La laitue (Lactuca saliva L.) est un légume-feuille de climat frais, ayant un cycle annuel. Son importance à la fois sociale et économique facilite la mise sur pied de programmes d'amélioration où les génotypes choisis sont préservés par clonage in vitro. Cette étude porte sur des facteurs d'ordres génétique, hormonal et cultural dans le but d'établir les conditions optimales pour la régénération des explantats, issus de bourgeons apicaux et axillaires, en plants de laitue producteurs de semences. La première expérience (chap. 1) cherchait à optimiser le processus d'excision des tissus sous-jacents de l'explantat. Quatre types de coupes (diamant « DNT », carré « CAR », diamétral « DAL » et transversal « TRA ») ont été effectués, à différents niveaux (3, 6 et 9 mm), sur l'explantat. Les résultats ont montré que les explantats issus de bourgeons apicaux régénèrent mieux que ceux provenant des axillaires et que la coupe DNT6 a induit le meilleur pourcentage de régénération en plantules viables. L'expérience suivante (chap. 2) étudie l'effet génétique du cultivar sur l'organogénèse. Pour ce faire, des explantats issus de bourgeons apicaux et axillaires ont été prélevés sur des cœurs provenant de 4 cultivars de laitue (Lactuca saliva L.) pommée (cvs. Estival, Ithaca, Eldorado) et romaine (cv. Sunbelt). Nous avons observé que les explantats issus de bourgeons apicaux sont encore ceux qui ont le mieux régénéré. De plus des différences génotypiques ont été décelées, bien que le pourcentage d'explantats régénérés en plantules viables n'ait pas été influencé par le cultivar. La troisième expérience surveille l'effet de différentes combinaisons d'acide 3-indoleacétique (AIA) et de 6-benzylaminopurine (BAP) sur le développement et la viabilité des plantules de laitue pommée issues de bourgeons apicaux. Les résultats ont montré que l'AIA n'a pas affecté la régénération des plantules de laitue tandis que la BAP a négativement influencé chacune des variables à l'étude en dehors du nombre de feuilles. Nous avons déduit que la régénération peut se faire sur un milieu de culture contenant uniquement de l'AIA à une faible concentration. Le problème lié à l'aseptisation en culture in vitro a été évoqué dans le chapitre 4. Une expérience exploratoire a permis de démontrer que l'aseptisation faite simplement avec de l'hypochlorite de sodium (NaOC1) donnait de meilleurs résultats qu'en combinaison avec du peroxyde d'hydrogène. Une seconde expérience a été effectuée en utilisant différentes concentrations de NaOC1 et durées d'exposition pour aseptiser des explantats issus de bourgeons apicaux et axillaires prélevés sur des cœurs de laitue pommée. Elle a révélé qu'une aseptisation faite avec du NaOC1 à 1.2% pendant 10 minutes donnait des résultats satisfaisants. En dernier lieu, le brunissement des tissus et du milieu de culture, a été abordé au chapitre 5. Trois types de traitements antioxydants ont été utilisés, pour la première fois, sur des explantats de laitue issus de bourgeons axillaires : l'application d'une période à l'obscurité en début de culture Gours); le trempage et la coupe dans une solution d'acide citrique et d'acide ascorbique; le trempage dans une solution et/ou la mise en culture dans un milieu contenant du polyvinylpyrrolidone (PVP). Bien qu'il n'y ait pas eu de différence au niveau de l'indice d'opacité du milieu entre ces traitements, nous avons constaté que le fait de tailler l'explantat dans une goutte d'acide ascorbique et d'acide citrique est à considérer puisque ce traitement est facile à appliquer en plus de favoriser le développement de feuilles (≥ 1 cm) et de racines (≥ 1 cm). En somme, pour régénérer des explantats en plantules de laitue saines et viables provenant de n'importe quel cultivar, il faut utiliser les bourgeons apicaux comme explantats et les aseptiser avec du NaOC1 1.2% pendant 10 minutes. Puis, les tissus sous-jacents aux bourgeons doivent être excisés selon un plan de coupe DNT6, dans une goutte de solution antioxydante avant que les bourgeons soient placés sur un milieu de culture contenant uniquement de l'AIA. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Lactuca saliva L., culture in vitro, bourgeons apicaux et axillaires, taille des explantats, hormones de croissance, aseptisation, brunissement

Les guêpes du genre Cotesia sont des endoparasitoïdes de Lépidoptères. Les larves se développent à l’intérieur du corps de la chenille et altèrent sa physiologie notamment pour échapper aux défenses immunitaires de l’hôte. Pour ce faire, ces guêpes ont développé une stratégie particulièrement originale : la domestication d’un virus, le bracovirus. Ce dernier a pour origine un virus intégré de manière stable dans le génome de la guêpe. La guêpe utilise ce bracovirus afin de produire des particules virales contenant des gènes de virulence qui permettent, une fois exprimés dans l'hôte, le développement des larves et le succès parasitaire. L'objectif de mon travail de thèse a été, par des approches de génomique évolutive, de replacer le bracovirus dans l'histoire évolutive de ces guêpes. / The wasps from the Cotesia genus are endoparasitoids of Lepidoptera. The larvae grow inside the host body and alter its physiology to escape the host immune defenses. To achieve that, these wasps developed a particularly original strategy: virus domestication. Named Bracovirus, it originates from a free-living virus stably integrated into the wasp genome. The wasp uses this bracovirus to produce viral particles containing virulence genes, once expressed in the host, allowing larval development and parasitic success. The aim of my thesis was to uncover, using evolutionary genomic approaches, the role of the bracovirus in the evolutionary history of theses wasps. At the population level, Cotesia sesamiae, used in Africa as biocontrol agents, is structured in several populations, including one strictly associated to a single host species.

L'objectif de cette recherche est d'étudier l'accomplissement dialogué de la version abstraite de tâche de sélection, en particulier les processus socio-cognitifs en jeu dans cet accomplissement. Pour ce faire, nous faisons accomplir la tâche à 32 dyades en situation de résolution dialogique coopérative. Nous analysons les 32 dialogues produits avec une théorie de la forme logique des événements interlocutoires tels qu'ils se présentent phénoménalement, c'est-à-dire avec de la langue naturelle dont la production séquentielle est distribuée sur plusieurs interlocuteurs : la logique interlocutoire. Dans une première analyse, nous décrivons les caractéristiques des 32 dyades du point de vue de leur gestion sociale et de leur gestion cognitive de la tâche. Dans une seconde analyse, nous nous concentrons sur les dialogues des 4 (sur 32) dyades qui réussissent la tâche. Nous montrons, contrairement à l'affirmation de nombreux chercheurs en psychologie du raisonnement, que ces dyades construisent effectivement des raisonnements lorsqu'ils accomplissent la tâche. Enfin, nous mettons en évidence la structure discursivo-cognitive construite par chacune des 4 dyades. / The objective of this research is to study the dialogued achievement of the abstract version of the selection, in particular the socio-cognitive processes concerned in this achievement. With this intention, we make 32 dyads achieve the task in situation of cooperative dialogical resolution. We analyze the 32 dialogues produced with a theory of the logical form of the interlocutory events such as they present ourselves phenomenally, with natural language whose sequential production is distributed on several interlocutors : the interlocutory logic. In a first analysis, we describe the characteristics of the 32 dyads from the point of view of their social management and their cognitive management of the task. In a second analysis, we concentrate on the dialogues of the 4 dyads which achieve the task successfully. We show, contrary to the assertion of many researchers in psychology of the reasoning, that these dyads actually build reasoning when they achieve the task. Lastly, we highlight the discursivo-cognitive structure built by each of the 4 dyads.

Le travail réalisé dans le cadre de cette thèse a deux objectifs principaux. Le premier est de contribuer `à la spécification de la reconfiguration dynamique des systèmes à base de composants. Le deuxième objectif est de s´sélectionner la configuration optimale parmi un ensemble de configurations qui fournissent des fonctionnalités identiques ou similaires. Le processus de sélection dépend des propriétés non-fonctionnelles du système. La propriété de reconfigurabilité est essentielle pour de nombreux systèmes à base de composants contemporains. En effet, cette propriété améliore la disponibilité, l'adaptabilité, l'évolutivité, la maintenabilité et la performance des systèmes tels que les systèmes avioniques, les commutateurs de télécommunications et les systèmes commerciaux. Pour ces systèmes, l'arrêt de longue durée n'est pas admissible pour des raisons s´sécuritaires ou économiques. L'adaptabilité et l'evolvabilité sont également des caractéristiques importantes pour ces systèmes qui ont besoin d'inclure des changements de l'environnement ou des nouvelles exigences des utilisateurs dans le logiciel. Toutes ces motivations plus montrent l'importance de permettre, dès la conception, la reconfiguration dynamique de systèmes. La reconfiguration est la capacité de modifier la structure ou le comportement d'un système à l'exécution et sans l'arrêter complétement. Le travail présenté dans cette thèse étudie les mécanismes et les techniques pour fournir la reconfigurabilité aux systèmes à base de composants. La fourniture de reconfigurabilité nécessite la prise en considération de la cohérence du système pendant et après la reconfiguration. Il y a deux sortes de cohérence : cohérence globale et cohérence locale. Dans cette thèse, nous proposons une approche pour préserver la cohérence globale d'un système à base de composants reconfigurable en utilisant un langage formel déclaratif, Alloy. Une autre approche est proposée pour préserver la cohérence locale en analysant la relation entre la dépendance indirecte et la reconfiguration dynamique. Enfin, la sélection de configuration consiste à choisir la configuration la plus optimale à partir d'un ensemble de choix dans le but de maximiser la satisfaction de l'utilisateur. Une approche proposée pour faire le meilleur choix en fonction des préférences de l'utilisateur exprimées sur des métriques non-fonctionnelles / The research of this thesis has two main goals. The first goal is to provide the reconfigurability feature to the component-based systems. The second goal is to select the optimal configuration from a set of configurations, which provide similar functionality. The selection process depends on the non-functional properties of the system. Reconfigurability is essential feature for many contemporary component-based systems. Reconfigurability enhances the continuous availability, the adaptability, the evolvability, the maintainability, and the performance. Avionics systems, telecommunications switches and some commercial systems require the high availability. For these systems, long shutting down is not allowable due to economical or safety reasons. The adaptability and the evolvability are also important features for those systems which need to accommodate the environmental changes or the new requirements of software users. The maintainability and the performance are important requirements for a large category of systems. All the previous motivations and more show the importance of having the reconfigurability. Reconfigurability is the ability to change the system structure or the system behavior at running time without stopping it. The work presented in this thesis investigates the required mechanisms and techniques in order to provide the reconfigurability feature to a component-based system. The provision of the reconfigurability feature requires preserving the system consistency during and after the reconfiguration. The consistency has two kinds: global consistency and local consistency. In this thesis, we propose an approach to preserve the global consistency of a reconfigurable component-based system using declarative formal language. Another approach is proposed to preserve the local consistency during the reconfiguration. The second approach investigates the relationship between the indirect dependency and the dynamic reconfiguration. Configuration selection is to select the most optimal configuration from a set of alternatives in order to maximize the end user satisfaction. The thesis proposes an approach to make the best selection depending on the user preferences

Depuis quelques années déjà de nombreux didacticiens proposent, en réponse à un constat d’échec de la programmation actuelle de l’enseignement, de débuter l’apprentissage de la théorie de l’évolution et plus particulièrement de la sélection naturelle dès la fin du cursus primaire. Cette proposition renvoie à un nécessaire questionnement didactique sur la définition du modèle de la sélection naturelle qui doit être l’objet d’apprentissage et sur les modalités de sa construction de la part des élèves. Dans cette étude, nous tentons d’étayer cette proposition en choisissant d’envisager l’apprentissage de ce concept à partir du cadre théorique de la problématisation. Une analyse épistémologique de la sélection naturelle et une revue de la littérature des conceptions et des obstacles des élèves lors de l’apprentissage de la théorie de l’évolution sont tout d’abord réalisées. Ensuite nous testons une situation didactique dont la passation vise à nous renseigner sur le processus d’apprentissage de cette notion chez des élèves de 6ème primaire en Fédération Wallonie-Bruxelles. La séquence que nous avons proposée aux élèves implique donc de développer un modèle explicatif articulant différentes nécessités construites en réponse à un problème de modification morphologique d’une population au cours du temps. En accord avec les notions scientifiques vues à ce niveau scolaire, nous avons décidé d’outiller les élèves avec un cadre conceptuel de type darwinien. A partir d’analyses conceptuelles, d’analyses de l’évolution des objets du discours et d’analyses des argumentations menées sur les échanges oraux et sur les productions écrites des élèves, il a été possible mettre à jour le travail des trois nécessités identifiées lors des analyses épistémologiques et lors de l’analyse à priori. Néanmoins plusieurs obstacles reconnus comme le finalisme, le vitalisme ou encore l’essentialisme sont identifiés dans les propos des élèves durant et après la passation de la situation didactique. Une explication travaillée lors des débats se rapproche cependant d’une conception darwinienne de la sélection naturelle. Il semblerait que cette construction s’appuie notamment sur des outils insérés dans le canevas de départ de l’activité et sur le travail de questionnement de l’enseignante. Ces derniers semblent donc permettre la construction d’une conception mobilisable du processus de variation morphologique héréditaire. Cependant aux termes de l’activité, les élèves rencontrent des difficultés pour valider l’une des explications qu’ils ont construites durant le débat. La justification par l’aléa semble aussi être difficile à prendre à charge pour les élèves. A partir de ces résultats nous envisageons finalement de nouvelles pistes de travail. / Doctorat en Sciences / info:eu-repo/semantics/nonPublished

Le contexte de cette thèse est la sélection de variables en grande dimension à l'aide de procédures de régression régularisée en présence de redondance entre variables explicatives. Parmi les variables candidates, on suppose que seul un petit nombre est réellement pertinent pour expliquer la réponse. Dans ce cadre de grande dimension, les approches classiques de type Lasso voient leurs performances se dégrader lorsque la redondance croît, puisqu'elles ne tiennent pas compte de cette dernière. Regrouper au préalable ces variables peut pallier ce défaut, mais nécessite usuellement la calibration de paramètres supplémentaires. L'approche proposée combine regroupement et sélection de variables dans un souci d'interprétabilité et d'amélioration des performances. D'abord une Classification Ascendante Hiérarchique (CAH) fournit à chaque niveau une partition des variables en groupes. Puis le Group-lasso est utilisé à partir de l'ensemble des groupes de variables des différents niveaux de la CAH à paramètre de régularisation fixé. Choisir ce dernier fournit alors une liste de groupe candidats issus potentiellement de différents niveaux. Le choix final des groupes est obtenu via une procédure de tests multiples. La procédure proposée exploite la structure hiérarchique de la CAH et des pondérations dans le Group-lasso. Cela permet de réduire considérablement la complexité algorithmique induite par la flexibilité. / This thesis takes place in the context of variable selection in the high dimensional setting using penalizedregression in presence of redundancy between explanatory variables. Among all variables, we supposethat only a few number is relevant for predicting the response variable. In this high dimensional setting,performance of classical lasso-based approaches decreases when redundancy increases as they do not takeit into account. Firstly aggregating variables can overcome this problem but generally requires calibrationof additional parameters. The proposed approach combines variables aggregation and selection in order to improve interpretabilityand performance. First, a hierarchical clustering procedure provides at each level a partition of the variablesinto groups. Then the Group-lasso is used with the set of groups of variables from the different levels ofthe hierarchical clustering and a fixed regularization parameter. Choosing this parameter provides a list ofcandidates groups potentially coming from different levels. The final choice of groups is done by a multipletesting procedure. The proposed procedure exploits the hierarchical structure from hierarchical clustering and some weightsin Group-lasso. This allows to greatly reduce the algorithm complexity induced by the possibility to choosegroups coming from different levels of the hierarchical clustering.

Depuis plusieurs années, un intérêt grandissant pour les véhicules hybrides se fait sentir de la part des constructeurs. Que ce soit pour un modèle hybride, thermique et électrique, ou un modèle tout électrique, la masse importante d'un véhicule de type roadster va à l’encontre des objectifs de réduction de la consommation de carburant et d’augmentation de l’autonomie. Aussi, l’optimisation du châssis d'un roadster a été entreprise pour réduire la masse globale du véhicule. Le but de cette maîtrise est de juger de la viabilité mécanique et économique d’un châssis d’aluminium pour le roadster. Au changement de matériau vient s’ajouter la sélection d’un procédé d’assemblage pertinent. Les critères de choix seront la réduction de la masse du châssis après assemblage, le contrôle de son coût, l’assurance de sa bonne résistance mécanique, notamment en fatigue, et la rigidité de la structure. Plusieurs méthodologies ont été élaborées pour guider la conception des pièces en aluminium et permettre le choix d’un procédés d’assemblage pertinent. Appliquées au roadster, elles ont permis d’aboutir à la création de structures optimisées. Les méthodologies développées ont été formalisées pour être utilisables sur d’autres projets similaires.

La plupart des outils d’aide à la conception industrielle disponibles aujourd’hui sont basés sur l’utilisation des modèles analytiques et statistiques. Ces modèles permettent de caractériser les relations entre les facteurs de conception et les critères de qualité afin de prédire la qualité d’un nouveau produit sans effectuer de nouveaux essais expérimentaux. Néanmoins, en raison de la complexité du comportement du produit et/ou du procédé, de l’incertitude dans le processus de conception et du faible nombre de données expérimentales, ces modèles classiques sont souvent moins efficaces pour traiter des applications complexes. Dans le cadre de ma thèse doctorale, nous travaillons essentiellement sur la conception des matériaux composites multifonctionnels à base de fibres. Dans ce contexte, nous avons amélioré les outils d’aide à la conception industrielle afin de développer, de façon systématique, des nouveaux matériaux. Pour cela, nous proposons une démarche utilisant non seulement les techniques classiques d’analyse de données, mais aussi les techniques de calcul avancé. En nous appuyant sur ces techniques, nous avons réalisé un système intégral en langage UML et programmation informatique, permettant d’identifier les paramètres pertinents du procédé et de la structure du matériau composite étudié selon les propriétés fonctionnelles souhaitées. Ce système a été appliqué à la maîtrise d’un procédé textile de renfort par aiguilletage et au développement de matériaux biocomposites pour lesquels les performances mécaniques et acoustiques sont pris en compte simultanément. / Most of the industrial design assistant tools that are available nowadays are based on the use of analytical and statistical models. Those methods enable to characterize the relations between the design factors and the quality criterions in order to predict the quality of a new product without doing new experimental tests. Nevertheless, because of the behavioural complexity of the product or the method, the uncertainty in the design process and the weak number of experimental data, those classical models are often less efficient to treat complex applications. As part of my doctoral thesis, we have essentially worked (si tu veux mettre au present we work) on the design of multifunctional composite materials made of fibres. In this context, we have improved the industrial design assistant tools in order to develop in a systematic way, new materials. For this, we propose an approach that not only uses the classical technics of data analysis but also the advanced calculation technics. By using those technics, we realized an integral system in UML language and an oriented object computer programming, that allow to identify the pertinent parameters of the method and of the structure of the composite material studied according to the desired functional properties. This system was applied to the control of a textile reinforcement process by needling and development of biocomposites materials which the mechanical and acoustical performances are simultaneously considered.

Dans le cadre de cette thèse, nous nous intéressons à la sélection des attributs en s'appuyant sur la théorie des graphes dans les différents contextes d'apprentissage non supervisé, semi-supervisé et supervisé. En particulier, nous nous intéressons aux scores de classement d'attributs basés sur des contraintes must-link et cannot-link. En effet, ces contraintes sont faciles à obtenir dans le cadre des applications réelles. Elles nécessitent juste de formuler pour deux données si elles se ressemblent et donc doivent être regroupées ensemble ou non, sans requérir d'informations détaillées sur les classes à retrouver. Les scores de contraintes ont montré de bonnes performances pour la sélection semi-supervisée des attributs. Cependant, ils sont fortement dépendants du sous-ensemble de contraintes disponibles. Nous proposons alors un score qui utilise à la fois l'ensemble des contraintes disponibles et les propriétés locales des données non contraintes. Des expériences réalisées sur des bases de données artificielles et réelles montrent que ce nouveau score est moins dépendant de l'ensemble de contraintes disponibles que les scores existants tout en atteignant des performances de classification similaires. La sélection semi-supervisée d'attributs a également été appliquée avec succès à la classification de textures couleur. En effet, parmi les nombreux attributs de texture pouvant être extraits des images couleur, il est nécessaire de sélectionner les plus pertinents afin d'améliorer la qualité de classification. / Within the framework of this thesis, we are interested in feature selection methods based on graph theory in different unsupervised, semi-supervised and supervised learning contexts. We are particularly interested in the feature ranking scores based on must-link et cannot-link constraints. Indeed, these constraints are easy to be obtained on real applications. They just require to formalize for two data samples if they are similar and then must be grouped together or not, without detailed information on the classes to be found. Constraint scores have shown good performances for semi-supervised feature selection. However, these scores strongly depend on the given must-link and cannot-link subsets built by the user. We propose then a new semi-supervised constraint scores that uses both pairwise constraints and local properties of the unconstrained data. Experiments on artificial and real databases show that this new score is less sensitive to the given constraints than the previous scores while providing similar performances. Semi supervised feature selection was also successfully applied to the color texture classification. Indeed, among many texture features which can be extracted from the color images, it is necessary to select the most relevant ones to improve the quality of classification.

Ce mémoire explore la manière dont la communauté Salafiste en ligne perçoit la théorie de l’évolution par la sélection naturelle. Les sources consultées sont deux essais ainsi que de multiples courts textes et fatwas. / This thesis explore how online Salafis perceive the theory of evolution by natural selection. The sources used include two essays as well as multiples short texts and fatwas.