Submitted by Alex Sandro R?go (alex@ifpb.edu.br) on 2016-11-23T17:29:43Z No. of bitstreams: 1 Caracteriza??o de Cobertura de Sinais - Alexandre Ferreira dos Santos.pdf: 2003492 bytes, checksum: 2fb564ef825a2732e63662f5c7c238dc (MD5) / Approved for entry into archive by Alex Sandro R?go (alex@ifpb.edu.br) on 2016-11-23T17:35:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Caracteriza??o de Cobertura de Sinais - Alexandre Ferreira dos Santos.pdf: 2003492 bytes, checksum: 2fb564ef825a2732e63662f5c7c238dc (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-23T17:35:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Caracteriza??o de Cobertura de Sinais - Alexandre Ferreira dos Santos.pdf: 2003492 bytes, checksum: 2fb564ef825a2732e63662f5c7c238dc (MD5) Previous issue date: 2016-11-23 / A demanda por comunica??es pessoais, que estabele?am conex?es nas mais diversas situa??es do dia-a-dia, est? estimulando o desenvolvimento de novas t?cnicas de rede que supram a necessidade dos usu?rios m?veis em rela??o ?s transmiss?es de voz e dados ao se movimentarem atrav?s de pr?dios, cidades ou pa?ses. Isso torna o estudo sobre a caracteriza??o da ?rea de cobertura fundamental. Logo, em ambientes internos com mais de um pavimento e quando n?o h? uma linha de visada entre o transmissor e o receptor a propaga??o depende da reflex?o, difra??o, refra??o e, em menor escala, da dispers?o da onda eletromagn?tica. Este trabalho tem como objetivo caracterizar a cobertura de sinais em ambientes internos com mais de um pavimento na faixa de frequ?ncia de 700 MHz, em virtude da sua destina??o para o uso dos sistemas de comunica??o em banda larga 4G/LTE no Brasil. Para se obter os resultados simulados foi desenvolvida uma planta em 3D reproduzindo os ambientes analisados. Em seguida a planta foi importada pelas ferramentas que comp?em a su?te WinProp? para a realiza??o das simula??es. Durante esta etapa, foi utilizada uma metodologia simplificada de predi??o de cobertura utilizando o m?todo do Tra?ado de Raios, onde foram considerados transmissores virtuais, posicionados no in?cio dos tr?s corredores analisados do pavimento superior, que consideraram como pot?ncias de sa?da as mesmas encontradas naqueles pontos ou locais, a partir da realiza??o da simula??o. Para a etapa experimental do trabalho foi desenvolvida uma base m?vel, em poliestireno expandido, para transportar o receptor ao longo dos ambientes analisados. As campanhas de medi??es foram realizadas, obtendo-se valores m?dios do sinal em intervalos regularmente espa?ados, para garantir uma menor influ?ncia do fen?meno de desvanecimento r?pido e uma maior espacialidade entre elas. Por fim, os resultados simulados, medidos e calculados a partir da f?rmula de Friis apresentaram um comportamento concordante.

Submitted by Alex Sandro R?go (alex@ifpb.edu.br) on 2016-12-06T13:13:30Z No. of bitstreams: 1 15- Maria do Carmo de Luna Malheiros Fraz?o - CARACTERIZA??O DA COBERTURA DE SINAIS NA FAIXA DE 700 MHZ EM AMBIENTES INTERNOS CONSIDERANDO OS EFEITOS DA POLARIZA??O E DO AZIMUTE D.pdf: 3902705 bytes, checksum: 36e170471d2e520bd62d1b40bdd640a9 (MD5) / Approved for entry into archive by Alex Sandro R?go (alex@ifpb.edu.br) on 2016-12-06T13:14:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 15- Maria do Carmo de Luna Malheiros Fraz?o - CARACTERIZA??O DA COBERTURA DE SINAIS NA FAIXA DE 700 MHZ EM AMBIENTES INTERNOS CONSIDERANDO OS EFEITOS DA POLARIZA??O E DO AZIMUTE D.pdf: 3902705 bytes, checksum: 36e170471d2e520bd62d1b40bdd640a9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-06T13:14:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 15- Maria do Carmo de Luna Malheiros Fraz?o - CARACTERIZA??O DA COBERTURA DE SINAIS NA FAIXA DE 700 MHZ EM AMBIENTES INTERNOS CONSIDERANDO OS EFEITOS DA POLARIZA??O E DO AZIMUTE D.pdf: 3902705 bytes, checksum: 36e170471d2e520bd62d1b40bdd640a9 (MD5) Previous issue date: 2016-12-06 / Com o aparecimento dos sistemas de comunica??o pessoal, tornou-se importante a caracteriza??o da propaga??o em ambientes fechados. A atenua??o no espa?o livre, a propaga??o por multipercurso e as intera??es que a onda mant?m com obst?culos s?o fen?menos mais relevantes associados ? propaga??o em ambientes interiores. Entretanto, se o canal indoor for bem caracterizado os efeitos das perdas de propaga??o eletromagn?ticas podem ser minimizadas, atrav?s da varia??o angular da antena do transmissor, a fim de encontrar a posi??o adequada para a localiza??o do transmissor. No contexto de uma rede sem fio, um ambiente interno difere de um ambiente externo em dois aspectos: menor raio de cobertura e maior variabilidade no ambiente. Constata-se, na pr?tica, que a propaga??o dentro de edifica??es ? influenciada por aspectos espec?ficos, tais como sua arquitetura e pelos materiais usados na constru??o. Nas ?ltimas d?cadas foram desenvolvidos e aperfei?oados v?rios modelos de predi??o que consideram as caracter?sticas do ambiente interno. O presente trabalho tem por objetivo estabelecer a caracteriza??o da cobertura de sinais de comunica??o sem fio em ambientes interiores na faixa de frequ?ncia em torno de 700 MHz. Essa banda foi escolhida devido a sua destina??o para ser utilizada pelos sistemas de comunica??o em banda larga 4G/LTE no Brasil. Os resultados simulados foram obtidos utilizando o programa comercial WinProp?, com base no m?todo do Tra?ado de Raios. Durante as simula??es foi proposto um m?todo simplificado de predi??o de cobertura, onde foram considerados transmissores virtuais, posicionados pr?ximos ?s paredes de in?cio de cada corredor transversal (situa??o sem visada entre transmissor e receptor), que consideraram como pot?ncias de sa?das as mesmas pot?ncias aferidas naqueles pontos ou locais, a partir do transmissor real. As campanhas de medi??es para a caracteriza??o experimental da cobertura de sinal foram realizadas, obtendo-se valores m?dios do sinal em intervalos regularmente espa?ados, de modo a se garantir uma menor influ?ncia do fen?meno de desvanecimento r?pido e uma maior espacialidade entre elas. Deste modo, os resultados obtidos mostraram uma boa concord?ncia entre os valores simulados, medidos e te?ricos, calculados a partir da f?rmula de Friis, nas situa??es com visada e sem visada direta.

Submitted by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-06-29T11:48:00Z No. of bitstreams: 1 DIS_LEONARDO_VERONESE_SOLETTI_COMPLETO.pdf: 4509586 bytes, checksum: 932e17294867261485737bead0bba62c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-29T11:48:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DIS_LEONARDO_VERONESE_SOLETTI_COMPLETO.pdf: 4509586 bytes, checksum: 932e17294867261485737bead0bba62c (MD5) Previous issue date: 2016-03-30 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / As a consequence of the post-genomic era an explosion of information and numerous discoveries made available large amounts of biological data. Even with the technology enhancements regarding protein structure prediction techniques, it is still not possible to find a tool to predict with precision the exact the three-dimensional structure of a given protein. This brings new challenges, starting from how to understand and organize these resources until sharing and reuse of successful experiments, as well as how to provide interoperability between data from different sources, without mentioning the diversity between tools and different user profiles. This kind of data flow is regularly addressed as command line scripts which require users to have programming skills. Such scripts have problems interfering, collecting and storing data while executing. Furthermore, these scripts and can be very complex leading to difficulties of implementation, maintenance and reuse. Another problem that arises when a set of tasks are proposed to be conducted through scripts is the possibility of missing any step in the process or running at incorrect order, leading to inconsistent results. It becomes necessary techniques and tools to ease this process in an organized way as a sequence of steps characterized by a workflow, thus automating this process. In this context, we sought to develop a scientific workflow model using bioinformatics tools and biology expertise to automate the process of protein refinement of polypeptides predicted by CReF method once the refinement process scripts were automated, it was possible to increase the amount of experiments while maintaining an acceptable quality criteria. Finally, was developed a web interface that facilitates the visualization of the results in an organized way. / Com o advento da era p?s-gen?mica surge, como consequ?ncia, uma explos?o de informa??es onde in?meras descobertas geram grande quantidade de dados biol?gicos. Mesmo com o avan?o da tecnologia nas t?cnicas de predi??o de estruturas de prote?nas, n?o ? poss?vel ainda se encontrar uma ferramenta capaz de predizer com precis?o exata a estrutura 3D de prote?nas. Em decorr?ncia disso, surgem novos desafios para entender e organizar esses recursos nas pesquisas, o compartilhamento e reuso de experimentos bem-sucedidos, assim como prover interoperabilidade entre dados e ferramentas de diferentes locais e utilizados por usu?rios com perfis distintos. As atividades de estudos do fluxo destes dados, inicialmente, baseiam-se em scripts que auxiliam na entrada, processamento e resultado final da an?lise, normalmente executados por linha de comando, o que obriga seus usu?rios a terem dom?nio de algoritmos e l?gica de programa??o. Tais scripts apresentam problemas em interferir, coletar e armazenar dados ao longo de sua execu??o, e podem ser muito complexos, ocasionando a dificuldades de implementa??o, manuten??o e reuso. Outro problema ? quando um conjunto de tarefas a serem realizadas atrav?s de scripts, podem ter o risco de faltar algum passo no processo ou n?o ser executado na ordem certa, obtendo-se com isso resultados n?o satisfat?rios. Torna-se necess?rio t?cnicas e ferramentas que facilitem esse processo, de maneira organizada como uma sequ?ncia de etapas caracterizados por um fluxo de execu??o, automatizando-se assim este processo. Neste contexto, buscou-se desenvolver um modelo de workflow cient?fico utilizando-se ferramentas de bioinform?tica e de conhecimentos da biologia para automatizar o processo de refinamento de prote?nas, do polipept?dio predito pelo m?todo CReF. Os scripts do processo de refinamento foram automatizados, com isso foi poss?vel aumentar a quantidade de experimentos, mantendo um crit?rio de qualidade aceit?vel. Para o resultado final do processo, desenvolveu-se uma interface web que facilita a visualiza??o dos resultados de uma forma organizada.

Submitted by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-06-29T13:51:27Z No. of bitstreams: 1 DIS_CARLOS_EDUARDO_SEQUEIROS_BORJA_PARCIAL.pdf: 2369724 bytes, checksum: 0bcf4fe536f9f8fc084f08e3dc335db9 (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-06-29T13:51:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DIS_CARLOS_EDUARDO_SEQUEIROS_BORJA_PARCIAL.pdf: 2369724 bytes, checksum: 0bcf4fe536f9f8fc084f08e3dc335db9 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-29T13:51:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DIS_CARLOS_EDUARDO_SEQUEIROS_BORJA_PARCIAL.pdf: 2369724 bytes, checksum: 0bcf4fe536f9f8fc084f08e3dc335db9 (MD5) Previous issue date: 2017-02-23 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / Protein structure prediction from just the amino acid sequence continues to be a major challenge in structural bioinformatics. If at all possible, prediction needs to be accurate and fast. In this project, it is proposed and tested the effects of cotranslation within an ideal ribosomal channel model in protein structure prediction using classical molecular dynamics and replica-exchange molecular dynamics simulations. An ideal ribosomal channel model was built, different translation speeds were used and compared the results to control simulations. Different translation speeds were tested to verify their influence on predictions, and the best results were observed at translation speeds between 80 and 200 ps. The quality of the predicted models were as low as 0.3 ? and 1.0 for the RMSDs and GDT-TS parameters, respectively, for simulations of just 50 ns. Overall, the use of this approach to protein structure prediction has successfully produced native and near-native structures in three of the four proteins investigated, thus reaching accuracy and speed as expected. As a conclusion, using cotranslation within an IRCM is a promising approach to predict native-like 3D structures of mini-proteins successfully. Improvements to the methodology should allow the prediction of 3D structures of larger proteins of biological and biomedical interest. / A predi??o de estrutura 3D de prote?nas partindo apenas da sequ?ncia de amino?cidos ainda ? um grande desafio em bioinform?tica estrutural. Apesar da dificuldade, a predi??o precisa de ser acurada e r?pida. Nesta disserta??o, prop?e-se e mesuram-se os efeitos da co-tradu??o e o uso de um modelo ideal de canal ribossomal na predi??o da estrutura 3D de prote?nas, fazendo uso de din?mica molecular cl?ssica e din?mica molecular com intercambio de r?plicas. O modelo do canal ribosomal constru?do foi testado com diferentes velocidades de tradu??o, e os resultados foram comparados com simula??es padr?o. Foram testadas diferentes velocidades de tradu??o para verificar sua influ?ncia nas predi??es, e as velocidades que apresentaram os melhores resultados ficaram na faixa de 80 at? 200 ps. A qualidade dos modelos preditos foram boas, apresentando valores de GDT-TS de 1,0, assim como 0,3 ? para RMSD para simula??es de apenas 50 ns. No geral, demostra-se que o uso desta abordagem na predi??o da estrutura de prote?nas, produz satisfatoriamente estruturas nativas ou perto da nativa em tr?s de quatro prote?nas testadas, atingindo assim a acur?cia e velocidade esperadas. Como conclus?o, o uso da co-tradu??o com um modelo do canal ribosomal ? uma abordagem promissora para a predi??o de estruturas de mini prote?nas perto da estrutura nativa. Melhoras na metodologia e no modelo permitir?o uma predi??o de estruturas 3D de prote?nas maiores de interesse biol?gico e biom?dico.

Submitted by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-10-20T10:56:20Z No. of bitstreams: 1 DIS_VANESSA_STANGHERLIN_MACHADO_COMPLETO.pdf: 9505213 bytes, checksum: c355721326b3d2f7c04de64104755fac (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-20T10:56:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DIS_VANESSA_STANGHERLIN_MACHADO_COMPLETO.pdf: 9505213 bytes, checksum: c355721326b3d2f7c04de64104755fac (MD5) Previous issue date: 2015-08-26 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / The prediction of protein tertiary structure is a problem of Structural Bioinformatics still unsolved by science. The challenge is to understand the relationship between the amino acid sequence of a protein and a three dimensional structure, which is related to the function of these macromolecules. Among the methods related to protein structure prediction is CREF (Central Residue Fragment-based Method) proposed by Dorn & Norbert Souza (2008) for prediction of proteins? or polypeptide?s approximate 3D structure. In this thesis we present the wCReF, the Web interface for the CREF method developed with a focus on usability. With this tool the users can enter the amino acid sequence of its target protein, and get as a result the approximate 3D structure of a protein in an automated manner without the need to install all the necessary tools for their use. To define the requirements for its development were conducted usability evaluations, guided by experts on both Human-Computer Interaction and bioinformatics domain areas, in three protein structures prediction servers - I-TASSER, QUARK and Robetta - all participants at CASP (Critical Assessment of Protein Structure Prediction) competition. The inspections were conducted through the Heuristic Evaluation method using Nielsens? 10 heuristics. As a result, violations were found in all heuristics resulting in 89 usability problems. They were classified into 5 severities, 29 scored as being of high priority solution and 25 as problems to be solved immediately. Assessment results serve as guiding orientation of the key features that wCReF must have compiled in a document software requirements for its implementation. From this step was carried out prototyping and glimpsing the detection of new usability problems with end users by adapting the Ssemugabi satisfaction questionnaire. As a final product we present the wCReF server, protein structure prediction server rooted in concern about the usability and interaction with its users. Furthermore, this study can contribute to improvement of usability of existing bioinformatics applications, the prediction servers analyzed and the development of new scientific tools. / A predi??o da estrutura terci?ria de prote?nas ? um problema da Bioinform?tica Estrutural ainda n?o solucionado pela ci?ncia. O desafio ? entender a rela??o entre a sequ?ncia de amino?cidos de uma prote?na e sua estrutura tridimensional 3D, que est? relacionada ? fun??o destas macromol?culas. Dentre os m?todos relacionados ? predi??o de estruturas de prote?nas est? o M?todo CReF (Central Residue Fragment-based Method), proposto por Dorn & Norberto de Souza (2008), para predi??o da estrutura 3D aproximada de uma prote?na ou polipept?dio. Nesta disserta??o, apresentamos o wCReF, a interface Web para o m?todo CReF desenvolvida com o enfoque em usabilidade. Com esta ferramenta o usu?rio informa a sequ?ncia de amino?cidos de sua prote?na alvo, e como resultado obt?m a estrutura 3D aproximada de uma prote?na, de forma automatizada, sem a necessidade de instala??o das ferramentas necess?rias para sua utiliza??o. Para definir os requisitos necess?rios para seu desenvolvimento foram realizadas avalia??es de usabilidade, realizadas por especialistas em Intera??o Humano-Computador e da ?rea de dom?nio, a bioinform?tica, em tr?s servidores de predi??o de estruturas de prote?nas - I-TASSER, QUARK e Robetta - todos participantes do CASP (Critical Assessment of protein Structure Prediction). As inspe??es foram realizadas atrav?s do m?todo de Avalia??o Heur?stica, utilizando as 10 heur?sticas de Nielsen. Como resultado, foram encontradas viola??es em todas as heur?sticas e detectados 89 problemas de usabilidade. Eles foram classificados em 5 severidades, 29 pontuados como sendo de alta prioridade de solu??o e 25 problemas de resolu??o imediata. Os resultados das avalia??es serviram como orienta??o norteadora dos principais recursos que o wCReF deveria possuir, compilados em um documento de requisitos de software, para sua implementa??o. A partir desta etapa foi realizada a prototipagem, vislumbrando a detec??o de novos problemas de usabilidade, com os usu?rios finais, atrav?s da adapta??o do question?rio de satisfa??o de Ssemugabi. Como produto final, apresentamos o servidor wCReF alicer?ado na preocupa??o com a usabilidade e intera??o com seus usu?rios. Al?m disso, este estudo pode contribuir para melhoria da usabilidade das aplica??es de bioinform?tica j? existentes, dos servidores de predi??o analisados e no desenvolvimento de novas ferramentas cient?ficas.

Submitted by PPG Ci?ncia da Computa??o (ppgcc@pucrs.br) on 2018-09-03T14:00:58Z No. of bitstreams: 1 RAFAEL CAUDURO OLIVEIRA MACEDO_DIS.pdf: 6178948 bytes, checksum: 6ed3599e31f122e78b11b322a8c0ac06 (MD5) / Approved for entry into archive by Sheila Dias (sheila.dias@pucrs.br) on 2018-09-04T12:17:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 RAFAEL CAUDURO OLIVEIRA MACEDO_DIS.pdf: 6178948 bytes, checksum: 6ed3599e31f122e78b11b322a8c0ac06 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-04T12:47:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RAFAEL CAUDURO OLIVEIRA MACEDO_DIS.pdf: 6178948 bytes, checksum: 6ed3599e31f122e78b11b322a8c0ac06 (MD5) Previous issue date: 2017-08-30 / Prote?nas executam um papel vital em todos os seres vivos, mediando uma s?rie de processos necess?rios para a vida. Apesar de existirem maneiras de determinar a composi??o dessas mol?culas, ainda falta-nos conhecimentos suficiente para determinar de uma maneira r?pida e barata a sua estrutura 3D, que desempenha um papel importante na suas fun??es. Um dos principais m?todos computacionais aplicados ao estudo das prote?nas e o seu processo de enovelamento, o qual determina a sua estrutura, ? Din?mica Molecular. Um aprimoramento deste m?todo, conhecido como Replica Exchange Molecular Dynamics (ou REMD), ? capaz de produzir resultados muito melhores, com o rev?s de significativamente aumentar o seu custo computacional e gerar um volume muito maior de dados. Esta disserta??o apresenta um novo m?todo de otimiza??o deste m?todo, intitulado Filtragem de Dados Anal?ticos, que tem como objetivo otimizar a an?lise p?s-simula??o filtrando as estruturas preditas insatisfat?rias atrav?s do uso de m?tricas de qualidade absolutas. A metodologia proposta tem o potencial de operar em conjunto com outras abordagens de otimiza??o e tamb?m cobrir uma ?rea ainda n?o abordada por elas. Adiante, a ferramenta SnapFi ? apresentada, a qual foi designada especialmente para o prop?sito de filtrar estruturas preditas insatisfat?rias e ainda operar em conjunto com as diferentes abordagens de otimiza??o do m?todo REMD. Um estudo foi ent?o conduzido sobre um conjunto teste de simula??es REMD de predi??o de estruturas de prote?nas afim de elucidar uma s?ries de hip?teses formuladas sobre o impacto das diferentes temperaturas na qualidade final do conjunto de estruturas preditas do processo REMD, a efici?ncia das diferentes m?tricas de qualidade absolutas e uma poss?vel configura??o de filtragem que utiliza essas m?tricas. Foi observado que as temperaturas mais altas do m?todo REMD para predi??o de estruturas de prote?nas podem ser descartadas de forma segura da an?lise posterior ao seu t?rmino e tamb?m que as m?tricas de qualidade absolutas possuem uma alta vari?ncia (em termos de qualidade) entre diferentes simula??es de predi??es de estruturas de prote?nas. Al?m disso, foi observado que diferentes configura??es de filtragem que utilize tais m?tricas carrega consigo esta vari?ncia. / Proteins perform a vital role in all living beings, mediating a series of processes necessary to life. Although we have ways to determine the composition of such molecules, we lack sufficient knowledge regarding the determination of their 3D structure in a cheap and fast manner, which plays an important role in their functions. One of the main computational methods applied to the study of proteins and their folding process, which determine its structure, is Molecular Dynamics. An enhancement of this method, known as Replica-Exchange Molecular Dynamics (or REMD) is capable of producing much better results, at the expense of a significant increase in computational costs and volume of raw data generated. This dissertation presents a novel optimization for this method, titled Analytical Data Filtering, which aims to optimize post-simulation analysis by filtering unsatisfactory predicted structures via the use of different absolute quality metrics. The proposed methodology has the potential of working together with other optimization approaches as well as covering an area still untouched at large by them to the best of the author knowledge. Further on, the SnapFi tool is presented, a tool designed specially for the purpose of filtering unsatisfactory structure predictions and also being able to work with the different optimization approaches of the Replica-Exchange Molecular Dynamics method. A study was then conducted on a test dataset of REMD protein structure prediction simulations aiming to elucidate a series of formulated hypothesis regarding the impact of the different temperatures of the REMD process in the final quality of the predicted structures, the efficiency of the different absolute quality metrics and a possible filtering configuration that take advantage of such metrics. It was observed that high temperatures may be safely discarded from post-simulation analysis of REMD protein structure prediction simulations, that absolute quality metrics posses a high variance of efficiency (regarding quality terms) between different protein structure prediction simulations and that different filtering configurations composed of such quality metrics carry on this inconvenient variance.

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:08:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JulianaPM.pdf: 4255756 bytes, checksum: 0f65b2b3a4f0afafcf55cda7d138bb36 (MD5) Previous issue date: 2009-06-29 / This master dissertation presents the study and implementation of inteligent algorithms to monitor the measurement of sensors involved in natural gas custody transfer processes. To create these algoritmhs Artificial Neural Networks are investigated because they have some particular properties, such as: learning, adaptation, prediction. A neural predictor is developed to reproduce the sensor output dynamic behavior, in such a way that its output is compared to the real sensor output. A recurrent neural network is used for this purpose, because of its ability to deal with dynamic information. The real sensor output and the estimated predictor output work as the basis for the creation of possible sensor fault detection and diagnosis strategies. Two competitive neural network architectures are investigated and their capabilities are used to classify different kinds of faults. The prediction algorithm and the fault detection classification strategies, as well as the obtained results, are presented / Esta disserta??o apresenta o estudo e implementa??o de algoritmos inteligentes para o monitoramento da medi??o de sensores envolvidos em processos de transfer?ncia de cust?dia de g?s natural. Para a cria??o destes algoritmos s?o investigadas arquiteturas de Redes Neurais Artificiais devido a caracter?sticas particulares, tais como: aprendizado, adapta??o e predi??o. Um preditor ? implementado com a finalidade de reproduzir o comportamento din?mico da sa?da de um sensor de interesse, de tal forma que sua sa?da seja comparada ? sa?da real do sensor. Uma rede recorrente ? utilizada para este fim, em virtude de sua capacidade em lidar com informa??o din?mica. A sa?da real do sensor e a sa?da estimada do preditor formam a base para a cria??o das estrat?gias de detec??o e identifica??o de poss?veis falhas. Duas arquiteturas de redes neurais competitivas s?o investigadas e suas potencialidades s?o utilizadas para classificar tipos diferentes de falhas. O algoritmo de predi??o e as estrat?gias de detec??o e classifica??o de falhas, bem como os resultados obtidos, ser?o apresentados

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:08:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AldayrDAJ.pdf: 1169839 bytes, checksum: a47b70e79b9bb61b42503d47bffbccd3 (MD5) Previous issue date: 2010-01-27 / One of the main activities in the petroleum engineering is to estimate the oil production in the existing oil reserves. The calculation of these reserves is crucial to determine the economical feasibility of your explotation. Currently, the petroleum industry is facing problems to analyze production due to the exponentially increasing amount of data provided by the production facilities. Conventional reservoir modeling techniques like numerical reservoir simulation and visualization were well developed and are available. This work proposes intelligent methods, like artificial neural networks, to predict the oil production and compare the results with the ones obtained by the numerical simulation, method quite a lot used in the practice to realization of the oil production prediction behavior. The artificial neural networks will be used due your learning, adaptation and interpolation capabilities / Uma das atividades essenciais na engenharia de petroleo e a estimativa de producao de oleo existente nas reservas petroliferas. O calculo dessas reservas e crucial para a determina??o da viabilidade economica de sua explotacao. Atualmente, a industria do petroleo tem se deparado com problemas para analisar a producao enquanto facilidades operacionais disponibilizam um volume de informacoes que crescem exponencialmente. Tecnicas convencionais de modelagem de reservatorios como simulacao matematica e visualizacao estao bem desenvolvidas e disponiveis. A proposta deste trabalho e o uso de tecnicas inteligentes, como as redes neurais artificiais, para a predicao de producao de petroleo e comparar seus resultados com os obtidos pela simulacao numerica, metodo bastante utilizado na pratica para a realizacao de predicao do comportamento da producao de petroleo. As redes neurais artificiais serao usadas devido a sua capacidade de aprendizado, adaptacao e interpolacao

Submitted by Jos? Henrique Henrique (jose.neves@ufvjm.edu.br) on 2017-12-18T20:32:46Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) eulalia_aparecida_silva.pdf: 2432219 bytes, checksum: e8c925e3e5ce27f2aa2cd5015580bd28 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2018-01-03T17:15:50Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) eulalia_aparecida_silva.pdf: 2432219 bytes, checksum: e8c925e3e5ce27f2aa2cd5015580bd28 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-03T17:15:50Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) eulalia_aparecida_silva.pdf: 2432219 bytes, checksum: e8c925e3e5ce27f2aa2cd5015580bd28 (MD5) Previous issue date: 2017 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / O objetivo do trabalho foi avaliar a efici?ncia da classifica??o da capacidade produtiva de povoamentos florestais de eucalipto (Eucalyptus ssp.) por meio de rede neural artificial (RNA). Os dados utilizados foram provenientes de invent?rios florestais cont?nuos conduzidos em povoamentos de clones de Eucalyptus ssp. localizados no estado de Minas Gerais. A classifica??o da capacidade produtiva foi realizada por meio de quatro m?todos: curva-guia, predi??o dos par?metros, equa??o das diferen?as e rede neural artificial. Em todos os m?todos foi adotada uma idade de refer?ncia de 72 meses e foram obtidas tr?s classes de capacidade produtiva (superior, m?dia e inferior). Para os m?todos da curva-guia e equa??o das diferen?as foi empregado o modelo de Schumacher linearizado e para o m?todo da predi??o dos par?metros foi utilizado o modelo log?stico. Na classifica??o por meio de RNA utilizou-se a rede auto-organiz?vel de Kohonen, sendo o agrupamento realizado em dois est?gios. Na primeira etapa os dados foram utilizados para treinar a rede e na segunda etapa os vetores de pesos sin?pticos foram agrupados utilizando o m?todo do vizinho mais distante. Foram testadas diferentes entradas (E) para as RNA: E1- volume total com casca (V); E2- ?rea basal (B); E3- altura total (Ht); E4- altura dominante (Hd); E5- di?metro quadr?tico m?dio (q); e E6- V, B, Ht, Hd, q e n?mero de ?rvores por hectare. A sele??o da entrada foi realizada por meio da an?lise discriminante, sendo selecionada a entrada E6 com 83,6% de acerto geral. Os m?todos foram comparados em termos de porcentagem de coincid?ncia na aloca??o dos talh?es, ?rea e volume por classe de capacidade produtiva. As classes obtidas pelos m?todos da curva-guia e equa??o das diferen?as foram muito semelhantes de acordo com os crit?rios de compara??o adotados. A classifica??o pelo m?todo da predi??o dos par?metros n?o foi semelhante aos outros m?todos. A classifica??o por meio de rede neural artificial foi eficiente quando comparada aos demais m?todos em termos de porcentagem de coincid?ncia na aloca??o dos talh?es, ?rea e estoque volum?trico por classe de capacidade produtiva. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Ci?ncia Florestal, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2017. / The objective of this work was to evaluate the efficiency of the classification of the productive capacity of eucalyptus forest stands (Eucalyptus ssp.) through artificial neural network (ANN). The data used came from continuous forest inventories conducted in stands of Eucalyptus ssp. located in the state of Minas Gerais. The classification of the productive capacity was accomplished through four methods: guide curve, prediction of the parameters, equation of the differences and artificial neural network. In all methods, a reference age of 72 months was adopted and three productive capacity classes (upper, middle and lower) were obtained. For the methods of the guide curve and equation of the differences was used the linearized Schumacher model and for the method of the prediction of the parameters was used the logistic model. In the classification by ANN was used the self-organizing network Kohonen, which the grouping was performed in two stages. In the first step the data were used to train the network and in the second step the vectors of synaptic weights were grouped using the method of the most distant neighbor. Different entries (E) for RNA were tested: E1- total volume with bark (V); E2- basal area (B); E3- total height (Ht); E4- dominant height (Hd); E5- square mean diameter (q); and E6- V, B, Ht, Hd, q and number of trees per hectare. The selection of the input was performed through the discriminant analysis, and the E6 input was selected with 83.6% of the general hit. The methods were compared in terms of coincidence percentage in the allocation of stands, area and volume by class of productive capacity. The classes obtained by the guide curve methods and equation of the differences were very similar according to the adopted criteria of comparison. Classification by the method of parameter prediction was not similar to the other methods. The classification by artificial neural network was efficient when compared to the other methods in terms of coincidence percentage in the allocation of stands, area and volumetric stock by productive capacity class.

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:13:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FernandoPB.pdf: 4835339 bytes, checksum: 31251ef256da75068c94b80cfee05d1f (MD5) Previous issue date: 2007-12-03 / The relation between metabolic demand and maximal oxygen consumption during exercise have been investigated in different areas of knowledge. In the health field, the determination of maximal oxygen consumption (VO2max) is considered a method to classify the level of physical fitness or the risk of cardiocirculatory diseases. The accuracy to obtain data provides a better evaluation of functional responses and allows a reduction in the error margin at the moment of risk classification, as well as, at the moment of determination of aerobic exercise work load. In Brasil, the use of respirometry associated to ergometric test became an opition in the cardiorespiratory evaluation. This equipment allows predictions concerning the oxyredutase process, making it possible to identify physiological responses to physical effort as the respiratory threshold. This thesis focused in the development of mathematical models developed by multiple regression validated by the stepwise method, aiming to predict the VO2max based on respiratory responses to physical effort. The sample was composed of a ramdom sample of 181 healthy individuals, men and women, that were randomized to two groups: regression group and cross validation group (GV). The voluntiars were submitted to a incremental treadmill test; objetiving to determinate of the second respiratory threshold (LVII) and the Peak VO2max. Using the m?todo forward addition method 11 models of VO2max prediction in trendmill were developded. No significative differences were found between the VO2max meansured and the predicted by models when they were compared using ANOVA One-Way and the Post Hoc test of Turkey. We concluded that the developed mathematical models allow a prediction of the VO2max of healthy young individuals based on the LVII / A rela??o entre a demanda metab?lica e o consumo de oxig?nio durante a pr?tica de exerc?cios f?sicos ? alvo de investiga??o em distintas ?reas do conhecimento. No campo da sa?de, a determina??o do consumo m?ximo de oxig?nio (VO2m?x) ? considerada um m?todo para classificar o n?vel de aptid?o f?sica ou risco de doen?as cardiocirculat?rias. A obten??o de dados de forma acurada possibilita uma melhor avalia??o das respostas funcionais, o que permite reduzir a margem de erros tanto no momento da classifica??o dos riscos, como tamb?m no momento da determina??o das cargas de treinamento aer?bico. No Brasil a utiliza??o da ventilometria conjugado ao teste de ergom?trico passou a ser uma op??o na avalia??o cardiorrespirat?ria. O emprego deste equipamento possibilita inferir sobre o processo de oxidorredutase, permitindo identificar respostas fisiol?gicas ao esfor?o como o limiar ventilat?rio. A presente tese centrou-se no desenvolvimento de modelos matem?ticos desenvolvidos por meio de regress?o m?ltipla com valida??o pelo m?todo stepwise com o objetivo de predi??o do VO2m?x tomando como base, as respostas ventilat?rias ao esfor?o. Para tanto, o estudo contou com uma amostra aleat?ria de 181 indiv?duos saud?veis, de ambos os sexos, que foram randomizados em dois grupos: grupo de regress?o e o grupo de valida??o cruzada (GV). Os volunt?rios foram submetidos a teste cardiopulmonar em esteira rolante em protocolo incremental; onde se visou a determina??o do limiar ventilat?rio II (LVII) e o VO2m?x de pico. Atrav?s da aplica??o do m?todo adi??o forward foram desenvolvidos 11 modelos de predi??o do VO2m?x em esteira rolante. N?o foram encontradas diferen?as significativa entre o VO2m?x mensurado com os preditos pelos modelos quando comparados pelo teste t pareado. Os resultados possibilitam-nos concluir que os modelos matem?ticos desenvolvidos permitem estimar o VO2m?x de indiv?duos jovens e h?gidos, tendo como ponto de refer?ncia o LVII