Orientador: Célio Fernando Baptista Haddad / Banca: Cyntia Peralta de Almeida Prado / Banca: Cinthia Aguirre Brasileiro / Banca: Franscisco Luis Franco / Banca: Luis Olimpio Menta Giasson / Resumo: O Planalto da Ibiapaba é um dos mais importantes fragmentos de floresta úmida do Ceará. Localizado do extremo noroeste do estado, essa região é privilegiada não somente pelas áreas de florestas úmidas, mas também por um mosáico de ambientes ao longo de sua extensão. Consequentemente, a fauna de anfíbios e répteis é extremamente rica se comparada as outras áreas do Bioma Caatinga. Durante dois anos a herpetofauna desse refúgio da vida silvestre foi estudada e os resultados obtidos são apresentados nessa tese. As 121 espécies (38 anfíbios e 83 répteis) encontradas no presente estudo revelam um resultado bastante expressivo, não só pelo fato de ser esta a região com maior riqueza de espécies para o Bioma Caatinga conhecidada até o momento, mas também pelo fato de que o Planalto da Ibiabapa abriga espécies consideradas raras e/ou ameaçadas. Padrões reprodutivos de machos e fêmeas em comunidades de anfíbios também foram investigados, tentando compreender melhor os mecanismos adaptativos das espécies para sobreviver às duras condições impostas pelo clima marcadamente sazonal da Caatinga. A presença no Planalto da Ibiapaba de Adelophryne baturitensis, uma espécie considerada ameaçada e até então conhecida somente para a localidade‐tipo, foi também estudada em maior detalhe e dados inéditos de vocalização, descobertas de novas populações e dados moleculares são apresentados. Ampliações de distribuição e atualizações de distribuição de 14 espécies são também apresentadas nessa tese. Os resultados obtidos mostram a necessidade de preservar os fragmentos de floresta úmida e regiões adjacentes do Planalto da Ibiapaba, além do que são importantes para uma melhor compreensão da ecologia, biogeografia e taxonomia dos anfíbios e répteis de florestas úmidas do Nordeste e de áreas abertas do Brasil, em especial do Bioma Caatinga / Abstract: The Planalto da Ibiapaba is one of the most important fragments of moist forests in the state of Ceará. Located at the Northwestern portion of the state, this region is not only privileged by the presence of moist forest areas, but also by the presence of a mosaic of environments along its extension. Consequently, the fauna of amphibians and reptiles present there is extremely rich if compared to other areas from the Caatinga Biome. During two years the herpetofauna of this wildlife refuge was studied and the results are presented in this thesis. The 121 species (38 amphibians and 83 reptiles) encountered in this study reveal a very expressive result, not only due to the fact that this is the region with the highest species richness for the Caatinga Biome known so far, but also because Planalto da Ibiabapa shelters species considered rare and threatened. Reproductive patterns for males and females in amphibian communities were also investigated, in order to try to understand adaptive mechanisms of the amphibian species to survive the harsh conditions imposed by marked seasonal climate of the Caatinga. The presence in Planalto da Ibiapaba of Adelophryne baturitensis, a species considered endangered and previously known only to its type locality, was also studied in more detail and data from vocalization, discoveries of new populations, and molecular data are here presented. Distribution extensions and upgrades of distribution from 14 species are also presented in this thesis. The results show the need to preserve the moist forest fragments and adjacent areas of the Planalto da Ibiapaba and are also important for the better understanding of ecology, biogeography, and taxonomy of amphibians and reptiles in the moist forests from Northeastern and open areas of Brazil, especially in the Caatinga Biome / Doutor

Orientador: Denise de Cerqueira Rossa-Feres / Coorientador: Vitor Hugo Mendonça do Prado / Banca: Fausto Nomura / Banca: Cinthia Aguirre Brasileiro Professor / Resumo: A diversidade local de espécies pode ser regulada por fatores locais (como competição, perturbação, condições abióticas, dispersão) e regionais (como a história climática, evolução e migração). O objetivo deste estudo foi entender quais fatores locais e da paisagem melhor explicam os padrões de distribuição de espécies de anuros. O estudo foi desenvolvido na região noroeste do Estado de São Paulo, entre julho de 2007 e fevereiro de 2009, empregando duas metodologias de amostragem: 1) armadilhas de interceptação e queda, instaladas no interior de 18 fragmentos florestais, e 2) procura auditiva e visual em 64 corpos d'água da região. Das 37 espécies conhecidas para esta região, 30 foram registradas neste estudo, sendo 13 no interior dos fragmentos florestais e 29 nos corpos d'água. A eficiência de amostragem foi avaliada por rarefação da curva do coletor. A curva do coletor atingiu a assíntota, indicando que para encontrarmos mais uma espécie o efeito amostral deveria ser muito intensificado. Modelos lineares generalizados (GLM) e análise de ordenação foram aplicados aos dados dos fragmentos florestais, incluindo uma variável espacial (coordenadas geográficas) como preditor de riqueza e composição além das variáveis ambientais que descrevem os fragmentos florestais. Para verificar qual variável ou conjunto de variáveis explicam a riqueza e composição de espécies observadas nos corpos d'água, foram aplicadas análises de regressão linear e correlação de matrizes. Se um efeito significativo fosse detectado, isso indicaria que a riqueza e composição de espécies dos fragmentos florestais e/ou corpos d'água seriam formadas por processos de seleção de habitat. Os resultados indicam que nem as características nem a sua localização geográfica dos fragmentos tem efeito significativo... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Species local diversity can be regulated by local (such as competition, disturbance, abiotic conditions) and regional factors (climate history, evolution and migration). The aim of this study was understand which local and landscape factors best explain the distribution patterns of anuran species. The study was developed in the northwestern São Paulo State between july 2007 and february 2009, using two sampling methods: 1) pitfall traps, installed in the interior of 18 forest fragments, and 2) hearing and visual search in 64 ponds located around the forest fragments. We registered 30 of the 37 known species to the study region: 13 in the interior of forest fragments and 29 in ponds. A rarefaction curve was used in the assessment of the sampling efficiency and results indicate that sampling effort should be highly intensified in order to find one more species. We characterize forest fragments and ponds by measuring five and ten environmental variables, respectively. These environmental variables were used as predictors of richness and composition of these habitats. General Linear Models (GLM) and ordination analysis were applied to the forest fragments data, which includes a spatial variable (geographic coordinates) as a predictor of richness and composition besides environmental variables that describe the forest fragments. In order to verify which variable or set of variables would explain the observed species richness and composition in ponds, it was applied linear regression and matrices correlation to the data. If a significant effect was detected, this would indicate that species richness and composition of the forest fragments and/or ponds are shaped by habitat selection processes. Results indicate that neither the fragments characteristics nor their location have significant effect over the species... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-04-25Bitstream added on 2014-06-13T19:18:37Z : No. of bitstreams: 1 esteves_mc_me_botib.pdf: 773522 bytes, checksum: 5cdb7c37b40b5393dc23f66a3e5972de (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Estudos relacionados à ecologia dos anuros vêm aumentando nos últimos anos, buscando compreender a organização das comunidades. O objetivo deste trabalho foi estudar organização de uma comunidade de anuros, analisando: a) a utilização dos micro-ambientes pelos adultos e girinos; b) o turno de vocalização e c) a distribuição temporal de adultos e girinos. As observações foram realizadas no período de julho de 2010 a junho de 2011, no entorno da represa do Ribeirão Lavapés (22º 55’ 23’’ S e 48º 27’ 28’’ W), Botucatu, SP. Foram registradas 17 espécies na fase pós-metamórfica e 12 na fase larval. A maior riqueza foi observada na estação quente e úmida, com 14 espécies. Os micro-habitats amostrados na represa apresentaram similaridade na composição de espécies. Apenas o canal e a poça diferiram na composição. Verificou-se sobreposição na ocupação dos micro-habitats pelos anfíbios, porém os maiores valores foram observados entre espécies menos aparentadas. Apenas sete, dos 17 anfíbios registrados, apresentaram comportamento restrito com relação à ocupação dos micro-habitats, ocorrendo em poucos pontos. Os machos dos hilídeos vocalizaram, predominantemente, empoleirados em vegetação herbácea, no máximo a 40 cm de distância do corpo d’água. As espécies das famílias Leptodactylidae Leiuperidae e Bufonidae apresentaram hábitos terrestre e/ou subaquático. Com relação aos girinos, a maioria ocorreu na estação quente e úmida. Apenas os girinos de Hypsiboas lundii apresentaram um longo período de ocorrência, presentes em 10, dos 12 meses estudados. Houve baixa similaridade entre os pontos quanto a composição de espécies na fase larval. Os girinos de Scinax hiemalis, Leptodactylus furnarius... / Studies concerning anurans ecology have been increased along the years, trying to understand the organization of their communities. The aim of this study was to understand the organization of an anuran community, based on: a) the use of habitats by adults and tadpoles individuals, b) the vocalization turn and c) the temporal distribution of adults and tadpoles. The study was conducted from July 2010 to June 2011, around dam of the Ribeirão Lavapés (22 º 55 '23'' S and 48 º 27' 28'' W), Botucatu, SP. We recorded 17 species in post-metamorphic phase and 12, in the larval stage. The highest richness was observed in the warm and wet season, with 14 species. The micro-habitats sampled in the dam showed similarity in species composition. The channel and pond differ in their composition. There was verified an overlapping among in the occupation of micro-habitats by the amphibians, but the highest values were observed among species less closely related. Seven, of the seventeen amphibians recorded, showed restricted behavior in relation to the occupation of micro-habitats, occurring in a few points. Males of hylid vocalized, predominantly, in the herbaceous vegetation, at 40 cm from the water body. The species of the families Leptodactylidae, Leiuperidae and Bufonidae showed terrestrial and / or subaquatic habits. The majority of tadpoles occurred in the warm and wet season. Only tadpoles of Hypsiboas lundii showed a long period of occurrence, present in 10, of 12 studied months. There was a low similarity among collecting points on the composition of species in the larval stage. Tadpoles of Scinax hiemalis, Leptodactylus furnarius, Leptodactylus fuscus and Dendropsophus sanborni have a restricted behavior in the occupation of micro-habitat. The results showed a predominance of generalist... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-08-30Bitstream added on 2014-06-13T18:40:15Z : No. of bitstreams: 1 trevine_vc_me_rcla.pdf: 3330330 bytes, checksum: 049d570d5b008b595984f2a864d06cd8 (MD5) / As regiões sudeste e sul do Brasil possuem a maior área preservada de Mata Atlântica do país. A maioria dos remanescentes concentra-se na região da Serra do Mar, caracterizada por elevada diversidade e endemismos. Estudos que esclareçam padrões de biodiversidade destas regiões são cada vez mais necessários, uma vez que a supressão territorial e pressões antrópicas persistem de forma contínua. A localidade de Paranapiacaba, município de Santo André, SP, abriga o Parque Natural Municipal Nascentes de Paranapiacaba (PNMNP), a Reserva Biológica do Alto da Serra de Paranapiacaba e uma porção do Parque Estadual da Serra do Mar. A área apresenta um extenso histórico de pesquisa em zoologia, notavelmente em relação aos anuros, sendo a única localidade de ocorrência de Ischnocnema gehrti, Phrynomedusa fimbriata e Hypsiboas cymbalum. Apesar do grande número de dados disponíveis, existe uma escassez de informações sobre a diversidade da herpetofauna da localidade, especialmente em relação aos répteis. O presente trabalho teve como objetivo principal realizar levantamento da fauna de répteis e anfíbios do PNMNP e delimitar seus padrões de diversidade, elaborando uma lista da composição de espécies de Paranapiacaba, assim como um histórico de dados de coleções e aspectos de conservação. A partir da coleta de dados primários e secundários foi encontrada uma riqueza de 136 espécies para Paranapiacaba, distribuídos em 40 espécies de serpentes, 13 de lagartos, dois anfisbenídeos, dois quelônios e 79 anuros. Foram registrados 2053 espécimes de anuros, 205 de lagartos, 44 serpentes e sete quelônios. Deste total, 14 espécies de anuros, 17 serpentes, sete lagartos, dois anfisbenídeos e dois quelônios apresentaram novos registros de ocorrência para a região. O método de rarefação de espécies... / The south and southeast regions of Brazil exhibit the largest portion of preserved Atlantic forests. Most of those remaining fragments are concentrated on the Serra do Mar, which has high rates of diversity and endemism. Scientific work that enlightens biodiversity patterns of those areas are increasingly needed once land suppression and anthropic pressures persist on the environment. Paranapiacaba, Santo André municipality, SP, harbors the “Parque Natural Municipal Nascentes de Paranapiacaba” (PNMNP), the “Reserva Biológica do Alto da Serra de Paranapiacaba” and a portion of the “Parque Estadual da Serra do Mar”. The region has an extensive research historic in zoology, remarkably for anurans, and it is the only known locality of distribution of the species Ischnocnema gehrti, Phrynomedusa fimbriata and Hypsiboas cymbalum. Even though a large amount of data are available, a scarcity of information regarding the diversity of the herpetofauna of the locality remains, especially concerning reptiles. The present work had as a main goal to perform a survey of the reptile and anuranfauna of the PNMNP and to ascertain their diversity patterns, preparing a list of species from Paranapiacaba, Santo André, SP, as well as an historical of data collections and conservation aspects. Considering primary and secondary data collected, a richness of 136 species was found for Paranapiacaba, allocated in 40 species of snakes, 13 lizards, two amphisbenids, two chelonians and 79 anurans. 2053 specimens of anurans, 205 lizards, 44 snakes and seven chelonians were recorded. Fourteen species of anurans, 17 snakes, seven lizards, two turtles and two amphisbaenids were added as a new record of distribution to the region. The species rarefaction and the richness estimator evaluated denoted that... (Complete abstract click electronic access below)

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2009. / Submitted by Allan Wanick Motta (allan_wanick@hotmail.com) on 2010-03-05T17:40:23Z No. of bitstreams: 1 2009_CarlaTatianadeMirandaHonorato.pdf: 1189980 bytes, checksum: 080332f15aa1d206d495e2b3ce7e77a4 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2010-03-08T13:53:24Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_CarlaTatianadeMirandaHonorato.pdf: 1189980 bytes, checksum: 080332f15aa1d206d495e2b3ce7e77a4 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-03-08T13:53:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_CarlaTatianadeMirandaHonorato.pdf: 1189980 bytes, checksum: 080332f15aa1d206d495e2b3ce7e77a4 (MD5) Previous issue date: 2009 / As secreções cutâneas dos anfíbios são reconhecidas como uma rica fonte de peptídeos biologicamente ativos há bastante tempo. Devido as suas propriedades antimicrobianas e ao seu mecanismo de ação que independe da interação com um receptor específico, cada vez mais, os peptídeos isolados dessas secreções vêm sendo considerados como uma opção alternativa aos antibióticos disponíveis comercialmente. Muitas linhagens bacterianas têm apresentado resistência a tais drogas e o fato dos peptídeos antimicrobianos de anuros estarem disponíveis em quantidades satisfatórias na natureza tem facilitado a pesquisa nessa área. O presente estudo teve como objetivo geral proceder à análise peptidômica da secreção cutânea do anuro Eupemphix nattereri com ênfase na prospecção de peptídeos antimicrobianos para aplicações terapêuticas. Como resultados do presente estudo, foram isolados e caracterizados três peptídeos antimicrobianos, denominados nattererinas. As nattererinas identificadas foram sintetizadas quimicamente e apresentaram atividade citolítica contra bactérias Gram positivas e Gram-negativas e baixa atividade hemolítica. Dentre suas propriedades estruturais, podemos ressaltar tratar-se de peptídeos catiônicos (com 30 resíduos de aminoácidos) que adquirem conformação em α-hélice na presença de TFE 50% (v/v). A pesquisa nessa área é de extrema importância, visto que a caracterização dos componentes presentes na secreção cutânea de anuros pode ajudar em identificações taxonômicas, bem como, fomentar a indústria farmacêutica com modelos para o desenho de novas drogas terapêuticas. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Amphibian skin secretions have been knowledge as a rich source of antimicrobial peptides for a long time. The outcome of antibiotic resistant bacterial species is an increasing problem, which encourages the search of new compounds in nature, for example, over anurans’ skin secretion. Due to its antimicrobial properties and mechanism of action, which is independent of specific receptors, these peptides have been considered as an alternative to the available antibiotics. The present study describes peptidômica analysis of the cutaneous secretion from the frog Eupemphix nattereri, focusing on antimicrobial peptides. As results of the present work, three antimicrobial peptides, named nattererins, were isolated and characterized. The identified nattererins were synthesized and tested against Gram-positive and Gram-negatives bacteria showing antimicrobial activity and low hemolytic activity. Nattererins are cationic peptides (30 amino acid residues long) and adopt an α-helical conformation in the presence of TFE 50% (v/v). Regarding the obtained results, naturally occurring bioactive peptides from amphibian skin can be a source of pharmaceutically interesting compounds, which endorses a higher investment in this kind of study. In addition, these peptides also can help in the taxonomy of anurans species.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília,Instituto de Ciências Biológicas, 2011. / Submitted by Shayane Marques Zica (marquacizh@uol.com.br) on 2011-09-05T19:01:30Z No. of bitstreams: 1 2011_DeboraLeiteSilvano.pdf: 11541396 bytes, checksum: 06305791209d82c6d9c09937389dceca (MD5) / Approved for entry into archive by LUCIANA SETUBAL MARQUES DA SILVA(lucianasetubal@bce.unb.br) on 2011-09-20T15:59:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_DeboraLeiteSilvano.pdf: 11541396 bytes, checksum: 06305791209d82c6d9c09937389dceca (MD5) / Made available in DSpace on 2011-09-20T15:59:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_DeboraLeiteSilvano.pdf: 11541396 bytes, checksum: 06305791209d82c6d9c09937389dceca (MD5) / O Brasil é o país que possui a maior diversidade de anfíbios do mundo, mas oconhecimento e, principalmente, as ações de conservação acerca desta fauna ainda émínimo. Os anfíbios são animais globalmente ameaçados, com populações em francodeclínio distribuídas por todo o mundo e com significativa concentração na regiãoneotropical e por isso merecem uma atenção especial. O Cerrado, um dos hotspots paraconservação da biodiversidade mundial, se destaca pela falta de conhecimento epolíticas de conservação adequadas. Este estudo teve como objetivo geral avançar noconhecimento sobre a fauna de anfíbios anuros no Cerrado, avaliar o estado atual efuturo de conservação deste grupo no bioma e fornecer subsídios para políticas eestratégias de conservação necessárias. No primeiro capítulo buscamos determinar osfatores ambientais contemporâneos e histórico-evolutivos que melhor predizem ospadrões de distribuição da riqueza de espécies e diversidade filogenética dos anfíbios noCerrado. Verificamos que riqueza e diversidade filogenética são dois componentesdistintos da biodiversidade e apresentam diferentes respostas a variáveis ambientais e,consequentemente, possuem distribuições geográficas distintas. A riqueza de anurosconcentra-se entre as regiões central e sudeste do Cerrado enquanto que a diversidadefilogenética concentra-se principalmente nas regiões central e norte. O segundo capítuloé uma previsão dos efeitos das mudanças climáticas e da perda de hábitat sobre espéciesde anfíbios endêmicas do bioma. Neste estudo, nós modelamos a distribuição potencialde espécies de anfíbios anuros endêmicas do Cerrado em resposta a uma média decenários de mudanças climáticas previstas para 2050. Estes modelos foram associados amodelos de previsão da degradação de habitat no Cerrado, em 2050, com o objetivo deavaliar não somente os efeitos das mudanças climáticas sobre esses animais, mastambém os efeitos da sinergia entre a perda de habitat e mudanças climáticas. Asanálises foram realizadas em dois cenários distintos: com e sem restrições à dispersãodas espécies. No cenário mais realista (com restrição), a maioria das espécies vai sofrermais contração do que expansão de áreas adequadas à sua ocorrência em 2050. Adireção predominante de deslocamento para o sudeste é preocupante, uma vez que asáreas do sudeste são as mais perturbadas e densamente povoadas do Brasil. Se aocupação humana no Cerrado continuar em direção ao norte, como esperado, aproporção de habitats naturais restantes será tão pequena que a riqueza de anfíbios seráreduzida para menos da metade. O terceiro e último capítulo trata de prioridades para aconservação da diversidade evolutiva dos anfíbios no Cerrado. Neste estudo realizamosuma análise de lacunas para avaliar o estado de proteção de espécies endêmicas deanuros do Cerrado. Em seguida, selecionamos áreas prioritárias para a conservaçãodesse bioma com base em uma abordagem de planejamento sistemático da conservação,incluindo também atributos das espécies como critérios de priorização. Cinquenta eduas espécies são consideradas espécies-lacuna, sendo que 19 delas estãocompletamente fora de Unidades de Conservação. As áreas prioritárias estão localizadasna porção central do Cerrado, e incluem vales de rios e montanhas. As áreas prioritáriasselecionadas aqui são também as regiões mais ricas e que possuem a maior diversidadefilogenética do bioma, demonstrando seu alto potencial para a conservação da históriaevolutiva das linhagens no Cerrado. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Brazil is well known as the world leader in amphibian diversity and also for the scarcityof knowledge and actions to promote amphibian conservation. Amphibians areexperiencing population decline all over the world, especially in the neotropics bringingto them special attention. Regarding to Cerrado biome, a biodiversity hotspot forconservation, lack of knowledge and appropriate conservation policies stands out. Thiswork aimed to bring and advance on knowledge about the Cerrado anurans’ fauna in theapproaching it through the evaluation of current and future scenarios about amphibianconservation status. The body of knowledge produced here provided information forconservation strategies and policies. In the first chapter we look after historical andcontemporary environmental factors that best predict the distribution patterns of speciesrichness and phylogenetic diversity of amphibians in the Cerrado. We found thatrichness and phylogenetic diversity are two distinct components of biodiversity, whichare differently impacted by environmental variables and consequently showing differentgeographical distributions. The richness is concentrated between the central andsoutheast of Cerrado while the phylogenetic diversity is concentrated mainly in centraland north areas. The second chapter aimed to investigate models that can predict howclimate changes and habitat loss will affect amphibian species endemic to the biome. Inthis study, we modeled the potential distribution of three endemic or nearly endemicspecies to this biome in response to an average of projected climate changes scenariosfor 2050. These models were associated with predictive models of habitat degradationin Cerrado in 2050, aiming to evaluate not only the effects of climate change on theseanimals, but also the effects of synergy between climate changes and habitat loss.Analyses were performed in two different scenarios: with or without species dispersalrestrictions. In the more realistic scenario (with dispersal restrictions), most species willsuffer with contraction of area suitable for their occurrence in 2050. The predominantdirection of dispersal to the southeast is worrying, since the areas of the southeast areamong the most disturbed and densely populated areas of Brazil. If human occupationin the Cerrado continue northward, as expected, the proportion of remaining naturalhabitats will be so small that the richness of amphibians will be reduced to less than halfof what we have right now. The third and final chapter deals with priorities to promoteevolutionary diversity conservation of amphibians in the Cerrado. In this study weapplied the gap analysis methodology to assess the state of endemic species protection.Based on our results, conservation priority areas were selected taking into account asystematic planning approach for conservation, where specie attributes was taken asprioritization criteria. Fifty-two species were considered gap species, with 19 of themcompletely out of protected areas. The priority areas were located in the central portionof the Cerrado, and include river valleys and mountains. The priority areas selected herewere showed the richest and greatest phylogenetic diversity of the biome, demonstratingits high potential for evolutionary history conservation of amphibian lineages in the Cerrado.

Submitted by Geyciane Santos (geyciane_thamires@hotmail.com) on 2015-08-24T13:47:26Z No. of bitstreams: 1 Dissertaçao - Rommel Roberto Rojas Zamora.pdf: 13957441 bytes, checksum: 0166fb38e9a1d74cba0a955065ad3480 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-08-28T15:03:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertaçao - Rommel Roberto Rojas Zamora.pdf: 13957441 bytes, checksum: 0166fb38e9a1d74cba0a955065ad3480 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-08-28T15:09:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertaçao - Rommel Roberto Rojas Zamora.pdf: 13957441 bytes, checksum: 0166fb38e9a1d74cba0a955065ad3480 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-08-28T15:09:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertaçao - Rommel Roberto Rojas Zamora.pdf: 13957441 bytes, checksum: 0166fb38e9a1d74cba0a955065ad3480 (MD5) Previous issue date: 2014-02-24 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Amazophrynella is a genus of the family Bufonidae. Actually the genus remains problematic taxonomically; the difficulty lays principally in the lack of diagnostic characters in the original description of A. minuta, the lack of molecular data and refined taxonomic comparison of individuals through its wide distribution. In this study a partial taxonomic revision of the genus Amazophrynella was performed; especially trying to reveal the evolutionary and biological diversity hidden in the A. minuta complex. The study was conducted integrating several sources of data: (1) phylogenetic, using the 16S rRNA; (2) morphometric, through the principal component analysis measures of organisms; (3) bioacoustics, by comparison of the advisement calls, and (4) morphological, by comparing meristic characters. Our results showed the existence of eight linages of Amazophrynella, four of which are known nominal species and the other four strains represent potential new species. The genetic distances showed a high divergence between all strains (higher than 4%). The comparison of the bioacustic data showed differences in frequency, note size, and number of pulses, while the principal component analysis indicated differences in size and shape between some phylogenetic lineages found. With the need to improve the taxonomy of the genus, A. minuta was redescribed based on topotypes collected at the type locality, generating new diagnostic characters and a more complete description of the species. Two phylogenetic linages of the genus found in this study were described morphologically; observing profound morphological differences between them. Based on our results, we suggest continuing studies of this genus. / Amazophrynella é um gênero da família Bufonidae que durante muito tempo não recebeu um tratamento taxonômico adequado; como por exemplo a espécie A. minuta; que provavelmente representa um complexo de espécies. No presente estudo foi realizada uma revisão da taxonômica e sistemática do gênero Amazophrynella; especialmente tentando revelar a diversidade biológica e evolutiva críptica no complexo A. minuta. O estudo foi realizado integrando dados filogenéticos, utilizando o gene 16S rRNA, morfométricos, através dos análises de componentes principais das medidas dos organismos, bioacústicos, pelo análises e comparação dos cantos de anúncio, e morfológicos, através da comparação de caracteres merísticos de todas as quatro espécies conhecidas do gênero. Nossos resultados filogenéticos mostraram a existência de oito linhagens de Amazophrynella; quatro dos quais são espécies nominais conhecidas e as outras quatro linhagens representam potenciais espécies novas. As distâncias genéticas mostraram uma alta divergência entre todas as linhagens (maior que 4%). A comparação dos cantos de anúncio mostraram diferenças nas frequências, tamanho da nota, e número de pulsos e as análises de componentes principais indicaram divergências na forma e tamanho entre algumas linhagens filogenéticas encontradas. Com a necessidade de melhorar a taxonomia do gênero, A. minuta foi redescrita com base em topótipos coletados na localidade tipo, gerando novos caracteres diagnósticos e uma descrição mais completa da espécie. Duas linhagens do gênero encontradas neste trabalho foram descritas morfologicamente; observando-se profundas diferenças morfológicas entre elas. Baseado em nossos resultados, sugerimos a continuidade dos estudos integrativos deste gênero.

Orientador: Virgínia Sanches Uieda / Coorientador: Fernando Ribeiro Gomes / Banca: Geise Valentina Melo / Banca: Reginaldo Donatelli / Banca: Renata Cristina Batista Fonseca / Banca: Silvio César de Almeida / Resumo: A coexistência de espécies em uma determinada comunidade é possibilitada, entre diversos fatores, pela partilha dos recursos disponíveis. As pressões seletivas que determinam o padrão de ocupação pelas espécies podem estar diretamente relacionadas à morfologia das mesmas. No presente trabalho foi investigada a relação do tamanho corporal e da morfologia na distribuição espacial e temporal de 42 espécies de anfíbios anuros. A hipótese do estudo é que o tamanho influencia na ocupação do habitat e no hábito das espécies. Características morfológicas foram analisadas em relação à distribuição temporal e a índices ecológicos (distribuição espacial) utilizando abordagens convencionais e filogenéticas. Os resultados indicam que espécies menores são mais abundantes do que espécies de grande porte e que não houve variação expressiva dos valores de massa total (biomassa) dentro das classes de tamanho ao longo do período de estudo. Houve restrição na distribuição das espécies em relação ao tamanho. A análise de componentes principais evidenciou relações morfológicas de comprimento e largura que remetem às formas corporais típicas de anuros de determinados hábitos e hábitats. A análise de Morisita-Horn indicou alta sobreposição quanto à ocupação temporal do ambiente entre as classes de tamanho. Análises descritivas indicaram diferenças na ocupação de hábitat e no hábito entre anuros de tamanhos diferentes. O teste de Kruskal-Wallis não indicou relação entre o comprimento rostro-cloacal e o hábito dos anuros. No entanto, os resultados indicaram que espécies com diferentes massas apresentam hábitos e abundâncias distintas. Foi detectado sinal filogenético para três dos quatro componentes principais testados, como também para quatro dos sete índices ecológicos testados. Os resultados indicam que os índices ecológicos estão relacionados com a morfologia dos anuros, sugerindo que ... / Abstract: The species coexistence in a given community is possible in function of species resources partitioning, among many other factors. The selective pressures which determine the pattern of occupation by species may be directly related to their morphology. In the present study, we investigated the relationship of body size and morphology of 42 species of anurans with their spatial and temporal distribution. The study hypothesis is that body size influences their habitat and behavior. Morphological characters were analyzed regarding to temporal distribution and to ecological indexes (spatial distribution) using conventional and phylogenetic approaches. The results indicate that smaller species are more abundant than large ones, and that there was no significant variation in of total mass (biomass) when analyzed per size classes. There were constraints in species distribution regarding to size. The principal components analyses revealed morphological relations of length and width that refer to typical anurans body shapes of certain habits and habitats. The analysis of Morisita-Horn showed high temporal overlap on the environment occupation between size classes. Descriptive analyses indicated differences in habitat occupation and habit among frogs of different sizes. The Kruskal-Wallis test indicated no relationship between snout-vent length and the habit of anurans. However, the results indicated that species with different body masses have different habits and abundances. Phylogenetic signal was detected in three of four principal components tested, as well as in four of seven ecological indexes tested. The results indicate that environmental indexes are related to anurans morphology, suggesting that environment type and how it is occupied are good predictors to infer body shape. The results indicated that size, duration and regime of water bodies do not influence size and morphology of adult anurans. These ecological factors may be more ... / Doutor

Orientador: Célio Fernando Baptista Haddad / Banca: Maria Laura Ponssa / Banca: Hélio Ricardo da Silva / Banca: Boris Leonardo Blotto Acuna / Banca: Paulo Christiano de Anchietta Garcia / Resumo: O gênero Adenomera é composto por 16 espécies, das quais seis possuem distribuição restrita à Mata Atlântica. O grupo apresenta uma taxonomia complicada por apresentar espécies crípticas, com alto grau de polimorfismo intraespecífico e interespecífico. Recentemente, uma análise filogenética extensa, abrangendo grande parte da distribuição das espécies do gênero, 35 espécies candidatas foram propostas; 16 na Mata Atlântica. No presente trabalho, propomos testar se as espécies candidatas distribuídas na Mata Atlântica compõem um grupo monofilético. Usando uma abordagem interativa com dados diretos de morfologia externa e bioacústica, pudemos delimitar espécies dentro dos clados Thomei e Marmorata. A maior amostragem dados fenotípicos e de um fragmento do gene 16S de indivíduos da Mata Atlântica na análise, permitiu inferir com maior confiança que as espécies distribuídas na Mata Atlântica compõem um grupo monofilético (clados Thomei + Marmorata), irmão do clado Hylaedactyla + Martinezi. O material adicional nos permitiu delimitar e redescrever duas espécies previamente consideradas como um complexo de espécies (Adenomera marmorata e A. bokermanni). Das 16 espécies candidatas do clado Mata Atlântica previamente sugeridas, pudemos delimitar apenas 10 espécies sendo sete já conhecidas e três novas para a Ciência. / Abstract: The genus Adenomera has 16 species, six of which are Atlantic Forest dwellers. The genus has a difficult taxonomy, mostly due to the high levels of intra and interspecific polymorphism. Recently, a phylogenetic analysis using samples collected through the whole geographic distribution of the genus (roughly tropical and temperate cis-Andean South America) suggested the existence of 35 candidate species; 16 of which being Atlantic Forest dwellers.The present contribution intends to test whatever the Atlantic Forest dwellers are a monophyletic unit. An integrative approach with directly observed data on morphology and bioacoustics allowed species delimitation within the Thomei and Marmorata Clades. Based on a denser sampling of phenotipic and 16S rRNA fragments, we recovered the Atlantic Forest dwellers are a monophyletic unit, with two major clades (Thomei + Marmorata) and sister to the Hylaedactyla + Martinezi clade. The additional material allowed the delimitation and redescritpion of two species previously understood as species complexes (Adenomera marmorata and A. bokermanni). Of the 16 Atlantic Forest dwellers candidate species, we could delimit only 10; seven of those assignable to previously described species / Doutor

Orientador: Denis Otavio Vieira de Andrade / Banca: José Eduardo de Carvalho / Banca: Kênia Cardoso Bicego / Abstract: As ectotherms, amphibians may experience wide fluctuations in body temperature and, due to their high skin permeability, terrestrial species face a constant risk of desiccation. These two variables (temperature and dehydration) are centrally relevant for water balance regulation because they directly affect water flux through the integument, i.e. skin evaporative water loss (EWLSkin) and water uptake (WU). In addition, as nearly all anurans are lung breathers, the respiratory water loss (EWLResp) will add to EWLSkin. Although the contribution of EWLResp to total EWL (EWLTotal) is generally assumed to be negligible, the partitioning between EWLSkin and EWLResp varies among species and is affected by temperature and dehydration. Therefore, we investigated the combined effects of temperature and dehydration on the rates of EWL through the skin and the lungs of the terrestrial toad, Rhinella schneideri. Subsequently, we evaluated how water uptake (WU) through the pelvis skin was affected by temperature and dehydration. To this aim, we measured rates of EWLTotal and EWLSkin in intact and masked adult toads at 15, 25 and 35 oC under fully hydrated condition and dehydrated until they have lost 10% and 20% of their initial body mass. Masked toads were able to breath normally during the measurement of EWLSkin; EWLResp was calculated as EWLTotal minus EWLSkin. Rates of EWL were also determined using biophysical agar models of R. schneideri specimens, which allowed the estimation of ski... (Complete abstract click electronic access below) / Resumo: Como animais ectotérmicos, os anfíbios experimentam longas flutuações na temperatura corpórea e, devido à sua alta permeabilidade cutânea, eles também enfrentam o risco constante da dessecação. Essas duas variáveis (temperatura e desidratação) são muito relevantes no contexto do balanço hídrico dado que elas afetam diretamente o fluxo de água através da pele, ou seja, a perda evaporativa de água (PEAPele) e a absorção de água (RE). Além disso, dado que a maioria dos anuros possuem respiração pulmonar, a perda de água respiratória (PEAResp) irá se adicionar à cutânea. Embora a contribuição da PEAResp para a perda de água total (PEATotal) seja geralmente considerada insignificante, a divisão entre PEAPele e PEAResp varia de acordo com as espécies e é afetada pela temperatura e desidratação. Portanto, nós investigamos os efeitos combinados da temperatura e desidratação nas taxas de PEA através da pele e pulmões no sapo terrestre, Rhinella schneideri. Posteriormente, avaliamos como a absorção de água através da pele ventral (RE) foi afetada pela temperatura e desidratação. Para isso, medimos as taxas de PEATotal e PEAPele em sapos adultos intactos e mascarados à 15, 25 e 35 oC e desidratados até perderem 10% e 20% da massa corpórea inicial. Os sapos mascarados foram capazes de respirar normalmente durante a medição da PEAPele; PEAResp foi calculado como PEATotal menos PEAPele. As taxas de perda de agua também foram determinadas usando modelos de ágar de espécimes de R. schneideri... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre