Os conceitos e métodos provindos das teorias de integração morfológica e de genética quantitativa formam o arcabouço teórico para o estudo da evolução de estruturas complexas, compostas de múltiplos caracteres que interagem entre si. Nesse trabalho, utilizamos o crânio como modelo de estrutura complexa e estudamos sua diversificação nas espécies de sapo do grupo Rhinella granulosa. As perguntas do trabalho foram: (1) A organização da (co)variação é similar entre as espécies?; (2) A organização da (co)variação é modular nas espécies, conforme expectativas baseadas em desenvolvimento ou função?; (3) Fatores externos, como filogenia e clima, estruturam a similaridade no padrão de covariação entre as espécies?; (4) A diversificação da morfologia média do crânio se deu por deriva ou seleção natural?; (5) A divergência na morfologia média do crânio está associada à variação climática entre as espécies?; e finalmente (6) Restrições evolutivas atuaram na divergência entre as espécies? Os espécimes foram escaneados e validamos o uso de imagens 3D para a mensuração de 21 distâncias lineares. Os crânios das espécies foram representados como matrizes fenotípicas (P) de covariância e de correlação entre as distâncias. A similaridade entre as P das espécies é alta. As P de todas as espécies se conformam a um padrão modular compatível com interações funcionais entre ossos. As diferenças entre as P concentram-se no rostro e são associadas a diferenças no clima entre as espécies. Detectamos sinal de seleção natural nos nós mais basais da filogenia e variação local no crânio está associada à variação na sazonalidade da chuva entre as espécies. Restrições evolutivas atuaram na diversificação do crânio das espécies, defletindo as respostas evolutivas para tamanho. Concluímos que tanto seleção estabilizadora e direcional, conectadas à variação climática, quanto restrições evolutivas atuaram na diversificação do crânio das espécies / Concepts and methods within the theories of morphological integration and quantitative genetics characterize the foundation to study the evolution of complex structures, composed of several traits that interact with each other. In this work, we used the skull as a model of complex structure and we studied its diversification in toad species belonging to the Rhinella granulosa group. The questions addressed were: (1) Is the (co)variance structure similar across species?; (2) Is the (co)variance structure modular in the species, and compatible with developmental or functional interactions among traits?; (3) Do external factors, such as phylogeny and climate, structure the similarity in covariance pattern across species?; (4) Was the diversification of skull mean morphology driven by drift or natural selection?; (5) Is skull divergence associated to climatic variation across species?; and finally, (6) Is there a role for evolutionary constraints in species skull divergence? We scanned all specimens and we validated the use of 3D images to measure 21 linear distances. The skull was represented as covariance and correlation phenotypic matrices (P) among distances. P similarity is very high among species. All species\' P had a modular pattern compatible with functional interactions among bones. Differences in P were concentrated in the snout and associated to differences in climate across species. We detected a selection signal in the three most basal nodes of the phylogeny and local variation in the skull is explained by between-species variation in precipitation seasonality. Evolutionary constraints played a major role in species skull diversification, biasing evolutionary responses towards the direction of size. We conclude that stabilizing and directional selection, connected to climatic variation, as well as evolutionary constraints, acted in species skull diversification

Na última década diferentes modalidades e técnicas quantitativas de neuroimagens aplicadas ao estudo de doenças neuro-degenerativas vêm fornecendo um volume cada vez maior de dados, tornando sua utilização uma tarefa complexa. Paralelamente, técnicas computacionais de reconhecimento de padrões vêm sendo desenvolvidas para apoiar a tomada de decisão humana. O propósito geral do presente estudo é aplicar técnicas de reconhecimento de padrões em dados quantitativos de neuroimagens adquiridas por ressonância magnética (RM) em pacientes com Esclerose Múltipla (EM). Especificamente foram avaliados dados retrospectivos de um grupo de 203 sujeitos controle sem doenças neurológicas e um grupo de 144 pacientes portadores de Esclerose Múltipla. Os dados usados foram provenientes da combinação de ferramentas computacionais de processamento de imagens e neuroimagens adquiridas em um aparelho de RM de 3 Tesla usando diferentes técnicas quantitativas: Difusão, Relaxometria, Taxa de Transferência de Magnetização (MTR) e Volumetria. Os dados das diferentes técnicas quantitativas em 126 regiões cerebrais não excludentes foram processados no programa de mineração de dados WEKA. Os algoritmos: k-nearest-neighbor (KNN) com diferentes números de vizinhos e Support vector machine (SVM) foram utilizados para a classificação e agrupamento desses dados. As regiões com maior contribuição na separação de ambos os grupos foram encontradas na substância branca (SB) nas seguintes estruturas: corpo caloso, precúneo, cerebelo e fusiforme esquerdos. Outro atributo significante foi o de hipo-intensidades que pode ser associado à presença de lesões, também na substância branca. Dentre as técnicas, a mais relevante foi a MTR com 92,9% de valor médio de área sob a curva ROC (Receiver Operating Characteristic), considerando os diferentes algoritmos de classificação e métodos de seleção de atributos, porém uma análise global incluindo os dados de todas as técnicas elevou esta área para 96,2%. O algoritmo KNN com 5 vizinhos foi considerado o melhor classificador geral para o conjunto de dados e tarefas aqui explorados resultando em 91,7% de valor médio de área sob a curva ROC, seguido por KNN3 com 90,8%, KNN1 com 87,1% e SVM com 85,8%. Uma classificação restrita, com áreas reconhecidamente afetadas pela EM e com KNN5 trouxe resultados de classificação 2,1% de valor médio de área sob a curva ROC inferiores à classificação principal sem restrições. O uso de técnicas de reconhecimento de padrões a partir dos dados de técnicas quantitativas de neuroimagem aplicadas à amostra estudada, demonstrou que a substância branca do cérebro é a mais afetada pela EM seguindo um padrão global com maior envolvimento no hemisfério esquerdo. A estratégia sugerida neste problema de classificação seria o uso dos dados de todas as técnicas quantitativas aqui discutidas provenientes das regiões envolvidas na classificação restrita conjuntamente com o precuneus e o fusiform, aplicando o KNN5 com seleção de melhores atributos. / In the last decade different modalities and quantitative neuroimaging techniques applied to the study of neurodegenerative diseases have been providing an increasing volume of data, making use of such a complex task. At the same time, computational techniques of pattern recognition have been developed to favor the human performance. The purpose of this study is to apply techniques of pattern recognition in quantitative data of neuroimaging acquired by magnetic resonance (MR) in patients of multiple sclerosis (MS). There were evaluated retrospective data from a control group of 203 people without neurological diseases and a group of 144 patients with MS. The data used were from the combination of computational tools of image processing and neuroimaging acquired in an MR apparatus of 3 Tesla using different quantitative techniques: diffusion, relaxometry, magnetization transfer rate (MTR) and volumetry. The data of the different quantitative techniques in 126 regions of the brain not mutually excludent were processed in the software WEKA of data mining. The algorithms: k-nearest-neighbor (KNN) with different numbers of neighbors and support vector machine (SVM) were used for the classification and grouping of the data. The regions with the highest contribution to the separation of both groups were found in the white matter of the following structures: corpus callosum, precuneus, cerebellum and left spindle. Another significant attribute was the hypo-intensities that can be associated to the presence of lesions in the white matter also. The most relevant technique was the MTR with 92.9% of average area under ROC, considering the different algorithms of classification and methods of feature selection, however a global analysis including data from all techniques increased this area under ROC to 96.2%. The KNN algorithm for k = 5 is considered the best overall classifier for the dataset resulting in 91.7% average area under ROC, followed by KNN for k = 3 with 90.8%, KNN for k = 1 with 87.1%, and SVM with 85.8%. A restricted classification with known affected areas by MS and KNN for k = 5 brought results of classification of average area under ROC of 2.1% inferior to the main classification without restrictions. The use of techniques of pattern recognition from the data of quantitative techniques of neuroimaging showed that the white matter of the brain is the most affected by MS following a global pattern with higher involvement in the left hemisphere. The strategy suggested in this classification issue would be the use of data from all quantitative techniques discussed from the regions involved in restricted classification jointly with precuneus and fusiform, applying KNN for k = 5 with selection of best features.

A buspirona, ansiolítico da segunda geração usada no tratamento de ansiedade, foi analisada fisico-quimica e quimicamente, com o objetivo de fornecer subsídios para a respectiva monografia. Fizeram-se os seguintes testes de caracterização deste fármaco: faixa de fusão, análise elementar, pH, umidade e solubilidade. Realizaram-se igualmente as provas de identificação constante de: análise cromatográfica, ensaio de cloreto, espectro no infravermelho, espectro no ultravioleta, espectro de ressonância magnética protônica, espectro de massa, espectro de carbono-13, termogravimetria, calorimetria exploratória diferencial e cromatografia líquida de alta resolução. Efetuaram-se, também, determinações quantitativas pelos seguintes métodos: micro-Kjeldahl, gravimétrico, potenciométrico com nitrato de prata, doseamento com ácido perclórico em meio acetico por volumetria e potenciometria e espectrofotométrico no ultravioleta. Concluiu-se que: 1) o teste de caracterização mais indicado e o ponto de fusão; 2) das provas de identificação, as mais simples e rápidas são as seguintes: identificação de cloreto, infravermelho e ultravioleta; 3) dos métodos de determinação quantitativa, mais prático e o doseamento com ácido perclórico em meio acético, usando como indicador o vermelho de quinaldina. / Buspirone, a new non-benzodiazepine anxiolytic agent which is effective in the treatment of anxiety, was analyzed by physicochemical and chemical methods, having in mind a monograph of this drug. The fo1lowing characterization tests of this drug were performed: melting range, elementary analysis, pH, loss in drying, solubility. The following identification tests were also carried out: chromatographic analysis, identification of chloride, infrared absorption, ultraviolet absorption, protonic magnetic resonance spectra, mass spectrum, carbon 13C NMR spectroscopy, thermogravimetry and high performance liquid chromatography. Quantitative determinations were obtained through the following methods: micro-Kjeldahl, gravimetry, potenciometry, non-aqueous titration with perchloric acid and ultraviolet spectrometry. The following conclusions were reached: 1) the best characterization test is the melting range; 2) the simplest and quickest tests of identification are: identification of chloride, infrared and ultraviolet spectrophotometry; 3) the most practical method is the non-aqueous assay with perchloric acid.

O município de Bertioga insere-se, geologicamente, no Terreno Serra do Mar, em grande parte coberto por sedimentos cenozoicos e sua história geológica está relacionada aos estágios de evolução do Supercontinente Gondwana até os eventos de variação do nível relativo do mar durante o Quaternário. Além da notável geodiversidade, omunicípio possui extraordinária importância em relação às fortificações militares construídas com materiais pétreos entre os séculos XVI e XX no litoral paulista, pois, dentre as dezoito fortificações inicialmente existentes, restam apenas sete, das quais uma (Forte São João) está nele situado. As restantes (Fortaleza de Santo Amaro da Barra Grande, Fortim da Praia do Góes, Fortaleza de Vera Cruz de Itapema, Forte São Luiz, Fortaleza de Itaipu e Forte dos Andradas), situam-se em Guarujá e Praia Grande. Com base nestes fatos, esta pesquisa foi estruturada de forma a elaborar estratégias de geoconservação para a geodiversidade in situ e ex situ da região. A avaliação da geodiversidade in situ foi feita por meio do inventário de geossítios (com valor científico) e de sítios de geodiversidade (com valor educativo e turístico). Como resultado, foram definidos os seguintes geossítios: Registros tectônicos da Cachoeira do Sertão, Milonitos da Praia de São Lourenço, Gnaisse do Canto do Itaguá, Mirante da Serra do Mar, Terraço Pleistocênico do Rio Itapanhaú, Paleoterraço do Rio Guaratuba, Captura fluvial do Rio Guaratuba e Terraços Marinhos da Praia de Itaguaré. Os sítios de geodiversidade são: Granitos da Praia do Indaiá, Gnaisses da Praia de São Lourenço, Blocos rolados do Rio Itatinga e Granitos da Cachoeira do Guaratuba. A análise da geodiversidade ex situ foi feita de forma a identificar os tipos de pedras utilizadas na construção das fortificações, inferir sobre a provável proveniência destes materiais, avaliar o estado de conservação, reconhecer seu uso atual e apresentar um levantamento histórico-bibliográfico sobre as fortificações remanescentes. Com base nos resultados para a geodiversidade in situ foi possível constatar que os sítios que apresentam maior risco de degradação por atividades antrópicas são aqueles localizados em praias e cachoeiras devido ao grande número de visitantes, enquanto os sítios que possuem baixo risco de degradação são os protegidos por meio das Unidades de Conservação. Por sua vez, os sítios que possuem moderado risco de degradação localizam-se em praias e em áreas não protegidos. Os resultados da geodiversidade ex situ atestam os blocos de pedras utilizadas nas construções são de granitos e gnaisses, rochas provenientes do Terreno Serra do Mar e outras representantes da geodiversidade local. Com base nesses resultados foram elaboradas propostas de gestão, divulgação e valorização para os geossítio e sítio de geodiversidade e propostas de roteiros geoturísticos para as fortificações. Essas propostas oferecem subsídios para as estratégias de geoconservação da geodiversidade in situ e ex situ e visam contribuir com o planejamento territorial de forma a proteger a geodiversidade para esta e para as futuras gerações. / The town of Bertioga is situated, in terms of geology, on the Serra do Maz Terrain, covered to a lazge extent by Cenozoic sediments, and its geological history is related to the stages of evolution of the Gondwana supercontinent up to the relative sea level variation events during the Quaternary. In addition to the outstanding geodiversity, the municipality has extraordinary importance regazding the military fortifications built with stone materials between the XVI and XX centuries on the coast of São Paulo State, considering that, among the eighteen initially existing fortifications, only seven have been preserved, one of which (São João Fort) is located within the city limits. The others (Fortress of Santo Amazo da Barra Grande, Fortress of Praia do Góes, Fortress of Vera Cruz de Itapema, São Luiz Fort, Fortress of Itaipu and Andradas Fort) are located in Guarujá and Praia Grande. Based on these facts, this research was conceived in such a way as to develop geoconservation strategies for the geodiversity in situ and ex situ of the region. The assessment of the geodiversity situ was done through the inventory of geosites (with scientific value) and geodiversity sites (with educational and touristic value). As a result, the following geosites were determined: Tectonic records of Cachoeira do Sertã.o, Mylonites of São Lourenço beach, Gneiss of Canto do Itaguá, Viewpoint of Serra do Mar, Pleistocene terrace of Itapanhaú river, Paleoterrace of Guazatuba river, River capture of Guazatuba river and Marine terraces of Itaguaré beach. The geodiversity sites are: Granites of Indaiá beach, Gneiss of São Lourenço beach, Rolled stone blocks of Itatinga river and Granites of Cachoeira do Guazatuba. The analysis of the geodiversity ex situ was made in order to identify the types of stones used in the construction of the fortifications, infer the probable origin of these materials, evaluate their conservation status, recognize their current use and present a historical literature review on the remaining fortifications. Based on the results for the geodiversity situ, it was found that the sites with higher possibility of degradation by anthropic activities are those located on beaches and waterfalls due to the large number of visitors, while the sites with low risk of degradation aze protected within environmental protection areas. For their part, the sites with moderate risk of degradation are located on beaches and on non-protected areas. The results for the geodiversity attest that the stone blocks used in the constructions are granites and gneisses, rocks from the Serra do Mar Terrain and other representatives ofthe local geodiversity. Based on these results, proposals were developed for management, publicity and valorization for the geosites and geodiversity sites, and geotourism routes for the fortifications. These proposals present information for geoconservation strategies for the geodiversity and and aim to contribute to the land-use planning in order to protect the geodiversity for this and future generations.

Este avaliou as características do EEG numa população de indivíduos nonagenários cognitivamente normais tanto através da analise visual como espectral. A amostra constituía de 42 sujeitos com idade que variava de 90 a101 anos (media de 92 DP 3,0 anos) clinica e cognitivamente saudáveis vivendo em seus lares e totalmente independentes oriundos do ambulatório do grupo de neurologia cognitiva do HC (acompanhantes) e da Casa Idoso. Eles foram submetidos a uma entrevista, exame neurológico, avaliação neuropsicológica e um EEG digital com programas capacitados a realizar analise espectral e de analise de coerência.Foi avaliado através da analise visual o PF (pico de freqüência) da banda alfa em áreas posteriores,a reatividade alfa a abertura ocular ,a presença de atividade lenta nas regiões temporais, a ocorrência de variantes benignas e de atividade epileptiforme espontânea. Através da analise espectral foi determinado o PF espectral da banda alfa nas regiões occipitais, e a coerência inter-hemisférica para a banda alfa entre os eletrodos P3P4 e O1O2. Os resultados deste estudo confirmam os vários trabalhos da literatura, que concluíram que em indivíduos idosos saudáveis a freqüência do ritmo alfa nas regiões posteriores do cérebro nunca foi menos que 8,0 Hz, e que as mulheres apresentam um pico de freqüência maior que os homens. A reatividade do ritmo alfa à abertura ocular foi observada em 41 sujeitos (97,61%) do total, e atividade lenta nas regiões temporais em 9 indivíduos (21,42%) com predomínio no hemisfério cerebral esquerdo. O valor médio para a coerência inter-hemisférica obtida para banda alfa em P3P4 e O1O2 foi respectivamente 0,61(DP 0,11) e 0,65( DP 0,13), e não foi detectado nenhuma diferença significa relacionada ao sexo, e nem uma redução deste valor com o envelhecimento. Conclusão: indivíduos idosos nonagenários cognitivamente normais apresentam um pico de freqüência para o ritmo alfa em áreas posteriores do encéfalo (eletrodos O1O2) igual ou maior que 8,0 Hz, e que valores abaixo desta faixa pode significar anormalidade e que as mulheres tem uma freqüência maior que os homens. A reatividade à abertura ocular do ritmo alfa permanece apesar da idade avançada e que sua ausência pode significar algum comprometimento funcional. A presença de alentecimento nas regiões temporais um achado que para muitos autores pode ser normal durante a senescência, foi observada neste estudo em somente 21% dos indivíduos, e não teve nenhuma correlação significativa com o perfil cognitivo e nem com o nível de escolaridade. A coerência para banda alfa em áreas posteriores (P3P4 e O1O2) não apresenta alteração importante durante o envelhecimento / This study evaluated the characteristics of the EEG in a population of cognitively normal nonagenarian individuals both through visual and spectral analysis.The sample consisted of 42 subjects ranging from 90 to 101 years (median of 92 years), clinically and cognitively healthy living in their homes and totally independent. In the outpatient clinic of the cognitive neurology group of the HC (companions) and of the Elderly House (Casa do Idoso). They were submitted to an interview, neurological examination, neuropsychological assessment and a digital EEG with programs capable of performing spectral analysis and coherence analysis. Through the spectral analysis it was evaluated the PF (peak frequency) of the alpha band in posterior areas, the alpha reactivity to ocular opening, the presence of slow activity in the temporal regions, the occurrence of benign variants and spontaneous epileptiform activity. Through the spectral analysis the spectral PF of the alpha band was determined in the occipital regions, and the interhemispheric coherence for the alpha band between the electrodes P3P4 and O1O2. The results of this study confirm a various studies in the literature, which concluded that in healthy elderly individuals the frequency of the alpha rhythm in the posterior regions of the brain was never less than 8.0 Hz, and that women presents a higher frequency peak than men. Reactivity of the alpha rhythm to ocular opening was observed in 41 subjects (97.61%) of the total, and slow activity in the temporal regions in 9 individuals (21.42%) with predominance in the left cerebral hemisphere. The mean value for the interhemispheric coherence obtained for the alpha band in P3P4 and O1O2 was 0.61 (SD 0.11) and 0.65 (SD 0.13), respectively, and no difference was detected related to sex, nor reduction of this value with aging. CONCLUSION: Cognitively normal nonagenarians (90 to 101 years of age) have a peak frequency of alpha rhythm in posterior brain areas (O1O2 electrodes) equal to or greater than 8.0 hz, and values below this range may be abnormal, and that women have a higher frequency than men. Reactivity ocular opening of the alpha rhythm remains despite advanced age and that its absence may also mean some functional impairment. The presence of slowing in the temporal regions, a finding that for many authors may be normal during senescence, was observed in this study in only 21% of the individuals, and had no significant correlation with the cognitive profile nor with the schooling level. The coherence for alpha band in posterior areas (P3P4 and O1O2) does not present significant alteration during the aging

O objetivo deste estudo foi compreender como seleção natural age sobre a variação fenotípica a fim de determinar como espécies respondem às mudanças ambientais. Para isso, usei esquilos do gênero Tamias (subgênero Neotamias, família Sciuridae) como um modelo em uma escala tanto macro quanto micro-evolutiva. Esse conjunto de 23 espécies de Neotamias é parte de uma radiação recente, ocupando uma ampla gama de hábitats com marcada partição de nicho entre as espécies. Um aspecto essencial que molda evolução fenotípica são características ambientais, tais como variações climáticas. Dessa forma, no primeiro capítulo eu examinei se as diferenças fenotípicas entre as espécies estão relacionadas às diferenças climáticas entre os hábitats que ocupam. Diversas características ambientais foram significativamente correlacionadas com atributos morfológicos, indicando que estas tiveram um papel importante como possíveis pressões seletivas conduzindo à divergência entre as espécies. Como consequência, é razoável supor que mudanças climáticas em tempo histórico (isto é, durante o Antropoceno) também afetam variação morfológica dentro de uma escala microevolutiva. No segundo capítulo, portanto, eu examinei esta expectativa usando espécimes de seis diferentes espécies, coletados com cerca de 100 gerações entre coletas (um século). Neste capítulo, não foi encontrada uma associação ente o grau de mudanças climáticas ao longo deste período e a magnitude de mudança morfológica ou de pressão seletiva. Contudo, as estimativas de força de seleção variaram substancialmente entre espécies: para a espécie Tamias alpinus observou-se uma alta estimativa de força de seleção, quase duas vezes maior do que para a espécie Tamias speciosus, a qual as menores forças de seleção foram observadas. Desta forma, a fim de avaliar o impacto de seleção direcional nos padrões de (co)variação fenotípica, no terceiro capítulo eu utilizei estas duas espécies, dado que representam extremos em termos de força de seleção dentre as populações analisadas. Estudos teóricos preveem que sob seleção direcional os padrões de (co)variação podem evoluir, realinhando-se com a paisagem adaptativa subjacente, aumentando a quantidade de variância genética na direção da seleção. Este padrão foi observado para T. alpinus, como esperado, dado que esta espécie sofreu a maior força de seleção. Além disso, para esta espécie foram observadas mudanças nos padrões de correlações entre os caracteres. Estes resultados apoiam expectativas obtidas a partir de modelos teóricos que consideram a evolução do mapa genótipo- fenótipo em resposta à seleção natural / The aim of this study was to understand how natural selection acts on phenotypic variation to determine species\' response to environmental change. I used chipmunks of the genus Tamias (subgenus Neotamias; family Sciuridae) as a model at both a macro and micro-evolutionary scales. This set of 23 species is part of a recent radiation that occupy a wide range of habitats with marked niche partitioning among co-distributed members. As climate variation is an essential aspect believed to shape phenotypic evolution, in the first chapter I examined how phenotypic differences among these species were related to climatic differences among the habitats occupied. Several climatic variables were significantly correlated with morphological attributes differentiating taxa, suggesting a possible causal link between climate, through selection, and species divergence. As a consequence, it is reasonable to suggest that climate change within historic times (the Anthropocene) has also affected cranial morphological variation within species at a microevolutionary scale. In the second chapter, therefore, I examined this expectation using specimens from six different species, each collected about 100 generations apart (one century). Here, no relationship was found between the degree of climate change over this period and the magnitude of observed morphological change, or in a measure of selection strength. Nevertheless, the estimates of selection strength varied substantially among these species: those for the alpine chipmunk (Tamias alpinus) were the strongest and nearly twice that of the co-distributed lodgepole chipmunk (Tamias speciosus). As a result, to assess the impact of directional selection on the observed patterns of phenotypic (co)variation, in the third chapter I contrasted these two species, since they represent the extremes in the estimated strength of selection among all the species\' populations I examined. Theory predicts that, under directional selection, patterns of phenotypic (co)variation might evolve in order to match the subjacent adaptive landscape. This prediction was upheld in the populations of alpine chipmunks, as perhaps expected since they exhibited the strong selective response. Equally importantly, I also observed changes in the overall correlation between traits for the alpine chipmunk in a pattern consistent with that expected under theoretical models that consider the evolution of the genotype-phenotype map in response to directional selection

Dissertação apresentada para obtenção do grau de Mestre em Estatística Aplicada e Modelação, na Faculdade de Engenharia da Universidade do Porto, sob a orientação no ICBAS do Professora Doutora Denisa V. de Mendonça, e na FEUP do Professor Doutor Francisco L. Calheiros

Os microRNAs (miRNAs) são pequenos RNAs não codificadores, de cerca de 20 bases de comprimento, capazes de regular negativamente a expressão gênica após a transcrição. A ação regulatória destas moléculas é indispensável para o funcionamento adequado de diversos processos biológicos, dentre eles o desenvolvimento e a manutenção da musculatura esquelética. Com o objetivo de caracterizar a população de miRNAs presentes na musculatura esquelética adulta de frangos, foi construída uma biblioteca de miRNAs a partir do músculo peitoral de indivíduos jovens (21 dias pós-eclosão). Um total de 576 clones foi sequenciado e as sequências obtidas foram agrupadas por similaridade em 98 grupos, dentre os quais 47 corresponderam à miRNAs conhecidos, 30 à outros tipos de RNA e seis à possíveis novos miRNAs. Estes dados poderão subsidiar estudos funcionais subsequentes, que visem entender a função exercida por cada uma destas moléculas na musculatura esquelética. Buscando-se associar a ocorrência e expressão dos miRNAs ao controle da miogênese, foi analisada a expressão de três miRNAs identificados na biblioteca (miR-125b, miR-221 e miR-206), envolvidos na regulação do balanço entre proliferação e diferenciação celular, mecanismo determinante da miogênese. A análise foi realizada por PCR quantitativa em diferentes estádios do desenvolvimento (nove e 17 dias embrionário e 21 dias pós-eclosão) e entre duas linhagens de frango com potencial divergente para crescimento e ganho de massa muscular. Não houve diferença significativa na expressão dos miRNAs entre as linhagens em nenhum dos estádios aferidos, entretanto, foi possível traçar a ontogenia destas moléculas ao longo do desenvolvimento do animal, o que permitiu inferências sobre as condições morfológicas e fisiológicas das células musculares em cada um dos estádios analisados. Por fim, com o objetivo de associar os dados de expressão obtidos para os miRNAs, à variações na expressão de genes alvo, aferimos a expressão de três genes: SRF, Fstl e Pola1; onde o primeiro é regulado pelo miR-133a (cuja expressão não foi aferida devido à questões metodológicas) e os dois últimos pelo miR-206. A análise foi feita também por PCR quantitativa, entre as linhagens e em diferentes estádios do desenvolvimento. Foi possível visualizar, apenas nos estádios embrionários, a relação entre a expressão do miR-206 e seus genes alvo, com uma coerência entre o aumento na expressão do miR-206 e a diminuição na expressão de Pola1 e Fstl1. A determinação do perfil de expressão dos três genes ao longo do desenvolvimento muscular permitiu inferências sobre a ação destas moléculas no balanço entre proliferação e diferenciação nas linhagens de corte e postura / MicroRNAs (miRNAs) represent a class of small and noncoding RNAs, about 20-nucleotides long that negatively regulate gene expression posttranscriptionally. The regulatory action of these molecules is essential for the proper functioning of various biological processes, including the development and maintenance of skeletal muscles. To identify miRNAs that might be important for the skeletal muscle development, we constructed a miRNA library from pectoral skeletal muscle of 21º days after birth chickens. A total of 576 clones were sequenced and these sequences were collapsed into 98 clusters. Sequence analysis identified 47 small RNAs that show significant similarities with published miRNAs, 30 with others noncoding RNAs and six sequences clusters could be identified as potentially novel miRNAs. These data may support subsequent functional studies aimed at understanding the function performed by each of these molecules in skeletal muscle of chicken. To further associate the miRNA presence with the gene expression in the controlling of myogenesis the expression patterns of tree miRNAs identified in the library (miR-125b, miR-221 e miR-206) were analyzed. These miRNAs are involved in the balance between proliferation and differentiation mechanisms that control myogenesis. The expressions of these miRNAs were measured using quantitative RT-PCR. We analyzed samples from two embryos stages (9 and 17 days) and one adult stage (21º days after birth) in two chicken lines with different potential to growth and gain of muscle mass. There were no significant differences between the lines about these miRNAs expression. But, we could predict an overview of these miRNAs expressions during the muscle development of chicken, which allowed inferences about the physiologic and morphologic conditions of the muscles cells in each analyzed stage. Also, to further associate the miRNAs results to variations in the target genes expressions, we analyzed the expression of three genes: SRF, Fstl e Pola1. The first one is target of miR-133a (not analyzed due to methodological problems), and the others are target of miR-206. We analyzed by quantitative RT-PCR different stages and two chicken lines. It was possible to observe, only in the earlier stages, a relationship between the miR-206 expression and the Pola1 and Fstl1 expression, with a consistency between the increased expression of mir-206 and decrease in expression of Pola1 and Fstl1. The determination of the profile of these three gene expressions during the muscle development allowed inferences about the action of these molecules in the balance between proliferation and differentiation process in chicken strains for broiler and layer

Acompanha 1 mapa anexo / Orientador: Fábio Augusto Gomes Vieira Reis / Banca: José Eduardo Zaine / Banca: Oswaldo Augusto Filho / Resumo: Os escorregamentos são movimentos de massa recorrentes na Serra do Mar. Quando ocorrem de forma generalizada podem causar prejuízos e perdas de vidas, como no acidente ocorrido no município de Caraguatatuba (SP) em 1967. Com o intuito de evitar estes danos, na literatura, são propostos vários métodos para analisar e prever a ocorrência destes processos. Diante do exposto, o objetivo principal desta pesquisa consiste em analisar a suscetibilidade a escorregamentos na região entre Caraguatatuba e São Sebastião (SP), utilizando a compartimentação fisiográfica e a análise quantitativa. Para alcançar estes objetivos foi realizada a análise e compartimentação do terreno e a análise quantitativa dos fatores condicionantes (declividade, hipsometria e geologia) e da compartimentação fisiográfica. Foram testados, em ambiente SIG, diversos cenários a partir de dois métodos distintos. No Método 1, os fatores condicionantes foram analisados através de pesos de influência. No Método 2, os fatores condicionantes mantiveram os mesmos pesos do Método 1 e foram somados pesos para as classes de cada fator. A compartimentação fisiográfica definiu 16 unidades. Os resultados demonstraram que a maioria dos escorregamentos se concentraram na unidade fisiográfica IV e que há um controle topográfico na distribuição dos escorregamentos entre 100 e 400 m de altitude, em encostas com declividade entre 15º e 30º, compostas por gnaisse migmatítico e granito-gnaisse. Os mapas elaborados a partir do Método 2... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Landslides are recurrent mass movements in the Serra do Mar. When they occur in a generalized way, as in the event occurred in Caraguatatuba city (SP) in 1967, they can cause a lot of environmental damage and deaths. In order to avoid this damage, several methods were proposed to analyze and predict the occurrence of this process. Considering the above, the main objective of this research is to analyze the susceptibility to landslides in the region between Caraguatatuba and São Sebastião (SP), using physiographic compartmentalization and quantitative analysis. In order to achieve these objectives, a physiographic analysis of the study area was carried out by the method of physiographic compa(...) / Mestre

Orientador: Ananda Virginia de Aguiar / Resumo: As espécies nativas podem ser utilizadas para diversos usos em sistemas de produção, bem como para recuperação ambiental. Porém, poucas dessas espécies são exploradas economicamente devida à falta de oferta de sementes com qualidade genética no mercado. De maneira geral, a caracterização genética de populações e a seleção de indivíduos mais produtivos a partir de testes de progênies é a primeira etapa do processo para obtenção de indivíduos mais produtivos para sistemas de produção. Assim, os objetivos desse trabalho foram estimar a variação e a divergência genética, as relações genéticas e fenotípicas entre os caracteres quantitativos, bem como a interação genótipo x ambiente de testes de progênies de polinização aberta de Cordia trichotoma e Dalbergia nigra. As avaliações foram realizadas durante os quatro primeiros anos após o plantio. Os caracteres avaliados foram: diâmetro do coleto a 30 cm do solo, diâmetro a altura do peito 1,30 m do solo, altura total das plantas, altura do primeiro verticilo e sobrevivência. Para a estimativa dos componentes de variância e das análises multivariadas utilizou-se o método REML/BLUP (Melhor predição linear não viciada/máxima verossimilhança restrita). As análises foram realizadas entre as progênies da mesma espécie. Dois testes de progênies de C. trichotoma e D. nigra, em sistema de consórcio, foram instalados em 2012 na empresa Vale Rio Doce, em Linhares-ESpirito Santo, em duas áreas, em duas textura de solos. O delineamento experiment... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Native species can be used for various purposes in production systems, as well as for environmental recovery. However, few of these species are economically exploited due to the lack of genetic quality of seeds in the marketplace. In general, the genetic characterization of populations and the selection of more productive individuals from progeny tests are the first stage of the process to obtain more productive individuals for production systems. The objectives of this work were to estimate the variation and genetic divergence, identify the genetic and phenotypic relationships among the quantitative traits, as well as analyze the genotype x environment interaction of open pollinated progenies of Cordia trichotoma and Dalbergia nigra. The assessments were conducted during the first four years after planting. The evaluation traits were: collection diameter at 30 cm from the soil, diameter at 1.30 m from the soil, total height of the plants, height of first whorl and survival. To estimate the components of variance and multivariate analyzes, the REML/BLUP method (Restricted Maximum Likelihood/Best Linear Unbiased Prediction) was used. The analyses were carried out among the progenies of the same species. The two progenies of Cordia trichotoma and Dalbergia nigra, in a consortium system, were installed in 2012 at Vale Rio Doce, in the municipality of Linhares, Espirito Santo, in two areas, using two distinct soils. The experimental Randomized Complete Block design (RCB) were div... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor