Nous présentons dans ce travail un couplage cohérent des distributions spectrales d'énergies de galaxies évoluées aux longueurs d'onde X et optiques. Les nouveaux télescopes spatiaux en orbite (XMM et CHANDRA) ainsi que les grands télescopes au sol (VLT) permettent aujourd'hui d'observer avec une grande précision les galaxies proches comme les plus lointaines. L'étude des sources de rayons X dans les galaxies met en évidence le rôle particulier des étoiles en fin de vie. Parmi celles-ci, les restes de supernovae, les binaires X de faible masse et les binaires X de grande masse sont des sources particulièrement brillantes. Du gaz chaud est également présent dans les régions de formation d'étoiles et dans les galaxies elliptiques. Enfin, l'absorption des photons X par le gaz froid du milieu interstellaire est souvent très grande aux énergies inférieures à 1 keV. L'association de la modélisation des spectres de ces sources avec un code de synthèse spectrale évolutive nous permet de prédire les spectres X de galaxies dont les histoires de formation d'étoiles peuvent être très diverses. Nous étendons ainsi la couverture spectrale des spectres synthétiques calculés jusqu'à présent dans les domaines ultraviolet, visible, et infrarouge proche. La force du modèle d'évolution est de pouvoir prédire de façon cohérente la formation d'étoiles (qui se manifeste principalement dans l'optique), et la mort de ces étoiles (dont les restes sont souvent des objets compacts émetteurs de rayons X). De plus, les métallicités du milieu interstellaire et des étoiles, qui évoluent au fur et à mesure que les étoiles meurent, ont des signatures particulières dans tous ces domaines de longueur d'onde. Nous présentons les résultats de spectres et de couleurs X obtenus pour tous les types spectraux de galaxies. Nous expliquons les corrélation observées entre le taux de formation d'étoiles, les luminosités en bande B et les luminosités aux longueurs d'onde X. Nous appliquons ensuite nos modèles à la prédiction des fonctions de luminosité X des galaxies normales, puis nous estimons la fraction du fond diffus X qui peut être attribuée à ces galaxies. L'étude de la formation d'étoiles et de l'évolution de la métallicité est faite conjointement dans le visible. Nous construisons un code de synthèse spectrale automatique et nous l'appliquons à l'analyse de galaxies elliptiques proches. Nous présentons également une extension de ce code, permettant d'estimer des décalages spectraux photométriques, et nous l'utilisons pour analyser des galaxies lointaines. Enfin, nous proposons une étude des raies en stellaires en absorption dans la lumière visible des galaxies, en associant le code d'évolution PÉGASE à une bibliothèque stellaire à haute résolution spectrale. Nous définissons alors deux nouveaux indices qui caractérisent bien l'âge et la métallicité d'une population stellaire.

Depuis son avènement au début des années 1990, le Web a profondément bouleversé la société contemporaine et ce à plusieurs niveaux. Ce nouvel outil est rapidement devenu incontournable et s'est affirmé comme la plus grande base de données du monde. La popularité sans cesse croissante du Web a généré une dynamique très importante principalement au niveau des données qu'il renferme. En effet, en vertu de l'évolution des connaissances du monde réel, de nouvelles informations sont rajoutées, d'autres retirées et certaines sont modifiées sans cesse sur le Web posant ainsi des problèmes pour retrouver l'information pertinente. Les moteurs de recherche existants ne sont pas capables d'une part de prendre en compte l'évolution des connaissances du Web lorsqu'un utilisateur pose une requête et d'autre part, de comprendre les besoins en information de l'utilisateur pour lui retourner les pages Web répondant à ces besoins. L'apparition du paradigme du Web Sémantique, visant à donner un sens aux données du Web pour les rendre compréhensibles par les machines grâce à l'utilisation d'ontologies, contribue à l'amélioration de la recherche documentaire sur le Web. Cependant, les problèmes posés par l'évolution restent peu pris en compte. Dans ces travaux, nous nous sommes intéressés à la prise en compte de l'évolution des données du Web dans le but d'améliorer, en terme de pertinence des résultats, la recherche documentaire sur le Web. La solution que nous proposons est basée sur les ontologies, fondement du Web Sémantique, pour représenter les connaissances du domaine de recherche visé par des requêtes ainsi que les vues des utilisateurs sur ce domaine. Dans la solution que nous préconisons, les ontologies sont vues comme des connaissances qui évoluent au cours du temps. Cette solution nous a obligé à considérer l'évolution des ontologies sous deux aspects différents : de manière générale par rapport au domaine visé par la requête et de manière plus particulière par rapport aux points de vue des utilisateurs. En premier lieu, nous proposons un modèle d'ontologies adaptatives ainsi qu'un processus d'adaptation permettant aux ontologies de s'adapter aux évolutions des connaissances d'un domaine. Le modèle ainsi défini s'appuie sur des idées émises dans les domaines de la psychologie et des sciences naturelles. Ensuite, nous proposons une exploitation de ce type d'ontologie pour améliorer la recherche documentaire sur le Web. Nous introduisons tout d'abord, des structures de données (les WPGraphs et W3Graphs) pour la représentation des données du Web, puis le langage de requête ASK adapté à ces structures pour l'extraction des données pertinentes. Nous proposons également un ensemble de règles d'enrichissement des requêtes ASK basé sur les relations ontologiques et les éléments propres aux ontologies adaptatives des ontologies représentant le domaine visé par la requête et celle représentant les vues des utilisateurs sur le domaine. Pour finir nous proposons un outil pour la gestion des ontologies adaptatives et la recherche d'information sur le Web ainsi qu'une validation expérimentale des concepts introduits. Cette dernière est basée sur un cas d'étude réaliste pour la recherche d'articles scientifiques publiés à la conférence internationale World Wide Web.

L'objet de cette thèse est de réaliser une revue critique des principaux modèles Darwiniens de l'évolution culturelle, de montrer dans quelle mesure et de quelle façon l'évolution culturelle est analogue à l'évolution biologique et de proposer des instruments conceptuels et formels pour étudier l'évolution culturelle dans cette perspective. Trois ensembles théoriques distincts sont étudiés. La mémétique repose sur l'idée qu'il existe dans le domaine culturel un mécanisme psychologique équivalent à la réplication en biologie. Nous montrons que l'imitation n'est pas assez fidèle pour jouer pleinement ce rôle et donc que le modèle mémétique ne peut pas servir de base à une théorie générale des phénomènes culturels. La théorie de la coévolution gène-culture part de l'idée que la sélection est un facteur dominant de l'évolution et soutient qu'il existe plusieurs mécanismes psychologiques et forces propres au domaine culturel. Nous montrons que l'importance de la sélection est à relativiser et dépend d'autres forces. Dans une partie dédiée à l'étude de l'épidémiologie culturelle, nous défendons l'idée selon laquelle les mécanismes psychologiques tendent à être modulaires et à maximiser la pertinence. Ces deux propriétés font que les mécanismes psychologiques construisent les éléments culturels qu'ils transmettent. Le phénomène d'attraction, conséquence à l'échelle de la population de ces transformations successives, permet d'expliquer la stabilité et l'évolution des éléments culturels. Attraction et sélection sont les deux sources de la stabilité des éléments culturels. L'évolution culturelle est donc à penser dans un cadre Darwinien populationnel.

À partir d'une analyse épistémologico-langagière de trois débats scientifiques mettant au travail des concepts relevant de la biologie fonctionnaliste (nutrition dans une classe de 3e) et de la biologie historique (mécanismes de l'évolution dans une classe de première ES ; ancêtre hypothétique commun dans un groupe d'étudiants préparant le concours de recrutement de professeur des écoles), notre recherche vise à comprendre comment les pratiques de savoir et les pratiques langagières des élèves s'articulent étroitement pour permettre une problématisation scolaire visant des apprentissages biologiques. Le type d'analyse mené a permis d'expliciter les liens qui existent entre l'activité de problématisation des élèves, la dynamique de construction d'une explication en biologie et la secondarisation des textes produits oralement par les élèves. Nous avons distingué plusieurs niveaux de problématisation et précisé la fonction des obstacles par rapport au processus de problématisation.

DANS L'ETUDE DES PROCESSI D'EVOLUTION DU DEVELOPPEMENT, LES FACTEURS DE TRANSCRIPTION SONT IMPORTANTS CAR ILS REGULENT L'EXPRESSION GENIQUE AU COURS DU DEVELOPPEMENT. PARMI CES FACTEURS, LES RECEPTEURS NUCLEAIRES (RNS) ONT UN STATUT PARTICULIER CAR LEUR ACTIVITE EST REGULEE PAR UN LIGAND. DURANT MA THESE, JE ME SUIS INTERESSEE A L'EVOLUTION DES RNS CHEZ LES CHORDES (TELS QUE LES VERTEBRES, LES TUNICIES ET L'AMPHIOXUS) EN ETUDIANT DEUX RNS PARTICULIERS : LES RECEPTEURS AUX OESTROGENES (ER) ET AUX HORMONES THYROÏDIENNES (TR), CHEZ L'AMPHIOXUS BRANCHIOSTOMA FLORIDAE. AINSI, J'AI ETUDIE LE ROLE DE TR DANS L'EVOLUTION DE LA METAMORPHOSE CHEZ LES CHORDES. BIEN QUE LA PLUPART DES CHORDES METAMORPHOSENT, LES MODIFICATIONS MORPHOLOGIQUES CORRESPONDANTES SONT TRES VARIABLES D'UNE ESPECE A L'AUTRE. CETTE VARIABILITE MORPHOLOGIQUE SE REFLETE-TELLE DANS LE DETERMINISME MOLECULAIRE DE LA METAMORPHOSE ? CE DERNIER EST ENCORE MAL CONNU EN DEHORS DES MODELES VERTEBRES CLASSIQUES CHEZ QUI LA METAMORPHOSE EST INDUITE PAR LA FIXATION DES HORMONES THYROÏDIENNES (HTS) SUR TR. PAR DES APPROCHES BIOINFORMATIQUES ET BIOCHIMIQUES, J'AI ETABLI QUE LE PROTOCHORDE AMPHIOXUS PRODUIT DES HTS PAR UNE VOIE METABOLIQUE HOMOLOGUE A CELLE DES VERTEBRES. J'AI ALORS MONTRE QUE LES HTS REGULENT LA METAMORPHOSE DE L'AMPHIOXUS, EN MODULANT L'ACTIVITE DE TR, COMME CHEZ LES VERTEBRES. J'AI AINSI PROPOSE QUE LA CONSERVATION DU DETERMINISME MOLECULARE (LE COUPLE TH/TR) DE LA METAMORPHOSE CHEZ LES CHORDES EN REVELE L'HOMOLOGIE, ALORS QUE LES AUTRE PARTIES DE LA VOIE DE REGULATION ONT ETE MOINS CONSERVEES AU COURS DE L'EVOLUTION ET EXPLIQUENT LA DIVERSITE MORPHOLOGIQUE QUE L'ON OBSERVE DE NOS JOURS.

L'objectif de ce travail de thèse est de comprendre le rôle de la déglaciation et l'influence de l'évolution géomorphologique de la basse vallée glaciaire de la Romanche sur l'initiation et la localisation des instabilités gravitaires de ses versants rocheux.<br />Une étude multidisciplinaire combinant des données géologiques, morphologiques, géophysiques, et chronologiques a ainsi été menée à deux échelles spatiales différentes : celle de la basse vallée de la Romanche et celle du mouvement de terrain de Séchilienne.<br />La détermination de la fracturation du massif, obtenues par morphologie de surface, indiquent que les caractéristiques lithologiques et structurales sont des facteurs importants dans la localisation et l'initiation des instabilités gravitaires. De plus, le surcreusement glaciaire très important de la vallée, mis en évidence par prospection géophysique, a probablement engendré une modification importante de l'état des contraintes dans le massif rocheux. Cependant, ce processus érosif, associé à la décompression élastique générée par la fonte des glaciers et aux facteurs litho-structuraux, ne semble pas avoir été suffisant pour déclencher des instabilités gravitaires de manière immédiate après le retrait glaciaire. Les données chronologiques obtenues sur l'escarpement sommital de Séchilienne suggèrent en effet que ce mouvement a été déclenché avec un délai d'au moins 5400 ans par rapport au retrait glaciaire, et probablement suite à une modification brusque du climat correspondant à l'optimum climatique de l'Holocène. En particulier, le régime pluviométrique apparaît être un facteur majeur dans l'initiation et dans la dynamique du mouvement de terrain de Séchilienne.

Je présente dans ce manuscrit mes travaux de recherche effectués depuis la thèse. Mes thèmes de recherche sont principalement motivés par des applications en génomique ou post-génomique. Mon domaine de recherche est assez vaste, mais le dénominateur commun de mes travaux est la présence de variables latentes (non observées) dans les modèles étudiés. Mes préoccupations sont majoritairement théoriques : éudes asymptotiques, convergence des estimateurs, vitesses, identifiabilité... Les modèles considérés peuvent être aussi bien paramétriques que semi ou non paramétriques, et les outils statistiques utilisés sont donc relativement variés.<br /><br />Ma présentation s'organise en trois grandes thématiques : les travaux portant sur des séquences, notamment sur la modélisation de leur distribution et des processus d'évolution sous-jacents ; les travaux de statistique semi ou non paramétrique portant sur des signaux observés avec du bruit ; et enfin les travaux (en partie en cours) portant sur les graphes aléatoires.

Durant cette thèse je me suis intéressé à l'évolution profonde du vivant, depuis le dernier ancêtre commun universel (LUCA) jusqu'aux ancêtres des trois grands royaumes, les Archées, les Bactéries et les Eucaryotes. J'ai notamment cherché à placer quelques organismes dans l'arbre de la vie, tels que la bactérie Aquifex aeolicus et l'archée Cenarchaeum symbiosum, et j'ai également étudié l'évolution des températures de croissance il y a plusieurs milliards d'années. Pour ce faire, j'ai développé des algorithmes afin de reconstruire l'évolution de séquences géniques, puis j'ai utilisé ces séquences pour prédire les températures optimales de croissances d'organismes aujourd'hui éteints. Mes collègues et moi-même estimons que LUCA ne vivait pas à très haute température, mais que ses directs descendants les ancêtres des Bactéries et du groupe comprenant les Archées et les Eucaryotes vivaient dans des environnements plus chauds. Cela signifie que les deux lignées venant de LUCA ont subi le même type d'évolution en parallèle, qui pourrait avoir été causée par une seule et même pression de sélection. Cette pression pourrait être le résultat d'un intense bombardement météoritique il y a 3.8 milliards d'années, et avoir été accompagnée d'un changement depuis un génome à ARN pour LUCA vers des génomes à ADN pour ses descendants. Ensuite, dans la lignée des Bactéries, les températures optimales de croissance ont chuté, ce qui pourrait correspondre à l'évolution de la température des océans au cours des 3.5 derniers milliards d'années.

L'approche proposée traduit l'imperfection potentielle des règles en transposant, dans le domaine informatique, le concept de tolérance, classique en ingénierie. Elle s'articule autour d'un prédicat de tolérance qui permet de décider si une instance non conforme est une exception ou une erreur et d'un comportement exceptionnel du système qui assure l'intégration de l'exception et sa gestion ultérieure

Après le recrutement de main-d'œuvre massif au cours des années 1960/1970, le contexte de la migration européenne vers Marseille et les communes alentours change : la libre circulation des personnes à l'intérieur de l'Union Européenne succède aux mouvements de population soutenus par des accords bilatéraux entre la France et l'Espagne, l'Italie et le Portugal. Le profil sociodémographique des migrants évolue également : si, dans les années 1960/1970, ce sont principalement les travailleurs, souvent peu qualifiés, qui sont concernés, les professionnels hautement qualifiés, les personnes non actives et les retraités prennent plus fréquemment part à la migration, indépendamment du regroupement familial. <br />L'objet de ce travail est de montrer dans quelle mesure la diversification de la migration correspond non seulement aux phénomènes extérieurs à l'espace d'arrivée mais aussi à la mutation de l'espace marseillais lui-même. Il s'appuie sur la mesure de cette migration, de 1968 à 2005, au travers de l'analyse des caractéristiques sociodémographiques et de la répartition spatiale des migrants ; il s'attache ainsi à relier l'hétérogénéité du stock de population de l'Union Européenne en 1999 à la nature des vagues migratoires successives et de l'attractivité à laquelle elles semblent répondre. Cette attractivité semble devenir multiple : liée historiquement à l'activité industrielle de l'espace, puis à la présence d'entreprises de haute technologie, elle est maintenant également en partie portée par l'importance accordée par les migrants au cadre et à la qualité de vie.