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Isolation, Purification and Structure Elucidation of New Secondary Metabolites from Terrestrial, Marine, and Ruminal Microorganisms / Isolation, Purification and Structure Elucidation of New Secondary Metabolites from Terrestrial, Marine, and Ruminal MicroorganismsZendah, Imene 13 July 2012 (has links)
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Exoenzyme S of Pseudomonas aeruginosa : cellular targets and interaction with 14-3-3 /Yasmin, Lubna, January 2007 (has links)
Diss. (sammanfattning) Umeå : Univ., 2007. / Härtill 4 uppsatser.
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Mécanismes moléculaires impliqués dans la régulation post-traductionnelle du système de sécrétion du type VI chez Pseudomonas aeruginosa / Molecular mechanisms involved in the post-translational regulation of type VI secretion system in Pseudomonas aeruginosaCasabona, Maria Guillermina 13 May 2013 (has links)
La bactérie à Gram-négatif Pseudomonas aeruginosa est un pathogène humain opportuniste qui peut causer des infections chroniques pouvant conduire à la mort des patients, et plus particulièrement ceux atteints de la mucoviscidose. Il a été montré qu‘un de ses trois systèmes de sécrétion de type VI (SST6) est actif durant les infections chroniques, le SST6-H1. P. aeruginosa est capable d'injecter des toxines de type bactériolytique directement dans le périplasme des autres bactéries à Gram-négatif grâce au SST6-H1, ce qui laisse penser que cette nanomachine pourrait être capitale dans la compétitivité de P. aeruginosa dans les niches polymicrobiennes, comme par exemple un poumon infecté. Cette nanomachine insérée dans l'enveloppe bactérienne est régulée au niveau post-traductionnel par une voie de phosphorylation ressemblant à celles des eucaryotes. Cette voie est constituée par une kinase, PpkA, et une phosphatase, PppA, qui modulent ensemble le niveau de phosphorylation de la protéine Fha1. Nous avons démontré que quatre protéines spécifiques de Pseudomonas appelées TagT, TagS, TagR et TagQ, agissent en amont du couple PpkA/PppA, et sont indispensables pour l'activation du SST6-H1. De plus, elles sont aussi nécessaires lors de compétitions entre P. aeruginosa et d'autres bactéries. Nous avons montré que TagR, connue comme étant une protéine périplasmique, est en fait associée à la membrane externe et cette localisation dépend de TagQ, une lipoprotéine ancrée dans le feuillet interne de la membrane externe. TagT et TagS forment un transporteur de type ABC qui a une activité d'ATPase. L'association de TagR à la membrane externe a été mise en évidence par des études de protéomique à haut débit qui avaient pour but la caractérisation des membranes externe et interne de P. aeruginosa. Grâce à l'analyse des résultats, unmodèle de l'assemblage du SST6-H1 au sein de l'enveloppe a pu être proposé. Ce travail a permis l'identification de plus de 1700 protéines, parmi elles un complexe multi-protéique incluant MagD, une protéine homologue à la macroglobuline humaine. Les résultats obtenus lors de la caractérisation de ce complexe sont aussi présentés dans ce manuscrit. / Pseudomonas aeruginosa is a human opportunistic pathogen that can cause severe infections and death in chronically infected cystic fibrosis (CF) patients. It has been shown that one of its three Type VI Secretion Systems (T6SS), the H1-T6SS, is active during chronic infections in CF patients. P. aeruginosa injects bacteriolytic toxins directly into other Gram-negative bacteria by means of its H1-T6SS, which could be of high importance in its outcome in complex niches such as an infected lung. This trans-envelope nanomachine is posttranslationally regulated by a eukaryotic-like phosphorylation pathway, which includes a kinase-phosphatase pair, PpkA and PppA, respectively. In this work, TagT, TagS, TagR and TagQ, Pseudomonas specific T6SS proteins that are encoded in the same operon as Ppka, PppA and Fha1, were analysed functionally and biochemically. We found that these four proteins are indispensable for the activation of H1-T6SS, by acting upstream of the phosphorylation checkpoint. Moreover, they were also needed for intra- and inter-species fitness mediated by H1-T6SS. We discovered that TagR, a periplasmic protein, associates with the outer membrane (OM) of P. aeruginosa in a TagQ-dependent manner. TagQ is an OM lipoprotein that faces the periplasm. TagT and TagS form a membrane-bound complex, an ABC transporter, with ATPase activity. TagR association with the OM was discovered by shotgun mass spectrometry analyses of the OM and the inner membrane (IM) of P. aeruginosa. In this work, the IM and OM sub-proteomes of P. aeruginosa are also presented, with highlights on T6SS global assembly. Moreover, these two sub-proteomes allowed the identification of a novel envelope-associated complex with macroglobulin-like protein, MagD. The studies concerning this protein and its partners in P. aeruginosa are also presented in this manuscript.
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Influência dos Métodos de Sensibilidade aos Antimicrobianos no Uso Clínico das Polimixinas / Influence of the Antimicrobial Susceptibility Methods in the Clinical Use of PolymyxinsSilva, Itacy Gonçalves de Siqueira e [UNIFESP] 04 May 2010 (has links) (PDF)
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Publico-304.pdf: 908273 bytes, checksum: fde22ebc553f8fa63d900f7873b29d41 (MD5) / Introdução: Acinetobacter spp. e Pseudomonas aeruginosa constituem importantes patógenos causadores de infecções relacionadas à assistência à saúde em hospitais brasileiros e tem se tornado, cada vez mais, resistentes a praticamente todos os antimicrobianos disponíveis. Dessa forma, a indicação clínica do uso parenteral das polimixinas tem sido restabelecida nos últimos anos. Consequentemente, os laboratórios de microbiologia devem estar aptos a realizar testes de sensibilidade que forneçam resultados confiáveis. Objetivo: Avaliar a influência dos métodos de sensibilidade aos antimicrobianos no uso clínico das polimixinas. Material e métodos: Foram testadas nove amostras de P. aeruginosa e 10 de Acinetobacter spp., quanto à sensibilidade à polimixina B e colistina. Foram comparados os resultados obtidos por diluição em ágar, microdiluição em caldo e Etest, realizados conforme recomendações do CLSI. Para cada metodologia foi avaliada a influência do meio de cultura, concentração de cálcio, concentração do inóculo e tempo de incubação, na determinação da CIM. Resultados: Houve uma boa correlação entre as distintas técnicas de sensibilidade às polimixinas para Acinetobacter spp., diferente de P. aeruginosa. Foi observado 100% de concordância entre os resultados obtidos com meio Iso-Sensitest e o meio Mueller-Hinton, por diluição em agar e Etest, para Acinetobacter spp. Já pela metodologia de microdiluição em caldo, essa correlação foi menor: 90% e 60% para polimixina B e colistina, respectivamente. Para P. aeruginosa, a metodologia de Etest foi a que mais sofreu variação nas CIMs, quando utilizados diferentes meios de cultura para realização dos testes de sensibilidade. Em geral, com o meio BHI foram obtidas CIMs mais baixas do que com o meio Müeller-Hinton. O aumento da concentração de cálcio no meio de cultura promoveu a elevação em ±1Log2 nas CIMs de ambas espécies, sendo a metodologia de Etest a que mais sofreu influência dessa variável, sendo que, 55,6% e 88,9% de erros leve foram observados para polimixina B e colistina, respectivamente. Além disso, 11,1% de erro grave foi observado em testes com polimixina B. A metodologia de diluição em ágar sofreu maior influencia do tamanho do inóculo do que microdiluição em caldo, apresentando taxas de erro leve de erros leve de 10% (polimixina B) e 30% (colistina), para Acinetobacter spp.; e 33,3% (polimixina B) e 66,6% (colistina), para P. aeruginosa. Quando realizada leitura com diferentes tempos de incubação, só foi observada diferenças nas CIMs entre os isolados de P. aeruginosa, sendo a metodologia de Etest a que sofreu maior influência dessa variável, onde foram observadas taxas de erro leve de 33,3% (polimixina B) e 44,4% (colistina). Pela metodologia de diluição em ágar ocorreu 11,1% de erro leve. A metodologia de microdiluição em caldo não sofreu influência dessa variável. / Introduction: Acinetobacter spp. e Pseudomonas aeruginosa are important pathogens that cause infections in Brazilian hospitals and have become resistant to almost every available antimicrobial. Thereby, the clinical indication of parenteral use of polymyxin has been reestablished in recent years. Therefore, the clinical laboratory of microbiology need be able to perform reliable susceptibility antimicrobial tests. Objective: Analyze the influence of susceptibility antimicrobial tests in the clinical use of polymyxins. Material and Methods: Nine P. aeruginosa and 10 Acinetobacter spp. strains were tested to polymyxin susceptibility. The results of agar dilution, broth microdilution and Etest were compared, according CSLI. The influence of culture medium, calcium concentration, inoculum concentration and incubation time in the susceptibility antimicrobial test was evaluated. Results: There was good agreement between different polymyxin antimicrobial susceptibility methods for Acinetobacter spp isolates, but not for P. aeruginosa. It was observed 100% of agreement between Iso-sensitest and Müeller-Hinton medium through agar dilution and Etest for Acinetobacter spp. isolates. Through broth microdilution occurred 90% of agreement for polymyxin B and 60% for colistin. Between P. aeruginosa isolates, Etest had greater MIC variation when using different culture mediuns. In general, BHI medium had low MICs comparing with Müller- Hinton. The calcium concentration increase in the culture medium promoted MICs elevation in ±1Log2 of dilution, for both microrganisms. Etest had 55,6% (polymyxin B) and 88,9% (colistin) of minor error, and 11,1% of major error in polymyxin B. Inoculum size had greater influence in agar dilution, with minor error rates of 10% (polymyxin B) and 30% (colistin) for Acinetobacter spp. isolates, and 33,3% (polymyxin B) and 66,6% (colistin) for P. aeruginosa isolates. Different time incubations caused MICs variation only between P. aeruginosa isolates. Etest method had 33,3% (polymyxin B) and 44,4%(colistin) of minor error. Through agar dilution, the minor error rate was 11,1% with incubation time variation. / TEDE / BV UNIFESP: Teses e dissertações
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Tomografia computadorizada do tórax em pacientes com fibrose cística: comparação de escore tomográfico em pacientes colonizados por Pseudomonas aeruginosa e por Staphylococcus aureus / Computed tomography in cystic fibrosis: tomography score in CF patients colonyzed with Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureusTania Wrobel Folescu 21 June 2010 (has links)
Na Fibrose Cística (FC) a infecção pulmonar crônica leva a lesão estrutural e disfunção pulmonar progressiva que precedem a insuficiência respiratória, maior causa de morbidade e mortalidade pela doença. As infecções bacterianas estão associadas a microrganismos específicos. Em geral, Staphylococcus aureus e Haemophilus influenzae estão associados a infecções respiratórias em pacientes mais jovens. Posteriormente a infecção por Pseudomonas aeruginosa marca a aceleração no declínio da função pulmonar e progressão das lesões estruturais pulmonares. A avaliação do comprometimento respiratório inclui culturas de secreção respiratória, provas de função respiratória e imagens de tórax. A tomografia computadorizada de tórax de alta resolução (TCAR) é capaz de avaliar precocemente o comprometimento estrutural de vias aéreas e parênquima pulmonar e tais alterações podem ser sistematicamente mensuradas através de diferentes escores de pontuação. O estudo tem como objetivo comparar a pontuação do escore de Bhalla modificado e as alterações pulmonares detectadas através da tomografia computadorizada de tórax de alta resolução em dois grupos de pacientes com FC vinculados ao Centro de Referência para FC do Instituto Fernandes Figueira, apresentando características microbiológicas distintas: colonizados cronicamente por Staphylococcus aeruginosa (n=26) e por Staphylococcus aureus (n=15). As imagens de tomografia computadorizada de tórax de alta resolução foram individualmente analisadas e pontuadas através do escore de Bhalla modificado, por dois radiologistas em dois momentos distintos. Houve boa concordância global tanto intraobservador (coeficiente de correlação intraclasse > 0.8) quanto interobservador (coeficiente de correlação intraclasse > 0.8) e essa avaliação demonstrou que as medidas são confiáveis e reprodutíveis. As pontuações obtidas através do escore adotado, bem como as alterações de imagem e a freqüência das mesmas, foram avaliadas e comparadas em cada grupo de pacientes. As médias dos escores totais do grupo cronicamente colonizado por Pseudomonas aeruginosa evidenciaram maior gravidade das lesões (observador 1: escore 13.5 e observador 2: escore 11.96) do que o grupo colonizado por Staphylococcus aureus (observador 1: escore 5.0 e observador 2: escore 5.07). A detecção precoce de lesões estruturais relacionadas à infecção e sua análise através de sistema de pontuação podem contribuir efetivamente para o ajuste de estratégias terapêuticas que venham alterar o prognóstico de pacientes portadores de FC. / In Cystic Fibrosis (CF) chronic lung infection leads to irreversible structural abnormalities, progressive lung disease and respiratory failure, most common cause of death in CF. Bacterial infection in CF is usually related to specific agents: Staphylococcus aureus e Haemophilus influenzae usually infect younger patients. After this, Pseudomonas aeruginosa infection is associated with lung function deterioration and progression of structural lung disease. Assessment of CF lung disease includes monitoring of respiratory secretions microbiology, lung function and thoracic imaging. High resolution computed tomography of the lung (HRCT) is involved on early detection of structural airway and parenchymal abnormalities. These structural abnormalities can be assigned systematically through different scoring systems. The aim of this study was to compare the results of the modified Bhalla score for High resolution computed tomography of the lung from two groups of CF patients attending the CF Reference Center at Instituto Fernandes Figueira, Rio de Janeiro, Brazil. These two groups had different microbiological features: chronically infected by Pseudomonas aeruginosa (n = 26) and infected by Staphylococcus aureus (n = 15). High resolution computed tomography of the lung images were randomly and blindly scored using a modified Bhalla scoring system by two independent radiologists in two different moments. There was good intraobserver and interobserver variability and this observation indicates that the measurements are reliable and reproducible. Score results and abnormalities found in each group were compared. Final scores of Pseudomonas aeruginosa group showed more severe disease (radiologist 1: 13.5 and radiologist 2: 11.96) then the Staphylococcus aureus group (radiologist 1: 5.0 and radiologist 2: 5.07). Early detection of structural abnormalities associated to infection and its assessment through scoring systems may contribute to therapeutical approaches that can improve prognosis for CF patients.
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Etude de la régulation du système de sécrétion de type 3 et du système de sécrétion de type 6 chez Pseudomonas aeruginosa : Approches de chémogénomique, mutagénèse aléatoire et étude d'isolat clinique / Study of the regulation of the Type III and Type VI Secretion Systems in Pseudomonas aeruginosa : Chemogenomic approaches, random mutagenesis and study of clinical isolate.Sall, Khady 28 November 2013 (has links)
Pseudomonas aeruginosa est un bacille gram négatif, ubiquiste de l'environnement. Ce pathogène opportuniste humain provoque sous sa forme planctonique des infections aiguës dont le facteur de virulence clé est le SST3. P. aeruginosa peut aussi se développer sous forme de biofilm où elle exprime entre autre le SST6-1 et induire des infections chroniques. L'expression ciblée des différents facteurs de virulence est liée à l'intégration de nombreux stimuli environnementaux transduits au moyen de systèmes à deux composants ou encore de messagers secondaires, comme le di-GMPc et l'AMPc, et conduisant à une régulation très fine, conférant une grande capacité d'adaptation à la bactérie. La nature, de même que les mécanismes impliqués dans la transduction du signal, n'ont pas encore été tous identifiés à ce jour. Le but de cette thèse était de décrypter ces mécanismes moléculaires de détection et de transduction du signal gouvernant la réponse adaptative de ce pathogène à son environnement au moyen de différentes approches : chémogénomique, mutagénèse aléatoire et d'étude d'isolat clinique. Lors de cette thèse, nous avons criblé deux chimiothèques commerciales à la recherche de molécules activatrices du SST3 et du SST6-1 et nous avons pu établir un test de criblage à haut débit robuste pour les criblages de plus larges banques de composés. En utilisant une souche avec deux rapporteurs, nous avons réalisé une banque de mutants par transposons et nous avons trouvé des mutants affectés dans leur expression du SST3, candidats intéressants pour identifier de nouveaux régulateurs du système. Enfin, grâce à l'analyse de l'isolat clinique CHA (issu d'un patient atteint de mucoviscidose), nous avons découvert qu'une délétion dans le gène codant pour le régulateur majeur GacS définissait le phénotype agressif de cette souche. / Pseudomonas aeruginosa is a gram negative bacillum present in several places. This opportunistic pathogen has the capacity to infect a wide range of hosts: plants, animals, humans. This bacterium, that shows an impressive adaptability relying on a multifactorial virulence, possesses two lifestyles. These lifestyles are associated with specific virulence patterns of expression. Under its planktonic form, P. aeruginosa can provoke acute infections thanks to the activation of T2 and T3SS or induces chronic infections in cystic fibrosis patients' lungs where it establishes a biofilm (communautary life). The expression of virulence factors is linked to the integration of several environmental cues that are transduced through two-component systems and secondary messengers like c-di-GMP and that lead to a fine tuned regulation. The nature and the mechanisms involved in this signal transduction remain largely unknown. The goal of this thesis was to decipher molecular mechanisms of signal detection and transduction that govern the adaptive pathogen response to host environment using the combination of a chemogenomics, random mutagenesis and study of clinical isolate. During this work, we screened two commercial libraries and set up a robust high throughput screening test to analyse huge molecules libraries. By setting up a double reporter-gene strain, we realized a transposon mutagenesis bank and identified interesting candidates with a down-regulated T3SS. Finally, the study of the particular clinical isolate CHA (from a cystic fibrosis patient), leads to the discovery that a deletion in the gene encoding for the important regulator GacS shapes the aggressive phenotype of this strain.
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Etude de deux protéines impliquées dans l'injection de toxines par la bactérie Pseudomonas aeruginosa / Study of two proteins involved in toxin injection by the bacterium Pseudomonas aeruginosaPerdu, Caroline 04 June 2013 (has links)
Pseudomonas aeruginosa, une bactérie à Gram négatif responsable d'infections nosocomiales, possède de nombreux facteurs de virulence lui permettant d'infecter ses hôtes. En particulier, le Système de Sécrétion de Type III (SST3) lui permet d'injecter des effecteurs directement dans le cytoplasme de la cellule cible eucaryote. Durant cette thèse, deux protéines du SST3 de P. aeruginosa ont été étudiées : l'ATPase PscN et la protéine ExsB. Plusieurs approches ont été utilisées afin d'étudier l'ATPase PscN, indispensable à l'activité du SST3. Des mutations ponctuelles réalisées dans PscN conduisent à des souches de P. aeruginosa non cytotoxiques, et cet effet est dominant négatif. Une autre approche a permis l'obtention de fractions partiellement purifiées de l'ATPase PscN active, sous forme de grands complexes visualisés en microscopie électronique. Ces fractions contiennent également d'autres protéines du SST3, qui pourraient être des partenaires de PscN. La protéine ExsB a été caractérisée pour la première fois. Après avoir vérifié son expression chez P. aeruginosa, son association à la membrane externe de la bactérie a été démontrée. Son rôle a ensuite été étudié par une analyse du phénotype d'une souche de P. aeruginosa dépourvue du gène exsB. Nous n'avons pas identifié d'activité de ExsB dans la régulation du SST3. Après avoir constaté l'implication de ExsB dans la virulence de la bactérie dans des modèles d'infections aiguës chez les animaux, son rôle dans l'activité du SST3 a été établi. Nous avons enfin pu montrer que ExsB a une activité de pilotine, car elle participe à l'assemblage de la sécrétine, le composant de la membrane externe du SST3. / Pseudomonas aeruginosa, a Gram negative bacterium responsible for nosocomial infections, exhibits numerous virulence factors to infect its hosts. In particular, the Type III Secretion System (T3SS) allows the injection of effectors directly into the host cell cytoplasm. This work focuses on the study of two proteins from the T3SS of P. aeruginosa: the ATPase PscN and the ExsB protein. Several approaches were used to study the ATPase PscN, an enzyme essential for T3SS activity. Site-directed mutations, made on PscN, lead to non cytotoxic strains, and this effect is dominant negative. Another approach allowed the partial purification of active PscN, visualized as large complexes by electron microscopy. These partially purified samples also contain other T3SS proteins, which could interact with PscN. The ExsB protein was characterized for the first time. After checking its expression in P. aeruginosa, its association with the outer membrane was shown. The phenotypic analysis of a strain lacking exsB gene gave insights into the role of this protein. We did not identified any function of ExsB in the T3SS regulation. After showing the involvement of ExsB in the bacterial virulence during acute animal infections, ExsB role in T3SS activity was established. Finally, we showed that ExsB has a pilotin activity as it participates in the assembly of the secretin, the outer membrane component of T3SS.
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Otimização da produção e propriedades tensoativas de biossurfactantes em meios à base de melaço e manipueira / Optimization of production and tensoactives properties of biosurfactants in means based molasses and manipueiraRossmann, Maike 30 July 2008 (has links)
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Previous issue date: 2008-07-30 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The production of biossurfactants on an industrial scale is usually limited by the high cost of the media components for the microorganisms cultivation. The use of agroindustrial substrates as the basic culture mean for the production of these compounds has been suggested as an alternative to making the process. The objective was to study the production and the tensoatives properties of biossurfactants in culture medias based on manipueira and molasses by bacterial isolates previously identified as biossurfactants producer. The low values of surface tension and the high values of Critical Micellar Dilution (CMD) showed that three isolates, Pseudomonas aeruginosa LBBMA 88A, Bacillus subtilis LBBMA 155 and B. subtilis subsp. spizizenii LBBMA 283, stood out as the best among the ten selected for the study. The culture medias for each of the selected bacterial isolates and mixed cultures containing these same isolates was optimized using the Response Surface Methodology (RSM) through the Central Composite Rotational Design (CCRD). P. aeruginosa LBBMA 88A and the mixed culture composed by the three selected isolates were potentially the greater interest to the production of biossurfactant, since they were the only which the biossurfactants production was influenced only by the concentration of molasses and the only who reached values of DMC at least 10 times. The surfactant produced by P .aeruginosa LBBMA 88A formed emulsions considered stable with kerosene. Temperatures over 70°C and pH values of 4.0 reduced the viscosity of culture media destabilizing the emulsions formed between aqueous solutions of biossurfactants and kerosene. NaCl concentrations above 10 g L-1 altered the tensoative activity because of estabilization of the present.surfactant micelles. The media based on molasses and manipueira achieved satisfactory results for the production of surfactant by the tested isolates with desirable characteristics for environmental applications, particularly the stability in wide ranges of salinity, temperature and pH. / A produção de biossurfactantes em escala industrial é usualmente limitada pelo alto custo dos componentes do meio para o cultivo dos microrganismos. A utilização de substratos agroindustriais como meio de cultura básico para a produção desses compostos tem sido sugerida como alternativa para viabilizar o processo. O objetivo deste trabalho foi o de estudar a produção e as propriedades tensoativas de biossurfactantes em meios de cultura à base de manipueira e melaço por isolados de bactérias previamente identificadas como produtoras de biossurfactantes. Os baixos valores de tensão superficial e os altos valores de Diluição Micelar Crítica (DMC) demonstraram que três isolados, Pseudomonas aeruginosa LBBMA 88A, Bacillus subtilis LBBMA 155 e B. subtilis subsp. spizizenii LBBMA 283, destacaram-se como os melhores entre os dez selecionados para o estudo. Os meios de cultura para cada um dos isolados bacterianos selecionados e para culturas mistas contendo esses mesmos isolados foi otimizado usando-se a Metodologia de Superfície de Resposta (MSR) por meio do Delineamento Composto Central Rotacional (DCCR). P. aeruginosa LBBMA 88A e a cultura mista composta pelos três isolados selecionados foram potencialmente os de maior interesse para a produção de biossurfactante, uma vez que foram os únicos cuja produção de biossurfactantes foi influenciada apenas pela concentração de melaço e que alcançaram valores de DMC de pelo menos 10 vezes. O surfactante produzido por P.aeruginosa LBBMA 88A formou emulsões consideradas estáveis com querosene. Temperaturas acima de 70°C e valores de pH 4,0 reduziram a viscosidade do meio de cultura desestabilizando as emulsões formadas entre soluções aquosas dos biossurfactantes e o querosene. Concentrações de NaCl acima de 10 g L-1 alteraram a atividade tensoativa em razão da desestabilização das micelas presentes. O meio a base de melaço e manipueira alcançou resultados satisfatórios para a produção de surfactante pelos isolados testados com características desejáveis a aplicações ambientais, em especial a estabilidade em amplas faixas de salinidade, temperatura e pH.
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Tomografia computadorizada do tórax em pacientes com fibrose cística: comparação de escore tomográfico em pacientes colonizados por Pseudomonas aeruginosa e por Staphylococcus aureus / Computed tomography in cystic fibrosis: tomography score in CF patients colonyzed with Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureusTania Wrobel Folescu 21 June 2010 (has links)
Na Fibrose Cística (FC) a infecção pulmonar crônica leva a lesão estrutural e disfunção pulmonar progressiva que precedem a insuficiência respiratória, maior causa de morbidade e mortalidade pela doença. As infecções bacterianas estão associadas a microrganismos específicos. Em geral, Staphylococcus aureus e Haemophilus influenzae estão associados a infecções respiratórias em pacientes mais jovens. Posteriormente a infecção por Pseudomonas aeruginosa marca a aceleração no declínio da função pulmonar e progressão das lesões estruturais pulmonares. A avaliação do comprometimento respiratório inclui culturas de secreção respiratória, provas de função respiratória e imagens de tórax. A tomografia computadorizada de tórax de alta resolução (TCAR) é capaz de avaliar precocemente o comprometimento estrutural de vias aéreas e parênquima pulmonar e tais alterações podem ser sistematicamente mensuradas através de diferentes escores de pontuação. O estudo tem como objetivo comparar a pontuação do escore de Bhalla modificado e as alterações pulmonares detectadas através da tomografia computadorizada de tórax de alta resolução em dois grupos de pacientes com FC vinculados ao Centro de Referência para FC do Instituto Fernandes Figueira, apresentando características microbiológicas distintas: colonizados cronicamente por Staphylococcus aeruginosa (n=26) e por Staphylococcus aureus (n=15). As imagens de tomografia computadorizada de tórax de alta resolução foram individualmente analisadas e pontuadas através do escore de Bhalla modificado, por dois radiologistas em dois momentos distintos. Houve boa concordância global tanto intraobservador (coeficiente de correlação intraclasse > 0.8) quanto interobservador (coeficiente de correlação intraclasse > 0.8) e essa avaliação demonstrou que as medidas são confiáveis e reprodutíveis. As pontuações obtidas através do escore adotado, bem como as alterações de imagem e a freqüência das mesmas, foram avaliadas e comparadas em cada grupo de pacientes. As médias dos escores totais do grupo cronicamente colonizado por Pseudomonas aeruginosa evidenciaram maior gravidade das lesões (observador 1: escore 13.5 e observador 2: escore 11.96) do que o grupo colonizado por Staphylococcus aureus (observador 1: escore 5.0 e observador 2: escore 5.07). A detecção precoce de lesões estruturais relacionadas à infecção e sua análise através de sistema de pontuação podem contribuir efetivamente para o ajuste de estratégias terapêuticas que venham alterar o prognóstico de pacientes portadores de FC. / In Cystic Fibrosis (CF) chronic lung infection leads to irreversible structural abnormalities, progressive lung disease and respiratory failure, most common cause of death in CF. Bacterial infection in CF is usually related to specific agents: Staphylococcus aureus e Haemophilus influenzae usually infect younger patients. After this, Pseudomonas aeruginosa infection is associated with lung function deterioration and progression of structural lung disease. Assessment of CF lung disease includes monitoring of respiratory secretions microbiology, lung function and thoracic imaging. High resolution computed tomography of the lung (HRCT) is involved on early detection of structural airway and parenchymal abnormalities. These structural abnormalities can be assigned systematically through different scoring systems. The aim of this study was to compare the results of the modified Bhalla score for High resolution computed tomography of the lung from two groups of CF patients attending the CF Reference Center at Instituto Fernandes Figueira, Rio de Janeiro, Brazil. These two groups had different microbiological features: chronically infected by Pseudomonas aeruginosa (n = 26) and infected by Staphylococcus aureus (n = 15). High resolution computed tomography of the lung images were randomly and blindly scored using a modified Bhalla scoring system by two independent radiologists in two different moments. There was good intraobserver and interobserver variability and this observation indicates that the measurements are reliable and reproducible. Score results and abnormalities found in each group were compared. Final scores of Pseudomonas aeruginosa group showed more severe disease (radiologist 1: 13.5 and radiologist 2: 11.96) then the Staphylococcus aureus group (radiologist 1: 5.0 and radiologist 2: 5.07). Early detection of structural abnormalities associated to infection and its assessment through scoring systems may contribute to therapeutical approaches that can improve prognosis for CF patients.
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Avaliação da eficácia de medidas preventivas no controle de Acinetobacter spp. e Pseudomonas aeruginosa resistente a carbapenêmicos em unidade de terapia intensiva / Evaluation of the efficacy of interventions on the colonization by Acinetobacter spp. and carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa in an intensive care unitMírian de Freitas Dal Ben Corradi 29 July 2010 (has links)
INTRODUÇÃO: Infecções hospitalares por agentes multirresistentes (MR) acarretam custos significativos, elevada morbidade e mortalidade. A transmissão cruzada de MR é dependente da existência de pacientes e ambientes colonizados, as fontes, e da existência da via de transmissão, representada principalmente pelas mãos dos profissionais de saúde. As altas taxas de infecção hospitalar na unidade de terapia intensiva da neurologia do Hospital das Clínicas da Universidade de São Paulo e o aumento na frequência de isolamento de Acinetobacter spp. e Pseudomonas aeruginosa resistente a carbapenêmicos despertaram o interesse no estudo da colonização por estes agentes dos pacientes admitidos na unidade e o efeito de medidas de intervenção educativas na prevenção da colonização. MÉTODOS: O trabalho consistiu em um estudo quasi-experimental com três períodos (pré-intervenção educativa - PI, pós-educação-PE e pós-álcool gel - PA) nos quais eram colhidos swabs orais, axilares e retais de todos os pacientes à admissão, após três dias da admissão e semanais. Para a análise da coorte, foram excluídos os pacientes que já apresentavam colonização por PMR e AC à admissão e aqueles pacientes que, por permaneceram internados na UTIN por período inferior a três dias, tiveram culturas colhidas apenas à admissão. Entre o PI e o PE, foi realizada uma intervenção educativa que consistiu no treinamento dos profissionais de saúde visando higienização das mãos e isolamento de contato. Entre o PE e o PA, foi realizada a segunda intervenção que consistiu na disponibilização de álcool-gel para higienização das mãos na unidade. A adesão à higienização das mãos antes e após o contato com os pacientes e a adesão ao uso correto de luvas foram avaliadas antes e após cada intervenção. Calculou-se a pressão de colonização em cada período e a colonização à admissão. RESULTADOS: 1) Não houve diferenças entre os períodos em relação a idade, sexo, APACHE II, dias de internação prévios. 2) A intervenção educativa melhorou a adesão à higienização das mãos antes e após o contato com os pacientes e ao uso correto de luvas. No PA, apesar da disponibilização de álcool-gel, a adesão à higienização das mãos e ao uso correto de luvas decresceu a valores similares ao PI. 3) A probabilidade de se tornar colonizado ao longo do tempo por PMR e AC aumentou progressivamente do PI para o PE e para o PA. A densidade de incidência de colonização por PMR e AC por 1000 pacientes-dia foi de 24,8 no PI, 43,3 no PE e 67,5 no PA. 4) A pressão de colonização por PMR e AC foi diferente entre os três períodos, com média de 14,7 no PI, 38,2 no PE e 53,3 no PA. Este aumento deveu-se, principalmente, à admissão de pacientes já colonizados provenientes do Pronto Socorro. CONCLUSÃO: Para o controle da transmissão cruzada de AC e PMR são importantes intervenções educativas que visem o aumento na adesão à higienização das mãos. Entretanto, provavelmente é necessário o monitoramento da pressão de colonização e o planejamento de ações visando atuação mais abrangente, locadas nas unidades que representam fontes externas de indivíduos colonizados / Nosocomial infections by resistant pathogens are a major public health concern due to their related costs, morbidity and mortality. The cross transmission of resistant pathogens are dependent on the existence of a source, colonized patients or environment, and on carriage by the healthcare workerss hands. The increasing incidence of infections and colonization by Acinetobacter spp. (AC) and carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa (CRPA) in the Neurology intensive care unit (NICU) at Hospital das Clínicas of Universidade de São Paulo led to the study of the colonization by these pathogens and the efficacy of interventions on prevention. METHODS: This was a quasi-experimental study with three periods (pre-interventional- PI, post-educational PE and post-alcool hand rub implementation PA). In each period, patients had surveillance cultures (oropharyngeal, axillary and rectal) collected on admission, 3rd day and weekly. Patients who were colonized by CRPA or AC on admission in the NICU and patients who had just one set of cultures collected were excluded from the study. Between PI and PE, an educational intervention focused on hand hygiene and contact precautions was conducted. By the end of PE, an intervention based on the installation of alcohol hand rub dispensers was applied. Hand hygiene and glove use compliance were evaluated before and after each intervention. Colonization pressure was calculated in each period as well as colonization on admission to the ICU. RESULTS: 1) There were no differences in patients age, sex, APACHE II score and number of days in the hospital previous to NICU admission between the periods 2) The educational intervention increased hand hygiene and glove use compliance. In the PA, beside alcohol hand rub dispensers, hand hygiene and glove use compliance decreased. 3) The probability of becoming colonized by CRPA and AC during NICU stay increased over the periods. The incidence density of colonization by CPRA and AC by 1000 patient-days was 24,8 in PI, 43,3 in PE and 67,5 in PA. 4) Colonization pressure by CPRA and AC was different between periods: 14,7 in PI, 38,2 in PE and 53,3 in PA. The increase in the colonization pressure was due to the admission of patients already colonized, mainly from the Emergency room. CONCLUSIONS: Control of cross transmission of AC and CPRA requires efforts to increase hand hygiene compliance, monitoring of colonization pressure and interventions aimed at units that are sources of colonized patients
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