Submitted by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-01-05T18:42:52Z No. of bitstreams: 2 rebeca_araujo_fiore.pdf: 1355098 bytes, checksum: 9068f2cf748b48bb87c50d51c7cdea53 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-01-05T18:43:21Z (GMT) No. of bitstreams: 2 rebeca_araujo_fiore.pdf: 1355098 bytes, checksum: 9068f2cf748b48bb87c50d51c7cdea53 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-01-05T18:43:26Z (GMT) No. of bitstreams: 2 rebeca_araujo_fiore.pdf: 1355098 bytes, checksum: 9068f2cf748b48bb87c50d51c7cdea53 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-01-05T18:43:42Z (GMT) No. of bitstreams: 2 rebeca_araujo_fiore.pdf: 1355098 bytes, checksum: 9068f2cf748b48bb87c50d51c7cdea53 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-01-05T18:43:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 rebeca_araujo_fiore.pdf: 1355098 bytes, checksum: 9068f2cf748b48bb87c50d51c7cdea53 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2014 / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do estado de Minas Gerais (FAPEMIG) / Em se tratando da contamina??o de ecossistemas por res?duos de defensivos agr?colas, especial aten??o ? dada para a classe dos herbicidas, em fun??o do volume de aplica??o. Os que possuem mol?culas sol?veis pass?veis de contamina??o de len??is h?dricos subterr?neos se destacam pela abrang?ncia dos efeitos negativos. Nesse sentido, objetivou-se selecionar esp?cies vegetais arb?reas interessantes na remedia??o de ambientes contaminados por res?duos de atrazine e 2,4-D. Foram avaliados 36 tratamentos compostos pela combina??o de 12 esp?cies florestais [Inga marginata (ing?), Schizolobium parahyba (guapuruvu), Handroanthus serratifolius (ip? amarelo), Jacaranda puberula (carobinha), Cedrela fissilis (cedro), Calophyllum brasiliensis (landin), Psidium mirsinoides (goiabinha), Tibouchina glandulosa (quaresmeira), Caesalpinia f?rrea (pau-ferro), Caesalpinia pluviosa (sibipiruna), Terminalia arg?ntea (capit?o) e Schinopsis brasiliensis (bra?na)] e tr?s solu??es simulando o composto lixiviado (atrazine, 2,4-D e ?gua ? controle), com quatro repeti??es. Foram feitas 3 aplica??es dos herbicidas atrazine e 2,4-D com intervalos de 20 dias (aos 60, 80 e 100 dias ap?s o plantio), sendo cada aplica??o correspondente ? metade da dose comercial dos produtos. Para as avalia??es de crescimento foram mensuradas a altura da planta, o di?metro do caule, o n?mero de folhas, a ?rea foliar e o ac?mulo de biomassa seca. Na estimativa do efeito visual dos herbicidas ?s plantas avaliadas, optou-se pela atribui??o de notas em escala de intoxica??o. Para verifica??o de capacidade remediadora das esp?cies arb?reas procedeu-se a semeadura da esp?cie indicadora para indicativo do res?duo do herbicida no solo, (Cucumis sativus (L.)). Posteriormente em amostras de solo provenientes da esp?cie remediadora mais promissora procedeu-se a an?lise de polimorfismo de comprimento de fragmento de restri??o terminal (T-RFLP), com intuito de caracterizar a diversidade microbiana presente. As esp?cies florestais sobreviveram ? aplica??o dos herbicidas, sendo que umas se mostram mais sens?veis do que outras. O ing? apresentou bons resultados de remedia??o com o bioensaio, assim como o ip? amarelo, apesar da sua sensibilidade aos herbicidas. Observou-se aumento no conte?do relativo de macronutrientes para as plantas sob a??o dos herbicidas, na maioria dos tratamentos. Os resultados de T-RFLP confirmaram a diversidade microbiana diferenciada associada ? rizosfera de ing?, principalmente quando submetida ? a??o de atrazine. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Ci?ncia Florestal, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2014. / ABSTRACT In the case of contamination of ecosystems by residues of pesticides, special attention is given to the class of herbicides, according to the application volume. Those with likely contamination of underground water soluble molecules sheets are distinguished by breadth of negative effects. In this sense, the aim of this work was to select interesting woody plant species in the remediation of contaminated by residues of atrazine and 2,4-D environments. Were evaluated 36 treatments consisted of combinations of 12 forest species [Inga marginata (ing?), Schizolobium parahyba (guapuruvu), Handroanthus serratifolius (ip? amarelo), Jacaranda puberula (carobinha), Cedrela fissilis (cedro), Calophyllum brasiliensis (landin), Psidium mirsinoides (goiabinha), Tibouchina glandulosa (quaresmeira), Caesalpinia f?rrea (pau-ferro), Caesalpinia pluviosa (sibipiruna), Terminalia arg?ntea (capit?o) and Schinopsis brasiliensis (bra?na)] and three leachate solutions simulate the compound ( atrazine , 2,4 - D and water - control),with four replicates each. Three applications of atrazine and 2,4-D were made at intervals of 20 days (at 60, 80 and 100 days after planting), each application was corresponding to half of the recommended. Evaluations of growth were measured plant height, stem diameter, number of leaves, leaf area and dry biomass. In estimating the visual effect of herbicides on plants assessed, was opted for the grading scale of intoxication. To check remediation ability of tree species proceeded seeding indicator species for indication of herbicide residue in the soil (Cucumis sativus (L.)). Later in soil samples from the species most promising remedial proceeded to analysis of length polymorphism terminal restriction fragment (T-RFLP), in order to characterize the microbial diversity present. Forest species survived the herbicide application, and some are more sensitive than others. The ing? had good results with the remediation bioassay, as well as the ipe amarelo, despite their sensitivity to herbicides. Observed increase in the relative content of macronutrients for plants under the effect of herbicides in most treatments. The results of T-RFLP confirmed the differentiated microbial diversity associated with the rhizosphere of ing?, especially when subjected to the action of atrazine.

As the base of the food chain, plankton affect the cycling of nutrients and organic matter within ecosystems and support production at higher trophic levels. The overall goal of this project was to examine how natural water quality fluctuations, such as changes in nutrients, temperature, and salinity, influence estuarine plankton community structure. To achieve this, I examined water quality as well as the diversity and biomass of eukaryotic plankton communities in a subtropical estuary located within the Mission-Aransas National Estuarine Research Reserve. The sampling sites included in this study consisted of three bay (Copano Bay West, Copano Bay East, Aransas Bay) and two river (Mission River Estuary, Aransas River Estuary) estuary sites. Water samples were collected monthly at the five sites from September 2011 to August 2012 and analyzed for a suite of abiotic and biotic variables. Eukaryotic plankton diversity and community structure were evaluated by using the terminal restriction fragment length polymorphism (t-RFLP) method. Although a narrow salinity gradient was present at the sampling sites, seasonal changes in water quality conditions were observed. In the river estuaries, water quality parameters defined three significant temporal periods at the Mission River Estuary site, whereas only one month differed at the Aransas River Estuary site, indicating little seasonal variation. The Copano Bay sites exhibited a seasonal pattern consisting of four periods, marked by a distinct fall (October, November, December) grouping, while Aransas Bay showed a seasonal pattern consisting of three periods, with no fall group. Even though the water quality conditions define different monthly groupings in the bay and river estuary sites, the same parameters – DOC, TDN, and pH – are the strongest drivers of the patterns at all of the sites. Seasonal and spatial distinctions in the Mission-Aransas Estuary eukaryotic plankton community composition were determined using t-RFLP. Frequent shifts in composition were apparent across samples collected at approximately bi-weekly to monthly intervals. There were significant differences (ANOSIM, p < 0.05) in community composition between the Aransas and Mission River Estuary and Aransas Bay sites. Although the overall ANOSIM tests show significance between eukaryotic plankton communities monthly and between the bay water quality periods, none of the pairwise comparisons were significantly different. However, the ANOSIM R-statistic for the monthly pairwise comparisons displays a general increasing trend over time from sampling, further highlighting the dynamic nature of the microbial eukaryotic assemblage within sites. / text

Most legume-nodulating rhizobia release hydrogen into the surrounding soil. The effect of hydrogen on soil bacterial communities in microcosms and surrounding legume roots was investigated by generating Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism (T-RFLP) profiles of bacterial 16S rRNA genes. (For complete abstract open document).

Estuaries are valuable economic resources to humans. However, changes in these ecosystems, such as alteration in nutrient availability, can impose eutrophic pressures. Traditionally, estuaries have been monitored through chemical analyses that measure factors such as sediment oxygen demand (SOD) and reduced forms of Fe(II), Mn(II), and H2S. These methods are time consuming and have been proven to be unreliable. This study was conducted to determine if using T-RFLP analysis could be used as a proxy for some of the current methods used to monitor eutrophication. Using SPSS to perform a principle component analysis, it was determined that connections can be made between the genetic fingerprints of microbial communities in estuaries and the biogeochemical markers that are currently used to monitor eutrophication. This method can potentially replace the current methods by allowing scientists to measure more sites rapidly and with reproducibility.

The effects of an organic biocide (CTN) with and without coded antioxidant (BHT) on microbial communities in SYP were assessed using terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) analyses in both field and accelerated decay laboratory studies. Ammoniacal copper quaternary (ACQ-C) was used as a positive control in the field study component, but not in the laboratory test. Field stakes were treated with 0.25 and 0.37% ammoniacal copper quat (ACQ-C), CTN (0.1 and 0.25%), CTN (0.1 and 0.25%) with 2% BHT added, 2% BHT alone, and controls were left untreated. In the field studies, preservative treatment slowed the initial colonization of wood by fungi. Higher species richness and diversity were found in non-biocidal treatments (BHT and untreated controls). Fungal communities in treated wood were different based on their species composition, but eventually became more similar to untreated controls. Preservative treatment increased richness and diversity of basidiomycete fungi, but overall presence of basidiomycetes was low compared to other fungi. Preservatives did not change the species composition of basidiomycetes compared to untreated controls. Preservative treatment initially increased bacterial richness and diversity, but over time these trends diminished to levels consistent with untreated controls. Preservatives changed the species composition of colonizing bacteria so that treated and untreated communities remained different over 15 months of soil exposure. Bacterial diversity was negatively correlated with CTN depletion at the lowest rate. In the accelerated decay laboratory test, the effects of CTN and/or BHT on bacterial, fungal, and basidiomycete communities in composted and uncomposted soil were evaluated over a 12 month period. Composted soil had less fluctuation in changing microbial diversity due to more constant moisture. The consensus of the analyses of the bacterial, fungal, and basidiomycete communities indicate that wood preservatives increased microbial species richness and diversity. Preservative treatment increased species turnover that decreased over time. Eventually, microbial communities approached a stable community structure consistent with untreated controls. Preservatives were completely degraded after 30 days exposure; however, definite changes in bacterial and fungal richness, diversity, and species composition were found. Basidiomycetes again represented the smallest portion of the microbial community involved in the overall decay process.

Os manguezais tropicais são considerados um dos ecossistemas mais produtivos do mundo, sendo caracterizados pela alta taxa de ciclagem de matéria orgânica e nutrientes que ocorre entre os oceanos e os ambientes terrestres. Embora os manguezais sejam considerados áreas de proteção ambiental, a destruição desses ambientes é progressiva, devido a atividades industriais e portuárias nos estuários. Nos manguezais, a ciclagem de nutrientes está diretamente relacionada às atividades e a diversidade das comunidades microbianas presentes no solo. Este trabalho está inserido em um projeto mais amplo dentro do programa BIOTA/FAPESP, no que tange aos estudos da biodiversidade no Estado de São Paulo e utilização dessa biodiversidade de modo sustentável. O objetivo deste trabalho foi avaliar as estruturas e diversidade das comunidades de Bacteria, Archaea e Fungi presentes no solo de manguezal preservado da Ilha do Cardoso-SP. As amostras foram analisadas pelas técnicas de T-RFLP, ARISA, clonagem e seqüenciamento a fim de obter uma caracterização das estruturas das comunidades microbianas de uma área de manguezal preservado em comparação com os ambientes adjacentes de restinga e floresta e também a um manguezal antropizado. Os resultados permitiram concluir que o manguezal possui características exclusivas, com a presença de organismos distintos, revelando um possível potencial biotecnológico a ser explorado. Adicionalmente, os dados revelaram que a ação antrópica afetou as estruturas dessas comunidades de modo a ser notada uma sensível diminuição de diversidade no manguezal antropizado, evidenciando, dessa maneira, a importância da preservação desse ecossistema / The tropical mangroves are considered one of the most productive ecosystems of the world, being characterized by the high tax of organic matter and recycling of nutrients, that happens between the oceans and the terrestrial habitats. Although the mangroves are considered areas of environmental protection, the destruction of those ecosystems is progressive, due to industrial and port activities in the estuaries. In mangroves, the recycling of nutrients is directly related to the activities and to the diversity of microbial communities present in the soil. This work is part of a wider project inside of the program BIOTA/FAPESP, with respect to the studies of the biodiversity in the State of São Paulo and use of that biodiversity in a maintainable way. The objective of this work was to evaluate the structures and diversity of communities of Bacteria, Archaea and Fungi present in the soil of preserved mangrove of Ilha do Cardoso-SP. The samples were analyzed by T-RFLP and ARISA techniques, cloning and sequencing in order to obtain a characterization of the microbial communities structure of preserved mangrove area in comparison with the adjacent environments of restinga (tropical moist forest) and forest and also to a degraded mangrove. The results allowed concluding that the mangroves present exclusive characteristics, with the presence of distinct organisms, revealing a possible biotechnological potential to be explored. Additionally, the data revealed that the human action affected the structures of those communities in a way to be noticed a sensitive diversity decrease in the degraded mangrove, evidencing, this way, the importance of the ecosystem preservation

Os manguezais tropicais são considerados um dos ecossistemas mais produtivos do mundo, sendo caracterizados pela alta taxa de ciclagem de matéria orgânica e nutrientes que ocorre entre os oceanos e os ambientes terrestres. Embora os manguezais sejam considerados áreas de proteção ambiental, a destruição desses ambientes é progressiva, devido a atividades industriais e portuárias nos estuários. Nos manguezais, a ciclagem de nutrientes está diretamente relacionada às atividades e a diversidade das comunidades microbianas presentes no solo. Este trabalho está inserido em um projeto mais amplo dentro do programa BIOTA/FAPESP, no que tange aos estudos da biodiversidade no Estado de São Paulo e utilização dessa biodiversidade de modo sustentável. O objetivo deste trabalho foi avaliar as estruturas e diversidade das comunidades de Bacteria, Archaea e Fungi presentes no solo de manguezal preservado da Ilha do Cardoso-SP. As amostras foram analisadas pelas técnicas de T-RFLP, ARISA, clonagem e seqüenciamento a fim de obter uma caracterização das estruturas das comunidades microbianas de uma área de manguezal preservado em comparação com os ambientes adjacentes de restinga e floresta e também a um manguezal antropizado. Os resultados permitiram concluir que o manguezal possui características exclusivas, com a presença de organismos distintos, revelando um possível potencial biotecnológico a ser explorado. Adicionalmente, os dados revelaram que a ação antrópica afetou as estruturas dessas comunidades de modo a ser notada uma sensível diminuição de diversidade no manguezal antropizado, evidenciando, dessa maneira, a importância da preservação desse ecossistema / The tropical mangroves are considered one of the most productive ecosystems of the world, being characterized by the high tax of organic matter and recycling of nutrients, that happens between the oceans and the terrestrial habitats. Although the mangroves are considered areas of environmental protection, the destruction of those ecosystems is progressive, due to industrial and port activities in the estuaries. In mangroves, the recycling of nutrients is directly related to the activities and to the diversity of microbial communities present in the soil. This work is part of a wider project inside of the program BIOTA/FAPESP, with respect to the studies of the biodiversity in the State of São Paulo and use of that biodiversity in a maintainable way. The objective of this work was to evaluate the structures and diversity of communities of Bacteria, Archaea and Fungi present in the soil of preserved mangrove of Ilha do Cardoso-SP. The samples were analyzed by T-RFLP and ARISA techniques, cloning and sequencing in order to obtain a characterization of the microbial communities structure of preserved mangrove area in comparison with the adjacent environments of restinga (tropical moist forest) and forest and also to a degraded mangrove. The results allowed concluding that the mangroves present exclusive characteristics, with the presence of distinct organisms, revealing a possible biotechnological potential to be explored. Additionally, the data revealed that the human action affected the structures of those communities in a way to be noticed a sensitive diversity decrease in the degraded mangrove, evidencing, this way, the importance of the ecosystem preservation

Os fungos representam cerca de 75% da biomassa microbiana em áreas florestais, desempenhando funções importantes, desde a mineralização dos resíduos orgânicos até a disponibilização de nutrientes para plantas por meio das associações micorrízicas, o que influencia a ciclagem de nutrientes e, consequentemente, o crescimento das árvores. O objetivo desse trabalho foi avaliar a comunidade de fungos do solo, da rizosfera e do sistema radicular de Eucalyptus grandis e Acacia mangium plantados em monocultivos e em consórcio, e encontrar respostas para os padrões observados por meio da correlação com os atributos físicos, químicos, biológicos e a profundidade do solo. A coleta das amostras foi realizada na Estação Experimental de Ciências Florestais de Itatinga, em 2016, quando as plantas estavam com 2 anos de idade. Foram coletadas amostras em quatro tratamentos: monoculturas de E. grandis e de A. mangium e consórcios de E. grandis e de A. mangium, nos quais foram construídas trincheiras para coleta das amostras nas camadas de 0-10, 10-20, 20-50 e 50-100 cm de profundidade. Foram caracterizados os atributos físicos e biológicos do solo e os atributos químicos do solo, da rizosfera e das raízes. Para a avaliação micorrízica, foi quantificado o número de esporos de fungos micorrízicos arbusculares (FMA) e as taxas de colonização radicular por FMA e por fungos ectomicorrízicos. Foi avaliada a morfologia das estruturas das micorrizas arbusculares e ectomicorriza (ECM). A estrutura da comunidade de fungos do solo e da rizosfera foi avaliada por meio da técnica de Terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP). Para isso, o DNA foi amplificado utilizando os primers ITS1f-FAM e ITS4 e a restrição dos fragmentos foi realizada com a enzima HaeIII. A abundância de cópias do gene ITS do solo e da rizosfera foi quantificada por PCR quantitativo (qPCR), utilizando os primers ITS1f e 5.8s. Os atributos físicos, químicos e biológicos tiveram poucas variações entre os tratamentos avaliados, sendo as maiores diferenças encontradas entre as profundidades. O número de esporos (<29) e as taxas de colonização micorrízica (<48%) foram baixos em todos os tratamentos, e se reduziram com o aumento da profundidade. As plantas de A. mangium não formaram micorrizas arbusculares. Nas raízes de E. grandis, não houve a formação de arbúsculos, mas foi verificada a presença de hifas enroladas (hyphal coils), estrutura de micorriza do tipo Paris. A anatomia das ECM confirmou a colonização destes fungos nas raízes das plantas estudadas. O qPCR mostrou maior abundância de genes ITS na rizosfera em relação ao solo, assim como nas camadas superficiais (0-10 cm) em relação às mais profundas (10 cm abaixo). A Análise de Coordenadas Principais revelou diferenças na estrutura das comunidades de fungos nos tratamentos estudados, principalmente para a região da rizosfera, diferenciando o perfil de fungos do monocultivo de E. grandis dos demais tratamentos, assim como a influência da A. mangium na estruturação da comunidade. A análise de redundância mostrou a influência de alguns atributos químicos nas taxas de colonização e estruturação da comunidade. Dessa forma, conclui-se que em sistema de consórcio, uma espécie de planta parece ser mais influente do que a outra na estruturação da comunidade de fungos e essa influência é mais evidente na rizosfera. Além disso, os atributos químicos são fatores importantes na organização da comunidade fúngica. / The fungi represent about 75% of the microbial biomass in forest areas, performing important functions, from the mineralization of the organic residues to the availability of nutrients to plants through mycorrhizal associations, which influences the nutrient cycling and, consequently, the growth of trees. The objective of this work was to evaluate the community of fungi of the soil, rhizosphere and root system of Eucalyptus grandis and Acacia mangium planted in monocultures and consortium, and to find explanations for the observed patterns through the correlation with physical and chemical soil attributes and soil depth. The samples were collected at the Experimental Station of Forest Sciences of Itatinga in 2016, when the plants were 2 years old. Samples were collected in four treatments: monocultures of E. grandis and A. mangium and consortia of E. grandis and A. mangium, in which trenches were constructed to collect samples in the 0-10, 10-20, 20 -50 and 50-100 cm deep. The physical and biological attributes of the soil and the chemical attributes of soil, rhizosphere and roots were characterized. For the mycorrhizal evaluation, the number of spores of arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) and the rates of root colonization by AMF and ectomycorrhizal fungi were quantified. The morphology of arbuscular mycorrhizal and ectomycorrhizal (ECM) structures was evaluated. The structure of the soil and rhizosphere fungi community by was evaluated by the technique of Terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP). For this, the DNA was amplified using primers ITS1f-FAM and ITS4 and restriction of the fragments was performed with the enzyme HaeIII. The abundance of ITS gene copies of soil and rhizosphere was quantified by quantitative PCR (qPCR), using primers ITS1f and 5.8s. The physical, chemical and biological attributes had few variations among the evaluated treatments, being the greatest differences found between the depths. The number of spores (<29) and mycorrhizal colonization rates (<48%) were low in all treatments, and reduced with increasing depth. A. mangium plants did not form FMA. In the roots of E. grandis, there was no formation of arbuscules, but we found the presence of hyphal coils, mycorrhizal structures of the Paris type. The anatomy of the ECM confirmed the colonization of these fungi in the roots of the studied plants. The qPCR showed higher abundance of ITS genes in the rhizosphere in relation to the soil, as well as in the superficial layers (0-10 cm) in relation to the deeper ones (10 cm below). The Principal Coordinates Analysis revealed differences in the structure of the fungal communities in the treatments studied, especially for the rhizosphere region, differentiating the fungal profile of the E. grandis monoculture from the other treatments, as well as the influence of A. mangium on the structure of the community. The redundancy analysis showed the influence of some chemical soil attributes on the rates of colonization and community structuring. Thus, it is concluded that in a consortium system, one plant species seems to be more influential than the other in structuring the fungal community, and this influence is more evident in the rhizosphere. In addition, chemical attributes are important factors in the organization of the fungal community.

Os manguezais sÃo ecossistemas entremarÃs produtivos e biologicamente importantes que ocorrem em regiÃes tropicais e subtropicais do mundo. Ãreas de manguezais nÃo perturbados fornecem habitats para uma variedade de plantas, animais e microrganismos. Estes ecossistemas recebem materiais sedimentares do mar e continente, tornando-se uma Ãrea de transiÃÃo com elevada produtividade. Importantes processos, tais como ciclagem de nutrientes, estÃo diretamente conectados à atividade e diversidade das comunidades microbianas dos solos do manguezal. No entanto, devido a sua localizaÃÃo estratÃgica, manguezais tÃm sido amplamente impactados por todo o mundo. A compreensÃo da estrutura e das funÃÃes das comunidades microbianas e suas adaptaÃÃes Ãs alteraÃÃes ambientais resultantes de xenobiÃticos, alteraÃÃes climÃticas e a prÃtica industrial, tais como a exploraÃÃo petrolÃfera, à essencial para manter ou restabelecer funÃÃes desejÃveis do ecossistema. Dessa forma, o presente estudo investigou a estrutura de comunidades bacterianas de amostras de solos do manguezal da Barra Grande, Icapuà (37 20âW, 4 40âS), por mÃtodo independente de cultivo usando Polimorfismo do Tamanho de Fragmentos de RestriÃÃo Terminal (T-RFLP) e tambÃm avaliou o mÃtodo dependente de cultivo (enriquecimento) para isolar cepas de bactÃrias com potencial para degradar petrÃleo e n-Hexadecano. Um total de trÃs pontos foi amostrado ao longo do manguezal, com 150 metros de distÃncia entre cada um deles. Temperatura, pH, salinidade, matÃria orgÃnica e granulometria dos solos foram medidas. AnÃlises de T-RFLP foram feitas apÃs a digestÃo de DNA genÃmico com as enzimas HhaI e MspI e o nÃmero e diversidade de Unidades TaxonÃmicas Operacionais (OTU) de cada amostra foi analisado pelo programa T-Align (Applied Biosystems). A cepa selecionada para testes de diferentes concentraÃÃes de n-Hexadecano foi identificada pelo seqÃenciamento do gene do rRNA 16S. Esta cepa foi tambÃm avaliada em relaÃÃo à susceptibilidade a radiaÃÃo UV e antibiÃticos. Os resultados mostraram que as comunidades bacterianas de solos do manguezal sÃo semelhantes em nÃmero de OTUs, mas diferem em composiÃÃo. Provavelmente a peculiaridade das variÃveis fÃsico-quÃmicas e granulometria do solo sÃo responsÃveis pelas diferenÃas na composiÃÃo e estrutura das comunidades bacterianas. Dezoito cepas de bactÃrias foram isoladas de culturas de enriquecimento com petrÃleo e quatro cepas mostraram potencial particular para degradar n-Hexadecano. Uma cepa identificada como Acinetobacter sp. IC18 foi caracterizada como uma boa degradadora de hidrocarboneto, pois foi capaz de degradar 1% do n-Hexadecano em 48 horas. Esta cepa tambÃm utilizou cerca de 30% de uma concentraÃÃo total de 20% (v/v) de n-Hexadecano durante o mesmo perÃodo de incubaÃÃo. AlÃm disso, IC18 foi susceptÃvel a vÃrios antibiÃticos e resistente à radiaÃÃo UV. Em conclusÃo, a estrutura da comunidade bacteriana de solos do manguezal da Barra Grande parece nÃo ser afetada pela presenÃa da exploraÃÃo petrolÃfera em IcapuÃ. AlÃm disso, os solos deste manguezal sÃo colonizados por vÃrias cepas com potencial para degradar hidrocarbonetos, que à particularmente interessante em virtude do risco de derramamentos de petrÃleo.

Os fungos representam cerca de 75% da biomassa microbiana em áreas florestais, desempenhando funções importantes, desde a mineralização dos resíduos orgânicos até a disponibilização de nutrientes para plantas por meio das associações micorrízicas, o que influencia a ciclagem de nutrientes e, consequentemente, o crescimento das árvores. O objetivo desse trabalho foi avaliar a comunidade de fungos do solo, da rizosfera e do sistema radicular de Eucalyptus grandis e Acacia mangium plantados em monocultivos e em consórcio, e encontrar respostas para os padrões observados por meio da correlação com os atributos físicos, químicos, biológicos e a profundidade do solo. A coleta das amostras foi realizada na Estação Experimental de Ciências Florestais de Itatinga, em 2016, quando as plantas estavam com 2 anos de idade. Foram coletadas amostras em quatro tratamentos: monoculturas de E. grandis e de A. mangium e consórcios de E. grandis e de A. mangium, nos quais foram construídas trincheiras para coleta das amostras nas camadas de 0-10, 10-20, 20-50 e 50-100 cm de profundidade. Foram caracterizados os atributos físicos e biológicos do solo e os atributos químicos do solo, da rizosfera e das raízes. Para a avaliação micorrízica, foi quantificado o número de esporos de fungos micorrízicos arbusculares (FMA) e as taxas de colonização radicular por FMA e por fungos ectomicorrízicos. Foi avaliada a morfologia das estruturas das micorrizas arbusculares e ectomicorriza (ECM). A estrutura da comunidade de fungos do solo e da rizosfera foi avaliada por meio da técnica de Terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP). Para isso, o DNA foi amplificado utilizando os primers ITS1f-FAM e ITS4 e a restrição dos fragmentos foi realizada com a enzima HaeIII. A abundância de cópias do gene ITS do solo e da rizosfera foi quantificada por PCR quantitativo (qPCR), utilizando os primers ITS1f e 5.8s. Os atributos físicos, químicos e biológicos tiveram poucas variações entre os tratamentos avaliados, sendo as maiores diferenças encontradas entre as profundidades. O número de esporos (<29) e as taxas de colonização micorrízica (<48%) foram baixos em todos os tratamentos, e se reduziram com o aumento da profundidade. As plantas de A. mangium não formaram micorrizas arbusculares. Nas raízes de E. grandis, não houve a formação de arbúsculos, mas foi verificada a presença de hifas enroladas (hyphal coils), estrutura de micorriza do tipo Paris. A anatomia das ECM confirmou a colonização destes fungos nas raízes das plantas estudadas. O qPCR mostrou maior abundância de genes ITS na rizosfera em relação ao solo, assim como nas camadas superficiais (0-10 cm) em relação às mais profundas (10 cm abaixo). A Análise de Coordenadas Principais revelou diferenças na estrutura das comunidades de fungos nos tratamentos estudados, principalmente para a região da rizosfera, diferenciando o perfil de fungos do monocultivo de E. grandis dos demais tratamentos, assim como a influência da A. mangium na estruturação da comunidade. A análise de redundância mostrou a influência de alguns atributos químicos nas taxas de colonização e estruturação da comunidade. Dessa forma, conclui-se que em sistema de consórcio, uma espécie de planta parece ser mais influente do que a outra na estruturação da comunidade de fungos e essa influência é mais evidente na rizosfera. Além disso, os atributos químicos são fatores importantes na organização da comunidade fúngica. / The fungi represent about 75% of the microbial biomass in forest areas, performing important functions, from the mineralization of the organic residues to the availability of nutrients to plants through mycorrhizal associations, which influences the nutrient cycling and, consequently, the growth of trees. The objective of this work was to evaluate the community of fungi of the soil, rhizosphere and root system of Eucalyptus grandis and Acacia mangium planted in monocultures and consortium, and to find explanations for the observed patterns through the correlation with physical and chemical soil attributes and soil depth. The samples were collected at the Experimental Station of Forest Sciences of Itatinga in 2016, when the plants were 2 years old. Samples were collected in four treatments: monocultures of E. grandis and A. mangium and consortia of E. grandis and A. mangium, in which trenches were constructed to collect samples in the 0-10, 10-20, 20 -50 and 50-100 cm deep. The physical and biological attributes of the soil and the chemical attributes of soil, rhizosphere and roots were characterized. For the mycorrhizal evaluation, the number of spores of arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) and the rates of root colonization by AMF and ectomycorrhizal fungi were quantified. The morphology of arbuscular mycorrhizal and ectomycorrhizal (ECM) structures was evaluated. The structure of the soil and rhizosphere fungi community by was evaluated by the technique of Terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP). For this, the DNA was amplified using primers ITS1f-FAM and ITS4 and restriction of the fragments was performed with the enzyme HaeIII. The abundance of ITS gene copies of soil and rhizosphere was quantified by quantitative PCR (qPCR), using primers ITS1f and 5.8s. The physical, chemical and biological attributes had few variations among the evaluated treatments, being the greatest differences found between the depths. The number of spores (<29) and mycorrhizal colonization rates (<48%) were low in all treatments, and reduced with increasing depth. A. mangium plants did not form FMA. In the roots of E. grandis, there was no formation of arbuscules, but we found the presence of hyphal coils, mycorrhizal structures of the Paris type. The anatomy of the ECM confirmed the colonization of these fungi in the roots of the studied plants. The qPCR showed higher abundance of ITS genes in the rhizosphere in relation to the soil, as well as in the superficial layers (0-10 cm) in relation to the deeper ones (10 cm below). The Principal Coordinates Analysis revealed differences in the structure of the fungal communities in the treatments studied, especially for the rhizosphere region, differentiating the fungal profile of the E. grandis monoculture from the other treatments, as well as the influence of A. mangium on the structure of the community. The redundancy analysis showed the influence of some chemical soil attributes on the rates of colonization and community structuring. Thus, it is concluded that in a consortium system, one plant species seems to be more influential than the other in structuring the fungal community, and this influence is more evident in the rhizosphere. In addition, chemical attributes are important factors in the organization of the fungal community.