngicos, antibacterianos, biofertilizantes, entre outros. Atualmente, para o estudo de cianobactérias tornou-se importante o cultivo laboratorial para que se consiga biomassa e controle de contaminantes. Porém, são escassos os trabalhos sobre o cultivo, em particular das Nostocales com ramificações verdadeiras, e vários dos poucos existentes relatam tentativas frustradas na obtenção de cultivos específicos demonstrando a forte resistência destes organismos ao crescimento em condições laboratoriais. Os resultados presentemente obtidos indicaram que in vitro as Nostocales com ramificações verdadeiras seguem as mesmas características de crescimento quando em hábitat natural: crescimento lento, baixa taxa de colonização e competição. Dentre as variações testadas, a diluição de 2:1 (tanto líquido quanto sólido) foi considerada a melhor concentração do meio de cultivo e a agitação em shaker resultou em melhorias para o crescimento. A realização ou não de repicagens não foi suficiente para o estabelecimento de coleções, pois estes organismos não resistem a muitos meses sob condições de cultura. O teste de antibióticos para o controle de contaminantes mostrou-se ineficiente e, portanto, não foi possível estabelecer quantidade segura para o seu emprego. As pesquisas em relação ao cultivo destes organismos são ainda muito escassas. Neste estudo pôdese indicar um conjunto de condições de crescimento mais favoráveis para estes organismos, mas para um melhor estabelecimento das condições ainda são necessários estudos mais abrangentes e aprofundados. / Mestre
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Isolamento e caracterização de leveduras de Polybia ignobilis (Hymenoptera: Vespidae) /Sousa, Paula Sanchez de. January 2011 (has links)
Orientador: Fernando Carlos Pagnocca / Banca: Sandra Regina Ceccato Antonini / Banca: Vanderlei Geraldo Martins / Resumo: Polybia ignobilis é uma vespa social que apresenta uma alimentação variável e inespecífica, consumindo outros insetos, pedaços de animais mortos, néctar, polpa de madeira e água. Dentro do ninho ocorre a trofalaxia, onde o alimento é distribuído entre os indivíduos da colônia através de secreção labial, podendo ocorrer entre adulto e larva ou apenas entre adultos, propiciando a dispersão de micro-organismos. A associação entre leveduras e insetos pode ser considerada transitória, onde os insetos podem atuar como vetores na dispersão desses micro-organismos sem benefício nutricional; por outro lado, também pode ser considerada como uma associação benéfica, onde o inseto utiliza as leveduras como complemento alimentar. O presente estudo teve como objetivos: caracterizar a comunidade de leveduras associadas à P. ignobilis; verificar se há relação entre a distribuição das leveduras nas diferentes castas da vespa e contribuir com a formação de um banco temático de leveduras isoladas de insetos sociais. Indivíduos do ninho de P. ignobilis e amostras de mel foram coletados no campus da UNESP - Rio Claro. O isolamento e identificação das estirpes foi feita de acordo com a metodologia clássica descrita em YARROW (1998). Foram isoladas 167 estirpes, sendo 59 do primeiro ninho e 108 do segundo. Após uma seleção baseada em análises morfológicas, bioquímicas e perfil de bandas de microsatélites (MSP-PCR) estirpes representativas de cada grupo, bem como as estirpes únicas foram identificadas pelo sequênciamento da região D1/D2 do rDNA 26S. Os resultados revelaram a prevalência no primeiro ninho dos gêneros Candida, Cryptococcus, Hanseniaspora e Rhodotorula, compreendendo 45% do total das estirpes, sendo as espécies mais freqüentes Candida azyma, Candida chrysomelidarum, Cryptococcus liquefaciens e Rhodotorula mucilaginosa. No segundo ninho, as espécies... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Polybia ignobilis is a social wasp that features a variable and unspecific alimentation, eats other insects, bits of dead animals, nectar, wood pulp and water. Inside the nest occurs trofalaxis, where food is distributed among individuals of the colony through labial secretion, it can occur between adult and larva or adults only, being vectors in the dispersion of microorganisms. The association between yeasts and insects can be considered temporary, where the insects serve as vectors in the dispersal of these micro-organisms without nutritional benefit; on the other hand, can also be regarded as a beneficial association, where the insect uses the yeasts as a food supplement. This present study aimed to characterize the yeast community associated with P. ignobilis; verify whether exists a relation between the distribution of yeasts in different varieties of wasp and contribute to the formation of a thematic database of yeasts isolated from social insects. Individuals from the nest of P. ignobilis and honey samples were collected on the campus of UNESP - Rio Claro. The isolation and identification of strains was made according to classical methodology described in YARROW (1998). We isolated 167 strains, 59 and 108 of the first and second nest. After a selection based on morphological, biochemical and microsatellite band profiles (MSP-PCR) representative strains of each group as well as unique strains were identified by sequencing the D1/D2 region of 26S rDNA. The results revealed the prevalence in the first nest of Candida, Cryptococcus, Hanseniaspora and Rhodotorula, comprising 45% of all strains, being the most frequent species Candida azyma, Candida chrysomelidarum, Cryptococcus liquefaciens and Rhodotorula mucilaginosa. In the second nest of the species that prevailed were Aureobasidium pullulans, Meyerozyma guillermondii. Some strains may constitute new... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Problemática en la contratación del servicio de internet fijo en la Región ArequipaMaguiña Ylla, Lucía de los Milagros, Oblitas Carletto, Carlos Eduardo, Túpac Yupanqui Castillo, José Luis 12 May 2018 (has links)
La presente investigación tiene por finalidad determinar cuál es la problemática en la contratación del servicio de Internet fijo en la región de Arequipa, dada la cantidad de reclamos presentados ante el OSIPTEL, centrándonos exclusivamente en los reclamos de calidad, que básicamente giran en torno a la velocidad del servicio de acceso a Internet. Para ello, hemos desarrollado el servicio de acceso a Internet como servicio público, dada su importancia en la actualidad como herramienta para la difusión de información y del desarrollo de los ciudadanos, revisando y analizando el marco normativo vigente, en que se aprecia que existe la obligación por parte de las empresas operadoras de telecomunicaciones de brindar determinada información a los usuarios, pero que de alguna manera dicha información no es suficiente para adoptar una decisión de consumo adecuada al momento de contratar, más aún cuando las empresas operadoras prestadoras de dicho servicio tienen la obligación de brindar solamente el 40% de la velocidad contratada como velocidad mínima garantizada. Este último dato, especialmente importante debería resultar en efecto más relevante para el usuario al momento de contratar. / This investigation has as objective to determine which the problem is with the hiring of fixed-line Internet in the Arequipa region, considering the amount of complaints reported to OSIPTEL, focusing only on the complaints regarding quality, which basically revolve around the speed of the service to access the Internet. To do this, we have developed Internet access service as a public service, given its importance nowadays as a tool for information dissemination and development of the citizens, revising and analyzing the current legal framework where it can be seen that the obligation of the telecommunication service companies to give certain information to their users exists, but somehow such information is not sufficient to make an appropriate consume decision at the moment of getting the service, even more when telecommunication service companies have the obligation of only giving the 40% of the hired speed as the minimal guaranteed speed, information that should be very important and relevant for the users when hiring the service. / Tesis
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