Cette thèse s'est attachée à répondre à trois problématiques principales. La première est une enquête historiographique sur le bocage, l'habitat et le parcellaire médiéval et les paysages vendéens afin d'identifier les impasses et les voies de rénovation possibles des discours scientifiques. La seconde est une analyse archéogéographique des formes planimétriques (la voirie, le parcellaire, l'habitat en réseau), à plusieurs échelles d'espace et de temps, contenues dans une fenêtre de 800 km² dans le sud de la Vendée (85). Il s'est agit de comprendre leur organisation, leur mise en place et leur transmission sur une échelle de temps long et selon le paradigme de la dynamique et de la complexité des processus. Enfin, le dernier axe de recherche a consisté en une réflexion sur les liens entre les différentes connaissances sur le parcellaire, la voirie, le peuplement depuis la Protohistoire jusqu'à nos jours afin de proposer une piste de renouvellement du récit géohistorique traditionnel.

Reproduction de : Thèse de doctorat : Géographie : Lille 1 : 2006. / N° d'ordre (Lille 1) : 3840. Titre provenant de la page de titre du document numérisé. Bibliogr. p. 409-449.

Reproduction de : Thèse de doctorat : Géographie et aménagement : Paris 4 : 2005. / Titre provenant de l'écran titre. 72 références bibliographiques.

La thèse examine les relations entre l'activité agricole et le milieu qu'elle transforme : l'intérêt est ici porté aux vallées. Dans ces espaces spécifiques en matière de sols, de topographie et de modes d'écoulement, l'activité agricole doit s'adapter, valoriser ou surmonter les spécificités naturelles, tout en répondant à des attentes sociales fortes (qualité de l'eau et des paysages, aménagement des cours d'eau, biodiversité...). L'espace d'analyse est constitué des trois principales vallées du bassin de la Maine (Loir, Mayenne et Sarthe). Ces vallées de l'Ouest concentrent des fonctions et usages variés, dont l'agriculture représente l'un des principaux éléments structurants. Il est d'abord montré en quoi l'agriculture des vallées considérées est spécifique des points de vue environnemental et socio-économique, à l'échelle du bassin versant jusqu'à celle de zones d'études de quelques communes en vallée, et de façon diachronique (du XIXe siècle à l'époque actuelle). Puis, des entretiens auprès d'agriculteurs à l'échelle des exploitations agricoles permettent d'accéder à la diversité des prises en compte d'un même milieu, caractérisé par des contraintes d'hydromorphie dans le fond de vallée et de pente sur les versants. Les usages spécifiques à la vallée sont mis en évidence : types de cultures, accessibilité des parcelles, type d'usage du fourrage herbager, etc. Enfin, grâce à huit critères d'ordres quantitatifs et qualitatifs, tels que la dispersion des parcellaires, les dynamiques d'usages des terres de vallée ou la relation à l'eau, une typologie d'exploitations est construite sur trois niveaux d'appréciation de la vallée portée par les agriculteurs.

Face aux changements globaux et sociaux qui perturbent les conditions de vie des éleveurs de la zone pastorale du nord Niger, quelle contribution peut-on apporté pour une gestion durable des ressources végétales ? C'est à cette question que cette thèse tente de répondre dans le contexte de la plaine de l'Eghazer, véritable poumon régulateur de l'élevage pastoral du Niger, située au nord de cette zone pastorale du pays. Chaque année, à partir de juillet de nombreux transhumants venant du sud affluent dans la zone pastorale de l'Eghazer rejoignant ainsi les éleveurs locaux. Cette migration estivale appelée « Cure salée » vise à l'exploitation des pâturages saisonniers riches en sels minéraux très appréciés par les pasteurs. Ces ressources pastorales riches et variées, même si elles sont très variables en fonction des années, font de l'Eghazer, l'une des dernières zones de grande concentration saisonnière des éleveurs. Localement, la pression sur les terres et les ressources se fait de plus en plus forte et la durabilité du système parait compromise. La recherche a été conduite en faisant appel à des méthodes de cartographie, d'étude de la végétation, d'enquêtes quantitatives et qualitatives le plus souvent participatives. Ce travail a montré que les pasteurs ont développé un ensemble de connaissances sur les ressources végétales leur permettant de résister aux conditions difficiles de la pratique du pastoralisme en milieu aride. Ces savoirs locaux se traduisent également dans une description détaillée du milieu s'appuyant sur des critères topographiques, géomorphologiques et fonctionnels, et que l'appréciation en termes de qualité de pâturage dépend de facteurs d'importance variable selon les saisons. Il ressort par ailleurs que ces savoirs traditionnels peuvent être combinés avec les connaissances scientifiques dans l'élaboration de carte de paysages, élément principal de cogestion. Enfin, l'étude des pâturages à travers les deux appréciations (scientifique et vernaculaire) a permis de connaître l'état de la ressource pastorale, notamment de la végétation. Elle a également mis en évidence les zones prioritaires d'interventions dans la zone pastorale de l'Eghazer. Le croisement de ces savoirs vernaculaires des pasteurs avec les connaissances scientifiques peut être un atout favorable à la mise en place d'un dispositif de cogestion des pâturages de l'Eghazer. / Facing the total and social changes which unsettle the living conditions of the stockbreeders of the pastoral zone of the north Niger, what contribution can they brought for a lasting management of plant resources? It is in this question that this thesis tries to answer in the context of the plain of Eghazer, true regulating lung for the pastoral animal husbandry of Niger, located north of this pastoral zone of the country. Every year, from July of many transhumants from the south rush in the pastoral zone of Eghazer joining so the local stockbreeders. This summer called migration " salt Remedy " aims at the working of the seasonal pasture rich in mineral salts very appreciated by the pastors. These rich and various pastoral resources, even if they are very variable according to the years, make of Eghazer, one of the last zones of big seasonal concentration of the stockbreeders. Locally, the pressure on lands and resources becomes more and more strong and the durability of the system parried compromised. Search was conducted by calling methods of cartography, of study of vegetation, quantitative and qualitative inquiries most often participative. This job showed that the pastors developed group of knowledge on the plant resources allowing them to resist the difficult conditions of the practice of the pastoralisme in arid middle. These local knowledges are also translated in a detailed description of the middle leaning on topographical criteria, géomorphologiques and functional, and that the evaluation in quality terms of pasture depends on factors of variable importance according to seasons. It emerges moreover that these traditional knowledges can be combined with scientific knowledge in the development of card of landscapes, main element of joint management. Finally, the study of pasture across both (scientific and vernacular) evaluations allowed to know the state of pastoral resource, notably of vegetation. She also highlighted the priority zones of interventions in the pastoral zone of Eghazer. The crossing of these vernacular knowledges of the pastors with scientific knowledge can be a trump favourable to the installation of a device of joint management of the pasture of Eghazer.

Les perturbations environnementales enregistrées aujourd’hui dans le cadre du changementclimatique global exacerbent les craintes des sociétés quant au développement durable. Si l’impact desactions anthropiques sur les changements contemporains est désormais reconnu scientifiquement, lesspécialistes des sociétés anciennes et des géosciences se demandent si les changementsenvironnementaux d’origine naturelle ou anthropique n’ont pas déjà et à plusieurs reprises, affecté ledéveloppement des sociétés au cours des derniers millénaires. Les investigations menées, dans le cadrede cette thèse, proposent de contribuer à ce débat à partir de l’étude sur le temps long de la basse valléedu Strymon (Grèce du Nord) depuis le début de l’Holocène. L’enjeu est de comprendre les relationsqu’ont entretenues les sociétés avec leur environnement afin d’examiner les questions d’éventuelseffondrements culturels d’origine environnementale comme le suggèrent certains chercheurs pour la findu Néolithique ou l’Âge du Bronze, et celles des conséquences des actions des sociétés (néolithisation,conquête grecque, etc.) sur l’environnement et la durabilité de son exploitation. Pour dépasser les étudesde cas, nous proposons une approche géographique multiscalaire et géoarchéologique. Elle s’appuie surune étude des archives paléoenvironnementales combinant (1) une analyse géomorphologique et (2) uneanalyse palynologique des cours d’eau et des zones humides afin de renseigner les changementsenvironnementaux au plus près des lieux de vie des populations et de leurs pratiques agropastorales.Les résultats obtenus sont ensuite confrontés aux recherches archéologiques et historiques pourcomprendre les interactions Sociétés/Environnement de l’échelle de l’habitat à celle de la région étudiéeà différentes époques, et participer activement aux discussions multidisciplinaires sur la question. / Environmental disturbances recorded nowadays in global changes rise up society fears aboutsustainable development. Even if the responsibility of activities on contemporary changes is now wellknown,the specialists of past societies are still wondering if such environmental changes, either fromnatural or from anthropogenic origin, have not already affected societies development in last thousandsof years. This research project contributes to this debate on the base of long time study of Strymona lowvalley (northern Greece), from Early Holocene. The aim is to understand the relationships betweensocieties and environment by questioning the possibility of cultural collapses from environmentalorigin, and to examine the consequences of human activities (Neolithisation, Greek conquest, ...) onenvironment and his sustainability. To overcome case studies, we suggest a geographical andgeoarchaeological approach. Based on study of palaeoenvironmental archives which combinegeomorphological and palynological analyses of streams and wetlands. Our aim is to analyze the role ofagropastoral practices and climate events and oscillations on environmental changes, and on thedynamics of mosaic landscapes. Results will be compared with archaeological and historical researchesto understand the interactions between societies and their environment from sites to regional scale, fromthe Neolithic to Ottoman period and to take part actively to multidisciplinary discussions on this debate.

Submitted by FABÍOLA CRISTINA ALVES null (biula_alves@yahoo.com.br) on 2016-07-28T16:16:30Z No. of bitstreams: 1 ALVES_Fabiola-tese-final.pdf: 51765676 bytes, checksum: e230c06259aef9676721ecbaedc042c0 (MD5) / Rejected by Felipe Augusto Arakaki (arakaki@reitoria.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: A versão final da dissertação/tese deve ser submetida no formato PDF (Portable Document Format) e o arquivo não deve estar protegido. Por favor, corrija o arquivo PDF e realize uma nova submissão com o arquivo desprotegido. Agradecemos a compreensão. on 2016-08-01T14:13:11Z (GMT) / Submitted by FABÍOLA CRISTINA ALVES null (biula_alves@yahoo.com.br) on 2016-08-01T16:25:16Z No. of bitstreams: 1 ALVES_Fabiola-tese-final.pdf: 51765676 bytes, checksum: e230c06259aef9676721ecbaedc042c0 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-08-02T14:54:16Z (GMT) No. of bitstreams: 1 alves_fc_dr_ia.pdf: 51765676 bytes, checksum: e230c06259aef9676721ecbaedc042c0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-02T14:54:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 alves_fc_dr_ia.pdf: 51765676 bytes, checksum: e230c06259aef9676721ecbaedc042c0 (MD5) Previous issue date: 2016-07-12 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Dans le texte Visconti face aux générations modemes (1950) , le critique Mário Pedrosa suggérait que les premiers artistes modernes brésiliens auraient dO étudier la communicabilité entre l'homme et la nature à partir des peintures de Eliseu Visconti et non uniquement avec les idées importées de l'Europe, puisque au Brésil il existait déjà des enseignements en relation aux reuvres de cet artiste. À partir du texte de Mário Pedrosa, cette recherche développe une réflexion sur les contextes qui touchent directement le parcours et la production de Eliseu Visconti, mais plus spécifiquement ses peintures de paysages. Nous cherchons à comprendre les expériences viscontiennes qui lui ont mené à développer les leçons que l'on peut tirer des paysages, à partir d'une lecture qui s'enrichie des contributions des éléments historiques, philosophiques et anthropologiques. Vient s'y rajouter les préoccupations esthétiques. Les contextes sont reconstitués et discutés, dans l'intention de mieux comprendre la relation de Eliseu Visconti avec l'expérience d'être ou de ne pas être un homme moderne en période de modernités multiples en tenant compte des concepts de modernité, transitoire et monde vécu, nous avons repensé le "lieu" de Eliseu Visconti dans notre mémoire. Nous relisons la façon de concevoir la nature et le paysage dans l'art, pour élaborer les notions de peintre habitant et de peintre non habitant dans cette étude. Nous réfléchissons sur la maniêre dont Eliseu Visconti cesse d'être un peintre non habitant pour devenir un peintre habitant révélant l'ensemble de ses peintures de paysages une leçon sur la communicabilité entre l'homme et la nature, qui a été introduite par les réalisations des premiers artistes modernes et reste actuelle par l'appréciation du public contemporain. / No texto Visconti diante das modernas gerações (1950), o crítico Mário Pedrosa sugere que os primeiros artistas modernos brasileiros deveriam ter aprendido a comunicabilidade entre o homem e a natureza com as pinturas de Eliseu Visconti e não apenas ter importado ideias da Europa, pois no Brasil já haviam aprendizados indispensáveis na obra desse artista. Partindo do referido texto de Mário Pedrosa, esta pesquisa desenvolve uma reflexão sobre os contextos que tocam diretamente ou não a trajetória e a produção de Eliseu Visconti, mais especificamente suas pinturas de paisagem. Procuramos compreender as experiências viscontianas que o levaram a desenvolver o ensinamento contido nas suas pinturas de paisagem a partir de uma leitura que se beneficia das contribuições de abordagens históricas, filosóficas e antropológicas, incluindo preocupações estéticas. Os contextos são reconstruídos e discutidos, no intento de melhor entender a relação de Eliseu Visconti com a experiência de ser ou não ser um homem moderno em tempos de múltiplas modernidades. Considerando os conceitos de modernidade, transitoriedade e mundo vivido, repensamos o “lugar” de Eliseu Visconti na nossa memória. Revisamos os modos de conceber a natureza e a paisagem na arte, para no estudo elaborar as noções de pintor inabitante e pintor habitante. Discorremos sobre os modos pelos quais Eliseu Visconti deixa de ser um pintor inabitante para se tornar um pintor habitante ao revelar no conjunto de suas pinturas de paisagem uma lição sobre a comunicabilidade homem e natureza, que estava aberta à fruição dos primeiros artistas modernos e continua atualizada para a apreciação do espectador contemporâneo.

Avec la révolution moléculaire en biologie, une compréhension des mécanismes de la relation génotype-phénotype est devenue possible. Récemment, les progrès réalisés dans la synthèse et le séquençage de l’ADN ont permis le développement d’expériences de deep-mutational scanning capable de quantifier divers phénotypes pour un ensemble de génotypes sur toute la longueur d’un gène. Ces ensembles de données sont non seulement intéressants en eux-mêmes, mais permettent également de tester de manière rigoureuse des modèles phénotypiques quantitatifs. Nous avons utilisé cette technologie pour caractériser les cartes séquence-fitness de 3 systèmes bactériens modèles: un régulateur global, la CRP, une enzyme de résistance aux antibiotiques, la β-lactamase, et une petite voie métabolique constituée des enzymes AraA et AraB. Ces systèmes ont été choisis pour éclairer les rôles de différentes caractéristiques dans la formation de la relation génotype-fitness (réseaux de régulations, stabilité des protéines et flux métabolique). Nous constatons que la tendance globale des effets sur le fitness semble prévaloir sur les tendances spécifiques. Ceci nous conduit à penser qu’une grande partie de la relation entre le génotype et le fitness pourrait être expliquée à partir de la forme des fonctions de phénotype-fitness. Par ailleurs, nous voyons que la caractérisation de la relation génotype-fitness dans différents systèmes peut être un moyen puissant d’obtenir des informations sur les phénotypes pertinents. / With the molecular revolution in Biology, a mechanistic understanding of the genotype-phenotype relationship became possible. Recently, advances in DNA synthesis and sequencing have enabled the development of deep-mutational scanning experiments, capable of scoring comprehensive libraries of genotypes for a variety of phenotypes over the length of entire genes. Such datasets are not only interesting in themselves, but also allow rigorous testing of quantitative phenotypic models. We used this technology to characterise sequence-fitness maps for 3 model bacterial systems: a global regulator, CRP, an antibiotic-resistance enzyme, β-lactamase, and a small metabolic pathway, consisting of the enzymes AraA and AraB. These different systems were chosen to illuminate the roles of different mechanistic features in shaping the genotype-fitness relationship (regulatory wiring, protein stability and metabolic flux). We find that smooth patterns of fitness effects tend to prevail over idiosyncrasy, indicating that much of the genotype-fitness relationship could be understood from the global shape of smooth underlying phenotype-fitness functions. On the flip side, we see that characterising the genotype-fitness relationship in different systems can be a powerful way to glean phenotypic insights.

Face au constat des limites de la lutte contre les inondations, la vision de «Vivre avec» se développe. Il ne s’agit plus de rejeter l’eau mais de l’accepter sur le territoire et de s’y adapter. Cette approche stratégique ouvre la voie vers une vision positive du risque d’inondation qui permet d’envisager des opportunités liées aux inondations.Dans ce contexte du «Vivre avec», ce travail de thèse vise à théoriser et valoriser l’approche émergente que représente la démarche par l’opportunité pour la conception de villes éco-résilientes aux inondations. Ainsi, cette thèse examine en quoi :1. le concept d’opportunité constitue une démarche dans le cadre théorique des villes éco-résilientes aux inondations ;2. la démarche par l’opportunité constitue une méthode de conception et présente des avantages, une pertinence et un potentiel pour la conception de villes éco-résilientes aux inondations, notamment au vu de la gestion du risque plus courante.La recherche mise en œuvre a pour objet de formaliser la méthode de conception par l’opportunité au travers d’une représentation – une grille d’observation – afin d’en faciliter l’utilisation et la promotion. Pour communiquer mais surtout exploiter les résultats sur la méthode, une grille d’observation des stratégies associées à des projets urbains et paysagers pour la conception par l’opportunité est investiguée. Ce support tout particulièrement destiné aux concepteurs architecturaux, urbains et paysagers, est élaboré selon le principe d’une représentation sémantique. La cartographie sémantique correspond à l’outil méthodologique utilisé dans cette recherche. Elle permet d’explorer et de mettre en relation les multiples informations établies tout en les organisant pour une meilleure compréhension de leur complexité. Ainsi, la grille d’observation vient cartographier la méthode établie et constituer un support d’aide à la conception par l’opportunité.Les résultats obtenus de ce travail démontrent premièrement que d’une part, la démarche par l’opportunité présente un potentiel de conception face à la complexité des territoires inondables en milieu urbain. En agissant sur des notions diversifiées et proactives elle apparaît comme pertinente dans la balance entre phénomènes naturels et activités humaines. D’autre part, les démarches par le risque et par l’opportunité sont deux approches différentes mais complémentaires. Il ressort du travail cartographique que la conception de villes éco-résilientes aux inondations s’appuie sur un équilibre entre risque et opportunité.Ces résultats démontrent deuxièmement que la conception par l’opportunité correspond à une logique qui induit des cycles vertueux entre des caractéristiques paysagères (sols, végétations, etc.) et des flux fondamentaux (eau, énergie, déchets, nutriments, etc.) pour la production de bénéfices socio-éco-environnementaux. Elle a pour socle d’action de reconnecter les villes avec leur territoire en articulant et exploitant de manière multifonctionnelle, interdisciplinaire et pluritemporelle les synergies entre les éléments physiques du territoire urbain. Elle est particulièrement pertinente en ce qu’elle formule une nouvelle relation équilibrée pour le couple humain/systèmes hydro-écologiques et présente le potentiel d’un horizon sociétal innovant.En conclusion et synthèse, il est tout d’abord à retenir que la cartographie sémantique constitue un outil de recherche pertinent en ce qu’elle facilite le traitement et l’analyse de données complexes. Ensuite, la méthode théorisée, tout comme la grille d’observation élaborée, induit une évolution des pratiques de conception liées aux inondations. Enfin, cette thèse définit une base de travail théorique et pratique affinée, qui vient questionner le paradigme de la gestion du risque pour approfondir la recherche sur les villes éco-résilientes aux inondations et le «Vivre avec». / In recognition of the limits of the possibilities of combating floods, a vision of “Living With” floods is developing. The aim is no longer to resist water, but to allow it into the territory and adapt. This strategic approach opens the way to a positive vision of flood risk, in which the opportunities associated with floods can be envisaged.In this context of “Living With”, this piece of research seeks to theorise and promote the emerging method of opportunity-based design as applied to flood eco-resilient cities. This thesis therefore examines how:1. the concept of opportunity constitutes an approach within the theoretical framework of flood eco-resilient cities;2. the opportunity-based approach constitutes a method of design and offers advantages, relevance and potential for the design of flood eco-resilient cities, in particular by comparison with the most common method of risk management.The purpose of this thesis research is to formalise the method of opportunity-based design through a representational tool—an observation grid— in order to facilitate the use and promotion of such design. In order to communicate on —but above all to exploit the results— of the method, a grid for the observation of the strategies associated with urban and landscape projects for opportunity-based design is investigated. This instrument, in particular aimed at architectural, urban and landscape designers, is developed by means of a semantic map. Semantic mapping is the methodological solution employed in this research. It is used to explore and connect the multiple data collected, and to organise them so that their complexity can be understood. The observation grid therefore maps the method employed and constitutes a tool for implementation in opportunity-based design.On the one hand, the results obtained from this research demonstrate, first, that the opportunity-based approach offers potential for design in response to the complexity of urban flood territories. Through diversity and proactiveness, it would seem to be relevant in achieving the balance between natural phenomena and human activities. On the other hand, the risk-based and opportunity-based approaches are different but complementary. What emerges from the mapping process is that the design of flood eco-resilient cities entails a balance between risk and opportunity.Second, these results show that opportunity-based design reflects a logic that generates virtuous cycles between landscape features (soil, vegetation, etc.) and fundamental flows (water, energy, waste, nutrients, etc.) for the production of socio‑eco-environmental benefits. The basis of its action is to reconnect cities with their territories by articulating, in a multifunctional, interdisciplinary and multitemporal way, the synergies between the physical elements of urban territory. It is particularly relevant in that it formulates a new, balanced relationship between human and hydro-ecological systems and offers the potential for a new societal perspective.To sum up, the first important conclusion is that semantic mapping is an effective research tool in that it facilitates the handling and analysis of complex data. The second is that the method theorised, together with the observation grid developed, constitute a change in flood-related design practices. And finally, this thesis establishes a refined theoretical and practical starting point for challenging the risk management paradigm and pursuing further research into flood eco-resilient cities and into “Living With” floods.

L’essentiel de ce texte est une réflexion sur mon travail de création et les concepts théoriques qui le construisent. J’aborde plusieurs thèmes dont en particulier le paysage autour duquel je développe une réflexion sur l’habitation. Ma recherche est au confluent de ces deux éléments qui concernent les relations entre le paysage, l’habitation et l’appartenance. À travers ce projet de recherche-création, j’explore différentes facettes du paysage et je m’approprie ce concept à travers une quête identitaire puisque j’utilise ma ville natale, Lebel-sur-Quévillon, pour mener ma recherche. Les concepts mentionnés seront développés en relation avec les oeuvres produites tout au long de mon projet de recherche-création.