Made available in DSpace on 2016-06-02T19:56:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2321.pdf: 2212590 bytes, checksum: e03a838bd999bce0488998d98b12479f (MD5) Previous issue date: 2009-02-20 / Universidade Federal de Sao Carlos / Arachis hipogae L. peanut is an orthodox seed that must go through a drying process to become free from aflatoxin. The fruit is formed by a system made up by a nucleus and a resistant involucre that constitutes a heterogeneous mixture. So as to contribute to the improvement of those seeds drying, the objective of this study is to analyze the drying of the compound system and its subsystems in relation to moisture transport and shrinkage, as well as the influence on physiological and physical characteristics. In order to do so, the fruit, the seeds with and without endocarp, as well as the pericarp were placed in a forced convection dryer. To approach the problem, the idea of fluid flow on submerged bodies was adopted. The experiments were conducted based on a 32 experimental planning with temperatures of 30, 40 e 50°C and velocities of 0,5; 1,0 e 1,5 m/s. The intermittent method was used to measure the samples mass and to obtain the images. Analysis of the physical and physiological characteristics was performed from observations during the experiments. The results showed that the diffusive transport of moisture was predominant when the fruit and seed with and without the endocarp are concerned. The convective mechanism was also observed for the pericarp. As far as the physical barriers effect is concerned, it was verified that the pericarp and the endocarp cause resistance to mass transport. It was possible to verify the development of the seed s (with and without the endocarp) superficial concavity through image analyses with the aid of IMAGE PRO PLUS® software. However this deformation was not observed for the fruit or for the pericarp. The dimension reductions demonstrate the presence of the shrinkage phenomenon for the seed with and without the endocarp. The results regarding the physiological and physical characteristics showed dependency on operational conditions used when the seeds are processed outside the pericarp. Analysis concerning the process interaction with the product characteristics demonstrated that convective drying is a promising technique having a better relation between the process and quality for the product. Due to the results obtained, the discrimination of the equations that represent drying kinetics with focus on the improvement of seeds production was performed. The advancements obtained contribute to the drying studies of seeds that present protective cover under the perspective of seeds drying engineering. / O amendoim (Arachis hipogae L.) é uma semente ortodoxa que precisa passar pelo processo de secagem para se tornar livre da aflatoxina. O fruto é formado por um sistema composto por um núcleo e um invólucro resistente que constitui uma mistura heterogênea. Visando contribuir com a melhoria da secagem destas sementes o objetivo deste estudo é analisar a secagem do sistema composto e seus subsistemas em relação ao transporte de umidade e encolhimento, assim como, a influência sobre as qualidades físicas e fisiológicas. Para tanto, o fruto, as sementes com e sem endocarpo, bem como, o pericarpo, foram submetidos em um secador de convecção forçada com reciclo de ar. Para a abordagem do problema adotou-se a visão de escoamento de fluido sobre corpos submersos. Os experimentos foram conduzidos com base em um planejamento experimental 32 com temperaturas de 30, 40 e 50°C e velocidades de 0,5; 1,0 e 1,5 m/s. Para medida da massa das amostras e a tomada de imagens foi utilizado o método intermitente. As qualidades físicas e fisiologias foram realizadas a partir de observações durante os experimentos. Os resultados obtidos mostraram que o mecanismo predominante no transporte de umidade é o difusivo, quando se tem o fruto, a semente com e sem endocarpo. Para o pericarpo foi verificada também a presença do mecanismo convectivo. Quanto ao efeito das barreiras físicas, foi constatado que o pericarpo e o endocarpo causam resistência ao transporte de massa. Através da análise das imagens, com auxílio do software IMAGE PRO PLUS® foi possível constatar o desenvolvimento da concavidade na superfície da semente com e sem endocarpo. Entretanto, esta deformação não foi observada para o fruto nem para o pericarpo. As reduções das dimensões demonstram a ocorrência do fenômeno de encolhimento para a semente com e sem endocarpo. Os resultados referentes às qualidades fisiológicas e físicas mostraram dependência com as condições operacionais utilizadas quando as sementes são processadas fora do pericarpo. A análise referente à interação do processo com as qualidades do produto demonstrou que a secagem convectiva é promissora tendo a melhor relação entre o processo e qualidade para o fruto. Diante dos resultados obtidos, foi realizada a discriminação das equações que representam a cinética de secagem com enfoque na melhoria da produção de sementes. Os avanços obtidos contribuem com os estudos da secagem de sementes que apresentam capa protetora sob o ponto de vista de engenharia de secagem de sementes.

Micotoxinas são metabólitos secundários produzidos por fungos filamentosos que podem contaminar os grãos em diferentes períodos de pré e pós-colheita. O objetivo desse trabalho foi avaliar a contaminação fúngica e por micotoxinas em diferentes períodos do cultivo do amendoim no Rio Grande o Sul, considerando diferentes regiões e cultivares, durante as safras 2006/2007 e 2007/2008 e, ainda, desenvolver um método eficiente de quantificação de aflatoxina B1, baseado na cromatografia em camada delgada com detector de carga acoplada. Foram coletadas nas regiões de Augusto Pestana e Ivorá, amostras dos cultivares Tatu e Paraguaio, em diferentes períodos da cultura: (1) solo pré-plantio, (2) enchimento dos grãos, (3) colheita, (4) pós-secagem e (5) solo pós-colheita. Os fungos contaminantes do solo foram quantificados pela técnica de diluição seriada e nos grãos, o percentual de incidência foi determinado pela técnica de plaqueamento direto. O potencial toxigênico de Aspergillus seção Flavi e Aspergillus seção Nigri foi verificado em Agar Coco e Agar Extrato de Levedura Sacarose, respectivamente. Aflatoxina B1 e ocratoxina A foram determinadas por cromatografia em camada delgada com detector de carga acoplada. As espécies predominantes em todas as amostras foram Aspergillus flavus e Aspergillus niger var. niger. Entre as espécies de A. flavus e A. parasiticus, 89,3% e 39,2%, se mostraram produtoras de aflatoxina B1, respectivamente. Nenhum dos isolados de A. niger var. niger produziu ocratoxina nas condições testadas. Aflatoxina B1 foi detectada em 50% das amostras, com níveis entre 16 μg/Kg e 115 μg/Kg. Ocratoxina A foi detectada em 25% das amostras, com níveis entre 12,2 μg/Kg e 76,9 μg/Kg. Foi observada a ocorrência simultânea das duas micotoxinas em amostras do período pós-colheita. O método desenvolvido para quantificação de aflatoxina B1, baseado em procedimentos de fotometria fotográfica, se mostrou sensível, eficiente e prático, apresentando um limite de detecção de 0,4 ng por mancha, um limite de quantificação de 1,2 μg/kg e média de recuperação de 92%. / Mycotoxins are secondary metabolites produce by filamentous fungi that can contaminate grains in different stages of pre and postharvest management. The objective of this study was to investigate the occurrence of fungi and mycotoxins at different maturation stages of peanut produced in different regions of south of Brazil during 2006/2007 and 2007/2008 harvests. Moreover, to develop an efficient quantification method of aflatoxin B1, based on thin-layer chromatography and charged coupled device detector. Peanut samples, Tatu and Paraguaio varieties, were obtained in regions of Augusto Pestana and Ivorá, in different stages of cultura: (1) soil before planting, (2) pod filling, (3) at harvest, (4) after drying, (5) soil after harvest. The soil contamination was quantified by serial dilution technique and the fungi incidence on grains was determinate by direct planting technique. The toxigenic potential of Aspergillus section Flavi and Aspergillus section Nigri was verified in Coco Medium Ágar and Yeast Extract Sucrose agar medium, respectively. Aflatoxin B1 and ochratoxin A were determinate by on thin-layer chromatography and charged coupled device detector. The predominant species in all samples were Aspergillus flavus and Aspergillus niger var. niger. Among the species of A. flavus and A. parasiticus, 89,3% e 39,2%, produced aflatoxin B1, respectively. None of A. section Nigri isolates were ochratoxin A producers in the conditions tested. Aflatoxin B1 was detected in 50% of samples, with levels of 16.0 μg/Kg to 115.0 μg/Kg. Ochratoxin A was detected in 25% of samples, with levels of 12.2 μg/Kg to 76.9 μg/Kg. It was observed the co-occurrence of both mycotoxins in samples of postharvest. The method developed for aflatoxin B1 quantification was sensitive, efficient and practical, with a detection limit of 0.4 ng per spot, a limit of quantification of 1.2 μg/kg and average recovery of 92%.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Tecnologia, Departamento de Engenharia Florestal, Programa de Pós-Graduação em Engenharia Florestal, 2014. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2014-04-28T13:08:23Z No. of bitstreams: 1 2014_AngelaPereiraBussinguer.pdf: 9488786 bytes, checksum: 2a9862952452a4787e38c2aff207df29 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-04-28T13:34:30Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_AngelaPereiraBussinguer.pdf: 9488786 bytes, checksum: 2a9862952452a4787e38c2aff207df29 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-28T13:34:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_AngelaPereiraBussinguer.pdf: 9488786 bytes, checksum: 2a9862952452a4787e38c2aff207df29 (MD5) / Existe a necessidade do desenvolvimento de testes em sementes florestais que avaliem a viabilidade e a qualidade de sementes de maneira rápida, eficaz e a baixos valores, principalmente com a finalidade de produção de mudas para a recuperação de áreas degradadas e como estratégia de conservação das espécies, ao diminuir a pressão sobre áreas nativas. Pterogyne nitens é uma espécie que ocorre no Cerrado, possui grande potencial para recuperação de áreas degradadas e está ameaçada de extinção na Mata Atlântica devido à extração madeireira. O objetivo do trabalho foi avaliar o comportamento e vigor de sementes de Pterogyne nitens utilizando o teste de envelhecimento acelerado, realizado com sementes armazenadas e recém-colhidas de mesmas matrizes. Foram coletadas sementes em 10 matrizes georreferenciadas em áreas do Distrito Federal, as sementes foram desinfectadas em soluções de água sanitária a 5% e armazenadas por um período de 12 meses em condições de laboratório. Após esse período foram realizadas novas coletas nas mesmas matrizes. Sementes armazenadas e recémcolhidas foram submetidas ao teste de envelhecimento acelerado, totalizando 10 tratamentos (1 – germinação controle a 25°C; 2 – 41°C, 48h; 3 – 41°C, 72h; 4 – 41°C, 96h; 5 – 43°C, 48h; 6 – 43°C, 72h; 7 – 43°C, 96h; 8 – 45°C, 48h; 9 – 45°C, 72h; 10 – 45°C, 96h). Avaliou-se as taxas de germinação, primeira contagem e índice de velocidade de germinação (IVG) para verificar os efeitos do envelhecimento acelerado e do armazenamento nas sementes. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado, com 4 repetições. As análises estatísticas foram realizadas pelo programa Genes, com fatorial simples (2X10) constando de análise de variância, teste de Tukey a 5% de probabilidade e correlação linear simples. Para a análise da germinação foram observadas diferenças estatísticas apenas para as condições de armazenamento, não sendo observados efeitos do envelhecimento acelerado sobre a germinação ou morte das sementes, com maiores valores encontrados para a condição armazenada, indicando quebra de dormência física. Para a primeira contagem de germinação e IVG foram observados diferenças estatísticas para as condições de armazenamento e para os tratamentos aplicados. O armazenamento se mostrou eficiente para a manutenção da viabilidade das sementes de Pterogyne nitens por 12 meses e sugere o efeito de quebra de dormência tegumentar. Apesar de apresentarem menores taxas de germinação, sementes recémcolhidas se mostraram vigorosas ao atingirem maiores valores de primeira contagem de germinação e IVG no envelhecimento artificial a 45°C. O teste de envelhecimento acelerado pode ser conduzido a 41°C por um período de 48 horas para a obtenção de dados de vigor de sementes de Pterogyne nitens. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / There is a need to develop tests to forestry seeds to assess the viability and quality of seeds quickly, efficiently and at low values, mainly for the purpose of producing seedlings for the rehabilitation of degraded areas and as a species conservation strategy, to the reduce the pressure on wild areas. Pterogyne nitens is a species that occurs in the Cerrado, has great potential for recovery of degraded areas and is under threat of extinction in the Atlantic Forest due to timber harvesting. The aim of this study was to evaluate the behavior and vigor of Pterogyne nitens using the accelerated aging test, performed with stored seeds and recent harvested in the same matrices. Seeds were collected from 10 georeferenced matrices in areas of District Federal, the seeds were disinfected in solutions of bleach to 5% and stored for a period of 12 months under laboratory conditions. After this period new collections were made in the same matrices. Stored and recent harvested seeds were subjected to accelerated aging, totaling 10 treatments (1 - control germination at 25 ° C; 2 – 41°C, 48h; 3 – 41°C, 72h; 4 – 41°C, 96h; 5 – 43°C, 48h; 6 – 43°C, 72h; 7 – 43°C, 96h; 8 – 45°C, 48h; 9 – 45°C, 72h; 10 – 45°C, 96h). It was evaluated the rates of germination, first count and germination speed index (GSI) to verify the effects of accelerated aging and storage in seeds. The experimental design was completely randomized with 4 replications. Statistical analyzes were performed by Genes program with a simple factorial (2X10) consisting of analysis of variance, Tukey test at 5% probability and linear correlation. For the analysis of germination statistical differences were observed only for the storage conditions, and were not observed effects of accelerated aging on germination or death of seeds, with higher values found for the stored condition, indicating breaking physical dormancy. For the first count and GSI statistical differences in storage conditions and the treatments were observed. The storage was efficient for the maintenance of the viability of seeds of Pterogyne nitens for 12 months and suggests the breaking effect of tegumentary dormancy. Despite having lower germination rates, recent harvested seeds have demonstrated vigor to achieve higher values of first germination and GSI in artificial aging at 45 ° C. The accelerated aging test can be conducted at 41 ° C for 48 hours to obtain data vigor of Pterogyne nitens.

Micotoxinas são metabólitos secundários produzidos por fungos filamentosos que podem contaminar os grãos em diferentes períodos de pré e pós-colheita. O objetivo desse trabalho foi avaliar a contaminação fúngica e por micotoxinas em diferentes períodos do cultivo do amendoim no Rio Grande o Sul, considerando diferentes regiões e cultivares, durante as safras 2006/2007 e 2007/2008 e, ainda, desenvolver um método eficiente de quantificação de aflatoxina B1, baseado na cromatografia em camada delgada com detector de carga acoplada. Foram coletadas nas regiões de Augusto Pestana e Ivorá, amostras dos cultivares Tatu e Paraguaio, em diferentes períodos da cultura: (1) solo pré-plantio, (2) enchimento dos grãos, (3) colheita, (4) pós-secagem e (5) solo pós-colheita. Os fungos contaminantes do solo foram quantificados pela técnica de diluição seriada e nos grãos, o percentual de incidência foi determinado pela técnica de plaqueamento direto. O potencial toxigênico de Aspergillus seção Flavi e Aspergillus seção Nigri foi verificado em Agar Coco e Agar Extrato de Levedura Sacarose, respectivamente. Aflatoxina B1 e ocratoxina A foram determinadas por cromatografia em camada delgada com detector de carga acoplada. As espécies predominantes em todas as amostras foram Aspergillus flavus e Aspergillus niger var. niger. Entre as espécies de A. flavus e A. parasiticus, 89,3% e 39,2%, se mostraram produtoras de aflatoxina B1, respectivamente. Nenhum dos isolados de A. niger var. niger produziu ocratoxina nas condições testadas. Aflatoxina B1 foi detectada em 50% das amostras, com níveis entre 16 μg/Kg e 115 μg/Kg. Ocratoxina A foi detectada em 25% das amostras, com níveis entre 12,2 μg/Kg e 76,9 μg/Kg. Foi observada a ocorrência simultânea das duas micotoxinas em amostras do período pós-colheita. O método desenvolvido para quantificação de aflatoxina B1, baseado em procedimentos de fotometria fotográfica, se mostrou sensível, eficiente e prático, apresentando um limite de detecção de 0,4 ng por mancha, um limite de quantificação de 1,2 μg/kg e média de recuperação de 92%. / Mycotoxins are secondary metabolites produce by filamentous fungi that can contaminate grains in different stages of pre and postharvest management. The objective of this study was to investigate the occurrence of fungi and mycotoxins at different maturation stages of peanut produced in different regions of south of Brazil during 2006/2007 and 2007/2008 harvests. Moreover, to develop an efficient quantification method of aflatoxin B1, based on thin-layer chromatography and charged coupled device detector. Peanut samples, Tatu and Paraguaio varieties, were obtained in regions of Augusto Pestana and Ivorá, in different stages of cultura: (1) soil before planting, (2) pod filling, (3) at harvest, (4) after drying, (5) soil after harvest. The soil contamination was quantified by serial dilution technique and the fungi incidence on grains was determinate by direct planting technique. The toxigenic potential of Aspergillus section Flavi and Aspergillus section Nigri was verified in Coco Medium Ágar and Yeast Extract Sucrose agar medium, respectively. Aflatoxin B1 and ochratoxin A were determinate by on thin-layer chromatography and charged coupled device detector. The predominant species in all samples were Aspergillus flavus and Aspergillus niger var. niger. Among the species of A. flavus and A. parasiticus, 89,3% e 39,2%, produced aflatoxin B1, respectively. None of A. section Nigri isolates were ochratoxin A producers in the conditions tested. Aflatoxin B1 was detected in 50% of samples, with levels of 16.0 μg/Kg to 115.0 μg/Kg. Ochratoxin A was detected in 25% of samples, with levels of 12.2 μg/Kg to 76.9 μg/Kg. It was observed the co-occurrence of both mycotoxins in samples of postharvest. The method developed for aflatoxin B1 quantification was sensitive, efficient and practical, with a detection limit of 0.4 ng per spot, a limit of quantification of 1.2 μg/kg and average recovery of 92%.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-29T13:54:02Z No. of bitstreams: 1 Luciane de Nazare Almeida dos Reis.pdf: 1286764 bytes, checksum: e8ebbda7828d562331b43505ce6da593 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-29T13:54:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luciane de Nazare Almeida dos Reis.pdf: 1286764 bytes, checksum: e8ebbda7828d562331b43505ce6da593 (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / The peanut (Arachis hypogaea L.) is an important source of protein and oil, and considered one of the most cultivated plants in Brazil and worldwide, that provide products consumed in different ways. It is the fourth world largest oleaginous in seed production, cultivated in over 30 countries, where China leads with 40.8%, followed by India with 14% and Nigeria with 7.5%. Brazil occupies the 17th position, concentrated in the Southeast and South regions, and the State of São Paulo accounts for 91.4% of national production. Among the factors that limit the development of this crop, there are several viruses, which cause reduction on productivity and the value of the product for marketing. Up to now, 31 viral species, classified in the following genera and respective families have been recorded naturally infecting peanut: Begomovirus (Geminiviridae), Bromovirus (Bromoviridae), Carlavirus (Betaflexiviridae), Cucumovirus (Bromoviridae), Irlavirus (Bromoviridae), Luteovirus (Luteoviridae), Pecluvirus (Virgaviridae), Potexvirus (Alphafleviridae), Potyvirus (Potyviridae), Rhabdovirus (Rhabdoviridae), Soymovirus (Caulimoviridae), Tospovirus (Bunyaviridae), Tymovirus (Tymoviridae) e Umbravirus (Tombusviridae). Of these genera, Potyvirus has more species. The advent of metagenomics, combined with high-performance technologies (Next Generation Sequencing - NGS) provides the exploration of micro-universe in various areas of science, including the Plant Virology. These techniques, together with bioinformatics, act as excellent tools for detection and characterization of novel viruses, as well as, all the viral genomes of different species or strains present in certain samples. The objective of this work was to study the virome of peanut plants exhibiting typical virus symptoms, obtained from producing areas of 10 counties of the State of São Paulo by NGS. The viral isolates were maintained by successive passages to peanut plants by grafting, under greenhouse conditions at the University of Brasilia (UnB). To perform the NGN, samples were semipurified aiming enrichment of virus particles, followed by total RNA extraction and sequencing carried out by Illumina platform. The metagenomic analysis permitted the detection the complete genome of Peanut mottle virus virus - PeMoV (Potyvirus) and Groundnut ringspot virus - GRSV (Tospovirus). Biological (indicator plants), serological (Dot-ELISA) and molecular (RT-PCR) tests were performed in order to characterize some GRSV isolates from peanut, which sequences were identified by metagenomic. Molecular analysis of the gene encoding the N protein, used for species taxonomy within Tospovirus genus, was also carried out with the selected isolates A1, N1 and O1. These three isolates induced symptomatic response in at least one of the indicator species (Datura stramonium L.) used in this work and widely cited in the literature. Positive results for these isolates were also confirmed by serology, indicating the presence of GRSV in peanut producing counties in the State of São Paulo. Phylogenetic analyzes of the segments L, M and S of tospoviruses revealed that the peanut GRSV isolates studied in this work grouped with sequences of GRSV isolate from watermelon (Citrullus lanatus (Thunb.) Matsum. & Nakai) and a recombinant isolate of GRSV and Tomato chlorotic spot virus - TCSV obtained from tomato (Solanum lycopersicum L.). However, the phylogenetic analysis using the N protein sequence, demonstrated that the present peanut isolate grouped with sequences of GRSV isolates previously studied in Brazil. After phylogenetic analysis for proteins of all GRSV segments, it is believed that the species GRSV and TCSV share the same M segment. The comparison of PeMoV coat protein sequences revealed that the Brazilian peanut isolate reported in this work is more phylogenetically related with the isolate from South Korea, obtained from soybean (Glycine max L.) with 98% identity. This is the first report in Brazil and in the world of the complete genome sequences of PeMoV and GRSV in peanuts, by using NGS. / O amendoim (Arachis hypogaea L.) é uma importante fonte de proteína e óleo, sendo considerada uma das plantas mais cultivadas no Brasil e no mundo, com grande diversidade de formas de consumo de seus produtos. É a quarta oleaginosa com maior produção mundial, cultivada em mais de 30 países, em que a China lidera com 40,8%, seguida pela Índia com 14% e Nigéria com 7,5%. O Brasil ocupa a 17ª posição, concentrada nas regiões Sudeste e Sul, sendo o Estado de São Paulo responsável por 91,4% da produção nacional. Dentre os fatores que limitam o desenvolvimento dessa cultura, encontram-se diversos vírus, os quais ocasionam a redução da produtividade e valor do produto para comercialização. Até o momento, já foram registradas, infectando naturalmente o amendoim, 31 espécies virais, classificadas nos seguintes gêneros e respectivas famílias: Begomovirus (Geminiviridae), Bromovirus (Bromoviridae), Carlavirus (Betaflexiviridae), Cucumovirus (Bromoviridae), Irlavirus (Bromoviridae), Luteovirus (Luteoviridae), Pecluvirus (Virgaviridae), Potexvirus (Alphafleviridae), Potyvirus (Potyviridae), Rhabdovirus (Rhabdoviridae), Soymovirus (Caulimoviridae), Tospovirus (Bunyaviridae), Tymovirus (Tymoviridae) e Umbravirus (Tombusviridae). Destes, o gênero Potyvirus é o que agrega maior número de espécies. O advento da metagenômica, aliada às tecnologias de alto desempenho (Next Generation Sequencing - NGS) vêm propiciando a exploração do universo de microrganismos em várias áreas das ciências, inclusive na Virologia Vegetal. Estas técnicas, juntamente com a bioinformática, atuam como excelentes ferramentas para detecção e caracterização de novos vírus e de todos os genomas virais presentes em determinadas amostras, sejam de diferentes espécies ou estirpes. O objetivo desse trabalho foi realizar estudo de viroma de plantas de amendoim exibindo sintomas típicos de viroses, obtidas de áreas produtoras de 10 municípios do Estado de São Paulo por NGS. Os isolados virais foram mantidos por sucessivas passagens para plantas de amendoim por meio de enxertia, em casa de vegetação da Universidade de Brasília (UnB). Para a realização do NGS, as amostras foram semipurificadas objetivando um enriquecimento de partículas virais seguido de extração de RNA total e o sequenciamento, realizado pela Plataforma Illumina Miseq. A análise metagenômica permitiu a detecção do genoma completo do Peanut mottle virus - PeMoV (Potyvirus) e do Groundnut ringspot virus - GRSV (Tospovirus). Análises biológicas (plantas indicadoras), sorológicas (Dot-ELISA) e moleculares (RT-PCR) foram realizadas com intuito de caracterizar alguns isolados de GRSV de amendoim cuja sequência foi identificada por metagenômica. Análises moleculares do gene que codifica a proteína N, amplamente utilizado em trabalhos de taxonomia no gênero Tospovirus, foram também realizadas com os isolados selecionados A1, N1 e O1. Estes três isolados induziram reação sintomatológica em pelo menos uma das espécies indicadoras (Datura stramonium L.) utilizadas nesse trabalho e amplamente citada na literatura. Resultados positivos para estes isolados foram também confirmados por sorologia, evidenciando a presença de GRSV em municípios produtores de amendoim no Estado de São Paulo. Análises filogenéticas para os segmentos L, M e S de tospovírus revelaram que o isolado de GRSV de amendoim estudado neste trabalho agrupou-se com sequências de um isolado de GRSV de melancia (Citrullus lanatus (Thunb.) Matsum. & Nakai) e um isolado recombinante de GRSV e Tomato chlorotic spot virus - TCSV, obtido de tomate (Solanum lycopersicum L.). Entretanto, com a análise filogenética feita com a sequência da proteína N, ficou demonstrado que o presente isolado de amendoim se agrupou com sequências de isolados de GRSV previamente estudado no Brasil. Após análises filogenéticas para as proteínas de todos os segmentos de GRSV, acredita-se que as espécies de GRSV e TCSV compartilham o mesmo segmento M. Comparação das sequências da capa proteica de PeMoV, revelaram que o isolado brasileiro de amendoim relatado neste trabalho está mais relacionado filogeneticamente com um isolado obtido de soja (Glycine max L.), encontrado na Coréia do Sul, apresentando 98% de identidade. Este é o primeiro relato no Brasil e no Mundo das sequências do genoma completo de PeMoV e GRSV em amendoim, por meio do uso de NGS.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-12-14T15:40:55Z No. of bitstreams: 1 Adrielle Naiana Ribeiro Soares.pdf: 757850 bytes, checksum: 1724b4e0309f3e3c95805d3f5a92de61 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-14T15:40:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Adrielle Naiana Ribeiro Soares.pdf: 757850 bytes, checksum: 1724b4e0309f3e3c95805d3f5a92de61 (MD5) Previous issue date: 2014-02-03 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The evaluation of the sanitary quality of seeds is of fundamental importance to the establishment of the peanut crop, with the use of natural products a viable alternative for the control of diseases. The experiments were performed in the laboratories of the Seed and Plant Pathology and Microbiology at the Federal Rural University of Pernambuco / Academic Unit of Garanhuns (UFRPE / UAG) in order to assess the physiological and health potential of peanut seeds cv. BR1 treated with powder and cinnamon extracts. In both experiments the completely randomized design with four replications of 50 seeds was used. In the first experiment, the seeds were treated with different doses of powdered cinnamon (Cinnamomum zeylanicum): 0 (control), 2, 4, 6, 8 and 10 g in the ratio of 2g powder to 81.2 g of seeds and then submitted to the following tests: germination (calculated the percentage of normal and abnormal seedlings), index of germination speed, length and dry weight of seedlings and seed health testing. In the second experiment, the treatments consisted of different concentrations of aqueous extract of cinnamon bark: 0 (control), 5, 10, 15 and 20%, and the same variables were evaluated in the first experiment. In both experiments was assessed the percentage and type of fungus present in the seeds and was detected fungi of the genus Aspergillus niger, Penicillium spp. and Rhizophus spp., having greater control in treatments which used the highest dose of cinnamon powder and concentration of the extract of cinnamon bark. The use of powder and cinnamon extracts were effective against molds and did not affect the seed quality of peanuts. / A avaliação da qualidade sanitária das sementes é de fundamental importância para o estabelecimento da cultura do amendoim, sendo a utilização de produtos naturais uma alternativa viável para o controle de doenças. Os experimentos foram realizados nos Laboratórios de Análise de Sementes e Fitopatologia e Microbiologia na Universidade Federal Rural de Pernambuco/Unidade Acadêmica de Garanhuns (UFRPE/UAG) com o objetivo de avaliar o potencial fisiológico e sanitário de sementes de amendoim cv. BR1 tratadas com pó e extratos de canela. Nos dois experimentos foi utilizado o delineamento experimental inteiramente casualizado, com quatro repetições de 50 sementes. No primeiro experimento as sementes foram tratadas com diferentes doses de pó de canela (Cinnamomum zeylanicum): 0 (testemunha), 2, 4, 6, 8 e 10g, na proporção de 2g de pó para 81,2g de sementes e em seguida submetidas aos seguintes testes: germinação (calculou-se a porcentagem de plântulas normais e anormais), índice de velocidade de germinação, comprimento e massa seca de plântulas e teste de sanidade. No segundo experimento os tratamentos consistiram em diferentes concentrações de extrato aquoso de casca de canela: 0 (testemunha), 5, 10, 15 e 20%, e foram avaliadas as mesmas variáveis do primeiro experimento. Nos dois experimentos foi avaliado a porcentagem e o tipo de fungo presente nas sementes e detectou-se os fungos do gênero Aspergillus niger, Penicillium spp. e Rhizophus spp., havendo maior controle nos tratamentos em que se utilizou a maior dose do pó de canela e concentração do extrato de casca de canela. A utilização de pó e extratos de canela foi eficientes controle de fungos e não afetou a qualidade fisiológica das sementes de amendoim.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-03-14T13:35:25Z No. of bitstreams: 1 Valeska Silva Lucena.pdf: 1217437 bytes, checksum: 33855731b5ae335ab1a9f3ba06e27101 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-14T13:35:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Valeska Silva Lucena.pdf: 1217437 bytes, checksum: 33855731b5ae335ab1a9f3ba06e27101 (MD5) Previous issue date: 2016-08-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Climate changes are affecting the productivity of various crops; among these, the peanut (Arachis hypogaea L.) stands out for its great socio-economic value in tropical and sub-tropical regions to be the fifth most grown oilseed in the world. Water stress is one of the abiotic factors that affect productivity. Although the ecophysiological responses of this species are studied, little is known about the molecular events and their metabolic relationships. This study initially examined the physiological, biochemistry and agronomy response, using the method of canonical variables (VCA) and UPGMA in peanut genotypes subjected to water deficit, contributing to identify tolerant genotypes to drought. Physiological changes and activity of enzymes SOD, CAT and APX were measured in the vegetative stage eight peanut genotypes subjected to six days of total water suspension. From which waterings were re-established and analyzed the agronomic damage of stress. It was found that UPGMA method was more contributory to separate genotypes, especially the CNPA 166 AM early lineage, as the most promising for improvement work. Among the trailing lines to BR1xLViPE-06 (B) showed moderate behavior when subjected to water deficit. At the proteomic level, peptides differentially expressed by 1DE and 2DE, involved in several metabolic routes such as photosynthesis, energy metabolism, antioxidative defense and involved in the response to the water deficit present in different cell compartments were identified. Through the sequencing by MS of the peptides by 1DE the peptides ATP synthase, peroxidase, taraxerol synthase and clathrin involved in the response to the damage suffered in the sensitive genotype LViPE-06 and peptidyl-prolyl-cis trans isomerase, beta-1,3-galactosyltransferase , Phosphatase, cytochrome p450 involved in increased tolerance to drought in Senegal-55437. The tolerant genotype Senegal-55437 was chosen for identification of differentially expressed proteins related to drought tolerance through 2DE. A total of 52 differentially expressed proteins were found, of which 32 were identified in treatment with water stress and six were directly involved in drought tolerance routes. Proteins were involved in redox homeostasis, photosynthesis, beta-oxidation and osmoprotection. Seven proteins were found, all involved in several biotic and abiotic processes, including drought tolerance: kinesin, enoyl-CoA hydratase, photosystem I subunit, AP2 / ERF transcription factor, helicase and defensin-like protein. Pioneering studies for these peanut genotypes contributed to the knowledge and evaluation of the adaptive responses that led to metabolic changes in the identification of promising genotypes. At the same time, it opens perspectives for the validation of new markers that can be used in peanut breeding populations aiming at drought tolerance and maintenance of peanut productivity contributing to food stability in the face of climate change and meeting global demands. / As mudanças climáticas vêm afetando a produtividade de diversas culturas; dentre estas, a do amendoim (Arachis hypogaea L.) que se destaca pelo seu grande valor socioeconômico em regiões tropicais e sub-tropicais por ser a quinta oleaginosa mais cultivada no mundo. O estresse hídrico é um dos fatores abióticos que mais afetam sua produtividade. Embora as respostas ecofisiológicas desta espécie sejam estudadas, pouco se sabe sobre os eventos moleculares e suas relações metabólicas. Neste estudo inicialmente examinou-se a resposta fisiológica, bioquímica, agronômica, utilizando o método de variáveis canônicas (VCA) e UPGMA, em genótipos de amendoim submetidos a déficit hídrico, contribuindo na identificação de genótipos tolerantes a seca. A partir de experimentos com condições controladas as mudanças fisiológicas e da atividade das enzimas antioxidativas SOD, CAT e APX foram mensuradas na fase vegetativa de oito genótipos de amendoim submetidos a seis dias de suspensão hídrica total. A partir do qual as regas foram reestabelecidas e analisadas os danos agronômicos do estresse. Verificou-se que o método de UPGMA foi o mais contributivo na separação dos genótipos, destacando-se a linhagem CNPA 166 AM, precoce, como a mais promissora para trabalhos de melhoramento. Dentre as linhagens rasteiras a BR1 x LViPE-06(B) revelou comportamento moderado quando submetida ao déficit hídrico. Em nível proteômico foram identificados peptídeos diferencialmente expressos por 1DE e 2DE, envolvidos em diversas rotas metabólicas como fotossíntese, metabolismo energético, defesa antioxidativas e envolvidos na resposta ao déficit hídrico presentes em diferentes compartimentos celulares. Através do sequenciamento via MS dos peptídeos por 1DE foram identificados os peptídeos ATP sintase, peroxidase, taraxerol sintase e clatrina envolvidos na resposta ao dano sofrido no genótipo sensível LViPE-06 e peptidil-prolil-cis trans isomerase, beta-1,3-galactosiltransferase, fosfatase, citocromo p450 envolvidos no aumento da tolerância a seca em Senegal-55437. O genótipo tolerante Senegal-55437 foi escolhido para identificação das proteínas diferencialmente expressas relacionadas com tolerância a seca através do 2DE. Um total de 52 proteínas diferencialmente expressas foram encontradas, dentre as quais, 32 foram identificadas em tratamento com estresse hídrico e seis foram diretamente envolvidas em rotas de tolerância à seca. As proteínas estavam envolvidas na homeostase redox, na fotossíntese, na beta-oxidação e na osmoproteção. Sete proteínas foram encontradas, todas envolvidas em vários processos bióticos e abióticos, incluindo a tolerância à seca: kinesina, enoyl-CoA hidratase, subunidade do fotossistema I, fator de transcrição AP2 / ERF, helicase e proteína do tipo defensina. Os estudos pioneiros para estes genótipos de amendoim contribuíram para conhecer e avaliar as respostas adaptativas que culminaram em alterações metabólicas na identificação de genótipos promissores. Ao mesmo tempo, abre perspectivas para validação de novos marcadores que poderão ser utilizados em populações de melhoramento do amendoim visando à tolerância a seca e manutenção da produtividade de amendoim contribuindo para a estabilidade alimentar frente às mudanças climáticas e atendendo as demandas mundiais.

O trabalho objetivou construir um dendograma filogenético das cepas de Aspergillus flavus isoladas de amendoim recém-colhido de quatro regiões de São Paulo (Cafelândia, Jaboticabal, Rosália e Tupã), avaliar o potencial toxigênico e agrupar as cepas quanto à produção de esclerócios. A técnica de AFLP foi utilizada para caracterização genotípica. O potencial aflatoxigênico foi avaliado pelo cultivo das cepas em meio de ágar coco, extração das aflatoxinas por clorofórmio, separação por CCD e quantificação por espectrodenditômetro CS-9000. A indução da produção de esclerócios foi feita pela incubação dos isolados em meio ágar Czapeck-DOX. AFLP gerou 78 fragmentos de 27 pb a 365 pb, sendo 13% não polimórficos. O perfil genotípico revelou 31 haplótipos e de 12 grupos no dendograma. A similaridade entre os isolados variou de 37 a 90 %. O potencial aflatoxigênico revelou 91,7 % de cepas produtoras, com níveis entre 39,27 mg/Kg e 28689,61 mg/Kg para AFB1 e 1,50 mg/Kg a 9781,09 mg/Kg para AFB2. Quanto aos esclerócios, 83,9% das cepas foram produtoras, sendo todas tipo S. / This study aimed to draw a phylogenetic dendogram of Aspergillus flavus strains isolated from fresh harvested peanut from four regions of São Paulo state (Cafelândia, Jaboticabal, Rosália and Tupã), to determine the toxigenic potential and to group them regarding the sclerotia production pattern. The AFLP thecnique was used for genotypic characterization. Aflatoxin production was evaluated by inoculation of fungi in coconut agar, extraction with chloroform, TLC segregation and quantification by spectrophotometer CS-9000. Agar Czapeck-DOX was used to evaluate sclerotia production. AFLP generated 78 fragments varying from 27 pb to 365 pb, 13 % of them were not polymorphic. The genotypic profile showed 31 haplotypes and 12 groups in the dendogram. The similarity among the isolates varied from 37 to 90 %. The aflatoxigenic potential showed 91,7 % of producer strains, with levels between 39,27 mg/Kg and 28689,61 mg/Kg for AFB1 and between 1,50 mg/Kg and 9781,09 mg/Kg for AFB2. Concerning the sclerotia production, 83,9 % of the strains were producers, all were S type.

Orientador: Mara Cristina Pessôa da Cruz / Banca: Felipe Batistella Filho / Banca: Manoel Evaristo Ferreira / Resumo: RESUMO - Existem poucos resultados de pesquisa sobre resposta de cultivares de amendoim do grupo botânico Virgínia à adubação nitrogenada na semeadura e, para a cultivar IAC OL3, de introdução relativamente recente, não há dados disponíveis. Desta forma, foi objetivo com o presente trabalho, avaliar o estado nutricional, a produtividade e o rendimento do amendoim IAC OL3 em função de doses de N aplicadas na semeadura. O experimento foi instalado em Sertãozinho-SP, em área de Latossolo Vermelho argiloso. O delineamento utilizado foi de blocos ao acaso, com cinco tratamentos e cinco repetições. Os tratamentos foram 0, 10, 20, 30 e 40 kg ha-1 de N aplicados na semeadura, usando ureia como fertilizante. A semeadura foi realizada em novembro de 2016 e a colheita foi feita em março de 2017, aos 125 dias após a semeadura. No florescimento foi feita coleta de folhas para avaliação do estado nutricional das plantas e, na colheita, determinou-se: produção de grãos+casca, produção de grãos, rendimento e % de grãos retidos nas peneiras 25, 23, 21 e 19 avos de polegada. Os dados foram submetidos à análise de variância (teste F) e, quando houve efeito significativo das doses de N, aplicou-se teste de comparação de médias (Tukey, 5% de probabilidade). A aplicação de doses de N de até 40 kg ha-1 favoreceu o aumento da concentração de N nas folhas de amendoim. No entanto, acima de 10 kg ha-1 de N não houve ganho de produtividade com o aumento da concentração de N nas folhas. A maior produtivi... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: ABSTRACT - There are few research results on the response of peanut cultivars to nitrogen fertilization and, for the relatively recent introduction IAC OL3, no data are available. Thus, the objective of this work was to evaluate the the nutritional status and the yield of peanut IAC OL3 as a function of N rates applied at sowing. The experiment was installed in Sertãozinho-SP, in a clayey Oxisol area. The experimental design was a randomized block design, with five treatments and five replications. The treatments were 0, 10, 20, 30 and 40 kg ha-1 N applied at sowing, using urea as fertilizer. Seeding was carried out in November 2016 and the harvest was made in March 2017, approximately 125 days after sowing. In the flowering, leaves were collected to evaluate the nutritional status of the plants, and grain yield + bark yield, grain yield, yield, and % of grains retained in sieves 25, 23, 21 and 19 were determined at harvest. Data were submitted to analysis of variance (F test) and, when there was a significant effect of the N doses, a test of comparison of means (Tukey, 5% of probability) was applied. The application of N doses of up to 40 kg ha-1 favored the increase of N concentration in the peanut leaves, but above 10 kg ha-1 of N there was no gain in productivity with the increase of N concentration in the leaves. The highest productivity, 7,318 kg ha-1, was obtained with application of 10 kg ha-1 of N, which represented an increase of 33% in relation to the treatment tha... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Javier Telis Romero / Banca: Ângelo Luiz Fazani Cavallieri / Banca: Maria Aparecida Mauro / Resumo: Atualmente, são investidas grandes quantidades de recursos no desenvolvimento de novas tecnologias para o aproveitamento de subprodutos do setor agrícola e de processos visando à produção de etanol de segunda geração. O beneficiamento do amendoim é um dos setores que mais produzem resíduos, com valores próximos aos gerados pela cultura da canade- açúcar. Uma das tecnologias emergentes envolvidas no tratamento dos resíduos é o ultrassom (US) de potência, o qual vem sendo testado em áreas como pré-tratamento de materiais celulósicos e método combinado para incrementar a velocidade de reação em processos fermentativos. Neste trabalho foi obtido pó de casca de amendoim com tamanho de partícula médio de 963,2 μm e densidade variando com o tamanho de partícula. Sua composição química apresentou matéria seca com 37,1% de celulose, 33,4% de hemicelulose e 15% de lignina. Inicialmente, as suspensões ácidas a serem utilizadas nas hidrólises físicas tiveram suas propriedades físicas determinadas para permitir o cálculo dos parâmetros ultrassônicos. Entre essas propriedades estão a densidade, os parâmetros reológicos e o calor específico, onde não foi verificada influência do pH. Tais propriedades puderam ser modeladas simultaneamente em função da concentração de sólidos e temperatura, através de modelos empíricos e/ou modelos propostos com boa representatividade. Os campos acústicos foram determinados e modelados, indicando maior efeito cavitativo em suspensões menos concentradas quando submetidas a maiores potências aplicadas. Através de um planejamento experimental, nas suspensões de menor concentração de biomassa (em maiores tempos e maior potência aplicada) ocorreu a maior liberação de açúcares totais. Além da consequente liberação de açúcares redutores, as regiões amorfas e cristalinas da celulose puderam ser afetadas. Este fato evidencia... / Abstract: Nowadays, many resources are invested on developing new technologies for agroindustrial by-products utilization and process aiming at the second generation ethanol production. The peanut processing is one of the biggest waste producers, approximating to the waste from sugar cane culture. An emerging technology involved on residues treatment is the power ultrasound (US), which is being tested in areas such as cellulosic materials pretreatment and combined method to increase the reaction velocity in fermentative processes. In this work, powder peanut shells was obtained with an average particle size of 963,2 μm and density ranging according to its partice size. Its chemical characterization presented a dry matter composed by 37,1% of cellulose, 33,4% of hemicellulose and 15% of lignin. Initially, the acid suspension, which will be used in the physical hydrolysis, had its physical properties determined to allow the ultrasonic parameters calculation. Among the properties, there are density, rheological parameters and specific heat, where no influence of pH was verified. These properties could be modeled simultaneously as function of solid concentration and absolute temperature, through empirical and/or proposed models with good accuracy. Acoustic fields were determined and modeled, indicating higher cavitation effect in less concentrated suspensions when submitted to higher applied power. Throughout a experimental design, in suspensions at low biomass concentration (at high treatment time and applied power) occured higher total sugar release. Besides the consequent reducing sugar release, the amorphous and crystalline regions of cellulose could be affected. This fact evidenced the using of high-intensity ultrasound in pretreatment and its possibility as combined method applied to... / Mestre