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Polyhedral Study of Tree Decomposition / Estudo PoliÃdrico de DecomposiÃÃo em ÃrvoreJefferson LourenÃo Gurguri 09 February 2015 (has links)
CoordenaÃÃo de AperfeÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / The concept of treewidth was introduced by Robertson and Seymour. Treewidth may be defined as the size of the largest vertex set in a tree decomposition.
Recent results show that several NP-Complete problems can be solved in polynomial time, or linear, when restricted to graphs with small treewidth.
In our bibliographic research, we focus attention on the calculation of lower bounds for the treewidth and we described, in our dissertation, some of the principal results already available in the literature.
We realize that linear-integer formulations for determining the treewidth are very limited in the literature and there are no studies available on the polyhedra associated with them.
The Elimination Order Formulation (EOF) has been proposed by Koster and Bodlaender. It is based on orderly disposal of vertices and the relationship between the treewidth of a graph and its chordalizations.
As a result of our study, we present a simplification of EOF formulation, we show that the polyhedron associated with this simplification is affine isomorphic to the EOF formulation. We determine the dimension of the polyhedron associated with the simplification, we briefly present a set of very simple facets and we introduce, analyse and demonstrate be a facet, some more complex inequalities. / O conceito de largura em Ãrvore (âtreewidthâ) foi introduzido por Robertson e Seymour. A largura em Ãrvore de um grafo G Ã o mÃnimo k tal que G pode ser decomposto em uma DecomposiÃÃo em Ãrvore (DEA) com cada subconjunto de vÃrtice com no mÃximo k+1 vÃrtices.
Resultados recentes demonstram que vÃrios problemas NP-Completos podem ser resolvidos em tempo polinomial, ou ainda linear, quando restritos a grafos com largura em Ãrvore pequena.
Em nossa pesquisa bibliogrÃfica, focamos a atenÃÃo no cÃlculo de limites inferiores para a largura em Ãrvore e descrevemos, em nossa dissertaÃÃo, alguns dos resultados jà disponÃveis na literatura.
NÃs percebemos que formulaÃÃes lineares-inteiras para a determinaÃÃo da largura em Ãrvore sÃo limitadas na literatura e nÃo hà estudos disponÃveis sobre os poliedros associados a elas.
A formulaÃÃo por ordem de eliminaÃÃo (EOF) foi proposta por Koster e Bodlaender. Ela à baseada na eliminaÃÃo ordenada de vÃrtices e na relaÃÃo entre a largura em Ãrvore de um grafo e suas cordalizaÃÃes.
Como resultado de nosso estudo, apresentamos uma simplificaÃÃo da formulaÃÃo EOF, demonstramos que o poliedro associado a simplificaÃÃo à afim-isomÃrfico ao da formulaÃÃo EOF, verificamos a dimensÃo do poliedro associado à simplificaÃÃo, apresentamos brevemente um rol de facetas muito simples desse poliedro e, em seguinte, introduzimos, analisamos e demonstramos ser faceta algumas desigualdades mais complexas.
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Algoritmos para resolução do problema de empacotamento de conjuntos utilizando poliedros quase inteiros / Algorithms for the set packing problem using quasi integer polyhedraPorto, Claudia Akemi Furushima 12 October 2010 (has links)
Orientador: Cid Carvalho de Souza / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação / Made available in DSpace on 2018-08-17T07:58:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2010 / Resumo: O resumo poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: The abstract is available with the full electronic digital document / Mestrado / Teoria da Computação / Mestre em Ciência da Computação
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Enveloppe convexe des codes de Huffman finis / The convex hull of Huffman codesNguyen, Thanh Hai 10 December 2010 (has links)
Dans cette thèse, nous étudions l'enveloppe convexe des arbres binaires à racine sur n feuilles.Ce sont les arbres de Huffman dont les feuilles sont labellisées par n caractères. à chaque arbre de Huffman T de n feuilles, nous associons un point xT , appelé point de Huffman, dans l'espace Qn où xT est le nombre d'arêtes du chemin reliant la feuille du ième caractère et la racine.L'enveloppe convexe des points de Huffman est appelé Huffmanoèdre. Les points extrêmes de ce polyèdre sont obtenus dans un premier temps en utilisant l'algorithme d'optimisation qui est l'algorithme de Huffman. Ensuite, nous décrivons des constructions de voisinages pour un point de Huffman donné. En particulier, une de ces constructions est principalement basée sur la construction des sommets adjacents du Permutoèdre. Puis, nous présentons une description partielle du Huffmanoèdre contenant en particulier une famille d'inégalités définissant des facettes dont les coefficients, une fois triés, forment une suite de Fibonacci. Cette description bien que partielle nous permet d'une part d'expliquer la plupart d'inégalités définissant des facettes du Huffmanoèdre jusqu'à la dimension 8, d'autre part de caractériser les arbres de Huffman les plus profonds, i.e. une caractérisation de tous les facettes ayant au moins un plus profond arbre de Huffman comme point extrême. La contribution principale de ce travail repose essentiellement sur les liens que nous établissons entre la construction des arbres et la génération des facettes / In this thesis, we study the convex hull of full binary trees of n leaves. There are the Huffman trees, the leaves of which are labeled by n characters. To each Huffman tree T of n leaves, we associate a point xT , called Huffman point, in the space Qn where xT i is the lengths of the path from the root node to the leaf node marked by the ith character. The convex hull of the Huffman points is called Huffmanhedron. The extreme points of the Huffmanhedron are first obtained by using the optimization algorithm which is the Huffman algorithm. Then, we describe neighbour constructions given a Huffman point x. In particular, one of these constructions is mainly based on the neighbour construction of the Permutahedron. Thereafter, we present a partial description of the Huffmanhedron particularly containing a family of inequalities-defining facets whose coeficients follows in some way the law of the well-known Fibonacci sequence. This description allows us, on the one hand, to explain the most of inequalities-defining facets of the Huffmanhedron up to the dimension 8, on the other hand, to characterize the Huffman deepest trees, i.e a linear characterization of all the facets containing at least a Huffman deepest tree as its extreme point. The main contribution of this work is essentially base on the link what we establish between the Huffman tree construction and the facet generation.
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A Polyhedral Study of Quadratic Traveling Salesman ProblemsFischer, Anja 12 July 2013 (has links) (PDF)
The quadratic traveling salesman problem (QTSP) is an extension of the (classical) Traveling Salesman Problem (TSP) where the costs depend on each two nodes that are traversed in succession, i. e., on the edges in the symmetric (STSP) and on the arcs in the asymmetric case (ATSP). The QTSP is motivated by an application in bioinformatics. It can be used in the solution of certain Permuted Markov models that are set up for the recognition of transcription factor binding sites and of splice sites in gene regulation. Important special cases are the Angular-Metric TSP used in robotics and the TSP with Reload Costs used in the planning of telecommunication and transport networks.
The SQTSP and the AQTSP can be formulated as integer optimization problems over the polytope associated with the STSP resp. ATSP together with a quadratic cost function. We study the polytopes arising from a linearization of the respective quadratic integer programming formulations. Based on the proof of the dimension of the polytopes using the so called direct method we can prove the facetness of several valid inequalities. These facets and valid inequalities can be divided into three large groups. Some are related to the Boolean quadric polytope. Furthermore we introduce the conflicting edges/arc inequalities that forbid certain configurations of edges and 2-edges resp. of arcs and 2-arcs. Finally, we strengthen valid inequalities of STSP and ATSP in order to get stronger inequalities in the quadratic case. We present two general lifting approaches. One is applicable to all inequalities with nonnegative coefficients and the second allows to strengthen clique tree inequalities. Applying these approaches to the subtour elimination constraints leads to facets in most cases, but in general facetness is not preserved. In addition, the complexity of the separation problems for some of the facet classes is studied.
Finally, we present some computational results using a branch-and-cut framework, which is improved by some of the newly derived cutting planes. The tested instances from biology could be solved surprisingly well. Instances with up to 100 nodes could be solved in less than 700 seconds improving the results in the literature by several orders of magnitude. For most of the randomly generated instances using some additional separators allowed to reduce the root gaps and the numbers of nodes in the branch-and-cut tree significantly, often even the running times.
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Geração de Facetas para Politopos de Conjuntos Independentes / Facet-generating Procedures for Stable Set PolytopesXavier, Alinson Santos January 2011 (has links)
XAVIER, Alinson Santos. Geração de Facetas para Politopos de Conjuntos Independentes. 2011. 141 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências, Departamento de Computação, Fortaleza-CE, 2011. / Submitted by guaracy araujo (guaraa3355@gmail.com) on 2016-05-23T19:04:42Z
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Previous issue date: 2011 / A stable set of a graph is a set of pairwise non-adjacent vertices. The maximum stable set problem is to find a stable set of maximum cardinality in a given graph. The maximum induced k-partite subgraph problem is to find k stable sets such that their union has maximum cardinality. Besides having applications in various fields, including computer vision, molecular biology and VLSI circuit design, these problems also model other important combinatorial problems, such as set packing and vertex coloring. In the present work, we study the facial structure of the polytopes associated with both problems. First, we describe a new facet generating procedure for the stable set polytope, which unifies and subsumes several previous procedures. Besides generating many well-known facet inducing inequalities, this procedure can also generate new facet-inducing inequalities which have not been previously described. Then, we study the maximum induced k-partite polytope formulated by asymmetric representatives. We describe its simplest facets, show that some of its facets arise from vertex induced subgraphs, and identify two classes of subgraphs which generate facets of the polytope. To reach these main results, we study the affine equivalence between polyhedra, and also develop a new facet generating procedure for general polyhedra which subsumes the many versions of the lifting of variables. / Um conjunto independente de um grafo é um subconjunto de vértices que não contém nenhum par de vértices vizinhos. O problema do maior conjunto independente consiste em encontrar um conjunto independente de cardinalidade máxima. O problema do maior subgrafo induzido k-partido consiste em encontrar k conjuntos independentes cuja união tenha cardinalidade máxima. Além de possuírem aplicação em diversas áreas, como visão computacional, biologia molecular e projeto de circuitos integrados, estes problemas também modelam outros problemas de otimização combinatória, como empacotamento de conjuntos e coloração de vértices. Neste trabalho, estudamos os politopos associados aos dois problemas. Primeiro, descrevemos um novo procedimento de geração de facetas para o politopo de conjuntos independentes, que unifica e generaliza diversos procedimentos anteriores. Além de gerar várias classes de desigualdades indutoras de facetas já conhecidas, este procedimento também gera novas desigualdades que ainda não foram descritas na literatura. Em seguida, estudamos o politopo do subgrafo induzido k-partido associado à formulação por representantes de cor. Identificamos suas facetas mais simples, mostramos que facetas podem ser geradas a partir de subgrafos induzidos, e descrevemos duas classes de subgrafos que geram facetas deste politopo. Para obter os principais resultados desta dissertação, fazemos um estudo da relação de afim-isomorfismo entre poliedros, e desenvolvemos um novo procedimento de conversão de faces em facetas que generaliza as diversas versões do procedimento de levantamento de variáveis.
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The socio-technical teams formation problem: Complexity, Mathematical Formulations and Computational Results / Problema de FormaÃÃo de Equipes SociotÃcnicas: Complexidade, FormulaÃÃes MatemÃticas e Resultados ComputacionaisTatiane Fernandes Figueiredo 14 August 2014 (has links)
Using concepts of the socio-technical systems theory, this dissertation defines mathematically the problems of cooperative teams formation considering social and technical constraints separately, and then presents their computational complexity. Mainly, it is defined and studied the central problem in this work, which jointly considers social and technical requirements for creating teams of cooperative work, to be called FEST (Socio-Technical Teams Formation Problem).
Two mathematical formulations and a meta-heuristic are proposed for FEST. One formulation uses a cubic number of variables and constraints, whereas the second one has a quadratic number of variables but an exponential number of constraints. The proposed heuristic is based on the Non-monotonic Simulated Annealing meta-heuristic with local search using swap-like operators. The correctness of both formulations is proved. A polynomial algorithm to separate the constraints of the second formulation is presented. It is proved that the two formulations provide the same linear programming bound, and valid inequalities to strengthen it are proposed. For the compact formulation, some classes of valid inequalities are shown to be facet-inducing under suitable hypotheses. Finally, it is statistically analyzed the performance of the presented formulations and meta-heuristic. Real and random generated instances are used in the computational experiments. / Utilizando conceitos da Teoria dos Sistemas SociotÃcnicos, este trabalho define matematicamente os problemas de formaÃÃo de equipes cooperativas considerando separadamente restriÃÃes sociais e tÃcnicas e apresenta a complexidade computacional dos mesmos. Sobretudo, Ã definido e estudado o problema central deste trabalho, que considera conjuntamente requisitos sociais e tÃcnicos para criaÃÃo de equipes de trabalho cooperativo, denominado FEST (Problema de FormaÃÃo de Equipes SociotÃcnicas).
Duas formulaÃÃes matemÃticas e uma meta-heurÃstica para o FEST sÃo propostas. Uma formulaÃÃo utiliza um nÃmero cÃbico de variÃveis e restriÃÃes, enquanto a segunda formulaÃÃo possui um nÃmero quadrÃtico de variÃveis, mas um nÃmero exponencial de restriÃÃes. A meta-heurÃstica proposta à baseada no Simulated Annealing NÃo-MonotÃnico com busca local que usa operadores tipo swap. A corretude de ambas as formulaÃÃes à provada. Um algoritmo polinomial para separar as restriÃÃes da segunda formulaÃÃo à apresentado. Mostra-se que as duas formulaÃÃes fornecem o mesmo limite de programaÃÃo linear, e desigualdades vÃlidas para fortalecÃ-lo sÃo propostas. Para a formulaÃÃo compacta, algumas classes de desigualdades vÃlidas sÃo demonstradas indutoras de facetas sob hipÃteses apropriadas. Por fim, foi analisado estatisticamente o desempenho das formulaÃÃes e da meta-heurÃstica apresentadas. InstÃncias reais e geradas aleatoriamente sÃo usadas nos experimentos computacionais.
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Estudo poliedral do problema do máximo subgrafo induzido comum / Polyhedral study of the maximum common induced subgraph problemPiva, Breno 11 1900 (has links)
O problema do Máximo Subgrafo Induzido Comum (MSIC) pertence a classe NP-difícil e possui aplicações em diversas áreas. Apesar de sua complexidade, ainda é importante conhecer soluções exatas para instâncias deste problema. Os algoritmos exatos encontrados na literatura buscam resolvê-lo através de técnicas de backtracking ou através de sua redução para o problema da Clique Máxima. Neste trabalho procuramos dar uma solução exata para o MSIC, tratando-o diretamente através da utilização de modelos de Programação Linear Inteira (PLI) e técnicas de combinatória poliédrica. Assim, realizamos um estudo teórico do poliedro do MSIC e fomos capazes de encontrar algumas desigualdades válidas fortes, inclusive com provas de que algumas delas representam facetas daquele poliedro. Adicionalmente, provamos que existe uma equivalâencia entre o modelo PLI aqui apresentado para o MSIC e uma formulação bem conhecida para o problema da Clique Máxima. Posteriormente, foram implementados algoritmos de Branch-and-Bound (B&B) e Branch-and-Cut (B&C) utilizando as desigualdades encontradas e algumas técnicas para tentar tornar os algoritmos mais eficientes. Experimentos foram executados com os algoritmos implementados neste trabalho e, também, com um algoritmo já existente para resolver o problema da Clique, chamado Cliquer. Os resultados foram comparados e, dentre os algoritmos de PLI, constatamos que o mais eficiente foi aquele que utilizou uma formulação para o MSIC que chamamos de Clique-IS, utilizando B&B e técnicas mais básicas que outros algoritmos. Este algoritmo mostrou-se mais eficiente, inclusive, que um algoritmo PLI com um modelo baseado no problema da Clique Máaxima. Este fato sugere que para uma abordagem baseada em PLI, vale a pena utilizar uma formulação do MSIC diretamente, ao invés de uma que se apóie na redução deste para o problema da Clique Máxima. Ja a comparaçao do melhor algoritmo desenvolvido neste trabalho com o Cliquer, mostrou que este último é mais eficiente. Para que um algoritmo baseado em PLI (utilizando uma formulação com as mesmas variáveis usadas por nós) tivesse alguma chance de vencer um algoritmo combinatório como o Cliquer, seria necessário conhecer mais desigualdades que estivessem ativas na solução ótima do problema._________________________________________________________________________________________ ABSTRACT: The Maximum Common Subgraph problem (MSIC) is in MV-hard and has applications in several fields. Despite its complexity, it is still important to know exact solutions for instances of this problem. The exact algorithms found in literature try to solve it through backtracking techniques or through its reduction to the Maximum Clique problem. In this work we try to give an exact solution to MSIC by addressing it directly, using Linear Integer Programming (PLI) and polyhedral combinatorics techniques. So, we performed a study of the MSIC polyhedron and we were able to find some strong valid inequalities, including some that were proven to define facets of that polyhedron. Additionally, we proved that an equivalence between the PLI model presented here for MSIC and a well known formulation for the Maximum Clique problem exists. Later, Branch-and-Bound (B&B) and Branch-and-Cut (B&C) algorithms were implemented using the inequalities found and some techniques to try to render the algorithms more efficient. Experiments were performed with the algorithms implemented in this work and, also, with an already existing algorithm to solve the Maximum Clique problem, called Cliquer. The results were compared and, among the PLI algorithms, we found that the most efficient was the one that used the formulation which we called Clique-IS, using B&B and more basic techniques than other algorithms. This algorithm was even more efficient than a PLI algorithm with a Clique-based model. This fact suggests that for a PLI approach it is worth to use a formulation based on the MSIC polyhedron instead of one based on its reduction to the Maximum Clique problem. The comparison of the best algorithm developed in this work with Cliquer, though, showed that the latest is more efficient. In order to some PLI-based algorithm (using a formulation with the same variables used by us) to have any chance of outperforming a combinatorial algorithm like Cliquer, it would be necessary to know more inequalities that are active in the problem's optimal solution.
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Estudo poliedral do problema do maximo subgrafo induzido comum / Polyhedral study of the maximum common induced subgraph problemPiva, Breno, 1983- 15 August 2018 (has links)
Orientador: Cid Carvalho de Souza / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação / Made available in DSpace on 2018-08-15T07:24:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2009 / Resumo: O problema do Máximo Subgrafo Induzido Comum (MSIC) pertence a classe NP-difícil e possui aplicações em diversas áreas. Apesar de sua complexidade, ainda é importante conhecer soluções exatas para instâncias deste problema. Os algoritmos exatos encontrados na literatura buscam resolvê-lo através de técnicas de backtracking ou através de sua redução para o problema da Clique Máxima. Neste trabalho procuramos dar uma solução exata para o MSIC, tratando-o diretamente através da utilização de modelos de Programação Linear Inteira (PLI) e técnicas de combinatória poliédrica. Assim, realizamos um estudo teórico do poliedro do MSIC e fomos capazes de encontrar algumas desigualdades válidas fortes, inclusive com provas de que algumas delas representam facetas daquele poliedro. Adicionalmente, provamos que existe uma equivalâencia entre o modelo PLI aqui apresentado para o MSIC e uma formulação bem conhecida para o problema da Clique Máxima. Posteriormente, foram implementados algoritmos de Branch-and-Bound (B&B) e Branch-and-Cut (B&C) utilizando as desigualdades encontradas e algumas técnicas para tentar tornar os algoritmos mais eficientes. Experimentos foram executados com os algoritmos implementados neste trabalho e, também, com um algoritmo já existente para resolver o problema da Clique, chamado Cliquer. Os resultados foram comparados e, dentre os algoritmos de PLI, constatamos que o mais eficiente foi aquele que utilizou uma formulação para o MSIC que chamamos de Clique-IS, utilizando B&B e técnicas mais básicas que outros algoritmos. Este algoritmo mostrou-se mais eficiente, inclusive, que um algoritmo PLI com um modelo baseado no problema da Clique Máaxima. Este fato sugere que para uma abordagem baseada em PLI, vale a pena utilizar uma formulação do MSIC diretamente, ao invés de uma que se apóie na redução deste para o problema da Clique Máxima. Ja a comparaçao do melhor algoritmo desenvolvido neste trabalho com o Cliquer, mostrou que este último é mais eficiente. Para que um algoritmo baseado em PLI (utilizando uma formulação com as mesmas variáveis usadas por nós) tivesse alguma chance de vencer um algoritmo combinatório como o Cliquer, seria necessário conhecer mais desigualdades que estivessem ativas na solução ótima do problema / Abstract: The Maximum Common Subgraph problem (MSIC) is in MV-hard and has applications in several fields. Despite its complexity, it is still important to know exact solutions for instances of this problem. The exact algorithms found in literature try to solve it through backtracking techniques or through its reduction to the Maximum Clique problem. In this work we try to give an exact solution to MSIC by addressing it directly, using Linear Integer Programming (PLI) and polyhedral combinatorics techniques. So, we performed a study of the MSIC polyhedron and we were able to find some strong valid inequalities, including some that were proven to define facets of that polyhedron. Additionally, we proved that an equivalence between the PLI model presented here for MSIC and a well known formulation for the Maximum Clique problem exists. Later, Branch-and-Bound (B&B) and Branch-and-Cut (B&C) algorithms were implemented using the inequalities found and some techniques to try to render the algorithms more efficient. Experiments were performed with the algorithms implemented in this work and, also, with an already existing algorithm to solve the Maximum Clique problem, called Cliquer. The results were compared and, among the PLI algorithms, we found that the most efficient was the one that used the formulation which we called Clique-IS, using B&B and more basic techniques than other algorithms. This algorithm was even more efficient than a PLI algorithm with a Clique-based model. This fact suggests that for a PLI approach it is worth to use a formulation based on the MSIC polyhedron instead of one based on its reduction to the Maximum Clique problem. The comparison of the best algorithm developed in this work with Cliquer, though, showed that the latest is more efficient. In order to some PLI-based algorithm (using a formulation with the same variables used by us) to have any chance of outperforming a combinatorial algorithm like Cliquer, it would be necessary to know more inequalities that are active in the problem's optimal solution / Mestrado / Otimização Combinatoria / Mestre em Ciência da Computação
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GeraÃÃo de Facetas para Politopos de Conjuntos Independentes / Facet-generating Procedures for Stable Set PolytopesAlinson Santos Xavier 26 September 2011 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento CientÃfico e TecnolÃgico / Um conjunto independente de um grafo à um subconjunto de vÃrtices que nÃo contÃm nenhum par de vÃrtices vizinhos. O problema do maior conjunto independente consiste em encontrar um conjunto independente de cardinalidade mÃxima. O problema do maior subgrafo induzido k-partido consiste em encontrar k conjuntos independentes cuja uniÃo tenha cardinalidade mÃxima. AlÃm de possuÃrem aplicaÃÃo em diversas Ãreas, como visÃo computacional, biologia molecular e projeto de circuitos integrados, estes problemas tambÃm modelam outros problemas de otimizaÃÃo combinatÃria, como empacotamento de conjuntos e coloraÃÃo de vÃrtices. Neste trabalho, estudamos os politopos associados aos dois problemas. Primeiro, descrevemos um novo procedimento de geraÃÃo de facetas para o politopo de conjuntos independentes, que unifica e generaliza diversos procedimentos anteriores. AlÃm de gerar vÃrias classes de desigualdades indutoras de facetas jà conhecidas, este procedimento tambÃm gera novas desigualdades que ainda nÃo foram descritas na literatura. Em seguida, estudamos o politopo do subgrafo induzido k-partido associado à formulaÃÃo por representantes de cor. Identificamos suas facetas mais simples, mostramos que facetas podem ser geradas a partir de subgrafos induzidos, e descrevemos duas classes de subgrafos que geram facetas deste politopo. Para obter os principais resultados desta dissertaÃÃo, fazemos um estudo da relaÃÃo de afim-isomorfismo entre poliedros, e desenvolvemos um novo procedimento de conversÃo de faces em facetas que generaliza as diversas versÃes do procedimento de levantamento de variÃveis. / A stable set of a graph is a set of pairwise non-adjacent vertices. The maximum stable set problem is to find a stable set of maximum cardinality in a given graph. The maximum induced k-partite subgraph problem is to find k stable sets such that their union has maximum cardinality. Besides having applications in various fields, including computer vision, molecular biology and VLSI circuit design, these problems also model other important combinatorial problems, such as set packing and vertex coloring. In the present work, we study the facial structure of the polytopes associated with both problems. First, we describe a new facet generating procedure for the stable set polytope, which unifies and subsumes several previous procedures. Besides generating many well-known facet inducing inequalities, this procedure can also generate new facet-inducing inequalities which have not been previously described. Then, we study the maximum induced k-partite polytope formulated by asymmetric representatives. We describe its simplest facets, show that some of its facets arise from vertex induced subgraphs, and identify two classes of subgraphs which generate facets of the polytope. To reach these main results, we study the affine equivalence between polyhedra, and also develop a new facet generating procedure for general polyhedra which subsumes the many versions of the lifting of variables.
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O problema da subsequência comum máxima sem repetições / The repetition-free longest common subsequence problemTjandraatmadja, Christian 26 July 2010 (has links)
Exploramos o seguinte problema: dadas duas sequências X e Y sobre um alfabeto finito, encontre uma subsequência comum máxima de X e Y sem símbolos repetidos. Estudamos a estrutura deste problema, particularmente do ponto de vista de grafos e de combinatória poliédrica. Desenvolvemos algoritmos de aproximação e heurísticas para este problema. O enfoque deste trabalho está na construção de um algoritmo baseado na técnica branch-and-cut, aproveitando-nos de um algoritmo de separação eficiente e de heurísticas e técnicas para encontrarmos uma solução ótima mais cedo. Também estudamos um problema mais fácil no qual este problema é baseado: dadas duas sequências X e Y sobre um alfabeto finito, encontre uma subsequência comum máxima de X e Y. Exploramos este problema do ponto de vista de combinatória poliédrica e descrevemos vários algoritmos conhecidos para resolvê-lo. / We explore the following problem: given two sequences X and Y over a finite alphabet, find a longest common subsequence of X and Y without repeated symbols. We study the structure of this problem, particularly from the point of view of graphs and polyhedral combinatorics. We develop approximation algorithms and heuristics for this problem. The focus of this work is in the construction of an algorithm based on the branch-and-cut technique, taking advantage of an efficient separation algorithm and of heuristics and techniques to find an optimal solution earlier. We also study an easier problem on which this problem is based: given two sequences X and Y over a finite alphabet, find a longest common subsequence of X and Y. We explore this problem from the point of view of polyhedral combinatorics and describe several known algorithms to solve it.
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