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Máquinas de Vetores Suporte e a Análise de Gestos: incorporando aspectos temporais / Support Vector Machines and Gesture Analysis: incorporating temporal aspects

Renata Cristina Barros Madeo 15 May 2013 (has links)
Recentemente, tem se percebido um interesse maior da área de computação pela pesquisa em análise de gestos. Parte dessas pesquisas visa dar suporte aos pesquisadores da área de \"estudos dos gestos\", que estuda o uso de partes do corpo para fins comunicativos. Pesquisadores dessa área analisam gestos a partir de transcrições de conversas ou discursos gravados em vídeo. Para a transcrição dos gestos, geralmente realiza-se a sua segmentação em unidades gestuais e fases. O presente trabalho tem por objetivo desenvolver estratégias para segmentação automatizada das unidades gestuais e das fases dos gestos contidos em um vídeo no contexto de contação de histórias, formulando o problema como uma tarefa de classificação supervisionada. As Máquinas de Vetores Suporte foram escolhidas como método de classificação, devido à sua capacidade de generalização e aos bons resultados obtidos para diversos problemas complexos. Máquinas de Vetores Suporte, porém, não consideram os aspectos temporais dos dados, características que são importantes na análise dos gestos. Por esse motivo, este trabalho investiga métodos de representação temporal e variações das Máquinas de Vetores Suporte que consideram raciocínio temporal. Vários experimentos foram executados neste contexto para segmentação de unidades gestuais. Os melhores resultados foram obtidos com Máquinas de Vetores Suporte tradicionais aplicadas a dados janelados. Além disso, três estratégias de classificação multiclasse foram aplicadas ao problema de segmentação das fases dos gestos. Os resultados indicam que um bom desempenho para a segmentação de gestos pode ser obtido ao realizar o treinamento da estratégia com um trecho inicial do vídeo para obter uma segmentação automatizada do restante do vídeo. Assim, os pesquisadores da área de \"estudos dos gestos\" poderiam segmentar manualmente apenas um trecho do vídeo, reduzindo o tempo necessário para realizar a análise dos gestos presentes em gravações longas. / Recently, it has been noted an increasing interest from computer science for research on gesture analysis. Some of these researches aims at supporting researchers from \"gesture studies\", which studies the use of several body parts for communicative purposes. Researchers of \"gesture studies\" analyze gestures from transcriptions of conversations and discourses recorded in video. For gesture transcriptions, gesture unit segmentation and gesture phase segmentation are usually employed. This study aims to develop strategies for automated segmentation of gestural units and phases of gestures contained in a video in the context of storytelling, formulating the problem as a supervised classification task. Support Vector Machines were selected as classification method, because of its ability to generalize and good results obtained for many complex problems. Support Vector Machines, however, do not consider the temporal aspects of data, characteristics that are important for gesture analysis. Therefore, this paper investigates methods of temporal representation and variations of the Support Vector machines that consider temporal reasoning. Several experiments were performed in this context for gesture units segmentation. The best results were obtained with traditional Support Vector Machines applied to windowed data. In addition, three strategies of multiclass classification were applied to the problem of gesture phase segmentation. The results indicate that a good performance for gesture segmentation can be obtained by training the strategy with an initial part of the video to get an automated segmentation of the rest of the video. Thus, researchers in \"gesture studies\" could manually segment only part of the video, reducing the time needed to perform the analysis of gestures contained in long recordings.
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A influência do contexto de discurso na segmentação automática das fases do gesto com aprendizado de máquina supervisionado / The influence of the speech context on the automatic segmentation of the phases of the gesture with supervised machine learning

Jallysson Miranda Rocha 27 April 2018 (has links)
Gestos são ações que fazem parte da comunicação humana. Frequentemente, eles ocorrem junto com a fala e podem se manifestar por uma ação proposital, como o uso das mãos para explicar o formato de um objeto, ou como um padrão de comportamento, como coçar a cabeça ou ajeitar os óculos. Os gestos ajudam o locutor a construir sua fala e também ajudam o ouvinte a compreender a mensagem que está sendo transmitida. Pesquisadores de diversas áreas são interessados em entender como se dá a relação dos gestos com outros elementos do sistema linguístico, seja para suportar estudos das áreas da Linguística e da Psicolinguística, seja para melhorar a interação homem-máquina. Há diferentes linhas de estudo que exploram essa temática e entre elas está aquela que analisa os gestos a partir de fases: preparação, pré-stroke hold, stroke, pós-stroke hold, hold e retração. Assim, faz-se útil o desenvolvimento de sistemas capazes de automatizar a segmentação de um gesto em suas fases. Técnicas de aprendizado de máquina supervisionado já foram aplicadas a este problema e resultados promissores foram obtidos. Contudo, há uma dificuldade inerente à análise das fases do gesto, a qual se manifesta na alteração do contexto em que os gestos são executados. Embora existam algumas premissas básicas para definição do padrão de manifestação de cada fase do gesto, em contextos diferentes tais premissas podem sofrer variações que levariam a análise automática para um nível de alta complexidade. Este é o problema abordado neste trabalho, a qual estudou a variabilidade do padrão inerente à cada uma das fases do gesto, com apoio de aprendizado de máquina, quando a manifestação delas se dá a partir de um mesmo indivíduo, porém em diferentes contextos de produção do discurso. Os contextos de discurso considerados neste estudo são: contação de história, improvisação, descrição de cenas, entrevistas e aulas expositivas / Gestures are actions that make part of human communication. Commonly, gestures occur at the same time as the speech and they can manifest either through an intentional act, as using the hands to explain the format of an object, or as a pattern of behavior, as scratching the head or adjusting the glasses. Gestures help the speaker to build their speech and also help the audience to understand the message being communicated. Researchers from several areas are interested in understanding what the relationship of gestures with other elements of the linguistic system is like, whether in supporting studies in Linguistics or Psycho linguistics, or in improving the human-machine interaction. There are different lines of study that explore such a subject, and among them is the line that analyzes gestures according to their phases: preparation, pre-stroke hold, stroke, post-stroke hold, hold and retraction. Thus, the development of systems capable of automating the segmentation of gestures into their phases can be useful. Techniques that implement supervised machine learning have already been applied in this problem and promising results have been achieved. However, there is an inherent difficulty to the analysis of phases of gesture that is revealed when the context (in which the gestures are performed) changes. Although there are some elementary premises to set the pattern of expression of each gesture phase, such premises may vary and lead the automatic analysis to high levels of complexity. Such an issue is addressed in the work herein, whose purpose was to study the variability of the inherent pattern of each gesture phase, using machine learning techniques, when their execution is made by the same person, but in different contexts. The contexts of discourse considered in this study are: storytelling, improvisation, description of scenes, interviews and lectures
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Bioatividade de extratos orgânicos de meliáceas e óleos essenciais de piperáceas sobre Rhopalosiphum maidis (Hemiptera: Aphididae) / Bioactivity of organic extracts from Meliaceae and essential oils from Piperaceae on Rhopalosiphum maidis (Hemiptera: Aphididae)

Rafael Major Pitta 04 November 2010 (has links)
Os afídeos são importantes pragas na agricultura, principalmente por serem vetores de fitovírus, os quais são transmitidos geralmente no momento da picada de prova. Além disso, os afídeos também removem os aminoácidos nitrogenados das plantas ao se alimentarem no floema e injetam substâncias presentes na saliva, que interferem na fisiologia da planta. Entre as táticas de controle para o manejo integrado desses insetos, pode-se citar o emprego de inseticidas químicos ou botânicos e o uso de produtos repelentes que tornam as plantas pulverizadas não atrativas, evitando que pulgões pousem e se alimentem normalmente da planta. Nesse contexto, objetivou-se estudar a bioatividade de extratos orgânicos das Meliaceae Trichilia pallida, Trichillia claussenii,Trichilia catigua, Toona ciliata e Guarea guidonia e dos óleos essenciais das Piperaceae Piper amalago, Piper umbellatum, Piper claussenianum e Piper sp. em relação a pulgões, utilizando como espécie-modelo R. maidis. Os extratos orgânicos das Meliaceae foram obtidos, por maceração, com o uso dos solventes hexano, diclorometano e etanol, nessa sequência de extração. O extrato hexânico de T. pallida foi o que apresentou a maior atividade aficida, sendo então selecionado para fracionamento por cromatografia de coluna rápida utilizando, sequencialmente, os solventes hexano, acetato de etila e metanol. Entre as frações, a hexânica causou a maior mortalidade, sendo selecionada para a determinação dos modos de ação sobre R. maidis. A referida fração não apresentou ação de contato e nem ação neurotóxica; entretanto, foi constatada ação translaminar. No ensaio com Electrical Penetration Graph - EPG, os insetos apresentaram maior dificuldade para se alimentar. Entre as Piperaceae, a maior repelência e mortalidade a R. maidis foi causada por P. claussenianum, cujo óleo essencial foi então selecionado para os testes subsequentes. Sua atividade inseticida ocorreu por contato, causando rápida mortalidade, acreditandose, assim, tratar-se de um efeito neurotóxico; não foi constatado, entretanto, efeito fumigante. Quanto às alterações comportamentais, constatou-se efeito repelente sobre alados por meio de teste com olfatômetro e o efeito fagodeterrente com uso do EPG. Com base nos resultados, conclui-se que entre os extratos orgânicos e óleos essenciais testados, a fração hexânica do extrato hexânico de T. pallida apresenta substâncias com atividade inseticida sobre R. maidis, sendo uma possível fonte para síntese de novos inseticidas e que o óleo essencial de P. claussenianum pode ser utilizado diretamente no controle de pulgões ou servir de fonte para a identificação de moléculas inseticidas para a síntese. / Aphids are important pests in agriculture mainly because they are vectors of phytovíruses, which are normally transmitted during the aphids probe. In addition, aphids not only remove amino-nitrogen from the plants while feeding in the phloem but also inject substances present in their saliva, which interfere in plant physiology. Among the strategies for the integrated management of these insects, we can state the use of chemical or botanical insecticides as well as repellents which turn the plants into nonattractive ones, thus avoiding that aphids land and feed normally from the plant. Therefore, we studied the bioactivity of organic extracts from the Meliaceae plants Trichilia pallida, Trichilia claussenii, Trichilia catigua, Toona ciliata and Guarea guidonia and essential oils from the Piperaceae plants Piper amalago, Piper umbellatum, Piper claussenianum and Piper sp. against aphids, using R. maidis as a model species. Organic extracts from Meliaceae were obtained by maceration technique using hexane, dichloromethane and ethanol solvents, in this sequence of extraction. Hexanic extract from T. pallida provoked the highest activity against aphids being chosen for the fractionation using a chromatographic column with fast flow and using hexane, ethyl acetate and methanol solvents, in this sequence. Hexanic fraction provoked the highest mortality among the fractions evaluated being chosen in order to understand its modes of action on R. maidis. This fraction had neither mode of action by contact nor neurotoxic action; however, its translaminar action was proved. Using the Electrical Penetration Graph - EPG, we observed that most of the insects had difficulty to feed themselves. Among the Piperaceae plants, the highest repellency and mortality of R. maidis was caused by P. claussenianum which was selected for the subsequent assays. Its insecticidal activity occurred through contact causing a fast mortality perhaps due to a neurotoxic effect. Nevertheless, a fumigant effect was not observed. With regard to behavioral changes, a repellent effect was proven on alates through olfactometer assay and a phagodeterrent effect was proven using EPG assay. According to the results, we concluded that among the organic extracts and essential oils evaluated, the hexanic fraction from hexanic extract from T. pallida contains substances with insecticidal activity against R. maidis being a potential source for synthesis of new insecticides while the essential oil from P. claussenianum may be used both to control aphids and to be a source for identification of insecticidal molecules aiming their synthesis.
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Ecologia de flebotomíneos (Diptera, psychodidae) e sua interação com leishmania (Kinetoplastida, trypanosomatidade) e hospedeiros vertebrados em áreas de transmissão de leishimanioses / Ecology of sandflies (Diptera, psychodidae) and their interaction with leishimania (Kinetoplastida, trypanosomatidade) and vertebrate hosts in areas of transmission of leishmaniasis

Silva, Antonia Suely Guimarães e 30 June 2016 (has links)
Submitted by Rosivalda Pereira (mrs.pereira@ufma.br) on 2017-06-21T18:25:20Z No. of bitstreams: 1 AntoniaSilva.pdf: 3060571 bytes, checksum: a7f2fb96a4ad01ab72950bd6a3cbffca (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-21T18:25:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AntoniaSilva.pdf: 3060571 bytes, checksum: a7f2fb96a4ad01ab72950bd6a3cbffca (MD5) Previous issue date: 2016-06-30 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa e ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico do Maranhão (FAPEMA) / Fundação de Amparo à Pesquisa de Minas Gerais (FAPEMIG) / The Sandflies are insects diptera nematocera belonging to the Psychodidae family, very important for public health, because some species are vectors of etiological agents of leishmaniasis, endemic parasitic disease in the state of Maranhão and in Brazil. These vectors are frequently found in natural ecotopes, domestic animal shelters and human habitations. This research aimed to study the occurrence of sandflies in the urban and rural peridomiciliary environment of municipality of Caxias, Maranhão, in notification area of cases of cutaneous and visceral leishmaniasis, as well as the rate of natural infection by Leishmania and analysis of blood food source. This is a cross-sectional, exploratory, descriptive and field study, with a quantitative approach, performed from March 2013 to February 2015. The specimens were collected with CDC (Center for Disease Control) light traps type in 20 homes, 10 in urban area and 10 in rural area. Were collected 15,895 specimens belonging to 17 species, one of genus Brumptomyia and 16 of Lutzomyia. The most abundant species were Lu. longipalpis (90.26%) and Lu. whitmani (7.65%). In the urban area the abundance of sandflies was higher in rainy season, and in the rural area in the dry season. Lu. longipalpis and Lu. whitmani occurred in two seasons, most frequently in rainy and dry season, respectively. From a total of 3, 520 female, 982 samples were used for DNA and PCR-RFLP extraction for detecting the presence of Leishmania. The vector Lu. longipalpis was found infected by Le. infantum (3.0%); Le. shawi (0.3%); Le. mexicana (0.2%); Le. braziliensis (0.6%) and Le. guyanensis (0.6%) and with mixed infection Le. infantum/Le. braziliensis (0.6%). The specie Lu. whitmani was infected by Le. infantum/Le. braziliensis (4.0%) and Le. braziliensis (4.3%). Other species found infected include: Lu. trinidadensis with Le. infantum/Le. braziliensis and Lu. evandroi and Lu. termitophila with Le. braziliensis and Le. guyanensis respectively. Based on these results it is suggested adopting control measures by the public health authorities to contain a future epidemic of AVL in this area, which is also endemic to ACL. For detection of food source were captured 778 engorged females, 573 were positive for eight different types of domestic and wild animals: dog, man, chicken, ox, pig, horse, rodent and opossum; obtaining mixed reactions in eight different associations: dog/rodent, man/chicken, chicken/rodent, dog/chicken, horse/rodent, rodent/pig and man/opossum. The presence of sandflies species infected with different species of leishmanias and fed with blood of domestic animals and human justifies the occurrence of endemic form of visceral and cutaneous leishmaniasis in the municipality of Caxias. Based on these results it is suggested adoption of control measures by the public health authorities to contain a future epidemic of these diseases. / Os flebotomíneos são dípteros nematóceros, pertencentes à família Psychodidae, muito importantes para a saúde pública, pois algumas espécies são vetores dos agentes etiológicos das leishmanioses, doenças parasitárias endêmicas em todo o território brasileiro. Esses vetores são encontrados com frequência em ecótopos naturais, abrigos de animais domésticos e habitações humanas. A presente pesquisa teve como objetivo estudar a ocorrência de flebotomíneos no ambiente peridomiciliar urbano e rural do município de Caxias, Maranhão, em área de notificação de casos de leishmaniose tegumentar e visceral, bem como, a taxa de infecção natural por Leishmania e análise da fonte alimentar sanguínea. Trata-se de um estudo transversal, exploratório, descritivo e de campo, tendo uma abordagem quantitativa, realizado no período de março de 2013 a fevereiro de 2015. Os espécimes foram coletados com armadilhas luminosas do tipo CDC (Center for Disease Control) em 20 residências, 10 na zona urbana e 10 na zona rural. Foram coletados 15.892 espécimes pertencente a 17 espécies, sendo uma do gênero Brumptomyia e 16 do gênero Lutzomyia. As espécies mais abundantes foram Lu. longipalpis (90,26%) e Lu. whitmani (7,65%). Na zona urbana a abundância de flebotomíneos foi maior no período chuvoso, e na zona rural na estação seca. Lu. longipalpis e Lu. Whitmani ocorreram nas duas estações, com mais frequência na estação chuvosa e seca, respectivamente. Do total de 3.520 fêmeas, 982 exemplares foram utilizados para a extração de DNA e PCR-RFLP para detecção de presença de Leishmania. O vetor Lu. longipalpis foi encontrado infectado por Le. infantum (3,0%), Le. shawi (0,3%), Le. mexicana (0,2%), Le. braziliensis (0,6%) e Le. guyanensis (0,6%) e com infecção mista Le. infantum/Le. braziliensis (0,6%). A espécie Lu. whitmani estava infectada com Le. infantum/Le. braziliensis (4,0%) e Le. braziliensis (4,3%). Outras espécies encontradas infectadas incluem-se: Lu. trinidadensis com Le. infantum/Le. braziliensis; Lu. evandroi e Lu. termitophila com Le. braziliensis e, Le. guyanensis, respectivamente. Para detecção da fonte alimentar foram utilizadas 778 fêmeas ingurgitadas, 573 positivaram para oito tipos diferentes de animais domésticos e silvestres, sendo detectadas reações simples representadas por sange de: cão, homem, galinha, boi, porco, cavalo, roedor e gambá e as reações mistas foram representadas por sangue de: cão/roedor, roedor/homem, galinha/homem, galinha/roedor, cão/galinha, cavalo/roedor, roedor/porco e homem/gambá. A presença de espécies de flebotomíneos infectadas com diferentes espécies de leshmânias e alimentados com sangue de animais domésticos e humanos justifica a ocorrência de forma endêmicas das leishmanioses visceral e tegumentar no município de Caxias. Diante dos resultados obtidos sugere-se adoção de medidas de controle por parte das autoridades de saúde pública, de forma a conter uma futura epidemia dessas doenças.
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Bioprospecção anti-helmíntica de geoprópolis de Melipona fasciculata Smith em testes in vitro com ovos e larvas de Haemochus contortus de pequenos ruminantes / Anthelmintic bioprospecting of Melipona fasciculata Smith geopropolis in vitro tests with eggs and larvae of Haemochus contortus of small ruminants

Batista, Marisa Cristina Aranha 22 June 2016 (has links)
Submitted by Rosivalda Pereira (mrs.pereira@ufma.br) on 2017-06-21T18:34:09Z No. of bitstreams: 1 MarisaBatista.pdf: 12168457 bytes, checksum: 713e23639a20220c99636f8a2b8cd14d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-21T18:34:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MarisaBatista.pdf: 12168457 bytes, checksum: 713e23639a20220c99636f8a2b8cd14d (MD5) Previous issue date: 2016-06-22 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPQ) / Fundação de Amparo à Pesquisa e ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico do Maranhão (FAPEMA) / One of the main barriers to creation of goats and sheep are gastrointestinal parasites, which represent the largest and most serious health problem, reaching economically derail the creation, due to the resistance of parasites to anthelmintic drugs. Natural products, especially geopropolis produced by stingless bees of the genus Melipona, especially Melipona fasciculata Smith (tiúba) is an alternative for treatment of these diseases. Data in the literature on anthelmintic activity with geopropolis are scarce in this way, we aimed to evaluate the chemical composition of geopropolis of different phytogeographical regions, antioxidant activity and anthelmintic activity in sheep and goats, in order to obtain an anthelmintic product. The samples of geopropolis were collected in the municipalities of Palmeirândia and Fernando Falãao, MA and subjected to extraction to obtain the hydroalcoholic extracts of geopropolis. Geopropolis extracts obtained from the municipalities of Palmeirândia and Fernando Falcão, MA, were determined the total phenolic content by the Folin-Ciocalteu and antioxidant activity using the in vitro assay with 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH) and ferric reducing antioxidant power (FRAP). Extracts were derivatized and analyzed by gas chromatography-mass spectrometer (GC/MS) to identify the chemical constituents. Samples of geopropolis of different phytogeographical regions showed variations in the total phenolic content (126.60 – 847.50 mgGAE/g), and antioxidant activity antioxidante for DPPH (IC50 4.24 – 44.44 µg/mL) and FRAP (1.29 – 18.42 mmol FeII/g), the geopropolis from Fernando Falcao, showed better levels. On geopropolis from municipality of Palmeirândia were identified triterpenes cicloartane type, ursane and oleanane and phenolic acids (gallic acid and protocatechuic acid), whereas in geopropolis from Fernando Falcão, phenolic acids, gallic acid and ellagic were the main constituents. Besides the chemical identification extracts were subjected to anthelmintics in vitro larval exsheathment inhibition assay with Haemonchus contortus, with activity only the extract originating from the municipality of Fernando Falcão, and gotten a bioproduct (patent filed) when tested under the same conditions also presents action anthelmintic. This same sample from municipality of Fernando Falcão was subjected to a new extraction to obtain a higher yield, fractioned and, biomonitoring by liquid/liquid partition with solvents of different polarities, yielding fractions: hexane (HFG), chloroform (CFG), ethyl acetate (EAFG) and hydroalcoholic (HAFG). The extract and fractions were evaluated with anthelmintics in vitro assays larval exsheathment inhibition and egg hatch of Haemonchus contortus. New spectrophotometric analyzes were conducted to determine the polyphenol contents, in vitro antioxidant activity on DPPH and FRAP and chromatographic profile by high-performance liquid chromatography coupled with UV detector (HPLC/UV) and identification of the chemical components of the active fractions was performed by highperformance liquid chromatography coupled to mass spectrometry (HPLC/MS). For the egg hatch test EC50% ranged from 2.01 to 3.73 mg/ml to extract and fractions being the most active fraction EAFG with EC50 2.01 mg/ml, and exsheathment larval varied with EC50 0.12 - 0.55 mg/ml, most active fraction HAFG EC50 0.12 mg/ml. The extract and fractions showed high levels of polyphenols (64.50 - 650.19 mgGAE/g) and antioxidant activity (IC50 6.50 – 29.80 µg/mL) and FRAP (6.91 -17.19 mM Fe2+/g). The hexane fraction had low income in this way was not subject to anthelmintics tests did not show antioxidant and had the lowest concentrations of polyphenols. The active fractions were identified phenolic acid (ellagic acid and derivatives, and brevifolin carboxilate, caftaric acid), hydrolyzable tannins (gallotannins and ellagitannins). The anthelmintic activity of geopropolis of Melipona fasciculata (tiúba) is probably related to the antioxidant activity and the presence of phenolic compounds mainly phenolic acids and hydrolyzable tannins, also plant sources used by bees to produce the geopropolis contribute to the composition chemical and bioactivity of the product. / Um dos principais entraves ao crescimento da caprinovinocultura são as parasitoses gastrintestinais, que representam o maior e mais grave problema sanitário, chegando a inviabilizar economicamente a criação, em função da resistência dos parasitos aos fármacos anti-helmínticos. Os produtos naturais, especialmente a geoprópolis produzida por abelhas sem ferrão do gênero Melipona, com destaque para Melipona fasciculata Smith (tiúba) surge como uma alternativa para tratamento dessas enfermidades. Dados na literatura sobre atividade anti-helmíntica com a geoprópolis são escassos, desta forma, objetivamos avaliar a composição química da geoprópolis de diferentes regiões fitogeográficas, atividade antioxidante e atividade anti-helmíntica em caprinos e ovinos, visando a obtenção de um produto anti-helmíntico. As amostras de geoprópolis foram coletadas nos municípios de Palmeirândia e Fernando Falcão, MA e submetidas a extração para obtenção dos extratos hidroalcoólicos da geoprópolis. Dos extratos obtidos das geoprópolis oriundas dos municípios de Palmeirândia e Fernando Falcão, MA, foram determinados os teores de fenólicos totais pelo reagente de Folin−Ciocalteu, e atividade antioxidante utilizando o ensaio in vitro com o 2,2-difenil-1-picrilhidrazil (DPPH) e capacidade redutora do ferro (FRAP). Os extratos foram derivatizados e analizados por cromatografia gasosa acoplada a espectrômetro de massas (CG/EM), para identificação dos constituintes químicos. As amostras da geoprópolis oriundas das diferentes regiões fitogeográficas apresentaram variações no teor de fenólicos totais (126,60 – 847,50 mgEAG/g), atividade antioxidante para DPPH (IC50 4,24 - 44,44 µg/mL) e FRAP (1,29 – 18,42 mmol FeII/g) no entanto, as geoprópolis de Fernando Falcão, apresentaram melhores teores. Nas geoprópolis do município de Palmeirândia foram identificados, triterpenos do tipo cicloartano, ursano e oleanano e ácidos fenólicos (ácido protocatecuico e ácido gálico), enquanto que na geoprópolis de Fernando Falcão, ácidos fenólicos, ácido gálico e elágico foram os principais constituintes. Além da identificação química os extratos foram submetidos a teste anti-helmínticos in vitro de desembainhamento larvar com Haemonchus contortus, apresentando atividade apenas o extrato oriundo do município de Fernando Falcão, sendo obtido um bioproduto (patente depositada) que quando testado nas mesmas condições também apresenta ação anti-helmíntica. Essa mesma amostra oriunda do município de Fernando Falcão foi submetida a uma nova extração para obtenção de um maior rendimento, fracionada por biomonitoramento, por partição líquido/líquido com solventes de diferentes polaridades, obtendo-se frações: hexânica (HFG), clorofórmica (CFG), acetato de etila (EAFG) e hidroalcoólica (HAFG). O extrato e frações foram avaliados com testes anti-helmínticos in vitro de desembainhamento larvar e inibição da eclodibilidade de ovos de Haemonchus contortus. Novas analises espectrofotométricas foram realizadas a para determinação dos teores polifenois totais, atividade antioxidante in vitro com DPPH e FRAP e perfil cromatográfico por cromatografia líquida de alta eficiência acoplada a detector de ultravioleta (CLAE/UV) e a identificação dos componentes químicos das frações ativas foi realizada por cromatografia liquída de alta eficiência acoplada a espectrômetro de massas (CLAE/EM). Para o teste de eclodibilidade de ovos a CE50 variou de 2,01 – 3,73 mg/mL, para extrato e frações sendo a fração mais ativa EAFG com CE50 2,01 mg/mL, e o teste de desembainhamento larvar variou com CE50 de 0,12 – 0,55 mg/mL, a fração mais ativa HAFG com CE50 0,12 mg/mL. O extrato e frações apresentaram altos teores de polifenóis totais (64,50-650,19 mgEAG/g) e atividade antioxidante para DPPH (IC50 6,50 – 29,80 µg/mL) e FRAP (6,91 -17,19 mM Fe2+/g). A fração hexânica apresentou baixo rendimento desta forma não foi submetida a testes anti-helmínticos, não apresentou ação antioxidante e apresentou as menores concentrações de polifenóis. Nas frações ativas foram identificados ácido fenólicos (ácido elágico e derivados, brevifolin e ácido caftárico), taninos hidrolisáveis (galotaninos e elagitaninos). A atividade anti-helmíntica da geoprópolis de Melipona fasciculata (tiúba) provavelmente está relacionada com a atividade antioxidante e à presença de compostos fenólicos principalmente ácidos fenólicos e taninos hidrolisáveis, além disso, as fontes vegetais utilizadas pelas abelhas para a produção da geoprópolis contribuem para a composição química e bioatividade deste produto.
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Metodologia computacional para detecção automática de estrabismo em imagens digitais através do Teste de Hirschberg / Computational Methods for Detection Automatic Strabismus in Pictures Digital by Hirschberg's test

ALMEIDA, João Dallyson Sousa de 12 February 2010 (has links)
Submitted by Rosivalda Pereira (mrs.pereira@ufma.br) on 2017-08-14T17:54:04Z No. of bitstreams: 1 JoaoDallysonAlmeida.pdf: 4607146 bytes, checksum: 8e76d2b2ba34e77fcc3d20c8cfa92e17 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-14T17:54:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JoaoDallysonAlmeida.pdf: 4607146 bytes, checksum: 8e76d2b2ba34e77fcc3d20c8cfa92e17 (MD5) Previous issue date: 2010-02-12 / Strabismus is a pathology that affects about 4% of the population causing aesthetic problems, reversible at any age, and irreversible tensorial alterations, modifying the vision mechanism. Hirschberg's test is one of the available exams to detect such pathology. Computer Aided Diagnosis and Detection Systems have been used with relative success to help health professionals. Nevertheless, the increasingly application of high technology resources to help diagnosis and therapy in ophthalmology is not a reality in the Strabismus sub-specialty. This way, the present work has the objective of introduing a methodology for automatic detection Strabismus in digital images through Hirschberg's test. For such, it is organized in four stages: finding the region of the eyes, precise location of the eyes, limb and bright, and identi cation of Strabismus The methodology presents results of 100% of sensibility, 91,3% of specificity and 94% of match in the identification of Strabismus, comproving the eficiency of the geostatistical functions in the extraction of the texture of the eyes and of the calculations of the alignment between eyes in digital images acquired from Hirschberg's test. / O estrabismo é uma patologia que afeta cerca de 4% da população provocando problemas estéticos, reversíveis a qualquer idade, e alterações sensoriais irreversíveis, modificando o mecanismo da visão. O teste de Hirschberg é um dos tipos de exames existentes para detectar tal patologia. Sistemas de Detecção e Diagnóstico auxiliados por computador (Computer Aided Detection/Diagnosis) estão sendo usados com relativo sucesso no auxílio aos profissionais de saúde. No entanto, o emprego cada vez mais rotineiro de recursos de alta tecnologia, no auxílio diagnóstico e terapêutico em oftalmologia, não é uma realidade dentro da subespecialidade estrabismo. Sendo assim, o presente trabalho tem como objetivo apresentar uma metodologia para detectar automaticamente o estrabismo em imagens digitais através do teste de Hirschberg. Para tal, o estudo está organizado em quatro fases: localização da região dos olhos, localização precisa dos olhos, localização do limbo e do brilho, e identificação do estrabismo. A metodologia apresenta resultados de 100% de sensibilidade, 91,3% de especificidade e 94% de acerto na identificação do estrabismo comprovando a eficiência das funções geoestatísticas na extração de textura dos olhos e do cálculo da alinhamento entre os olhos em imagens digitais adquiridas a partir do teste de Hirschberg.
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Detecção automática de massas em mamografias digitais usando Quality Threshold clustering e MVS / Automatic mass detection on digital mammography using Quality Threshold clustering and MVS

SILVA, Joberth de Nazaré 20 February 2013 (has links)
Submitted by Rosivalda Pereira (mrs.pereira@ufma.br) on 2017-08-16T18:29:06Z No. of bitstreams: 1 JoberthSilva.pdf: 6383640 bytes, checksum: f18918eb45c49cb426b560e4daddf994 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-16T18:29:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JoberthSilva.pdf: 6383640 bytes, checksum: f18918eb45c49cb426b560e4daddf994 (MD5) Previous issue date: 2013-02-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Breast cancer is worldwide the most common form of cancer affecting woman, sometimes in their lives, at the proportion of either one to nine or one to thirteen women who reach the age of ninety in the west world (LAURENCE, 2006). Breast cancer is caused by frequent reproduction of cells in various parts of the human body. At certain times, and for reasons yet unknown, some cells begin to reproduce at a higher speed, causing the onset of cellular masses called neoplasias, or tumors, which are new tissue formation, but from pathological origin. This work has proposed a method of automatic detection of masses in digital mammograms, using the Quality Threshold (QT), and the Supporting Vector Machine (MVS). The images processing steps were as follows: firstly, the pre-processing phase took place which consisted of removing the background image, smoothing it with a low pass filter, to increase the degree of contrast, and then, in sequence, accomplishing an enhancement of the Wavelet Transform (WT) by changing their coefficients with a linear function. After the pre-processing phase, came the segmentation with the use of the QT which divided the image in to clusters with pre-defined diameters. Then, the post-processing occurred with the selection of the best candidates to mass formed by the MVS analysis of the shape descriptors. For the extraction phase of texture features the Haralick descriptors and the function correlogram were used. As for the classification stage, the MVS was used again for training, validation of the MVS model and final test. The achieved results were: sensitivity of 92. 31%, specificity of 82.2%, accuracy of 83,53%, a false positive rate per image of 1.12 and an area under a FROC curve of 0.8033. / O câncer de mama é, mundialmente, a forma mais comum de câncer em mulheres afetando, em algum momento suas vidas, aproximadamente uma em cada nove a uma em cada treze mulheres que atingem os noventa anos no mundo ocidental (LAURANCE, 2006). O câncer de mama é ocasionado pela reprodução frequente de células de diversas partes do corpo humano. Em certos momentos e por motivos ainda desconhecidos algumas células começam a se reproduzir com uma velocidade maior, ocasionando o surgimento de massas celulares denominadas de neoplasias ou tumores que são tecidos de formação nova, mas de origem patológica. Neste trabalho foi proposto um método de detecção automática de massas em mamografias digitais usando o Quality Threshold (QT), e a Máquina de Vetores de Suporte (MVS). As etapas de processamento das imagens foram as seguintes: primeiramente veio a fase de pré-processamento que consiste em retirar o fundo da imagem, suavizá-la com um filtro passa-baixa, aumentar a escala de contraste, e na sequencia realizar um realce com a Transformada de Wavelet (WT) através da alteração dos seus coeficientes com uma função linear. Após a fase de pré-processamento vem a seguimentação utilizando o QT que segmenta a imagem em clusters com diâmetros pré-definidos. Em seguida, vem o pós-processamento com a seleção dos melhores candidatos à massa feita através da análise dos descritores de forma pela MVS. Para fase de extração de características de textura foram utiliza os descritores de Haralick e a função correlograma. Já na fase de classificação a MVS novamente foi utilizada para o treinamento, validação do modelo MVS e teste final. Os resultados alcançados foram: sensibilidade de 92,31%, especificidade de 82,2%, Acurácia de 83,53%, uma taxa de falsos positivos por imagem de 1,12 e uma área sob a curva FROC de 0,8033.
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Classificação de tecidos da mama em massa e não-massa usando índice de diversidade taxonômico e máquina de vetores de suporte / Classification of breast tissues in mass and non-mass using index of Taxonomic diversity and support vector machine

OLIVEIRA, Fernando Soares Sérvulo de 20 February 2013 (has links)
Submitted by Rosivalda Pereira (mrs.pereira@ufma.br) on 2017-08-17T17:25:58Z No. of bitstreams: 1 FernandoOliveira.pdf: 2347086 bytes, checksum: 0b2d54b7d13b7467bee9db13f63100f5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-17T17:25:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FernandoOliveira.pdf: 2347086 bytes, checksum: 0b2d54b7d13b7467bee9db13f63100f5 (MD5) Previous issue date: 2013-02-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Breast cancer is the second most common type of cancer in the world and difficult to diagnose. Distinguished Systems Aided Detection and Diagnosis Computer have been used to assist experts in the health field with an indication of suspicious areas of difficult perception to the human eye, thus aiding in the detection and diagnosis of cancer. This dissertation proposes a methodology for discrimination and classification of regions extracted from the breast mass and non-mass. The Digital Database for Screening Mammography (DDSM) is used in this work for the acquisition of mammograms, which are extracted from the regions of mass and non-mass. The Taxonomic Diversity Index (∆) and the Taxonomic Distinctness (∆*) are used to describe the texture of the regions of interest, originally applied in ecology. The calculation of those indices is based on phylogenetic trees, which applied in this work to describe patterns in regions of the images of the breast with two regions bounding approaches to texture analysis: circle with rings and internal with external masks. Suggested in this work to be applied in the description of patterns of regions in breast imaging approaches circle with rings and masks as internal and external boundaries regions for texture analysis. Support Vector Machine (SVM) is used to classify the regions in mass or non-mass. The proposed methodology provides successful results for the classification of masses and non-mass, reaching an average accuracy of 99.67%. / O câncer de mama é o segundo tipo de câncer mais frequente no mundo e de difícil diagnóstico. Distintos Sistemas de Detecção e Diagnóstico Auxiliados por Computador (Computer Aided Detection/Diagnosis) têm sido utilizados para auxiliar especialistas da área da saúde com a indicação de áreas suspeitas de difícil percepção ao olho humano, assim ajudando na detecção e diagnóstico de câncer. Este trabalho propõe uma metodologia de discriminação e classificação de regiões extraídas da mama em massa e não-massa. O banco de imagens Digital Database for Screening Mammography (DDSM) é usado neste trabalho para aquisição das mamografias, onde são extraído as regiões de massa e não-massa. Na descrição da textura da região de interesse são utilizados os Índices de Diversidade Taxonômica (∆) e Distinção Taxonômica (∆*), provenientes da ecologia. O cálculo destes índices é baseado nas árvores filogenéticas, sendo aplicados neste trabalho na descrição de padrões em regiões das imagens da mama com duas abordagens de regiões delimitadoras para análise da textura: círculo com anéis e máscaras internas com externas. Para classificação das regiões em massa e não-massa é utilizado o classificador Máquina de Vetores de Suporte (MVS). A metodologia apresenta resultados promissores para a classificação de massas e não-massas, alcançando uma acurácia média de 99,67%.
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CARACTERIZAÇÃO DE NÓDULOS PULMONARES SOLITÁRIOS UTILIZANDO ÍNDICE DE SIMPSON E MÁQUINA DE VETORES DE SUPORTE. / CHARACTERIZATION OF SOLID PULMONARY NODULES USING SIMPSON INDEX AND VECTOR MACHINE SUPPORT.

SILVA, Cleriston Araújo da 12 February 2009 (has links)
Submitted by Maria Aparecida (cidazen@gmail.com) on 2017-08-18T14:02:37Z No. of bitstreams: 1 cleriston.pdf: 1605933 bytes, checksum: c1faa5f854c1a9debfbaa1affc5ab4ad (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-18T14:02:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 cleriston.pdf: 1605933 bytes, checksum: c1faa5f854c1a9debfbaa1affc5ab4ad (MD5) Previous issue date: 2009-02-12 / The diagnosis of lung nodules has been constantly looked for by researchers as a way to minimize the high global mortality indices related to lung cancer. The usage of medical images, such as Computerized Tomography, has made possible the deepening and the improvement of techniques used to evaluate exams and provide diagnosis. This work presents a methodology for diagnosing single lung nodules that can be an aid for studies performed on similar areas and for specialists. This methodology was applied to two different image databases. The representation of the nodules was done with extraction of geometry and texture features, being the last one described through Simpson’s Index, a statistic used in Spatial Analysis and in Ecology. These features were submitted to the Support Vector Machine classifier (SVM) in two approaches: the traditional approach and the approach by using One Class. With the traditional SVM approach, we have obtained sensibility rates of 90%, specificity of 96.67% and accuracy of 95%. Using One Class SVM, the obtained rates were: sensibility of 89.7%, specificity of 89.7% and accuracy of 89.7%. / O diagnóstico de nódulos pulmonares tem sido buscado constantemente por pesquisadores como forma de amenizar os altos índices de mortalidade mundial relacionado ao câncer de pulmão. O uso de imagens médicas, como a Tomografia Computadorizada, tem possibilitado um aprofundamento e melhoramento de técnicas para avaliar exames e prover diagnósticos. Este trabalho apresenta uma metodologia para diagnóstico de nódulos pulmonares solitários que possa servir como um auxílio para estudos realizados em áreas afins e para especialistas. Esta metodologia foi aplicada a duas diferentes bases de dados de imagens. A representação dos nódulos foi feita com a extração de medidas de geometria e de textura sendo esta última descrita através do Índice de Simpson, uma estatística utilizada na Análise Espacial e na Ecologia. Essas medidas foram submetidas ao classificador Máquina de Vetores de Suporte - MVS em duas abordagens: a abordagem tradicional e abordagem usando uma classe. Com abordagem MVS tradicional, obtiveramse taxas de sensibilidade de 90%, especificidade de 96,67% e acurácia de 95%. Usando MVS de uma classe, as taxas obtidas foram: sensibilidade igual a 89,7%, especificidade igual a 89,7% e acurácia igual a 89,7%.
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Relação vírus-vetor-hospedeira no patossistema da leprose dos citros / Citrus leprosis pathosystem: virus-vector-host relationship

Garita Salazar, Laura Cristina 15 February 2013 (has links)
A leprose dos citros é considerada uma das doenças mais destrutivas da indústria citrícola. O patossistema dessa doença envolve o agente causal o Citrus leprosis virus C, o vetor Brevipalpus phoenicis Geijskes (Acari: Tenuipalpidae) e as plantas hospedeiras. Este vírus com genoma conhecido é membro tipo do gênero Cilevirus. Causa sintomas localizados nas folhas, frutos e caules e está restrito ao continente Americano. Apesar de muitos esforços para se conhecer o patossistema, ainda existem muitas questões pendentes sobre as interações. O presente trabalho teve como objetivo obter informações detalhadas sobre as relações vetorvírus- hospedeiro da leprose citoplasmática, estando dividido em três objetivos: 1. Procurou-se uma planta indicadora padrão que fosse de facil obtenção, manejo e baixo custo, e que expressase em curto tempo os sintomas de CiLV-C e outros vírus transmitidos por Brevipalpus (VTBr); 2. Determinar parâmetros como o período de acesso para aquisição e inoculação do CiLV-C pelo ácaro vetor, o período de retenção do vírus pelo ácaro, avaliação da capacidade das diferentes fases do ácaro de transmitir o vírus e a % de indivíduos de uma população de ácaros colonizando plantas afetadas pela leprose capazes de transmitir o vírus; 3. Avaliar um grande número de espécies de plantas, de diferentes famílias botânicas, quanto à suscetibilidade experimental à infecção pelo CiLV-C, pelo ácaro vetor. A presença de CiLV-C nestes ensaios foi confirmada por testes de ELISA, RT-PCR, microscopia eletrônica de transmissão e imunofluorescência. O feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.) reage com lesões necróticas locais em apenas cinco dias à inoculação com ácaros virulíferos, podendo-se reduzir para dois dias se as plantas forem incubadas a 28ºC. O cv. ,,Una\" foi selecionado como planta-teste padrão dentre 113 cvs. avaliados. Outros vírus transmitidos por Brevipalpus do tipo citoplasmático (VTBr) como vírus da pinta verde do maracujá (Passion fruit green spot virus PFGSV), vírus da mancha anular de Ligustrum (Ligustrum ringspot virus LigRSV) e mancha verde do hibisco (Hibiscus green spot vírus HGSV) também causaram lesões locais necróticas em feijoeiro. Usando feijão como planta teste e ácaros virulíferos, se determinou o período de acesso à aquisição do vírus-4 h; período de acesso à inoculação do vírus-4h; período de retenção do vírus no ácaro de 12 dias, porcentagem de ácaros virulíferos, colonizando tecidos infectados, transmitirem CiLV-C em até 45%. Os experimentos também confirmaram que todas as etapas de desenvolvimento do ácaro (larvas, proto-deutoninfa e adultos) são capazes de transmitir CiLV-C, inclusive confirmou-se que o macho tem a capacidade de transmissão e que o vírus pode ser adquirido a partir de lesões de folhas, frutos e caules. Não se constatou transmissão transovariana do CiLV-C. Foram testadas 140 espécies, de 45 famílias, dentro das quais 62 espécies de 26 famílias apresentaram lesões localizadas nas folhas. Destas, 46 espécies sintomáticas, o CiLV-C foi detectado em pelo menos um dos testes para sua detecção, confirmando a transmissão. O conhecimento de parâmetros de alimentação, retenção do vírus e porcentagem de ácaros viruliferos na população, além do genoma de hospedeiras suscetíveis ao vírus tem importantes implicações no entendimento da epidemiologia, na quarentena e podem oferecer indícios da origem do CiLV-C. / Citrus leprosis (CL), caused by the Citrus leprosis virus C (CiLV-C), is reported only in the American continent. The pathosystem of the CL involves the causal agent, the main vector Brevipalpus phoenicis Geijeskes (Acari: Tenuipalpidae) and the susceptible hosts. For long time only Citrus spp. were considered the sole susceptible host. The entire genome of the CiLV-C was sequenced and a new genus, Cilevirus, was assigned for this virus. CL is characterized by the induction of localized symptoms on the leaves, fruits and stems. Important advances were made recently for the understanding of CL pathosystem, but despite these efforts little is known about details of the virus/vector/host relationship. The present work aimed to cover such deficiencies. In the first place a search of suitable indicator plant was made and the common bean (Phaseolus vulgaris L.) was found to respond with localized necrotic lesions after infestation with viruliferous B. phoenicis in five days and when infested leaves are incubated at 28°C. Furthermore, bean plants are easy and cheap to produce and handle. The black bean cv. ,,IAC Una\" was adopted as a standard test variety, among 113 assayed cultivars of various genetic backgrounds. Common bean plants mite-inoculated with other cytoplasmic-type Brevipalpus-transmitted viruses (BrTVs) [Passion fruit green spot virus (PFGSV), Solanum violaefolium ringspot virus (SvRSV), Ligustrum ringspot virus (LigRSV) and Hibiscus green spot virus (HGSV)] also responded with necrotic local lesions and could serve as test plants for these viruses. Detecion of these viruses were made by RTPCR and/or transmission electron microscopy. Using common bean as test plant, some parameters of the vector/virus relationship were determined: virus acquisition feeding period- 4 h; virus inoculation feeding period- 4h; period of retention of the virus by a single viruliferous mite- at least 12 days; percentage of viruliferous mites from a mites colonizing infected tissues- 45%. The experiments also confirmed that all the developmental stages of the mite (larvae, proto- and deutonymph, adult) as well as males are able to transmit CiLV-C. No transovarial passage of the CiLV-C was registered. The virus can be acquired from lesions of leaves, fruits and stems. To assess the experimental host range of CiLV-C, a large number of plant species were inoculated with B. phoenicis, viruliferous to CiLV-C, under experimental conditions. Of the140 species tested, belonging to 45 families, 62 (of 26 families) produced localized lesions on inoculated leaves. Of these 62 plants producing local lesions, 45 had the presence of CiLV-C confirmed by at least one of the assays to detect the virus (RT-PCR, ELISA, transmission electron microscopy and immunofluorescence). These assays were also used to confirm the presence of CiLV-C in transmission experiments. Although only few non Citrus species were found naturally infected by CiLV-C, present results show that a large number of plant species are susceptible to the virus with implications on the epidemiology, quarantine and the evolution of the citrus leprosis pathosystem.

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