This thesis addresses the mechanisms regulating the evolution and maintenance of colour polymorphism in the shrimp Hippolyte obliquimanus. It includes four chapters that illustrate, in an integrative approach, the ecological and behavioural consequences of different camouflage and habitat use strategies selected in main colour morphs. In the first chapter entitled Camouflage through colour change: mechanisms, adaptive value, and ecological significance, the physiological and structural mechanisms underpinning colour change, and hence camouflage, in different species were detailed within a general framework. Also in this section, both the adaptive value and the ecological and evolutionary implications of these processes were discussed. In the second chapter entitled Shape, colour plasticity, and habitat use indicate morph-specific camouflage strategies in a marine shrimp morph-specific colour change and habitat selection were investigated as potential mechanisms affecting camouflage efficiency and the natural distribution of H. obliquimanus colour morphs between macroalgal habitats formed by Sargassum furcatum and Galaxaura marginata. Moreover, morph-specific morphology and behavioural traits were also assessed. Shrimp showing a homogeneous coloration (H) changed colour when placed in colour-mismatching backgrounds and also exhibited a more robust shape associated to high substrate fidelity and specialization. On the other hand, striped translucent shrimp (ST) were not capable of colour change and showed high mobility, consistent with a more streamlined shape and a generalised use of algal habitats. In the third chapter entitled The adaptive value of camouflage and colour change in a polymorphic shrimp visual models and predation trials were used to test the adaptive value of camouflage and colour change of H. obliquimanus colour morphs against colour-contrasting macroalgae, which provide different levels of colour concealment. The low colour discrimination predicted by a visual model of a seahorse predator for pink shrimp against the red weed Galaxaura was directly translated to lower detection and consumption rates on this morph by captive seahorses in a laboratory experiment, demonstrating the high adaptive value of camouflage in this species. Finally, in the fourth chapter entitled Habitat-dependent niche partitioning between colour morphs of the algal-dwelling shrimp Hippolyte obliquimanus the trophic ecology of H and ST morphs when using Sargassum and Galaxaura habitats were assessed through stable isotope analysis. Morphs showed different isotopic signatures only in Galaxaura, where the supply of food resources are limiting, leading to a tropic niche diversification between H and ST shrimp and a probable relaxation of intra-specific competition. Conversely, in Sargassum, where resources are abundant, morphs coexistence is possible even without niche partitioning. Altogether, the results of this thesis contributed to a better understanding of the adaptive value and the underlying mechanisms controlling for the maintenance of colour polymorphism in H. obliquimanus. From both an ecological and evolutionary perspective, morph-specific strategies of camouflage and habitat use likely promote the stability of shrimp populations in a spatially heterogeneous and markedly seasonal habitat. / Esta tese aborda os mecanismos que regulam a evolução e manutenção do polimorfismo de cor no camarão Hippolyte obliquimanus ao longo de quatro capítulos que ilustram de forma integrada as consequências ecológicas e comportamentais das distintas estratégias de camuflagem e de uso do habitat selecionadas nos principais morfótipos da espécie. No Capítulo 1, intitulado Camouflage through colour change: mechanisms, adaptive value, and ecological significance, são detalhados de maneira geral os mecanismos fisiológicos e estruturais responsáveis pelo processo de mudança de cor e obtenção de camuflagem em diferentes espécies de animais. Nessa seção também é detalhado o valor adaptativo e as implicações ecológicas e evolutivas desses processos. No Capítulo 2, intitulado Shape, colour plasticity, and habitat use indicate morph-specific camouflage strategies in a marine shrimp, são investigados os processos de mudança de cor e de seleção de habitat como possíveis mecanismos reguladores dos padrões de camuflagem e de distribuição dos morfótipos de cor de H. obliquimanus entre os bancos das algas Sargassum furcatum e Galaxaura marginata. Além disso, também são avaliadas diferenças morfológicas e comportamentais entre os morfótipos na utilização dos habitats vegetados. Camarões caracterizados por uma coloração homogênea (H) mudam de cor quando em contato com substratos de coloração diferente à sua, exibindo também uma morfologia mais robusta e um comportamento de alta fidelidade e especialização aos substratos de macroalgas. Por outro lado, camarões transparentes listrados (TL) não mudam de cor e apresentam elevada mobilidade, consistente com uma morfologia mais hidrodinâmica e com uso mais generalizado dos habitats estudados. No Capítulo 3, intitulado The adaptive value of camouflage and colour change in a polymorphic shrimp, são utilizados modelos visuais e experimentos de predação para testar o valor adaptativo da camuflagem e mudança de cor em diferentes morfótipos do camarão H. obliquimanus quando estes estão associados a macroalgas que fornecem diferentes graus de semelhança cromática. O baixo grau de discriminação cromática previsto para camarões rosa em associação à alga vermelha Galaxaura através da modelagem visual de um predador (cavalo-marinho) resultou em baixas taxas de detecção e predação desse morfótipo por cavalos-marinhos em um experimento de laboratório, demonstrando um alto valor adaptativo da camuflagem nessa espécie. Por fim, no Capítulo 4, intitulado Habitat-dependent niche partitioning between colour morphs of the algal-dwelling shrimp Hippolyte obliquimanus, a ecologia trófica dos morfótipos de cor H e TL na utilização dos bancos de Sargassum e Galaxaura é avaliada através de análises de isótopos estáveis. Os morfótipos de cor mostraram diferenças nas razões isotópicas apenas em Galaxaura, onde a abundância de recursos alimentares é limitante, levando à diversificação de nicho trófico entre camarões H e TL e uma provável redução da competição intraespecífica. Por outro lado, em Sargassum, onde há abundância de recursos, a coexistência entre os morfótipos é possível mesmo sem partição de nicho ecológico. Em conjunto, os resultados obtidos nessa tese detalham tópicos centrais sobre os mecanismos reguladores e o valor adaptativo do polimorfismo cromático em H. obliquimanus. Dentro de uma abordagem ecológica e evolutiva, as diferentes estratégias de camuflagem e de uso de habitat dos morfótipos de cor parecem ser essenciais para o equilíbrio populacional da espécie, uma vez que os bancos de macroalgas utilizados como habitat pelos indivíduos são bastante heterogêneos e sua disponibilidade varia sazonalmente.

Os estudos sobre a relação habitat-espécie são importantes para a conservação, pois geram conhecimento sobre características de habitat essenciais para uma população. A incorporação destas informações em planos de conservação permite um manejo mais inteligente tanto da fauna como das áreas a serem preservadas. O presente estudo teve como objetivo estudar o uso e a seleção de habitat de Saltator atricollis e Cypsnagra hirundinacea na Estação Ecológica de Itirapina, região central do estado de São Paulo, Brasil. Ambas espécies são aves endêmicas do Cerrado e ameaçadas de extinção no Estado de São Paulo. O estudo foi desenvolvido entre setembro e dezembro de 2007 e setembro de 2008. O habitat foi analisado em duas escalas: o macro-habitat e o micro-habitat. Para analisar o habitat foram dispostos sistematicamente 84 pontos de amostragem na área de estudo. Na análise do macro-habitat foram utilizadas informações sobre o uso-disponibilidade das diferentes fisionomias sendo comparadas por meio do intervalo de confiança de Bailey. No estudo de micro-habitat foram medidas 11 características estruturais da vegetação ao redor de cada ponto de contato com S. atricollis, com C. hirundinacea e nos 84 pontos de amostragem. Para analisar as associações entre as características estruturais e as aves foi utilizado modelos de regressão logística selecionados pelo Critério de Informações de Akaike (AIC). Saltator atricollis selecionou áreas de campo cerrado, utilizou na mesma proporção que o esperado as áreas campestres e utilizou menos que o esperado o cerrado sensu stricto. Cypsnagra hirundinacea utilizou na mesma proporção que o esperado as áreas campestres e o campo cerrado enquanto o cerrado sensu stricto foi utilizado menos que o esperado. Quanto ao micro-habitat os melhores modelos para explicar a presença de S. atricollis incluíram maior densidade de árvores maiores que 2 m de altura e menor densidade de Syagrus petrea e de arbustos com até 1 m de altura. A presença de árvores é importante para a espécie, pois são utilizadas como poleiros durante o comportamento de sentinela. As altas densidades de Syagrus petrea e arbustos baixos (< 1m) podem diminuir a quantidade de moitas de gramíneas (utilizadas para a construção de ninhos) já que ambos ocupam o mesmo estrato. Assim, indiretamente, a presença de Syagrus petrea e arbustos baixos (< 1m) podem diminuir a disponibilidade de sítios reprodutivos. Além disso, podem atrapalhar o forrageamento por dificultar a utilização do estrato herbáceo. Os modelos que explicaram melhor a presença de C. hirundinacea foram representados por uma maior densidade de arbustos e árvores intermediárias e altas (entre 1 e 2 m, entre 2 e 4 m e maiores que 4 m de altura), maior densidade de braquiária e menor densidade de Attalea geraensis e de solo exposto. A presença de árvores é importante, pois a espécie as usa para forragear, construir ninhos e vigiar contra predadores. A relação positiva com a braquiária pode estar relacionada ao fato da espécie não utilizar o estrato herbáceo e ao mesmo tempo a invasão dessa gramínea, possivelmente, ainda não deve ter alterado a estrutura da vegetação lenhosa. Já a relação inversa entre a presença de C. hirundinacea e a densidade de solo exposto e de A. geraensis deve ocorrer, pois em ambientes com alta densidade dessas variáveis provavelmente há um baixo número de árvores o que diminui a disponibilidade de sítios de forrageamento e reprodutivos. Portanto para a manutenção dessas espécies é importante preservar as fisionomias abertas do Cerrado, as quais estão desaparecendo no estado de São Paulo, além disso recomenda-se manter nessas fisionomias a presença de algumas árvores e evitar a dominância de palmeiras rasteiras. / Studies about habitat-species relationships are important for conservation, because they generate knowledge about the essential characteristics of a habitat for a population. Incorporation of such information in conservation plans allows for a more intelligent management of both fauna and habitats that should be preserved. The aim of this study was to investigate the habitat use and selection by Saltator atricollis and Cypsnagra hirundinacea at Estação Ecológica de Itirapina in central State of São Paulo, Brazil. Both species are endemic birds of the Cerrado (Brazilian Savannah) and they are considered threatened with extinction in the State of São Paulo. The study was developed from September to December of 2007 and in September 2008. Habitat was analyzed in two scales: macrohabitat and microhabitat. To analyze the habitat 84 sampling points had been distributed at the study area. Macrohabitat selection was analyzed based on use-availability data of physiognomy and performing Baileys confidence interval. To investigate the use of the microhabitat there were estimated eleven structural characteristics of vegetation. These characteristics were described in each exact point that S. atricollis and C. hirundinacea had seen and in the 84 sampling points. The associations between the structural characteristics and the birds were identified by logistic regression models selected by Akaike Information Criteria (AIC). Saltator atricollis selected campo cerrado physiognomies (grassland savannah), it use campos (grasslands) at the expected proportion and cerrado sensu stricto (woodland savannah) less than expected proportion. Cypsnagra hirundinacea used both campos and campo cerrado areas at expected proportions while cerrado sensu stricto was used less than expected proportion. At the microhabitats level, the best models to explain the presence of S. atricollis included greater density of trees higher than 2 meters, lesser density of Syagrus petrea, and lesser density of bushes of to up to 1 meter height. The presence of trees is important to this specie, because the trees are used as perches during sentinel behavior. The high density of Syagrus petrea should diminish the amount of grassy because they use the same space on the habitat. Birds use the grassy to make its nest and the presence of Syagrus petrea and short bushes (< 1m) should indirectly reduce places for reproductive sites and might make foraging more difficult. The best models to explain the presence of C. hirundinacea were the one represented by a greater density of bushes and, trees of intermediate to greater height (between 1 and 2 meters, between 2 and 4 meters, and higher than 4 meters), greater density of Brachiaria grasses and lesser density of Attalea geraensis and exposed ground. The presence of trees is important because the species use them to forage, build nests and watch against predators. The positive relation with Brachiaria grasses might be occurs because C. hirundinacea dont use the herb layer. Possibly, the invasion of the Brachiaria grasses not having changed the structure of the vegetation yet. The inverse relation between the bird specie and the presence of exposed ground and A. geraensis, should occur because in habitats with high density of exposed ground and A. geraensis there are few places to feed and to reproduction. Therefore, to the maintenance of these birds species it is important preserving the open physiognomies of the Cerrado, which are disappearing from the State of São Paulo. Its also necessary to keep in theses physiognomies the presence of a few bushes and trees and also avoid the dominance of A. geraensis and Syagrus petrea.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A compreensão sobre a estrutura e funcionamento das comunidades biológicas é uma das principais questões das teorias ecológicas e principalmente no contexto de diversidade funcional, já que os atributos das espécies influenciam fortemente a distribuição e o papel que os organismos desempenham nos ecossistemas. Neste trabalho, tivemos como objetivo avaliar a variabilidade intraespecífica e interespecífica dos atributos ecológicos em duas assembleias de peixes localizadas em riachos sujeitos a diferentes condições físicas. A variação na utilização dos recursos, seja entre indivíduos e/ou entre espécies pode nos ajudar a compreender as interações bióticas e a estrutura das populações e comunidades de peixes. Os atributos referentes a morfologia, dieta, uso do habitat e alguns aspectos comportamentais foram avaliados e suas variações foram testadas a partir dos valores individuais. As coletas foram realizadas em dois riachos tropicais, sendo um localizado no ambiente da Mata Atlântica e o outro, no ambiente do semiárido brasileiro. Além das análises empíricas, uma revisão bibliográfica sobre o tema e uma possível composição funcional dos grupos de peixes de riacho foram descritas no capítulo 1 da presente tese. Nos capítulos 2 e 3, foram testadas as hipóteses de que existe alta variabilidade intraespecífica em relação aos atributos ecológicos dos peixes e que esta variabilidade é influenciada pela alta disponibilidade de recursos, enquanto no capítulo 4, a variação entre os indivíduos foi testada em relação a aspectos comportamentais. Nossos resultados revelaram que, de fato, a variação intraespecífica foi alta em ambas as assembleias, porém na assembleia do semiárido, esta variabilidade foi maior. Este resultado pode estar relacionado a alta disponibilidade de recursos espaciais encontrada nesta localidade. A morfologia e a dieta apresentaram correlação significativa, porém foi fraca em ambas as assembleias, demonstrando assim a importância de mensurar esses dois aspectos da biodiversidade dos peixes. Os resultados relacionados ao uso do habitat também apresentaram alta variabilidade entre os indivíduos e entre as espécies nos dois riachos em estudo. A assembleia do semiárido apresentou maior variabilidade física com potenciais microambientes formados por bancos de macrófitas a serem explorados pelos organismos, permitindo assim, o uso diferenciado e a escolha individual por diferentes recursos espaciais. A variabilidade individual também foi encontrada no comportamento social de duas espécies desta assembleia, onde houve formação de cardumes compostos por indivíduos maiores nas extremidades com maior capacidade de fuga na relação presa-predador. Neste sentido, a alta variação intraespecífica para diversos aspectos funcionais avaliados neste trabalho evidencia ainda mais a importância de mensurar as características ecológicas dos peixes a partir de valores individuais. Adicionalmente, a partir desta ferramenta, podemos compreender melhor a complementaridade da especialização e originalidade ecológica dos indivíduos e finalmente, sugerir de que forma os atributos funcionais dos organismos influenciam a estrutura das populações e comunidades de peixes de riachos tropicais / Describing biological community structure and function is one of the principal issues on ecological theories. This issue is of particular interest for functional diversity since species traits can strongly influence the function and distribution of individuals in the ecosytem. Here we evaluated the intraspecific and interspecific variability of ecological traits in two stream fish assemblages under different physical conditions. Resource use variation within and/or between species can elucidate biotic interactions and the structure of fish communities and populations. Morphology, diet, habitat use, and behavioral aspects were analyzed and their variability was tested through individual values. We collected the samples in one stream located in Rainforest and the other in the Semiarid. Additionally, we did a review about the studies that explore this issue and suggested a possible functional composition of stream fish in chapter 1. The chapters 2 and 3 include the hypothesis that there is high intraspecific variability of fish traits and that this variability is higher at the environments with high resource availability. In the chapter 4 we tested the intraspecific variability of behavioral traits. Our results indicated that the intraspecific variability was high in both assemblages but when we compared the two assemblages, this variability was higher at the semiarid stream. This result can be related to the higher physical resources availability in this assemblage. The morphology and diet were correlated, but this correlation was weak in both assemblages, highlighting the importance of measuring these two aspects of fish biodiversity. The variability of habitat use was also high within and between species and it was influenced by stream physical structure. The semiarid stream presented potential microhabitats with macrophytes that can be explored by the individuals, allowing for differences in habitat use and individual choice for different spatial resources. The individual variability was also expressive on the social behaviour of two species in the semiarid stream, with schools formed by larger individuals at the edges, which have higher ability to avoid predation. Thus, the high intraspecific variability in some ecological traits confirm that it is important to quantify the fish traits from individual values. Moreover, we can explain better the complementarity of ecological specialization and originality from intraspecific variability. Finally, we can understand the influence of ecological traits on population and communities structure of tropical stream fishes

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A compreensão sobre a estrutura e funcionamento das comunidades biológicas é uma das principais questões das teorias ecológicas e principalmente no contexto de diversidade funcional, já que os atributos das espécies influenciam fortemente a distribuição e o papel que os organismos desempenham nos ecossistemas. Neste trabalho, tivemos como objetivo avaliar a variabilidade intraespecífica e interespecífica dos atributos ecológicos em duas assembleias de peixes localizadas em riachos sujeitos a diferentes condições físicas. A variação na utilização dos recursos, seja entre indivíduos e/ou entre espécies pode nos ajudar a compreender as interações bióticas e a estrutura das populações e comunidades de peixes. Os atributos referentes a morfologia, dieta, uso do habitat e alguns aspectos comportamentais foram avaliados e suas variações foram testadas a partir dos valores individuais. As coletas foram realizadas em dois riachos tropicais, sendo um localizado no ambiente da Mata Atlântica e o outro, no ambiente do semiárido brasileiro. Além das análises empíricas, uma revisão bibliográfica sobre o tema e uma possível composição funcional dos grupos de peixes de riacho foram descritas no capítulo 1 da presente tese. Nos capítulos 2 e 3, foram testadas as hipóteses de que existe alta variabilidade intraespecífica em relação aos atributos ecológicos dos peixes e que esta variabilidade é influenciada pela alta disponibilidade de recursos, enquanto no capítulo 4, a variação entre os indivíduos foi testada em relação a aspectos comportamentais. Nossos resultados revelaram que, de fato, a variação intraespecífica foi alta em ambas as assembleias, porém na assembleia do semiárido, esta variabilidade foi maior. Este resultado pode estar relacionado a alta disponibilidade de recursos espaciais encontrada nesta localidade. A morfologia e a dieta apresentaram correlação significativa, porém foi fraca em ambas as assembleias, demonstrando assim a importância de mensurar esses dois aspectos da biodiversidade dos peixes. Os resultados relacionados ao uso do habitat também apresentaram alta variabilidade entre os indivíduos e entre as espécies nos dois riachos em estudo. A assembleia do semiárido apresentou maior variabilidade física com potenciais microambientes formados por bancos de macrófitas a serem explorados pelos organismos, permitindo assim, o uso diferenciado e a escolha individual por diferentes recursos espaciais. A variabilidade individual também foi encontrada no comportamento social de duas espécies desta assembleia, onde houve formação de cardumes compostos por indivíduos maiores nas extremidades com maior capacidade de fuga na relação presa-predador. Neste sentido, a alta variação intraespecífica para diversos aspectos funcionais avaliados neste trabalho evidencia ainda mais a importância de mensurar as características ecológicas dos peixes a partir de valores individuais. Adicionalmente, a partir desta ferramenta, podemos compreender melhor a complementaridade da especialização e originalidade ecológica dos indivíduos e finalmente, sugerir de que forma os atributos funcionais dos organismos influenciam a estrutura das populações e comunidades de peixes de riachos tropicais / Describing biological community structure and function is one of the principal issues on ecological theories. This issue is of particular interest for functional diversity since species traits can strongly influence the function and distribution of individuals in the ecosytem. Here we evaluated the intraspecific and interspecific variability of ecological traits in two stream fish assemblages under different physical conditions. Resource use variation within and/or between species can elucidate biotic interactions and the structure of fish communities and populations. Morphology, diet, habitat use, and behavioral aspects were analyzed and their variability was tested through individual values. We collected the samples in one stream located in Rainforest and the other in the Semiarid. Additionally, we did a review about the studies that explore this issue and suggested a possible functional composition of stream fish in chapter 1. The chapters 2 and 3 include the hypothesis that there is high intraspecific variability of fish traits and that this variability is higher at the environments with high resource availability. In the chapter 4 we tested the intraspecific variability of behavioral traits. Our results indicated that the intraspecific variability was high in both assemblages but when we compared the two assemblages, this variability was higher at the semiarid stream. This result can be related to the higher physical resources availability in this assemblage. The morphology and diet were correlated, but this correlation was weak in both assemblages, highlighting the importance of measuring these two aspects of fish biodiversity. The variability of habitat use was also high within and between species and it was influenced by stream physical structure. The semiarid stream presented potential microhabitats with macrophytes that can be explored by the individuals, allowing for differences in habitat use and individual choice for different spatial resources. The individual variability was also expressive on the social behaviour of two species in the semiarid stream, with schools formed by larger individuals at the edges, which have higher ability to avoid predation. Thus, the high intraspecific variability in some ecological traits confirm that it is important to quantify the fish traits from individual values. Moreover, we can explain better the complementarity of ecological specialization and originality from intraspecific variability. Finally, we can understand the influence of ecological traits on population and communities structure of tropical stream fishes

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:36:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JoseGJ_TESE.pdf: 2733330 bytes, checksum: c245d949088d4dc111ec99c0f50e3537 (MD5) Previous issue date: 2010-05-03 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / Lemon sharks, Negaprion brevirostris, are common in the Fernando de Noronha Archipelago, but detailed information about the species in this site is lacking. The aim of this study was to describe the spatial distribution, grouping behavior, habitat use and behavioral ecology of juvenile lemon sharks in the archipelago, and their interaction with some environmental and ecological factors. During 2006 and 2007, the presence and spatial distribution of juvenile sharks were quantified through scuba diving and snorkeling at several sites of the archipelago. In 2008 the habitat use of juvenile sharks was quantified through visual census while snorkeling along 300 x 8 m strip transects. During these transects the grouping behavior of lemon sharks was quantified by ad libitum. Results indicate that Fernando de Noronha Archipelago is used as a nursery area for lemon sharks, and the parturition occurs from November to April. Juveniles preferred using shallower areas available by the tide variation and formed groups only in the presence of adult conspecifics. This preference for shallower habitats and the group behavior probably are anti-predatory tactics used by juvenile lemon sharks, in response to the low availability of shelter and high predation risk of the studied areas. Quantifications of prey availability and predation risk of juveniles showed that, in general, lemon sharks are trading-off food by security and investing in sites with higher possibility of energetic return. Behavioral observations enabled to record juvenile carangid fishes following juvenile lemon sharks, remora host-parasite and juvenile sharks foraging on schools of herrings and octopuses. We also recorded the behavior of juvenile sharks following conspecifics of similar size, circling with two or three individuals and smaller individuals giving way to larger juveniles. When adults are present, juvenile lemon sharks are more social than solitary, indicating that predation is one of the factors that contribute to social behaviors of the species. Results also suggest that when grouped the juveniles have a hierarchical organization according to body size. Furthermore, observation of large adult females with several fresh mating bites and scars in the same habitats used by juvenile lemon sharks, indicates that Fernando de Noronha Archipelago is used as nursery and mating grounds by this species / Os tubar?es lim?o, Negaprion brevirostris, s?o comuns no Arquip?lago de Fernando de Noronha, por?m n?o existem informa??es detalhadas sobre a esp?cie na regi?o. O objetivo deste estudo foi descrever a distribui??o espacial, a forma??o de grupos, o uso do h?bitat e a ecologia comportamental de jovens de tubar?o lim?o no Arquip?lago de Fernando de Noronha, e sua intera??o com alguns fatores ambientais e ecol?gicos. A presen?a e distribui??o espacial dos tubar?es jovens foram quantificadas atrav?s de mergulhos aut?nomos e livres em diversas localidades do arquip?lago, durante 2006 e 2007. O uso do h?bitat foi quantificado durante 2008, atrav?s da execu??o de censos visuais de abund?ncia em transe??es de 300 x 8 m. Durante estas transe??es a forma??o de grupos de tubar?es lim?o foi quantificado atrav?s do m?todo ad libitum. Os resultados indicam que o Arquip?lago de Fernando de Noronha ? uma ?rea de ber??rio para tubar?es lim?o, com a parturi??o ocorrendo entre Novembro e Abril. Os jovens de tubar?o lim?o utilizam preferencialmente a zona mais rasa dispon?vel pela varia??o da mar? e formam grupos somente na presen?a de indiv?duos adultos de sua esp?cie. Possivelmente a maior utiliza??o dos h?bitats mais rasos e a forma??o de grupos s?o t?ticas anti-predat?rias utilizadas pelos jovens, diante da baixa disponibilidade de abrigos e do alto risco de preda??o das localidades estudadas. A an?lise da disponibilidade de alimento e do risco de preda??o dos jovens mostrou, de maneira geral, que os tubar?es lim?o priorizam o alimento sobre a seguran?a e que investem em locais com maior possibilidade de retorno energ?tico. A observa??o comportamental possibilitou o registro de peixes jovens da fam?lia Carangidae seguindo jovens de tubar?o lim?o, a rela??o de hospedeiro-parasita por r?moras e o forrageamento de tubar?es jovens sobre cardumes de sardinha e polvos. Tamb?m foi registrado o comportamento de tubar?es jovens seguirem outros indiv?duos de sua esp?cie de tamanho similar, realizar c?rculos com dois ou tr?s indiv?duos e de um indiv?duo conceder a passagem para outro indiv?duo de maior porte. Na presen?a de adultos os jovens de tubar?o lim?o s?o mais sociais do que solit?rios, sugerindo que a preda??o ? dos fatores que contribuem para os comportamentos sociais da esp?cie. Os resultados tamb?m indicam que, quando agrupados, os jovens apresentam uma organiza??o hier?rquica de acordo com o tamanho corporal. Al?m disso, a observa??o de grandes f?meas adultas com diversas marcas de mordidas e cicatrizes nas mesmas ?reas utilizadas pelos jovens de tubar?o lim?o indica que o Arquip?lago de Fernando de Noronha pode ser considerado tanto como uma ?rea de ber??rio como uma ?rea de c?pula para a esp?cie

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:37:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MaisaSL_DISSERT.pdf: 2026475 bytes, checksum: e8193d7fef1558e71f648e1ff98597f9 (MD5) Previous issue date: 2010-12-13 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / To clarify the functional mechanisms of habitat use is necessary to analyze it in conjunction with the conduct performed by animals. The occurrence, distribution and use of space are characteristic of a species resulting from habitat selection that is in search of conditions favorable to its survival. One can relate the physical and biological factors of the environment with the ecological characteristics of the species, since these factors act by regulating the ecological success of organisms, and from there you can get important information about the habitat use and behavior of individuals. This study aimed to characterize the use of habitat and diurnal activity expressed by the Guiana dolphin, Sotalia guianensis in an estuarine area of Sergipe state, Brazil, analyzing the influence of tide and time days on the occurrence of animals and behavior s state, and group s size and composition in this cetacean species. From March 2009 to February 2010, focal groups observations of dolphins were made from fixed - point and records snapshots of data taken every 5 min. in the interval from 6 a.m to 6 p.m, in alternating shifts. The results showed that the constant presence of animals in the area of the Sergipe River estuary indicates that this is an important area of occurrence of S. guianensis, which use the region mainly in the morning, at low tide and as a feeding. As in other regions of northeastern Brazil, small groups formed 2-12 individuals were most common, with adults and immatures. The high frequency of immature animals may indicate that this area of the estuary is used as brood area and parental care of pups and young animals, since the immature animals were very associated with adults and monitoring the activities of foraging / feeding may be related to a form of learning or training of such behavior / Para esclarecer os mecanismos funcionais do uso do habitat ? preciso analis?-lo conjuntamente ao comportamento realizado pelos animais. A ocorr?ncia, distribui??o e uso do espa?o s?o caracter?sticas de uma esp?cie decorrentes da sele??o do habitat que esta faz em busca das condi??es favor?veis ? sua sobreviv?ncia. Podem-se relacionar os fatores f?sicos e biol?gicos do ambiente com as caracter?sticas ecol?gicas da esp?cie, j? que estes fatores atuam regulando o sucesso ecol?gico dos organismos, e a partir disso ? poss?vel obter importantes informa??es sobre o uso de habitat e do comportamento dos indiv?duos. Assim, este estudo objetivou caracterizar o uso de habitat e o comportamento diurno expresso pelo boto-cinza, Sotalia guianensis, na zona estuarina do Rio Sergipe, nordeste do Brasil, analisando a influ?ncia do estado da mar? e hora do dia sobre a ocorr?ncia dos animais e dos estados de comportamento, bem como verificar o tamanho e composi??o dos agrupamentos nesta esp?cie de cet?ceo. Para isso, de Mar?o de 2009 a Fevereiro de 2010, observa??es focais dos agrupamentos de botos foram feitas a partir de ponto - fixo e os registros instant?neos dos dados efetuados a cada 5 min., no intervalo das 6:00h as 18:00h, em turnos alternados. Os resultados mostraram que a constante presen?a dos animais na zona estuarina do Rio Sergipe indica que esta ? uma importante ?rea de ocorr?ncia de S. guianensis, os quais usam a regi?o principalmente no turno da manh?, em n?veis baixos de mar? e como ?rea de alimenta??o. Como em outras regi?es do nordeste do Brasil, pequenos agrupamentos foram mais comuns, formados por 2 a 12 indiv?duos de ambas as classes de idade, adultos e imaturos. A alta freq??ncia de animais imaturos pode indicar que esta ?rea do estu?rio seja utilizada como ?rea de cria e cuidado parental dos filhotes e animais jovens, j? que os imaturos estiveram bastante associados aos adultos e o acompanhamento nas atividades de forrageio/ alimenta??o pode estar relacionado a uma forma de aprendizagem ou treinamento desse comportamento

Studies focusing syntopic species help to understand how they partition resources and coexist. The objective of this work was to describe the social system, habitat use and diet of the hoary fox (Pseudalopex vetulus) and the crab-eating fox (Cerdocyon thous), in an area of cattle farms in Central Brazil. It is also reported a confrontation between the two species, observed during a study on the behavioral repertory of the hoary fox. Social system and habitat use were studied by direct observation of foxes in the field and diet, through scat analysis. Crab-eating foxes were found in pairs in 34 (59%) of 58 encounters and hoary foxes were solitary in 58 (84.0%) of 69 encounters, with no seasonal variation in the group size of both species. During one encounter of a crab-eating fox couple, the male vocalized to call the female that had remained behind. Hoary foxes were sighted in grazed pasture in a higher proportion (84%) than crab-eating foxes (67%) and they were never found in forest neither in swamp. Besides, both species were rarely seen together, and the only encounter registered ended in a conflict, with the crab-eating fox driving the hoary fox out. Twenty-seven taxa were identified in the diet of the two canids, with the crab-eating fox (n = 32 scats) consumed fruits, insects (mainly Orthoptera and Coleoptera) and vertebrates (most Cricetidae and Squamata) and the hoary fox (n = 23 scats) ate primarily termites (Isoptera). Results indicate that crab-eating fox couples keep more tight bonds than hoary fox couples. The coexistence of both species may be related to the detected differences in habitat use and diet. / Estudos enfocando espécies sintópicas ajudam a entender como elas partilham os recursos e coexistem. O objetivo deste trabalho foi descrever o sistema social, o uso do habitat e a dieta da raposa-do-campo (Pseudalopex vetulus) e do cachorro-do-mato (Cerdocyon thous), em uma área de fazendas de gado no Brasil Central. Também é relatado um confronto entre as duas espécies observado durante um estudo sobre o repertório comportamental da raposa-do-campo. O sistema social e o uso de habitat foram estudados a partir da observação direta dos animais no campo e a dieta, através da análise de fezes. Os cachorros-do-mato foram encontrados em duplas em 34 (59%) de 58 encontros e as raposas-do-campo estavam solitárias em 58 (84%) de 69 encontros, não havendo variação sazonal no tamanho de grupo das duas espécies. Durante um dos encontros de uma dupla de cachorro-do-mato, o macho vocalizou para chamar a fêmea que havia ficado para trás. As raposas-do-campo foram avistadas em pastagens em uma proporção maior (84%) que os cachorros-do-mato (67%) e nunca foram encontradas em florestas ou brejos. Além disso, as duas espécies raramente foram vistas juntas, sendo que o único encontro registrado terminou em conflito, com o cachorro-do-mato expulsando a raposa-do-campo. Vinte e sete táxons foram identificados na dieta dos dois canídeos. O cachorro-do-mato (n = 32 fezes) consumiu frutos, insetos (principalmente Orthoptera e Coleoptera) e vertebrados (a maioria Cricetidae e Squamata) e a raposa-do-campo (n = 23 fezes) se alimentou principalmente de cupins (Isoptera). Os resultados indicam que casais de cachorros-do-mato mantêm laços mais estreitos que casais de raposa-do-campo. A coexistência de ambas as espécies pode estar relacionada às diferenças detectadas no uso do habitat e na dieta. / Mestre em Ecologia e Conservação de Recursos Naturais

Os estudos sobre a relação habitat-espécie são importantes para a conservação, pois geram conhecimento sobre características de habitat essenciais para uma população. A incorporação destas informações em planos de conservação permite um manejo mais inteligente tanto da fauna como das áreas a serem preservadas. O presente estudo teve como objetivo estudar o uso e a seleção de habitat de Saltator atricollis e Cypsnagra hirundinacea na Estação Ecológica de Itirapina, região central do estado de São Paulo, Brasil. Ambas espécies são aves endêmicas do Cerrado e ameaçadas de extinção no Estado de São Paulo. O estudo foi desenvolvido entre setembro e dezembro de 2007 e setembro de 2008. O habitat foi analisado em duas escalas: o macro-habitat e o micro-habitat. Para analisar o habitat foram dispostos sistematicamente 84 pontos de amostragem na área de estudo. Na análise do macro-habitat foram utilizadas informações sobre o uso-disponibilidade das diferentes fisionomias sendo comparadas por meio do intervalo de confiança de Bailey. No estudo de micro-habitat foram medidas 11 características estruturais da vegetação ao redor de cada ponto de contato com S. atricollis, com C. hirundinacea e nos 84 pontos de amostragem. Para analisar as associações entre as características estruturais e as aves foi utilizado modelos de regressão logística selecionados pelo Critério de Informações de Akaike (AIC). Saltator atricollis selecionou áreas de campo cerrado, utilizou na mesma proporção que o esperado as áreas campestres e utilizou menos que o esperado o cerrado sensu stricto. Cypsnagra hirundinacea utilizou na mesma proporção que o esperado as áreas campestres e o campo cerrado enquanto o cerrado sensu stricto foi utilizado menos que o esperado. Quanto ao micro-habitat os melhores modelos para explicar a presença de S. atricollis incluíram maior densidade de árvores maiores que 2 m de altura e menor densidade de Syagrus petrea e de arbustos com até 1 m de altura. A presença de árvores é importante para a espécie, pois são utilizadas como poleiros durante o comportamento de sentinela. As altas densidades de Syagrus petrea e arbustos baixos (< 1m) podem diminuir a quantidade de moitas de gramíneas (utilizadas para a construção de ninhos) já que ambos ocupam o mesmo estrato. Assim, indiretamente, a presença de Syagrus petrea e arbustos baixos (< 1m) podem diminuir a disponibilidade de sítios reprodutivos. Além disso, podem atrapalhar o forrageamento por dificultar a utilização do estrato herbáceo. Os modelos que explicaram melhor a presença de C. hirundinacea foram representados por uma maior densidade de arbustos e árvores intermediárias e altas (entre 1 e 2 m, entre 2 e 4 m e maiores que 4 m de altura), maior densidade de braquiária e menor densidade de Attalea geraensis e de solo exposto. A presença de árvores é importante, pois a espécie as usa para forragear, construir ninhos e vigiar contra predadores. A relação positiva com a braquiária pode estar relacionada ao fato da espécie não utilizar o estrato herbáceo e ao mesmo tempo a invasão dessa gramínea, possivelmente, ainda não deve ter alterado a estrutura da vegetação lenhosa. Já a relação inversa entre a presença de C. hirundinacea e a densidade de solo exposto e de A. geraensis deve ocorrer, pois em ambientes com alta densidade dessas variáveis provavelmente há um baixo número de árvores o que diminui a disponibilidade de sítios de forrageamento e reprodutivos. Portanto para a manutenção dessas espécies é importante preservar as fisionomias abertas do Cerrado, as quais estão desaparecendo no estado de São Paulo, além disso recomenda-se manter nessas fisionomias a presença de algumas árvores e evitar a dominância de palmeiras rasteiras. / Studies about habitat-species relationships are important for conservation, because they generate knowledge about the essential characteristics of a habitat for a population. Incorporation of such information in conservation plans allows for a more intelligent management of both fauna and habitats that should be preserved. The aim of this study was to investigate the habitat use and selection by Saltator atricollis and Cypsnagra hirundinacea at Estação Ecológica de Itirapina in central State of São Paulo, Brazil. Both species are endemic birds of the Cerrado (Brazilian Savannah) and they are considered threatened with extinction in the State of São Paulo. The study was developed from September to December of 2007 and in September 2008. Habitat was analyzed in two scales: macrohabitat and microhabitat. To analyze the habitat 84 sampling points had been distributed at the study area. Macrohabitat selection was analyzed based on use-availability data of physiognomy and performing Baileys confidence interval. To investigate the use of the microhabitat there were estimated eleven structural characteristics of vegetation. These characteristics were described in each exact point that S. atricollis and C. hirundinacea had seen and in the 84 sampling points. The associations between the structural characteristics and the birds were identified by logistic regression models selected by Akaike Information Criteria (AIC). Saltator atricollis selected campo cerrado physiognomies (grassland savannah), it use campos (grasslands) at the expected proportion and cerrado sensu stricto (woodland savannah) less than expected proportion. Cypsnagra hirundinacea used both campos and campo cerrado areas at expected proportions while cerrado sensu stricto was used less than expected proportion. At the microhabitats level, the best models to explain the presence of S. atricollis included greater density of trees higher than 2 meters, lesser density of Syagrus petrea, and lesser density of bushes of to up to 1 meter height. The presence of trees is important to this specie, because the trees are used as perches during sentinel behavior. The high density of Syagrus petrea should diminish the amount of grassy because they use the same space on the habitat. Birds use the grassy to make its nest and the presence of Syagrus petrea and short bushes (< 1m) should indirectly reduce places for reproductive sites and might make foraging more difficult. The best models to explain the presence of C. hirundinacea were the one represented by a greater density of bushes and, trees of intermediate to greater height (between 1 and 2 meters, between 2 and 4 meters, and higher than 4 meters), greater density of Brachiaria grasses and lesser density of Attalea geraensis and exposed ground. The presence of trees is important because the species use them to forage, build nests and watch against predators. The positive relation with Brachiaria grasses might be occurs because C. hirundinacea dont use the herb layer. Possibly, the invasion of the Brachiaria grasses not having changed the structure of the vegetation yet. The inverse relation between the bird specie and the presence of exposed ground and A. geraensis, should occur because in habitats with high density of exposed ground and A. geraensis there are few places to feed and to reproduction. Therefore, to the maintenance of these birds species it is important preserving the open physiognomies of the Cerrado, which are disappearing from the State of São Paulo. Its also necessary to keep in theses physiognomies the presence of a few bushes and trees and also avoid the dominance of A. geraensis and Syagrus petrea.

Informações sobre o tamanho da área de vida, o uso e seleção de habitat contribuem para o entendimento da ecologia das espécies e por isso acabam servindo como importantes referências para o manejo e conservação. Apesar de no Hemisfério Norte muitos estudos abordarem área de vida e uso de habitat em Strigiformes, na região Neotropical, informações dessa natureza ainda são escassas na literatura. No presente estudo, quatro indivíduos machos da corujinha-do-mato (Megascops choliba) foram monitorados por radiotelemetria durante cerca de seis meses em uma área de cerrado (lato sensu) no interior do Estado de São Paulo. Apesar das diferenças dos habitats utilizados, o tamanho médio da área de vida de M. choliba segundo o mínimo polígono convexo (51,2 ± 26,9 ha) foi semelhante à de espécies do mesmo gênero na América do Norte. A grande variação individual encontrada no tamanho das áreas de vida pode ser explicada pelos tipos de habitats utilizados e também pelo status social dos indivíduos. No período noturno, a corujinha-do-mato preferiu fisionomias de cerrado semi-abertas e fechadas e, além disso evitou fisionomias abertas. No período diurno, habitats com vegetação mais densa e fechada como matas de galeria e manchas de Pinus invasor foram preferencialmente utilizados para uso como abrigo. O uso desses locais durante o dia, provavelmente está ligado à maior cobertura vegetal dessas áreas que podem fornecer proteção contra predadores e também microclimas adequados. / Information on home ranges and habitat use and selection is useful to understand species ecology and therefore may help to establish species management and conservation plans. Despite the large numbers of Northern Hemisphere studies addressing Strigiformes home range and habitat use, the same is not applied to Neotropical owl species, what makes such information still scarce. In this study, four males of Tropical Screech-Owls (Megascops choliba) were radio-tracked for about six months in a cerrado (lato sensu) region in state of São Paulo, southeastern Brazil. Despite the differences in used habitats between species from the two hemispheres, the mean home range size of Tropical Screech-Owls (51.2 ± 26.9 ha) appears to be similar to North American Megascops species. The considerable individual variation in home range sizes may be related to types of habitats and individual social status. At night, the Tropical Screech-Owls preferred semi-open and closed savannas and, moreover, avoided open savannas. Habitats with dense vegetation, such as gallery forests and invasive pine forests were preferentially used for daytime roost. Use of these sites during the day is probably associated to higher vegetation cover which can provide protection against predators and suitable microclimates

This thesis addresses the mechanisms regulating the evolution and maintenance of colour polymorphism in the shrimp Hippolyte obliquimanus. It includes four chapters that illustrate, in an integrative approach, the ecological and behavioural consequences of different camouflage and habitat use strategies selected in main colour morphs. In the first chapter entitled Camouflage through colour change: mechanisms, adaptive value, and ecological significance, the physiological and structural mechanisms underpinning colour change, and hence camouflage, in different species were detailed within a general framework. Also in this section, both the adaptive value and the ecological and evolutionary implications of these processes were discussed. In the second chapter entitled Shape, colour plasticity, and habitat use indicate morph-specific camouflage strategies in a marine shrimp morph-specific colour change and habitat selection were investigated as potential mechanisms affecting camouflage efficiency and the natural distribution of H. obliquimanus colour morphs between macroalgal habitats formed by Sargassum furcatum and Galaxaura marginata. Moreover, morph-specific morphology and behavioural traits were also assessed. Shrimp showing a homogeneous coloration (H) changed colour when placed in colour-mismatching backgrounds and also exhibited a more robust shape associated to high substrate fidelity and specialization. On the other hand, striped translucent shrimp (ST) were not capable of colour change and showed high mobility, consistent with a more streamlined shape and a generalised use of algal habitats. In the third chapter entitled The adaptive value of camouflage and colour change in a polymorphic shrimp visual models and predation trials were used to test the adaptive value of camouflage and colour change of H. obliquimanus colour morphs against colour-contrasting macroalgae, which provide different levels of colour concealment. The low colour discrimination predicted by a visual model of a seahorse predator for pink shrimp against the red weed Galaxaura was directly translated to lower detection and consumption rates on this morph by captive seahorses in a laboratory experiment, demonstrating the high adaptive value of camouflage in this species. Finally, in the fourth chapter entitled Habitat-dependent niche partitioning between colour morphs of the algal-dwelling shrimp Hippolyte obliquimanus the trophic ecology of H and ST morphs when using Sargassum and Galaxaura habitats were assessed through stable isotope analysis. Morphs showed different isotopic signatures only in Galaxaura, where the supply of food resources are limiting, leading to a tropic niche diversification between H and ST shrimp and a probable relaxation of intra-specific competition. Conversely, in Sargassum, where resources are abundant, morphs coexistence is possible even without niche partitioning. Altogether, the results of this thesis contributed to a better understanding of the adaptive value and the underlying mechanisms controlling for the maintenance of colour polymorphism in H. obliquimanus. From both an ecological and evolutionary perspective, morph-specific strategies of camouflage and habitat use likely promote the stability of shrimp populations in a spatially heterogeneous and markedly seasonal habitat. / Esta tese aborda os mecanismos que regulam a evolução e manutenção do polimorfismo de cor no camarão Hippolyte obliquimanus ao longo de quatro capítulos que ilustram de forma integrada as consequências ecológicas e comportamentais das distintas estratégias de camuflagem e de uso do habitat selecionadas nos principais morfótipos da espécie. No Capítulo 1, intitulado Camouflage through colour change: mechanisms, adaptive value, and ecological significance, são detalhados de maneira geral os mecanismos fisiológicos e estruturais responsáveis pelo processo de mudança de cor e obtenção de camuflagem em diferentes espécies de animais. Nessa seção também é detalhado o valor adaptativo e as implicações ecológicas e evolutivas desses processos. No Capítulo 2, intitulado Shape, colour plasticity, and habitat use indicate morph-specific camouflage strategies in a marine shrimp, são investigados os processos de mudança de cor e de seleção de habitat como possíveis mecanismos reguladores dos padrões de camuflagem e de distribuição dos morfótipos de cor de H. obliquimanus entre os bancos das algas Sargassum furcatum e Galaxaura marginata. Além disso, também são avaliadas diferenças morfológicas e comportamentais entre os morfótipos na utilização dos habitats vegetados. Camarões caracterizados por uma coloração homogênea (H) mudam de cor quando em contato com substratos de coloração diferente à sua, exibindo também uma morfologia mais robusta e um comportamento de alta fidelidade e especialização aos substratos de macroalgas. Por outro lado, camarões transparentes listrados (TL) não mudam de cor e apresentam elevada mobilidade, consistente com uma morfologia mais hidrodinâmica e com uso mais generalizado dos habitats estudados. No Capítulo 3, intitulado The adaptive value of camouflage and colour change in a polymorphic shrimp, são utilizados modelos visuais e experimentos de predação para testar o valor adaptativo da camuflagem e mudança de cor em diferentes morfótipos do camarão H. obliquimanus quando estes estão associados a macroalgas que fornecem diferentes graus de semelhança cromática. O baixo grau de discriminação cromática previsto para camarões rosa em associação à alga vermelha Galaxaura através da modelagem visual de um predador (cavalo-marinho) resultou em baixas taxas de detecção e predação desse morfótipo por cavalos-marinhos em um experimento de laboratório, demonstrando um alto valor adaptativo da camuflagem nessa espécie. Por fim, no Capítulo 4, intitulado Habitat-dependent niche partitioning between colour morphs of the algal-dwelling shrimp Hippolyte obliquimanus, a ecologia trófica dos morfótipos de cor H e TL na utilização dos bancos de Sargassum e Galaxaura é avaliada através de análises de isótopos estáveis. Os morfótipos de cor mostraram diferenças nas razões isotópicas apenas em Galaxaura, onde a abundância de recursos alimentares é limitante, levando à diversificação de nicho trófico entre camarões H e TL e uma provável redução da competição intraespecífica. Por outro lado, em Sargassum, onde há abundância de recursos, a coexistência entre os morfótipos é possível mesmo sem partição de nicho ecológico. Em conjunto, os resultados obtidos nessa tese detalham tópicos centrais sobre os mecanismos reguladores e o valor adaptativo do polimorfismo cromático em H. obliquimanus. Dentro de uma abordagem ecológica e evolutiva, as diferentes estratégias de camuflagem e de uso de habitat dos morfótipos de cor parecem ser essenciais para o equilíbrio populacional da espécie, uma vez que os bancos de macroalgas utilizados como habitat pelos indivíduos são bastante heterogêneos e sua disponibilidade varia sazonalmente.