Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 836731 bytes, checksum: 1e5b214c3c6014a5c95797b0c455ae73 (MD5) Previous issue date: 2010-02-24 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / In breeding programs, it is important to use viable alternatives to reduce cost and time spent on population evaluations, combined with adequate statistical methodologies applying the maximum information available. Within this context, this work aimed to: i) study the genetic control of popping capacity and grain yield in popcorn; ii) predict the effects of general combining ability (GCA) and specific combining ability (SCA), applying mixed model analysis; iii) evaluate the performance per se of the lines used in hybrid crosses; and iv) evaluate the efficiency of Best Linear Unbiased-Prediction (BLUP) in predicting the performance of non crossed hybrids in diallelic analysis. Data from experiment evaluations of intra-population diallels of the Beija-Flor and Viçosa popcorn populations were used in the analyses. Eighteen S6 Beija-Flor elite lines were analyzed in ten environments and 29 S6 Viçosa elite lines in eight environments. Combined analyses were carried out, considering all the environments, with the additive model being adopted. The software ASREML was used in all analyses. GCA variability was verified both for grain yield and popping capacity. A significant SCA variability was verified in Beija-Flor for the two variables. In Viçosa, SCA was significant at 8% for grain yield while for popping capacity, the presence of additive effects was practically verified in its expression. Through the incorporation of sibling relationships in diallelic analysis, SCA values of combination of a line with itself (sjj) were predicted, without such cross being carried out. The use of BLUP/REML allowed the prediction of over 43 to 210% hybrid combinations, if compared only to the hybrid observed. Based on hybrid predictions, promising crosses were identified both for grain yield and popping capacity, being observed that the inclusion of a pedigree seems to make the analyses more accurate, as compared to the model not using this information. The performance per se and under S6 family crosses showed moderate correlations (r = 0.53) for popping capacity, showing that families with high popping capacity GCA can be selected, based on their performance per se. Aiming to obtain information on the efficiency in predicting S6 families based on performance per se and on S3 family crosses, a positive correlation (r = 0.76) was found for production between the GCA of top cross hybrids of the S3 families and the S6.family hybrids. When verifying BLUP efficiency in the prediction of non crossed hybrids, moderate to high Pearson and Spearman correlations were found among the predicted and observed values. Prediction of hybrids in the absence of dominance (popping capacity, r = 0.88) was more efficient than in the presence of dominance (grain yield, r = 0.53). The overall results showed that the use of mixed models is an efficient alternative in diallelic analysis, providing good precision in estimating genetic parameters, besides allowing the prediction of non crossed hybrids. / Em programas de melhoramento é importante o uso de alternativas viáveis para redução de custos e tempo nas avaliações de populações, aliadas ao uso de metodologias estatísticas adequadas, que aproveitem ao máximo as informações disponíveis. Neste contexto, o presente trabalho teve como objetivos: i) estudar o controle genético da capacidade de expansão e produção de grãos em milho-pipoca; ii) predizer os efeitos da capacidade geral de combinação (CGC) e da capacidade específica de combinação (CEC) por meio da análise de modelos mistos; iii) avaliar o desempenho per se das linhagens utilizadas nos cruzamentos híbridos; iv) avaliar a eficiência do BLUP na predição do desempenho de híbridos não realizados na análise dialélica. Nas análises, foram utilizados dados de experimentos de avaliação de dialelos intrapopulacionais das populações de milho-pipoca Beija-Flor e Viçosa. Foram analisadas 18 linhagens elites S6 de Beija-Flor, em 10 ambientes, e 29 linhagens elites S6 de Viçosa, em 8 ambientes. Foram realizadas análises conjuntas, considerando todos os ambientes, sendo adotado o modelo aditivo-dominante. Em todas as análises foi utilizado o software ASREML. Foi verificada variabilidade para CGC tanto para produção como para capacidade de expansão. Para CEC houve variabilidade significativa em Beija-Flor para as duas variáveis. Em Viçosa, a CEC foi significativa a 8% para produção de grãos, enquanto para capacidade de expansão foi verificada praticamente a presença de efeitos aditivos na sua expressão. Por meio da incorporação de informações de parentesco na análise dialélica, valores de capacidade específica de combinação de uma linhagem com ela mesma (sjj) foram preditos, sem que este cruzamento tenha sido realizado. Com o uso do BLUP/REML foi possível predizer de 43% a 210% a mais de combinações híbridas, se comparada somente aos híbridos observados. A partir das predições dos híbridos, cruzamentos promissores foram identificados tanto para produção de grãos como para capacidade de expansão, sendo que a inclusão do pedigree parece deixar as análises mais acuradas, em comparação ao modelo sem uso destas informações. O desempenho per se e em cruzamento de famílias S6 evidenciaram correlações moderadas (r=0,53) para capacidade de expansão, mostrando ser possível selecionar famílias com alta CGC em capacidade de expansão a partir do desempenho per se de suas famílias. Visando obter informações sobre a eficiência da predição de famílias S6 a partir do desempenho per se e em cruzamento de famílias S3, foi encontrada correlação positiva (r=0,76) para produção, entre a CGC dos híbridos topcross de famílias S3 e híbridos de famílias S6. Ao verificar a eficiência do BLUP na predição de híbridos não realizados, foram encontradas correlações de Pearson e Spearman de moderada a elevadas, entre os valores preditos e observados. A predição de híbridos não realizados na ausência de dominância (capacidade de expansão, r=0,88) foi mais eficiente, em comparação à presença de dominância (produção de grãos, r=0,53). Os resultados gerais demonstraram que o uso de modelos mistos é uma alternativa eficiente na análise dialélica, proporcionando boa precisão nas estimações dos parâmetros genéticos, além de permitir a previsão de cruzamentos não realizados.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 670022 bytes, checksum: 545da53bb28a3a29eb0f499873a94613 (MD5) Previous issue date: 2011-02-18 / The bean breeding aiming to produce more upright architecture plants comes growing in importance based on four main objectives: to attend the demand of the producer of irrigated areas in relation to the possibility of mechanical harvesting; to attenuate the problems of diseases caused by soil fungi, especially the white mold; to facilitate the cultural practices and reduce the risks of cultivation in the rainy season. Currently, a grading scale is being used to evaluate the architecture of plant bean, however, this scale is subjective, demands hard work and relies an extensive experience of the evaluator. Therefore, it is important for bean breeding programs to identify characters with the potential to support or even replace, the assessment of plant architecture by notes, seeking greater efficiency in the selection of upright plants. Aiming to identify effective indicators of plant architecture, thirty-six bean lines were evaluated for key traits related to plant architecture and agronomic traits in two seasons, winter of 2007 and winter of 2009. The experiments were conducted in a randomized block design with three repetition at Coimbra’s Experimental Station, belonging to the Department of Plant Science, Universidade Federal de Viçosa. It was observed that more erect plants had a higher cycle, higher at harvest time, smaller insertion angle of branches, epicotyl and hypocotyls with larger diameter, higher height of first pod, pods concentrated on the main stem and a greater number of internodes on the main stem. By path analysis, it was observed that the insertion angle of branches, plant height at harvest and the diameter of the hypocotyl were the main determinants of character architecture of bean plants. Hypocotyl diameter showed a strong association of cause and effect with note plant architecture, high accuracy and precision in its evaluation and ease of evaluation. Moreover, its evaluation is not subjective, can be taken for individual plants within plots, the evaluation can be done after harvest and requires only six measures to access the genotypic value of lineages. Thus, the diameter of the hypocotyl stood out as an effective indicator of the bean plant architecture. / O melhoramento do feijoeiro visando à obtenção de plantas de arquitetura mais ereta vem crescendo em importância com base em quatro objetivos principais: atender à demanda do produtor de áreas irrigadas com relação à possibilidade de colheita mecânica; atenuar os problemas de doenças causadas por fungos de solo, especialmente o mofo-branco; facilitar os tratos culturais e reduzir os riscos do cultivo na safra das águas. Atualmente vem-se utilizando o emprego de uma escala de notas para avaliar a arquitetura de plantas de feijão, porém, essa escala é subjetiva, trabalhosa e depende de grande experiência do avaliador. Assim, é de importância para os programas de melhoramento do feijoeiro a identificação de caracteres com potencial para subsidiar, ou até mesmo substituir, a avaliação da arquitetura de plantas por notas, visando maior eficiência na seleção de plantas de porte ereto. Com o objetivo de identificar indicadores efetivos da arquitetura de plantas, trinta e seis linhagens de feijoeiro foram avaliadas quanto aos principais caracteres relacionados à arquitetura de plantas e caracteres agronômicos em duas safras, inverno de 2007 e inverno de 2009. Os experimentos foram conduzidos em blocos casualizados, com três repetições, na Estação Experimental de Coimbra, pertencente ao departamento de Fitotecnia da Universidade Federal de Viçosa. Observou-se que plantas mais eretas apresentaram maior ciclo, maior altura na colheita, menor ângulo de inserção dos ramos, epicótilo e hipocótilo com maior diâmetro, maior altura de inserção da primeira vagem, vagens concentradas na haste principal e maior número de entrenós na haste principal. Pela análise de trilha, observou-se que o ângulo de inserção dos ramos, a altura das plantas na colheita e o diâmetro do hipocótilo foram os principais caracteres determinantes da arquitetura de plantas do feijoeiro. O diâmetro do hipocótilo apresentou elevada associação de causa e efeito com nota de arquitetura de planta, elevada acurácia e precisão em sua avaliação e maior facilidade de avaliação. Ademais, sua avaliação não é subjetiva e podem ser tomadas medidas de plantas individuais dentro da parcela, bem como a avaliação pode ser realizada após a colheita e são necessárias apenas seis medidas para acessar o valor genotípico de linhagens. Assim, o diâmetro do hipocótilo se destacou como indicador efetivo da arquitetura de plantas do feijoeiro.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 863911 bytes, checksum: da28f5a9138c52a83953d8b676a03728 (MD5) Previous issue date: 2012-02-16 / The obtaining of plants of more erect architecture is growing in importance due to the demand of the producing of irrigated areas regarding the possibility of automated crop, reduction of the problems of diseases and easiness of the cultural treatments. In general it comes if using a scale of notes to evaluate the bean plants architecture, however, that scale is visual, difficult and it depends on the appraiser's great experience. Recent works (Moura, 2011 and Silva, 2011) tell that the hypocotyl diameter is an effective indicator of the bean plant architecture and a significant association among hypocotyl diameter of F2 plants and their derived progenies would potentiate the earnings with the selection seeking improvement of the bean plant architecture in programs of appealing selection, as well as the efficiency of the phenotypic recurrent selection. Besides, in the improvement of the bean plant, to select plants to associate good productivity and erect architecture has been the preference of the breeders. The objectives of this work were to verify the association among hypocotyl diameter of F2 plants and their F2:3 progenies, and to obtain estimates of genetic parameters, seeking the choice of the best selection strategy for improvement of the load of the bean plant and to analyze the effectiveness of the genotype-ideotype distance index in the selection of bean plant families as for the load and grains productivity, appraised in different atmospheres. They were appraised 96 F2 families, their F2:3 progenies and four controls (BRSMG Majestoso, L1, BRSMG Madrepérola and A525) in random blocks, with three repetitions, as for the plants architecture, hypocotyl diameter and grains productivity in the harvests of the winter of 2010 and of the drought of 2011. It was observed that the association among F2 plants HD and characters related to the load in the F2:3 progenies were of magnitude relatively low, compared to the estimates of correlations considering the genitors, indicating great influence of the atmosphere in the determination of the hypocotyl diameter in individual plants of bean plant. There was predominance of addictive effect in the determination of this character, that presented larger precision and accuracy compared to the evaluation of the load by the note of architecture of the plants, evidencing that the hypocotyl diameter can be used as auxiliary measure in the selection of progenies in the improvement of the bean plant seeking improvement of the load of the plants, since the selection is based, in agreement with the repeatability analysis, in the average of at least 40 plants within plots. Besides, families were observed with grains productivity above the largest values presented by the parents in the two harvests, with architecture notes and hypocotyl diameter comparable to the most erect genitors. The use of the genotype-ideotype distance index was effective in the selection of families seeking improvement of the load and grains productivity, appraised in different atmospheres, with prominence for the families of the population originating from of the crossing among the bean plant lines A525 and BRSMG Majestoso. / A obtenção de plantas de arquitetura mais ereta vem crescendo em importância devido à demanda do produtor de áreas irrigadas com relação à possibilidade de colheita mecanizada, redução dos problemas de doenças e facilidade dos tratos culturais. Em geral vem se utilizando uma escala de notas para avaliar a arquitetura de plantas de feijão, porém, essa escala é visual, trabalhosa e depende de grande experiência do avaliador. Trabalhos recentes (Moura, 2011 e Silva, 2011) relatam que o diâmetro do hipocótilo é um indicador efetivo da arquitetura de plantas do feijoeiro e uma associação significativa entre o diâmetro do hipocótilo de plantas F2 e suas progênies derivadas potencializaria os ganhos com a seleção visando melhoria da arquitetura do feijoeiro em programas de seleção recorrente, bem como a eficiência da seleção recorrente fenotípica. Ademais, no melhoramento do feijoeiro, selecionar plantas que associem boa produtividade e arquitetura ereta tem sido a preferência dos melhoristas. Os objetivos deste trabalho foram verificar a associação entre diâmetro do hipocótilo de plantas F2 e de suas progênies F2:3, e obter estimativas de parâmetros genéticos, visando a escolha da melhor estratégia de seleção para melhoria do porte do feijoeiro e analisar a eficácia do índice genótipo-ideótipo na seleção de famílias de feijoeiro quanto ao porte e produtividade de grãos, avaliadas em diferentes ambientes. Foram avaliadas 96 famílias F2, suas progênies F2:3 e quatro testemunhas (BRSMG Majestoso, L1, BRSMG Madrepérola e A525) em blocos ao acaso, com três repetições, quanto à arquitetura de plantas, diâmetro do hipocótilo e produtividade de grãos nas safras do inverno de 2010 e da seca de 2011. Observou-se que a associação entre o DH de plantas F2 e caracteres relacionados ao porte nas progênies F2:3 foram de magnitude relativamente baixa, comparada às estimativas de correlações considerando os genitores, indicando grande influência do ambiente na determinação do diâmetro do hipocótilo em plantas individuais de feijoeiro. Houve predominância de efeito aditivo na determinação deste caráter, que apresentou maior precisão e acurácia comparada à avaliação do porte pela nota de arquitetura das plantas, evidenciando que o diâmetro do hipocótilo pode ser utilizado como medida auxiliar na seleção de progênies no melhoramento do feijoeiro visando melhoria do porte das plantas, desde que a seleção se baseie, de acordo com a análise de repetibilidade, na média de pelo menos 40 plantas na parcela. Além disso, foram observadas famílias com produtividade de grãos acima dos maiores valores apresentados pelos pais nas duas safras, com notas de arquitetura e diâmetro do hipocótilo comparáveis aos genitores mais eretos. A utilização do índice da distância genótipo-ideótipo foi eficaz na seleção de famílias visando melhoria do porte e produtividade de grãos, avaliadas em diferentes ambientes, com destaque para as famílias da população oriunda do cruzamento entre as linhagens A525 e BRSMG Majestoso.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 379535 bytes, checksum: 5424301d5c25f5d965d852155f33e0d2 (MD5) Previous issue date: 2008-07-24 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The objectives of the present work were to install the REML/BLUP methodology in the recurrent populational improvement, using half-brothers families, to compare this methodology with the traditional analysis of the ordinary least squares and to present the SAS routines for the analyses of mixed models. The model used corresponds to the beeder model used in the animal improvement. The computer analyses were carried out using the computer software SAS® through proc mixed, proc inbreed, proc iml and proc gml procedures. As the theory support, data from three cycles of recurrent selection in the population of Voçosa por-corn, of the Programa de Melhoramento do Setor de Genética (Improvement Program of the Genetic Sector), do Departamento de biologia Gerald a Universidade Federal de Viçosa (Department of General Biology of the Viçosa Federal University) were used. The experiments were designed in single 14 x 14 lattice. In each block of the experiment, the production and the expansion ability (CE) in ml/g were evaluated. For each improvement cycle, the variance components were estimated the genotypic means were predicted, according to the REML/BLUP methodology. For each cycle the analysis by the ordinary Least Squares (OLS) was also made with the estimation of the variance components and of the genotypic means. Besides, the gains due to the selection in each cycle mere calculated. Moreover the ordination of the selected individuals was verified and the confidence intervals for the genetic values predicted and estimated were built. By the variance analysis, it could be verified that as the improvement cycles progressed, there was a sifnificant reduction in the variability for CE, and in the third selection cycle the variability was no more detected. This variability reduction can be explained by the high selection intensity, because the 20 families selected in the third cycle were from only mine plants of the first cycle of selection. Referring the genetic parameters estimated by the two methodologies, it was observed that both with the REML and the OLS methodology the estimate values for the variance components were similar. For the genotypic means, when there was no relationship among the individuals there was an accordance among the best individuals estimated and predicted, but the predicted values presented narrower confidence intervals, indicating that these values are more accurate than the estimated ones. When the relationship information was included, there was a reduction on the coincidence values between the selected ones and those of the Speerman co-relation indicating that the use of the prodictd genotypic means in the selection of superior individuals will provide greater gains due to the selection. / O presente trabalho teve como objetivos implementar a metodologia REML/BLUP no melhoramento populacional recorrente, empregando famílias de meios-irmãos, comparar essa metodologia com a análise tradicional por mínimos quadrados ordinário e apresentar as rotinas do SAS para as análises de modelos mistos. O modelo empregado corresponde ao modelo de reprodutor utilizado no melhoramento animal. As análises computacionais foram realizadas utilizando o aplicativo computacional SAS® por meio dos seus procedimentos proc mixed, proc inbreed, proc iml e proc glm. Como suporte à teoria, foram utilizados dados de três ciclos de seleção recorrente na população de milho-pipoca Viçosa, do Programa de Melhoramento do Setor de Genética, do Departamento de Biologia Geral da Universidade Federal de Viçosa. Os experimentos foram delineados em látice 14 x 14 simples. Em cada parcela dos experimentos, foram avaliadas a produção e a capacidade de expansão (CE) em ml/g. Para cada ciclo de melhoramento, foram estimados os componentes de variância e preditas as médias genotípicas, de acordo com a metodologia REML/BLUP. Para cada ciclo também foi feita análise por Mínimos Quadrados Ordinário (OLS), com estimação dos componentes de variância e das médias genotípicas. Foram calculados, ainda, os ganhos devidos à seleção em cada ciclo. Também foi verificada a ordenação dos indivíduos selecionados e construídos os intervalos de confiança para os valores genéticos preditos e estimados. Pelas análises de variância, pôde-se verificar que à medida que os ciclos de melhoramento avançaram, houve uma redução significativa na variabilidade para CE, sendo que no terceiro ciclo de seleção não foi detectada variabilidade. Essa redução da variabilidade pode ser explicada pela alta intensidade de seleção, tanto que as 20 famílias selecionadas no terceiro ciclo eram originárias de apenas nove plantas do primeiro ciclo de seleção. Quanto aos parâmetros genéticos estimados pelas duas metodologias, observou-se que, tanto pela metodologia REML quanto pela OLS, os valores estimados para os componentes de variância foram semelhantes. Para as médias genotípicas, quando não existia parentesco entre os indivíduos, houve concordância entre os melhores indivíduos estimados e preditos, porém, os valores preditos apresentaram intervalos de confiança mais estreitos, indicando que esses valores são mais precisos que os estimados. Ao incluir as informações de parentesco, houve uma redução nos valores de coincidência entre os selecionados e os da correlação de Speerman, indicando que o uso das médias genotípicas preditas na seleção dos indivíduos superiores proporcionará maiores ganhos devidos à seleção.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 665559 bytes, checksum: 20e883c9a1b228fc8f3e959a0a0064c6 (MD5) Previous issue date: 2013-03-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The aim this present work were from the simulated population, make replication or enlargement of populations sets, with the same characteristics off from average, herdability and variation coefficient and organization (covariance or correlation matrix), by means of spectral decomposition, and evaluable efficiency of use artificial neural network in the prediction genetics value in randomized blocks experiments. The design used to simulation of the experiments was randomized blocks with six repetitions. They were simulated 80 conformation, when get established values of average, herdability and experimental variation coefficient. Experiments simulated were used to training (experiment with 5000 genotypes) and validation (100 experiment with 150n and 200 genotypes by each conformation). Thus to measurement the efficiency of the ANN in prediction of genetic value compared its correlation between network value with genetic value and correlation between phenotypic value with genetic value. Average, herdability, variation coefficient and variance and covariance matrix were maintained constant in all experiments simulated. It was possible through spectral decomposition techniques. Neural network were efficient for prediction of genetic value with gain 0,64 until 10,3% in relation phenotypic value regardless of size from populations, herdability or variation coefficient simulated. Thus concluded that preservation variance and covariance matrix of experimental data was efficiently performed by using spectral decomposition of the matrix observed. Therefore datasets simulated can be used to training of the ANNs maintaining original populations characteristics. Thus it was found that ANNs is a technique more efficient by prediction of genetic value in balanced experiments, when compared with phenotype value (average). / Os objetivos do presente trabalho foram a partir das populações simuladas, fazer a replicação ou a ampliação de conjuntos populacionais, com as mesmas características pontuais de média, herdabilidade e coeficiente de variação e de estruturação (matriz de covariância ou de correlações), por meio da utilização da t écnica de decomposição espectral, e avaliar a eficiência da utilização das redes neurais artificiais na predição do valor genético em experimentos em blocos casualizados. O delineamento utilizado para simulação dos experimentos foi blocos casualizados contendo seis repetições. Foram simuladas 80 cenários, que possuíam valores estabelecidos para a média, a herdabilidade e coeficiente de variação experimental. Os experimentos simulados foram utilizadas para treinamento (experimento com 5000 genótipos) e validação (100 experimentos com 150 ou 200 genótipos para cada cenário). Para medir a eficiência da RNA na predição do valor genético comparou-se a correlação do valor de rede com o valor genético e a correlação do valor fenotípico com a valor genético. A média, herdabilidade, CV e a matriz de variância e covariância foram mantidos constantes em todos os experimentos simulados. Isso foi possível através da utilização da técnica de decomposição espectral. As redes neurais foram eficientes para predição do valor genético com ganho de 0,64 a 10,3% em relação ao valor fenotípico independente do tamanho de população utilizada, da herdabilidade ou do coeficiente de variação simulado. Assim concluiu-se que a preservação da matriz de variâncias e covariâncias de dados experimentais foi eficientemente realizada por meio do uso da decomposição espectral da matriz observada. Portanto os conjuntos de dados simulados podem ser utilizados para treinamento das RNAs mantendo as características da população original. Assim verificou-se que as RNAs é uma técnica mais eficiente na predição do valor genético em experimentos balanceados, quando comparado ao valor fenotípico (média).

Submitted by JYAN LUCAS BENEVENUTE null (jyanbenevenutte@gmail.com) on 2017-04-18T12:52:17Z No. of bitstreams: 1 Jyan Lucas Benevenute DISSERTAÇÃO.pdf: 2243221 bytes, checksum: 73e247ea0e0661031eef2500c7ca6f1c (MD5) / Rejected by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: No campo “Versão a ser disponibilizada online imediatamente” foi informado que seria disponibilizado o texto completo porém no campo “Data para a disponibilização do texto completo” foi informado que o texto completo deverá ser disponibilizado apenas 12 meses após a defesa. Caso opte pela disponibilização do texto completo apenas 12 meses após a defesa selecione no campo “Versão a ser disponibilizada online imediatamente” a opção “Texto parcial”. Esta opção é utilizada caso você tenha planos de publicar seu trabalho em periódicos científicos ou em formato de livro, por exemplo e fará com que apenas as páginas pré-textuais, introdução, considerações e referências sejam disponibilizadas. Se optar por disponibilizar o texto completo de seu trabalho imediatamente selecione no campo “Data para a disponibilização do texto completo” a opção “Não se aplica (texto completo)”. Isso fará com que seu trabalho seja disponibilizado na íntegra no Repositório Institucional UNESP. Por favor, corrija esta informação realizando uma nova submissão. Agradecemos a compreensão. on 2017-04-18T12:59:21Z (GMT) / Submitted by JYAN LUCAS BENEVENUTE null (jyanbenevenutte@gmail.com) on 2017-04-18T13:10:19Z No. of bitstreams: 1 Jyan Lucas Benevenute DISSERTAÇÃO.pdf: 2243221 bytes, checksum: 73e247ea0e0661031eef2500c7ca6f1c (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-04-18T13:12:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 benevenute_jl_me_jabo.pdf: 2243221 bytes, checksum: 73e247ea0e0661031eef2500c7ca6f1c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-18T13:12:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 benevenute_jl_me_jabo.pdf: 2243221 bytes, checksum: 73e247ea0e0661031eef2500c7ca6f1c (MD5) Previous issue date: 2017-02-14 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Embora novos genótipos de agentes Anaplasmataceae vêm sendo detectados em carnívoros selvagens, aves selvagens e cervídeos no Brasil, poucos são os estudos acerca da circulação destes patógenos em pequenos mamíferos em nosso território. O presente trabalho teve como objetivo investigar a presença de DNA de Ehrlichia e Anaplasma em roedores amostrados no Brasil. Entre 2000 e 2011, diferentes espécies de roedores [n = 60] foram capturadas em cinco biomas brasileiros. As amostras de baço de roedores foram submetidas a extração de DNA utilizando um kit comercial. A presença de DNA de Ehrlichia e Anaplasma foi investigada utilizando ensaios de PCR em tempo real e convencionais dirigidos a vários genes. Dentre as 458 amostras de baço de roedores testadas, 0,44% (2/458) mostraram-se positivas para Ehrlichia spp. e 2,40% (11/458) para Anaplasma spp., pelos ensaios de PCR em Tempo Real multiplex baseados no gene groESL. A quantificação média do número de cópias de um fragmento do gene groESL por microlitro variou de 1,071 x 102 a 2,808 x 102 cópias para Ehrlichia spp. e 1,123 x 100 a 1,310 x 102 para Anaplasma spp. Pelos ensaios de PCR convencional baseados no gene 16S rRNA, 1,09% (5/458) das amostras mostraram-se positivas para Ehrlichia sp. e 1,97% (9/458) para Anaplasma sp. Análises filogenéticas de máxima verossimilhança baseada em um fragmento de 546 pb do gene 16S rRNA posicionaram os genótipos de Anaplasma detectados em roedores próximos a A. phagocytophilum ou isolados de A. marginale e A. odocoilei. Por outro lado, os genótipos de Ehrlichia detectados em roedores amostrados mostraram-se intimamente relacionados com E. canis com base na análises filogenéticas de um fragmento de 358 pb do gene 16S rRNA. O presente estudo mostrou baixa ocorrência de Anaplasma e Ehrlichia em roedores no Brasil. / Although new genotypes of Anaplasmataceae agents have been detected in wild carnivores, wild birds and deer in Brazil, few reports have been done in order to assess the circulation of these pathogens in small mammals in our territory. The present work aimed to investigate the presence of Ehrlichia and Anaplasma in rodents sampled in Brazil. Between 2000 and 2011, different rodent species [n=60] were trapped in five Brazilian biomes. Rodents' spleen samples were submitted to DNA extraction using a commercial kit. The presence of Ehrlichia and Anaplasma DNA was investigated using real time and conventional PCR assays targeting several genes. Among 458 rodent tested spleen samples, 0.44% (2/458) were positive for Ehrlichia spp. and 2.40% (11/458) for Anaplasma spp., by a multiplex qPCR assay based on groESL gene. The mean quantification of the number of copies of 83pb groESL gene fragment per microliter ranged from 1,071 x 102 to 2,808 x 102 copies for Ehrlichia spp., and 1,123 x 100 to 1,310 x 102 for Anaplasma spp. Out of 458 samples tested, 1.09% (5/458) were positive for Ehrlichia sp. and 1.97% (9/458) for Anaplasma sp. by cPCR assays based on 16S rRNA gene. Maximum Likelihood phylogenetic analyse based on 546pb fragment of 16S rRNA gene positioned the Anaplasma genotypes detected in rodents near to A. phagocytophilum or A. marginale and A. odocoilei isolates. On the other hand, the Ehrlichia genotypes detected in sampled rodents were closely related to E. canis, according to the phylogenetic analyses based on 358pb 16S rRNA gene fragment. The present study showed a low occurrence of Anaplasma and Ehrlichia in rodents in Brazil. / CNPq: 133907/2015-5

Submitted by BEATRIZ MARQUES GABELINI null (bgabelini@gmail.com) on 2017-08-31T17:47:38Z No. of bitstreams: 1 Dissertação GABELINI, B M 2017.pdf: 19236253 bytes, checksum: f945ee682ee01330adc9122af7b4b3dd (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-08-31T19:36:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 gabelini_bm_me_rcla.pdf: 19236253 bytes, checksum: f945ee682ee01330adc9122af7b4b3dd (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-31T19:36:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 gabelini_bm_me_rcla.pdf: 19236253 bytes, checksum: f945ee682ee01330adc9122af7b4b3dd (MD5) Previous issue date: 2017-06-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os escorregamentos são movimentos de massa recorrentes na Serra do Mar. Quando ocorrem de forma generalizada podem causar prejuízos e perdas de vidas, como no acidente ocorrido no município de Caraguatatuba (SP) em 1967. Com o intuito de evitar estes danos, na literatura, são propostos vários métodos para analisar e prever a ocorrência destes processos. Diante do exposto, o objetivo principal desta pesquisa consiste em analisar a suscetibilidade a escorregamentos na região entre Caraguatatuba e São Sebastião (SP), utilizando a compartimentação fisiográfica e a análise quantitativa. Para alcançar estes objetivos foi realizada a análise e compartimentação do terreno e a análise quantitativa dos fatores condicionantes (declividade, hipsometria e geologia) e da compartimentação fisiográfica. Foram testados, em ambiente SIG, diversos cenários a partir de dois métodos distintos. No Método 1, os fatores condicionantes foram analisados através de pesos de influência. No Método 2, os fatores condicionantes mantiveram os mesmos pesos do Método 1 e foram somados pesos para as classes de cada fator. A compartimentação fisiográfica definiu 16 unidades. Os resultados demonstraram que a maioria dos escorregamentos se concentraram na unidade fisiográfica IV e que há um controle topográfico na distribuição dos escorregamentos entre 100 e 400 m de altitude, em encostas com declividade entre 15º e 30º, compostas por gnaisse migmatítico e granito-gnaisse. Os mapas elaborados a partir do Método 2 apresentaram expressiva concordância com o mapeamento de cicatrizes de Fúlfaro et al. (1976). O cenário escolhido como mais coerente foi o Cenário O, em que houve 60% de influência da declividade, 30% de hipsometria e 10% de geologia. Portanto, a partir do estudo da suscetibilidade, por meio da análise fisiográfica e quantitativa, é possível afirmar que o fator que tem mais influência na ocorrência de escorregamentos, na área de estudo, é a declividade, seguida da hipsometria e geologia. / Landslides are recurrent mass movements in the Serra do Mar. When they occur in a generalized way, as in the event occurred in Caraguatatuba city (SP) in 1967, they can cause a lot of environmental damage and deaths. In order to avoid this damage, several methods were proposed to analyze and predict the occurrence of this process. Considering the above, the main objective of this research is to analyze the susceptibility to landslides in the region between Caraguatatuba and São Sebastião (SP), using physiographic compartmentalization and quantitative analysis. In order to achieve these objectives, a physiographic analysis of the study area was carried out by the method of physiographic compartmentalization. Topographic and geological factors, as well as a physiographic comparison were analyzed using percentages of Class Frequency, Scars Concentration and Disproportionality Factor. We tested several scenarios from two different methods in a GIS environment. Method 1 by which the conditioning factors were analyzed through influence weights and Method 2, which maintains the influence weight for the factors and includes weights to the classes of each factor. The physiographic compartmentalization defined 16 units. Our results showed that most of the landslides were concentrated in the Physiographic Unit IV, and a topographic control in the distribution of landslides between 100 and 400 m of altitude, in slopes with declivity between 15 and 30º, composed of migmatite gneiss and granite-gneiss. Method 2 presented significant agreement with the scar mapping of Fúlfaro et al. (1976), and the scenario chosen as more coherent was Scenario O, which presented 60% influence of declivity, 30% hypsometry and 10% geology. The application of the different methods was satisfactory and based on the results we considered the utilization of the physiographic compartmentalization and the probabilistic analysis as important tools in the prediction of susceptibility, thus being able to collaborate with the territorial and environmental management of the cities.

Apesar da citricultura brasileira deter a liderança mundial na produção de laranjas e de suco de laranja concentrado congelado (FCOJ, frozen concentrated orange juice), observa-se baixo consumo no mercado interno de frutos e de suco in natura, o preferido pelo consumidor brasileiro. Assim, há grande interesse no desenvolvimento de produtos, técnicas de produção e conservação específica para variedades de laranja. As indústrias que produzem suco de laranja a partir do processamento da fruta in natura, conhecido como suco pasteurizado não proveniente do suco concentrado, Not From Concentrate (NFC), enfrentam sérios problemas tecnológicos. As frutas apresentam variabilidade química e sensorial devido às características intrínsecas, podendo variar o sabor e aroma devido às diferentes variedades disponíveis ao longo do ano. O objetivo do presente trabalho foi otimizar o processo da radiação gama em suco de laranja, escolhendo a melhor dose, a fim de reduzir a contagem microbiana e não comprometer as características sensoriais e físico-químicas do suco. Definidas as doses, o objetivo foi avaliar as características microbiológicas, físico-químicas e sensoriais do suco de laranja proveniente de três variedades cítricas, submetido aos processos de pasteurização e irradiação e desenvolver uma terminologia descritiva e o perfil sensorial de suco de laranja. As amostras foram avaliadas por uma equipe treinada de nove provadores e avaliadas quanto à aceitação, com escala hedônica de sete pontos por cinquenta provadores. Tendo em vista os resultados obtidos, a radiação gama e a pasteurização contribuíram para a redução das contagens microbiológicas. No entanto, sensorialmente, os tratamentos com 4,5 e 6,0 kGy foram considerados abaixo do limite de aceitabilidade, quanto ao sabor e à impressão global. As doses estudadas mostraram reduzido impacto sobre as características físico-químicas, independente das variedades cítricas. O tratamento com 3,0 kGy resultou em suco com aroma e sabor acentuado de remédio e cozido, que provavelmente terão influência negativa na aceitabilidade do produto / The Brazilian citrus is the global leader in production of oranges and frozen concentrated orange juice (FCOJ) there is low domestic consumption of fruits and fresh juice, preferred by brazilian consumers. Thus, there is a great interest by development of products, processes and specific conservation to the cultivation of citrus varieties for the juice\'s production. The industries produce orange juice from the fresh fruit processing, known as pasteurized juice not from concentrate juice (NFC), have serious technological problems. The fruits have chemical and sensory variability due to intrinsic characteristics and can vary the flavor and smell of orange juice because the different varieties available throughout the year. The aim of this study was to optimize the process of gamma radiation in orange juice, picking the best dosage in order to reduce microbiological count and that doesn\'t compromise the sensory characteristics and physicochemical juice. Defined dosages, the objective was to evaluate the microbiological, physicochemical and sensory orange juice from different varieties subjected to pasteurization and irradiation and develop a descriptive terminology and sensory profile of orange juice. The sensorial attributes analysed in this study were appearance, smell, flavor and texture. The samples were evaluated by a trained painel of nine tasters and evaluated for acceptance, with seven-point hedonic scale for fifty tasters. In view of these results, gamma radiation and pasteurisation contributed to the reduction of microbiological counts. However, sensory, treatments with 4.5 and 6.0 kGy were considered the limit of acceptability for flavor and overall impression. The doses studied showed little impact on the physical and chemical characteristics, independent of the citrus varieties. Treatment with 3.0 kGy resulted in juice with aroma and sharp taste of medicine and baked, which will probably have a negative influence on the acceptability of the product

Meliponiculture (or stingless beekeeping) is a powerful tool for sustainable economic development in the tropics. However, meliponiculture has many challenges as it lacks standardization in management and breeding practices. The aim of this thesis was to investigate stingless bee reproductive biology combined to management and breeding as background to meliponiculture improvement. In chapter 1, we performed a meta-analysis of heritability across the Hymenoptera in order to review current knowledge and discuss the challenges for bee breeding and conservation. In chapter 2, we assessed how sexual selection acts on male traits in the stingless bee Scaptotrigona aff. depilis and identified which traits may affect male fitness. In chapter 3, we estimated heritability and genetic correlations for the traits studied in the previous chapter, to understand how evolution shapes male traits and to identify important traits for breeding programs. Finally, in chapter 4 we investigated how the environment and long-term management influence colony productivity in Melipona subnitida (jandaíra), a commercially managed species in Northeastern Brazil. Our results revealed that morphological traits exhibit higher heritability estimates than fitness related traits, and in general, colony productivity traits showed potential for breeding. However, few studies are available for stingless bees yet. Male aggregations in S. aff depilis selected competitive males with higher quality sperm, indicating the importance of this mechanism in stingless bee mating biology. The studied male traits exhibited high heritability estimates, with exception of sperm length. Since aggregations selected males with shorter sperm, these results suggest selection for long-term sperm storage by queens and higher fertilization potential. The assessment of M. subnitida records revealed that honey production was affected by climate and management, and strategies to improve beekeeping practices were discussed. We believe this thesis provides important guidelines to establish successful stingless bee breeding programs / A meliponicultura, criação racional de abelhas sem ferrão, é uma poderosa ferramenta para o desenvolvimento econômico sustentável em regiões tropicais. No entanto, a prática da meliponicultura enfrenta diversos desafios, como a falta de padronização das técnicas de manejo e melhoramento genético. O objetivo desta tese foi investigar a biologia reprodutiva de abelhas sem ferrão aliada ao manejo e ao melhoramento genético, a fim de fornecer subsídios para o aprimoramento da meliponicultura. No capítulo 1, realizamos uma meta-análise sobre herdabilidade em Hymenoptera, a fim de compreender o conhecimento atual e os desafios associados ao melhoramento genético de abelhas e sua conservação. No capítulo 2, avaliamos como a seleção sexual atua em caracteres dos machos da espécie Scaptotrigona aff. depilis e identificamos quais caracteres podem influenciar o sucesso reprodutivo. No capítulo 3, estimamos a herdabilidade e correlações genéticas para os caracteres avaliados no capítulo anterior, a fim de entender como a evolução atua moldando os caracteres dos machos e quais desses caracteres podem ser utilizados em programas de melhoramento genético. Finalmente, no capítulo 4, investigamos o efeito do ambiente e do manejo na produtividade de colônias em Melipona subnitida (jandaíra), uma espécie manejada comercialmente no Nordeste brasileiro. Nossos resultados revelaram que caracteres morfológicos exibem estimativas de herdabilidade mais altas do que caracteres ligados ao sucesso reprodutivo. No entanto, poucos estudos com abelhas sem ferrão foram realizados até o momento. Agregações de machos em S. aff. depilis selecionaram machos mais competitivos que apresentaram maior qualidade espermática, indicando a importância desse mecanismo na biologia reprodutiva de abelhas sem ferrão. Os caracteres estudados apresentaram alta herdabilidade, com exceção do comprimento do espermatozoide. Como agregações selecionam machos com espermatozoides mais curtos, esses resultados sugerem seleção direcionada para um maior tempo de armazenamento do esperma pelas rainhas e maior potencial de fertilização. A avaliação dos registros de M. subnitida revelou que a produção de mel foi afetada pelo clima e pelo manejo, e estratégias a fim de melhorar as práticas da meliponicultura foram discutidas. Acreditamos que essa tese fornece importantes resultados para o estabelecimento de programas de melhoramento genético em abelhas sem ferrão

nÃo hà / A sociedade atual demonstra, em relaÃÃo ao sÃculo passado, uma maior preocupaÃÃo com a responsabilidade social e corporativa em geral, e as organizaÃÃes privadas, para atender Ãs demandas coercivas e de competitividade, nÃo ficam fora desse atual momento. Diante desse cenÃrio, o trabalho proposto, classificado como exploratÃrio, pesquisa de campo e descritivo, buscou conhecer o cenÃrio corporativo de indÃstrias localizadas no Brasil, de setores especÃficos, do ponto de vista de suas adoÃÃes prÃticas de Responsabilidade Social Corporativa. Para essa anÃlise, foi necessÃrio desenvolver uma pesquisa de natureza quantitativa, atravÃs de uma survey. O instrumento desenvolvido foi um questionÃrio estruturado construÃdo pela autora a partir da exploraÃÃo bibliogrÃfica, tendo como base a temÃtica Responsabilidade Social Corporativa e Stakeholders, o qual foi analisado à luz da estatÃstica, atravÃs do software SPSS. Esse instrumento permite avaliar a adoÃÃo de prÃticas de RSC das organizaÃÃes a partir de trÃs perspectivas: a da interaÃÃo da organizaÃÃo com os atores e assuntos internos à mesma; a da interaÃÃo da organizaÃÃo com os atores externos e, por fim, a da interaÃÃo da organizaÃÃo com a perspectiva ambiental na qual està inserida. A survey foi viabilizada com o questionÃrio fechado, onde as respostas deveriam ser marcadas numa escala Likert de cinco pontos, enviado a 246 indÃstrias que fabricam itens de diferentes segmentos (TÃxtil e Moda, EletrÃnico, SaÃde, Higiene e Beleza, Casa, Lazer e Brinquedos, e Alimentos) os quais sÃo comercializados no Varejo de Departamentos do Brasil. AlÃm disso, os stakeholders que estÃo diretamente ligados Ãs indÃstrias respondentes foram abordados em dois agrupamentos de questÃes, onde no primeiro buscou-se identificar a pressÃo de cada um deles do ponto de vista dos seus direcionamentos para que as prÃticas de RSC sejam uma realidade na indÃstria e, o segundo, buscou identificar a percepÃÃo das indÃstrias com relaÃÃo à forÃa do ambiente de alguns dos paÃses listados quanto Ãs suas preocupaÃÃes e, com isso, pressÃes visando a efetivaÃÃo da RSC. A pesquisa revelou que os resultados estÃo alinhados com o material teÃrico explorado e indica, a partir da taxa de retorno dos respondentes de 58,13%, que o setor de EletrÃnicos apresenta maior nÃmero de adoÃÃo das prÃticas levantadas dentre os cinco setores explorados. AlÃm disso, apontou que o stakeholder que mais pressiona a indÃstria a desenvolver aÃÃes responsÃveis à a MÃdia, seguido pelo Governo, justificado teoricamente pela preocupaÃÃo das organizaÃÃes em serem obedientes Ãs regras impostas pelos poderes pÃblicos ou pela preocupaÃÃo de manter uma boa imagem de empresa responsÃvel e, com isso, manter-se competitiva. AlÃm disso, constatou-se que hà um movimento de desenvolvimento de responsabilidades corporativas voltadas para o ambiente interno das organizaÃÃes, onde as preocupaÃÃes com os trabalhadores e com a qualidade na produÃÃo apresentam-se como prioritÃrias dentre as aÃÃes desenvolvidas, diferentemente das preocupaÃÃes com os agentes externos e meio ambiente. Por outro lado, sabe-se, a partir das interaÃÃes com os diversos respondentes e pelas revisÃes teÃricas, que a RSC està muito longe de ser uma realidade ideal no ambiente institucional brasileiro, sendo necessÃrio um maior envolvimento dos importantes stakeholders, como os consumidores, por exemplo, que possuem um grande poder de pressionar as organizaÃÃes a desenvolverem diferentes tipos de posturas responsÃveis mas que desconhecem ou nÃo utilizam-se deste poder.