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Caracterização molecular e avaliação da patogenicidade em gerânio de isolados brasileiros da biovar 2 de Ralstonia solanacearum / Molecular characterization and pathogenicity evaluation on geranium of Brazilian strains of biovar 2 of Ralstonia solanacearum

Rossato, Maurício 10 February 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1802890 bytes, checksum: 0b75928115b5c4403a010430868a5dbc (MD5) Previous issue date: 2012-02-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Ralstonia solanacearum (RS) is a bacterial complex species that causes the bacterial wilt in hundreds of plant hosts, inducing heavy losses mainly on cultivated solanaceus species in tropical and subtropical countries. The race 3 biovar 2 (R3B2) of the pathogen causes not only direct losses but latent infections in many hosts, like the geranium, which facilitates its dissemination in and between countries. In the last decade, it was introduced in USA by infected geranium from Kenya and Guatemala, causing great concerns due the adaptation of this variant to the potato crop. In USA, the R3B2 of RS acquired the status of bioterrorism agent and now faces strong quarantine restrictions in the country. In this work we evaluated the pathogenicity of 36 Brazilian RS strains to geranium, most of them of R3B2. These strains were evaluated to their capacity of infecting geranium (Pelargonium peltatum and P. hortorum), potato and tomato. Seedlings were inoculated by xylem penetration with a pin contaminated at the time of inoculation by touching it onto the selected colony. Ten strains of biovar 1, 22 of biovar 2 and two of biovar 3 were used for comparison proposes. The disease incidence was measured every two days by the percentage of symptomatic plants. The strains were identified in order to analyze the eventual correlations among host of origin, biovar and phylotype. All the five geranium cultivars tested were susceptible, but with different responses among strains. The geraniums were less susceptible than solanaceous hosts tested. Nineteen strains infected one or two of the hosts and 17 infected at least one of the three hosts. The races 1 and 3, biovars 1, 2 and 3, phylotypes I and II, were all capable of infecting geranium. The capacity of R3B2 Brazilian strains to infect the geranium requires special methods for identification and detection of the bacteria in greenhouses for plants produced for export. It was not possible to group the strains according to pathogenic and molecular characteristics; therefore, it is proposed that complete genome analysis be performed to unveil eventual host specificity for some isolates. / Ralstonia solanacearum (RS) é uma espécie bacteriana complexa que causa a murcha bacteriana em centenas de plantas hospedeiras, provocando grandes perdas principalmente em solanáceas cultivadas em países de clima tropical e subtropical. Especificamente a raça 3 biovar 2 (R3B2) do patógeno, além de causar perdas diretas, causa infecções latentes em diversas hospedeiras, como o Pelargonium sp., o que facilita sua disseminação dentro e entre países. Por exemplo, na última década, esta bactéria foi introduzida nos EUA desta forma, causando preocupação em virtude da adaptação dessa variante à cultura da batata. Face à sua forte restrição quarentenária principalmente em países da América do Norte, onde adquiriu status de agente de bioterrorismo, avaliou-se a patogenicidade a gerânio de 36 isolados brasileiros, com ênfase na R3B2 de RS. Esses isolados foram avaliados quanto à sua capacidade de infectar gerânios (P. peltatum, P. hortorum), batata e tomate. Plantas jovens foram inoculadas pela penetração do xilema com um alfinete esterilizado contaminado pelo toque em colônia de RS de cada isolado. Foram usados 36 isolados, sendo 10 da biovar 1, 22 da biovar 2, dois da biovar 3 e dois de gerânio. A incidência da doença foi medida a cada dois dias pela porcentagem de plantas com sintomas da doença. Além do teste de patogenicidade a gerânio, os isolados foram identificados em filotipos com a finalidade de verificar se os isolados capazes de infectar estas hospedeiras se agrupavam de maneira a explicar alguns dos comportamentos. Todas as cinco cultivares de gerânio foram suscetíveis, porém ocorreram variações quanto à resposta entre isolados. Os gerânios, em geral, são menos suscetíveis a todos os isolados quando comparados com batata e tomate. Dezenove dos 36 isolados infectaram uma ou duas das espécies testadas e 17 infectaram ao menos uma planta de todas as espécies hospedeiras avaliadas. Isolados das raças 1 e 3, biovares 1, 2 e 3, filotipos I e II, foram capazes de infectar o gerânio. A capacidade de isolados brasileiros da R3B2 de RS de infectar o gerânio faz com que sejam necessários métodos especiais para identificação e detecção da bactéria em viveiros de plantas visando a exportação. Não foi possível agrupar os isolados segundo suas características patogênicas e moleculares; então, é proposto que análises de genoma completo sejam realizadas para que pequenos deste, possam revelar a gama de hospedeiras.
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Potencial de óleos essenciais no controle de Meloidogyne javanica em tomateiro / Potential of essential oils in the control of Meloidogyne javanica in tomato

Amora, Deisy Xavier 23 February 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 431416 bytes, checksum: ef204dc49faf9dccd4e32266cf30edf7 (MD5) Previous issue date: 2010-02-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Plants have substances known as secondary metabolites which have diverse functions, among them to protect the plant against attack by pathogens. The use of plants as nematicides for nematode control has been extensively studied and the use of essential oils is an alternative for controlling nematodes in small areas. This study aimed to evaluate the effect of essential oils of wormwood, peppermint, oregano and thyme on the control of Meloidogyne javanica. Initially was assessed in vitro the nematicidal potential of these oils on hatching and mortality of juvenile nematodes. The essential oils were solubilized in dimethyl sulfoxide 2% and applied at the concentrations 0.05%, 0.25% or 0.5% in hatching and juvenile mortality tests. All oils tested reduced hatching and increased mortality of juveniles of M. javanica comparing to the control, for the three concentrations analyzed. Subsequently, the potential of these same oils was tested in a greenhouse in the suppression of the number of root galls and nematode eggs. Two methods were tested: foliar spray on tomato plants and direct addition of essential oils solutions into the soil. The essential oils were solubilized in 2% dimethyl sulfoxide and applied at the concentrations 0.05%, 0.25% or 0.5%, when applied by foliar sprays, and 0.25% and 0.5%, when added to soil. The oils were applied weekly for eight weeks. Sixty days after transplanting, plants were evaluated for shoot mass, root mass, number of galls and number of eggs. None of the oils suppressed the number of galls or eggs when they were applied by foliar sprays or when they were added directly into the soil. / As plantas possuem substâncias denominadas metabólitos secundários que possuem diversas funções, dentre elas a de proteger a planta contra o ataque de organismos patogênicos. O emprego de plantas com propriedades nematicidas para o controle de fitonematoides vem sendo muito estudado e o uso de óleos essenciais representa mais uma alternativa no controle de fitonematoides em pequenas áreas. O presente trabalho teve como objetivo avaliar o efeito dos óleos essenciais de losna, hortelã-pimenta, orégano e tomilho no controle de Meloidogyne javanica. Inicialmente avaliou-se o potencial nematicida in vitro destes óleos sobre a eclosão e a mortalidade de juvenis do nematoide. Os óleos essenciais foram solubilizados em dimetil sulfóxido 2% e aplicados nas concentrações 0,05%, 0,25% ou 0,5%, nos testes de eclosão e de mortalidade dos juvenis. Todos os óleos testados reduziram a eclosão e aumentaram a mortalidade dos juvenis de M. javanica em relação à testemunha, nas três concentrações analisadas. Posteriormente, o potencial destes mesmos óleos foi testado em casa de vegetação na supressão do número de galhas radiculares e de ovos do nematoide. Dois métodos foram testados: pulverização foliar de tomateiros e adição direta ao solo das soluções dos óleos essenciais. Os óleos essenciais foram solubilizados em dimetil sulfóxido 2% e aplicados nas concentrações 0,05%, 0,25% ou 0,5%, quando aplicados via pulverização foliar, e 0,25% e 0,5%, quando adicionados ao solo. Os óleos foram aplicados semanalmente por oito semanas. Sessenta dias após o transplantio, as plantas foram avaliadas quanto à massa de parte aérea, massa de raiz, número de galhas e número de ovos. Nenhum dos óleos suprimiu o número de galhas ou de ovos quando foram aplicados via pulverização foliar nem quando foram adicionados diretamente ao solo.
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Intensidade da seca da mangueira em mudas submetidas a diferentes níveis de salinidade / Wilt intensity in mango seedlings submit in differents levels of salinity

Murta, Hiunes Mansur 26 February 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1763198 bytes, checksum: a6cae95e6f8012cb14ce5b308bc9307a (MD5) Previous issue date: 2013-02-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Mango wilt, caused by C. fimbriata, is a limiting factor to mango production in Oman, is here salinized soils predominant. As effect of salinity on disease intensity is unknown, we aimed to evaluate the effect of salinity on the disease in mango plants with different combinations rootstock x graft. Two experiments were carried out, E1 and E2. In both, we used five concentrations of NaCl (0, 15, 30, 45 and 60 mmol L-1) and three inoculation treatments (plants either uninoculated, inoculated in the rootstock, or inoculated in the graft). In E1, three cultivars were used as rootstocks ('Espada', 'Imbu' and 'Uba') and one as graft ('Haden'). In E2, Uba was used as rootstock and three cultivars were used as graft ('Palmer', 'Haden' and 'Tommy Atkins'). C. fimbriata was inoculated 10 cm above (graft inoculation) or below (rootstock inoculation) the grafting. The seedlings were kept in Hoagland solution in aerated hydroponic system. We run each experiment twice, each one in a completely randomized factorial design with four replicates (onde plant = one experimental unit). We assessed the time for the plants to wilt and die, length of lesions, and calculated the area under the disease progress curve and the rate of disease progression. At 0 and 90 days of exposure of the plant to the salt stress, we evaluated: plant height and diameter, and at 90 days the chlorophyll fluorescence and stomatal conductance. At the end of the experiments, we also determined: dry mass of the root and leaves, total dry matter, and content of N, P, K, Ca, Mg, Na and Cl in the root, stem, and leaves. The mango wilt intensity in the plants was greater when C. fimbriata was inoculated in the rootstock. There was a decrease in height, diameter, dry matter, and N, P, K, Ca and Mg with increasing concentrations of NaCl. In all cultivars evaluated disease symptoms were observed. In all situations in which Uba' was used as rootstock and 'Tommy Atkins' as graft, we detected lesser sensibility to salt stress and susceptibility to mango wilt. / A seca da mangueira, causada por Ceratocystis fimbriata, é o principal fator limitante à mangicultura em Omã. Nesse país, predominam os solos salinizados, e não se conhece o efeito da salinização na intensidade da doença. Assim, avaliou-se o efeito da salinidade sobre a doença em mudas de mangueiras, em diferentes combinações porta-enxerto x enxerto. Executaram-se dois ensaios, E1 e E2. Em ambos, usaram-se cinco concentrações de NaCl (0, 15, 30, 45 e 60 mmol L-1) e três condições de inoculação (sem inoculação, inoculação do porta-enxerto e inoculação do enxerto). Em E1, usaram-se três cultivares como porta-enxerto ( Espada , Imbu e Ubá ) e um como enxerto ( Haden ). Em E2, adotou-se Ubá como porta-enxerto e três cultivares ( Palmer , Haden e Tommy Atkins ) como enxerto. Inocularam-se as mudas, conduzidas em solução de Hoagland em sistema hidropônico aerado, com C. fimbriata a 10 cm acima (inoculação do enxerto) ou abaixo (inoculação do porta-enxerto) da marcação da enxertia. Executou-se cada ensaio por duas vezes, em esquema fatorial no delineamento inteiramente casualizado, com quatro repetições (uma muda=uma unidade experimental). Avaliaram-se os tempos para murcha e morte das plantas e o comprimento de lesões, e se calcularam a área abaixo da curva de progresso e a taxa de progresso da doença. Aos 0 e 90 dias após exposição ao estresse salino, avaliaram-se: altura e diâmetro das plantas, calculando-se o incremento na altura e no diâmetro no período, e aos 90 dias, avaliaram-se o índice SPAD e a condutância estomática. Ao final dos ensaios, determinaram-se: massa seca da raiz, do porta-enxerto, do enxerto, das folhas, e total, bem como os teores de N, P, K, Ca, Mg, Na e Cl na raiz, caule do porta-enxerto, caule do enxerto e folhas. A intensidade da seca foi maior quando se inoculou o porta-enxerto. Houve menor crescimento, em termos de altura e diâmetro, decréscimo da massa seca e dos teores de N, P, K, Ca e Mg com o aumento das concentrações de NaCl. Em todos os cultivares avaliados, observaram-se sintomas da doença. No conjunto das características avaliadas, Ubá usada como porta-enxerto e Tommy Atkins como enxerto, foram menos sensíveis ao estresse salino e à doença.
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Silício na resistência da bananeira ao mal do Panamá / Silicon on banana resistance to Panamá disease

Fortunato, Alessandro Antônio 28 July 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 564659 bytes, checksum: 31244befb1d4ed5d4db341b47bfe84a9 (MD5) Previous issue date: 2009-07-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This study aimed to determine the effect of silicon (Si) to reduce the symptoms of Panamá disease, caused by Fusarium oxysporum f.sp. cubense (Foc), on banana, besides the potentialization of some biochemical mechanisms of defense. Plants from cultivars Grande Naine (resistant) and Maçã (susceptible), were grown on plastic pots amended with 0 (-Si) and 0.39 g Si (+Si) per kg of soil and inoculated with Foc at 60 days after transplanting. Panamá disease progress (indirect and direct evaluations) and some biochemical determinations were performed. There was no difference between cultivars for Si concentration on the root system and on the rhizome-pseudostem, but Si concentration was higher on plants supplied with Si than on plants non-supplied with this element. Plants from cultivar Maçã showed the highest Si concentration on the pseudostem as compared to plants from cultivar Grande Naine . Calcium concentration on the root system and on the rhizomepseudostem was similar between plants from the two cultivars. The values for the variables area under reflex symptoms progress curve on leaves, area under symptoms progress on root system progress curve, and area under dark pseudostem progress curve were reduced in the presence of Si. Plants supplied with Si from both cultivars also showed reduced values for area under asymptomatic fungic colonization progress curve, area under relative lesion length progress curve, and area under Panamá disease progress curve. The concentration of pigments on leaves from the two cultivars supplied with Si was greater as compared to plants non supplied with this element. The concentration of malonic aldehyde and hydrogen peroxide was not different between the two cultivars supplied or not with Si. The concentration of total soluble phenolics and lignin-thioglycolic acid derivatives was greater on root system of plants from the two cultivars supplied with Si. The activities of the enzymes phenylalanine ammonia lyase, peroxidase, polyphenoloxidase, glucanase, and chitinase on the root system of the two cultivars were not potentiated by Si. The results of this study show an effect of Si to potentiate defense responses of banana to Foc, especially for the susceptible cultivar through the reduction of disease symptoms in association with a greater lignification and production of phenolics on the root system. / O objetivo deste trabalho foi estudar o efeito do silício (Si) em reduzir os sintomas do mal do Panamá, causado por Fusarium oxysporum f.sp. cubense (Foc), em bananeira, além da potencialização de mecanismos bioquímicos de defesa. Plantas das cultivares Grande Naine (resistente) e Maçã (suscetível), foram crescidas em solo contendo 0 (-Si) e 0,39 g Si (+Si)/kg de solo e foram inoculadas com Foc aos 60 dias após o transplantio. A avaliação do progresso do mal do Panamá (avaliado de forma indireta e direta) e as determinações bioquímicas foram realizadas posteriormente. Não houve diferença na concentração de Si no sistema radicular e no rizomapseudocaule entre as duas cultivares de bananeira, mas a concentração desse elemento foi maior em plantas supridas com Si quando comparadas com as não supridas. Plantas da cultivar Maçã apresentaram maior concentração de Si no rizoma-pseudocaule quando comparadas com plantas da cultivar Grande Naine. A concentração de cálcio no sistema radicular e no rizoma-pseudocaule foi similar entre as plantas das duas cultivares. As variáveis área abaixo da curva do progresso dos sintomas reflexos nas folhas, área abaixo da curva do progresso dos sintomas no sistema radicular e a área abaixo da curva do progresso do escurecimento do rizoma foram reduzidas somente nas plantas supridas com Si. O fornecimento de Si às plantas das duas cultivares também reduziu as variáveis área abaixo da curva do progresso da colonização fúngica assintomática, área abaixo da curva do progresso do comprimento relativo de lesão e a área abaixo da curva do progresso do mal do Panamá. A concentração de pigmentos nas folhas das plantas das duas cultivares supridas com Si foi maior em comparação com as plantas não supridas. A concentração de aldeído malônico e peróxido de hidrogênio não diferiu entre as duas cultivares supridas ou não com Si. A concentração de CFST e dos DLATG foi maior no sistema radicular das plantas das duas cultivares supridas com Si. Não houve efeito pronunciado do Si em potencializar a atividade das enzimas FAL, PER, PFO, GLU e QUI no sistema radicular das plantas das duas cultivares. Os resultados deste trabalho sugerem um efeito do Si em potencializar respostas de defesa da bananeira à Foc, principalmente para a cultivar suscetível, através da redução dos sintomas da doença associada com uma maior lignificação e produção de compotos fenólicos no sistema radicular.
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Reavaliação do ciclo de vida de Hemileia vastatrix no Brasil / A re-evaluation of the life cycle of Hemileia vastatrix in Brazil

Fernandes, Ronaldo de Castro 22 March 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1555014 bytes, checksum: 0c6c5a8ef13ff1e9dfba0b83360516de (MD5) Previous issue date: 2007-03-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Evidence is presented to show that Hemileia vastatrix, the causal agent of coffee leaf rust, has two types of teliospores in the life cycle: thin and smooth-walled, globose to napiform teliospores typically germinating with a four-celled promycelium (basidium), each cell producing a sterigma and basidiospore; thick-walled, ornamented, sub-reniform uredinioid teliospores. Caryological studies using Giemsa staining and image cytometry demonstrate that the first division of meiosis occurs in the uredinioid teliospores, and the second division only takes place after germination in the appressorium (delayed meiosis). The intent of examining the caryological status of H. vastatrix spores through flux cytometry was not implemented because this technique dependended on protoplast isolations that proved impossible with the treatments that were attempted for this fungus. Factors affecting the frequency and type of germination (mycelial versus appressorial) and of the uredinioid teliospores were investigated and analysed. Most germinate in the dark at temperatures between 22 and 26 oC, and appressorial formation is obtained under low temperatures (22 oC), in the dark. Teliospores were recorded from various localities in Minas Gerais, confirming the previous dubious record of the occurrence of this spore type in Brazil, and their occurrence appeared to be conditioned by the changing humidity during periods of lower temperatures in the winter and spring. A significant proportion of teliospores showed abnormal germination; the number of promycelial cells varying from three to seven, with or without the production of sterigmata and basidiospores. This body of information may explain the high number of races identified thus far in H. vastatrix, a supposedly functionally asexual fungus that produces non-functional basidiospores, according to the current views. The existence of an additional process allowing genetic recombination might explain the emergence of new races and the continuing breakdown of resistance in new coffee varieties. / Produziram-se evidências de que Hemileia vastatrix, o agente etiológico da ferrugem do cafeeiro, tem dois tipos de teliósporos no seu ciclo de vida: teliósporos globosos a napiformes de paredes finas e lisas e que germinam tipicamente pela formação de um promicélio (basídio) com quatro células, cada qual produzindo um esterigma sobre o qual um basidiósporo é produzido e teliósporos uredinóides subreniformes com parede espessa lisa ventralmente e equinulada dorsalmente. Estudos cariológicos usando corante Giemsa e citometria de imagem demonstraram que em teliósporos uredinóides a primeira divisão da meiose ocorre nos esporos e a segunda divisão ocorre apenas depois da germinação no apressório. A proposta de examinar o status cariológico de esporos de H. vastatrix pela citometria de fluxo não foi implementada, pois dependia do prévio isolamento de protoplastos, que foi impossível com os tratamentos testados para este fungo. Fatores que afetam a freqüência e o tipo de germinação (micelial versus apressorial) dos teliósporos uredinóides foram investigados e analisados. A maior proporção de germinação foi obtida no escuro entre 22 e 26 oC e a formação de apressorios foi obtida sob temperaturas amenas próximo de 22 oC no escuro. Teliósporos foram coletados em várias localidades em Minas Gerais, confirmando o relato, até então duvidoso, de ocorrência deste tipo de esporo no Brasil. Sua ocorrência pareceu condicionada a mudanças em condições de umidade em períodos de temperatura mais baixa no inverno e na primavera. Uma significativa proporção dos teliósporos apresentou um padrão de germinação anormal com um número de células no promicélio variando de três a sete, com ou sem produção de esterigmas e basidiósporos. O conjunto de observações efetuadas neste trabalho pode contribuir para explicar a ocorrência de um número relativamente grande de raças reconhecido para H. vastatrix que seria de acordo com o conceito usualmente aceito funcionalmente estritamente assexuado, produzindo basidiósporos não funcionais. A existência de um processo adicional para promoção da recombinação genética poderia explicar o aparecimento de novas raças e a continuada quebra de resistência em novas variedades de cafeeiro.
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Interação Clonostachys rosea, Silício e Botrytis cinerea em pepineiro / Interaction Clonostachys rosea, Silicon and Botrytis cinerea

Silva, Paula Renata Alves da 23 February 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 776205 bytes, checksum: bdeb274d6dc080817dbbde35d5621b65 (MD5) Previous issue date: 2012-02-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Cucumber plants grown in greenhouse conditions are often infected by Botrytis cinerea, which causes the gray mold. The disease is controlled by successive applications of fungicides. In the perspective of integrated management of gray mold, we studied the effects of the interaction Clonostachys rosea, Silicon (Si) and Botrytis cinerea on disease severity. When Si and C. rosea were applied alone or together, the incubation period of disease was increased. When C. rosea was applied, the incubation period increased about 63h and gray mold severity and electrolyte leakage were significantly reduced. The application of either C. rosea or Si alone increased the activity of poliphenoloxidase, peroxidase, chitinase and β-1,3- glucanase, and reduce disease severity, area under the curve of progress of disease (AUCPD), and rate of gray mold progress. The application of just C. rosea was promoted plant growth, considering the dry mass of root system, stem length and dry mass of stems. The antagonist colonized endophytically cucumber plants; the frequency of colonization was higher in the inoculated with B. cinerea then in the uninoculated plants. We conclude that C. rosea is a potential biological control agent of cucumber gray mold that can be endophytic and can promote the growth of cucumber plants. / Plantas de pepino sob cultivo protegido são frequentemente infectadas por Botrytis cinerea, que causa o mofo cinzento. Controla-se a doença com sucessivas aplicações de fungicidas. No contexto do manejo integrado do mofo cinzento, estudou-se o efeito da interação Clonostahcys rosea, Silício (Si) e B. cinerea na severidade da doença. Quando se aplicaram Si e C. rosea isolados ou em conjunto, aumentou-se o período de incubação da doença. Com a aplicação de C. rosea, o período de incubação aumentou-se em aproximadamente 63 h e se reduziram significativamente a severidade do mofo cinzento e o extravasamento de eletrólitos. Com a aplicação isolada de C. rosea ou de Si aumentou-se a atividade de polifenoloxidase, peroxidade, quitinase e β-1,3-glucanase e reduziram-se a severidade, a área abaixo da curva do progresso da doença (AACPD) e a taxa de progresso do mofo cinzento. Quando se aplicou C. rosea isoladamente, ocorreu promoção do crescimento de plantas, considerando-se a massa seca do sistema radicular, o comprimento da parte aérea, e a massa seca da parte aérea. O antagonista colonizou plantas endofiticamente e a frequência de colonização foi maior nas plantas inoculadas com B. cinerea que nas não inoculadas. Conclui-se que C. rosea é um potencial agente de controle biológico do mofo cinzento do pepino, que pode ser endofítico em plantas de pepino e promover seu crescimento.
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Utilização de fontes oleofílicas de nitrogênio e fósforo para biorremediação de petróleo em areia de praia / Utilization of oleophilic sources of nitrogen and phosphorus for petroleum bioremediation in beach sand

Oliveira, Carla Gabriela Braga de 05 September 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:51:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 803605 bytes, checksum: e8592fe1b32668a421b60b22522cb6d7 (MD5) Previous issue date: 2011-09-05 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Degradation of petroleum hydrocarbons by micro-organisms in coastal environments is a very interesting strategy for remediation of these compounds. However, microbial degradation is often limited by nutrients avaiability, particularly nitrogen and phosphorus. In this work, we compared the effect of addition of water-soluble (urea and KH2PO4) or oleophilic (urea-formaldehyde resin and soy lecithin) nitrogen and phosphorus sources on oil degradation by indigenous micro-organisms and bacteria in consortia in microcosms composed by beach sand contaminated with crude oil. The microcosms were submitted to daily water exchanges representing tides activities. We also analysed the retention capability of both nutrient sources in contaminated sediment. For this, we performed UFC.mL-1 counts and quantification of nitrogen and phosphorus concentrations in the water during the experiment. The remaining oil in the sand was extracted with hexane and quantified by spectrophotometry, in which the degradation corresponds to the difference between the initial and final amounts of oil. Water-soluble nutrients have been shown to be gradually washed away during the water exchange and not remained in the sediment for bacterial supply. However, an opposite pattern was verified for oleophilic nutrients, which is a desirable feature for application in environments with intense action of waves and tides. Despite the increased retention of oleophilic nutrients, there were no significant differences in microbial counts between both treatments. In addition, oil degradation occurred mainly in those microcosms supplied with water-soluble nutrients. Although the inoculated micro-organisms are able to use the oleophilic nutrient sources, more detailed studies on the concentration of nutrients to be applied and the availability of nutrients for micro-organisms are necessary in order to maximize the stimulus generated. / A degradação de hidrocarbonetos de petróleo por micro-organismos em ambientes costeiros é uma estratégia extremamente interessante de remediação desses compostos enquanto contaminantes ambientais. No entanto, essa biodegradação é frequentemente limitada pela disponibilidade de nutrientes, principalmente nitrogênio e fósforo. Neste trabalho foi comparado o efeito da adição de fontes de nitrogênio e fósforo solúveis em água (uréia e KH2PO4) e oleofílicas (resina uréia-formaldeído e lecitina de soja) sobre a degradação de petróleo cru, em microcosmos de areia de praia, por micro-organismos nativos ou adicionados em consórcios. As fontes de nutrientes foram ainda comparadas quanto a sua retenção no sedimento contaminado após trocas diárias de água. Para isso, realizou-se contagens de UFC.mL-1 e análises da concentração de nitrogênio e de fósforo na água. O óleo remanescente na areia foi extraído com hexano e quantificado por espectrofotometria, sendo a degradação correspondente a diferença entre as quantidades inicial e final de petróleo. Verificou-se que os nutrientes hidrossolúveis não permaneceram no sedimento, mas foram gradativamente lavados pela remoção diária de água. Um comportamento inverso ocorreu para os nutrientes oleofílicos, sendo essa uma característica desejável para sua aplicação em ambientes com intensa ação de ondas e marés. Apesar da maior retenção de nutrientes quando esses são oleofílicos, não se verificou diferenças consideráveis nas contagens microbianas entre os dois tratamentos. Além disso, a degradação do óleo ocorreu principalmente naqueles microcosmos supridos com os nutrientes solúveis em água. Embora os micro-organismos inoculados sejam capazes de utilizar as fontes oleofílicas como nutrientes, estudos mais detalhados da concentração a ser aplicada e da disponibilização desses nutrientes para os micro-organismos são necessários, a fim de se maximizar o estímulo gerado.
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Construção de uma linhagem floculante de Kluyveromyces marxianus com potencial para produzir etanol / Construction of a flocculent strain of Kluyveromyces marxianus with potential to produce ethanol

Belo, Edgard Valdomiro Charles 09 August 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:51:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1393937 bytes, checksum: d627ac6102daffc287744ec3395e1fd3 (MD5) Previous issue date: 2013-08-09 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Flocculent yeasts are useful in fermentation processes because they can be easily separated from the fermentation mash reducing costs with cell separation equipment. The flocculation phenotype is not often found in native yeasts, including the species Kluyveromyces marxianus which has a high biotechnological potential due to its ability to assimilate a variety of substrates, ferment at higher temperatures and present a high growth rate. This work aimed at the construction of flocculent strains of K. marxianus with potential to ferment agro-industrial residues. The cassettes used in the construction of flocculent strains of K. marxinaus were amplified from 4 different flocculent strains of Saccharomyces cerevisiae, each strain has a cassette consisting of the URA3 gene as a selection mark and a flocculation gene FLO under control of the constitutive promoter TDH3 (URA3-TDH3p-FLO) and each of these strains contains a different flocculation gene (FLO1, FLO5, FLO9 and FLO10). In order to obtain an auxotrophic mutant strain of K. marxinaus UFV-3, the URA3 gene of this strain was amplified and cloned. Then a fragment of its coding region was removed yielding an inactive gene (URA3Δ), which was used in the transformation of K. marxinaus UFV-3. Due to the impossibility to obtain an auxotrophic strain of K. marxinaus UFV-3, we used the CBS 6556 strain auxotrophic for uracil. This strain was transformed by electroporation using the cassettes from S. cerevisiae. We obtained 4 flocculent strains of K. marxianus CBS 6556 that were selected by growth in medium without uracil. By carrying out the phenotypic analysis of the transformants, it was found that all the strains were flocculants; however, the flocculation degree was different between the 4 strains. The fermentation characteristics of the flocculent strains of K. marxianus were evaluated by using glucose, lactose and glucose/lactose as carbon and energy source and it was found that the strain transformed with the cassette containing the gene FLO9 (KMCBSFLO9) was the strain that showed the best fermentative performance preserving its ability to flocculation. In order to verify the influence of flocculation phenotype in the alcohol tolerance, the KMCBSFLO9 strain, the less flocculant strain (KMCBSFLO10) and the no-flocculant strain (KMCBSΔURA3) were cultured in the presence of different concentrations of ethanol. The results showed that the flocculent and no-flocculant strains present higher cell viability after 12 hours of culture in the presence of different concentrations of ethanol. / Leveduras floculantes são de grande utilidade em processos fermentativos, pois são separadas facilmente do mosto de fermentação. Diminuindo os custos associados á etapa de separação das células. O fenótipo de floculação não é encontrado com frequência em leveduras nativas, incluindo a espécie Kluyveromyces marxianus a qual apresenta alto potencial biotecnológico devido a sua hablilidade de assimilar um amplo espectro de substratos, apresentar uma alta taxa de crescimento e ser termotolerante. Este trabalho teve como objetivo a construção de linhagens floculantes de K. marxianus com potencial para fermentar resíduos agroindustriais. Os cassetes utilizados na construção das linhagens floculantes de K. marxinaus foram amplificados de 4 linhagens floculantes de Saccharomyces cerevisiae que possuem, cada uma, um cassete constituído pelo o gene URA3 como marca de seleção e por um gene de floculação FLO, sob o controle do promotor constitutivo TDH3 (URA3-TDH3p-FLO). Sendo que cada uma dessas linhagens contém um gene de floculação diferente (FLO1, FLO5, FLO9 E FLO10). A fim de obter um mutante auxotrófico da linhagem de K. marxinaus UFV-3 o gene URA3 desta linhagem foi amplificado, clonado e um fragmento da sua região codificadora foi retirado obtendo-se um gene inativo URA3Δ que foi utilizado na transformação da K. marxinaus UFV-3. Neste trabalho não foi possível obter uma linhagem de K. marxinaus UFV-3 auxotrófica para uracila, por isso utilizamos a linhagem CBS 6556 já auxotrófica para uracila. Esta linhagem foi transformada por eletroporação utilizando os cassetes FLO obtendo-se 4 diferentes linhagens floculantes de K. marxianus CBS 6556 que foram selecionadas em meio sem uracila. A análise fenotípica dos transformantes mostrou que que todas as linhagens eram floculantes, contudo, o grau de floculação variou entre as 4 linhagens. Avaliou-se o perfil fermentativo das linhagens floculantes de K. marxianus utilizando glicose, lactose e glicose mais lactose como fonte de carbono e energia. Foi verificado que a linhagem transformada com o cassete contendo o gene FLO9 (KMCBSFLO9) apresentou melhor capacidade fermentativa e manteve sua capacidade de floculação. Com a finalidade de verificar a influência do fenótipo de floculação na viabilidade celular em resposta ao etanol a linhagem de KMCBSFLO9, assim como da linhagem menos floculante (KMCBSFLO10), e a não floculante (KMCBSΔURA3) foram cultivadas na presença de diferentes concentrações de etanol. Os resultados demonstraram que tanto a linhagem não floculante como as duas linahgens floculantes se mostraram resistentes ao etanol.
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Resistência a antimicrobianos e diversidade de β-lactamases em Escherichia coli de origem aviária / Antimicrobial resistance and β-lactamases diversity in Escherichia coli from poultry

Oliveira Filho, José Carlos de 04 October 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:51:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 01 - capa_abstract.pdf: 112846 bytes, checksum: f260bcc7fb2e9aa227782fd9e02a5c86 (MD5) Previous issue date: 2006-10-04 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The diversity of resistance mechanisms to antimicrobial compounds was investigated in E. coli strains isolated from poultry. All 30 isolates were resistant to ampicillin and 26 of them were resistant to at least two antibiotics. Multi-resistance profiles were confirmed, including intermediate levels. Forty percent of the strains presented four resistance markers and 93% of the isolates were resistant to tetracycline, an antibiotic commonly used in poultry farms. The β-lactamase diversity among the strains was probed against seven compounds. Among strains bearing the same resistance profile for other groups of antimicrobial drugs, it was possible to observe different β-lactamases activity against the tested substrates. This fact suggests either a pool of resistance genes or regulatory differences. The isolate that displayed confirmed activity against six of the β-lactamic antibiotics bears a large molecular mass plasmid that confers the AmpR phenotype. A fragment of this plasmid with approximately 5 kb was subcloned in the pCCR9 vector which is commonly used to detect β-lactamase genes. The amino acid deduced from nucleotide sequencing displayed 100% of identity to TEM-1, a class A serine β-lactamase. Next to the gene encoding TEM-1 was found putative transposon related to the Tn3 family, albeit with some differences in the order and direction of transcription of the genes. / A diversidade dos mecanismos de resistência a antimicrobianos foi investigada em Escherichia coli, originadas de frangos de corte. Dos 30 isolados, todos resistentes à ampicilina, 26 apresentaram mais de uma marca de resistência. Foram confirmados modelos de multirresistência, incluindo níveis intermediários de resistência. Em 40% dos casos, ocorreram quatro marcas e 93% dos isolados resistiram à ação de tetraciclina, um promotor de crescimento usual na agropecuária. A diversidade de β-lactamases entre os isolados foi demonstrada pela ação direta contra sete β-lactâmicos. Os isolados com mesmo modelo de resistência possuíam, sob mesmas condições, espectro de ação e de atividade diferentes, mostrando que há amplo pool de genes de resistência, ou diferenças regulatórias nessas bactérias. O isolado com maior espectro de ação, confirmado sobre seis β-lactâmicos, contém um plasmídeo de alta massa molecular, que confere resistência a ampicilina. Um fragmento deste plasmídeo, com aproximadamente 5 kb, foi clonado em pCCR9, vetor usado para detecção de genes de resistência a β-lactâmicos. As análises das seqüências obtidas revelaram 100 % de identidade com TEM-1, uma serina β-lactamase da classe A. Próximo ao gene codificador da TEM-1, foi encontrado um transposon putativo relacionado com os da família Tn3, porém com particularidades na ordem e direção de transcrição dos genes componentes.
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Gibellula spp. associadas a aranhas da Mata do Paraíso, Viçosa-MG / Gibellula spp. associated with spiders of Mata do Paraíso, Viçosa-MG

Costa, Pricila Palla 24 February 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:52:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1428549 bytes, checksum: e5f4d14aaf06e63420c374bb81738d9b (MD5) Previous issue date: 2014-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Fungi belonging to the genus Gibellula are found parasitizing spiders and have wide distribution in tropical and subtropical regions of the planet. This genus is spider specific and it is believed that this specificity is related to infection mechanism that probably acts at the level of the exoskeleton. Although many reports and descriptions of Gibellula spp. in the literature, there is no approach to the ecology of these natural enemies of spiders. Moreover, the knowledge of this kind in Brazil is extremely scarce. Therefore the aim of this study was to conduct a survey of the species of Gibellula in Research, Training and Environmental Education Mata do Paraiso, Viçosa - MG station, and to make a study of classical taxonomy, and establish relationships between host-pathogen interaction. Were performed collections in different areas of the forest in order to favor the detection of greater quantity and diversity of these fungi. The mummified spiders were identified to better understand the host-pathogen relationship. Were collected a total of 79 parasitized spiders that were distributed in ten families (Anyphaenidae, Araneidae, Corinnidae, Linyphiidae, Pholcidae, Salticidae, Sparassidae, Theridiidae, Thomisidae, Zodariidae), the most frequent Anyphaenidae (25.3%) and Pholcidae (26.6 %). Of the 79 fungi specimens collected, 20 ( 25.3%) were isolated and kept in pure culture. Among them nine species of Gibellula were identified, including Gibellula dimorpha was first reported in Brazil , and five new species will be proposed. / Fungos pertencentes ao gênero Gibellula são encontrados parasitando aranhas e possuem ampla distribuição pelas regiões tropicais e subtropicais do planeta. Este gênero é específico de aranhas e acredita-se que essa especificidade esteja relacionada ao mecanismo de infecção que provavelmente atua em nível de exoesqueleto. Apesar de diversos relatos e descrições de Gibellula spp. na literatura, não há nenhuma abordagem relativa a ecologia desses inimigos naturais em aranhas. Além disso, o conhecimento a respeito desse gênero no Brasil é extremamente escasso. Portanto o objetivo deste trabalho foi conduzir um levantamento das espécies de Gibellula na Estação de Pesquisas, Treinamento e Educação Ambiental Mata do Paraíso, Viçosa-MG, bem como efetuar um estudo de taxonomia clássica, e estabelecer relações de interação entre patógeno-hospedeiro. Foram realizadas coletas em diferentes áreas da mata de forma a favorecer a detecção de maior quantidade e diversidade desses fungos. As aranhas mumificadas foram identificadas para melhor compreensão da relação patógeno-hospedeiro. Foram coletadas um total de 79 aranhas parasitadas que se distribuíram em dez famílias (Anyphaenidae, Araneidae, Corinnidae, Linyphiidae, Pholcidae, Salticidae, Sparassidae, Theridiidae, Thomisidae, Zodariidae), sendo as mais frequentes Anyphaenidae (25,3%) e Pholcidae (26,6%). Dos 79 espécimes de fungos coletados, 20 (25,3%) foram isolados e mantidos em cultura pura. Dentre eles, nove espécies de Gibellula foram identificadas, entre as quais Gibellula dimorpha foi relatada pela primeira vez no Brasil, e cinco espécies novas serão propostas.

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