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MODELAGEM DA DISTRIBUIÇÃO DE DIÂMETROS EM POVOAMENTOS DE PARICÁ SOB DIFERENTES ESPAÇAMENTOSARAGAO, M. A. 19 February 2018 (has links)
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Previous issue date: 2018-02-19 / O conhecimento a respeito do crescimento da árvore e da produção florestal, assim como as estimativas dessas variáveis, são essenciais para viabilizar o planejamento, gerenciamento e controle de uma floresta. A modelagem da distribuição de diâmetros é amplamente utilizada para esse fim, que além de permitir a descrição atual do povoamento, permite a projeção da produção e auxiliam na tomada de decisão. Dessa forma, esse trabalho tem como objetivo propor um sistema de projeção da distribuição de diâmetros para povoamentos de Schizolobium parahyba var. amazonicum (Huber ex Ducke) Barneby (paricá) sob diferentes espaçamentos. Os dados utilizados nessa pesquisa foram provenientes de povoamentos homogêneos de paricá, localizados no estado do Pará, plantados sob os espaçamentos 3x2, 3x3, 3x4, 4x4 e 5x5 m. Ajustou-se as funções Weibull 2 e 3 parâmetros, Weibull 2 parâmetros com parâmetro de locação fixo no DAP mínimo, Weibull 3 parâmetros truncada à direita, Hiperbólica 2 e 3 parâmetros, Log-logística 2 e 3 parâmetros e Logística-generalizada. Após o ajuste das fdps, foi aplicado o teste de Kolmogorov-Smirnov para a avaliação da aderências aos dados, a 5% de significância, assim como a análise gráfica dos dados observados e estimados. As funções avaliadas obtiveram aderência aos dados observados superior a 98 %, e de acordo análise gráfica descreveu com eficiência os dados de campo nos cinco espaçamentos estudados, indicando que todas podem ser empregadas para a modelagem da distribuição de diâmetros de paricá. Na projeção dos diâmetros utilizou-se a função Weibull para a recuperação dos parâmetros por ser flexível e de fácil utilização. Foram ajustados sete modelos de regressão, para cada um dos espaçamentos. Os modelos foram avaliados por meio do coeficiente de determinação ajustado ( ), viés (V%) e da raiz do quadrado médio do erro (RQME%). O parâmetro de forma não apresentou boa estimativa, principalmente para os espaçamentos 3x4 e 5x5 m. Foi possível obter sistemas de equações para a projeção dos parâmetros das funções em quatro dos espaçamentos estudados, exceto para o espaçamento 5x5 m.
Palavras-chave: Função Densidade de Probabilidade, Prognose, Schizolobium parahyba var. amazonicum
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ANÁLISE DE RISCO DE INCÊNDIOS EM FLORESTAS PLANTADASEUGENIO, F. C. 02 June 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-06-02 / Nos casos em que a prevenção não é suficiente para evitar a deflagração de um incêndio florestal, a rápida detecção do mesmo constitui fator decisivo para minimizar os possíveis danos provocados pelo fogo, bem como a redução dos custos associadas ao seu combate. Mediante tal contexto,com esta pesquisa objetivou-sedesenvolvimento de um modelo de risco baseado em banco de dados e avaliar, juntamente com outras três metodologias de riscos de incêndios florestais, a que melhor representa os incêndios florestais em áreas de florestas plantadas na costa centro-norte do estado do Espírito Santo e costa sul da Bahia, contemplando as seguintes etapas metodológicas: a) Determinação das áreas com clima homogêneo; b) Estatística dos incêndios florestais; c) Cálculo e espacialização dos índices de risco de incêndios florestais: Fire Weather Index (FWI); Fórmula de Monte Alegre Alterada (FMA+) e Risco de Fogo do Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais (RF); d) desenvolver um modelo para cálculo do risco de incêndios florestais baseado em banco de dados(RIF-Database); e, f) Escolhados modelos de riscos, a partir dos incêndios florestais catalogados pela empresa FIBRIA Celulose S.A.A metodologia adotada mostrou-se eficiente para o agrupamento de estações meteorológicas em três subzonas climáticas homogêneas para a área de estudo.Os resultados evidenciam que há duas épocas de ocorrência de incêndios florestais na área estudada, sendo que para a primeira época, a subzona 1é de dezembro a março, para a subzona 2 é de janeiro a março, e para a subzona 3 está nos meses de janeiro e fevereiro. A segunda época, para todas as subzonas, é entre os meses de agosto a outubro. O modelo FWI apresentou os melhores resultados para a subzona 1, o modelo RIF-Database apresentou resultados excelentes, é o recomendado para as subzonas 2 e 3. O modelo FWI é visto como o modelo mais próspero para a área de estudo, uma vez que, encontrou valores superiores, para uma subzona, ao modelo desenvolvido por meio da base de dados da área de estudo, entretanto, será necessário um estudo para a calibração dos seus parâmetros.
Palavras-chave: FMA+; FWI; Geotecnologias; Proteção florestal; RF; RIF-Database Risco de incêndio.
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Efeito de níveis de ferro e radiação ultravioleta no crescimento e produção de microcistina em Microcystis aeruginosa Kützing - NPLJ-4.LAZARO, G. C. S. 25 June 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-06-25 / A presente pesquisa teve como objetivo simular e avaliar os impactos de variáveis ambientais (ferro e UV-C) sobre o crescimento e produção de MCY de M.aeruginosa (NPLJ-4). Para tanto, tal cepa foi cultivada sob condições controladas.
No ensaio do ferro, não houve diferença significativa de densidade, biovolume e clorofila-a entre as diferentes concentrações de ferro, enquanto que taxa de crescimento, tempo de duplicação e concentração de toxina apresentaram tal diferença. Foram observadas mais divisões celulares (G) a uma menor taxa nas culturas com maior teor de Fe, causando aumento de densidade e biomassa (viceversa).
As divisões reduziram-se a uma taxa maior até que o Fe ficasse escasso (10,4, 1 e 0,5 μM, respectivamente). Culturas com 0,5 μM registraram: maior taxa,menor tempo de duplicação, menor densidade e biovolume. Quanto a toxina, células da fase log (6º ao 14º dia) e estacionária (16º ao 35º dia) influenciaram nos altos valores de MCY-LR total das culturas com Fe. Os teores aumentaram do 10º para o 20º dia e caíram no 30º dia nas culturas com 4 e 10 μM Fe. Ademais, o tratamento com 1 μM Fe obteve maior densidade, biovolume, picos de maior área e maiores concentrações de MCY-LR total em relação as culturas com 0,5, 4, e 10 μM Fe,respectivamente. Assim, o crescimento de MA nem sempre está atrelado aos maiores níveis de Fe e uma única célula pode ser responsável por produção de
grande quantidade de toxina. Já no experimento de simulação de exposição à radiação UV-C, obteve-se remoção completa da MCY-LR total em meio ASM-1 com floração de M. aeruginosa, sendo que mais que 50% da toxina foi degradada nas 2 primeiras horas de exposição. Os valores de MCY-LR total, densidade, biovolume e clorofila-a declinaram à medida que o tempo de exposição à UV-C aumentava.
Ademais, não ocorreu produção de microcistina LA e RR em nenhum dos
experimentos.
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ANÁLISE DA INFLUÊNCIA DO ESCOAMENTO NO INTERIOR DE UMA CÂMARA DE FLUXO DINÂMICA NA TAXA DE EMISSÃO DE SULFETO DE HIDROGÊNIOANDREAO, W. L. 30 March 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-03-30 / O processo de tratamento de efluentes domésticos leva à formação de compostos odorantes, como o sulfeto de hidrogênio (H2S), que pode causar incômodo e impactos à saúde dos residentes próximos. A câmara de fluxo dinâmica é largamente utilizada para estimar a emissão dos gases odorantes a partir de superfícies líquidas quiescentes, presentes nas estações de tratamento de esgoto. A geometria da câmara deve promover uma completa mistura do gás volatilizado em seu interior para que a emissão medida seja independente do ponto de amostragem. Um dispositivo auxiliar, como um micro ventilador, é comumente utilizado para esse fim. O presente estudo investigou a influência do escoamento no interior da câmara sobre o transporte de H2S e sua taxa de emissão. A modelagem matemática desses fenômenos foi efetuada por meio da solução numérica das equações de transporte considerando o escoamento turbulento, utilizando o código ANSYS-CFX 14.5. Os resultados mostram que uma câmara de fluxo com oito entradas de ar promove uma distribuição mais homogênea da concentração, porém a velocidade de fricção na interface (0,007 m s-1) não é suficiente para promover um varrimento adequado da interface, onde são encontrados valores elevados de concentração. Já na configuração padrão (modelo US EPA), com quatro entradas, o fluxo de ar limpo pode atingir a sonda de amostragem, afetando o valor medido de concentração. Se micro ventiladores são utilizados, a turbulência criada dentro da câmara e a velocidade de fricção são significativamente maiores. A concentração rapidamente atinge o estado estacionário dentro da câmara (1 a 2 min) e a taxa de emissão final é, em média, 25,3% maior com o uso dos micro ventiladores. Se o objetivo do uso da câmara é representar as condições ambientais que seriam encontradas em campo, é recomendado o uso de micro ventiladores.
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Modulação da apoptose de neutrófilos humanos em cultura pela galangina e 6,7-diidroxi-3-[3\',4\'-metilenodioxifenil]-cumarina / Modulation of apoptosis of cultured human neutrophils by galangin and 6,7-dihydroxy-3-[3\',4\'-methylenedioxyphenyl]-coumarinCamila Andresa Carvalho 06 November 2015 (has links)
Os neutrófilos são os leucócitos mais abundantes na circulação sanguínea, sendo recrutados rapidamente para os locais de infecção e inflamação. Em condições fisiológicas, os neutrófilos circulantes possuem tempo de vida curto, de cerca de 6 a 8 horas, mas a sua sobrevida pode aumentar em condições inflamatórias. O papel dos neutrófilos em diversas doenças foi negligenciado por muito tempo, em parte devido àsdificuldades em seu estudo e manipulação, pois os mesmos são facilmente ativados e difíceis de serem mantidos em cultura. Nos últimos anos, o advento de novas técnicas e o aprimoramento de condições laboratoriais têm possibilitado uma investigação mais ampla da fisiopatologia dos neutrófilos e revelado a diversidade de funções e interações dessas células. Para dar continuidade aos estudos visando o entendimento de como as funções efetoras dos neutrófilos podem ser moduladas por produtos naturais e sintéticos, e a aplicação desse conhecimento no tratamento de patologias nas quais tais leucócitos participam, o presente trabalho estabeleceu, primeiramente, as condições experimentais para a cultura de neutrófilos humanos. As células mantiveram-se viáveis e em estado de repouso por até 24 horas, tanto em solução balanceada de Hank\'s quanto em meio RPMI. A funcionalidade dos neutrófilos foi avaliada através da sua capacidade de produzir espécies reativas de oxigênio (ERO), medida por quimioluminescência dependente de luminol (QLlum). Diferentemente do meio RPMI, a solução balanceada de Hank\'s não interferiu no ensaio de QLlum, possibilitando a análise da funcionalidade das células. Durante o período de cultura celular de 24 horas, os neutrófilos mantiveram a sua capacidade de produzir ERO em quantidades suficientes para serem detectadas e permitirem a avaliação do efeito inibitório de substâncias antioxidantes. Em seguida, este trabalho avaliou o efeito de dois antioxidantes - a 3-fenilcumarina 6,7-diidroxi-3-(3\',4\'-metilenodioxifenil)-cumarina (C13) e o flavonol galangina - na produção de ERO pelos neutrófilos. Ambas as substâncias inibiram esta função efetora dos neutrófilos durante todo o período de cultura analisado, indicando que as mesmas não foram degradadas a ponto de perderem a sua atividade antioxidante. As condições de cultura padronizadas possibilitaram também a avaliação do efeito da galangina e da C13 na viabilidade celular. Na maior concentração analisada (20 ?M), ambas as substâncias não alteraram a porcentagem de células viáveis (aproximadamente 80%), mas modularam os estágios de sobrevivência dos neutrófilos, reduzindo a porcentagem de células em apoptose e aumentando a porcentagem de células em necrose, principalmente após 18 horas de cultura. Portanto, a solução balanceada de Hank´s é adequada para manter neutrófilos humanos em cultura por até 24 horas, possibilitando a avaliação do efeito de substâncias antioxidantes na produção de ERO por estas células e na sua viabilidade. / Neutrophils are the most abundant leukocytes in blood, which are rapidly recruited to sites of infection and inflammation. Circulating neutrophils have a short lifetime of about 6 to 8 hours under physiological conditions, but their survival can be increased under inflammatory conditions. The role that neutrophils play in various diseases was long neglected, partially due to the difficulties to study and manipulate these cells, which are easy to activate and hard to maintain in culture. In recent years, the development of new techniques and improvement of laboratory conditions have broadened the investigation of neutrophil physiopathology and revealed the variety of functions and interactions of these cells. To continue the studies to understand how the effector functions of neutrophils can be modulated by natural and synthetic products, and to apply such knowledge to treat diseases in which these leukocytes participate, the first part of the present work established the experimental conditions to culture human neutrophils. Cells cultured in either Hank\'s balanced solution or RPMI medium remained viable and in the resting state for up to 24 hours. Neutrophil functionality was evaluated through its ability to produce reactive oxygen species (ROS), assessed by the luminol-enhanced chemiluminescence assay (CL-lum). In contrast to RPMI medium, Hank\'s balanced solution did not interfere in the CL-lum assay and thereby allowed analysis of neutrophil functionality. During the 24-hour cell culture period, neutrophils maintained their capacity to produce ROS in detectable amounts that were sufficient to assess the inhibitory effect of antioxidant compounds. Next, this work examined the effect of two antioxidants - the 3-phenylcoumarin 6,7-dihydroxy-3-[3\',4\'-methylenedioxyphenyl]-coumarin (C13) and the flavonol galangin - on ROS production by neutrophils. Both compounds suppressed this effector function of neutrophils during the whole culture period studied, indicating that they were not degraded to the point of losing their antioxidant activity. The standardized culture conditions also allowed assessing whether galangin and C13 affected cell viability. At the highest concentration tested (20 ?M), both compounds did not alter the cell viability percentage (around 80%) but modulated the neutrophil survival stages by reducing the percentage of apoptotic cells and increasing the percentage of necrotic cells, particularly after 18 hours of culture. Therefore, Hank\'s balanced solution is suitable to culture human neutrophils for up to 24 hours, and enables to assess the effect of antioxidant compounds on neutrophil ROS production and viability.
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Detecção de auto-anticorpos anti-desmogleína 1 e 3 na saliva e soro de pacintes portadores de pênfigode Andrade Lima Arcoverde, Camila 31 January 2010 (has links)
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Previous issue date: 2010 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O pênfigo é um grupo de doenças muco-cutâneas, de origem auto-imune, relacionado à
produção de anticorpos contra importantes componentes da adesão celular, as desmogleínas.
Estas patologias são caracterizadas pela formação de bolhas intra-epiteliais que podem acometer
a pele e membranas mucosas. O pênfigo vulgar e o pênfigo foliáceo são os subtipos mais comuns
deste grupo, e, apesar de raros, têm sua importância devido à alta taxa de mortalidade quando
não tratados. O teste ELISA tem sido bastante utilizado para diagnóstico sorológico destas
doenças, mas pouco se sabe sobre sua eficácia quando da utilização da saliva como material
biológico. O objetivo deste estudo foi avaliar a presença de auto-anticorpos IgG antidesmogleína
1 e 3 na saliva de pacientes com pênfigo e comparar com sua presença no soro.
Também foram investigadas associações entre a presença sérica dos auto-anticorpos e a atividade
das lesões e a influência do tratamento sistêmico. O grupo estudado foi composto por 24
pacientes, dos quais 19 eram portadores de pênfigo vulgar e 5 de pênfigo foliáceo. Destes
pacientes foram colhidas amostras de sangue e saliva que foram processadas e realizado o teste
ELISA. Como resultado obteve-se que 8,3% das amostras de saliva reagiram positivamente para
as desmogleínas estudadas, o que se mostrou estatisticamente significante (p<0,05). No entanto,
não foi percebida relação entre a presença sérica destas e a existência de lesões ativas, a terapia
medicamentosa também pareceu não ter influência sobre presença dos auto-anticorpos no soro
(p>0,05). Pode-se concluir que as desmogleínas 1 e 3 estão presentes na saliva dos pacientes com
pênfigo
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Structure and function of the myelin enzyme 2′,3′-cyclic nucleotide 3′-phosphodiesteraseMyllykoski, M. (Matti) 27 May 2013 (has links)
Abstract
The myelin sheath is a crucial component of vertebrate nervous systems. Myelin is formed as the plasma membrane of a glial cell is wrapped around a neuronal axon. The presence of myelin enables the fast transmission of neuronal impulses, and degradation or dysfunction of myelin results in severe neurological symptoms. Molecular composition of myelin is unique, and many myelin proteins are not present elsewhere in the body. A myelin enzyme, 2′,3′-cyclic nucleotide 3′-phosphodiesterase (CNPase), is found in specific regions within the myelin sheath and is one of the most abundant proteins in the brain. Substrates for CNPase catalytic activity are formed during brain damage. CNPase also interacts with the cytoskeleton and cell membranes, and it is thought to play a role during myelin formation. Mice that lack CNPase suffer from axonal degeneration and die early.
The aim of this study was to characterise CNPase structure and function. To this end, a system was first developed to produce the protein for subsequent analyses. The aim was to characterise the catalytic mechanism of CNPase by determining its three-dimensional molecular structure at different stages of the catalytic reaction. The interactions between CNPase and other molecules related to its function would also be characterised. Finally, the structure of the full-length protein would be used to understand of the function of the uncharacterised N-terminal domain.
Using X-ray crystallography, the structure of the CNPase catalytic domain was determined in the presence of substrate and product molecules. These data, complemented with analyses of mutationally inactivated enzyme variants, were used to examine the catalytic reaction at the molecular level. The catalytic domain structure was compared to homologous enzymes from diverse organisms. The interaction between CNPase and the calcium-sensing protein calmodulin was characterised. The solution structure of full-length CNPase was determined using small-angle X-ray scattering, and protein sequence databases were utilised to determine CNPase conservation during animal evolution.
The results provide novel information on the catalytic activity and overall function of CNPase. Further studies will be necessary to determine its specific role, but it is increasingly clear that CNPase can perform multiple important tasks within the nervous system. / Tiivistelmä
Myeliinituppi on tärkeä osa selkärankaisten hermostoa. Myeliiniä muodostuu, kun gliasolun solukalvo kiertyy hermosolun aksonin ympärille. Myeliini mahdollistaa hermoimpulssien nopean välityksen, ja sen tuhoutuminen ja vajaatoiminta aiheuttavat vakavia neurologisia oireita. Myeliinin molekyylikoostumus on ainutlaatuinen, ja monet myeliiniproteiineista eivät esiinny muualla elimistössä. Myeliinissä esiintyvää entsyymiä, 2′,3′-syklisten nukleotidien 3′-fosfodiesteraasia (CNPaasi), esiintyy runsaasti tietyillä myeliinialueilla, ja se on yksi aivojen runsaslukuisimmista proteiineista. Substraatteja CNPaasin katalyyttiselle aktiivisuudelle muodostuu aivovaurion aikana. CNPaasi on myös vuorovaikutuksessa solun tukirangan ja solukalvon kanssa, ja sen uskotaan vaikuttavan myeliinin muodostumiseen. Hiiret, joilta puuttuu CNPaasi, kärsivät aksonien rappeumista ja kuolevat ennenaikaisesti.
Tämän tutkimuksen tavoite oli karakterisoida CNPaasin rakennetta ja toimintaa. Tätä tarkoitusta varten ensin kehitettiin menetelmä analysoitavan proteiinin tuottamiseksi. Tavoitteena oli karakterisoida CNPaasin katalyyttinen mekanismi määrittämällä sen kolmiulotteinen molekyylirakenne katalyysireaktion eri vaiheissa. Myös CNPaasin vuorovaikutuksia sen toimintaan liittyvien molekyylien kanssa tutkittiin. Lopuksi kokopitkän proteiinin rakenteen avulla selvitettiin karakterisoimattoman aminoterminaalisen alayksikön toimintaa.
CNPaasin katalyyttisen alayksikön rakenne määritettiin käyttäen röntgenkristallografiaa substraatti- ja tuotemolekyylien läsnäollessa. Rakennetta, täydennettynä mutaatioilla inaktivoitujen entsyymimuunnosten analyysillä, käytettiin katalyyttisen reaktion molekyylitason karakterisointiin. Katalyyttisen alayksikön rakennetta verrattiin eri organismeissa esiintyviin homologisiin entsyymeihin. CNPaasin ja kalsiumia sitovan kalmoduliinin vuorovaikutusta karakterisoitiin. Kokopitkän CNPaasin liuosrakenne selvitettiin pienkulmaröntgensironnan avulla, ja CNPaasin sekvenssin säilymistä eläinten evoluution aikana tarkasteltiin proteiinisekvenssitietokantoja käyttämällä.
Tulokset antavat uutta tietoa CNPaasin katalyyttisestä aktiivisuudesta ja tämän arvoituksellisen entsyymin toiminnasta. Jatkotutkimukset ovat tarpeen sen täsmällisen roolin selvittämiseksi, mutta on kasvavassa määrin selvää, että CNPaasi pystyy suorittamaan useita tärkeitä tehtäviä hermostossa.
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ACAD64_FBunton, Kate, Story, Brad January 2014 (has links)
The Arizona Child Acoustic Database consists of longitudinal audio recordings from a group of children over a critical period of growth and development (ages 2-7 years). The goal of this database is to 1) document acoustic changes in speech production that may be related to physical growth 2) inform development of a model of speech production for child talkers. This work was funded by NSF BSC-1145011 awarded to Kate Bunton, Ph.D. and Brad Story, Ph.D, Principal Investigators.
This database contains longitudinal audio recordings of 55 American English speaking children between the ages of 2-7 at 3-month intervals. Since children began the study at different ages, some children have fewer recording sessions than others. The database can also be used to provide cross-sectional data for children of a specific age. Please refer to the subject data table for information on specific sessions available here http://arizona.openrepository.com/arizona/handle/10150/316065.
All children were recorded using the same protocol; therefore, task numbers are consistent across children and sessions. A calibration tone is included as Record 1 for all sessions. The speech protocol focused on production of English monopthong and diphthong vowels in isolation, sVd, hVd, and monosyllabic real words. In addition, the protocol includes several nonsense vowel-to-vowel transitions. Speakers were prompted either verbally by investigators or by graphical prompts. Details of the protocol with reference to task numbers can be found in the protocol spreadsheet available here http://arizona.openrepository.com/arizona/handle/10150/316065.
Details on data recording:
All samples were recorded digitally using an AKG SE 300B microphone with a mouth to mic distance of approximately 10 inches. Signals were recorded digitally using a Marantz PMD671, 16 bit PCM (uncompressed) at 44.1KHz. Recordings are made available in .wav format. Individual zip files contain all recordings from a single session.
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Generationsskiften i fåmansföretag - skattemässiga förutsättningar enligt 3:12-reglerna. / Generational shifts in closely held companies - Tax conditions under the 3:12 rules.Edin Normark, Julia January 2018 (has links)
No description available.
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Characterisation of the Campylobacter jejuni PEB3 and GlpTCantu, Deborah January 2016 (has links)
The pathogen C. jejuni is now recognised as the leading cause of bacterial foodborne enteritis in the industrial world. The yearly estimate for Campylobacter infections in the United States alone is 2.4 million people or 1% of the population. Illness caused by C. jejuni is self-limiting, however, some individuals develop complications resulting in autoimmune responses. Despite being a major health burden, the pathogenic process is not fully understood. One aspect of importance is the ability of C. jejuni to adhere to glycosaminoglycans (GAGs), such as heparin. GAGs, sulphated carbohydrates expressed on or in host cells, can serve as receptors for bacterial proteins. In the first study, five heparin-binding proteins of C. jejuni NCTC 11168H were identified. For PEB3 (Cj0289c), this work showed that native wild-type PEB3 and purified recombinant PEB3 produced in E. coli bind heparin. The location of two PEB3 heparin-binding clusters: 62KAKKD65 and 122NKKVRI127, was investigated via site-directed mutagenesis, resulting in impaired heparin-binding. These data suggest GAG-protein-binding may play a role in the pathogenesis of C. jejuni. As well as GAG-binding PEB3 binds 3-PG. Though its exact in vivo role remains unclear, it may act to deliver 3-PG. Scrutiny of the C. jejuni NCTC 11168H genome revealed an uncharacterised gene next to peb3 encoding glpT, or a putative 3-PG transporter. The location of glpT adjacent to peb3 may suggest a related function for the corresponding proteins with PEB3 as the periplasmic binding partner for the transport of 3-PG via GlpT. In this thesis, the roles of peb3 and glpT for two independent phenotypes, 3-PG dependent growth and fosfomycin sensitivity was studied in vitro. The findings indicate glpT has an effect on both, but not peb3. Furthermore, the NCTC 11168H glpT pseudogene, despite containing two frameshift mutations, has the capacity to encode a functional protein. Lastly, the NCTC 11168H peb3/glpT locus was compared with other C. jejuni strains and closely related species C. coli, C. lari and C. upsaliensis genome sequences. The majority of strains peb3/glpT locus followed the gene arrangement lpxB, peb3, glpT, surE. However, the findings indicate the gene loci between lpxB/surE in remaining strains to be hypervariable. Further analysis shows peb3 to be relatively conserved, whereas, the majority of glpT genes display genetic diversity due to interruptions such as indels and deletion. Lastly, I display the organisation of the peb3/glpT locus and glpT structure in their evolutionary context through MLST. In summary, the findings provide for further characterisation of the PEB3 protein and explores the importance of the uncharacterised GlpT of C. jejuni.
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