El moteado del níspero, causado por el hongo Fusicladium eriobotryae es la principal enfermedad que afecta al cultivo del níspero, produciendo pérdidas importantes en la cosecha en los años con condiciones climáticas adecuadas. Sin embargo, no existen estudios sobre la epidemiología y el control de esta enfermedad, por lo que éstos constituyen el principal objetivo de la presente Tesis. Para ello, se va ha caracterizar in vitro y en campo la influencia de las principales variables climáticas en el desarrollo de F. eriobotryae, desarrollándose ecuaciones matemáticas que modelicen esta relación. Por otro lado, se va a llevar a cabo un modelo epidemiológico para el moteado del níspero capaz de predecir, en función de las principales variables climáticas el riesgo de infección. Además, se realizará un estudio del control de la enfermedad que comprenderá, por un lado, la evaluación in vitro y en planta de la efectividad de las principales materias activas utilizadas para el control del moteado del níspero, y por otro la evaluación del grado de resistencia de una colección de aislados de F. eriobotryae a DMI y Metil-Tiofanato y la caracterización molecular de la misma. / González Domínguez, E. (2014). Biology, epidemiology and control of Fusicladium eriobotryae, causal agent of loquat scab [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/38715

L'insuffisance cardiaque (IC) se définit par une incapacité du cœur à pomper suffisamment le sang pour répondre aux besoins en oxygène du corps. Le diabète de type 2 (DT2) est causé par une résistance à l'insuline, entraînant une absence de contrôle de la glycémie. Le DT2 et l’IC sont en nette progression (2% et 6,6% de la population canadienne). Le DT2 est un facteur de risque de l’IC, les patients IC étant quatre fois plus souvent diabétiques que la population générale. Récemment, l’inflammation a été montrée comme un mécanisme clef dans la progression de l’IC, et dans les conséquences du DT2. L’IC elle-même comprend deux physiopathologies : l’IC à fraction d’éjection réduite (IC-FER) et à fraction d’éjection préservée (IC-FEP). L’IC-FER survient le plus souvent après une lésion au myocarde tel un infarctus. Plusieurs stratégies contre l’IC-FER ciblent l’activité sympathique et le système rénine-angiotensine-aldostérone. L’IC-FEP survient à la suite d’une inflammation multifactorielle incluant souvent le DT2. L’IC-FEP est davantage inflammatoire que l’IC-FER. L’inflammation est donc un sujet d’étude dans la recherche de pistes thérapeutiques de l’IC et du DT2. Les neutrophiles sont les leucocytes les plus répandus dans la circulation (jusqu’à 70%). Les neutrophiles ont longtemps été considérés comme une population homogène. Cependant, il a été montré qu’ils se subdivisent en différentes populations. Notamment, dans des pathologies inflammatoires, des neutrophiles à haute et à faible densité ont été observés (HDNs et LDNs). Les HDNs correspondent aux neutrophiles étudiés depuis des décennies. Les LDNs ont été étudiés seulement récemment. Les LDNs sont quasi-absents en conditions physiologiques et leur présence semble exclusive à l’état pathologique. Ils sont davantage inflammatoires que les HDNs, notamment par une production augmentée de neutrophil extracellular traps (NETs). Ces filaments sont pro-inflammatoires, pro-thrombotiques et facilitent l’adhérence des leucocytes à l’endothélium. Le rôle des LDNs, et de leur NETs, n’a pas encore été étudié dans l’IC ni dans le DT2. Nous avons observé l’augmentation des taux de LDNs dans le DT2 et l’IC (jusqu’à 28 fois). Les taux de HDNs n’augmentent que de 1,5 fois. Les taux de LDNs corrèlent beaucoup plus avec les marqueurs inflammatoires que les HDNs. Les LDNs produisent 2 à 3 fois plus de NETs que les HDNs. Les LDNs sont autant adhérents que les HDNs à la matrice extracellulaire. Tous ces résultats ont été observés aussi bien dans l’IC-FEP, l’IC-FER, que le DT2. Ces études nous ont permis de montrer le rôle important des LDNs et des NETs dans l’inflammation des IC-FER et IC-FEP ainsi que dans le DT2. Dans la discussion, des figures complémentaires suggèrent que l’effet cumulé du DT2 et de l’IC se répercute de façon synergique sur les taux de LDNs et leur production de NETs, montrant que l’inflammation neutrophilique contribue à l’augmentation de la comorbidité du DT2 en IC. Ces études suggèrent aussi que les LDNs et les NETs pourraient être utilisés comme marqueurs prognostiques. Enfin, cela suggère que la NETose pourrait être une cible thérapeutique anti-inflammatoire dans la prévention et/ou le traitement de l’IC et le DT2. / Heart failure (HF) is defined by the inability of the heart to pump enough blood to meet the body requirements in oxygen. Type 2 diabetes (T2D) is caused by insulin resistance, resulting in a lack of glycemic control. T2D and HF are on the rise (2% and 6.6% of the population in Canada). T2D is a risk factor for HF, with HF patients being four times more likely to be diabetics than the general population. These conditions are active research topics. Recently, inflammation has been identified as a key mechanism in the progression of HF and in the consequences of T2D. HF itself has two physiopathologies: HF with reduced ejection fraction (HF-REF) and preserved ejection fraction (HF-PEF). HF-REF occurs mostly after a myocardial injury such as an infarct. Several strategies against HF-REF target sympathetic activity and the renin-angiotensin-aldosterone system. HF-PEF results from a multifactorial inflammation, often involving T2D. HF-PEF is more inflammatory than HF-REF. Inflammation is an active research topic in finding therapeutic approaches for HF and T2D. Neutrophils are the most abundant white blood cells in circulation (up to 70%). Long considered a homogeneous population. However, studies reveal their subdivision into different populations. In inflammatory conditions, high and low-density neutrophils (HDNs and LDNs) have been observed. HDNs are the well-known neutrophil population studied for decades. LDNs have been studied only recently. LDNs are nearly absent in physiological conditions and seems almost exclusive to the pathological state. LDNs demonstrates stronger pro-inflammatory activities than HDNs, partly du to their increased production of neutrophil extracellular traps (NETs). These filaments are pro-inflammatory, pro-thrombotic and induce leukocytes adhesion to the endothelium. The role of LDNs and their NETs has not been studied yet in HF and T2D. Elevated LDN levels were observed in T2D and HF (up to 28 times). HDN levels only increased by 1.5 times. LDNs correlated much more with inflammatory markers than HDNs. LDNs produced 2 to 3 times more NETs than HDNs and showed similar adhesion to the extracellular matrix. These results were observed in HF-PEF, HF-REF, and T2D. These studies demonstrate the significant role of LDNs and NETs in HF-REF, HF-PEF, and T2D inflammations. In the discussion, additional figures suggest that the cumulative effect of T2D and HF synergistically impacts LDN levels and NETs production, highlighting the contribution of neutrophilic inflammation to the increased comorbidity of T2D in HF. These studies also suggest that LDNs and NETs could be used as prognostic markers. Finally, it suggests that NETosis could be a therapeutic target in the prevention and/or treatment of HF and T2D.

This master’s thesis investigates the application of advanced machine learning models for the identification and classification of Swedish predators using camera trap images. With the growing threats to biodiversity, there is an urgent need for innovative and non-intrusive monitoring techniques. This study focuses on the development and evaluation of object detection models, including YOLOv5, YOLOv8, YOLOv9, and Faster R-CNN, aiming to enhance the surveillance capabilities of Swedish predatory species such as bears, wolves, lynxes, foxes, and wolverines. The research leverages a dataset from the NINA database, applying data preprocessing and augmentation techniques to ensure robust model training. The models were trained and evaluated using various dataset sizes and conditions, including day and night images. Notably, YOLOv8 and YOLOv9 underwent extended training for 300 epochs, leading to significant improvements in performance metrics. The performance of the models was evaluated using metrics such as mean Average Precision (mAP), precision, recall, and F1-score. YOLOv9, with its innovative Programmable Gradient Information (PGI) and GELAN architecture, demonstrated superior accuracy and reliability, achieving an F1-score of 0.98 on the expanded dataset. The research found that training models on images captured during both day and night jointly versus separately resulted in only minor differences in performance. However, models trained exclusively on daytime images showed slightly better performance due to more consistent and favorable lighting conditions. The study also revealed a positive correlation between the size of the training dataset and model performance, with larger datasets yielding better results across all metrics. However, the marginal gains decreased as the dataset size increased, suggesting diminishing returns. Among the species studied, foxes were the least challenging for the models to detect and identify, while wolves presented more significant challenges, likely due to their complex fur patterns and coloration blending with the background.

Neutrophile sind die häufigsten weißen Blutkörperchen im menschlichen Blut. Sie bilden die erste Verteidigungslinie und töten eindringende Krankheitserreger ab. Neutrophile extrazelluläre Fallen (NETs) sind netzartige Strukturen, die aus dekondensiertem Chromatin bestehen und mit zytotoxischen Proteinen dekoriert sind. NETs können Mikroben in vitro und in vivo einfangen und abtöten, sind aber auch für verschiedene Krankheiten verantwortlich. Frühere Studien haben eine spezifische Gruppe von 20-50 Neutrophilenproteinen identifiziert, die an NETs gebunden sind und von denen einige eine mikrobizide Wirkung haben. Wie diese Proteine an die NETs binden, wie sie interagieren und wie die Bindung ihre antimikrobielle Aktivität beeinflusst, ist noch nicht bekannt. In dieser Dissertation habe ich die Verteilung von acht neutrophilen Proteinen und Nukleosomen auf NETs mit Hilfe der Superauflösungsmikroskopie untersucht. Es wurden drei unabhängige Techniken mit Auflösungen von mehr als 90 nm verwendet. Die Nukleosomen bildeten auf den NETs periodische Cluster mit deutlich größeren Abständen im Vergleich zum kondensierten Chromatin. Drei NET-Proteine waren ebenfalls in periodischen Clustern auf den NETs lokalisiert und zwei von ihnen waren stark mit Nukleosomen kolokalisiert. Alle anderen analysierten Proteine zeigten keine Muster der Bindung an NETs. Zusammengenommen zeigen diese Ergebnisse, dass die Bindung von Proteinen an NETs zumindest teilweise spezifisch ist und teilweise durch Wechselwirkungen mit Nukleosomen vermittelt wird. Die erfolgreiche Einführung der superauflösenden Mikroskopie für schwierige NET-Proben in Kombination mit einem vorgeschlagenen rekonstituierten NET-System eröffnet neue Möglichkeiten für das Verständnis der molekularen Mechanismen der NET-Bildung und der Protein-Protein-Interaktion bei der NET-vermittelten Abtötung. / Neutrophils are the most abundant human white blood cell in circulation. They are the first line of defense and kill invading pathogens. Neutrophil Extracellular Traps (NETs) are weblike structures composed of decondensed chromatin decorated with cytotoxic proteins. NETs can trap and kill microbes in vitro and in vivo, but also mediate several diseases. Previous studies identified a specific set of 20-50 neutrophil proteins bound to NETs, several with microbicidal activity. It remains unknown how these proteins bind to NETs, how they interact and how binding influences their anti-microbial activity. In this dissertation, I studied the distribution of eight neutrophil proteins and nucleosomes on NETs using super-resolution microscopy. Three independent techniques with resolutions larger than 90nm were used. Nucleosomes formed periodic clusters on NETs, with significantly larger spacing compared to condensed chromatin. Three NET proteins also localized in periodic clusters on NETs and two of them strongly co-localized with nucleosomes. All other proteins analyzed showed no patterns binding to NETs. Taken together, these findings demonstrate that, at least some, protein binding to NETs is specific and in part mediated by interactions with nucleosomes. The successful introduction of super-resolution microscopy to the challenging NET samples in combination with a proposed reconstituted NET system opens new possibilities to understand the molecular mechanisms behind NET formation and protein-protein interaction in NET mediated killing.

Pulsed laser ablation, calcium, absorption spectrum, spectral line