Submitted by Alex Sandro R?go (alex@ifpb.edu.br) on 2017-06-06T12:11:49Z No. of bitstreams: 1 33- Maria La?s F?lix da Silva - ESTUDO E DESENVOLVIMENTO DE SENSOR EM FIBRA ?PTICA POLIM?RICA BASEADO NA RESSON?NCIA DE PL?SMONS DE SUPERF?CIE.pdf: 1171314 bytes, checksum: 71f7ec19abb6963312d0d672f587dfcb (MD5) / Approved for entry into archive by Alex Sandro R?go (alex@ifpb.edu.br) on 2017-06-06T12:14:12Z (GMT) No. of bitstreams: 1 33- Maria La?s F?lix da Silva - ESTUDO E DESENVOLVIMENTO DE SENSOR EM FIBRA ?PTICA POLIM?RICA BASEADO NA RESSON?NCIA DE PL?SMONS DE SUPERF?CIE.pdf: 1171314 bytes, checksum: 71f7ec19abb6963312d0d672f587dfcb (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-06T12:14:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 33- Maria La?s F?lix da Silva - ESTUDO E DESENVOLVIMENTO DE SENSOR EM FIBRA ?PTICA POLIM?RICA BASEADO NA RESSON?NCIA DE PL?SMONS DE SUPERF?CIE.pdf: 1171314 bytes, checksum: 71f7ec19abb6963312d0d672f587dfcb (MD5) Previous issue date: 2017-05-06 / O presente trabalho tem como intuito estudar e desenvolver um sensor em fibra ?ptica polim?rica multimodo, baseado no fen?meno de Resson?ncia de Pl?smons de Superf?cie (Surface Plasmon Resonance, SPR). Esse fen?meno vem ganhando cada vez mais destaque devido ? elevada sensibilidade a pequenas varia??es de ?ndice de refra??o do meio externo. O interesse na utiliza??o de fibra ?ptica polim?rica como substrato deve-se ? possibilidade da redu??o de tamanho e peso, f?cil manuseio no que diz respeito ? remo??o da casca, realizada por meio de um procedimento simples, em que a fibra ? imersa em uma solu??o qu?mica, sem envolver processos mais complexos que poderiam aumentar o custo do sensor, al?m do acesso remoto. A configura??o utilizada ? o modelo de Krestchmann, baseado na Reflex?o Total Atenuada, constitu?do por tr?s camadas: um substrato ?ptico, uma camada met?lica com elevada condutividade e um analito com ?ndice de refra??o a ser identificado. A resposta do sensor ?ptico SPR neste trabalho usar? os modos de interroga??o espectral e angular, com os pontos de opera??o do sensor (comprimento de onda e ?ngulo de resson?ncia, respectivamente) determinados computacionalmente. Para a fabrica??o do sensor, uma caracteriza??o num?rica ? realizada com o intuito de investigar a espessura do filme fino e o ponto de opera??o do sensor para a detec??o do analito de interesse. O modelo utilizado ? composto por tr?s camadas: pol?mero (camada 1), Ouro (camada 2) e ?gua destilada (camada 3). Na prepara??o da regi?o sensora, ser? mostrado que a casca da fibra ?ptica deve ser removida quimicamente, e depositada em seu lugar uma camada fina de metal (Ouro), utilizando uma m?quina de pulveriza??o cat?dica. A carateriza??o experimental no modo de interroga??o angular apresenta concord?ncia com os resultados te?ricos, assim como os resultados experimentais obtidos para o modo de interroga??o espectral. Com base nas investiga??es realizadas ao longo do trabalho, ? poss?vel prever um futuro promissor na utiliza??o das fibras ?pticas como substrato de sensores ?pticos SPR

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:30:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 459062.pdf: 3282874 bytes, checksum: e29fb295dfeeacf089328b5b93cff4a0 (MD5) Previous issue date: 2014-02-26 / The persistence of infection within the root canal system is one of the main factors responsible for endodontic failures. The complexity of the internal anatomy of root canals prevents its complete removal by current instrumentation techniques. Thus, alternative disinfection protocols, including irrigating solutions and photo-activated therapy (PAD), have been acessed. In this study, 10 dogs were randomly divided into two groups (n= 5): with and without PAD. The canals of upper and lower premolars of each dog were distributed in the experimental subgroups: SX (400ppm Sterilox), H2 (2% sodium hypochloride (NaOCl)), H5 (5% NaOCl) and C+ (positive control: saline solution) in a total sample of 134 root canals. Teeth of the experimental and C+ groups were opened and the canals were left exposed to the oral environment for 15 days and then sealed for apical periodontitis (AP) induction. After 60 days, the root canals were treated in accordance with each disinfection protocol proposed and filled in the same session. After 120 days, the dogs were euthanized and the following procedures were carried out: periapical radiography (PR), to measure the AP area; cone beam computed tomography (CBCT), to measure the AP area and volume; light microscopy, to evaluate inflammatory periapical events. Based on the colected data, the study was divided into two papers. The first carried out an evaluation of the efficacy of 400ppm Sterilox, 2%NaOCl and 5%NaOCl, with and without PAD, in a single visit root canal treatment of dog s teeth with AP. In the histological evaluation, scores were given according to the intensity of inflammatory infiltrate. Data was colected and analized statistically with Kruskall-Wallis and Mann-Whitney tests (&#945;= .05). The PAD did not produce significant differences in the scores for apical inflammation when used after chemo-mechanical preparation. The irrigating solutions SX, H2 and H5 without PAD were statistically different from SS (P<0,05) that presented the greatest scores for apical inflammation. In conclusion, PAD did not show any clinical relevance for the treatment of root canal with pulpal necrosis and AP. The use of 400 ppm Sterilox in the chemo-mechanical preparation provided efficient cleaning and may be considered an alternative to NaOCl in root canal treatment. The second paper investigated the correlation and agreement between PR (area) and CBCT (area and volume) data, correlating with the correspondig histopathological data. The correlation between methods was evaluated by Pearson's coefficient and Bland-Altman's (BA) method was used to assess the agreement between PR and CBCT data. The results showed that, despite a strong correlation between PR and CBCT areas, the limits of agreement were very broad (95%: 0.19 to 1.08). PR only measured on average 63% of CBCT values. Although the strong correlation between PR area and CBCT volume, BA suggests that the larger the CBCT volume the more underestimated the PR value. When APs had volumes smaller than 6 mm3, the PR estimates of CBCT data were unpredictable. The correlation between PR area, CBCT area, CBCT volume and histology data was significant. In conclusion, the diagnosis of AP based on PR data is clinically limited and it should not be used for scientific investigations. / A persist?ncia de infec??o no interior do sistema de canais radiculares constitui um dos principais fatores respons?veis pelos insucessos endod?nticos. A complexidade da anatomia interna dos canais dificulta sua elimina??o completa pelas t?cnicas de instrumenta??o atuais. Diante desta realidade, protocolos alternativos de desinfec??o, abrangendo meios qu?micos e terapia fotodin?mica (PAD), t?m sido pesquisados. Nessa pesquisa, 10 c?es foram divididos aleatoriamente em dois grandes grupos (n=5): submetidos ou n?o ? PAD. Os canais dos dentes pr?-molares superiores e inferiores de cada c?o foram distribu?dos nos subgrupos experimentais: SX (Sterilox 400ppm), H2 (hipoclorito de s?dio (NaOCl) 2%), H5 (NaOCl 5%) e controle: C+ (controle positivo: soro fisiol?gico) totalizando uma amostra de 134 canais radiculares. Os dentes dos grupos experimentais e do grupo C+ foram abertos e os canais foram deixados expostos ao ambiente oral por 15 dias. Ap?s o selamento das cavidades, aguardaram-se 60 dias, objetivando-se a indu??o de periodontite apical (PA). Os canais foram preparados de acordo com cada protocolo de desinfec??o proposto e obturados na mesma sess?o. Decorridos 120 dias, os c?es foram mortos, sendo realizados os seguintes procedimentos: radiografias periapicais (PR), para mensura??o das ?reas das PAs; tomografias cone beam (CBCT), para mensura??o das ?reas e dos volumes das PAs; microscopia ?ptica, para avalia??o dos eventos inflamat?rios periapicais. Com base na coleta desses dados, o experimento foi dividido em 2 artigos. O primeiro realizou uma avalia??o da efic?cia das solu??es irrigadoras Sterilox 400ppm e NaOCl nas concentra??es de 2% e 5%, associados ou n?o ? PAD, na endodontia em sess?o ?nica de dentes de c?es com PAs. Na avalia??o histol?gica, o processo inflamat?rio 6 apical foi categorizado em escores, de acordo com a intensidade. Os dados foram coletados e analisados estatisticamente com os testes Kruskall-Wallis e Mann-Whitney (&#945;= .05). A PAD n?o apresentou efeito significativo sobre o processo inflamat?rio apical quando utilizada ap?s o preparo qu?mico-mec?nico (PQM). As solu??es irrigadoras H5, H2 e SX do grupo sem PAD apresentaram diferen?as estat?sticas do grupo C+ (P=.02). Este estudo sugere que o emprego da PAD n?o apresentou relev?ncia cl?nica nos resultados da endodontia de dentes com necrose pulpar associados a PA. O emprego do Sterilox 400ppm no PQM promoveu limpeza eficiente e pode ser considerado como um irrigante alternativo ao NaOCl no tratamento endod?ntico. O segundo artigo avaliou a correla??o e a concord?ncia existentes entre as medidas da PA, fornecidas pela PR (?rea) e pela CBCT (?rea e volume), correlacionando com seu correspondente histol?gico. A correla??o entre os m?todos foi avaliada por meio do coeficiente de Person e a concord?ncia pelo m?todo de Bland-Altman (BA). Os resultados demonstraram que, apesar de uma forte correla??o entre as medidas das ?reas obtidas na PR e na CBCT, os limites de concord?ncia se apresentaram muito amplos (95%: 0.19 a 1.08). A PR mensurou em m?dia apenas 63% do valor da ?rea da CBCT. De acordo com o m?todo de BA, apesar da forte correla??o entre a ?rea da PR e o volume da CBCT, quanto maior o volume da PA na CBCT, mais subestimado ? o seu tamanho pela PR. Quando as PAs apresentaram volumes menores de 6 mm3, a estimativa dos valores da CBCT pela PR foram imprevis?veis. A correla??o da ?rea da PR, ?rea da CBCT e volume da CBCT com os dados histol?gicos foi significativa. Em conclus?o, o diagn?stico da PA baseado em dados radiogr?ficos ? clinicamente limitado e n?o deveria ser usado para investiga??es cient?ficas.

Submitted by Alex Sandro R?go (alex@ifpb.edu.br) on 2017-06-06T12:00:22Z No. of bitstreams: 1 32- Mauricio Vicente - ESTUDO COMPUTACIONAL DE BIOCHIP EM FIBRA ?PTICA BASEADO NA RESSON?NCIA DE PL?SMONS DE SUPERF?CIE.pdf: 2764637 bytes, checksum: 32348af8b12e2c07b56a0ffc0014865a (MD5) / Approved for entry into archive by Alex Sandro R?go (alex@ifpb.edu.br) on 2017-06-06T12:04:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 32- Mauricio Vicente - ESTUDO COMPUTACIONAL DE BIOCHIP EM FIBRA ?PTICA BASEADO NA RESSON?NCIA DE PL?SMONS DE SUPERF?CIE.pdf: 2764637 bytes, checksum: 32348af8b12e2c07b56a0ffc0014865a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-06T12:04:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 32- Mauricio Vicente - ESTUDO COMPUTACIONAL DE BIOCHIP EM FIBRA ?PTICA BASEADO NA RESSON?NCIA DE PL?SMONS DE SUPERF?CIE.pdf: 2764637 bytes, checksum: 32348af8b12e2c07b56a0ffc0014865a (MD5) Previous issue date: 2017-05-06 / O fen?meno de Resson?ncia de Pl?smons de Superf?cie (RPS) tem sido utilizado para a produ??o de biossensores por apresentar vantagens, como a possibilidade de miniaturiza??o, baixo custo, alta sensibilidade, alta seletividade e velocidade de resposta. Este trabalho tem como objetivo realizar um estudo computacional dos biossensores RPS em fibra ?ptica convencional (s?lica e/ou pol?mero). Neste caso, a casca da fibra ? removida na regi?o sensora, e o n?cleo ? recoberto por uma camada fina de metal, formando o biochip ?ptico. A an?lise computacional ? realizada com o aux?lio do software MATLAB, em que foi implementado o modelo de multicamadas de Fresnel, e o software COMSOL Multiphysics, baseado no m?todo dos elementos finitos, para a modelagem do biochip. O objetivo ? modificar e investigar os par?metros geom?tricos (dimens?es da fibra, espessura da camada met?lica) e eletromagn?ticos (comprimento de onda, ?ndice de refra??o, ?ngulo de incid?ncia, dentre outros) do biochip. Al?m disso, o tipo de metal utilizado ? de fundamental import?ncia, uma vez que sua oxida??o pode implicar na diminui??o do desempenho do biossensor, em contato com o analito (solu??o aquosa). O uso de metais nobres, como Ouro e Prata, na configura??o do biossensor oferece bons resultados, observados por meio dos valores de FWHM e refletividade, tanto para a ocorr?ncia do fen?meno RPS, quanto ao se analisar os par?metros de desempenho do biossensor. An?lises foram realizadas utilizando os modos de interroga??o angular e espectral. Por fim, tamb?m s?o consideradas configura??es de biochip com camadas de grafeno dispostas nas interfaces metal-fibra e metal-analito, com o fito de estudar a possibilidade de aumento da transmissividade do campo el?trico evanescente. Os resultados das an?lises s?o mostrados e discutidos.

Made available in DSpace on 2016-04-04T18:31:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rodrigo Frandsen da Silva.pdf: 3782928 bytes, checksum: cd013447a70916926978a2ddc8e42dbb (MD5) Previous issue date: 2012-12-19 / Pontif?cia Universidade Cat?lica de Campinas / In this dissertation we evaluate a new technique that performs optical encryption of signals travelling through transparent optical networks (TON). It is, thus, intended to prevent eavesdroppers to capture and retrieve optical signals. The technique consists in dividing an optical signal into several spectral slices and applying different attenuation and delays to each of them. After this process the signal is again multiplexed and transmitted through the considered TON. At this point the signal is ideally unintelligible to any receiver who does not know the encryption key, i.e. the set of utilized attenuations and delays. To evaluate the strength of such key, we measure the bit error rate (Bit Error Rate, BER) of the encoded signal, BERC. Generally speaking, the higher BERC, the lower is the chance of the encrypted signal being decoded by an eavesdropper. At the authorized receiver side, signal is again divided into spectral slices which are subjected to a set of attenuations and delays that are complementary to the ones utilized as the encryption key. All slices are again multiplexed and, as a result, at the output of the decoder the original encoder input signal is ideally reconstructed. The quality of the decoded signal is measured by evaluating the BER of the decoded signal, BERd, which should be low enough to allow proper reception of the signal transmitted by the TON. Simulations with the software VPITransmissionMaker, VPIPhotonics Company Inc., were used to investigate the performance of the technique for different gains and delays. For the operation of spectral slicing, the profiles of the utilized filters were adjusted to represent the ones of state-of-the-art off-the-shelf equipment. Results indicate that BERC may reach values of up to 42% and 32% for non-return to zero (NRZ) and differential quadrature phase shift keying (DQPSK) signals, respectively. In both of these cases it was possible to find results of BERd lower than 10-12, after properly adjusting the spacing between the filters; this was observed even for propagation over amplified standard fiber links with lengths as long as 400 km. To the best of our knowledge, this is the first time that such analyses are presented. / Neste trabalho avaliamos uma t?cnica para realizar a criptografia totalmente ?ptica em redes ?pticas transparentes. Dessa maneira, pretende-se impedir que um intruso consiga capturar e analisar o sinal ?ptico. A t?cnica consiste em dividir um sinal ?ptico em diversas fatias espectrais e aplicar diferentes atenua??es e atrasos a cada uma delas. Ap?s este processo o sinal ? novamente multiplexado e transmitido por uma rede ?ptica transparente. Neste ponto o sinal est? idealmente inintelig?vel para qualquer receptor que n?o conhe?a a chave criptogr?fica (conjunto de atenua??es e atrasos) utilizada. Para avaliar a for?a da chave criptogr?fica, mede-se a taxa de erros de bit (Bit Error Rate, BER) do sinal codificado, BERC. De forma geral, quanto maior BERC, menor ? a chance de o sinal ser decodificado por um receptor n?o autorizado. Na decodifica??o o sinal ? novamente dividido em fatias espectrais, e para todas as fatias s?o aplicados valores distintos de atenua??o e atraso de forma a reconstituir o sinal de entrada. Na sa?da do decodificador, avalia-se a BER do sinal decodificado BERD, que deve ser suficientemente baixa para permitir a recep??o do sinal transmitido pela TON. Simula??es com o software VPITransmissionMaker, da empresa VPIPhotonics Inc, foram utilizadas para investigar o desempenho da t?cnica para diferentes ganhos e atrasos. Para a opera??o de fatiamento espectral, os perfis dos filtros usados foram ajustados para representar equipamentos de mercado. Resultados indicam que BERC pode atingir valores de at? 42% e 32% para sinais com modula??o non return to zero - on-off keying (NRZ-OOK) e por deslocamento de fase diferencial em quadratura (differential quadrature phase shift keying, DQPSK), respectivamente. Em ambos os casos foi poss?vel encontrar resultados de BERd inferiores a 10-12, mediante ajuste adequado do espa?amento entre os filtros, mesmo ap?s 400 km de propaga??o por enlaces de fibra padr?o. No melhor de nosso conhecimento, esta ? a primeira vez que tais an?lises s?o apresentadas.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:56:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 458958.pdf: 7355419 bytes, checksum: 8a2fa20967c4240f1bb187644d3207a4 (MD5) Previous issue date: 2013-12-19 / Vision is one of the most important senses of man. Many diseases that affect the sense of vision are related to the retina. Some of these diseases specifically affecting the photoreceptors, light-sensitive cells that is the first stage of vision. The examinations of dark adaptation have motivated interest in the study of mechanisms of retinal diseases. This exam directly accesses the functions of the photoreceptors by noninvasive methods. The technique consists in measuring the time to recovery of sensitivity of the retina after exposing the retina to a controlled amount of light. The dark adaptometry equipment is used to monitor the response of these cells to a light stimulus and then reveal some deficiency in the operation. This work describes the procedures, calculations, measurements and verifications necessary for the calibration of an existing dark adaptometer. This equipment was developed in the Image Laboratory at PUCRS, led by Professor Dario Azevedo, Ph.D. from a modified fundus camera. This dark adaptometer is able to test localized regions of the retina, while visualizing the regions of interest, and therefore compensating for any eye movements. For calibration of dark adaptometer, various calculations based on literature review was conducted. After using instruments such as spectrometer, radiometer, and light meter luminometer dark adaptometer was calibrated. The operation of each block that makes up this instrument was checked. Measurements of illuminance values of the light stimulus, retinal luminance attenuation of dark adaptometer, attenuation imposed by optical fiber, was observed throughout the range of attenuation filters (0 dB to 60 dB), also checked the operation of the wheels were made and a shutter that filters are controlled by the motor steps. The dark adaptometer met all specifications, i.e., the values set in the calculations in this work has been achieved. / A vis?o ? um dos mais importantes sentidos do homem. Muitas doen?as que afetam o sentido da vis?o est?o relacionadas com a retina. Algumas dessas doen?as afetam especificamente os fotorreceptores, c?lulas sens?veis ? luz, que ? o primeiro est?gio da vis?o. Os exames de adapta??o ao escuro t?m motivado o interesse no estudo de mecanismos de doen?as de retina. Esse exame acessa diretamente as fun??es dos fotorreceptores por m?todos n?o invasivos. A t?cnica consiste, em medir o tempo de recupera??o da sensitividade da retina, depois de expor a retina a uma quantidade controlada de luz. Um equipamento de adaptometria ao escuro ? utilizado para monitorar a resposta destas c?lulas a um est?mulo luminoso e ent?o revelar alguma defici?ncia no funcionamento. Neste trabalho, est?o descritos os procedimentos, c?lculos, medidas e verifica??es necess?rias para a calibra??o de um adapt?metro de escuro j? existente. Este equipamento foi desenvolvido no Laborat?rio de Imagens da PUCRS, liderado pelo professor Dario Azevedo Ph.D. a partir de uma c?mera de fundus modificada. Este adapt?metro de escuro ? capaz de testar, de forma localizada, regi?es da retina permitindo, a crit?rio do examinador testar e mapear exclusivamente as regi?es que forem do seu interesse e compensar eventuais movimentos oculares. Para a calibra??o do adapt?metro de escuro, foi realizados diversos c?lculos com base na revis?o bibliogr?fica. Ap?s, utilizando instrumentos como espectrofot?metro, espectroradi?metro, lux?metro e luminanc?metro o adapt?metro de escuro foi calibrado. Foi verificado o funcionamento de cada bloco que comp?e este instrumento. Foram realizadas as medidas dos valores de ilumin?ncia do est?mulo luminoso, lumin?ncia retinal, atenua??es do adapt?metro de escuro, atenua??o impostas pela fibra ?ptica, foi verificado toda a faixa de atenua??o dos filtros (0 dB at? 60 dB), tamb?m verificado o funcionamento das rodas de filtros e do shutter que s?o comandados pelos motores de passos. O adapt?metro de escuro atendeu todas as especifica??es, ou seja, os valores definidos nos c?lculos neste trabalho foram atingidos.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:59:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 459620.pdf: 5079443 bytes, checksum: 08c93370bfca9d36a99775d85a58b7d2 (MD5) Previous issue date: 2014-06-03 / The main goal of this work was to implement a microfabricated electrode system for in vitro neural stimulation and recording. The MEA biosensor structural characterization was obtained by optical and scanning electrical microscopy images. Qualitative analysis of the chemical composition was made through energy-dispersive X-ray spectroscopy. Analysis of the noise level was conducted by evaluating the RMS value of the potentials recorded with sensors filled with standard saline solution. An electronic interface between a MEA and a conventional data acquisition system with eight channels was constructed and performance tests of the built interface were conducted. Installation of a MEA commercial system was carried out and preliminary tests were performed by experimenting with rodent neuronal cell culture and brain slices. An attempt was made to adapt a conventional perfusion system by peristaltic pump to the MEA system; however, the results were unsatisfactory due to the high noise level of the recordings. Experimental procedures related to the proper handling of MEAs were defined, and the influence of different parameters involved in experimentation with MEAs was investigated. Finally, the data analysis of cell culture recordings indicated detection of local field potentials (LFPs) of greater amplitude, higher counts of spikes and higher spike frequency in the records obtained with standard culture medium compared to those obtained with extracellular electrophysiological solution. The data analysis of cortical slices recordings indicated the detection of a greater number of spikes per minute, higher spike frequency and greater peak-to-peak spikes amplitudes by the microelectrodes that have captured LFPs of greater magnitude. / O objetivo principal deste trabalho foi implementar um sistema de eletrodos microfabricados para registro e estimula??o neural extracelular in vitro. A estrutura dos arranjos de microeletrodos (MEAs) foi caracterizada atrav?s de imagens por microscopia ?ptica e por microscopia eletr?nica de varredura. A an?lise qualitativa da composi??o qu?mica foi feita por espectroscopia de raios X por energia dispersiva e a an?lise do n?vel de ru?do foi realizada atrav?s da avalia??o do valor RMS dos potenciais registrados com os sensores preenchidos com solu??o salina padr?o. Uma interface eletr?nica entre um MEA e um sistema de aquisi??o de dados convencional com oito canais foi constru?da e testes de desempenho foram realizados. Um sistema MEA comercial foi instalado e validado atrav?s de experimenta??o com cultura neuronal e fatias de c?rebro de roedor. A tentativa de adapta??o de um sistema convencional de perfus?o por bomba perist?ltica ao sistema MEA mostrou-se insatisfat?ria devido ao alto n?vel de ru?do dos registros. Procedimentos experimentais relacionados ao correto manuseio dos MEAs foram definidos, e investigou-se a influ?ncia de diferentes par?metros sobre a atividade detectada com os sensores. Finalmente, a an?lise dos dados com cultura celular indicou detec??o de potenciais de campo locais (PCLs) de maior amplitude, maior contagem de spikes e maior freq??ncia de atividade nos registros obtidos com meio de cultura padr?o. Os dados com fatias de tecido indicaram a detec??o de maior n?mero de spikes por minuto, de maior freq??ncia de atividade e de maior amplitude pico-a-pico dos spikes nos microeletrodos que captaram PCLs de maior amplitude.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 401047.pdf: 2592282 bytes, checksum: e66bbe58a6b50d908b9402f9668879bc (MD5) Previous issue date: 2008-03-23 / A habilidade para detectar e analisar ind?cios de animais na natureza, parte integral da pesquisa e manejo da vida silvestre, se torna fundamental quando a esp?cie em estudo ? um carn?voro. Para as esp?cies desse grupo, geralmente raras e/ou dif?ceis de capturar, a an?lise das fezes ? um dos melhores m?todos n?o-invasivos para a identifica??o, caracteriza??o e monitoramento das popula??es. Contudo, identifica??es de esp?cies a partir de amostras fecais podem ser subjetivas quando baseadas em crit?rios tradicionais. Neste estudo, comparamos a efici?ncia de dois m?todos de identifica??o de esp?cies de carn?voros: an?lise do DNA fecal e microscopia ?ptica de p?los-guarda encontrados em fezes. Ambos foram aplicados a 102 amostras de fezes coletadas em uma ?rea de Mata Atl?ntica no Rio Grande do Sul. Atrav?s da an?lise das seq??ncias de mtDNA obtidas a partir de 70 fezes foi poss?vel identificar 75,7% destas amostras como pertencentes a 3 esp?cies de felinos, 21,3% a uma esp?cie de can?deo silvestre e 3% ao c?o dom?stico. P?los-guarda foram encontrados em 56% das fezes coletadas. Atrav?s da an?lise microsc?pica desses p?los identificou-se 55,6% das amostras em n?vel de esp?cie (tr?s esp?cies de fel?deos) e 44% em n?vel de fam?lia (Canidae ou Felidae). Foram analisadas comparativamente 44 amostras sobrepostas pelos dois m?todos. Desacordos na identifica??o entre os m?todos ocorreram em apenas tr?s amostras. No total, 77 amostras de fezes foram identificadas em n?vel de esp?cie por pelo menos um dos m?todos, permitindo uma caracteriza??o da dieta destes carn?voros. A identifica??o baseada em microscopia de p?los requer poucos gastos ou tecnologia, sendo simples e r?pida para an?lises em campo. Contudo, algumas caracter?sticas morfol?gicas dos p?los-guarda podem influenciar o poder de identifica??o por microscopia, em alguns casos podendo levar a uma interpreta??o err?nea ou incompleta dos padr?es observados. A identifica??o baseada na an?lise do DNA fecal pode ter alto custo e ser tecnicamente dif?cil, mas as informa??es que podem ser obtidas atrav?s deste m?todo superam em quantidade e qualidade outros m?todos. Assim, considerando as vantagens e desvantagens dos m?todos analisados, as diferen?as entre eles permitem que sejam usados de forma a se complementarem mutuamente em diversos estudos, propiciando maior acur?cia na identifica??o de esp?cies a partir de fezes.

Submitted by Setor de Tratamento da Informa??o - BC/PUCRS (tede2@pucrs.br) on 2016-08-17T12:05:28Z No. of bitstreams: 1 DIS_EZEQUIEL_SCHNEIDER_SANTANA_COMPLETO.pdf: 2682346 bytes, checksum: 254350f39385a5e4965f508782a2e8fd (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-17T12:05:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DIS_EZEQUIEL_SCHNEIDER_SANTANA_COMPLETO.pdf: 2682346 bytes, checksum: 254350f39385a5e4965f508782a2e8fd (MD5) Previous issue date: 2015-10-29 / This work presents an instrument, similar to videonystagmography (VNG) that includes a set of tools for complementary medical examination in individuals who suffer from balance disorders. It performs the extraction of parameters based on the analysis of eye movement recordings. It implements image processing algorithms to calculate pupil position and to extract parameters used for medical diagnosis support, including speed and amplitude of the eye movements. The algorithm was tested with a 3D eye model, specially designed to produce horizontal and vertical nystagmus as they would occur in human beings with a pathological nystagmus. / Este trabalho apresenta um instrumento, similar a videonistagmografia, que inclui um conjunto de ferramentas para diagn?stico m?dico complementar em indiv?duos que sofrem de dist?rbios de equil?brio. Atrav?s deste projeto, ? poss?vel realizar a extra??o de par?metros com base na an?lise de registros de movimentos de olhos. O software implementa algoritmos de processamento de imagens para calcular a posi??o da pupila e extrair par?metros utilizados para apoio ao diagn?stico. Dentre os par?metros, est?o a velocidade e amplitude dos movimentos de olhos. O algoritmo foi testado com um modelo 3D do olho, especialmente desenvolvido para produzir movimentos como os de nistagmo, que ocorrem, por exemplo, em pessoas com nistagmo patol?gico.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-12-04T21:15:19Z No. of bitstreams: 1 AmandaFernandesDeMedeiros_DISSERT.pdf: 1948827 bytes, checksum: 087502936007b7e2996629625be441ef (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-12-08T21:43:18Z (GMT) No. of bitstreams: 1 AmandaFernandesDeMedeiros_DISSERT.pdf: 1948827 bytes, checksum: 087502936007b7e2996629625be441ef (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-08T21:43:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AmandaFernandesDeMedeiros_DISSERT.pdf: 1948827 bytes, checksum: 087502936007b7e2996629625be441ef (MD5) Previous issue date: 2017-11-03 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico (CNPq) / A obesidade ? uma das Doen?as Cr?nicas N?o Transmiss?veis de maior impacto na sa?de p?blica. A semente de tamarindo (Tamarindus indica L.) vem sendo estudada por possuir inibidor de tripsina, e, entre os atributos relacionados a esse inibidor parcialmente purificado (ITT), tem-se a sua rela??o com a saciedade, por aumentar colecistocinina (CCK) plasm?tica em animais eutr?ficos e seu efeito na redu??o da concentra??o circulante de leptina em animais com obesidade, entretanto sem aumento plasm?tico de CCK. Neste estudo, o ITT foi purificado, caracterizado e avaliado quanto ?s suas propriedades frente aos horm?nios CCK e leptina em ratos Wistar com obesidade. Para purifica??o e caracteriza??o desse inibidor, foram realizados: fracionamento do extrato bruto proteico com sulfato de am?nio; cromatografia de afinidade Tripsina-Sepharose; Cromatografia L?quida de Alta Efici?ncia (HPLC); determina??o da massa molecular por MS-ESI; sequenciamento parcial por MALDI-TOF com ISD; ensaio de estabilidade de temperatura e pH; estimativa dos par?metros de especificidade; eletroforese bidimensional (2-DE) e dosagens de CCK e leptina plasm?tica, por ELISA, em ratos com obesidade, submetidos ? gavagem oral (730 ?g/kg) do inibidor de tripsina purificado (ITTp) comparando-os a ratos com obesidade sem tratamento. Desse modo, o ITT purificado por HPLC foi denominado ITTp. Com o refinamento do m?todo, obtiveram-se, com base no ITTp, dois picos proteicos, as fra??es: Fr 1 e Fr 2. As massas moleculares m?dias dessas fra??es proteicas foram de [M+H]+ = 19594,690 Da e de [M+H]+ = 19578,266 Da, respectivamente. Ap?s redu??o e alquila??o, estimou-se a presen?a de 4 ciste?nas para Fr 1 e Fr 2. As sequ?ncias parciais obtidas para Fr 1 e Fr 2 foram de 54 e 53 res?duos de amino?cidos identificados e exatamente com a mesma sequ?ncia para ambas, sugerindo-se tratar da mesma mol?cula. O ITTp se mostrou resistente ? varia??o de temperatura at? 80?C, reduzindo cerca de 30% de sua atividade antitr?ptica quando em 100 ?C, e resistente aos extremos de pH. Para o ITTp estimou-se a IC50 de 2,7 x 10-10 mol.L-1 e a Ki de 2,9 x 10-11 mol.L-1. Na eletroforese bidimensional com ITTp foram revelados pontos isoel?tricos entre pH 5 e 6, al?m de um spot pr?ximo ao pH 8. Dessa forma, foi constatado que se trata de um inibidor de tripsina da fam?lia Kunitz. No experimento in vivo foi confirmada a a??o de ITTp sobre a redu??o de leptina plasm?tica, mas sem efeito sobre CCK em animais com obesidade, como j? atestado em estudos pr?vios com o ITT. A caracteriza??o bioqu?mica desse inibidor e os seus efeitos sobre CCK e leptina, observados em experimentos in vivo, constituem relatos in?ditos e promissores para uma prov?vel aplica??o biotecnol?gica. / Obesity is one of the non-communicable chronic diseases with a great impact on public health. The tamarind (Tamarindus indica L.) seed has been studied for its trypsin inhibitor and one of the attributes of this partially purified inhibitor (TTI) is its relationship with satiety, increasing cholecystokinin (CCK) in eutrophic and reducing leptin in obese animals. In this study the ITT was purified, characterized and evaluated for its properties against CCK and leptin in obese Wistar rats. For the purification and characterization of this inhibitor, the crude protein extract was fractionated with ammonium sulfate followed by trypsin-Sepharose affinity chromatography, two-dimensional electrophoresis (2-DE) and High Efficiency Liquid Chromatography (HPLC). TTIp molecular mass was determined by MS-ESI. Partial sequencing of TTIp was established by MALDI-ISD. Inhibitory specificity, stability to temperature and pH was characterized for TTIp. Plasma CCK and leptin was evaluated in rats submitted to oral gavage with TTIp (730 ?g / kg) comparing them to untreated obese rats. TTI was purified by HPLC with a single protein peak (ITTp). After refinement of the methods, two protein fractions were observed: Fr 1 and Fr 2, with average mass of [M+H]+ = 19594.690 Da and [M+H]+ = 19578.266 Da, respectively. The presence of 4 cysteines was estimated after reduction and alkylation of Fr 1 e Fr 2. The protein fractions showed 54 and 53 amino acid residues with exactly the same sequence. TTIp presented resistance to temperature variations, reducing about 30% of its anti-tryptic activity at 100 ?C, and resistance to pH extremes. TTIp IC50 was 2.7 x 10-10 mol.L-1 and Ki was 2.9 x 10-11 mol.L-1. The 2-DE revealed spots with isoelectric points between pH 5 and 6, and a spot near pH 8. TTIp characteristics are compatible with trypsin inhibitors from the Kunitz family. In the in vivo experiment, ITTp action on leptin reduction was confirmed, but no effect on CCK was observed in animals with obesity, corroborating previous studies using unpurified TTI. Biochemical knowledge of this molecule and the in vivo experiments shown here are novel and provide essential information for a biomolecule of possible biotechnological application.

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:03:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LarissaMA_DISSERT.pdf: 2537553 bytes, checksum: 12f02428f3ae0866d5e225dc96048ea4 (MD5) Previous issue date: 2013-05-20 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / Dopamine (DA) is known to regulate both sleep and memory formations, while sleep plays a critical role in the consolidation of different types of memories. We believe that pharmacological manipulation of dopaminergic pathways might disrupt the sleep-wake cycle, leading to mnemonic deficits, which can be observed in both behavioral and molecular levels. Therefore, here we investigated how systemic injections of haloperidol (0.3 mg/kg), immediately after training in dark and light periods, affects learning assessed in the novel object preference test (NOPT) in mice. We also investigated the hippocampal levels of the plasticity-related proteins Zif-268, brain-derived neurotrophic factor (BDNF) and phosphorylated Ca2+/calmodulin-dependent protein kinases II (CaMKII-P) in non-exposed (na?ve), vehicle-injected controls and haloperidol-treated mice at 3, 6 and 12 hours after training in the light period. Haloperidol administration during the light period led to a subsequent impairment in the NOPT. In contrast, preference was not observed during the dark period neither in mice injected with haloperidol, nor in vehicle-injected animals. A partial increase of CaMKII-P in the hippocampal field CA3 of vehicle-injected mice was detected at 3h. Haloperidol-treated mice showed a significant decrease in the dentate gyrus of CaMKII-P levels at 3, 6 and 12h; of Zif-268 levels at 6h, and of BDNF levels at 12h after training. Since the mnemonic effects of haloperidol were only observed in the light period when animals tend to sleep, we suggest that these effects are related to REM sleep disruption after haloperidol injection / A dopamina (DA) regula tanto o sono quanto o processo de forma??o de mem?rias, enquanto o sono desempenha uma fun??o essencial na consolida??o de diferentes tipos de mem?rias. Acreditamos que a manipula??o farmacol?gica das vias dopamin?rgicas possa afetar o ciclo sono-vig?lia, acarretando d?ficits mnem?nicos, os quais podem ser observados tanto em n?vel comportamental quanto molecular. Dessa forma, no presente estudo, investigamos o efeito do haloperidol (halo - 0,3 mg/kg; i.p.), administrado imediatamente ap?s sess?es de treino no per?odo da manh? e da noite, sobre o desempenho de camundongos no teste de prefer?ncia por objetos novos (TPON). Observamos que esse tratamento causou um preju?zo mnem?nico apenas nos camundongos testados pela manh?. Devido ? maior ocorr?ncia de epis?dios de sono durante a fase clara dos roedores, acreditamos que esse d?ficit pode estar associado a uma cascata de plasticidade hipocampal, a qual envolve a express?o de diferentes mol?culas em per?odos distintos ap?s a exposi??o ao est?mulo mnem?nico inicial. Para testar tal hip?tese, realizamos imunohistoqu?mica (IHQ) em tecidos de animais na?ve n?o expostos (NV), bem como de animais expostos aos objetos com posterior inje??o de halo ou salina (ve?culo - VH), perfundidos 3, 6 e 12h ap?s o est?mulo inicial. Quantificamos a express?o hipocampal (CA1, CA3 e GD) das prote?nas CaMKII-P, Zif-268 e BDNF, atrav?s de densitometria e contagem de c?lulas (somente para Zif-268). Observamos um aumento parcial na express?o de CaMKII-P em animais VH 3h, na regi?o CA3. Quanto ao grupo halo, houve uma redu??o dos n?veis de CaMKII-P nos tr?s hor?rios analisados; de Zif-268 em 6h, tanto em CA1 quanto CA3; e de BDNF em 12h, apenas no GD. Considerando-se o melhor desempenho diurno na consolida??o de mem?rias, associado ? fun??o do halo na regula??o do sono, propomos que a redu??o de plasticidade sin?ptica e os d?ficits no processo mnem?nicoocorreram devido ? supress?o do sono REM mediada pelo tratamento com haloperidol