Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-12-19T13:24:28Z No. of bitstreams: 1 Krystal de Acantara Notaro.pdf: 793764 bytes, checksum: 7ba62c08471fced23d53b2a89f703bda (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-19T13:24:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Krystal de Acantara Notaro.pdf: 793764 bytes, checksum: 7ba62c08471fced23d53b2a89f703bda (MD5) Previous issue date: 2012-07-27 / The cultivation of cassava has great economic impact in Brazil and worldwide due to its importance in human and animal foods and industrialization. The Northeast is a major national producer, being linked to a production in which uses little or no technology, which has contributed to increasing the number and severity of disease. Among these, the cassava root rot is becoming a major cause of losses. Therefore, this dissertation aimed to: 1. Perform prospecting the main biological agent responsible for cassava root rot in four cities who are among the largest producers of cassava in the state 2. Select sandy soils under twenty types of coverage, from the semiarid region of Pernambuco and characterize its chemical, physical and microbial properties 3. Determine the soil enzymes activity involved in the cycles (C, N, S and P), 4. Evaluate the natural suppressiviness on indigenous populations and with the inoculation of Scytalidium lignicola. In the Pernambuco state is prevalent Fusarium pathogens, associated to cassava root rot. In the Caetés city was prevalent pathogen Scytalidium lignicola affected areas with cassava root rot. When assessing the chemical, physical and microbial, physical variables (soil density, soil total porosity, field capacity, sand and clay), chemical (pH, Na, Ca and P) and microbial (soil basal respiration, carbon total organic, microbial biomass carbon, fluorescent group bacteria, total bacteria and endospore-forming bacteria) were more sensitive in detecting differences between the sandy soils with 20 different types of uses and vegetation covers from the semiarid region of Pernambuco. The human activity interferes directly in the enzymatic activity of the systems under different covers, which can be used as indicators of soil quality. The main variables involved in suppressiveness were high levels of K, Ca, soil basal respiration, organic matter, microbial biomass carbon, qCO2, qMIC, soil porosity total, wilting point, sand, FDA and arylsulfatase. The principal component analysis selected the attributes (severity, P, Ca, K, fluorescent group of bacteria, soil basal respiration, sand, acid phosphatase and arylsulfatase), able to detect differences between treatments, separated into three groups of similarity between soils conducive and in five groups between soils suppressive to root rot of cassava caused by Scytalidium lignicola. / O cultivo da mandioca tem grande expressão econômica no Brasil e no mundo devido à sua importância na alimentação humana e, animal e utilização na industria. A Região Nordeste é uma das principais produtoras nacionais, estando vinculado a uma produção na qual utiliza pouca ou nenhuma tecnologia, o que vem contribuindo para o aumento do número e intensidade de doenças. Dentre estas, a podridão radicular da mandioca vem se tornando uma das principais causas de perdas. Por isso, essa pesquisa teve como objetivos 1. Realizar a prospecção do principal agente biológico responsável pela podridão radicular da mandioca em quatro municípios que estão entre os maiores produtores de mandioca do estado; 2. Selecionar solos arenosos sob vinte tipos de coberturas, provenientes do semiárido de Pernambuco e caracterizar seus atributos químicos, físicos e microbianos; 3. determinar a atividade enzimática das enzimas envolvidas no ciclo do (C, N, S e P) desses solos e, 4. Avaliar a capacidade supressiva ou conduciva desses solos em populações autóctones e com a inoculação de Scytalidium lignicola. No estado de Pernambuco há prevalência de fitopatógenos do gênero Fusarium, associado à podridão radicular da mandioca. No município de Caetés houve prevalência do fitopatógeno Scytalidium lignicola nas áreas afetadas com a podridão radicular da mandioca. Quando avaliados os atributos químicos, físicos e microbianos, as variáveis físicas (densidade do solo, porosidade total, capacidade de campo, areia e argila), de fertilidade (pH, Na, Ca e P) e microbianas (respiração basal do solo, carbono orgânico total, carbono da biomassa microbiana, bactérias do grupo fluorescentes, bactérias totais e bactérias formadoras de endósporos) foram mais sensíveis em detectar diferenças entre os solos arenosos selecionando-se 20 tipos diferentes de usos e coberturas vegetais provenientes do semiárido de Pernambuco. A atividade antrópica interfere diretamente na atividade enzimática dos sistemas sob diferentes coberturas, podendo ser utilizados como indicadores da qualidade do solo. As principais variáveis envolvidas na supressividade foram avaliados teores de K, Ca, respiração basal do solo, matéria orgânica, carbono da biomassa microbiana, quociente metabólico, quociente microbiano, porosidade total, ponto de murcha permanente, areia, arilsulfatase e FDA. A análise de componentes principais selecionou os atributos (Severidade, P, Ca, K, bactérias do grupo fluorescente, respiração basal do solo, areia, fosfatase ácida e arilsulfatase), capazes de detectar diferenças entre os tratamentos, separando em três grupos de similaridade entre os solos conducivos e em cinco grupos entre os solos mais supressivos à podridão radicular da mandioca, causada por Scytalidium lignicola.

Made available in DSpace on 2017-07-10T17:37:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luciano_Stefanello.pdf: 1381556 bytes, checksum: 6bd57829a5462b5319b07e3a1fb7ba7a (MD5) Previous issue date: 2016-08-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Cassava culture has great importance for agriculture and for populations mainly those in development, for being a culture with high rusticity and productivity, but diseases have been reducing the productivity and invalidating croplands, as in the case of root rot. Therefore the aim of this study was to investigate the potential of Trichoderma to control root rot in cassava caused by Fusarium and Phytophthora, and to investigate the ability of Trichoderma to promote the development of culture and the use of Trichoderma combined with different varieties in both systems. Initially in vitro tests were performed with 23 isolates of Trichoderma spp., the pair of test cultures, production of volatile and non-volatile antimicrobial compounds, against Phytophthora drechsleri development and Fusarium solani, under field conditions cassava planting was realized using the range Fécula Branca in conventional system where at planting was performed spraying spore suspension six of Trichoderma isolates on cuttings in the planting furrow. A second experiment was performed in two culture systems with two varieties with and without Trichoderma harzianum application. For nonvolatiles antimicrobial compounds the isolate studied presented a high ability to reduce mycelial growth of P. drechsleri and F. solani with inibiting up to 100%, to evaluate nonvolatiles antimicrobial compounds produced by Trichoderma the results were less expressive with the maximum inhibition value of 23,87%. for the first experiment under field conditions,the isolated TLB 14 promoted a better root development, consequently providing more productivity, for the incidence of disease the isolates TOD2A, TLB14 and TI2 presented lower incidence. for the second experiment under field conditions, about the plant stand it was lower in range Baianinha and using T. harzianum, the incidence of brown streak was lower in conventional tillage and the productivity was higher in convencional tillage and using T. harzianum / A cultura da mandioca possui grande importância para as populações principalmente aquelas em desenvolvimento, por ser uma cultura com alta rusticidade e produtividade. No entanto doenças vem reduzindo a produtividade e inviabilizando áreas de cultivo como é o caso das podridões radiculares. Portanto o objetivo deste trabalho foi verificar o potencial de Trichoderma em controlar podridão radicular na mandioca causada por Fusarium e Phytophthora, além de investigar a capacidade do Trichoderma em promover o desenvolvimento da cultura e o uso de Trichoderma combinado com diferentes variedades em dois sistemas de cultivo. Inicialmente testes in vitro foram realizados com 23 isolados de Trichoderma spp., pelos testes de pareamento de culturas, produção de compostos antimicrobianos voláteis e não voláteis, frente ao desenvolvimento de Phytophthora drechsleri e Fusarium solani. Em condições de campo o plantio de mandioca foi realizado utilizando a variedade Fécula Branca em sistema convencional efetuando-se pulverização de suspenção de esporos de seis isolados de Trichoderma sobre as manivas dentro do sulco de plantio. Um segundo experimento foi realizado em condições de campo em dois sistemas de cultivo com duas variedades (IAC 90 e Baianinha) com e sem a aplicação de Trichoderma harzianum. Para compostos antimicrobianos não voláteis os isolados estudados apresentaram uma alta capacidade em reduzir o crescimento micelial de P. drechsleri e F. solani com inibição de até 100 %. Para a avaliação de compostos antimicrobianos voláteis produzidos por Trichoderma os resultados foram menos expressivos com valor de inibição máximo de 23,87 %. Para o primeiro experimento em condição de campo o isolado TLB 14 promoveu um melhor desenvolvimento radicular, consequentemente proporcionando maior produtividade, para a incidência de doença os isolados TOD2A, TLB14 e TI2 foram os que reduziram a incidência em raízes de mandioca. Para o segundo experimento em condições de campo, quanto ao estande de plantas ele foi menor na variedade Baianinha e com o uso de T. harzianum. A incidência de podridão radicular foi menor em sistema de plantio convencional e a produtividade foi maior em sistema de plantio convencional e com o uso de T. harzianum

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:34:59Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-12-17Bitstream added on 2014-06-13T19:24:04Z : No. of bitstreams: 1 correa_eb_dr_botfca.pdf: 989982 bytes, checksum: 71fbc2f45208972feb39e1343c4e6620 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O cultivo hidropônico de hortaliças vem crescendo e se tecnificando no Brasil. No entanto, podridões radiculares causadas por espécies de Pythium constituem um sério problema para a sua expansão. Uma vez o patógeno instalado no sistema, esse pode ser suprimido por meio da adição de microrganismos antagônicos. Além de suprimirem a podridão radicular, esses microrganismos introduzidos na solução nutritiva podem promover o crescimento das plantas, aumentando a receita do produtor. Entretanto, muitas vezes verifica-se baixa sobrevivência dos microrganismos adicionados na solução nutritiva. O desenvolvimento de formulações de agentes de controle biológico, principalmente de bactérias do gênero Pseudomonas, é um fator chave para a sua utilização em escala comercial. Devido à importância da podridão radicular em cultivos hidropônicos e o potencial de utilização do controle biológico da doença, os objetivos do presente trabalho foram (i) selecionar microrganismos residentes do manguezal como agentes de biocontrole da podridão radicular e promotores de crescimento em pepino hidropônico; (ii) avaliar o controle biológico da podridão radicular e a promoção de crescimento por Pseudomonas chlororaphis 63-28 e Bacillus subtilis GB03 em pimentão e alface cultivados em hidroponia; (iii) desenvolver uma formulação de Pseudomonas spp.. Em condições de casa de vegetação, Bacillus cereus AVIC-3-6, isolado de manguezal, protegeu as plantas de pepino do subdesenvolvimento causado pelo patógeno; Gordonia rubripertincta SO-3B-2 e Pseudomonas stutzeri MB-P3A-49, também isolados de manguezal, promoveram o crescimento de plantas de pepino não inoculadas com o patógeno. A adição de P. chlororaphis 63-28 e B. subtilis GB03 na solução nutritiva de pimentão cultivado em hidroponia e inoculado com P. aphanidermatum teve efeito positivo na supressão dos danos causados... / Hydroponic production of vegetables and flowers is increasing in Brazil, and the production technology is improving. A major factor constraining crop productivity is root rot caused by Pythium spp. Root rot severity can be reduced by the application of appropriate antagonistic microbes into the hydroponic nutrient solution or root zone of the crops. When in the root zone beneficial microbes may suppress progress of the root rot and increase crop productivity. However some beneficial microbes are not well-adapted to hydroponic environments and do not survive well in plant nutrient solutions. Ecologically-adapted microbes that are effective against root rot are a key factor for successful root rot control in hydroponic crops. The need for effective biological agents that are adapted to hydroponic systems and appropriately formulated for commercial use prompted investigations with the following aims: i) to select bacterial strains from among isolates obtained from mangrove swamps for effectiveness in controlling Pythium root rot in hydroponic cucumber; ii) to evaluate Pseudomonas chlororaphis 63-28 and Bacillus subtilis GB03 for controlling root rot and promoting growth of hydroponic lettuce and pepper; and iii) to assess formulations of Pseudomonas spp. for long-term shelf life. Bacillus cereus AVIC -3-6 from a mangrove reduced stunting of hydroponic cucumbers associated with Pythium root rot. Gordonia rubripertincta SO-3B-2 and Pseudomonas stutzeri MB-3PA-49 from a mangrove increased growth of healthy cucumber plants. Application of Pseudomonas chlororaphis 63-28 and Bacillus subtilis GB03 into the nutrient solution of hydroponic pepper suppressed root rot and increase the plant growth. Among tested formulations of Pseudomonas chlororaphis 63-28, a formulation with coconut fibre of 80% moisture content had the longest shelf life (up to 32 weeks) when kept at at 3ºC. We conclude that a)... (Complete abstract click electronic access below)

UFRA / Cassava is one of the most dynamic agricultural products in the world, being cultivated in many countries, however your productive is affected by pathogens, mainly those witch cause root rot, with Phytopythium sp. Studies related with identification of genes in the interaction between cassava-P/?yto/?y//?7MOT sp. are not found in the literature. Therefore, the main objective of thesis was prospecting genes involved in the mechanisms of response of cassava to the agent that causes root rot. The thesis is divided in six chapter, the first does a general contextualization, in second chapter was identified genes related with cassava immunity that possess potential for combat against root rot pathogen, the third chapter discussed the potential of phytocystatin in the control of plant diseases caused by fungi. In the chapter four a search of the cassava genome was carried out by genes that will code phytocystatin and these were characterized in silico and compared phylogenetically with phytocystatin from other cultures. Chapter five is about the adaptations methodology of rapid propagation of cassava for obtainment of seedlings aiming at greenhouse studies, such as the inoculation of root rot agent in cassava plants. The sixth chapter presents the results aiming at the inoculation of root rot agent of roots in cassava plants. The adaptation of the rapid propagation method of cassava was effective in the production of seedlings for studies at the molecular levei of the interaction of cassava -Phytopythium sp. In total, nine genes involved in biotic stress response were investigated, of which seven presented differential expression pattems in the roots inoculated with Phytopythium sp. The analysis of the cassava genome resulted in the identification of novel phytochemical gene isoforms that are distributed on seven chromosomes. These genes become eligible for use in breeding programs aimed at combating root rot in cassava caused by Phytopythium sp. Key / A mandioca é um dos mais dinâmicos produtos da agricultura mundial, sendo cultivada em mais de cem países, no entanto sua produtividade é afetada por patógenos, principalmente os causadores de podridões radiculares, como o Phytopythium sp. Não há relatos de estudos que identificaram genes envolvidos na interação Mandioca- Phytopythium sp., portanto esta tese tem como objetivo principal a prospecção de genes envolvidos nos mecanismos de resposta da mandioca ao agente causador da podridão radicular. A tese está dividida em seis capítulos, onde o primeiro faz a contextualização geral, o segundo identificou genes relacionados à imunidade de mandioca que possuam potencial para atuar na defesa contra o agente causador da podridão radicular, o terceiro capítulo discutiu o potencial das fitocistatinas no controle de doenças de plantas causadas por fungos. No quarto capítulo foi realizada uma busca no genoma da mandioca por genes que irão codificar fitocistatina e estes foram caracterizados />? silico e comparados filogeneticamentes com fitocistatinas de outras culturas. O quinto capítulo trata de uma adaptação no método de propagação rápida da mandioca para a obtenção de mudas visando estudos em casa de vegetação, tais como, a inoculação do agente causador da podridão radicular das raízes em plantas de mandioca. O sexto capítulo apresenta os resultados visando realizar a inoculação do agente causador da podridão radicular das raízes em plantas de mandioca. A adaptação do método de propagação rápida da mandioca foi eficaz na produção de mudas para estudos em nível molecular da interação mandioca-Phytopythium sp. No total foram investigados nove genes envolvidos na resposta ao estresse biótico, dos quais sete apresentaram padrões de expressão diferencial nas raízes inocuculadas com Phytopythium sp.. A análise do genoma da mandioca resultou na identificação de nove isoformas de genes da fitocistatina que estão distribuídas em sete cromossomos. Estes genes se tornam canditados para utilização em programas de melhoramento genético que visem o combate a podridão radicular em mandioca causado ^ox Phytopythium sp.

The cowpea, Vigna unguiculata (L.) Walp., is known as feijão-de-corda and feijão-verde , among others, is one of the main cultures exploited by small producers of the Northeast region of Brazil. Among the phytopathogens that affects its productivity, Sclerotium rolfsii Sacc. is noteworthy, causing the stem rot in several cultures around the world. The objective of this work was to evaluate the alternative control of S. rolfsii Sacc. in saplings of V. unguiculata (L.) Walp. trough the biocontrol of antagonists, organic residues incorporation to the soil, utilization of essential oils, plant extracts and mineral nutrition. The work was developed in the Laboratory de Phytopathology and in the vegetation house of CECA/UFAL. The pathogen was obtained trough the isolations of cowpea with symptoms of the disease and, afterwards, it was cultivated in sterilized rice. For in vitro control, the antagonists isolates were matched with the pathogen in PDA medium, for the purpose of evaluating the reduction of growth and the hyperparasitism. For the biofumigations of the soil, the organic materials poultry litter, mussel, sugar cane bagasse, bean residue, cassava scuff were dehydrated in stove at 55ºC for 96h, grinded in the concentrations of 10% and 20% (v/v) and incorporated to the substrate, infested for 20 days and compared to the group treated with methyl thiophanate and to the control. After thirty days, the seedlings were evaluated about the incidence and the suppression of the disease. In the in vivo control the seeds were microbiolized with antagonists (C110, C21, ENF24, R14 and Trichoderma harzianum), the fungicide and saline solution for the control. The substrate was infested with the pathogen, two days after the sow, and after 30 days were evaluated. For the natural substances, 21 days old seedlings were pulverized with cassava flour wastewater extract (40%), eucalyptus oil (1%), peppermint (1%), Ecolife® (2%), methyl thiophanate (0,7 g/L) and water for the control and after two days, the substrate was infested with the pathogen. Six days after the inoculation, a new pulverization was done. The mineral fertilization was done in the sow trough Sarruge solution and doses of calcium silicate and sodium, 50, 100, 500 and 1000mg/L-1 and water for the control. The substrate was infested two days after that and a second fertilization was done 10 days after the sow. After 30 days the evaluations took place. The antagonists R14, C16, ENF 24 and T. harzianum inhibited the pathogen with RC from 42 up to 57%. Trichoderma has the hyperparasitic capacity. The incorporation of organic material was not efficient in the control of the disease. The in vivo antagonists reduced the incidence of the disease, but it was effective in the suppression. The oils and plant extracts were not efficient in reduced the incidence. The mineral fertilizations was not able to suppress the disease. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O feijão-caupi, Vigna unguiculata (L.) Walp., é conhecido como feijão-de-corda e feijão-verde sendo uma das principais culturas exploradas pelos pequenos produtores no Nordeste brasileiro. Dentre os fitopatógenos que afetam sua produtividade, destaca-se Sclerotium rolfsii Sacc. que causa a podridão de colo em diversos cultivos do mundo. O objetivo do trabalho foi avaliar o controle alternativo de S. rolfsii Sacc. em mudas de V. unguiculata (L.) Walp. através do uso de antagonistas, incorporação de resíduos orgânicos ao solo, utilização de óleos essenciais, extratos vegetais e ecolife® e nutrição mineral. O trabalho foi desenvolvido no Laboratório de Fitopatologia e em casa de vegetação do CECA/UFAL. O patógeno foi obtido pelo isolamento de folhas de feijão-caupi com sintomas da doença e depois cultivados em arroz esterilizado. Para controle in vitro , os isolados de antagonistas foram pareados com o patógeno em meio de BDA, para avaliar a redução de crescimento micelial (RC) e o hiperparasitismo. Para a biofumigação do solo, as matérias orgânicas cama de frango, marisco, bagaço de cana, resíduo de feijão, raspa de mandioca foram desidratadas em estufa 55ºC por 96h, moídas e incorporadas ao substrato infestado, em concentrações de 10% e 20% (v/v) por 20 dias e comparadas ao tiofanato metílico e a testemunha. Após 30 dias, as plantas foram avaliadas quanto à incidência da doença e desenvolvimento da planta. No controle in vivo as sementes foram microbiolizadas com os antagonistas (C110, C21, ENF24, R14 e Trichoderma harzianum), o fungicida e água salina para testemunha. O substrato foi infestado com o patógeno, dois dias após o semeio foram avaliadas com 30 dias. Para as substâncias naturais, plantas de feijão-caupi, com 21 dias de idade foram pulverizadas com extrato de manipueira (40%), óleo de eucalipto (1%), hortelã pimenta (1%), Ecolife® (2%), tiofanato metílico (0,7 g/L) e água para a testemunha. Após dois dias, o substrato foi infestado com o patógeno. Ao completar seis dias da infestação, uma nova pulverização foi realizada. A adubação mineral foi realizada no semeio através de solução de Sarruge e doses de silicato de cálcio e sódio, 50, 100, 500 e 1000mg/L-1 e água para testemunha. O substrato foi infestado dois dias depois e uma segunda adubação foi feita 10 dias após o semeio. Os antagonistas R14, C16, ENF 24 e T. harzianum inibiram o patógeno com RC de 42 a 57%. Trichoderma teve capacidade hiperparasitária. A incorporação da matéria orgânica não foi eficiente no controle da doença. Os antagonistas in vivo reduziram a incidência da doença e contribuiu para o desenvolvimento das plantas. Os óleos e extratos vegetais não foram eficientes em reduzir a incidência da doença. A adubação mineral não foi capaz de suprimir a doença.

Apesar das excelentes condições edafoclimáticas para a produção de abacates no Brasil, a cultura encontra limitações relacionadas à baixa produtividade e suscetibilidade à podridão da raiz causada por Phytophthora cinnamomi, a principal doença da cultura nas distintas regiões produtoras. A aplicação de coberturas naturais ao solo é uma das estratégias que visa o controle desta doença, e entre seus benefícios estão a maior disponibilidade de água e nutrientes, menor competição das plantas daninhas, melhoria da estrutura, porosidade e fertilidade do solo e melhor aspecto sanitário das plantas, por favorecer a formação de um ambiente supressivo ao desenvolvimento do patógeno, pelo aumento do sistema radicular e da população de microorganismos antagônicos. Todos estes benefícios das coberturas naturais, junto ao aporte de nutrientes após sua incorporação, favorecem indiretamente a produção e o crescimento dos frutos. O objetivo deste trabalho foi avaliar distintos manejos da vegetação intercalar em abacateiros \'Hass\' visando à obtenção de coberturas naturais que, aplicadas ao solo, permitam minimizar a incidência da podridão radicular, promovendo melhorias no estado sanitário das plantas e na produção. Entre 2011 e 2013 foram avaliados cinco tratamentos: T1: ausência de vegetação intercalar, sem aplicação de cobertura morta sob a copa das plantas; T2: ausência de vegetação intercalar e duas aplicações externas de cobertura morta sob a copa; T3: duas deposições de cobertura morta sob a copa, obtida pelo corte da vegetação intercalar com roçadeira enleiradora lateral (REL); T4: três deposições de cobertura morta sob a copa, obtida pelo corte da vegetação intercalar com REL, e T5: manutenção da vegetação intercalar com três cortes anuais utilizando roçadeira convencional, sem deposição de cobertura morta sob a copa. O delineamento estatístico foi em blocos aleatorizados, com 6 repetições e 3 plantas úteis por parcela, nas quais foram avaliados: os teores de macronutrientes e micronutrientes em folhas e no solo; desenvolvimento vegetativo e radicular, produção de frutos, aspecto visual das plantas, massa seca da vegetação intercalar, espessura da cobertura morta e características químicas e microbiológicas do solo. A aplicação de coberturas vegetais resultou em um maior crescimento das plantas e maior tamanho dos frutos, sem efeito significativo sobre a produção. A deposição de cobertura morta obtida com REL favoreceu o desenvolvimento das raízes na camada superficial do solo. No entanto, os tratamentos não influenciaram significativamente o aspecto visual sanitário das plantas, nem os teores de macronutrientes e micronutrientes nas folhas e no solo. O manejo da vegetação intercalar com roçadeira convencional resultou em maior volume de massa seca, já o manejo desta com dois ou três cortes anuais utilizando REL depositou uma quantidade similar de cobertura morta sob a copa, que foi inferior à depositada pela aplicação externa de cobertura (T2). Todos os tratamentos com deposição de cobertura vegetal suprimiram o desenvolvimento de plantas daninhas sob a copa. No tratamento sem aplicação de cobertura morta e sem vegetação intercalar, houve aumento na população de P. cinnamomi no solo. Comparativamente, no período de dois anos, não foram observadas diferenças na população de actinomicetos no solo dos distintos tratamentos. / Despite the excellent soil and climatic conditions for avocado production in Brazil, the culture has limitations related to low productivity and susceptibility to avocado root rot caused by Phytophthora cinnamomi, the main crop disease in all producing areas. Mulching is one of the strategies utilized for controlling this disease, with several benefits such as an improved soil water and nutrients availability for roots, reduced weed competition, improved soil structure, porosity and fertility and enhanced plant health condition, due to the creation of a suppressive environment for the development of the pathogen, by increasing root density and the population of antagonistic microorganisms. All these benefits of natural mulches, together with the supply of nutrients and assimilates after their incorporation to the soil, indirectly enhance fruit yield and size. The aim of this work was to evaluate different managements of inter-row vegetation in an adult \'Hass\' avocado orchard in order to obtain mulches which, after being applied to the soil, will allow reducing root rot incidence, thus promoting improvement of plant sanitary condition, with positive effects on fruit yield. From 2011 through 2013, five treatments were evaluated: T1: absence of inter-row vegetation, without mulch application under the canopy; T2: absence of inter-row vegetation and two applications of external mulch under the canopy: T3: two mulch depositions under the canopy obtained after cutting off the inter-row vegetation with a lateral alignment mower (LAM); T4: three mulch depositions under the canopy obtained after cutting off the inter-row vegetation with a LAM, and T5: maintenance of natural inter-row vegetation with three annual cuttings using a conventional mower, without mulch deposition under the canopy. The experiment was conducted in randomized blocks, with 6 repetitions and 3 plants per plot, on which the following variables were measured: levels of macro and micronutrients in leaves and soil; root and plant size development; fruit yield and size; plant sanitary condition visually assessed with a 10-note scale; biomass of inter-row vegetation; mulch thickness and chemical and microbiological soil characteristics. Mulching resulted in larger plant growth and fruit size, with no significant effects on fruit yield. Application of mulch obtained with a LAM enhanced root growth in the surface soil layer. Nonetheless, the treatments did not significantly affect nor the plant sanitary aspect, neither the leaf or soil levels of macro and micronutrients. Management of inter-row vegetation with a conventional mower resulted in larger biomass development, while managing inter-row vegetation with two or three cuttings with LAM per year resulted in similar amounts of mulch laid down under the canopy, yet less than with the application of external mulch (T2). All the treatments with mulch deposition suppressed weed growth under the canopy. In the treatment with no mulch and no inter-row cropping, a larger population of P. cinnamomi was recorded. There were no differences in the Actinomycetes soil population among treatments.

Submitted by Élida Maeli Fernandes Quirino (maely_sax@hotmail.com) on 2018-05-15T19:05:55Z No. of bitstreams: 1 PEDRO LIMA FILHO - DISSERTAÇÃO PPGSA PROFISSIONAL 2015..pdf: 6434890 bytes, checksum: 9a4103b5aeb74beaec1a4cefac1a1429 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-15T19:05:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PEDRO LIMA FILHO - DISSERTAÇÃO PPGSA PROFISSIONAL 2015..pdf: 6434890 bytes, checksum: 9a4103b5aeb74beaec1a4cefac1a1429 (MD5) Previous issue date: 2015-06 / A cultura da melancia pode ser afetada por diversos patógenos que atuam no sistema radicular das plantas, comprometendo a absorção e o transporte de água e nutrientes, interferindo nos processos vitais para o seu desenvolvimento. Os experimentos foram conduzidos no CCTA/UFCG, Campus de Pombal. O primeiro avaliou o efeito de diferentes doses (0,14mL, 28mL, 56mL e 112mL/planta) do composto orgânico Bokashi no controle da podridão radicular ocasionada por Fusarium spp. em duas etapas simultâneas utilizando solo estéril e não estéril em casa de vegetação, as doses foram aplicadas semanalmente utilizandos e a cultivar ‘Crimson Sweet’ que foi semeada em vasos contendo seis kg de solo argiloso, constituído de seis tratamentos com cinco repetições. Foi avaliada a população microbiana total do solo, colhido a 0, 30, e 60 dias após o plantio da melancia e a uma profundidade de aproximadamente 10 cm e próximo ao sistema radicular além da incidência e severidade da podridão radicular, e matéria fresca seca da parte aérea das plantas. O segundo experimento em campo avaliou as duas melhores doses do composto orgânico ‘Bokashi, (112ml e 56ml) do experimento anterior e outras doses (224ml e 0ml), assim distribuídos (T1 112ml com Trichoderma, T2 112ml sem Trichoderma, T3 56ml com Trichoderma, T4 56ml sem Trichoderma, T5 224ml com Trichoderma, T6 224ml sem Trichoderma, T7 0ml com trichoderma, T8 0ml sem Trichoderma) totalizando 8 tratamentos e cinco repetições onde foram avaliadas a incidência e severidade a podridão radicular, além das características agronômicas da cultura como acúmulo de massa das plantas, e produção total dos frutos e fisiológica como taxa fotossintética (A), condutância estomática (gs), transpiração (E) e concentração intercelular de CO2 (Ci), No estudo em casa de vegetação os tratamentos com dose de 56ml de bokashi associado ao Trichoderma e o que utilizou dose de 112ml de bokashi obtiveram resultado significativo na redução da Incidência de patógenos fúngicos em melancieiras plantadas em solo não estéril e na severidade da podridão radicular causada por Fusarium spp em solo estéril. Em campo a dose 112ml de bokashi associado ao Trichoderma obteve redução tanto na incidência de patógenos fúngicos quanto na severidade da podridão radicular em melancieiras. O bokashi associado ao Trichoderma obteve melhor controle na incidência e severidade de podridão radicular em melancieira. O bokashi e Trichoderma não interferiram no crescimento e produção da melancieira. O Trichoderma interferiu de forma negativa nas análises fisiológicas da melancieira, para a taxa fotossintética, condutância estomática, transpiração e concentração intercelular de CO2. Os tratamentos que utilizaram dose de 112ml e 56ml de bokashi sem a presença do Trichoderma foi a que apresentou um melhor incremento para taxa fotossintética e condutância estomática respectivamente, evidenciando a importância do bokashi no intuito de melhorar a resposta fisiológica da planta. / The culture of watermelon can be affected by various pathogens that act on the root system of plants, affecting the absorption and transport of water and nutrients, interfering in the processes vital to their development.The experiments were conducted in the CCTA / UFCG, Campus de Pombal. The first evaluated the effect of different doses (0,14mL, 28ml, 56ml and 112mL / plant) of Bokashi organic compound in the control of root rot caused by Fusarium spp. in two simultaneous steps using sterile soil and non-sterile in greenhouse doses were applied weekly using the watermelon cultivar 'Crimson Sweet' that was sown in pots containing six kilograms of clay soil, made up of six treatments with five repetitions. We evaluated total soil microbial population, collected at 0, 30, and 60 days after planting watermelon and to a depth of about 10 cm and close to the root system beyond the incidence and severity of root rot, dry and fresh matter of watermelon. The second field experiment evaluating the top two doses of organic compost 'Bokashi, (112ml and 56ml) of the previous experiment and other doses (224ml and 0ml), distributed as follows (with Trichoderma 112ml, 112ml without Trichoderma, with Trichoderma 56ml, 56ml without Trichoderma, with Trichoderma a 224ml, 224ml without Trichoderma, 0ml with Trichoderma, 0ml without Trichoderma) totaling eight treatments and five replications which were assessed the incidence and severity of root rot and the agronomic characteristics of culture as a mass accumulation of plants, photosynthetic rate (a), stomatal conductance (gs), transpiration (E) and intercellular CO2 concentration (Ci), fresh and dry matter of shoot and total production of fruits. In the study of greenhouse treatments with 56ml dose of Bokashi associated with Trichoderma and what used dose of 112ml of Bokashi achieved significant results in reducing fungal pathogens incidence in watermelon planted in non-sterile soil and severity of root rot Fusarium spp in sterile soil. In the field dose of 112ml Bokashi associated with Trichoderma achieved a reduction in both the incidence of fungal pathogens as the severity of root rot in watermelon. Bokashi associated with Trichoderma got better control the incidence and severity of root rot in watermelon.

Apesar das excelentes condições edafoclimáticas para a produção de abacates no Brasil, a cultura encontra limitações relacionadas à baixa produtividade e suscetibilidade à podridão da raiz causada por Phytophthora cinnamomi, a principal doença da cultura nas distintas regiões produtoras. A aplicação de coberturas naturais ao solo é uma das estratégias que visa o controle desta doença, e entre seus benefícios estão a maior disponibilidade de água e nutrientes, menor competição das plantas daninhas, melhoria da estrutura, porosidade e fertilidade do solo e melhor aspecto sanitário das plantas, por favorecer a formação de um ambiente supressivo ao desenvolvimento do patógeno, pelo aumento do sistema radicular e da população de microorganismos antagônicos. Todos estes benefícios das coberturas naturais, junto ao aporte de nutrientes após sua incorporação, favorecem indiretamente a produção e o crescimento dos frutos. O objetivo deste trabalho foi avaliar distintos manejos da vegetação intercalar em abacateiros \'Hass\' visando à obtenção de coberturas naturais que, aplicadas ao solo, permitam minimizar a incidência da podridão radicular, promovendo melhorias no estado sanitário das plantas e na produção. Entre 2011 e 2013 foram avaliados cinco tratamentos: T1: ausência de vegetação intercalar, sem aplicação de cobertura morta sob a copa das plantas; T2: ausência de vegetação intercalar e duas aplicações externas de cobertura morta sob a copa; T3: duas deposições de cobertura morta sob a copa, obtida pelo corte da vegetação intercalar com roçadeira enleiradora lateral (REL); T4: três deposições de cobertura morta sob a copa, obtida pelo corte da vegetação intercalar com REL, e T5: manutenção da vegetação intercalar com três cortes anuais utilizando roçadeira convencional, sem deposição de cobertura morta sob a copa. O delineamento estatístico foi em blocos aleatorizados, com 6 repetições e 3 plantas úteis por parcela, nas quais foram avaliados: os teores de macronutrientes e micronutrientes em folhas e no solo; desenvolvimento vegetativo e radicular, produção de frutos, aspecto visual das plantas, massa seca da vegetação intercalar, espessura da cobertura morta e características químicas e microbiológicas do solo. A aplicação de coberturas vegetais resultou em um maior crescimento das plantas e maior tamanho dos frutos, sem efeito significativo sobre a produção. A deposição de cobertura morta obtida com REL favoreceu o desenvolvimento das raízes na camada superficial do solo. No entanto, os tratamentos não influenciaram significativamente o aspecto visual sanitário das plantas, nem os teores de macronutrientes e micronutrientes nas folhas e no solo. O manejo da vegetação intercalar com roçadeira convencional resultou em maior volume de massa seca, já o manejo desta com dois ou três cortes anuais utilizando REL depositou uma quantidade similar de cobertura morta sob a copa, que foi inferior à depositada pela aplicação externa de cobertura (T2). Todos os tratamentos com deposição de cobertura vegetal suprimiram o desenvolvimento de plantas daninhas sob a copa. No tratamento sem aplicação de cobertura morta e sem vegetação intercalar, houve aumento na população de P. cinnamomi no solo. Comparativamente, no período de dois anos, não foram observadas diferenças na população de actinomicetos no solo dos distintos tratamentos. / Despite the excellent soil and climatic conditions for avocado production in Brazil, the culture has limitations related to low productivity and susceptibility to avocado root rot caused by Phytophthora cinnamomi, the main crop disease in all producing areas. Mulching is one of the strategies utilized for controlling this disease, with several benefits such as an improved soil water and nutrients availability for roots, reduced weed competition, improved soil structure, porosity and fertility and enhanced plant health condition, due to the creation of a suppressive environment for the development of the pathogen, by increasing root density and the population of antagonistic microorganisms. All these benefits of natural mulches, together with the supply of nutrients and assimilates after their incorporation to the soil, indirectly enhance fruit yield and size. The aim of this work was to evaluate different managements of inter-row vegetation in an adult \'Hass\' avocado orchard in order to obtain mulches which, after being applied to the soil, will allow reducing root rot incidence, thus promoting improvement of plant sanitary condition, with positive effects on fruit yield. From 2011 through 2013, five treatments were evaluated: T1: absence of inter-row vegetation, without mulch application under the canopy; T2: absence of inter-row vegetation and two applications of external mulch under the canopy: T3: two mulch depositions under the canopy obtained after cutting off the inter-row vegetation with a lateral alignment mower (LAM); T4: three mulch depositions under the canopy obtained after cutting off the inter-row vegetation with a LAM, and T5: maintenance of natural inter-row vegetation with three annual cuttings using a conventional mower, without mulch deposition under the canopy. The experiment was conducted in randomized blocks, with 6 repetitions and 3 plants per plot, on which the following variables were measured: levels of macro and micronutrients in leaves and soil; root and plant size development; fruit yield and size; plant sanitary condition visually assessed with a 10-note scale; biomass of inter-row vegetation; mulch thickness and chemical and microbiological soil characteristics. Mulching resulted in larger plant growth and fruit size, with no significant effects on fruit yield. Application of mulch obtained with a LAM enhanced root growth in the surface soil layer. Nonetheless, the treatments did not significantly affect nor the plant sanitary aspect, neither the leaf or soil levels of macro and micronutrients. Management of inter-row vegetation with a conventional mower resulted in larger biomass development, while managing inter-row vegetation with two or three cuttings with LAM per year resulted in similar amounts of mulch laid down under the canopy, yet less than with the application of external mulch (T2). All the treatments with mulch deposition suppressed weed growth under the canopy. In the treatment with no mulch and no inter-row cropping, a larger population of P. cinnamomi was recorded. There were no differences in the Actinomycetes soil population among treatments.

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In both cases, identification at species level is an important step to manage this root pathogen complex, whose detection can be improved by molecular biology tools. Therefore, this study aimed to: 1) to develop and validate a multiplex PCR (m-PCR) method for simultaneous identification of three common bean pathogens, F. oxysporum f. sp. phaseoli, F. solani and C. flaccumfaciens pv. flaccumfaciens; and 2) develop an isothermal amplification of DNA (LAMP) method to detect of F. oxysporum f. sp. phaseoli on seeds. M-PCR method was developed for identification of isolated colonies, as well as infected seeds. In seeds, total DNA was obtained by alkaline lysis method, which inactivates nucleases during the extraction process. M-PCR allowed the identification of all pathogens, with detection of C. flaccumfaciens pv. flaccumfaciens, F. oxysporum f. sp. phaseoli and F. solani amplicons in agarose gel with respectively 306, 609 and 143 base pairs. Furthermore, m-PCR also reduced costs and time to detect Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli from 10 days to three hours. It was not possible to develop an optimized protocol for detection of F. oxysporum f. sp. phaseoli by the LAMP method, using only the tf1 gene for design of primers, since such primers were functional only for amplifying large amounts of target DNA. Based on the negative results with LAMP, it is suggested that further studies should be performed using other DNA sequences available in GenBank database. / O feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris L.) é cultivado durante todo o ano no território brasileiro, em três épocas distintas e em vários agroecosistemas. Nestes ambientes distintos, a cultura está exposta a diversos fatores que causam perdas de rendimento, como o ataque de patógenos. Dentre as doenças do feijoeiro-comum encontram-se a murcha-de-fusarium (Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli), a podridão-radicular-seca (Fusarium solani) e a murcha-de-curtobacterium (Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens) que apresentam sintomas semelhantes, dificultando seu diagnóstico no campo, e cuja identificação em testes de sanidade de sementes também é limitada. Em ambos os casos, a identificação em nível de espécie é uma importante etapa do manejo deste complexo de patógenos, cuja detecção pode ser aperfeiçoada com a adoção de ferramentas de biologia molecular. Portanto, este estudo teve como objetivos: 1) Desenvolver e validar um método de multiplex PCR (m-PCR) para identificação simultânea de três espécies de patógenos do feijoeiro-comum, F. oxysporum f. sp. phaseoli, F. solani e C. flaccumfaciens pv. flaccumfaciens; e 2) desenvolver a técnica de amplificação isotérmica de DNA (LAMP) para detecção de F. oxysporum f. sp. phaseoli em sementes. O método de m-PCR foi desenvolvido para identificação de colônias isoladas bem como sementes infectadas. Nas sementes, o DNA total foi obtido pela lise alcalina, método que inativa nucleases durante o processo de extração. A m-PCR possibilitou a identificação de todos os patógenos, com detecção de C. flaccumfaciens pv. flaccumfaciens, F. oxysporum f. sp. phaseoli e F. solani em bandas formadas em gel de agarose respectivamente com 306, 609 e 143 pares de base. Além disso, a extração do DNA total das sementes pela lise alcalina em combinação com a m-PCR também possibilitou redução de custos e tempo de realização do diagnóstico de Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli, de 10 dias para três horas. Não foi possível estabelecer um protocolo otimizado para detecção de F. oxysporum f. sp. phaseoli pelo método LAMP, utilizando somente o gene tf1 para desenho dos iniciadores, uma vez que, os iniciadores revelaram-se funcionais apenas para a amplificação com grandes quantidades de DNA alvo. Diante dos resultados obtidos com LAMP, sugere-se que estudos posteriores sejam realizados empregando outras sequências de DNA disponíveis no banco de dados GenBank.