Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-07-10T18:47:38Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1971791 bytes, checksum: 3db6edc8314196e7faded31d0a589269 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-10T18:47:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1971791 bytes, checksum: 3db6edc8314196e7faded31d0a589269 (MD5) Previous issue date: 2017-10-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / No presente trabalho apresentamos novos dados sobre taxonomia e história natural de Ololygon carnevallii, uma espécie de anuro descrita para o Parque Estadual do Rio Doce, município de Marliéria, estado de Minas Gerais, Brasil. No primeiro capítulo fizemos uma revisão taxonômica desta espécie através de dados integrativos como morfologia, morfometria, bioacústica e dados moleculares. No segundo capítulo descrevemos o uso do habitat, a dieta e a reprodução desta espécie, e no terceiro e último capítulo, descrevemos comportamentos defensivos desta espécie. Para realização deste estudo, visitamos coleções científicas e examinamos espécimes identificados como O. carnevallii e demais indivíduos com nomes relacionados a esta espécie (‘’cf’’, ‘’aff’’, ‘’gr’’.). Adicionalmente, realizamos campanhas de campo para coletar indivíduos de novas áreas de ocorrência e buscar dados sobre sua história natural. Analisamos 449 indivíduos pertencentes a 35 localidades, distribuídos em cinco bacias hidrográficas, em área de Mata Atlântica e transição com o Cerrado, todas no estado de Minas Gerais, Brasil. Como resultado do primeiro capítulo, descrevemos o canto de anúncio e de soltura de O. carnevallii. O primeiro canto se constitui de uma a três notas com duração de 0,002 a 0,05s e frequência dominante entre 3100,8Hz a 4823,4Hz. Dentre os parâmetros analisados, o canto de anúncio de O. carnevallii se difere de outros cantos de outras espécies principalmente pelo menor número de notas, menor duração e frequência dominante. O canto de soltura desta espécie se constitui de uma a duas notas com duração entre 0,007s e 0,055s e frequência dominante de 3273Hz a 4823,4Hz. Ainda no primeiro capítulo, descrevemos uma nova espécie para o gênero, denominada Ololygon ‘’Zona da Mata’’ sp. nov. cuja localidade tipo é Cataguases, estado de Minas Gerais, Brasil. Esta espécie é morfologicamente semelhante a O. albicans e O. trapiqueiroi, no entanto, o menor tamanho das fêmeas, formato do focinho, padrão de machas e parâmetros acústicos a distinguem prontamente dessas espécies. Os cantos desta espécie foram diferentes das demais espécies do gênero com canto descrito principalmente pelo menor número de notas e frequência dominante. Como resultado do segundo capítulo, obtivemos que machos, fêmeas e jovens utilizam os mesmos habitats e os itens alimentares encontrados pertencem ao filo Arthropoda, distribuídos em oito ordens. Dentre estas as que apresentaram maior importância relativa para os machos foram Araneae, Diptera e Ortoptera, e para as fêmeas foram Blattaria, Ortoptera e Araneae. A espécie apresenta dimorfismo sexual, onde as fêmeas são maiores que os machos, no entanto, o tamanho da fêmea não influencia no número estimado de ovócitos, que variou de 30 a 400. Como resultado do terceiro capítulo, observamos que O. carnevallii exibiu sete tipos de comportamentos defensivos: fugir, esconder, abrir a boca, tanatose, descarga cloacal, inflar o corpo e agachar. Devido a deficiência de dados sobre taxonomia e história natural de várias espécies, nosso trabalho apresenta informações inéditas que podem contribuir para a melhor diagnose e conhecimento sobre dados ecológicos de uma espécie que pertence a um grupo de taxonomia difícil. / This paper presents new data on the taxonomy and natural history of Ololygon carnevallii, an anuran species describe for the Parque Estadual do Rio Doce, Marliéria municipality, Minas Gerais state, Brasil. In the first chapter we did a taxonomic revision of this species through integrative data such as morphology, morphometry, bioacoustics and molecular data. In the second chapter we describe the habitat use, the diet and the reproduction of this species, and in the third and last chapter, we write up defensive behaviors of this species. To execute this paper, we visited scientific collections and examined specimens identified as O. carnevalli and others individuals with names related to it (“cf”, “aff”, “gr”). In addition, we carried out field samples to collect individuals from new areas of occurrence and seek data on their natural history. We analyzed 449 individuals belonging to 35 localities, distributed in five hydrographic basins, in the Atlantic Forest area in transition with the Cerrado biome, all in the Minas Gerais state, Brazil. As a result of the first chapter, we describe the advertisement call and release call of O. carnevallii. The advertisement call is consists of one to three notes duration of 0,002 to 0,05s, and a dominant frequency between 3100,8Hz and 4823.4Hz. Among the analyzed parameters, advertisement call of O. carnevallii differs from others species, mainly due to the lower number of notes, shorter duration and dominant frequency. The release call of this species consists of one to two notes with duration between 0.007s and 0.055s and a dominant frequency of 3273Hz to 4823.4Hz. Also in the first chapter, we describe a new species for the genus, called Ololygon '' Zona da Mata '' sp. nov. whose locality is Cataguases, Minas Gerais state, Brazil. This species is morphologically similar to O. albicans and O. trapiqueiroi, however, the smaller size of the females, snout shape, spot pattern and acoustic parameters distinguish it readily from these species. The calls of this species were different from the other species of the genus with described calls mainly by the smaller number of notes and dominant frequency. As a result of the second chapter, we obtained that males, females and juvenile use the same habitats, and the food items founded belong to the Arthropoda, distributed in eight orders. Among these, the orders that presented the greatest relative importance for the males were Araneae, Diptera and Ortoptera, and for females were Blattaria, Ortoptera and Araneae. The species exhibits sexual dimorphism, where females are larger than males, however, female size does not influence the estimated number of oocytes, ranging from 30 to 400. As a result of the third chapter, we observed that O. carnevallii exhibited seven types of defensive behaviors: fleeing, hiding, mouthgaping, thanatosis, cloacal discharge, puffing up the body and crouching down. Due to the lack of data on taxonomy and natural history of several species, our work presents unpublished information that can contribute to the best diagnosis and knowledge about ecological data of a species belonging to a group of difficult taxonomy.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:03:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1210_1.pdf: 3294326 bytes, checksum: 9fc990b48e1446999fb6ce37e99cda14 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Nematoda é um dos táxons mais abundantes e diversos dentre os metazoários, contudo, grande parte desta diversidade permanece desconhecida. A taxonomia do grupo muitas vezes tem uma história controversa, não somente em conseqüência do desenvolvimento dos procedimentos em sistemática, mas também por que relativamente poucos nematologistas produzem classificações detalhadas. Além disso, Nematoda é considerado um grupo de difícil identificação, devido ao seu tamanho corporal, o que reforça a necessidade da utilização de outros subsídios para acelerar a descoberta e classificação de sua biodiversidade. A fim de pôr em prática a taxonomia integrativa , onde vários tipos de dados são utilizados no estudo das espécies, este trabalho destinase a descrever uma nova espécie de Daptonema, revelar as suas relações filogenéticas, além de descrever e correlacionar sua estratégia reprodutiva com os parâmetros ambientais. As coletas de material biológico e dados abiótico foram realizadas na Bacia do Pina, quinzenalmente, na estação seca (setembro, outubro e novembro/2006) e na estação chuvosa (maio, junho e julho/2007), sempre na baixa-mar. Em dezembro, coletou-se uma amostra para extração de DNA e sequenciamento do gene 18S (rDNA). As seqüências foram analisadas pelos métodos de máxima parcimônia, neighbor-joining e inferência bayesiana. As correlações com os fatores ambientais foram realizadas utilizando a Correlação de Spearman. A espécie de Daptonema é nova por apresentar uma acentuada redução das setas cefálicas e a espícula em linha reta, característica esta que requer uma emenda na descrição do gênero. Em algumas fêmeas também se pode observar a incubação intra-uterina da prole, sendo tal característica considerada uma das autapomorfias da espécie. As análises apoiaram Daptonema sp. nov. como uma linhagem genética e evolutivamente distinta. Os dados também indicaram uma sinonímia e uma parafilia envolvendo Daptonema. Em Daptonema sp. nov. foi observado a ovoviviparidade, entretanto, o que torna o fenômeno peculiar é a presença de ovos e juvenis em vários estágios de desenvolvimento. Os resultados ecológicos mostraram que nenhum fator ambiental apresentou uma correlação significativa com o fenômeno reprodutivo em Daptonema sp. nov

Submitted by Natalie Mendes (nataliermendes@gmail.com) on 2015-11-17T23:50:59Z No. of bitstreams: 1 Disserta??o -Taiara Aguiar Caires.pdf: 5807922 bytes, checksum: c25f1e4054ec8de19fb9e5a8fc35a268 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-17T23:50:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Disserta??o -Taiara Aguiar Caires.pdf: 5807922 bytes, checksum: c25f1e4054ec8de19fb9e5a8fc35a268 (MD5) Previous issue date: 2013-03-15 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / (Benthic filamentous cyanobacteria from the coast of the State of Bahia, Brazil). Cyanobacteria exhibit morphological and physiological characteristics that enable them to occupy different environments, such as the marine. In these environments cyanobacteria present widely different morphologies depending on the environmental characteristics such as the type of substrate and the hydrodynamics. Despite the large expanse of coastal Brazil, this group is often excluded from floristic and ecological studies of marine communities. From Bahia, which has the longest coastline of Brazil, are listed only two benthic filamentous species, highlighting the need to conduct a survey to know the real diversity of cyanobacteria in this region. Thus, this study aims to know the biodiversity, the ecological and geographic distribution of marine benthic filamentous cyanobacteria from the coast of Bahia. We analyzed samples from 23 sites along the coastline comprising four economic macro-regions of the coast of Bahia. The samples were characterized with respect to microhabitat, habit and substrate type, in addition to frequency of occurrence. The preservation of the samples was performed in formalin (4%). Hoffmann et al. (2005) with modifications Kom?rek (2006) was the classification system used. The material was deposited in the Herbarium ALCB of UFBA with duplicates in the UEFS Herbarium. We identified 33 taxa belonging to 18 genera and nine families. The order Pseudanabaenales was the less diverse (5 taxa), while Oscillatoriales was the most representative (19 taxa). Nostocales was represented by nine taxa. Possibly, 10 taxa are new species and one is a new genus to science. 23 new occurrences are reported: 10 to Bahia, 11 to the Northeast region and two to Brazil. Most taxa showed rare occurrence (23 taxa), and only six species showed uncommon occurrence. Symploca cf. hydnoides was the species with the widest distribution in the coast of Bahia. The greatest diversity was observed in the protected region reef (17 taxa), followed by tide pool (11) and supralittoral (8). The epilithic habit was the most common, with 21 occurrences, followed by epiphytic, with 15. Only two species showed epizoic habit. Only Oscillatoriales occurred in all substrate types on the beaches. The more diverse macroregion was the South Coast, with 20 taxa, followed by the Metropolitan Region of Salvador, North Coast and Extreme South, with 17, 12 and 5 taxa respectively. This study can help in the development of new studies of cyanobacteria in coastal marine environment, due to the scant literature dealing on this topic. There are beaches and coastal environments subsampled in Bahia, as well as in Brazil, highlighting the need for further studies on this subject in order to demonstrate the actual biodiversity in this group on the Brazilian coast. / As cianobact?rias apresentam caracter?sticas morfol?gicas e fisiol?gicas que as possibilitam ocupar os mais diversos ambientes, como os marinhos. Nestes ambientes as cianobact?rias apresentam ampla variedade morfol?gica em fun??o das caracter?sticas ambientais, como o tipo de substrato e o hidrodinamismo atuante. Apesar da grande extens?o litor?nea do Brasil, este grupo ? comumente exclu?do dos levantamentos flor?sticos e dos estudos ecol?gicos das comunidades marinhas. Para a Bahia, que possui o maior litoral do Brasil, s?o referidas apenas duas esp?cies bent?nicas filamentosas, evidenciando a necessidade de realizar um levantamento para se conhecer a real diversidade de cianobact?rias nesta regi?o. Deste modo, o presente estudo tem por objetivo conhecer a biodiversidade, os aspectos ecol?gicos e a distribui??o geogr?fica das cianobact?rias marinhas bent?nicas filamentosas do litoral da Bahia. Foram analisadas amostras coletadas em 23 ?reas ao longo do litoral compreendendo quatro macrorregi?es econ?micas do litoral baiano. As amostras foram caracterizadas quanto ao microhabitat, h?bito e tipo de substrato, al?m da frequ?ncia de ocorr?ncia. A preserva??o das amostras foi feita em solu??o de formol (4%). O sistema de classifica??o utilizado foi o Hoffmann et al. (2005) com modifica??es de Kom?rek (2006). O material foi depositado no Herb?rio ALCB da UFBA com duplicatas para o Herb?rio da UEFS. Foram identificados 33 t?xons, distribu?dos em 18 g?neros e nove fam?lias. A ordem Pseudanabaenales foi a menos diversa (5 t?xons), enquanto Oscillatoriales foi a mais representativa (19 t?xons). Nostocales foi representada por nove t?xons. Possivelmente, 10 t?xons constituem novas esp?cies e um constitui novo g?nero para a ci?ncia. S?o relatadas 23 novas ocorr?ncias, sendo 10 para a Bahia, 11 para o Nordeste e dois para o Brasil. A maioria dos t?xons apresentou ocorr?ncia rara (23 t?xons), tendo apenas seis esp?cies com ocorr?ncia pouco frequente. Symploca cf. hydnoides foi a esp?cie com mais ampla distribui??o no litoral baiano. A maior diversidade foi observada na regi?o protegida do recife (17 t?xons), seguida da po?a de mar? (11) e do supralitoral (8). O h?bito epil?tico foi o mais comum, tendo 21 ocorr?ncias, seguido do epif?tico, com 15. Apenas duas esp?cies apresentaram h?bito epiz?ico. Somente as Oscillatoriales ocorreram em todos os tipos de substrato ocorrentes nas praias. A macrorregi?o mais diversa foi o Litoral Sul, com 20 t?xons, seguida da Regi?o Metropolitana de Salvador, Litoral Norte e Extremo Sul, com 17, 12 e 5 t?xons respectivamente. Este estudo serve de subs?dio para a realiza??o de novos trabalhos com cianobact?rias em ambiente marinho costeiro, visto a escassa bibliografia versando sobre este tema. Existem ainda praias e ambientes subamostrados no litoral baiano, assim como em todo o Brasil, evidenciando a necessidade de novos estudos com esta tem?tica, de modo a demonstrar a real biodiversidade deste grupo no litoral brasileiro.

La presente tesis se centra en el estudio de la taxonomía y sistemática del género Daucus, combinando para ello datos morfológicos y moleculares. Los análisis moleculares recientes han puesto de manifiesto que el linaje del género Daucus es polifilético. Dicho linaje incluye, además, a Athamanta della-cellae, Cryptotaenia elegans, Melanoselinum decipiens, Monizia edulis, Pachyctenium mirabile, Rouya polygama y las especies de los géneros Agrocharis, Pseudorlaya y Tornabenea. Por eso, en la medida de lo posible, también han sido incluidos en el presente estudio todos los citados táxones, así como otros considerados como grupo externo, representando las subtribus Daucinae, Ferulinae, Scandicinae y Torilidinae —v. gr.: Caucalis platycarpos, Cuminum cyminum, Ferula loscosii, Orlaya daucoides, Scandix pecten-veneris, Turgenia latifolia, etc. Dada la aparente marcada variabilidad morfológica asociada a los diferentes géneros, en primer lugar se realiza un estudio morfológico descriptivo lo más exhaustivo posible —sin preseleccionar caracteres concretos—. Así, se expone cuantiosa información sobre forma de vida, hojas, flores, androceo, polen, características externas e internas de los mericarpos, estilos y gloquidios. A partir de este estudio se pueden definir aproximadamente 80 caracteres que presentan utilidad variable a distintas escalas taxonómicas. La información descriptiva se recopila, en la medida de lo posible, en forma de tablas que permiten la comparación entre táxones. Además, se ofrecen diversas claves dicotómicas de identificación centradas en diferentes aspectos morfológicos estudiados. Con los conocimientos adquiridos tras el estudio morfológico exhaustivo, se seleccionan cuidadosamente ejemplares representativos de todos los táxones posibles y, a partir de ese material, se realiza el estudio molecular. Por un lado, se secuencia la región nuclear ITS, base de las filogenias moleculares publicadas por otros autores, con el fin de comprobar los resultados de dichas filogenias previas, pero añadiendo secuencias de táxones no considerados anteriormente; se obtiene así la inferencia filogenética basada en ITS más completa hasta la fecha. Adicionalmente se secuencian las regiones plastidiales rps16 intron y trnQrps16 que no se habían utilizado previamente en estudios focalizados en el género Daucus. En general, se confirman los resultados de filogenias previamente publicadas. Daucus resulta ser un género polifilético. Los táxones pertenecientes a otros géneros presentan, con frecuencia, mayor afinidad con la especie tipo —Daucus carota— que muchas de las especies tradicionalmente adscritas al propio género Daucus. Se resuelven errores de identificación existentes en filogenias publicadas previamente, sobre todo los relacionados con el complejo de Daucus guttatus, y que habían contribuido a aumentar la confusión en torno a dicho complejo. Aunque algunos clados no quedan resueltos satisfactoriamente, se realiza una propuesta de reconstrucción filogenética aunando las evidencias obtenidas con las tres regiones, junto con resultados publicados por otros autores. Para obtener una inferencia filogenética más precisa y resolutiva, se combinan las evidencias morfológicas y moleculares. Para ello, se evalúa el grado de congruencia de cada carácter morfológico con respecto a la inferencia filogenética predictiva propuesta. Del mismo modo se evalúan los números cromosomáticos —obtenidos tras la revisión bibliográfica—, así como las áreas de distribución inferidas a partir del numeroso material examinado durante el estudio morfológico. Mediante la combinación de caracteres moleculares y no moleculares se realiza una propuesta taxonómica integrada en la que se reconocen en el linaje «Daucus sensu latissimo» 12 géneros monofiléticos: Agrocharis, Cryptodaucus, Cyrenaica, Daucus, Melanoselinum, Neodurieua, Pachyctenium, Platyspermum, Pomelia, Pseudorlaya, Rhododaucus y Rouya. De entre ellos, 4 se proponen como géneros nuevos: Cryptodaucus, Cyrenaica, Neodurieua y Rhododaucus. Además, se recuperan los géneros Platyspermum y Pomelia, reconocidos como secciones de Daucus o como géneros independientes por autores previos. En total, son necesarias 17 nuevas combinaciones en el rango específico para acomodar los táxones estudiados en su nueva ubicación genérica. El género Daucus sensu stricto queda circunscrito de manera más restrictiva, incluyendo 6 especies, 5 de ellas tradicionalmente adscritas a Daucus sección Daucus y Pseudorlaya biseriata. Finalmente, según la nueva propuesta taxonómica, se aporta una clave dicotómica de identificación de todas las especies y se expone, para cada género, su caracterización morfológica diagnóstica y, para cada especie, la distribución general detallada, una selección de material estudiado y material gráfico representativo adicional.

Apesar do crescente aporte de informações na sistemática das serpentes Neotropicais, impulsionado pelo desenvolvimento de técnicas moleculares, as relações evolutivas intra e intertribais da subfamília Xenodontinae ainda são incipientes, e o posicionamento de gêneros e espécies de várias de suas tribos é desconhecido. A tribo Tachymenini (Dipsadidae, Xenodontinae) abriga sete gêneros e 33 espécies válidas, amplamente distribuídas na América do Sul, e representadas por um complexo histórico taxonômico e uma diversidade subamostrada. O presente projeto visou estudar as relações evolutivas de Tachymenini, de modo a testar as hipóteses de relacionamento entre seus gêneros e espécies em um contexto integrativo, e assim validar mudanças taxonômicas. Todos os táxons válidos de Tachymenini foram examinados, sendo este o trabalho mais abrangente para a tribo. Foram realizadas análises filogenéticas de Máxima Parcimônia, Máxima Verossimilhança e Bayeasiana, a partir da codificação de 70 caracteres morfológicos e do sequenciamento de três genes mitocondriais e três nucleares. As análises filogenéticas recuperaram Tachymenini como monofilética e seus gêneros mais especiosos, Tachymenis, Thamnodynastes e Tomodon, polifiléticos. Dois novos gêneros e quatro novas espécies são propostas, três espécies são sinonimizadas e dois outros gêneros são revalidados, resultando em uma nova classificação com 10 gêneros e 35 espécies para a tribo. Ainda, três complexos de espécies crípticas foram recuperados, o que aumentaria a diversidade de Tachymenini em pelo menos quatro novas espécies. O uso de dados morfológicos e moleculares combinados foi fundamental para o melhor entendimento das relações entre os gêneros da tribo, e para o estabelecimento de seus caracteres diagnósticos. Outros tipos de abordagens, além de complementação de lacunas amostrais, tanto morfológicas quanto moleculares, são necessárias em estudos sistemáticos futuros de Tachymenini e outros grupos de xenodontíneos / In spite of the incoming flow of information regarding the systematics of Neotropical snakes, largely driven by the innovation of new techniques for molecular data, the evolutionary relations among members of the subfamily Xenodontinae are incipient, and the phylogenetic status of several genera and species are still unknown. The tribe Tachymenini (Dipsadidade, Xenodontinae) is composed by seven genera and 33 species widely distributed throughout South America, and characterized by a complex taxonomic history and a hidden diversity. This project aimed to study the phylogenetic relations of Tachymenini, testing the evolutionary hypotheses of relationships among its genera and species in an integrative approach, and to further validate taxonomic changes. All Tachymenini taxa were analyzed in the most comprehensive study of the tribe. Maximum Parsimony, Maximum Likelihood and Bayesian analysis were performed using 70 morphological characters, three mitochondrial and three nuclear genes. Phylogenetic analysis recovered Tachymenini as monophyletic, and its most specious genera, Tachymenis, Thamnodynastes and Tomodon, as polyphyletic. Two new genera and four new species are proposed, three species are synonymized, and two other genera are resurrected, resulting in a new composition of 10 genera and 35 species for the tribe. Nevertheless, three cryptic species complexes were recovered, which would increase the diversity for Tachymenini in at least four other species. The combined use of morphological and molecular data was fundamental for a better understanding of the genera relationships, and for the establishment of diagnostic characters for the taxa. Other approaches, along with the improvement of morphological and molecular data deficiencies, are necessary in future studies of Tachymenini and other Xenodontinae systematics

O Estado da Bahia corresponde 35% da área total do nordeste brasileiro, abrangendo 417 municípios. Vários espécimes de moluscos terrestres e dulciaquícolas na coleção de Malacologia do Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo (MZSP, São Paulo, Brasil) foram coletados em municípios pertencentes a mesorregião Centro-Sul Baiano, a maior do estado. Contudo, cidades como Condeúba, Cordeiros, Mortugaba e Piripá permanecem sem registros, não só na coleção do MZSP, mas inclusive na literatura. A importância da diversidade de moluscos terrestres no Centro-Sul Baiano pode estar ligada ao fato da região incluir a fronteira entre três biomas brasileiros, Caatinga, Cerrado e Floresta Estacional Decídua. Trabalhos recentes realizados em áreas próximas aos municípios em questão, evidenciaram um número surpreendente de novos registros e novos táxons, o que justificaria um maior esforço pelo levantamento faunístico e conservação dos ambientes de Cerrado e Caatinga, que sofrem constante degradação. Assim, o presente estudo teve como objetivo central realizar o levantamento da malacofauna terrestre e dulcícola da mesorregião do Centro-Sul Baiano, usando dados da literatura, material histórico da coleção do MZSP, novas coletas, e a realização da sinopse taxonômica do material obtido. O levantamento resultou em 23 espécies de gastrópodes para os quatro municípios supracitados, das quais 95% evidenciaram novos registros. Exemplares das espécies Megalobulimus conicus e M. oblongus coletados, também foram estudados anatomicamente, revelando diferenças significativas entre as espécies. / Bahia state accounts for 35% of the total area of northeastern Brazil, including 417 municipalities. Several specimens of terrestrial and freshwater molluscs in the malacology collection of the Museum of Zoology of the University of São Paulo (MZSP, São Paulo, Brazil) were collected in municipalities belonging to the Central-South region of Bahia, the largest in the state. However, cities such as Condeúba, Cordeiros, Mortugaba and Piripá lack specific records, not only in the MZSP collection, but also in the literature. The importance of the diversity of terrestrial molluscs in the Center-South of Bahia may be related to the fact that the region includes the border between three Brazilian biomes, Caatinga, Cerrado and Atlantic Forest. Recent works carried out in areas close to the municipalities in question have revealed a surprising number of new records and new taxa, which would justify a greater effort for faunal surveys and the conservation of Cerrado and Caatinga environments, which suffer constant degradation. Thus, the present study aimed at surveying the terrestrial and freshwater malacofauna of the Center-South of Bahia, using data from the literature, historical material from the MZSP collection, new sampling, and the taxonomic study of the material obtained. The survey resulted in 23 species of gastropods for the four municipalities mentioned above, of which 95% are new records for the region. Specimens of Megalobulimus conicus and M. oblongus collected were also studied anatomically, revealing significant differences between species.

Orientador: Carlos Eduardo de Mattos Bicudo / Resumo: O estudo objetivou o inventário taxonômico dos gêneros, espécies e variedades taxonômicas da família Bacillariaceae presentes no Estado de São Paulo. A família Bacillariaceae compreende as diatomáceas com fíbulas na região interna da valva e frústula longilínea dos tipos fusiforme ou mais ou menos alongado, linear, lanceolado assimétrico, sigmoide, panduriforme ou elíptico. As estrias são lineares, uni ou bisseriadas e paralelas entre si na maioria das espécies. Os polos podem ser rostrados, capitados, obtusos, apiculados ou arredondados. A família é constituída por 18 gêneros que podem ocorrer em ambientes marinhos, estuarinos ou de água doce, sendo Nitzschia Hassal o mais especioso de todos. No Estado de São Paulo foram realizados estudos de cunho ecológico para os quais foram identificados 17 táxons em nível infragenérico e outros 13 em nível gênero. Entretanto, nenhum estudo sobre a taxonomia das Bacillariaceae foi realizado no Estado. O presente estudo contribui para o levantamento florístico das diatomáceas do Estado de São Paulo e serve de molde para realização de estudos congêneres em outros estados brasileiros. As análises foram realizadas utilizando amostras depositadas no Herbário Científico do Estado “Maria Eneyda P. Kauffmann Fidalgo” (SP) do Instituto de Botânica. Estas amostras vêm sendo coletadas desde 1960 e representam a essência da pesquisa. O plâncton foi coletado pelo arrasto subsuperficial de rede cônica confeccionada com tecido de náilon com malha de ab... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Study aimed at surveying the Bacillariaceae, including genera, species and varieties, occurring in the state São Paulo. The Bacillariaceae family comprises diatoms with fibulae in the internal region of the valve. The frustule may show various shapes as follows: short or long, straight, asymmetric lanceolate, panduriform and elliptic. Striae are uni or biseriate and parallel in most species. Valve ends may be rostrate, capitate, cuneate, obtuse, apiculate, and rounded. The family comprises 18 genera that may occur in marine, estuarine and freshwater environments. Nitzschia Hassal is the most specious genus. São Paulo state Bacillariaceae studies were mostly conducted with an ecological approach, identifying 17 taxa at infrageneric and 13 at generic level. Regrettably, no surveys were carried out aiming at the Bacillariceae floristics for that territory. Present study will improve the diatoms survey for the state São Paulo, and will provide a template for other Brazilian states. Analyses were made using samples deposited at the “Maria Eneida P. Kauffmann Fidalgo” Herbarium that belongs to the Botanical Institute of São Paulo. These samples have been collected since 1960 and represent the core of this research. Plankton samples were collected using subsurface towings with a conic 20 μm mesh nylon net. Periphyton was sampled by squeezing submerged plants and/or collecting whole submerged plants for later scraping at the laboratory. Rocks were also scraped using knives or razor b... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Regina Maria Barretto Cicarelli / Banca: Mauricio Bacci Junior / Banca: Fabrício José Jaciani / Resumo: O Brasil possui uma grande diversidade botânica, graças a seus diversos biomas, sendo a documentação das espécies existentes muito importante para o conhecimento da biodiversidade mundial. O gênero Senna possui 80 espécies enquanto o gênero Casearia apresenta 37 espécies no Brasil. O gênero Lantana possui cerca de 150 espécies. Alguns princípios ativos dessas espécies foram testados previamente no laboratório da Orientadora, apresentando atividade tripanocida promissora; entretanto existem dificuldades na classificação de alguns espécimes desses gêneros. Novas técnicas de identificação surgem para auxiliar na taxonomia. DNA Barcoding é uma técnica muito útil, pois é rápida, precisa, e com alta relação custo-benefício, utilizando uma pequena sequência de DNA para identificação. Suas aplicações vão desde identificar espécies crípticas até na luta contra o comércio ilegal de espécies ameaçadas de extinção e madeira extraída ilegalmente, dentre outras. Para realização desta técnica em plantas, utilizam-se genes localizados no cloroplasto - matK (codifica a proteína maturase K), rbcL (codifica a proteína ribulose 1,5-bifosfato ou Rubisco) e/ou regiões de espaçador intergênicos presente no cloroplasto (trbH-psbA). Neste trabalho em parceria com o NuBBE - Núcleo de Bioensaios, Biossíntese e Ecofisiologia de Produtos Naturais, visamos identificar as espécies pela técnica de DNA Barcoding, utilizando as regiões rbcL, trbH-psbA e ITS2, para para verificar a acurácia de banco de dados e melhorar a classificação taxonômica. Os resultados mostraram que a região rbcL é uma boa região para amplificação e sequenciamento, com boa taxa de discriminação de espécie. A região psbA-trnH é menos efetiva na discriminação de espécie comparada à região rbcL. A região ITS2 apresentou identidade com sequência de fungos, mostrando dificuldade na... / Abstract: Brazil has a great botanical diversity, thanks to its various biomes, and the documentation of existing species is very important for understanding the world's biodiversity. Senna genus has 80 species while Casearia genus has 37 species in Brazil. The Lantana genus has about 150 species. Some active compounds of these species were tested in the laboratory presenting promising trypanocidal activity; however there are difficulties in classification of some specimens of these genres. New identification techniques emerge to assist in taxonomy. DNA barcoding is a very useful technique because it is fast, accurate, and highly cost-effective, using a small DNA sequence for identification. Its applications range from identifying cryptic species to the fight against illegal trade in endangered species and illegally harvested timber, among others. To perform this technique, in plants, use genes located in the chloroplast - matK (encoding the protein maturase K) rbcL (encoding ribulose 1,5-bisphosphate or protein Rubisco) and/or intergenic spacer regions in the chloroplast (trbH-psbA). In this work in partnership with NuBBE - Center for Bioassays, Biosynthesis and Ecophysiology of Natural Products, we aimed to identify the species by DNA barcoding technique, using the regions rbcL, trbH-psbA and ITS2, to check the database accuracy and improve the taxonomic classification. The results showed that the rbcL region is a good region for amplification and sequencing, with good species discrimination rate. The psbA-trnH region is less effective in discrimination compared to the rbcL region. The ITS2 region showed identity with fungal sequence, showing difficulty in using this region. / Mestre

Os Pasiphaeoidea são um grupo de camarões Caridea pouco estudados ao nível mundial. O hábito de vida principalmente pelágico de águas profundas fazem com que sejam de difícil acesso e obtenção. Até hoje a superfamília Pasiphaeoidea está composta por 103 espécies agrupadas em sete gêneros, sendo Pasiphaea Savigny, 1816 o gênero mais diverso com 70 espécies. Nas Américas as referências aos Pasiphaeoidea são pouco frequentes e localizadas, não existindo revisões taxonômicas que englobem zonas geográficas maiores. O monofiletismo de Pasiphaeoidae em si e as relações entre os gêneros que compõem a família nunca foram abordados, mas estudos sobre a filogenia de Caridea que incluem material de Pasiphaeidae sugerem que o grupo seja parafilético. O objetivo desta tese é duplo: efetuar uma análise filogenética de Pasiphaeoidea com base em dados morfológicos e analisar taxonomicamente o grupo nas Américas. Para dar conta dos objetivos foram analisados material de 19 países das costas Atlântica e Pacífica das Américas. O material estudado correspondeu a 1.110 espécimes de 76 espécies (de um total de 103) de todos os sete gêneros da família. Representantes da família Procarididae foram utilizados grupo externo. 434 caracteres morfológicos foram testados. Espécimes de espécies polimórficas foram incluídos na análise como terminais. Pasiphaeidae s.s. é redefinida com base em 10 sinapomorfias. A família Leptochelidae é restabelecida para o gênero Leptochela Stimpson, 1860. Se propõe uma nova família, Psathyrocarididae, para as espécies do gênero Psathyrocaris Wood-Mason in Wood-Mason & Alcock, 1893. Pasiphaeidae s.s. engloba cinco gêneros: Pasiphaea Savigny, 1816, Eupasiphaea Wood-Mason in Wood-Mason & Alcock, 1893, Glyphus Filhol, 1884, Parapasiphae Smith, 1884, Phye Alcock, 1893 (reestabelecido para uma parte de Pasiphaea s.l.), juntamente com um novo gênero de Pasiphaeidae (proposto para uma parte de Pasiphaea s.l.), de eles todos estão representados nas costas das Américas. Os resultados obtidos recuperam a monofilia da superfamília Pasiphaeoidea, a presença de um primeiro par de maxilípedes com a porção distal do exópodo em forma de folha arredondada os diferencia do resto dos Caridea. Pasiphaeidae s.s. é restrita as espécies que possuam ou não um palpo mandibular (quando presente o palpo é do tipo pediforme), aparelho limpador das antenas no primeiro par de quelípodos, terceiro par de pereiópodos longos e delgados, quarto par de pereiópodos mais reduzido do que o quinto par. O gênero Pasiphaea s.s. é monofilético mas restrito a 25 espécies. Phye é monofilético e engloba 23 espécies. O gênero Parapasiphae é parafilético. O grupo nas Américas ficou composto por 34 espécies as quais se reúnem nas famílias: Leptochelidae (quatro espécies), Psathyrocarididae (uma espécie) e Pasiphaeidae s.s. com 29 espécies reunidas nos seis gêneros da família; Eupasiphae (duas espécies), Glyphus (uma espécie), Parapasiphae (três espécies), Pasiphaea s.s. (seis espécies), Phye (14 espécies) Pasiphaeidae novo gênero (duas espécies). / The Pasiphaeoidea is one of the least studied Caridean group to worldwide. The deep pelagic lifestyle is the reason that difficult its study. Until today 103 species are recognized, Pasiphaea is the most specious genera with more than 70 species. In America the references are locally restricted to just one country each. No wide geographic review already exists. The phylogeny and the inner relationships between genera are unknown. Some phylogenetic studies of the Caridea that include material of Pasiphaeid show a parafilético arrangement of the species. The scope of this thesis are: perform a phylogenetic analysis of Pasiphaeoidea based on morphological data and a taxonomic review of the Pasiphaeoidea in America. Material from 19 American countries results in 1110 specimens belong to 76 species of all seven genera of the family was analyzed. A matrix with 434 characters was performed. Specimens of Procarididae family of shrimps were used as out-group. Some polymorphic specimens were used as terminal to elucidate its taxonomic status, being the first time that specimens as terminals as used in a non-molecular analysis. The Pasiphaeidae was defined base on 10 sinapomorfias and Leptochelidae was reestablished for the Leptochela Stimpson, 1860. A new family was proposed Psathyrocarididae, for the species of the genera Psathyrocaris Wood-Mason in Wood-Mason & Alcock, 1893. Pasiphaeidae s.s. include five genera: Pasiphaea Savigny, 1816, Eupasiphaea Wood-Mason in Wood-Mason & Alcock, 1893, Glyphus Filhol, 1884, Parapasiphae Smith, 1884, Phye Alcock, 1893 (reestablished for a part of Pasiphaea s.l), with a new genera of Pasiphaeidae (proposed for a part of Pasipahea s.l) all of them with represents distributed in America waters. The obtained results recovered the monophyletic of the Pasiphaeoidea. The characters that define this group are the first pair of maxilliped with a distal portion of the exopod like a leaf and not as flagellum as in other Caridean. Pasiphaeidae s.s. is restricted just to species that share the next characters: with or without a mandibular palp, but when its present pediforme in shape. With an antennal flagellar grooming brush in the carpo-propodal on the first pereiopod. Third pair of pereiopod are very thin and long. Fourth pair of pereiopod are shorter than fifth. Pasiphaea s.s. is monophyletic, but restricted just to 25 species. Phye is monophyletic and contain 23 species. Parapasiphae is paraphyletic. Pasipaheoidea in America its composed for 34 species, which are reunited in three families: Leptochelidade (four species), Psathyrocarididae (one specie) and Pasiphaeidae s.s. with 29 species reunites in six genera: Eupasiphae (two species), Glyphus (one specie), Parapasiphae (three species), Pasiphaea s.s. (six especies), Phye (14 species) Pasiphaeidae new genera (two species).

Os ortópteros neotropicais, com exceção aos de importância econômica, de maneira geral, são muito pouco conhecidos em relação aos demais ortópteros ao redor do mundo. Isso devido à carência de trabalhos científicos para esse grupo, principalmente os estudos taxonômicos; consequentemente, o número de espécies descritas atualmente é muito subestimado. Não diferente, o gênero Eidmanacris Chopard, 1956, possui atualmente 20 espécies descritas, distribuídas nos domínios de Mata Atlântica e Cerrado, que se estendem pelas regiões sul, sudeste e centro-oeste brasileiras, além de também serem encontrados na Bolívia e Paraguai. São grilos ativos no período noturno, habitantes cavidades naturais, como tocas, barrancos, troncos de árvores mortas, fendas de rochas e cavernas. Neste estudo, o gênero foi revisado, incluindo a redescrição de espécies pouco conhecidas, descrição de sete novas espécies (E. scopula Campos, sp. nov., E. gigas Campos, sp. nov., E. neomarmorata Campos, sp. nov., E. desutterae Campos, sp. nov., E. putuhra Campos, sp. nov., E. fontanettiae Nihei & de Mello, sp. nov. e E. melloi Campos, sp. nov.), três novas combinações (E. speluncae (Mello-Leitão, 1937) comb. nov., E. minuta (de Mello, 1990) comb. nov. e E. endophallica (de Mello, 1990) comb. nov.) e uma sinonímia nova (E. lencionii Bolfarini, 2016 = E. dissimilis Desutter-Grandcolas, 1995, syn. nov.), totalizando 29 espécies para o grupo. Também foram feitos uma chave de identificação para o gênero e mapas de distribuição de suas espécies. Uma análise filogenética é apresentada incluindo 38 terminais, dos quais 12 foram considerados como grupo externo, e 98 caracteres morfológicos. Essa análise suportou a monofilia do gênero, permitiu visualizar seu relacionamento com táxons próximos de Luzarinae e sustenta a proposta de sinonímia de Endophallusia de Mello, 1990 com Eidmanacris Chopard, 1956, de modo a sua taxonomia refletir a monofilia indicada na análise filogenética / The Neotropical Orthoptera, excluding those with economic importance, are poorly known, in comparison with the orthopterans around the world. The main reason is the lack of scientific studies on this group, mainly taxonomic studies, resulting in a underestimated number of described species. Likewise, Eidmanacris Chopard, 1956 comprises 20 described species, and is mostly distributed on Atlantic Forest and Cerrado areas, extending from south, southeast and midwest Brazilian regions, and beyond, reaching Bolivia and Paraguay. Eidmanacris species are active at night, and inhabit natural cavities as burrows, bounds, hollow trees trunks, cavities in rocks and caves. In this study, the genus was reviewed, including the redescription of seven new species (E. scopula Campos, sp. nov., E. gigas Campos, sp. nov., E. neomarmorata Campos, sp. nov., E. desutterae Campos, sp. nov., E. putuhra Campos, sp. nov., E. fontanettiae Nihei & de Mello, sp. nov. and E. melloi Campos, sp. nov.), three new combinations (E. speluncae (Mello-Leitão, 1937) comb. nov., E. minuta (de Mello, 1990) comb. nov. and E. endophallica (de Mello, 1990) comb. nov.) and one synonym (E. lencionii Bolfarini, 2016 = E. dissimilis Desutter-Grandcolas, 1995, syn. nov.), totalizing 29 species in this genus. An identification key for the genus and a distribution map of species were made. A phylogenetic analysis is presented including 38 terminals, 12 of them as outgroup and 98 morphological characters This analysis attested the monophyly of the genus, showed its relationships with another Luzarinae taxa, and supported the proposal of synonymy of Endophallusia de Mello, 1990 with Eidmanacris Chopard, 1956, so that its taxonomy reflected the monophyly indicated in the phylogenetic analysis