A história evolutiva dos animais é altamente influenciada pela história do ambiente em que estes vivem. A floresta Atlântica é uma das mais biodiversas do mundo, e a segunda maior na região Neotropical. A história biogeográfica desta floresta é complexa, sendo que inúmeros fatores devem ter contribuído para a diversificação de sua biota. Esta dissertação estudou os padrões de distribuição da diversidade genética e morfológica em Didelphis aurita, uma espécie de marsupial didelfídeo, endêmico desta floresta, a fim de esclarecer eventos biogeográficos que tenham desempenhado um papel importante na história da floresta. A distribuição desta espécie é concordante com a distribuição da floresta, do norte do Rio Grande do Norte ao sul do Rio Grande do Sul. Os resultados mostraram que existe uma população muito divergente na porção nordeste desta distribuição (estados de Alagoas e Pernambuco), sendo que o grau de divergência tanto molecular quanto morfológica é um indicativo de que se trata de outra espécie. Além disso, os dados apontam que há pouco ou nenhum fluxo gênico entre as duas espécies. O relacionamento deste grupo do Nordeste com a espécie D. aurita e sua espécie irmã D. marsupialis, não pôde ser solucionado. No entanto, o evento de separação foi datado entre 800-500 mil anos, no período Quaternário. Uma vez que a Mata Atlântica e Floresta Amazônica sofreram vários eventos de expansão e retração nesta época, sugeriu-se que a dinâmica climática do Quaternário tenha desempenhado um importante papel na divergência deste grupos. Além disso, D. aurita (excluindo-se a população do Nordeste) foi estudado a fim de testar as predições da hipótese de Refúgios nesta floresta para este grupo. Os padrões de diversidade genética e morfológica dentro deste grupo foram concordante com várias das premissas da Hipótese de Refúgios, porém ao datar-se o evento de expansão, este, é mais antigo do que o previsto para a hipótese. Não obstante, dados de simulação mostraram que testes de refúgios baseados nestas premissas simplistas, podem não ser aplicáveis a história da Mata Atlântica. Desta forma, embora haja indícios de que a Hipótese de Refúgios tenha sido importante para a diversidade deste grupo, é necessário avaliar se esta expansão demográfica realmente deve-se a dinâmica climática do Quaternário e, portanto, avaliar se a diversidade encontrada nesta população pode ser explicada pela hipótese de Refúgios. / The evolutionary history of animals is highly influenced by the history of the environment where these animals live. The Atlantic rainforest is one of the most diverse in the world, and the second largest forest in the Neotropics. The biogeographical history of this forest is complex, and numerous factors might have played a role in the diversification of the biota. This dissertation has studied the patterns of distribution of the genetics and morphological variation in Didelphis aurita, a Didelphidae marsupial, endemic from this forest. This study aims to clarify the biogeographical events that have been important in the diversification of the Atlantic biota. D. aurita distribution is concordant with the forest distribution, going from the north of Rio Grande do Norte state to the south of Rio Grande do Sul state. The results have showed a very diverging population in the northeast distribution (Alagoas and Pernambuco states), and both molecular and morphological divergences indicate that it might be a different species. Moreover, both species might have very low or none gene flow between them. The phylogenetic relationship between this population with the other two species (D. aurita and D. marsupialis), cannot be solved. Even so, the separation event has been dated about 500-800 hundreds years ago, in the Quaternary period. Seeing that both Neotropical forests (Atlantic and Amazonian forests) have experienced several expansions and retractions events in this period, it has been suggested that the climatic dynamics of this period might have played a key role in the divergence of the three species. Moreover, D. aurita (excluding the Northeast population) has been studied with the purpose of testing the Refugee hypothesis in this forest. The genetic and morphological and molecular variations patterns are in agreement with several of this Hypothesis premises. However, the dating of the expansion event is not in agreement with the hypothesis, once it\'s much older than expected. Moreover, simulated data showed that this Refugee tests based in such simplistic assumptions might not be applicable to the history of the Atlantic forest. In this way, even though there are evidences supporting that the Quaternary climate oscillations have been important for this group, it is necessary to evaluate if this demographic expansion is really due to the cyclic glaciations events, and hence evaluate the roll of the Refugee hypothesis for this population.

The Atlantic Forest extends mainly along the Atlantic coast of Brazil, but today the native habitat is reduced to 14.5% of its historical range. This biome is among the fifth most important biodiversity hotspots in the world due to the high richness and endemism and also high degree of human-induced habitat modification. Understanding the response of species with differing life-history traits to habitat modification such as forest edges and matrix types helps predict species occurrence across changing landscapes. Previous studies have used amphibians as a biological indicator of habitat quality due to their physiological and morphological constraints. Amphibians are also an excellent taxon model to study antipredator behavior due to their variety of defensive postures, vocalizations, skin secretions and aposematic colors. Brazil has currently 1026 recognized amphibian species, of which 60 species were described in the past five years, mostly from the Atlantic Forest biome. New species are increasingly described with the increase in sampling effort at microhabitats from remote areas. My study aimed to understand frog response to habitat modification and their antipredator behaviors, and also to describe a new frog species. First, I demonstrated that the breeding guild was the most important variable explaining frog response to edge effects and matrix types. Leaf-litter and bromeliad breeders decreased in richness and abundance from the forest interior toward the matrix habitats. Water-body breeders increased in richness toward the matrix and remained relatively stable in abundance across distances. Second, I created a database comprising 224 records of frog antipredator behavior, of which 102 (45%) were collected during our fieldwork, 116 (52%) were compiled from the literature, and six (3%) were reported by colleagues. The 224 records represented 165 species, and included 16 families of anurans. Lastly, I described the first bromeliad-dwelling species among the 96 species of the genus Dendropsophus. The new species was diagnosed by its small size, framed dorsal color pattern, medium-sized vocal sac, and short membrane in the fifth toe. Phylogenetic analysis based on molecular data indicated this new species should not be assigned to any of the currently recognized species groups of Dendropsophus.

No presente trabalho objetivei estimar o número de espécies de Dacetini que devem ocorrer na serapilheira do bioma da Mata Atlântica, no âmbito do projeto Riqueza e diversidade de Hymenoptera e Isoptera ao longo de um gradiente latitudinal na Mata Atlântica - a floresta pluvial do leste do Brasil, do programa Biota/FAPESP (# 98/05083-0). Foi feita a separação e identificação de cada unidade taxonômica, através da comparação com as espécies já identificadas da coleção de Formicidae do Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo, quando existentes e comparando-as com as descrições originais, utilizando a chave de identificação para as espécies do mundo. De posse das informações taxonômicas foi preparada a matriz de dados utilizada para calcular os valores de riqueza, montada a partir de informações de frequência de cada espécie nas 50 amostras de 1m2 de serapilheira em cada uma das 26 localidades amostradas pelo projeto Biota. A riqueza esperada de espécies foi calculada por meio de rarefação baseada em amostras (Sobs), utilizando-se os estimadores comumente empregados para este fim: Chao1 (44, DP = 2), Chao 2 (47, DP = 4), Jackknife1(51, DP = 3) e Jackknife 2 (53, DP = 0). Objetivando avaliar a importância das classes de espécies (i.e. raras/comuns) no bioma, submeti os dados de frequência total a análises de modelos de abundância (série logarítmica e log-normal. O modelo de abundância que melhor explicou a distribuição das espécies nas amostras foi o modelo de série logarítmica. Foram identificadas 43 morfo-espécies de Dacetini para a Mata Atlântica pelo projeto Biota, sendo 39 delas já conhecidas para a Ciência e quatro ainda não descritas. Na coleção do Museu de Zoologia, outras sete espécies de Dacetini com ocorrência na Mata Atlântica puderam ser identificadas, apesar de não terem sido amostradas no âmbito do projeto Biota. Apresento diagnoses e mapas de distribuição na Mata Atlântica para as 46 espécies conhecidas de Dacetini (Formicidae: Myrmicinae) (quatro de Acanthognathus e 42 de Strumigenys), assim como descrições de quatro espécies novas de Strumigenys. Descrevo ainda, pela primeira vez, gines de seis espécies de Dacetini da Mata Atlântica. Utilizando-se como referência o valor mais alto dos quatro estimadores, é provável que ainda devam existir três espécies da tribo não registradas no bioma até agora. / In the present study I estimated the number of Dacetini species that might occur in the Atlantic Forest leaf-litter, under the project Riqueza e diversidade de Hymenoptera e Isoptera ao longo de um gradiente latitudinal na Mata Atlântica - a floresta pluvial do leste do Brasil, from the Biota/FAPESP (# 98/05083-0) program. I identified each taxonomic unit through comparison with already identified species deposited in the Formicidae collection in the Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo, when they were available, comparing them with the original descriptions and using identification keys to world species. With the taxonomic informations assembled I organized a data matrix based on species frequency in order to compute the richness values from the fifty 1m² litter samples in each of the 26 localities sampled during the Biota Project. The expected richness was calculated through sample rarefaction (Sobs), using the estimators: Chao1 (44, SD=2), Chao 2 (47, SD=4), Jackknife 1 (51, SD=3) and Jackknife 2 (53, SD=0). All estimates were made using the software EstimateS6.0b1a. To assess the importance of species classes (i.e. rare/common) in the biome, I submitted the total frequency data to an abundance analysis (log-series and log-normal). The model which best explained the species distribution in the samples was the log-series model. Fourty three Dacetini morphospecies were identified for the Atlantic Forest in the Biota Project, of which 39 were already known and 4 undescribed. In the Museu de Zoologia collection other seven Dacetini species recorded in the Atlantic Forest were identified, although they were not sampled during the Biota project. I provide diagnosis and distribution maps for the 46 known species of Dacetini (Formicidae: Myrmicinae) (four of Acanthognathus and 42 of Strumigenys), as well as descriptions for four new species of Strumigenys. Also, I describe for the first time gynes for six species of Dacetini from the Atlantic Forest. Using the higher value of the four richness estimators as reference, it is possible to assume that there may be another three unrecorded species for the tribe in this biome.

Submitted by LAURA CAROLINA BELLO LOZANO (caro.bello58@gmail.com) on 2018-09-13T18:59:34Z No. of bitstreams: 1 Tese Carolina Bello new version.pdf: 7168608 bytes, checksum: f47469d76b0f113d4401a511c5b9c908 (MD5) / Rejected by Ana Paula Santulo Custódio de Medeiros null (asantulo@rc.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: - Capa: deve seguir o modelo da seção de pós-graduação. Verificar (Modelo de capa) no site http://ib.rc.unesp.br/#!/pos-graduacao/secao-tecnica-de-pos/programas/ecologia-e-biodiversidade/normas/ - Página de rosto: retirar a informação da Comissão Examinadora e os membros - Nome: o seu nome deve estar completo na capa, na página de rosto e na ficha catalográfica - Título: o título deve seguir a folha de aprovação, ou seja, somente o título em inglês. Alterar o título da capa, da página de rosto e da ficha catalográrica. - Ficha catalográfica: solicitar alteração do seu nome e do título no site da biblioteca Agradecemos a compreensão. on 2018-09-14T11:36:38Z (GMT) / Submitted by LAURA CAROLINA BELLO LOZANO (caro.bello58@gmail.com) on 2018-09-14T15:22:10Z No. of bitstreams: 1 Bello teses versao imprimir OK grafica.pdf: 7240972 bytes, checksum: 78f64ec47aed13ae323c0ead8ce43294 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Santulo Custódio de Medeiros null (asantulo@rc.unesp.br) on 2018-09-14T16:34:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 bello-lozano_lc_dr_rcla.pdf: 6995897 bytes, checksum: 3eab07c5fa5a3be2ac3b78242a7a7f8e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-14T16:34:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 bello-lozano_lc_dr_rcla.pdf: 6995897 bytes, checksum: 3eab07c5fa5a3be2ac3b78242a7a7f8e (MD5) Previous issue date: 2018-07-27 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A extinção de animais é uma ameaça silenciosa nas florestas tropicais. As florestas tropicais estão se tornando ecossistemas defaunados, especialmente de animais de grande porte. No entanto, a defaunação vai além da perda de animais carismáticos, o que estamos perdendo são interações fundamentais que modulam a funcionalidade da floresta e, portanto, dos serviços ecossistêmicos associados. A defaunação tem efeitos sobre a dispersão de sementes, a ciclagem de nutrientes, a qualidade da água, a manipulação de matéria fecal, entre outros serviços ecossistêmicos. Nesta tese, exploramos os efeitos da defaunação de grandes animais no serviço ecosistêmico de estoque de carbono em florestas tropicais. Nós encontramos que o serviço ecossistêmico de armazenamento de carbono está sustentado pelos animais de grande porte, isso porque frugívoros grandes são os principais dispersores de árvores com sementes grandes e, as árvores com sementes grandes tendem a ser altas e com madeira densa, armazenando assim grandes quantidades de carbono. Portanto, a remoção de árvores de sementes grandes das florestas, devido à perda de dispersão induzida pela falta dos grandes frugívoros, pode reduzir o potencial do estoque de carbono da floresta. No entanto, a redução não é direta porque os frugívoros menores podem compensar parcialmente a perda dos grandes frugívoros. Além disso, a perda de grandes predadores de sementes também pode afetar o potencial estoque de carbono. Em comunidades fortemente defaunadas, pequenos roedores tendem a aumentar a sua abundância e a predação de sementes grandes, reduzindo assim o recrutamento deste tipo de árvore. Finalmente, nós exploramos o impacto da relação entre defaunação e o armazenamento potencial de carbono em programas de conservação. Nós mostramos que os projetos de restauração estão promovendo ecossistemas defaunados porque estes são dominados por árvores anemocóricas ou árvores de sementes pequenas que não irão fornecer recurso alimentar suficiente para animais grandes. Além disso, observamos que a falta de animais de grande porte pode produzir impactos econômicos nos mercados de carbono. Enfatizamos a necessidade urgente de integrar o papel dos animais em estratégias de restauração e mitigação das mudanças climáticas. O impacto econômico da defaunação no orçamento de carbono é um bom argumento para inserir os animais neste tipo de programas. Logo, devemos concentrar esforços no desenvolvimento de novas políticas nacionais e internacionais para proteger as florestas das "frentes de defaunação" assim como se tem feito com as “frentes de desmatamento." / Animal loss is a silent threat of forest ecosystem. Tropical forests are becoming defaunated ecosystems, especially defaunated of large animals. The loss of animals goes beyond than the loss of charismatic animals, what we are losing are key interactions that modulate the functionality of the forest and therefore of the associated ecosystem services. For instance, defaunation have effects over seed dispersal, nutrient cycling, water quality and dung removal among others ecosystem services. In this thesis, we explore the potential effects of defaunation of large animals in carbon stock ecosystem services of tropical forest. We found that the carbon stock ecosystem service is supported by large animals due to large frugivores are the main dispersers of large-seeded trees and, large-seeded trees tend to be tall trees with dense wood, therefore, store high quantities of carbon. Hence, the removal of large-seeded trees from the forest, because of diminished dispersal induced by the lack of large frugivores, reduce the carbon stock potential of the forest. However, the reduction is not straightforward because smaller frugivores can partially compensate for the loss of large frugivores. Moreover, strong defaunation effects in the seed predators communities can also affect the carbon stock potential of the forest. In strongly defaunated communities small rodents tend to increase their abundance and the predation pressure over large seeds, reducing their recruitment. In addition, we explore the impact of defaunation and carbon stock relation in conservation programs. We show that restoration projects are promoting defaunated ecosystems because they are dominated by abiotic trees or small-seeded trees, which will not provide enough food to large animals. Besides we observed that the lack of large animals can produce economic impacts in the carbon markets. Therefore, we argue the urgent necessity of integrating the animal role in restoration and climate mitigation strategies to. The economic impact of animal defaunation on carbon budget is a good argument to introduce animals in REED+ markets and forest restoration strategies. Within this evidence, we claim for the development of new national and international policy frames to protect forests from ‘defaunation fronts’ as well as has been done with ‘deforestation fronts’. / La extinción de animales es una amenaza silenciosa en los bosques tropicales. Los bosques tropicales se están convirtiendo en ecosistemas defaunados, especialmente despoblados de grandes animales. Esta pérdida de animales va más allá de la pérdida de animales carismáticos, lo que estamos perdiendo son interacciones clave que modulan la funcionalidad del bosque y, por lo tanto, de los servicios ecosistémicos asociados. Por ejemplo, la defaunación tiene efectos sobre la dispersión de semillas, el ciclo de nutrientes, la calidad del agua, la eliminación de excrementos, entre otros servicios de los ecosistemas. A través de esta tesis, exploramos los efectos potenciales de la defaunación de animales grandes en el servicio ecosistémico de almacenamiento de carbono de los bosques tropicales. Encontramos que el almacenamiento de carbono es soportado por animales grandes debido a que los frugívoros grandes son los principales dispersores de árboles con semillas grandes y, los árboles con semillas grandes tienden a ser árboles altos con madera densa, y consequentemente, almacenan altas cantidades de carbono. En consecuencia, la eliminación de árboles de semilla grande del bosque, debido a la dispersión disminuida inducida por la falta de grandes frugívoros, puede reducir el potencial de reserva de carbono del bosque. Sin embargo, la reducción no es directa debido a que los frugívoros más pequeños pueden compensar parcialmente la pérdida de frugívoros grandes. Además, los fuertes efectos de defaunación en las comunidades de depredadores de semillas también pueden afectar el potencial de reserva de carbono del bosque debido a que, en las comunidades fuertemente defaunadas los pequeños roedores tienden a aumentar su abundancia y la presión de depredación sobre las semillas grandes, reduciendo su reclutamiento. Finalmente, exploramos el impacto de la relación entre la defaunación y el potencial de carbono de los bosques tropicales en los programas de conservación. Mostramos que los proyectos de restauración están promoviendo ecosistemas defaunados porque están dominados por árboles abióticos o árboles de semilla pequeña, que no proporcionarán suficiente alimento a los animales grandes. Además, la falta de animales grandes puede producir impactos económicos en los mercados de carbono. Por lo tanto, recalcamos la necesidad urgente de integrar el papel de los animales en las estrategias de restauración y mitigación del cambio climático. El impacto económico de la defaunación de animales en los mercados de carbono es un buen argumento para introducir los animales en los proyectos REED+ y las estrategias de restauración forestal. A partir de estas evidencias, reivindicamos la necesidad de desarrollar nuevos marcos de políticas nacionales e internacionales para proteger los bosques de los "frentes de la defaunación", así como se ha hecho con los "frentes de deforestación". / FAPESP: 2013/22492-2 / FAPESP: 2015/23770-1

Orientador: Mauro Galetti Rodrigues / Banca: Adriano Garcia Chiarello / Banca: Milton Cezar Ribeiro / Resumo: Mamíferos florestais, sobretudo as espécies de maior porte têm sofrido impactos decorrentes da perda, fragmentação e alteração de habitats. Porém, mesmo em florestas intactas ocorre a redução ou perda das populações dessas espécies, devido a sobrecaça, resultando no processo conhecido como defaunação. Como consequências da defaunação, há a quebra ou relaxamento das interações animal-planta, interferindo na dinâmica florestal, o que tem sérias implicações sobre a manutenção dos ecossistemas. Nesta Dissertação de Mestrado, dividida em dois capítulos buscou-se primeiro, verificar qual é o estado de conservação da comunidade de mamíferos de médio e grande porte de uma floresta contínua (Capítulo I: Densidade e abundância de mamíferos de uma área contínua da Mata Atlântica: um caso de floresta defaunada?); e segundo entender quais são as consequências da perda de mamíferos de maior porte sobre o sub-bosque florestal (Capítulo II: Efeitos da defaunação sobre o sub-bosque de uma floresta tropical), com dados coletados entre julho de 2009 e janeiro de 2011. Através de amostragens em transectos lineares e armadilhas fotográficas, ficou demonstrado que a área de estudo apresenta redução substancial na população da maioria das espécies de mamíferos cinegéticos, com a extinção local de Tayassu pecari (Capítulo I). Por meio da comparação entre parcelas de exclusão (defaunação induzida) e parcelas controle (abertas para todos os animais), não foram observadas alterações significativas no sub-bosque na ausência de mamíferos de médio e grande porte, o que provavelmente esteja ligado à necessidade de maior tempo para respostas estruturais serem observadas; ou ainda ao desbalanço nas taxas de herbivoria, pisoteio e predação de sementes causadas pela defaunação que a área sofre (Capítulo II). / Abstract: Forest mammals, especially the larger species, have been impacted for loss, fragmentation and alteration of habitats. However, even in intact forests occurs loss or reduction of the populations of these species, due to overhunting, resulting in the process known as defaunation. Such process causes the breaking or relaxation of the animal-plant interactions, interfering in forest dynamic, which has serious implications for ecosystems maintenance. In this Master's dissertation, divided into two chapters, we aimed firstly to ascertain the conservation status of the large and medium mammals community in a continuous area of Atlantic Forest (Chapter I: Density and abundance of mammals in a continuous site of Atlantic Forest: is that a case of defaunated forest?), and second understand what are the consequences of the larger mammals loss on the forest understory (Chapter II: Effects of defaunation on understory of a tropical Forest), with data collected between July 2009 and January 2011. Through sampling on line transects and camera trapping, we verified that the study area presents substantial reduction in most game mammal population, with local extinction of Tayassu pecari (Chapter I). By comparing exclusion plots (defaunation induced) and control plots (open to all animals), we have not found significant changes in the understory in the absence of large and medium mammals, which is probably linked to the need of more time to found these structural responses, or to the imbalance in rates of herbivory, seed predation and trampling caused by defaution that the study area suffers (Chapter II) / Mestre

Resumo: Este trabalho teve como objetivos verificar como variam a chuva de sementes e o estabelecimento de plântulas entre ambientes colonizados (B) e não colonizados (SB) pelo bambu Guadua tagoara na floresta Atlântica do Parque Estadual Carlos Botelho, Sete Barras - SP. Foram utilizados 40 coletores e 40 parcelas de 1m2 em cada ambiente com monitoramento mensal no período de um ano. SB apresentou 38,71% mais sementes que B, maior riqueza, menor diversidade e equidade. Os ambientes mostraram uma alta similaridade no número de espécies de sementes em comum e com abundâncias semelhantes. SB apresentou maior média de sementes/mês e maior média de sementes/espécie. A densidade absoluta de sementes por coletor não variou entre ambientes, entretanto variou entre meses. Em relação às plântulas, B apresentou maior abundância, maior densidade, maior riqueza, maior dominância de Euterpe edulis, entretanto menor diversidade e equidade que SB. Os dois ambientes se apresentaram com baixa similaridade na composição e na abundância de plântulas por espécie. Em B houve maior média de plântulas/mês enquanto a média de plântulas/espécie foi semelhante entre ambientes. A densidade absoluta de plântulas de E. edulis variou entre meses e ambientes, com maior número em B. Para as demais espécies a diferença se deu entre ambientes e meses, porém maior número em SB. Quando analisadas todas as plântulas em conjunto houve diferença entre meses e ambientes. Maior média de plântulas emergiram e morreram no ambiente com bambu a cada mês. A taxa de sobrevivência variou segundo o tipo de ambiente e ao longo do ano. Nos dois ambientes E. edulis foi a única espécie que não apresentou qualquer tipo de limitação demográfica... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: This project aim to evaluate how the seed rain and the seedling establishment varied between environments with (B) and without (WB) the bamboo Guadua tagoara in the Atlantic forest of Carlos Botelho State Park, Sete Barras - SP. Forty traps and forty plots of 1m2 were placed within each patch type during one year of monthly monitoring. We recorded higher richness and more seeds in WB than in B, nonetheless, diversity and equitability were lower. Both environments showed high similarity in composition and abundance of seeds per specie. The average of seeds per month and seeds per specie was higher in WB. Also, the absolute density of seeds per trap varied predictable in time but there was not difference between B and WB. In respect to seedlings, B environment showed higher abundance, density, richness and dominance of Euterpe edulis, although diversity and equitability were lower than in WB. We found low similarity between B and WB environments in seedlings composition and abundance per specie. The average of seedlings per month was higher in B while the average of seedlings per specie was similar. The absolute density of E. edulis and other species seedlings varied in time in both environments, showing more seedlings density of the former in B and more seedlings density of the later in WB. When all species were analyzed together, seedling density was different between environments and months. The average of seedlings that emerged and died was higher in B environment. The survival rate varied between environments and in time. We found that E. edulis was the only specie that did not show any demographic limitations between environments. Seed rain did not vary between environments in relation to the specie composition as much as in the seed quantity... (Complete abstract, click electronic access below) / Orientador: Marco Aurélio Pizo Ferreira / Coorientador: Ricardo Ribeiro Rodrigues / Banca: Sergius Gandolfi / Banca: Mauro Galetti Rodrigues / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:14Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-08-03Bitstream added on 2014-06-13T21:00:37Z : No. of bitstreams: 1 brocardo_cr_me_rcla.pdf: 4253026 bytes, checksum: e6247a3d5dd9d94340cc5df8de42e45f (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Mamíferos florestais, sobretudo as espécies de maior porte têm sofrido impactos decorrentes da perda, fragmentação e alteração de habitats. Porém, mesmo em florestas intactas ocorre a redução ou perda das populações dessas espécies, devido a sobrecaça, resultando no processo conhecido como defaunação. Como consequências da defaunação, há a quebra ou relaxamento das interações animal-planta, interferindo na dinâmica florestal, o que tem sérias implicações sobre a manutenção dos ecossistemas. Nesta Dissertação de Mestrado, dividida em dois capítulos buscou-se primeiro, verificar qual é o estado de conservação da comunidade de mamíferos de médio e grande porte de uma floresta contínua (Capítulo I: Densidade e abundância de mamíferos de uma área contínua da Mata Atlântica: um caso de floresta defaunada?); e segundo entender quais são as consequências da perda de mamíferos de maior porte sobre o sub-bosque florestal (Capítulo II: Efeitos da defaunação sobre o sub-bosque de uma floresta tropical), com dados coletados entre julho de 2009 e janeiro de 2011. Através de amostragens em transectos lineares e armadilhas fotográficas, ficou demonstrado que a área de estudo apresenta redução substancial na população da maioria das espécies de mamíferos cinegéticos, com a extinção local de Tayassu pecari (Capítulo I). Por meio da comparação entre parcelas de exclusão (defaunação induzida) e parcelas controle (abertas para todos os animais), não foram observadas alterações significativas no sub-bosque na ausência de mamíferos de médio e grande porte, o que provavelmente esteja ligado à necessidade de maior tempo para respostas estruturais serem observadas; ou ainda ao desbalanço nas taxas de herbivoria, pisoteio e predação de sementes causadas pela defaunação que a área sofre (Capítulo II). / Forest mammals, especially the larger species, have been impacted for loss, fragmentation and alteration of habitats. However, even in intact forests occurs loss or reduction of the populations of these species, due to overhunting, resulting in the process known as defaunation. Such process causes the breaking or relaxation of the animal-plant interactions, interfering in forest dynamic, which has serious implications for ecosystems maintenance. In this Master’s dissertation, divided into two chapters, we aimed firstly to ascertain the conservation status of the large and medium mammals community in a continuous area of Atlantic Forest (Chapter I: Density and abundance of mammals in a continuous site of Atlantic Forest: is that a case of defaunated forest?), and second understand what are the consequences of the larger mammals loss on the forest understory (Chapter II: Effects of defaunation on understory of a tropical Forest), with data collected between July 2009 and January 2011. Through sampling on line transects and camera trapping, we verified that the study area presents substantial reduction in most game mammal population, with local extinction of Tayassu pecari (Chapter I). By comparing exclusion plots (defaunation induced) and control plots (open to all animals), we have not found significant changes in the understory in the absence of large and medium mammals, which is probably linked to the need of more time to found these structural responses, or to the imbalance in rates of herbivory, seed predation and trampling caused by defaution that the study area suffers (Chapter II)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:14Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-09-29Bitstream added on 2014-06-13T20:40:01Z : No. of bitstreams: 1 miyoshi_ar_me_rcla.pdf: 5579566 bytes, checksum: 5df7d88b2c4a58c1944625216c3c6e0d (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O objetivo desta dissertação foi fornecer informações taxonômicas, que permitissem verificar se duas populações de grilo do gênero Hygronemobius, que ocupam microambientes distintos, pertencem a espécies diferentes e se estas são novas para a ciência. Para um reconhecimento satisfatório e seguro, os seguintes elementos foram considerados: (1) morfometria, morfologia e ultramorfologia externa de machos e fêmeas, (2) morfologia da genitália masculina, (3) ultramorfologia do proventrículo, (4) morfologia e ultramorfologia da tégmina, (5) ultramorfologia e morfometria da pars stridens, (6) estrutura do som de chamado e de corte (7) observações ecológicas e comportamentais. Os espécimens foram capturados na Mata Atlântica, município de Ubatuba, estado de São Paulo, Fazenda Capricórnio (23O 23 S 45O 04 W). As coletas foram realizadas através de busca ativa (varredura com rede e captura manual) e ocorreu em 1996 e entre os anos de 1999 a 2004, sem obedecer a um cronograma regular. As duas populações exibiram morfologia externa semelhante. Entretanto, os resultados relativos ao habitat, morfologia da genitália masculina, morfometria corporal e padrão de coloração do último segmento dos palpos maxilares parecem indicar as duas populações, como sendo espécies distintas. A morfologia interna do proventrículo demonstrou um padrão inédito na subordem Ensifera, com a ocorrência de dois tipos de apêndices esclerotinizados. Nas duas populações, a estrutura do som de chamado apresentou características encontradas em aves e anuros que habitam corredeiras e é formada por notas com um número pequeno de pulsos; com relação ao número de pulsos em cada nota foi verificada a ocorrência de variações intra-específicas em ambas às populações; os demais parâmetros físicos mostraram-se semelhantes. . / The objective of this dissertation was to supply taxonomic information that allow to verify, if two populations of crickets belonging to the genus Hygronemobius, that inhabit different micro-enviroment, belong to different species, and if they are new to science. The following aspects were considered: (1) morphometric, morphology and ultramorphology of males and females, (2) morphology of the phallic sclerites, (3) ultramorphology of proventriculus, (4) morphology and ultramorphology of tegmina, (5) ultramorphology and morphometric of pars stridens, (6) calling song and courtship song, and (7) ecological and behavior observations. The specimens were collected at the Atlantic Rain Forest, Municipality of Ubatuba, state of São Paulo, Fazenda Capricórnio (23O 23 S 45O 04 W). The captures were accomplished through active search (sweeping with net and manual capture) and it accomplished on 1996 and among 1999 and 2004, without to follow a regular period. The two populations have similar external morphology. However, the results for habitat, morphology of the phallic sclerites, body size and pattern of coloration of the last segment of the maxillary palps allow to consider the two populations as being different species. The intern morphology of the proventriculus demonstrated a new pattern in the subordem Ensifera with the occurrence of two types of sclerotized appendices. In the two population, the structure of the calling song has a trait present in anurans and birds inhabiting streams. The calling song is formed by notes with a small number of pulses; there is intra-specific variations in the number of pulses in each note in both populations; the other physical parameters were similar. The courtship song was analyzed for the population of the Indaiá river and it is mentioned for the first time for the genus, which consists of a trill...(Complete abstract, click electronic address below).

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005-04-18Bitstream added on 2014-06-13T19:39:36Z : No. of bitstreams: 1 gabriel_va_me_rcla.pdf: 781557 bytes, checksum: 14c35f8bd36a58f818bd1e877323dd1d (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Esta pesquisa investigou o uso de cercas-vivas por aves em uma paisagem fragmentada de Mata Atlântica semidecídua em Itatiba, São Paulo. Objetivou-se (1) determinar quais espécies de aves utilizam as cercas-vivas, (2) que atividades aí realizam, (3) verificar a disponibilidade de frutos e artrópodes nas cercas-vivas, (4) se a presença das aves nas cercas-vivas está relacionada à disponibilidade desses recursos alimentares e (5) caracterizar a estrutura da vegetação das cercas-vivas e compará-las aos fragmentos estudados. Foram estudados cinco fragmentos e três cercas-vivas, que conectam tais fragmentos. Nove redes de neblina foram instaladas nas cercas-vivas e 15 nos fragmentos para a captura e anilhamento de aves. Pela recaptura das aves foi inferida a função das cercas-vivas como corredor. Taxas de captura nas cercas-vivas e fragmentos foram comparadas. Para isso foram consideradas, separadamente, guildas de aves frugívoras, insetívoras, granívoras-frugívoras, granívoras-insetívoras e nectarívorasinsetívoras. Quanto às taxas de captura, excetuando-se a taxa de captura de aves insetívoras, houve diferença significativa entre cercas-vivas e fragmentos, sendo sempre maiores nas cercas-vivas. Não houve diferença na oferta de frutos e artrópodes entre cercas-vivas e fragmentos. As taxas de captura de aves frugívoras e insetívoras não estiveram relacionadas à disponibilidade de frutos e artrópodes. Cercas-vivas e fragmentos pouco diferiram quanto à estrutura da vegetação. Concluiu-se que a presença de cercas-vivas pode amenizar os efeitos do isolamento a que estão sujeitas muitas aves tropicais devido à fragmentação de seu habitat. / This study investigated the use of live fences by birds in a fragmented Atlantic forest landscape in Itatiba, SE Brazil. The purpose of it was (1) identify what bird species use the live fences, (2) record what they do in the live fences, (3) investigate the availability of food resources (fruit and arthropod) in live fences, (4) investigate if the food availability influences the use of live fences by birds and (5) characterize the vegetation structure of live fences and forest fragments. Five forest fragments and three live fences that connect such fragments were studied. Nine mist-nets were installed in live fences and 15 in forest fragments to capture and band birds. For this, captured birds were classified into the following foraging guilds: frugivores, insectivores, granivores-frugivores, granivoresinsectivores and nectarivores-insectivores. Except for insectivorous birds, significant differences in capture rates between live fences and forest fragments were detected. Capture rates in live fences were always greater than in fragments. There was no difference in the availability of food resources between live fences and fragments. The capture rates of frugivorous and insectivorous birds were not related to the availability of fruits and arthropods. The vegetation structure at live fences and forest fragments differed little from each other. I concluded that live fences can serve as movement corridors for birds at the study site, thus helping to reduce the usually deleterious effects of isolation caused forest fragmentation.

Foram caracterizadas e comparadas a morfologia, a dieta, a utilização do substrato, a atividade sazonal e a biologia reprodutiva de Tropidodryas serra e T. striaticeps ao longo de toda sua distribuição na Mata Atlântica. Há segregação altitudinal na maior parte da distribuição geográfica das duas espécies-irmãs, T. serra habita predominantemente áreas de baixada e T. striaticeps ocupa as porções mais elevadas. Em localidades onde ocorrem em simpatria, há diferenciações na morfologia, na utilização do hábitat, nos tipos de presas consumidas e na extensão dos ciclos reprodutivos, possibilitando a partilha de recursos entre as duas espécies afins. As fêmeas das duas espécies foram maiores que os machos, indicando que não há combate ritual. Os machos em ambas as espécies apresentaram maiores comprimentos relativos da cauda, da cabeça e do olho que as fêmeas conspecíficas. Nas duas espécies as fêmeas foram mais robustas que os machos. Com relação às diferenças interespecíficas, T. serra é maior e mais pesada e T. striaticeps tem cauda, cabeça e olhos maiores. Nas duas espécies, os juvenis apresentaram a ponta da cauda branca. Os adultos de T. serra alteraram a coloração da ponta da cauda com a mudança nos tipos de presas ingeridas, ao passo que os adultos de T. striaticeps mantiveram a ponta da cauda branca mesmo com a variação na dieta. Poucos foram os indivíduos, em ambas as espécies, com mutilações na ponta da cauda. As duas espécies são diurnas, procuram ativamente por suas presas no solo e sobre a vegetação. Parecem utilizar mais a vegetação para repousar. Tropidodryas serra utiliza a vegetação com maior freqüência que T. striaticeps. Alimentam-se principalmente de mamíferos, mas incluem também aves, lagartos, anuros e serpentes na sua dieta. Tropidodryas serra apresentou maior equitabilidade na freqüência de captura de diferentes itens alimentares. Tropidodryas striaticeps apresentou maior freqüência de indivíduos com alimento no trato digestivo. Há variação ontogenética na dieta: juvenis se alimentam de presas ectotérmicas e adultos, em sua maioria, de endotérmicas. As fêmeas de T. serra foram coletadas com mais freqüência durante os meses mais quentes e chuvosos e os machos tiveram um pico de atividade entre fevereiro e abril. Os machos e as fêmeas de T. striaticeps não apresentaram diferenças na abundância ao longo do ano. Em T. serra as fêmeas atingiram a maturidade sexual antes que os machos coespecíficos, já em T. striaticeps ocorreu o contrário, os machos maturaram antes que as fêmeas. As fêmeas das duas espécies apresentam ciclos sazonais, com vitelogênese secundária e ovos durante a estação chuvosa. Nas fêmeas de T. serra o ciclo reprodutivo é mais restrito, as ninhadas são menores, os recém-nascidos maiores e a freqüência reprodutiva é maior que nas fêmeas de T. striaticeps. O ciclo espermatogênico é contínuo em ambas as espécies. O volume dos testículos e o diâmetro dos ductos deferentes se mantiveram elevados durante todo o ano nas duas espécies congêneres. Portanto, o ciclo sazonal nas fêmeas é pós-nupcial (a produção de ovos é dissociada da época de cópula) e o ciclo contínuo nos machos é pré-nupcial (a cópula ocorre simultaneamente com a produção de espermatozóides). / Morphology, diet, habitat use, seasonal activity and reproductive biology were analyzed and compared between Tropidodryas serra and T. striaticeps along their geographical distribution in the Atlantic Forest. The distribution of these sister species do not overlap in most of their range, T. serra have its distribution in lower altitude areas\' while T. striaticeps occurs in higher ones. In some localities where both species occur in sympatry they develop differences in body size, habitat preferences, food items and extension of reproductive cycles allowing them to share the resources. Mature females attained larger body sizes than mature males in T. striaticeps and T. serra, such differences in body length suggest that the ritual combat is absent. Males attained larger lengths of tail, head and eye than did females. In both species females have stouter body than males. Interespecific comparison shows that T. serra has the largest body size and is stouter whereas T. striaticeps has the largest tail, head and eye and is more slender. The juveniles present the tip of the tail white. Tail tip of adults T. serra is suffused with cryptic colors but in T. striaticeps the whitish tail tip remains until adult stage although the ontogenetic dietary changes take place. There were few individuals with tail injures. Both species are diurnal and forage actively on the ground and upon the vegetation. They may use the vegetation to rest. Tropidodryas serra seems to inhabit more frequently the lower branches of the vegetation instead T. striaticeps may use the canopy trees. They feed mainly on mammals, but also prey birds, lizards, anurans and snakes. Tropidodryas serra has a more equitable frequency of capture of food items whereas T. striaticeps shows a higher frequency of individuals with preys in their gut. The ontogenetic shift in diet is present, juveniles prey upon ectothermics and adults feed on endothermic preys. Females of T. serra show a peak of abundance during the warmest and rainy periods of the year and males show a peak of activity in February and April. Both sexes in T. striaticeps were equally distributed among seasons, showing no differences between rainy and dry one. Females attained sexual maturity before males in T. serra, the converse occur to T. striaticeps where males where mature before the co-specific females. Both females of these two closely related species present seasonal reproductive cycles with vitellogenesis and egg-laying occurring at the rainy season. In T. serra females the reproductive cycle is more restrict, the clutch size is smaller, the newborns are bigger and the frequency of reproduction higher than T. striaticeps. The spermatogenic cycle is continuous, testes volume and deferent ducts diameter did not vary throughout the year for both species. The seasonal cycle in females is postnuptial (mating seems to be dissociated from vitellogenesis and egg production) and the continuous cycle in males is prenuptial (the produced sperm is used immediately during the mating).