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Rôle des familles géniques YABBY et ARF dans la mise en place du carpelle au cours de l'évolution.Finet, Cédric 29 September 2008 (has links) (PDF)
L'apparition de la fleur a nécessité trois événements majeurs: (i) le regroupement des organes reproducteurs mâles et femelles sur un même axe, (ii) l'internalisation des ovules au sein d'un organe: le carpelle, (iii) la mise en place de pièces stériles en périphérie des organes reproducteurs. Ce travail de thèse consiste en l'identification d'événements moléculaires à l'origine du carpelle. Les gènes ARF3 et ARF4 jouent un rôle clé dans le développement du carpelle chez l'espèce modèle Arabidopsis thaliana. La reconstruction de l'histoire évolutive de ces gènes a permis de montrer qu'ils résultaient d'une duplication dans le lignage menant aux angiospermes. Leurs structures indiquent qu'ils ont évolué par perte de certains domaines protéiques, ceci de manière indépendante dans les lignages ARF3 ou ARF4. Ces changements dans la partie codante constituent un mode d'évolution généralisable à l'ensemble des embryophytes. La famille génique YABBY intervient dans l'établissement de la polarité adadiale-abaxiale des organes latéraux. En particulier, les gènes CRC et INO constituent respectivement deux marqueurs moléculaires du carpelle et de l'ovule. L'étude préliminaire de cette famille semble indiquer l'absence du gène CRC chez les gymnospermes, suggérant que l'apparition de CRC aurait été un pré-requis pour l'origine évolutive du carpelle.
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Epidemiologie moléculaire et résistance de Plasmodium vivax aux antipaludiques à MadagascarBarnadas, Celine 07 July 2008 (has links) (PDF)
Notre objectif a été d'évaluer (i) l'importance de Plasmodium vivax dans les infections palustres à Madagascar, (ii) la sensibilité de ce parasite à la chloroquine et à la sulfadoxinepyriméthamine, (iii) et la place des marqueurs moléculaires pour la surveillance de la résistance aux antipaludiques et de la circulation des souches parasitaires.<br />Pour cela, notre étude a été conduite sur 8 sites sentinelles. Les patients présentant un paludisme causé par P. vivax ont été inclus dans des tests d'efficacité thérapeutique selon les critères de l'OMS. L'analyse de polymorphismes génétiques sur les gènes pvcrt-o, pvmdr1, pvdhfr et pvdhps, impliqués dans la résistance aux antipaludiques, ainsi que sur les gènes pvcsp, pvmsp3, pvmsp1 utilisés pour le génotypage des souches a été réalisée sur les isolats<br />collectés. Des marqueurs microsatellites ont également été recherchés pour évaluer la diversité génétique de ces isolats, ainsi que la circulation des souches parasitaires et la propagation des isolats résistants.
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Stratégies pro-apoptotiques appliquées au traitement photodynamique avec le Foscan® de modèles précliniques d'adénocarcinome humainMarchal, Sophie 27 June 2008 (has links) (PDF)
Le but de cette thèse est de développer une stratégie pro-apoptotique à partir des paramètres pouvant moduler l'apoptose photoinduite par le Foscan® dans des modèles précliniques d'adénocarcinome humain. La PDT avec le Foscan® a été appliquée in vitro sur lignées cellulaires où une apoptose modérée a été obtenue via l'implication indirecte de la voie mitochondriale. La modulation de l'apoptose photoinduite par l'oxygénation a été démontrée sur sphéroïde, modèle de micro-tumeur non vascularisée. Une irradiance faible, garantissant le maintien de l'oxygénation du sphéroïde, favorise l'activation de la caspase-3 photoinduite par le Foscan®. Le deuxième paramètre favorisant l'apoptose photoinduite est l'accroissement du temps d'incubation du photosensibilisateur avec les cellules MCF-7, ce qui modifie sa localisation subcellulaire. Après 3h d'incubation, le Foscan® est essentiellement localisé dans le réticulum endoplasmique (RE) et l'appareil de Golgi. Après irradiation, le stress oxydant du RE évalué par l'induction de la protéine chaperone GRP78 suivie de la réponse apoptotique mitochondriale et de l'activation des caspases a été observée. Après 24h d'incubation avec le Foscan®, la localisation dans le RE est renforcée ainsi que l'expression photoinduite de GRP78 corrélée avec une augmentation de l'activation de la caspase-7 indépendamment de la réponse mitochondriale. Après PDT in vivo, l'estimation par immunohistochimie sur coupe tissulaire de l'activation de la caspase-7 et de la caspase-3 montre une activation prédominante de la caspase-3 ce qui suggère une apoptose majoritairement dépendante de la caspase-3 dans les tumeurs d'adénocarcinome colique HT29 traitées par Foscan®-PDT.
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Analyse génétique et modélisation de la production de semence et de la réussite de l'insémination artificielle en ovinDavid, Ingrid 18 February 2008 (has links) (PDF)
Plus de 800000 inséminations artificielles ovines en semence fraîche sont réalisées chaque année en France. Pour rester performants, les centres d'insémination ovins sont intéressés par une augmentation du nombre de doses utiles à l'insémination qu'un bélier peut produire (fonction du volume, de la concentration et de la motilité du sperme) et par une amélioration de la probabilité de réussite de l'insémination. Pour répondre à ces attentes, l'objectif de l'étude était d'estimer les facteurs environnementaux et génétiques de la production de semence et de la réussite de l'insémination en utilisant les méthodologies les mieux adaptées à la structure des données et à la spécificité des caractères étudiés. Les données des six principaux CIA ovins français, qui effectuent 96\% des IA françaises, ont servi aux analyses. Les données de production de semence étaient caractérisées par le nombre de répétitions des mesures intra et inter-année pour chaque bélier. Nous avons tenu compte de ces répétitions en ajustant dans un premier temps un modèle à répétabilité simple sur les données. Dans un deuxième temps, pour tenir compte de l'évolution de la corrélation entre mesures dans le temps, nous avons appliqué un modèle ''character process'' comportant trois effets environnementaux aléatoires: une environnement à long terme, un à court terme et la résiduelle. Dans pratiquement tous les cas, le modèle s'ajustant le mieux aux données était le modèle ''character process'' de processus spatial exponentielle pour l'environnement à court terme et autoregressive d'ordre 1 pour l'environnement à long terme. Les résultats obtenus étaient cohérents entre les races de l'étude et avec la littérature. Les principaux facteurs de variation de la production de semence retenus sont la combinaison année*saison, l'âge du bélier, l'intervalle de temps entre collectes et le nombre de sauts effectués par l'animal au moment de la collecte. Les héritabilités estimées sont moyennes (0.12 à 0.33) pour le volume, la concentration et le nombre de spermatozoïdes et plus faible pour la motilité (de 0.02 à 0.14). La réussite de l'insémination est mesurée en ovin par une variable binaire codée 1 si il y a mise-bas sur IA et 0 sinon. Elle est le résultat de la combinaison entre la fertilité de la femelle et la fécondance du mâle. Nous avons réalisé une première analyse conjointe des deux caractères en supposant que les effets génétiques et environnementaux du mâle et de la femelle s'associaient de manière additive (modèle additif). Les résultats obtenus étaient cohérents entre races et avec la littérature. Les principaux facteurs de variation de la réussite de l'IA étaient la combinaison année*saison, l'âge de la femelle, l'intervalle de temps avec la mise bas précédente, la motilité de sperme, l'inséminateur et la combinaison élevage*année. L'héritabilité de la fertilité femelle était faible (4 à 8\%), celle de la fécondance mâle était inférieure à 0.5\%. Pour être plus en adéquation avec les processus biologiques sous-jacent de la reproduction, nous avons considéré une autre modélisation conjointe: le modèle produit. Ce dernier considère qu'il existe deux phénotypes binaires sous jacent indépendants, la fécondance mâle et la fertilité femelle, et qu'il n'y a réussite de l'IA que si il y a réussite pour ces deux phénotypes. La probabilité de réussite de l'IA est le produit des probabilités de réussite des deux phénotypes non observés. Nous avons testé ce modèle sur des données simulées et montré qu'il était possible d'obtenir de bonnes estimations des paramètres. En revanche, appliquer un modèle additif alors que les données proviennent d'un modèle produit fournit des estimations biaisées, notamment pour les hautes valeurs génétiques. Nous avons réalisé une première application du modèle produit sur les données réelles. Enfin, nous avons estimé la corrélation génétique entre la fertilité femelle et la production laitière. Nous avons obtenus une corrélation génétique antagoniste similaire à ce qui a été reporté en bovin (-0.23).
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Etude du risque allergique à différentes protéines alimentaires Mise au point de modèle de souris allergiques à l'arachide, à l'albumine, à la caséine et à la colle de poissonLifrani, Awatif 02 1900 (has links) (PDF)
L'allergie alimentaire est actuellement inquiétante par sa fréquence dans les pays industrialisés. En effet, son incidence est en constante et rapide augmentation. Parmi les allergènes majeurs: l'arachide, le poisson, l'oeuf et le lait de vache sont couramment trouvés dans de nombreux produits agro-alimentaires (farines, vins...) d'où l'obligation d'un étiquetage systématique. Notre objectif était d'établir des modèles de souris allergiques, à certaines protéines alimentaires (arachide, colle de poisson, albumine et caséine), caractérisés par la production in vivo d'IgE et d'IgG1 sériques spécifiques de ces protéines et par les manifestations cliniques suites aux tests de provocation avec ces mêmes protéines. Nous avons étudié, tout d'abord, l'allergénicité des vins sur quatre souches de souris (C3H, CBA, DAB/2 et SJL) après les différentes étapes du collage et nous avons montré que la décantation, la filtration et le vieillissement sont des étapes importantes pour l'élimination des produits utilisés pour la clarification des vins. Ensuite, nous avons étudié la réaction croisée arachide-lupin chez les souris C3H, CBA, SJL et BALB/c sensibilisées à l'arachide et nous avons montré que la réaction croisée arachidelupin in vitro n'implique pas une allergie croisée arachide-lupin. Enfin, nous avons, expérimenté et comparé plusieurs approches et voies de sensibilisation pour identifier les facteurs environnementaux nécessaires à la manifestation de la réponse allergique. Nous avons conclu que la sensibilisation avec l'arachide par voie orale naturelle sur un modèle de souris sensibilisable (C3H et CBA), en présence et en absence d'adjuvant, ne provoque pas d'allergie. En conclusion, la voie intrapéritonéale en présence d'adjuvant reste le moyen le plus rapide et le plus efficace pour obtenir un modèle de souris allergiques.
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Déficience unilatérale et adaptation de la fonction posturale. Rôle de chacun des appuis dans le maintien de l'équilibre debout.Genthon, Nicolas 29 June 2006 (has links) (PDF)
Le comportement postural de sujets sains évalués debout est relativement symétrique : -i) le poids corporel est équi-réparti sur les deux appuis, -ii) les actions mises en places sous chacun des appuis sont symétriques et simultanées. L'influence de chacun des appuis dans le contrôle de l'équilibre s'exprime sous la forme de deux stratégies distinctes dépendantes de l'axe d'oscillation. Selon l'axe médio-latéral, l'équilibre debout est contrôlé par une stratégie de charge/décharge, alors que selon l'axe antéropostérieur l'équilibre debout est géré par la localisation des pressions sous les deux pieds.<br /> A la suite d'une déficience affectant unilatéralement les structures sensori-motrices impliquées dans la régulation de la station debout, cette symétrie risque d'être fortement perturbée. La première des caractéristiques classiquement observées est une augmentation des oscillations posturales. La seconde, est une asymétrie de la répartition de poids corporel sur les appuis. Cette asymétrie se caractérise par une mise en charge accrue de la jambe saine associée à une décharge de la jambe lésée.<br />Face à ce contexte, l'objectif principal de ce travail de thèse a été d'analyser les conséquences de différentes perturbations unilatérales sur le maintien postural. Pour cela, le rôle de chacun des appuis dans le maintien de l'équilibre debout non perturbé a été analysé chez différentes populations présentant une déficience unilatérale. Pour répondre à cet objectif des patients victimes d'un accident vasculaire cérébral ainsi que des patients victimes d'une entorse du ligament collatéral latéral de la cheville ont été inclus. Ces patients ont été évalués debout sur un système composé de deux plates-formes de force. Ce système permet d'analyser le rôle de chacun des appuis dans le contrôle de l'équilibre mais aussi d'évaluer les conséquences de ces perturbations sur les oscillations corporelles. <br /> Le comportement postural de patients victimes d'une déficience unilatérale d'origine diverse présente certaines particularités. Du fait de la déficience, l'organisation des forces de réaction mesurées sous l'appui lésé est fortement perturbée. Du fait de l'incapacité de l'appui lésé à gérer la station debout, les patients modulent leur orientation posturale latérale, en surchargeant leur appui sain. Par suite, des modulations des stratégies de contrôle des appuis ont pu être relevées. Alors que l'intervention de chaque appui est symétrique est simultanée chez les sujets sains, dans le cas d'une déficience unilatérale, une asymétrie a toujours été notée. Dans certains cas, une diminution de la relation spatio-temporelle entre les deux appuis a été relevée. Ces modifications ont entre autre pour conséquence une diminution de l'influence de l'appui lésé dans le contrôle de l'équilibre, associée à une augmentation de l'influence de l'appui sain dans les régulations posturales. Du fait des modifications observées au niveau plantaire, et malgré de possibles stratégies compensatoires mises en place, l'équilibre des patients victimes d'une déficience unilatérale est fortement perturbé. Il est intéressant de noter que l'augmentation de l'instabilité posturale des patients est dépendante de l'intégrité sensori-motrice de l'appui sain.<br /> Les caractéristiques énoncées ci-dessus sont en partie liées à l'asymétrie de répartition de poids corporel sur les appuis. Par contre, l'asymétrie n'explique pas à elle seule les perturbations posturales de ces patients. Que ce soit chez les patients victimes d'un AVC ou d'une entorse, nos résultats ont montrés une très forte importance des déficiences sensorielles dans la mise en place de ces perturbations. L'intégrité des afférences sensorielles semble être un pré requis nécessaire à la construction d'un schéma postural symétrique, qui selon nous est préférentiellement utilisé dans la construction de la posture.
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Intérêt d'une approche évolutive pour l'étude des invasions biologiques. L'invasion d'Ambrosia artemisiifolia dans la vallée du RhôneGenton, Benjamin 05 1900 (has links) (PDF)
Les invasions biologiques ont des conséquences écologiques et économiques considérables. Si leurs mécanismes démographiques, écologiques et génétiques sont maintenant connus, elles restent cependant difficiles à prédire. Les approches fondées sur la recherche des caractéristiques écologiques des espèces envahissantes ou des écosystèmes envahis n'ont pas encore abouti. Nous encourageons une approche évolutive pour mieux appréhender les mécanismes d'invasion, approche qui s'attache à la résolution de deux paradoxes. (1) Pourquoi une espèce "étrangère" réussit-elle à s'établir et à envahir un écosystème auquel elle n'est pas adaptée, surpassant parfois certaines espèces locales ? (2) Pourquoi les populations envahissantes réussissent-elles à s'adapter si rapidement à leur nouvel environnement malgré les effets de fondation ? L'ambroisie commune, envahissante dans la vallée du Rhône, est une Asteraceae d'origine nordaméricaine. Cet adventice des cultures pose d'importants problèmes de santé publique, son pollen étant très allergène. Pour tenter de résoudre les deux paradoxes évolutifs, nous avons mené plusieurs études comparant des populations envahissantes françaises à des populations nord-américaines de l'aire d'origine. Nous avons ainsi détecté un relâchement de la pression des herbivores qui pourrait avantager l'ambroisie dans l'aire d'invasion. En revanche, nous n'avons décelé aucune adaptation consécutive à cette diminution de pression d'herbivorie. Par ailleurs, après avoir développé des marqueurs microsatellites spécifiques, nous avons mis en évidence une diversité génétique plus élevée dans les populations françaises que dans les populations nord-américaines. Les effets de fondation furent probablement limités par l'introduction en France d'individus provenant de plusieurs populations sources. Enfin, nous proposons un cadre théorique évolutif où nous distinguons trois types d'invasion: celles ne nécessitant aucun changement de l'environnement ou de l'espèce, celles qui sont la conséquence d'un changement de l'environnement et celles qui résultent de l'adaptation de l'espèce.
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Evolución mecánico-energética del músculo cardíaco durante la isquemia y la reperfusiónMazzadi, Alejandro N. 17 August 1997 (has links) (PDF)
Se estudió la producción de calor (Ht) y evolución mecánica en ventrículos de rata estimulados electricamente a 1.5 Hz, perfundidos según la Técnica de Langendorff y sometidos a 45 min de isquemia (Isq) y 45 min de reperfusión (Rep). La influencia de la temperatura se evaluó a 25, 30 y 35 °C. Los 4 componentes diferenciables del calor activo (H1, H2, H3 y H4)(Ponce-Hornos y col, Pflugers Arch-Eur J Physiol 429; 1995) se analizaron en contracciones aisladas en los 10 primeros min de Isch. Los músculos se montaron en un calorímetro (Ponce-Hornos y col, Am. J. of Physiol. 243; 1982) que permitió medir Ht y simultaneamente la presión desarrollada en condiciones isovolúmicas (P) y la presión de reposo (PR). <br />A partir de los estudios realizados fue posible descartar procesos que fueron postulados como responsables de la falla cardíaca isquémica e involucrar en medida apropiada a otros. Entre los primeros, fue posible descartar la caída del pH y los cambios en la energía libre del ATP como responsables en etapas muy tempranas. También pudo disociarse la caída de la P respecto de la desaparición de un componente mitocondrial Ca++ dependiente (H4). Entre los segundos, se identificó un evento energético durante la Isch de alto valor predictivo de la disfunción mecánica y/o daño durante la Rep. También, los experimentos dan apoyo a los cambios en la PR como responsables de la abrupta caída en la P al inicio de la Isch. Además, fué posible vincular a la interacción actomiosínica con la mayor fracción de liberación de energía en el período inicial de la Rep. También se asoció la baja recuperación mecánica durante la Rep con altos valores relativos de calor independiente de tensión.
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Caractérisation des gènes AtNCED impliqués dans la biosynthèse de l'acide abscissique dans la graine d'Arabidopsis thalianaLefebvre, Valérie 04 1900 (has links) (PDF)
L'acide abscissique (ABA) est une hormone végétale impliquée dans la réponse des plantes aux stress et également dans la maturation et la germination des graines. L'ABA est issu du clivage des caroténoïdes (C40) et les étapes précoces sont communes à la formation de pigments, tels que le carotène et le lycopène par exemple. L'étude d'un mutant vivipare de maïs, vp14, déficient en ABA, a permis de cloner l'un des gènes impliqués dans l'étape de clivage des caroténoïdes en xanthoxine (C15), catalysé par les 9-cis-époxycaroténoïdes dioxygénases (NCED) et considéré comme l'étape limitante dans la biosynthèse de l'ABA (Schwartz et al., 1997). L'étude ultérieure de ces enzymes dans plusieurs espèces a montré qu'elles étaient codées par des familles multigéniques et cette famille comporte 9 membres appelés AtNCED chez Arabidopsis, mais seulement 5 d'entre-eux seraient impliqués dans la biosynthèse de l'ABA (Iuchi et al., 2001) (Tan et al., 2003). Ce travail de thèse a porté sur la caractérisation des gènes AtNCED impliqués dans la biosynthèse de l'ABA dans la graine d'Arabidopsis. Dans ce but, nous avons tout d'abord déterminé les expressions des 7 AtNCED les plus homologues à VP14 au cours du développement des siliques et dans les parties végétatives. Cette étude a montré que les 5 gènes potentiellement impliqués dans la biosynthèse de l'ABA sont exprimés dans les graines. Parmi eux, AtNCED6 et AtNCED9 présentent une accumulation de leurs transcrits exclusivement dans les siliques. L'analyse détaillée de leurs patrons d'expression a permis de localiser les transcrits d'AtNCED6 dans l'albumen des graines à tous les stades de développement, avec un pic d'accumulation à 14 JAF. Le gène AtNCED9 s'exprime légèrement plus tôt qu'AtNCED6, et ses transcrits ont été détectés dans l'embryon, ainsi que dans l'albumen des graines. Les mutants Atnced9 présentent des phénotypes similaires aux mutants Atnced6, plus faibles que des mutants ABA-déficients affectés dans des gènes uniques. Ils présentent une déficience en ABA uniquement dans les graines, qui se traduit par une réduction de la teneur en ABA et une résistance au paclobutrazol, mais la dormance des graines n'est pas affectée. La dormance et le besoin en gibbérellines pour germer seraient donc deux événements physiologiques régulés différemment par l'ABA. Par contre, les graines des doubles mutants Atnced6, Atnced9 présentent une dormance réduite. Ceci implique la participation de l'ABA synthétisé dans l'albumen dans le phénomène de mise en place de la dormance au cours du développement de la graine. De plus, la composition en acides gras des mutants Atnced6 est différente du sauvage, donc l'ABA synthétisé dans l'albumen intervient également dans la régulation de l'accumulation des réserves de la graine. L'analyse de l'expression de deux autres gènes, AtNCED2 et AtNCED3, montre que leurs transcrits s'accumulent en même temps au cours du développement de la graine, mais leurs patrons spatial d'expression diffèrent, suggérant que chaque enzyme pourrait permettre la synthèse de pools d'ABA impliqués dans des processus physiologiques distincts.
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Le rôle du photopériodisme dans l'élaboration du rendement de trois variétés de sorgho cultivées en Afrique de l'OuestClerget, Benoît 06 1900 (has links) (PDF)
Résumé Le rôle du photopériodisme dans l'élaboration du rendement de trois variétés de sorgho cultivées en Afrique de l'Ouest Les sorghos d'Afrique de l'Ouest sont très photopériodiques parce que ce caractère leur confère un important avantage évolutif en raison du climat continental de la zone, caractérisé par de fortes variations inter-annuelles du régime pluviométrique. Cette adaptation doit être maintenue dans les variétés améliorées pour la région. Mais en dehors de la variation de la durée du cycle de la phase végétative, les réponses physiologiques à la photopériode ont été peu quantifiées chez les céréales chez lesquelles ce caractère a été contre-selectionné jusqu'à présent. Une étude écophysiologique a été conduite sur 3 variétés de sorgho représentatives du matériel cultivé en Afrique de l'Ouest afin de quantifier la physiologie du photopériodisme. Les expérimentations ont été réalisées en conditions naturelles à Samanko, Mali, pendant 2 années et demi. Plusieurs conclusions originales sur le développement et la croissance des sorghos photopériodiques ont pu être tirées, grâce en particulier aux réponses très marquées de la variété de race guinea, originaire de la région, dont les principales sont : - Le déclenchement de l'initiation paniculaire est sous la double dépendance de la photopériode et du sens de variation de la durée du jour ou de ses composantes, les heures de lever et de coucher du soleil. - Le rythme de production des feuilles par l'apex varie en relation avec la photopériode et ses variations quotidiennes au moment de la levée, durée ou heures de l'aurore et du crépuscule. Il conserve ensuite la valeur initialement acquise jusqu'à un brusque ralentissement aux environs de la date de production de la 23ème feuille, lorsque débute la montaison spontanée en l'absence d'initiation paniculaire. - Le déclenchement de l'élongation des entre-nœuds à cette date est probablement la conséquence de la rapide augmentation du LAI et par conséquent de la biosynthèse. Tous les autres rythmes de développement et de croissance ralentissent simultanément en raison de la concurrence trophique et des relations de coordination entre phytomères qui organisent la cohésion architecturale de la plante. - Lorsque plus de 23 feuilles sont produites la concurrence trophique entre organes est minimale et la répartition de la biomasse est pilotée par la demande potentielle de chacun d'eux. En revanche, en dessous de 23 feuilles la panicule est en concurrence avec la tige pendant son développement et une part de sa croissance. - La taille de la panicule est peu variable en raison de l'évolution antagoniste de la durée et de la vitesse de son développement sur lesquels la photopériode exerce une influence inverse. Un modèle de croissance synthétisant ces connaissances et hypothèses a été calibré et testé pour chacune des variétés. Son utilisation couplée aux connaissances physiologiques acquises permet de conclure à destination des équipes de sélection que le tallage et la réduction de taille ne sont probablement pas de bonnes voies vers l'amélioration du potentiel de rendement des sorghos photopériodiques. L'effort doit essentiellement porter sur la décorrélation de la relation qui lie actuellement la taille potentielle de la panicule à la date de floraison de la variété.
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