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Analise estatistica de polimorfismo molecular em sequencias de DNA utilizando informações filogeneticas

Kiihl, Samara Flamini, 1980- 25 February 2005 (has links)
Orientador: Hildete Prisco Pinheiro / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica / Made available in DSpace on 2018-08-04T03:26:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kiihl_SamaraFlamini_M.pdf: 1063133 bytes, checksum: 4c4cce349b3bd30501a820e973a44fb2 (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: Variacao genetica no nivel de nucleotideo e uma fonte poderosa de informacao para o estudo da evolucao de uma populacao. Importantes aspectos da evolucao de populacoes naturais tem sido investigados utilizando sequencias de nucleotideos. A quantidade ? = 4N?, em que N e o tamanho efetivo da populacao e ? e a taxa de mutacao por sequencia (gene, locus) por geracao, e um parametro essencial porque determina o grau de polimorfismo em um locus. O sucesso da inferencia sobre a evolucao de uma populacao e medido pela acuracia da estimacao deste parametro. Esta dissertacao de mestrado apresenta diversos metodos de estimacao do parametro ?, bem como uma comparacao entre eles atraves de simulacoes e aplicacoes a dados reais. Utilizando informacoes filogeneticas de amostras de sequencias de DNA, constr'oi-se um modelo linear onde o coeficiente da variavel independente e a estimativa do parametro ?. Verificou-se que utilizando informacoes filogeneticas dos dados obtem-se estimadores bem mais eficientes / Abstract: Genetic variation at the nucleotide level is a powerful source of information for studying the evolution of a population. Important aspects of the evolution of a population have been investigated by using nucleotide sequences. The quantity ? = 4N?, where N is the effective size of the population and ? is the mutation rate per sequence (gene, locus) per generation, is an essential parameter because it determines the degree of polymorphism at the locus. The degree of success in our inference about the evolution of a population is measured to some extent by the accuracy of estimation of this essential parameter. This work presents some methods of estimation of this parameter, comparisons between the different methods through computational simulations and applications to real data. The evolution of a species can be seen through a phylogenetic tree and a linear model can be constructed by using the phylogenetic information to estimate ?. It has been verified that the use of such information leads us to more accurate estimators of ? / Mestrado / Estatistica / Mestre em Estatística
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Líquidos e soluções: aplicações do método de Monte Carlo e estatística de redes complexas

SILVA, Juliana Angeiras Batista da 31 January 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T23:16:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo937_1.pdf: 3577801 bytes, checksum: d3b438f35146c4886e6426bba0ca184f (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Metodologias baseadas no formalismo de redes complexas foram utilizadas para a obtenção de propriedades topológicas e da estatística de ilhas de líquidos, misturas e soluções que apresentam redes de ligações de hidrogênio, obtidas por simulação Monte Carlo (MC-NPT). Inicialmente estudou-se o comportamento da rede de ligações de hidrogênio em dois sistemas modelos: água e metanol com o amortecimento (η) da contribuição eletrostática para a interação intermolecular. Estes sistemas apresentaram comportamentos distintos, incluindo padrões de pequenos mundos e transição de percolação. Foi estabelecida uma relação direta entre as transições de fase de propriedades macroscópicas (densidade e entalpia de vaporização) com as propriedades topológicas das redes de ligação de hidrogênio. O formalismo de redes complexas é robusto, pois as mesmas conclusões foram obtidas para potenciais diferentes (TIP5P × 6-sítios) para água, bem como diferentes critérios para definição da ligação de hidrogênio, exceto o coeficiente de agrupamento, que apresentou grande dependência com o potencial e os critérios. As propriedades topológicas das redes de ligações de hidrogênio em água, metanol, t-butanol, n-butanol, amônia (em -33,35ºC) e suas misturas com água, obtidas por simulações de Monte Carlo, também foram analisadas com o formalismo de redes complexas. Os líquidos puros apresentam propriedades topológicas distintas, que podem ser correlacionadas com o número e a energia de interação de ligação de hidrogênio. Por exemplo, t-butanol apresenta padrões de pequenos mundos, enquanto os outros líquidos apresentam diferentes modos de agregação. Foram encontradas novas evidências de mudanças estruturais em frações molares de metanol próximas de 0,3 para misturas água-metanol, bem como características de microimiscibilidade. Diferenças marcantes foram encontradas nos modos de agregação dos isômeros do butanol e de suas misturas com água, principalmente nos coeficientes de agrupamento. As distribuições das conectividades intercalam entre os regimes broad-scale, sistemas que apresentam restrições na formação de ligações fazem parte desta classe de redes de pequenos mundos, e single-scale, dependendo da composição da mistura. O método de Monte Carlo com penalidade (MC-σ) foi testado para a água líquida descrita pelo potencial analítico TIP5P com adição de ruído Gaussiano com desvio padrão σ. Os resultados foram insatisfatórios, tanto com a amostragem do espaço de fase restrita ao uso da probabilidade de aceitação com penalidade quanto sem o uso desta restrição. Pelo fato dos ruídos poderem ser negativos e assim diminuírem a energia da configuração, ocorreu uma estabilização excessiva do sistema, isto é, as energias tornam-se muito negativas. Tentativas de correção deste método também foram inadequadas, e aparentemente o método MC-σ é aplicável apenas ao caso em que as energias são estocásticas, mas limitadas inferiormente, como em métodos de Monte Carlo quântico variacional
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Análise estatística de dados radioecológicos discrepantes usando o método Monte Carlo bootstrap

SILVA, Arykerne Nascimento Casado da 31 January 2013 (has links)
Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-03-03T13:02:19Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Arykerne Nascimento Casado da Silva.pdf: 1498641 bytes, checksum: 3834e238d6f9e275221a8b81e0bcb399 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-03T13:02:19Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Arykerne Nascimento Casado da Silva.pdf: 1498641 bytes, checksum: 3834e238d6f9e275221a8b81e0bcb399 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013 / O método de reamostragem bootstrap vem sendo estudado e utilizado desde 1979. Em Radioecologia existem dificuldades operacionais na obtenção de amostras de campo, levando o pesquisador algumas vezes a trabalhar com um número insuficiente de dados. Além disso, é frequente o surgimento de valores discrepantes nos dados amostrais. Como consequência, a análise estatística das amostras pode requerer a utilização de métodos analíticos paramétricos. O método bootstrap é executado utilizando o poder de processamento dos microcomputadores atuais. As reamostras são obtidas pelo método Monte Carlo através de um sorteio aleatório dos dados reais fornecidos, considerando que eles sejam independentes. Este trabalho foi desenvolvido com o objetivo de aplicar o método bootstrap na análise estatística de dados radioecológicos e auxiliar o pesquisador na obtenção dos estimadores mais adequados para os parâmetros populacionais. O método utiliza o aplicativo R, uma ferramenta interativa poderosa para cálculos estatísticos. A ferramenta permite também programação orientada a objetos através de interpretação. Os dados utilizados para os cálculos foram 14 concentrações do 226Ra na palma forrageira (Opuntia spp) que apresentaram variações entre 1.495 a 25.000 mBq.kg-1 na matéria seca, com média aritmética simples de 5.965,86 ± 5.903,05 mB.kg-1. A aplicação do método de reamostragem bootstrap com 1.000 iterações, através do algoritmo desenvolvido, obteve um valor médio de 6.012,85 ± 1.597,83 mBq.kg-1. Este, mais representativo que o do conjunto amostral, pois não sofreu influência dos valores discrepantes. Foi possível concluir então que o método bootstrap tem aplicação válida para a análise estatística univariada de dados radioecológicos.
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Estudo estatistico de parametros do processamento de borracha SBR para banda de rodagem de pneumaticos

Cassiano, Douglas Alves 25 April 2003 (has links)
Orientadores: Elias Basile Tambourgi, Luiz Carlos Bertevello / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Quimica / Made available in DSpace on 2018-08-03T15:06:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cassiano_DouglasAlves_D.pdf: 2595736 bytes, checksum: 782f8b2becea04b26425e612a8192f2c (MD5) Previous issue date: 2003 / Resumo: No presente trabalho, o estudo do processamento da borracha estireno-butadieno para banda de rodagens de pneumáticos foi efetuado. As operações de mistura dos componentes em misturador de câmara fechada tipo banbury e vulcanização do material em prensa aquecida foram avaliadas utilizando-se a metodologia do planejamento fatorial. As influências da velocidade de rotação de mistura, pressão interna e tempo de processamento em banbury foram avaliadas tendo por objetivo maximizar a dispersão de negro de fumo, obtendo-se uma dispersão de 95,5% na condição operacional de 30 rpm, em 06:00 minutos à 3 Kgf/cm2. Nos ensaios de vulcanização, avaliaram-se as influências exercidas pelo tempo e temperatura do processo na dureza, abrasão, resiliência e diferentes propriedades de tração do material. Modelos matemáticos foram obtidos utilizando-se o método de superfície de respostas para os ensaios de vulcanização. Ajustaram-se modelos matemáticos para a carga de ruptura, o percentual de deformação na ruptura e a resistência ao rasgamento do material em função do tempo e temperatura do processo de vulcanização. Uma discussão sobre as condições ótimas de processamento para as propriedades modeladas foi efetuada / Abstract: In the present work, the processing of styrene-butadiene rubber was studied. The studies were on the material for the part of tire in contact with the ground. The rubber components mixing in a banbury type internal mixer, and material vulcanization in a heated press, were studied by factorial design method. The influence of rotation speed, inner pressure and mixing time in the banbury were investigated in order to obtain a maximum in carbon black dispersion. A 95.5% carbon black dispersion was attained in the banbury, when mixing the material for 06:00 minutes, at 30 rpm, with 3 Kgf/cm2 of inner pressure. In the vulcanization assays, the influence of heating time and temperature over hardness, abrasion, resilience and tensile properties were evaluated. Mathematical models for vulcanization process were obtained by surface response method. Statistical models were fit for strength at rupture, deformation at rupture and tearing strength as function of heating time and temperature in vulcanization. Statements were made on optimal processing conditions from these models / Doutorado / Engenharia de Sistemas Quimicos e Informatica / Doutor em Engenharia Química
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Planejamento estatistico de experimentos aplicado ao processo de produção de protetores auditivos de espuma de poliuretano

Sato, Luciana Matsuyama 03 August 2018 (has links)
Orientador: Roy Edward Bruns / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-08-03T15:14:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sato_LucianaMatsuyama_M.pdf: 3632150 bytes, checksum: 1c8cd8c0cc39af2b6f4a40b57e91056c (MD5) Previous issue date: 2002 / Mestrado
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O conhecimento profissional dos professores e suas relações com estatistica e probabilidade na educação infantil

Lopes, Celi Aparecida Espasandin 03 August 2018 (has links)
Orientador: Anna Regina Lanner de Moura / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Educação / Made available in DSpace on 2018-08-03T15:34:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lopes_CeliAparecidaEspasandin_D.pdf: 3919999 bytes, checksum: 8a3ec1d9fabb4f616f828cd9f5d39c3f (MD5) Previous issue date: 2003 / Doutorado
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Uma plataforma flexivel de predição de cobertura celular com metodos empiricos e estatisticos combinados

D'Avila, Cesar Kyn 17 July 1995 (has links)
Orientador: Michel Daoud Yacoub / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Eletrica / Made available in DSpace on 2018-07-20T12:25:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 D'Avila_CesarKyn_M.pdf: 8043335 bytes, checksum: b337351abd4dde3c9f51922befee98e7 (MD5) Previous issue date: 1995 / Resumo: o objetivo principal alcançado por esse trabalho foi o desenvolvimento de uma plataforma flexível de predição de cobertura celular com métodos empÍricos e estatísticos combinados. A referida flexibilidade da plataforma está relacionada à possibilidade de se combinar diversos modelos e métodos propostos na literatura, possibilitando inclusive a obtenção de métodos não usuais, que unificam as características de diferentes modelos. As etapas necessárias para esse desenvolvimento foram desde o estudo das metodologias empÍricas e estatísticas de predição de cobertura, até a especificação e implementação da plataforma propriamente dita. Durante o processo foram ainda efetuadas uma série de contribuições como a proposição do método da estatística local, a proposição do método combinado ponto a ponto, desenvolvimento do modelo de reflexão de Okumura, além de análises e conclusões sobre as diversas metodologias estudadas / Abstract: Not informed. / Mestrado / Mestre em Engenharia Elétrica
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Aplicação de controle estatístico de processo na empresa Metasa como uma ferramenta de competitividade

Hessler, Carlos Vilibaldo 22 April 2008 (has links)
Nos últimos anos diversas áreas do setor produtivo vêm experimentando acelerados avanços tecnológicos e, desta forma, exigindo ferramentas cada vez mais específicas para monitorar e avaliar estes processos. Melhorias significativas nos processos de medições das características de qualidade têm sido observadas. Em relação ao controle de processo, em 1924, Walter Shewhart desenvolveu o conceito estatístico das cartas de controle para processos cujos dados sejam independentes e normalmente distribuídos, suposição esta que deve ser atendida para a construção das cartas de controle. Este artigo tem como objetivo mostrar a aplicação das cartas de controle estatístico de processo, no setor de pintura da Empresa Metasa, Rio Grande do Sul, Brasil, cuja característica do processo de pintura industrial analisada foi à espessura da camada de tinta. Os dados foram coletados levando em consideração, as seqüências que constituem o processo da aplicação da tinta (demãos de pintura), procurando-se oferecer uma melhoria sensível nos níveis de qualidade desse setor, com o objetivo de reduzir custos de produção. Os resultados encontrados são de grande importância para a empresa, pois foram estabelecidos os limites de controle que permitirão monitorar os processos. Para os casos onde a análise, entretanto, diagnosticou a permanência do processo fora de controle, se fez necessário o estudo das causas da variabilidade do mesmo. / In the last years many areas in the productive section have experienced fast technologic progress and, this way, demanding even more specific tools to control and assess these processes. Significant improvement in the processes of quality characteristics measurements has been noted. Regarding the process control, in 1924, Walter Shewhart (1931) developed the statistic concept of control letters to processes which data are independent and normally distributed, supposition that must be understood to control letters construction. This article has the goal to show the process statistic control letters, in the painting sector of the Company Metasa, Rio Grande do Sul, Brazil, which process characteristic of industrial painting analyzed was the paint coat thickness. The data were collected taking into consideration, the sequences that form the paint application process (painting coating), searching to offer a sensible improvement in the quality levels of this sector, with the objective of reducing production costs. The results found are of great importance to the company, since limits of control were established that will allow monitor the processes. For the cases where the analysis, otherwise, diagnosed the process permanence out of control, the study of their variability causes was necessary.
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Analise de qualidade de misturas proteicas pelo aminograma caracteristico e metodos estatisticos

Kumagai, Eunice Akemi 17 July 2018 (has links)
Orientador : Jaime Amaya-Farfan / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos e Agricola / Made available in DSpace on 2018-07-17T21:27:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kumagai_EuniceAkemi_M.pdf: 4784931 bytes, checksum: c9b2feddb39e1fd9605f3b83367edc57 (MD5) Previous issue date: 1983 / Resumo: Este trabalho tratou do estudo dos perfis aminoacídicos das proteínas visando a análise qualitativa e quantitativa de misturas protéicas binárias de origem animal e vegetal encontradas em produtos cárneos e formulações lácteas para consumo humano. Para tanto, foi coletado um número de amostras comerciais de produtos lácteos (premixespara mamadeiras, vitaminas e substitutos do leite em pó) e cárneos (salsichas, mortadelas, etc.).. Foram levantadas também curvas-padrão com as composições aminoacídicas, em quadruplicata, de misturas gradativas de leite-soja e carne-soja, as quais foram chamadas de grupos. Corno variáveis foram considerados os aminoácidos individuais e, como subgrupos, os conjuntos de quatro variáveis. Foram escolhidos os aminoácidos que melhor caracterizavam as fontes e os dados (composições aminoa cídicas) submetidos.a análise estatística que constou essencialmente de: a) Equação de Regressão (método manual) . Foi encontrada urna equação de regressão para cada aminoácido se paradamente e com esta equação calculou-se a porcentagem de pro teína de leite ou de carne nos produtos lácteos e árneos res pectivamente. Cada subgrupo gerou um teor de proteína referência para cada produto, de onde foi determinada a mediana representativa. b) Análise de Variância Multivariada e Análise Discriminante com Auxílio do Computador. Para a análise de variância multivariada foi utilizado o programa MANOVA em linguagem Fortran 10. O programa DISCRIMINANT em linguagem SPSS utilizado na análise discrirninante forneceu entre outros dados, os "scores" (produzidos pela função discriminante de cada subgrupo) para os diversos grupos das curvas-pa determinadas as medianas. A exatidão dos métodos testados, a julgar pelos resultados observados e pelos esperados foi satisfatória, visto que ambos permitiram a discriminação dentro dos intervalos preestabelecidos. Existe uma certa superioridade da análise discriminante sobre o mêtodo da equação de regressão quanto à exatidão dos resultados, uma vez que a análise discriminante assinala um peso estatístico para cada um dos aminoácidos. No entanto, visando o controle rotineiro da pureza de produtos no Brasil, -se-á optar pela equação de regressão considerando-se a sua maior simplicidade e os resultados obtidos / Abstract: The present is a study of the amino acid profiles of pnr teins aiming at the quality assurance of binary protein mixtures of either animal or vegetable origin found in milk and meat products for human consumption. A number of commercial milk'(pre-mixesfor bottle formulas, milk-shakes and milk substitutes) and meat (sausages, mo rtadelas, etc.) products were sampled for analysis. Standard aITVes were prepared in which groups were defined as the various mixtures of milk-soy and meat-soy proteins and sub-groups were sets of four amino acids (variables) that best characterized each protein source. The data (4 replicates) were statistically analyzed essentially as follows: a. Regression Equation (Manual procedure) . As a function of protein composition, each relevant amino acid generated a regression equation, which served to calculate the percent of milk or meat protein in the mixture. Since a number of percent 'values is obtained equal the number of existing subgroups, the median value was used for every product. b. Multivariate Analysis of Variance and Discriminant Analysis wfth the aid of a computer. For this purpose, the MANOVA program in Fortran-10 language and the DISCRIMINANT program in SPSS (Statistical Package for 80- cial Sciences) language were used. The Discriminant analysis furnishedprotein percentages in terms of scores for each one of the several sub-groups, from where the medians were obtained. The precision of the two procedures, assessed by comparing the experimentally obtained with the expected values, was reemed satisfactorywithin the pre-defined intervals. Especially due to the assignment of statistical weights to variables by the computer, the Discriminant Analysis seemed like the method of choice. However, for the purpose of routine quality assessment in Brasil, the Regression Equation procedure appears to sufice, considering its simplicity / Mestrado / Ciência de Alimentos / Mestre em Ciência de Alimentos
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Processo industrial de polimerização e copolimerização da acrilonitrila : abordagem experimental e modelagem estatistica

Marlet, Jose Maria Fernandes 04 May 1994 (has links)
Orientador: Edison Bittencourt / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-19T19:57:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marlet_JoseMariaFernandes_D.pdf: 7473936 bytes, checksum: cd640e85f05529e350c2a5ebac42c6c6 (MD5) Previous issue date: 1994 / Resumo: A terpolimerização da acrilonitrila com o acetato de vinila e com o metil-2 propeno-1 sulfonato de sódio em suspensão aquosa e a compolimerização da acrilonitrila com o acetato de vinila em suspensão aquosa, iniciada pelo sistema redox clorato de patássio/ bissulfito de sódio/ 'Fe POT. 2+¿, foram estudadas. Como variáveis importantes para o processo de terpolimerização e copolimorização foram consideradas a temperatura da reação, o tempo de residência e as concentrações molares da acrilonitrila, acetato de vinila , motil-2 propeno-1 sulfonato de sódio, NAHS¿O POT. 3¿, KCl¿O POT. 3¿ e de 'Fe POT. 2+¿ na estrada do reator. Como variáveis de resposta foram obtidas as taxas molares de consumo, as taxas de termopolimerização e copolimerizção, as massas, as taxas de termopolimerização, as massas moleculares ponderais médias dos terpolímeros e copolímeros obtidos, suas composições com relação aos termonômeros e comonômeros, a granulometria da suspensão de polímero e a produtividade do reator. Como variáveis de resposta foram obtidas as taxas molares de consumo, as taxas de terpolimerização e copolimerização, as massas moleculares ponderais médias dos terpolímeros e copolímeros obtidos, suas composições com relação aos termonômeros e comonômeros, a granulometria da suspensão de polímero e a produtividade do reator ...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: The terpolymerizatiion of acrylonitrile with vynil acetate and methyl ¿2 propene-1 sodium sulfonate in aqueous suspension and the copolymerization of acrylonitrile with vinyl acetate in aqueous suspension, initiated by the redox system potassium chlorate/ sodium bissufite/ 'Fe POT. 2¿,were studied. As important variables to the terpolumerzation and copolymerization process were considered the reaction temperature, the residence time and the input molar concentrationa of acrylonitrile, vinil acetate, methyl-2 propene-1 sodium sufonate, , NAHS¿O POT. 3¿, KCl¿O POT. 3¿ e de 'Fe POT. 2+¿. As response variables were obtained the monimer consuption rates, the terpolmerization or copolymerization rate, the weight-average molecular weight, their molar composition, the size of the polymer suspension and the reactor¿s productivity. Regression curves between the independent variables and the response variables were obtained. These equations compose the statistical kinetic model of the terpolymerization and copolymerization of acrylonitrile. In order to obtain these regression models, experiments were done in a pilote plant, consisting of a 227 l continuous stirred tank reactor and a stipping system to recover the non reacted monomers / Doutorado / Ciencia e Tecnologia de Materiais / Doutor em Engenharia Química

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