Made available in DSpace on 2018-08-02T00:00:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_3856_DissertacaoMestradoFabbianoFiorinFerrari.pdf: 1712967 bytes, checksum: 6f74ffe584a475a8284e28507c9c86ba (MD5) Previous issue date: 2011-09-06 / Para atender a crescente demanda por serviços de telecomunicações, com aplicações exigindo cada vez mais das redes de núcleo, as Redes Ópticas de Transporte (OTN Optical Transport Network), baseadas em multiplexação por comprimento de onda (WDM - Wavelength-Division Multiplexing) e no SONET/SDH (Synchronous Optical NETwork/ Synchronous Digital Hierarchy), surgem para prover serviços de transporte óptico mais eficiente. A OTN consolida-se como a nova geração de redes ópticas, cabendo à ITU-T (International Telecommunication Union Telecommunication Section) fornecer a padronização para os fabricantes de equipamentos e soluções de redes de transporte. Uma vez que essas novas tecnologias de redes oferecem maiores possibilidades de tráfego, proteção, restauração, comutação e qualidade de serviço para múltiplos clientes, há um aumento na complexidade da rede como um todo e no modo de gerenciamento desta. Neste cenário, com o objetivo de aprimorar o gerenciamento dessas redes, busca-se a automatização das suas funcionalidades. Nesta dissertação é apresentada uma proposta de arquitetura para o plano de gerência das redes OTN visando integração das funcionalidades de gerência e o plano de transporte. São desenvolvidos mecanismos para a descoberta automática da topologia e recursos da rede, baseando-se nos procedimentos descritos na recomendação ITU-T G.7714 e na IETF RFC4204 (LMP Link Management Protocol). A arquitetura e os procedimentos implementados são validados através de simulação no software OMNeT++, onde um framework de simulação de redes OTN está em desenvolvimento pelo grupo de pesquisa do Laboratório de Telecomunicações (LabTel) na UFES com o objetivo de analisar, testar e validar comportamentos e funcionalidades das redes OTN.

Made available in DSpace on 2018-08-02T00:00:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_3864_DissertacaoMestradoAlvaroChristianMontanoSaavedra.pdf: 7009838 bytes, checksum: decc6252088c647a4e2b7cc401daf7f3 (MD5) Previous issue date: 2011-05-05 / O trabalho apresenta a montagem e modelagem de uma planta formada por uma turbina hidráulica e um gerador síncrono para seu funcionamento como parte de uma Micro Central Hidroelétrica (MCH) para pequenos sistemas isolados. Uma vez feita a montagem da planta, partiu-se para o desenvolvimento de um modelo empírico do processo, na forma de curvas de reação, obtidas utilizando-se a técnica de resposta ao degrau; e que possibilitou a aproximação das variáveis principais envolvidas para um modelo de primeira ordem com tempo morto. Depois de obtidas as funções de transferência da planta, projetou-se um controlador PID com a finalidade de manter a tensão de saída do gerador num valor de referência adequado para a sua distribuição na rede elétrica no sistema isolado. Com a finalidade de validar os resultados obtidos nas simulações, obtiveram-se curvas de resposta do sistema real em laboratório e compararam-se ambas as respostas, dando um resultado satisfatório e muito parecido. Estes resultados servirão como base para futuros estudos nas áreas de controle de velocidade (ou governador de carga) e estabilidade do sistema, entre outros, no campo das MCHs para pequenos sistemas isolados.

Made available in DSpace on 2018-08-02T00:00:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_3869_DissertacaoMestradoCarlosTorturellaValadao.pdf: 3057975 bytes, checksum: acabb1d0b3247239cbe3e279b0e6ea48 (MD5) Previous issue date: 2011-03-25 / Crianças com deficiência física severa têm pouca chance de conseguirem interagir com o mundo e, devido a esta falta d einteração, acabam por criar um conceito de que não são capazes de realizar tarefas sozinhas, ideia esta chamada de "indefesa aprendida". Com esta falta de experiências, pode ocorrer comprometimento na parte de aprendizagem, uma vez que uma boa interação com o ambiente ao redor auxilia muito no processo de aprendizado. No entanto, com o auxílio de robôs, é possível fazer com que haja uma interação com o mundo de uma forma diferente, melhorando sua capacidade de cognição, socialização e, por fim, sua própria auto-estima. Tais elementos são fundamentais para uma melhor qualidade de vida. A grande motivação desta Dissertação de Mestrado é fazer com que essas crianças tenham uma melhor qualidade de vida, e, principalmente, desenvolvimento cognitivo e auto-estima. O sistema desenvolvido permite que a criança manipule de forma mais autônoma robôs, desde que configurados previamente pelo programa. Para fazer tal manipulação a criança utiliza alguns dispositivos auxiliares como sensores de inclinação e sensores mioelétricos, dentre outros dispositivos que podem ser configurados no sistema. Isso faz com que o sistema seja flexível a diversos dispositivos e robôs, bastando apenas fazer as devidas configurações, tanto no dispositivo como no sistema. É esperado que com tal programa as crianças sejam capazes de ter maior interação social, melhoria no quadro cognitivo e auto-estima, tentando, de certa forma, equilibrar os efeitos negativos da deficiência física.

Made available in DSpace on 2018-08-24T22:53:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_7294_dissertação versão final apos correções da banca.pdf: 956936 bytes, checksum: 222abe412411ed3a18e6dc20128e75dd (MD5) Previous issue date: 2013-08-27 / Dados da poluic¸ ao atmosf´erica apresentam, em geral, observac¸ es faltantes. Esta pesquisa apresenta um estudo de metodologias para estimac¸ ao da func¸ ao de autocorrelac¸ ao na presenc¸a de dados faltantes, baseados no trabalho de Yajima e Nishino (1999). Contempla tamb´em algumas t´ecnicas para imputac¸ ao de dados faltantes baseadas no uso do algoritmo EM, proposto por Dempster (1977), e nos modelos de s´eries temporais ARIMA de Box e Jenkins. Ensaios de simulac¸ oes com quatro proporc¸ oes de dados faltantes foram realizadas para comparar os erros quadr´aticos m´edios dos estimadores propostos. O estudo emp´ırico evidenciou que o m´etodo de estimac¸ ao sugerido apresenta bom desempenho em termos de medidas de erro quadr´atico m´edio. Como ilustrac¸ ao da metodologia proposta, duas s´eries temporais de concentrac¸ oes de Material Particulado Inal´avel (PM10) emitida na Regiao da Grande Vit´oria, E.S., Brasil, sao analisadas.

A regulação da expressão gênica é vital para todos os organismos se adaptarem rapidamente às mudanças ambientais. Estes mecanismos adaptativos são altamente complexos e a maioria deles não está completamente esclarecida. O fosfato inorgânico (Pi), um nutriente essencial para todos os organismos, é requerido em importantes processos celulares como a biosíntese de ácidos nucléicos e a sinalização metabólica. O sistema de aquisição de Pi no fungo filamentoso Neurospora crassa inclui pelo menos quatro genes regulatórios: nuc-2, preg, pgov e nuc-1. Em condições limitantes de Pi, NUC- 2, uma proteína com domínio de repetição de anquirina, inibe o funcionamento do complexo PREG-PGOV, ativando assim o fator de transcrição NUC-1 e a expressão de genes envolvidos na captação de fosfato, como fosfatases, fosfato permeases e nucleases. Visando entender a funcionalidade do gene nuc-2 na regulação da expressão gênica em resposta aos níveis de Pi exógeno, foram construídas duas bibliotecas de subtração de cDNA entre as linhagens selvagem St.L.74A e nuc-2A de N. crassa, cultivadas em Pilimitante. Obtivemos 52 transcritos induzidos e 16 reprimidos pela proteína NUC-2. A categorização funcional destas sequências revelou genes envolvidos em diversos processos celulares, como transporte, regulação transcricional, transdução de sinal, metabolismo, síntese protéica e desenvolvimento. Entre os genes modulados negativamente pela proteína NUC-2, foi identificado um gene que codifica a proteína MAK-2 (mitogen-activated protein kinase-2), envolvida em vias de sinalização intracelular. O papel funcional deste gene no monitoramento do Pi extracelular foi avaliado por microarranjos de oligonucleotídeos, comparando as linhagens selvagem e mutante mak-2, cultivadas em baixa concentração de Pi. Foram identificados 4.214 genes regulados pela proteína MAK- 2, dentre eles a ciclina codificada pelo gene preg. Além disto, genes regulados em função da concentração de Pi foram identificados, mostrando o envolvimento de 3.174 transcritos. Os resultados obtidos neste trabalho revelam novos aspectos moleculares envolvidos na adaptação à disponibilidade de Pi extracelular, sugerindo que o gene mak-2 constitui um novo componente da via de sinalização e monitoramento de fosfato em N. crassa. / Gene expression regulation is crucial for all organisms to rapidly adapt to environmental changes. These adaptive mechanisms are highly complex and most of them have not been completely elucidated. The inorganic phosphate (Pi), an essential nutrient for all organisms, is required for important cellular processes, such as nucleic acids biosynthesis and metabolic signaling. The Pi acquisition system in the filamentous fungus Neurospora crassa includes at least four regulatory genes: nuc-2, preg, pgov and nuc-1. Under limiting Pi conditions, NUC-2, an ankyrin-like repeat protein, inhibits the functioning of the PREG-PGOV complex, allowing the activation of the transcription factor NUC-1 and the expression of genes involved in phosphate acquisition, such as phosphatases, phosphate permeases and nucleases. Aiming at a better comprehension of the nuc-2 functionality in gene expression regulation in response to exogenous Pi levels, two cDNA subtraction libraries were constructed comparing N. crassa wild type St.L.74A and nuc-2A strains, grown under Pi starvation. We obtained 52 NUC-2 up- and 16 downregulated genes. Functional categorization of these sequences revealed genes involved in several cellular processes, such as cellular transport, transcriptional regulation, metabolism, protein synthesis and development. Among the NUC-2 negatively modulated genes, we identified the MAK-2 (mitogen-activated protein kinase-2) protein coding gene, involved in the intracellular signaling pathway. The functional role of this gene in the extracellular Pi sensing was evaluated by oligonucleotide microarrays, comparing wild type and mak-2 strains responses under Pi starvation. We identified 4.214 MAK-2 regulated genes, among them the cyclin coding gene, preg. Furthermore, 3.174 genes regulated in response to Pi levels were identified. In a nutshell, the results obtained in this work reveal novel molecular aspects of the adaptation to extracellular Pi availability, suggesting that the mak-2 gene constitutes a novel component of the N. crassa phosphate sensing and signaling pathway.

Le travail de ma thèse porte sur l’étude des protéines chaperonnes des acides nucléiques chez le virus de l’immunodéficience humaine VIH-1.Ces protéines sont au nombre de trois : Tat, Vif et la Nucléocapside. Je me suis concentrée sur les deux dernières citées : Vif, dont j’ai réalisé une étude structurale et fonctionnelle en partant du gène, j’ai réussi à produire et purifier la protéine, que je l’ai caractérisée par des méthodes structurales comme la diffusion de lumière et le dichroïsme circulaire. J’ai étudié les interactions de cette protéine avec les acides nucléiques par spectroscopie de fluorescence et Résonance Magnétique Nucléaire (RMN). Et finalement j’ai participé aux tests d’activités chaperonnes. Pour la nucléocapside, qui est une protéine déjà connue au sein du laboratoire, j’ai examiné son rôle de protéine chaperonne lors de l’initiation de la transcription inverse. J’ai mis en évidence par RMN une interaction très controversée entre l’ARN génomique virale et l’ARNtLys3 qui joue le rôle d’amorce pour l’initiation de la transcription inverse. / Pas de résumé en anglais

Les nouvelles normes de régulation Solvabilité 2 ont un impact très important sur l'assurance crédit. L'objectif de cette directive est que les compagnies d'assurance mesurent mieux les différents risques auxquels elles font face, afin qu'elles constituent suffisamment de capital pour faire face à des situations de crise. Notre travail se concentre sur une activité d'assurance assez particulière : l'assurance de crédit. Dans le cadre de Solvabilité 2, majoritairement, les assureurs de crédit s'orienteront vers le développement de modèles internes, afin d'avoir une meilleure estimation de leurs exigences en capital. Notre étude a pour objectif de proposer, ou de donner des pistes d'amélioration d'un type de modèle interne. Nous présentons tout d'abord de manière générale, ce qu'est le métier d'assureur crédit et nous aborderons ensuite le sujet d'un modèle interne. Nous présenterons alors celui que l'on aura choisi d'utiliser, un modèle multifacteurs associé à l'approche Merton. Nous comparerons également les méthodes d'intégration des corrélations entre contreparties des normes Solvabilité 2 avec celle du modèle interne. Nous essaierons ensuite d'affiner le modèle interne afin de tenir compte d'une caractéristique importante de l'assurance crédit : la gestion des garanties (limites), qui comme nous le verrons induit une baisse des exigences en capital. Pour cela, nous introduirons la prise en compte de cycles de crédit pour le calcul de pertes, un modèle non plus mono-périodique, comme c'est habituellement le cas, mais à deux périodes. Nous présenterons ensuite les résultats obtenus à l'aide de ce modèle. Nous exposerons alors une approche alternative en la méthode d'approximation linéaire par morceaux via des simulations de Monte Carlo (PLMC). Il s'agit ici de passer d'un modèle discret à un modèle continu. Nous comparerons ensuite les structures de dépendance Gaussienne et de Student afin de voir ce que le changement de cette structure induirait pour les exigences en capital. Nous nous intéresserons finalement au problème de la recherche de quantiles élevés, et des études de convergence de nos variables. Pour cela, nous introduirons tout d'abord la mesure du prix de marché du risque, et nous présenterons une estimation de ce prix de marché du risque, plus spécifiquement pour le risque de taux. Ceci nous permettra d'obtenir la dynamique des taux en univers risque neutre. Nous aborderons ensuite la question du calcul de Best Estimate, dans un cadre de dépendance entre les risques de taux et de crédit. Le calcul du SCR suivra. Nous discuterons d'une approche alternative permettant le calcul de l'exigence en capital, approche propre aux modèles structurels et qui permettrait de se passer de simulations pour ce calcul. Finalement, nous conclurons notre étude en exposant les différents enjeux de cette thèse ainsi que les contributions apportées, et les problématiques rencontrées au cours des travaux / -

Trabajo de Investigación Requisito para optar al Título de Cirujano Dentista / Introducción: Diabetes Mellitus tipo 2 (DM2) es una enfermedad que afecta el metabolismo de los carbohidratos. Su descompensación metabólica, medida con el test de hemoglobina glicosilada (HbA1c≥7%), se traduce en complicaciones sistémicas y orales, como enfermedad periodontal y disminución del flujo salival. Esto último, no necesariamente se relaciona al padecimiento de xerostomía (sensación de boca seca), altamente asociada en diabéticos, por lo que esta sensación podría estar determinada por otros factores que pueden alterarse según control metabólico en diabetes, como pH salival, concentración de proteínas salivales y consumo de fármacos antihipertensivos. No existe suficiente evidencia que compare estos parámetros entre sujetos con DM2 compensados y descompensados, por lo que el objetivo de este trabajo es comparar la prevalencia de xerostomía entre sujetos diabéticos compensados y descompensados metabólicamente y relacionar este parámetro con diferencias en la velocidad de flujo salival, concentración de proteínas salivales, pH salival y consumo de fármacos antihipertensivos. Material y métodos: De la Asociación de Diabetes de Chile, se reclutaron 50 sujetos DM2, compensados (HbA1c<7%) y descompensados (Hba1c≥7%). Se determinó xerostomía, pH salival, concentración de proteínas en saliva (PP) y velocidad de flujo salival (VFS) y se describió el consumo de fármacos antihipertensivos según lo encontrado en fichas clínicas. Para comparar pH, VFS, PP entre xerostómicos y no xerostómicos y entre DM2 compensados y no compensados, se utilizaron las pruebas t-Student y Mann-Withney. Para asociar el padecimiento de HTA y el consumo de fármacos antihipertensivos con xerostomía se utilizó chi cuadrado, considerándose una significancia del 95% (p<0,05). Resultados: De la muestra, 25 sujetos eran compensados y 25 descompensados. 13 (26%) eran hombres y 37 (74%) mujeres. La prevalencia de xerostomía fue mayor en descompensados, sin embargo esta diferencia no fue estadística. Sujetos DM2 descompensados presentaron menor pH (7.47), menor VFS (0.54 ml/min) y mayor PP (35.41 µg/ml) en comparación con DM compensados (pH=7.74, VFS=0,64 ml/min, PP=31.79 µg/ml), siendo la diferencia de pH, la única estadística (p<0,05). No hubo relación entre consumo de fármacos antihipertensivos y xerostomía. Conclusión: Xerostomía se presentó en sujetos con DM2 compensados y descompensados. Si bien, hubo diferencias al comparar pH salival entre estos grupos, ni ésta ni las otras variables estudiadas, se relacionaron con xerostomía, dando cuenta de la multifactorialidad de este fenómeno. / Adscrito a Proyecto FIOUCH 13-002

Ces travaux de thèse ont pour but de synthétiser des squelettes ladderanes en une seule étape de photocycloaddition [2+2] multiple. Le produit naturel acide pentacycloanammoxique est la molécule visée au terme de ce projet. Dans une première partie, nous avons développé une méthode originale de photocycloaddition [2+2] intramoléculaire à partir de précurseurs polyéniques soufrés. Ainsi, quatre types de composés cycliques ont été obtenus et caractérisés. Cette méthodologie a été appliquée à des composés mono, di et triènes, sulfures et sulfone, par irradiation au sein d’un photoréacteur Rayonet, ou dans des conditions plus douces avec des LED bleues. Différentes stratégies ont été testées dans le but de former des ladderanes, comme la modification des extrémités des chaînes polyéniques, les catalyses au cuivre (I) et photoredox, ou encore la photosensibilisation, mais aucune n’a permis la formation de plus d’un cyclobutane. La technique de l’encapsulation supramoléculaire au sein de cavités cyclodextrines et cucurbituriles a permis de préparer quantitativement un composé cyclobutanique de configuration syn-trans-syn sur petite échelle. Ce résultat étudié en photochimie de flux, représente une perspective encourageante pour la synthèse de ladderanes. Nous avons également étudié la synthèse d’un modèle de métabolite de l’acide pentacycloanammoxique, qui représenterait un étalon analytique. Dans ce contexte, une cétone tricyclique a été dans un premier temps préparée en sept étapes avec un rendement de 67% par le biais de la cycloisomérisation catalysée au platine (II) d’un précurseur énynylester. Puis l’intermédiaire alcool le plus avancé de la synthèse a été obtenu après six étapes supplémentaires avec un rendement de 7,4%. Enfin, une méthodologie de synthèse a été développée autour de l’intermédiaire cétone tricyclique de structure originale, permettant des transformations hautement régio et diastéréosélectives. Des réactions d’additions nucléophiles ou d’extensions de cycles telles que l’homologation de Bayer-Villiger ou le réarrangement de Beckmann ont été étudiées. / The aim of this PhD work was to synthesize ladderane skeletons in one multiple [2+2] photocycloaddition step. The natural product pentacycloanammoxic acid is the target molecule of the project. In a first part, we developped an original method of intramolecular [2+2] photocycloaddition from sulfide polyenic precursors. Thus, four kind of cyclic compounds were obtained and characterized. This metodology has been applied to mono, di, and triene compounds, either sulfide or sulfone, by irradiation in a Rayonet photoreactor or in milder conditions with blue LEDs. Different strategies have been tested in order to create ladderanes, such as modification of polyene chain end, copper(I) and photoredox catalysis, or photosensitization, but none allowed the formation of more than one cyclobutane. Supramolecular encapsulation in cyclodextrins and cucurbiturils have provided quantitatively cyclobutane compound with syn-trans-syn configuration on small scale. This result studied in flow photochemistry is an encouraging perspective for ladderane preparation. We have also studied the synthesis of a pentacycloanammoxic acid metabolite model. In this context, a tricyclic ketone has been prepared first in seven steps with a gobal yield of 67%, based on a platinum(II) catalysed cycloisomerization as a key step. Then, the most advanced alcohol intermediaite has been obtained after six more steps in a 7.4% yield. Finally, a synthesis methodology has been developped around the tricyclic ketone intermediaite, of novel structure, allowing highly regio and diastereoselective transformations. Nucleophilic additions or ring expansion reactions such as Bayer-Villiger homologation or Beckmann rearrangement have been studied.

Le paludisme est une maladie tropicale due au parasite P. falciparum. Avec le grand nombre de victimes qui lui sont imputées chaque année, cette maladie demeure la plus grande parasitose tropicale et il est primordial de la combattre. Ce combat passe aussi bien par la sensibilisation des populations que par la recherche. Plusieurs échecs thérapeutiques, dus à la résistance du parasite aux médicaments déjà disponibles, sont recensés. L’émergence de cette résistance pousse la recherche à identifier de nouvelles molécules antipaludiques. Ces travaux de thèse s'inscrivent dans le cadre d'une meilleure connaissance de la biologie du parasite dans le but d'identifier de nouvelles cibles thérapeutiques et de déterminer de nouvelles stratégies antipaludiques. Les protéines kinases, dont la protéine kinase A (PKA), sont connues pour avoir des rôles clé dans la régulation du cycle cellulaire. La régulation spatiale et temporelle de la PKA est assurée par des protéines d'ancrage appelées AKAP (A Kinase Anchoring Protéines). Nous avons identifié par homologie de séquences la première protéine AKAP putative chez P. falciparum (PfAKAP). Associant des études de biologie moléculaire (RT-PCR, interruption génique), de biologie cellulaire (immunofluorescence), de biochimie (« pull-down », « peptide array »), et de protéomique (spectrométrie de masse), nous avons caractérisé la PfAKAP. Cette protéine, majoritairement exprimée aux stades matures du développement érythrocytaire, semble importante pour le développement du parasite mais n'interagit pas directement avec la PKA du parasite. Elle fait intervenir des partenaires protéiques tels que la protéine Pf14-3-3I. En effet, la Pf14-3-3I pourrait être un substrat de la PfPKA et cependant jouer un rôle dans sa localisation. Par ailleurs, comme son proche homologue humain l’AKAP18, la PfAKAP interagit avec les nucléotides comme l’AMP et l’AMPc. Cela suggère entre autres que cette protéine peut interagir avec la voie de l'AMPK ou avec celle des phosphodiestérases chez le parasite. Nos premiers résultats sont encourageants et révèlent l’importance de la PfAKAP pour le développement parasitaire. Des recherches complémentaires permettront à l'avenir de développer et concevoir des nouvelles stratégies thérapeutiques comme celle des peptides interférents. / Pas de résumé