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Detecção e caracterização moleculares de vírus das famílias Alloherpesviridae e Iridoviridae em espécies de peixes ornamentais do Brasil / Detection and molecular characterization of viruses of Alloherpesviridae and Iridoviridae families in ornamental fish species in Brazil

Samara Rita de Lucca Maganha 12 August 2016 (has links)
As doenças virais de peixes causadas por vírus das famílias Iridoviridae e Alloherpesviridae estão distribuídas mundialmente e representam uma ameaça real a expansão do sistema aquícola mundial. Desse modo, tornam-se necessários o aprimoramento e aplicação das técnicas de diagnóstico existentes a fim de se controlar ou impedir o avanço dessas viroses entre países. Vírus do gênero Megalocytivirus (MV) e o Cyprinid herpesvirus (CyHV), tipos 1, 2 e 3, induzem enfermidades em peixes com elevada taxa de mortalidade. Já vírus do gênero Lymphocystivirus (LCDV), apesar da menor patogenicidade, causam graves perdas econômicas ao reduzirem o valor comercial dos animais infectados. Devido à escassez de dados disponíveis sobre a circulação desses vírus no Brasil, o presente estudo objetivou a prospecção, incluindo a detecção e caracterização por meio da utilização de técnicas moleculares, de MV, LCDV, CyHV-1, CyHV-2 e CyHV-3 em peixes ornamentais oriundos do município de São Paulo, bem como em espécies de peixes de vida livre e comerciais provenientes de 4 estados brasileiros. Para tanto, foram coletadas e caracterizadas amostras de 306 peixes de 47 espécies diferentes, sendo que todas foram processadas para CyHV-3 e 81 foram submetidas ao diagnóstico para os demais vírus, obtendo-se uma positividade de 47% para MV, 1,2% para LCDV e 2% para CyHV-3. Todas as amostras positivas eram oriundas de peixes ornamentais do município de São Paulo. A sequência nucleotídica de LCDV obtida agrupou-se filogeneticamente em clado do genótipo VII, com similaridade de 44,8-91,1% para com outras sequências homólogas. As sequências de MV agruparam-se em clado com outras sequências de origem asiática, exibindo similaridade de 47,2-99,2% para com outras sequências. Para CyHV-3, a similaridade entre as sequências obtidas e para com outras homólogas foi igual ou superior a 97,4%, agruparando-se em 2 clados distintos. Análises evolutivas indicaram seleção negativa fraca ou relaxada para todas as sequências dos 3 grupos virais estudados. Nesse sentido, destaca-se o ineditismo dos resultados obtidos para a melhor compreensão da epidemiologia molecular desses vírus no Brasil. / Viral fish disease caused by viruses of Iridoviridae and Alloherpesviridae families are distributed globally and represent a real threat to the expansion of world aquaculture system. Thus, improvement and application of current diagnostic techniques in order to control or stop the spread of these infections among countries become necessary. Virus of Megalocytivirus (MV) gender and the Cyprinid herpesvirus (CyHV), types 1, 2 and 3, induce diseases in fish with high mortality rate. Virus of Lymphocystivirus (LCDV) gender, despite their lower pathogenicity, cause severe economic losses by reducing the commercial value of infected animals. Due to the paucity of data available on the circulation of these viruses in Brazil, this study aimed to prospecting, including the detection and characterization through the use of molecular techniques, MV, LCDV, CyHV-1, CyHV-2 and CyHV-3 in ornamental fish come from the city of São Paulo, as well as in fish species of free and commercial life from 5 Brazilian states. For this purpose, 306 samples of 43 different species of fish were collected and characterized, all of which were processed to CyHV-3 and 81 were subjected to the diagnosis of other viruses, yielding a positivity rate of 47% for MV, 1.2% for LCDV and 2% for CyHV-3. All positive samples were from ornamental fish of São Paulo municipality. The only LCDV-nucleotide sequence obtained was grouped phylogenetically in the genotype VII clade, showing 44.8-91.1% similarity to other homologous sequences. Sequences of MV grouped into clade with Asian sequences, displaying 47.2-99.2% similarity to other homologous sequences. For CyHV-3, the similarity among the sequences obtained in this study and the similarity to homologous sequences was equal or superior to 97.4%, grouping into 2 distinct clades. Evolutionary analysis indicated weak or relaxed negative selection for all the sequences from the 3 studied virus groups. In this sense, it can highlight the novelty of the obtained results for a better understanding of the molecular epidemiology of these viruses in Brazil.
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Transferência de aflatoxinas da ração para lambaria (Astyanax altiparanae) cultivados em piscicultura / Transfer of aflatoxins from feed to lambari fish (Astyanax altiparanae) in fish farming

Euder Cesar Michelin 09 August 2016 (has links)
O objetivo deste trabalho foi estudar a transferência de aflatoxinas da ração para peixes lambari (Astyanax altiparanae), avaliando a influência dos níveis de toxina na ração sobre o desempenho dos peixes. As aflatoxinas foram incorporadas à ração extrusada para peixes tropicais, previamente testada para a presença de aflatoxinas, e as concentrações foram confirmadas por cromatografia líquida de alta eficiência (CLAE). Os tratamentos foram constituídos por: Controle - ração sem toxina; A. Ração + 10 µg AFB1/kg; B. Ração + 20 µg AFB1/kg e C. Ração + 50 µg AFB1/kg. Os juvenis de lambari foram alocados em aquários com densidade de 1 peixe por litro. O experimento foi realizado por 120 dias, com três repetições. A cada 30 dias foram realizados levantamentos biométricos e avaliação do desempenho (taxa de crescimento, sobrevivência, ganho de peso). A determinação de aflatoxinas nas amostras foi realizada por CLAE em músculo e fígado. Mensalmente, dez peixes por aquário foram utilizados para compor uma amostra, totalizando 48 amostras de músculo e 48 amostras de fígado analisadas ao final do experimento. As aflatoxinas na dieta prejudicaram o desempenho dos lambaris, observando-se menor peso e tamanho dos peixes nos tratamentos com aflatoxinas em relação ao controle. Houve também menor consumo de ração pelos peixes do tratamento C no período final do experimento. De modo geral, observou-se que, principalmente a partir dos 90 dias de experimento, houve acúmulo de aflatoxinas no fígado e no músculo dos animais. A concentração de aflatoxina B1 observada no músculo dos lambaris ao final do período de exposição foi semelhante aos níveis empregados na dieta. Os resultados mostraram que o lambari é uma espécie sensível, havendo efeito das aflatoxinas sobre o desempenho e acúmulo de aflatoxinas no músculo e fígado. Assim, quando da exposição diária e prolongada de lambaris às aflatoxinas, conclui-se que os limites atuais das legislações para aflatoxinas em ração animal não garantem segurança à produção e à saúde dos consumidores. / The aim of this study was to evaluate the transfer of aflatoxins from feed to lambari fish (Astyanax altiparanae), assessing the influence of toxin levels on fish performance. Aflatoxins were incorporated into extruded feed for tropical fish, previously tested for aflatoxins, and the concentrations were confirmed by high-performance liquid chromatography (HPLC). The treatments were: Control - feed without toxin; A. Feed + 10 µg AFB1/kg; B. Feed + 20 µg AFB1/kg and C. Feed + 50 µg AFB1/kg. Juveniles of lambari fish were placed in aquariums with density of 1 fish per liter. The experiment was conducted for 120 days, with three replications. Every 30 days biometric surveys were performed, including weight and standard length. Feed intake, feed conversion, growth rate and survival were also evaluated. Determination of aflatoxins was carried out by HPLC in muscle and liver. Monthly, a pool of 10 fish were used to make a sample, adding up to 48 samples of muscle and 48 samples of liver analyzed at the end of the experiment. Aflatoxins in the diet impaired the lambari performance, with lower weight and size of fish from aflatoxins treatments compared to control. There was also lower feed intake by fish from treatment C in the final period of the experiment. In general, it was observed that, mainly from 90 days of experiment, there was accumulation of aflatoxins in the liver of lambari fish and consequently in the muscle. Aflatoxin B1 concentration observed in the muscle of lambari fish at the end of the exposure period was similar to the levels used in the diet. Results showed that lambari fish is sensitive specie, with effects of aflatoxins on performance and accumulation of aflatoxins in muscle and liver. Therefore, when daily and prolonged exposure of lambaris to aflatoxins, it is concluded that the current regulation limits for aflatoxins in animal feed do not guarantee safety production and consumer health.
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Efeitos da suplementação de ácido ascórbico durante a realimentação na musculatura de pacus (Piaractus mesopotamicus) submetidos a um período de jejum

Zanella, Bruna Tereza Thomazini. January 2020 (has links)
Orientador: Maeli Dal Pai / Resumo: Períodos de restrição alimentar são comuns em peixes. Nessa condição, ocorre a degradação do tecido muscular e a produção de espécies reativas de oxigênio (ROS), danosas aos seres vivos. Nesse sentido, a adição de antioxidantes como o ácido ascórbico (AA) na alimentação, pode resultar na neutralização e prevenção dos danos ocasionados pelas ROS. O objetivo desse trabalho foi avaliar os impactos da suplementação de AA no músculo esquelético de pacus submetidos ao jejum. Pacus juvenis foram divididos nos grupos: Control (C; alimentação contínua - 200 mg/kg de AA), Fasting (F; 15 dias de jejum) e três grupos realimentados por 30 dias após o jejum: Low (L-AA; 100 mg/kg de AA), Balanced (B-AA; 200 mg/kg de AA) e High supplementation (H-AA; 400 mg/kg de AA). Amostras musculares foram coletadas após jejum (15 dias) e realimentação (6 horas, 15 e 30 dias). Fibras musculares foram mensuradas e separadas em classes de acordo com seu diâmetro; análises bioquímicas foram realizadas para avaliar a atividade de enzimas antioxidantes. A expressão de genes envolvidos nas vias de anabolismo, catabolismo, miogênese e metabolismo oxidativo foram avaliadas por RT-qPCR. Além disso, análises in vitro foram realizadas para comprovar o efeito direto desse protocolo em células musculares. Após o período de jejum, ocorreu a diminuição no diâmetro das fibras e na expressão de genes anabólicos, além de aumento na expressão de genes catabólicos no grupo F. Após um curto período de realimentação (6 horas)... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Fasting periods commonly occur throughout the fish’s life. During this condition, there is an increase in muscle degradation and reactive oxygen species (ROS) production, which can cause cell disturbances. Antioxidants, such as ascorbic acid (AA), can neutralize and prevent ROS’s damage. Thus, we aimed to evaluate the AA supplementation impacts in the skeletal muscle of pacu after a fasting period. Pacu juvenile were grouped in Control (C; continuous feeding - 200 mg/kg of AA), Fasting (F; 15 days of fasting) and three refeeding groups after fasting: Low (L-AA; 100 mg/kg of AA), Balanced (B-AA; 200 mg/kg of AA) and High-supplementation (H-AA; 400 mg/kg of AA). Muscle samples were collected after fasting (15 days) and refeeding (6 hours, 15 and 30 days). Muscle fibers were measured and grouped in diameter classes. Biochemistry analyses were performed to evaluate antioxidant enzymes activity. Genes related to anabolism, catabolism, myogenesis and oxidative metabolism were analyzed by RT-qPCR. Besides, in vitro analyzes were performed to evaluate the direct AA effect’s in muscle cells. After fasting, a decrease in fiber diameter and anabolic genes expression, besides an increase in catabolic genes was observed in F group. In the first moment after refeeding (6 hours), the anabolic and myogenic genes expression increased in the H-AA. After 15 days, the L-AA group presented a general decrease in gene expression, while the H-AA had an increase in myogenic genes expression and recov... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Análises cromossômicas e genômicas aplicadas ao estudo evolutivo e estrutural dos satelitomas em espécies do gênero Gymnotus (Teleostei, Gymnotiformes)

Melo, Silvana de January 2020 (has links)
Orientador: Fausto Foresti / Resumo: Um dos tipos mais abundantes de DNA repetitivo, o DNA satélite, apresenta importantes aspectos estruturais e evolutivos, como o acúmulo diferencial entre espécies próximas e taxas de evolução molecular variadas. O satelitoma, identificado como o conjunto total de DNAs satélites (satDNA) de determinado organismo, permite uma investigação mais aprofundada em abundância e riqueza desses elementos repetitivos entre espécies, mas ainda é de conhecimento restrito entre espécies de peixes. Mapeamentos prévios de DNA repetitivo no gênero Gymnotus evidenciaram uma ampla diversificação na distribuição dessas sequências no genoma do grupo, todavia é restrita a porção de DNA repetitivo reportado pela limitação de metodologias passadas. Dessa forma, a associação recente de plataformas de Sequenciamento de Próxima Geração (NGS) com análises de bioinformática proporcionam um acesso mais refinado ao genoma, permitindo a anotação de um maior número de elementos repetitivos nos componentes desse grupo. Assim, o objetivo do presente estudo foi investigar a evolução do DNA satélite e a distribuição física de famílias de satDNAs em espécies de peixe elétrico do gênero Gymnotus, a partir da construção do satelitoma dos grupos. Os genomas das espécies dos principais clados de Gymnotus foram acessados e a metodologia de filtragem pela plataforma RepeatExplorer e satMiner permitiu a identificação do satelitoma em cada um dos grupos abordados, caracterizando massivamente as famílias de satDNAs dentro ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: One of the most relevant types of repetitive DNA, the satellite DNA, has important structural and evolutionary aspects, such as differential accumulation between close species and diverse molecular evolution rates. The satellitome, identified as the total set of satellite DNAs (satDNA) of a given organism, allows further investigation into the abundance and richness of these elements between species, but is still of limited knowledge among fish species. Previous studies of repetitive DNA mapping in the Gymnotidae fish family showed a wide diversification in the distribution of these sequences in the genome of the group. Since past methodologies have been limited in reporting this portion of repetitive DNA, there is still too much to know regarding these elements. Notably, the recent association of Next Generation Sequencing (NGS) platforms with bioinformatics analysis provides a more refined access to the genome, allowing annotation of a greater number of repetitive elements. Thus, the aim of the present study was to investigate the evolution of satellite DNA and the physical distribution of satDNA families in Gymnotus, through the construction of the satellitome of the groups. The genomes of the species from the main Gymnotus clades were accessed and the RepeatExplorer filtering methodology allowed the identification of the satellitome in each of the groups analyzed, massively characterizing the families of satDNAs within each species complex in Gymnotus, highlighting the pr... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Pathological assessment of fishes and water quality of Billings Dam / Avaliação anatomopatológica de peixes e qualidade da água do Reservatório Billings

Santos, Sandy Lorena Pulecio 01 February 2018 (has links)
The environmental agencies has been monitoring water reservoirs such as the Billings dam with the purpose of protection and conservation of water resources based on periodical water and sediment analyses, but it does not use fish as bioindicators routinely. The study aimed to characterize water quality of the Billings dam based on integrated analyses of water and sediment parameters in addition to pathological assessment of tilapias (n=103), acaras (Geophagus brasiliensis, n=246), and trairas (Hoplias malabaricus, n=78). Samplings of water, sediment and fish were executed in six sites of the dam in summer and spring of 2014 and 2015. Analytical methods for water and sediment parameters were carried out according to standard methods, while the pathological evaluation of fish involved the Fulton index, gross lesions evaluations, the macroscopic index and histopathological diagnosis of gills, liver, kidney, and spleen lesions, and their histopathological indices. Water and sediment analyses characterized the water as a eutrophic environment and polluted by metals. Water parameters showed improvement in 2015, but physicochemical, biological, chronic toxicity results, and metals criteria were in part above historic average and legal limits required. The pathological evaluation revealed that the three fish species responded to environmental conditions in different ways and presented worse indices in 2015. Gills were the main organ affected in all species studied and the principal tissue response was regressive and reversible pattern. The indices of trairas were the highest and this species was considered the best for biomonitoring the Billings dam. Comprehensive approach of water, sediment and fishes parameters allowed the evaluation of water quality of the Billings dam and it may represent one of the ways to evaluate its environmental conditions as well as the quality of the fish consumed in the region. / Os reservatórios de água, como a represa Billings, são monitorados com o propósito de proteger e conservar os recursos hídricos baseando-se na análise periódica de água e do sedimento, porém não são utilizados de rotina peixes como bioindicadores. O objetivo do estudo foi caracterizar a qualidade de água da represa Billings, considerando a análise integrada dos parâmetros de água e sedimentos somados à avaliação anatomopatológica de tilápias (n=103), acarás (Geophagus brasiliensis, n=246), e traíras (Hoplias malabaricus, n=78). Amostras de água, sedimento e peixes foram coletadas em seis pontos da represa durante o verão e a primavera de 2014 e 2015. Métodos analíticos padronizados foram utilizados para avaliação da água e do sedimento, e a avaliação anatomopatológica dos peixes, incluiu o índice Fulton, lesões macroscópicas e histopatológicas de brânquias, fígado, rins e baço. As análises de água e sedimentos caracterizaram a água como ambiente eutrofizado e poluído por metais. Os parâmetros da água mostraram melhora no ano de 2015, porém os resultados físicoquímicos, biológicos, de toxicidade crônica e de metais estiveram acima da média histórica e dos limites permitidos pela legislação. A avaliação anatomopatológica revelou que as três espécies de peixes responderam às condições ambientais de formas diferentes, apresentando índices mais altos de lesão em 2015. A brânquia foi o principal órgão afetado em todas as espécies de peixes. O principal padrão de resposta tecidual foi o regressivo e reversível. Os índices das trairas foram os maiores e esta espécie foi considerada a melhor espécie para o biomonitoramento da represa Billings. A análise integrada de parâmetros de água, sedimento e dos peixes permitiu a avaliação da qualidade da água da represa Billings, e pode representar uma das formas de avaliar as condições ambientais bem como a qualidade dos peixes consumidos na região.
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Migrações ascendentes de peixes neotropicais e hidrelétricas: proteção a jusante de turbinas e vertedouros e sistemas de transposição. / Upstream migrations of neotropical fishes and hidroelectric dams: protection downstream from turbines and from spillways and fish passages.

Junho, Ricardo Ahouagi Carneiro 22 October 2008 (has links)
Este trabalho se propõe a examinar aspectos de engenharia, particularmente da engenharia hidráulica, referentes aos impactos dos aproveitamentos hidrelétricos sobre deslocamentos migratórios ascendentes de peixes, buscando identificar medidas para a redução da eventual mortalidade de peixes, em tubos de sucção de turbinas e em regiões de restituição do escoamento de vertedouros, e descrever os sistemas de transposição de peixes usuais, com destaque para escadas de peixes tipo ranhura vertical. A revisão bibliográfica se inicia abordando migrações de peixes e o impacto causado pela implantação de usinas hidrelétricas, vindo, em seguida, aspectos hidráulicos relativos a barreiras para o impedimento da entrada de peixes em tomadas dágua e sua possível aplicação para tubos de sucção de turbinas. São relatados estudos de casos relativos à implantação de canais de restituição em vertedouros, para evitar a mortalidade de peixes, eventualmente aprisionados em poços e depressões na região de restituição do escoamento vertido, quando esta não possui água permanentemente, após o fechamento das comportas. A revisão da literatura prossegue tratando de sistemas usuais de transposição de peixes para montante, de acordo com a experiência internacional e, também, com a experiência nacional recente. Em seguida, são apresentados estudos em modelo reduzido realizados para a avaliação e caracterização de escoamentos em tanques de algumas escadas de peixes tipo ranhura vertical, tanto com seção transversal retangular, que constituem solução clássica, quanto com seção transversal trapezoidal, com caráter inédito na literatura, que possui, comparativamente, menores custos de implantação, descrevendo-se as instalações experimentais utilizadas, os ensaios realizados e os resultados obtidos, com a discussão de aspectos hidráulicos e de ictiofauna. Conclui-se que as soluções mais promissoras para reduzir a mortalidade de peixes são grades metálicas e barreiras comportamentais sonoras e elétricas, na saída de tubos de sucção, bem como a implantação de canais de restituição do escoamento de vertedouros. Conclui-se, também, que escadas de peixe tipo ranhura vertical com seção transversal trapezoidal fornecem condições de escoamento adequadas, compatíveis com os supostos requisitos natatórios das diferentes espécies de peixes em suas migrações ascendentes, além de exigirem menores investimentos de implantação, quando comparadas com escadas com seção transversal retangular. Recomenda-se que sejam feitos estudos e monitoramentos de ictiofauna específicos para subsidiar projetos de engenharia nessa área. / This work aims to examine engineering, mainly hydraulic engineering, aspects related to the effects of hydroelectric dams on upstream fish migration, identifying possible measures for the reduction of fish mortality, inside turbines draft tubes and in the region downstream from spillways, and describing the most common upstream fish passages, mainly vertical slot fishways. The literature review starts with fish migrations and the effects of dams and reservoir on fishes, followed by hydraulic aspects of barriers to prevent fish entrance in water intakes and their possible application to turbine draft tubes. Case studies are reported concerning the construction of spillway exit channels to avoid the possible mortality of fish entrapped in depressions and pools in the old riverbed, when it`s not permanently flooded, after the closure of the spillway gates. The literature review proceeds with the most common upstream fish passages, according to the international experience and to the recent Brazilian`s experience. Next, the hydraulic model studies developed for evaluation and characterization of flow inside pools of vertical slot fishways are described, for the classical rectangular cross section, as well as for trapezoidal ones, not presented in the literature so far, which have comparatively lower costs, detailing the experimental arrangements, the experiments and experimental results, with discussions on hydraulic and ichthyofauna aspects. Its concluded that the most promising solutions to reduce fish mortality are fish screens and sound and electric behavioural barriers, at the exit of draf tubes, and the construction of spillway exit channels. Its also concluded that vertical slot fishways with trapezoidal cross sections provide good flow conditions, meeting the supposed swimming requirements of different fish species on their upstream migrations, with lower capital costs than classical fishways, with rectangular cross sections. Its recommended that specific ichthyofauna studies and monitoring be developed to subsidize engineering design in this field.
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Estrutura e composição da ictiofauna no terço final da bacia do Rio Santa Bárbara, Sub-bacia do Rio Sapucaí-Mirim, São Paulo, Brasil

Diniz, Paulo Baltazar January 2019 (has links)
Orientador: José Augusto Senhorini / Resumo: O Rio Santa Bárbara, pequeno afluente do Rio Sapucaí-Mirim, drena uma área de 1.013 km². Está inserido na bacia do alto rio Paraná, região considerada uma província ictiofaunística natural. Este trabalho estabeleceu como objetivo principal registrar a ictiofauna desse rio, de algumas de suas lagoas marginais e de seu afluente Rio Potreiro, bem como caracterizar o grau de antropização de sua bacia. Quatro campanhas foram realizadas, duas na estação seca e duas na estação chuvosa. Um total de 922 exemplares foram coletados, considerando os doze pontos de amostragens selecionados (seis pontos em lagoas e seis pontos em rios), distribuídos em 33 espécies representativas de 16 famílias e 6 ordens. A ordem Characiformes revelou-se a mais representativa (63%), seguida das ordens Perciformes (13%) e Siluriformes (12%). Com relação às famílias, Characidae (41%) foi a mais abundante, seguida pelas famílias Cichlidae (13%) e Poeciliidae (11%). Um espécime de Brycon nattereri foi coletado no Rio Santa Bárbara, espécie criticamente ameaçada no estado de São Paulo; duas espécies não nativas foram encontradas (Metynnis maculatus e Oreochromis niloticus), representado 0,7% do total de espécimes coletados e três espécies tiveram o seu primeiro registro para a bacia do Rio Sapucaí Mirim: Hyphessobrycon bifasciatus, Moenkhausia intermedia e Brycon nattereri. Foram identificadas 65 lagoas marginais ao longo da bacia do Rio Santa Bárbara (45 permanentes, 19 temporárias e 3 meandros abandonados), ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Santa Bárbara River, a small tributary of the Sapucaí-Mirim River, drains an area of 1,013 km². It is inserted in the upper Paraná river basin, a region considered a natural ichthyofaunistic province. This work aims to record the ichthyofauna of this river, some of its marginal lakes and its affluent Rio Potreiro, as well as to characterize the degree of anthropization of its basin. Four campaigns were carried out, two in the dry season and two in the rainy season. A total of 922 specimens were collected, considering the twelve sampling spots selected (six spots in lakes and six spots in rivers), distributed in 33 representative species of 16 families and 6 orders. The Characiformes order came out to be the most representative (63%), followed by Perciformes (13%) and Siluriformes (12%). Regarding the families, Characidae (41%) was the most abundant, followed by families Cichlidae (13%) and Poeciliidae (11%). A species of Brycon nattereri was collected in Santa Bárbara River, a species critically endangered in the state of São Paulo, two non-native species that were found (Metynnis maculatus and Oreochromis niloticus), represented 0.7% of the total specimens collected and three species had the first record for the Rio Sapucaí Mirim basin: Hyphessobrycon bifasciatus, Moenkhausia intermedia and Brycon nattereri. A total of 65 marginal lakes were identified along Santa Bárbara river’s basin (45 permanent, 19 temporary and 3 abandoned meanders), mapping the spatial patterns of the... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Migrações ascendentes de peixes neotropicais e hidrelétricas: proteção a jusante de turbinas e vertedouros e sistemas de transposição. / Upstream migrations of neotropical fishes and hidroelectric dams: protection downstream from turbines and from spillways and fish passages.

Ricardo Ahouagi Carneiro Junho 22 October 2008 (has links)
Este trabalho se propõe a examinar aspectos de engenharia, particularmente da engenharia hidráulica, referentes aos impactos dos aproveitamentos hidrelétricos sobre deslocamentos migratórios ascendentes de peixes, buscando identificar medidas para a redução da eventual mortalidade de peixes, em tubos de sucção de turbinas e em regiões de restituição do escoamento de vertedouros, e descrever os sistemas de transposição de peixes usuais, com destaque para escadas de peixes tipo ranhura vertical. A revisão bibliográfica se inicia abordando migrações de peixes e o impacto causado pela implantação de usinas hidrelétricas, vindo, em seguida, aspectos hidráulicos relativos a barreiras para o impedimento da entrada de peixes em tomadas dágua e sua possível aplicação para tubos de sucção de turbinas. São relatados estudos de casos relativos à implantação de canais de restituição em vertedouros, para evitar a mortalidade de peixes, eventualmente aprisionados em poços e depressões na região de restituição do escoamento vertido, quando esta não possui água permanentemente, após o fechamento das comportas. A revisão da literatura prossegue tratando de sistemas usuais de transposição de peixes para montante, de acordo com a experiência internacional e, também, com a experiência nacional recente. Em seguida, são apresentados estudos em modelo reduzido realizados para a avaliação e caracterização de escoamentos em tanques de algumas escadas de peixes tipo ranhura vertical, tanto com seção transversal retangular, que constituem solução clássica, quanto com seção transversal trapezoidal, com caráter inédito na literatura, que possui, comparativamente, menores custos de implantação, descrevendo-se as instalações experimentais utilizadas, os ensaios realizados e os resultados obtidos, com a discussão de aspectos hidráulicos e de ictiofauna. Conclui-se que as soluções mais promissoras para reduzir a mortalidade de peixes são grades metálicas e barreiras comportamentais sonoras e elétricas, na saída de tubos de sucção, bem como a implantação de canais de restituição do escoamento de vertedouros. Conclui-se, também, que escadas de peixe tipo ranhura vertical com seção transversal trapezoidal fornecem condições de escoamento adequadas, compatíveis com os supostos requisitos natatórios das diferentes espécies de peixes em suas migrações ascendentes, além de exigirem menores investimentos de implantação, quando comparadas com escadas com seção transversal retangular. Recomenda-se que sejam feitos estudos e monitoramentos de ictiofauna específicos para subsidiar projetos de engenharia nessa área. / This work aims to examine engineering, mainly hydraulic engineering, aspects related to the effects of hydroelectric dams on upstream fish migration, identifying possible measures for the reduction of fish mortality, inside turbines draft tubes and in the region downstream from spillways, and describing the most common upstream fish passages, mainly vertical slot fishways. The literature review starts with fish migrations and the effects of dams and reservoir on fishes, followed by hydraulic aspects of barriers to prevent fish entrance in water intakes and their possible application to turbine draft tubes. Case studies are reported concerning the construction of spillway exit channels to avoid the possible mortality of fish entrapped in depressions and pools in the old riverbed, when it`s not permanently flooded, after the closure of the spillway gates. The literature review proceeds with the most common upstream fish passages, according to the international experience and to the recent Brazilian`s experience. Next, the hydraulic model studies developed for evaluation and characterization of flow inside pools of vertical slot fishways are described, for the classical rectangular cross section, as well as for trapezoidal ones, not presented in the literature so far, which have comparatively lower costs, detailing the experimental arrangements, the experiments and experimental results, with discussions on hydraulic and ichthyofauna aspects. Its concluded that the most promising solutions to reduce fish mortality are fish screens and sound and electric behavioural barriers, at the exit of draf tubes, and the construction of spillway exit channels. Its also concluded that vertical slot fishways with trapezoidal cross sections provide good flow conditions, meeting the supposed swimming requirements of different fish species on their upstream migrations, with lower capital costs than classical fishways, with rectangular cross sections. Its recommended that specific ichthyofauna studies and monitoring be developed to subsidize engineering design in this field.
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Efeito do contato macho-fêmea na preferência da fêmea e na competição entre machos na tilápia-do-Nilo

Castro, André Luis da Silva [UNESP] 03 July 2008 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:30Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-07-03Bitstream added on 2014-06-13T20:00:48Z : No. of bitstreams: 1 castro_als_dr_jabo.pdf: 338540 bytes, checksum: 2873a81aaff2ff97d28c2182b3255c16 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O comportamento reprodutivo dos teleósteos envolve a seleção de parceiros para acasalamento por meio de escolha da fêmea e da disputa entre machos. A disputa pode levar à formação de hierarquia de dominância, na qual os machos dominantes têm vantagem no acasalamento por impedir que outros machos se aproximem da fêmea. Por outro lado, é possível que a fêmea prefira machos com maior habilidade competitiva, antes da formação da hierarquia. Assim, para compreender os fatores que afetam a preferência da fêmea e se a presença da fêmea durante as competições fornece vantagem na luta dos machos, realizamos dois estudos com a tilápia-do-Nilo (Oreochromis niloticus). O primeiro estudo testou a preferência das fêmeas em relação à características indicadoras da habilidade competitiva dos machos, sem a interferência da competição entre eles. Para isso, uma fêmea foi submetida ao contato visual com dois machos isolados e a preferência por um deles foi testada. Posteriormente os mesmos machos interagiram e estabeleceram a dominância. O macho preferido não se tornou dominante. Assim, não houve associação entre a preferência da fêmea e características indicadoras da habilidade competitiva dos machos. No segundo estudo testamos o efeito do contato visual de um macho com uma fêmea sobre a disputa hierárquica entre machos, uma vez que as interações macho-fêmea podem modular a reprodução e agressão dos peixes. Para isso, um macho em contato visual prévio com uma fêmea interagiu com um macho previamente isolado até o estabelecimento hierárquico. Porém, o macho em contato visual com a fêmea não se tornou dominante nem emitiu maior freqüência de ataques ao oponente. A presença da fêmea causou aumento do Índice Gonadossomático do... / Reproductive behavior of many fish species is performed by sexual selection and mate choice based on male-male contests. In such situation, selection is related to individual male competitive ability. Competition causes a social hierarchy, and dominant fish takes advantages for mating by avoid subordinate approach of females. Thus, it is possible that female prefer highest competitive ability males. To understand factors affecting female preference and, whether female presence can affect reproductive male ability, we performed two studies with Nile tilapia (Oreochromis niloticus) to understand the factors involved in dominance and female choice. In the first study we tested the female preference for highest competitive ability male. For this purpose, a female was kept in a visual contact with two males and the preference was tested by recording time female spent near to them. After that, both males were put together to fight, and we analyzed the chosen male was the winner. There was no association between female choice and male competitive ability. In the second study, we tested the effect of male visual contact with female and we supposed this could guarantee victories in a contest. Thus, a male was kept seeing a female during 6 days, and after that it was paired with a 6-days isolated male until hierarchical settlement. Female presence causes gonadosomatic index rise, but did not enhance chances for male victory in the social contest. This means that males that have more developed gonads do not take advantage in social interactions. Finally, we concluded that: i) females showed preference for one male; ii) female preference is not associated to male competitive ability; iii) visual stimulated males by female (with better gonadal condition) have not advantage in the hierarchy settlement.
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Táticas reprodutivas e ocorrência parasitária de isópodos em carapeba, Diapterus rhombeus (Cuvier, 1829), no Rio Grande do Norte, Brasil / Reproductive tactics and parasitary occurrence of isopods in carapeba, Diapterus rhombeus (Cuvier, 1829), in Rio Grande do Norte, Brazil

Freitas, Maria Daniana Felix de 18 October 2017 (has links)
Submitted by Lara Oliveira (lara@ufersa.edu.br) on 2018-03-28T21:06:53Z No. of bitstreams: 1 MariaDFF_DISSERT.pdf: 2297623 bytes, checksum: 4700cc8e86349c7cf496397919d441e3 (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Christiane (referencia@ufersa.edu.br) on 2018-06-18T16:55:19Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MariaDFF_DISSERT.pdf: 2297623 bytes, checksum: 4700cc8e86349c7cf496397919d441e3 (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Christiane (referencia@ufersa.edu.br) on 2018-06-18T16:55:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MariaDFF_DISSERT.pdf: 2297623 bytes, checksum: 4700cc8e86349c7cf496397919d441e3 (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Christiane (referencia@ufersa.edu.br) on 2018-06-18T16:57:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MariaDFF_DISSERT.pdf: 2297623 bytes, checksum: 4700cc8e86349c7cf496397919d441e3 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-18T16:57:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MariaDFF_DISSERT.pdf: 2297623 bytes, checksum: 4700cc8e86349c7cf496397919d441e3 (MD5) Previous issue date: 2017-10-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Diapterus rhombeus is a fish of coastal and estuarine water that can be found throughout the Western Atlantic, from the Gulf of Mexico to Brazil. As it is a peidxe of great abundance it is important to have knowledge about the reproductive and parasitological biology of the species. With this, the objective of this study was to verify the main tactics that compose the reproductive strategy and the condition factor of D. rhombeus and the occurrence of isopod ectoparasites. The study was carried out in marine waters in the Northwest of the Atlantic Ocean (4º 50'57 ''S and 3751'36''W), more precisely in the coast of Areia Branca, RN, Brazil. A total of 298 individuals of the species were captured, in which in the study of their reproductive tactics it was identified that the individuals presented total weight ranges from 51.4g to 220.5g and a total length of 150mm to 245mm, where females were always found to be larger range of total length than males. In the analysis of weight and length both sexes presented a negative allometric growth, that is, the individuals had greater increase in length than in weight. Individuals presented a 1.8M: 1F sex ratio throughout the study. Four stages of gonadal maturation were identified macroscopically: immature, maturing, mature and emptied and microscopic study with histological analysis showed oocyte and sperm development within gonads at each stage of maturation. The length at which individuals entered first maturation was calculated to be 160 mm in total length. The gonadosomatic index (IGS) showed higher peaks for both males and females in November, December and January, indicating that the spawning season occurs soon after this period. The absolute fecundity was 16,313 oocytes and indicated that the females had a synchronous reproductive development in two groups. In the study of condition factor (K) higher peaks were shown shortly after the spawning season, indicating that the greater well-being of the individuals occurs in this period. The parasitic study showed that the species is parasitized by Cymothoa excisa, an isopod parasite that was found inhabiting the oral cavity of the individuals, presenting parasitic indexes with prevalence of 7.38%, mean intensity of 1.18 and average abundance of 0.09. In the present work, D. rhombeus individuals possess reproductive tactics that identify the species as a fish seasonal strategist and that the species can be considered as a new host of the C. excisa isotope ectoparasite / Diapterus rhombeus é um peixe de água costeira e estuarino que pode ser encontrado em todo Oeste do Atlântico, desde o Golfo do México até o Brasil. Como se trata de um peidxe de grande abundancia é importante ter o conhecimento sobre biologia reprodutiva e parasitológica da espécie. Com isso, o objetivo deste estudo foi verificar as principais táticas que compõem a estratégia reprodutiva e o fator de condição de D. rhombeus e a ocorrência de ectoparasitos isópodos. O estudo ocorreu em águas marinhas no Norte do Sudoeste do Oceano Atlântico (4º 50’57’’S e 3751’36’’O), mais precisamente no litoral de Areia Branca, RN, Brasil. Foram capturados 298 indivíduos da espécie, nos quais no estudo das suas táticas reprodutivas foi identificado que os indivíduos apresentaram amplitudes de peso total 51,4g a 220,5g e comprimento total de 150 mm a 245 mm, onde as fêmeas sempre foram encontradas em maior amplitude de comprimento total que os machos. Na análise de peso e comprimento ambos os sexos apresentaram um crescimento alométrico negativo, ou seja, os indivíduos tiveram maior incremento em comprimento que em peso. Os indivíduos apresentaram proporção sexual de 1,8M:1F ao longo do estudo. Quatro estádios de maturação gonadal foram identificados macroscopicamente: imaturos, em maturação, maduros e esvaziados e estudo microscópico com análise histológica mostrou o desenvolvimento ovocitário e espermático dentro das gônadas de cada estágio de maturação. O comprimento em que os indivíduos entraram em primeira maturação foi calculado como sendo em 160mm de comprimento total. O índice gonadossomático (IGS) apresentou picos mais elevados tanto para machos quanto para fêmeas nos meses de novembro, dezembro e janeiro, o que indicou que a época de desova ocorre logo após esse período. A fecundidade absoluta foi de 16.313 ovócitos e indicou que as fêmeas apresentam um desenvolvimento reprodutivo sincrônico em dois grupos. No estudo de fator de condição (K) foi mostrado picos mais elevados logo após a época de desova, indicando que o maior bem-estar dos indivíduos ocorre neste período. O estudo parasitário mostrou que a espécie se encontra parasitada por Cymothoa excisa, parasito isópodo que foi encontrado habitando a cavidade bucal dos indivíduos, apresentando índices parasitários com prevalência de 7,38%, intensidade média de 1,18 e abundancia média de 0,09. Registrando no presente trabalho que os indivíduos da espécie D. rhombeus possuem táticas reprodutivas que identificam a espécie como um peixe estrategista sazonal e que a espécie pode ser considerada como um novo hospedeiro do ectoparasito isópodo C. excisa / 2018-03-28

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