A pele dos anfíbios atua como primeira barreira de proteção contra microorganismos invasores. Além dos componentes mecânicos, essa proteção deve incluir mecanismos bioquímicos e biológicos derivados tanto da comunidade microbiana ali residente quanto da secreção de moléculas bioativas a partir de glândulas dérmicas. Os objetivos gerais deste estudo foram: caracterizar a comunidade microbiana hospedada pela espécie Proceratophrys boiei e analisar a sua relação com comunidades microbianas ambientais; avaliar se nessa espécie a microbiota e a secreção cutâneas podem ser entendidas como um componente de proteção; avaliar a estabilidade de tais componentes a partir de diferentes populações em fragmentos florestais. Especificamente, as seguintes hipóteses foram testadas: 1. A composição da microbiota ambiental varia entre os fragmentos e micro-hábitats de Floresta Atlântica amostrados e tem relação com alguns parâmetros ambientais analisados; 2. A diversidade da microbiota cutânea de P. boiei é relacionada à diversidade da microbiota nos ambientes que ocupa. Ademais, em termos de composição, a microbiota cutânea é um subconjunto da microbiota ambiental que ocorre nos seus micro-hábitats; 3. A riqueza e abundância de bactérias da microbiota cutânea de P. boiei varia entre os diferentes remanescentes de Floresta Atlântica; 4. A riqueza e a abundância de bactérias presente na pele de P. boiei com atividade antimicrobiana varia entre populações ou locais de amostragem; 5. Existe efeito antimicrobiano das secreções sobre alguns patógenos e os perfis das secreções cutâneas diferem entre populações de P. boiei. Os resultados mostraram que a microbiota cutânea de P. boiei apresenta variações entre indivíduos e populações. Além disso, a qualidade do hábitat pode ser importante para a composição de bactérias hospedadas. Existe um compartilhamento de bactérias entre a microbiota cutânea de P. boiei e os micro-hábitats solo e água, ocupados por essa espécie, porém as comunidades dérmicas compõem-se principalmente por bactérias não detectadas nas amostras ambientais analisadas. Foi observada certa estabilidade na estrutura da microbiota cutânea de P. boiei quando analisadas populações distintas, mas variações na distribuição de morfotipos bacterianos em uma mesma localidade ocorre. Microbiota cutânea e secreções dérmicas de P. boiei podem prevenir infecções na pele, dada a atividade antimicrobiana demonstrada nesta pesquisa. Contudo, variações nos espectros de ação foram observadas em ambos os componentes, assim como, diferenças populacionais nas abundâncias e percentuais de bactérias produtoras de antimicrobianos. O estudo também demonstrou que certas características independem do contexto ambiental ocupado pelas populações, uma evidência de que o microambiente da pele dessa espécie oferece condições e certa estabilidade para a colonização de comunidades bacterianas específicas. A sustentabilidade de populações dessa espécie pode estar relacionada às interações entre hospedeiro, microrganismos e ambiente. / The skin of amphibians acts as first barrier of protection against invading microorganisms. Besides the mechanical components, this protection probably include biochemical and biological mechanisms derived from both the resident microbial community and the secretion of bioactive molecules from dermal glands. The aims of this study were to characterize the microbial community hosted by Proceratophrys boiei and analyse its relationship with environmental microbial communities; evaluate whether microbiota and skin secretion of this species can be understood as a protection component; evaluate the stability of these components through different populations in forest fragments. Specifically, the following hypotheses have guided this research: 1. The composition of environmental microbiota varies among microhabitats and fragments of Atlantic Forest and relates to some environmental parameters; 2. The diversity of skin microbiota of P. boiei relates to the diversity of microbes in the environment it occupies. Furthermore, in terms of composition, the skin microbiota is a subset of environmental microbes that occurs in its microhabitat; 3. The richness and abundance of bacteria from the skin microbiota of P. boiei varies between different remnants of Atlantic Forest; 4. The richness and abundance of bacteria present on the skin P. boiei with antimicrobial activity varies between populations or sampling sites; 5. There is antimicrobial activity of the skin secretions against some pathogens and its profiles differ between populations of P. boiei. The results showed variations on the microbial skin of P. boiei between individuals and populations and the quality of habitats could be important for the composition of hosted community. There is a sharing of bacteria between the skin microbiota of P. boiei and the microbial communities of microhabitats soil and water. However, mainly bacteria not detected in environmental samples composes the dermal communities. We observed some stability in the structure of the skin microbiota when analysed different populations, but variations in the distribution of bacterial morphotypes occurs in all sites. Skin microbiota and dermal secretions of P. boiei can prevent infection through the skin, according to the antimicrobial activity demonstrated in this study. There were variations in the action spectrum for both components, but population differences were mainly in abundance and percentage of bacteria producing antibiotics. This research showed the importance of the microbiota and skin secretion of P. boiei as components of protection and the importance of the environment for the composition of these associated communities. At the same time, we have shown that certain characteristics are independent of the environmental context occupied by the population, evidence that the microenvironment of the skin provides a certain stability for the colonization of specific bacterial communities. The sustainability of populations of this species may relates to interactions between host organisms and the environment.

Orientador: Luciana Bolsoni Lourenço Morandini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-20T20:53:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rodrigues_DeboraSilva_M.pdf: 3296545 bytes, checksum: 2a2ccc454f9a1df9f09173c2127af330 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: O gênero Engystomops apresenta ampla distribuição geográfica e constitui um interessante grupo de anuros para estudos cariotípicos. As populações de Engystomops encontradas na Amazônia têm sua identificação taxonômica ainda controversa. Análises genéticas e citogenéticas apoiam hipóteses que sugerem a existência de um complexo de espécies crípticas e especiação incipiente. Muitas vezes a variação citogenética observada entre diferentes populações estudadas dificultou o reconhecimento de homeologias cromossômicas entre os cariótipos. Uma caracterização cromossômica mais detalhada poderia auxiliar no possível reconhecimento de homeologias cromossômicas e, dessa forma, contribuir para o estudo dos processos envolvidos na divergência desses anuros. Já que o gene do DNAr 5S tem sido importante marcador genético e citogenético para estudos evolutivos e para a identificação e comparação de espécies em diversos grupos, no presente trabalho o DNAr 5S de Engystomops freibergi e de exemplares de Engystomops petersi de duas localidades Equatorianas (Puyo e Yasuní) foi estudado. Em todos os casos, dois tipos de DNAr 5S, facilmente diferenciados pelo tamanho e composição da sequência do seu espaçador não transcrito, foram isolados. A provável região promotora do gene do RNAr 5S (ICR) foi localizada nos dois tipos de sequências de DNAr 5S e a presença de possíveis sequências regulatórias adicionais foi discutida. No cariótipo de E. freibergi, sonda contendo a unidade repetitiva do DNAr 5S tipo I hibridou na região pericentromérica do braço curto dos cromossomos do par 3, e o DNAr 5S tipo II foi mapeado na região distal do braço longo dos cromossomos do par 6. A sonda formada somente pela região de NTS do DNAr 5S tipo I claramente detectou a região pericentromérica de 3p nos cariótipos de E. freibergi e E. petersi (Puyo) e de 5p no cariótipo de E. petersi (Yasuní), porém nenhum sinal distal ou intersticial foi observado. A sonda formada pela região de NTS do DNAr 5S tipo II detectou apenas a região distal de 6q nos três cariótipos estudados, corroborando a distribuição diferencial dos dois tipos de DNAr 5S nesses cariótipos. Tais sítios de DNAr 5S constituem novos marcadores cromossômicos, os quais permitem sugerir a homeologia entre o cromossomo 6 dos cariótipos de E. freibergi e de E. petersi, e entre o cromossomo 5 do cariótipo de E. petersi de Yasuní e o cromossomo 3 dos cariótipos de E freibergi e de E. petersi de Puyo. Já que os dois tipos de DNAr 5S encontrados em Engystomops são relacionados àqueles de Physalaemus tanto quanto à composição nucleotídica quanto à localização cromossômica, é ainda possível inferir que a origem desses dois tipos de sequências tenha antecedido a divergência evolutiva desses gêneros / Abstract: The Engystomops genus is widely distributed geographically and constitutes an interesting group for karyotypic studies. The taxonomic identifications of Amazonian populations of Engystomops is still controversial. Genetic and cytogenetic analyses suggest the existence of a complex of cryptic species and incipient speciation. The cytogenetic variations found among some populations prevent the recognition of chromosomal homeologies between the described karyotypes. A more detailed chromosomal characterization could help in the recognition of chromosome homeologies and, therefore, could contribute to the study of the processes involved in the divergence of these anurans. Since the 5S rDNA gene has been an important genetic and cytogenetic marker for evolutionary studies and even for the identification and comparison of species in diverse groups, in the present work the 5S rDNA of Engystomops freibergi and exemplars of Engystomops petersi from two Ecuadorian locations (Puyo and Yasuní) was studied. In all cases, two types of 5S rDNA, easily differed by size and compositon of their non-transcribed spacer, were isolated. A putative promoting region of the 5S rRNA gene (ICR) was recognized in the two types of 5S rDNA sequences and the presence of possible additional regulatory sequences was discussed. In the E. freibergi karyotypes, the entire type I 5S rDNA repeating unit hybridized to the pericentromeric region of 3p, whereas the entire type II 5S rDNA repeating unit mapped to the distal region of 6q, suggesting a differential localization of these sequences. The type I NTS probe clearly detected the 3p pericentromeric region in the karyotypes of E. freibergi and E. petersi from Puyo and the 5p pericentromeric region in the karyotype of E. petersi from Yasuní, but no distal or interstitial signals were observed. Interestingly, this probe also detected many centromeric regions in the three karyotypes, suggesting the presence of a satellite DNA family derived from 5S rDNA. The type II NTS probe detected only distal 6q regions in the three karyotypes, corroborating the differential distribution of the two types of 5S rDNA. Because the 5S rDNA types found in Engystomops are related to those of Physalaemus with respect to their nucleotide sequences and chromosomal locations, their origin likely preceded the evolutionary divergence of these genera. In addition, our data indicated homeology between chromosome 5 in E. petersi from Yasuní and chromosomes 3 in E. freibergi and E. petersi from Puyo. In addition, the chromosomal location of the type II 5S rDNA corroborates the hypothesis that the chromosomes 6 of E. petersi and E. freibergi are homeologous despite the great differences observed between the karyotypes of the Yasuní specimens and the others / Mestrado / Biologia Celular / Mestre em Biologia Celular e Estrutural

Submitted by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-09-11T18:08:26Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Sílvia_de_Pinho.pdf: 2440725 bytes, checksum: 0f35b4a66052c13674ec5fb447b060f8 (MD5) / Approved for entry into archive by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-09-11T18:09:37Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Sílvia_de_Pinho.pdf: 2440725 bytes, checksum: 0f35b4a66052c13674ec5fb447b060f8 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-11T18:09:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Sílvia_de_Pinho.pdf: 2440725 bytes, checksum: 0f35b4a66052c13674ec5fb447b060f8 (MD5) Previous issue date: 2018-04-20 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / As interações biológicas têm um papel importante na regulação e manutenção das populações naturais. Assim como a maioria destas interações, o parasitismo pode ser influenciado pelo ambiente, com as mudanças causadas pelas atividades antrópicas podem afetar profundamente o equilíbrio das assembleias dos organismos hospedeiros. Diante disto, nosso trabalho procurou descrever, a composição e riqueza dos hemoparasitos de anuros presentes em dois ambientes, inseridos no Bioma Amazônico, no leste do Pará, Brasil. Caracterizamos os grupos de hemoparasitos mais frequentes, e se o tipo de infecção hemoparasitária está relacionada com hábitat do anuro (arborícola ou terrestre). Coletamos 128 anuros nos dois ambientes, em duas expedições realizadas nos períodos de abril de 2016 e 2017, que correspondem a estação de chuva na região. No laboratório foram realizados esfregaços sanguíneos e imprint do fígado para identificação do parasito. No total foram registrados sete táxons distintos de hemoparasitos em 55 anuros (43%). Nas áreas de plantação haviam mais espécimes infectados e com infecções mistas que em áreas de floresta. Parasitos do gênero Trypanosoma foram os mais frequentes, ocorrendo em 67% dos anuros infectados nos dois ambientes, com a identificação de seis grupos morfológicos distintos, encontrados principalmente em anuros terrestres. Foram identificados dois grupos distintos de Hemogregarinas em seis espécimes de anuros mais parasitados, encontradas principalmente nos de hábito terrestre. Registramos a presença de um parasito do Filo Apicomplexa não identificado em espécimes de Trachycephalus typhonius, que provavelmente se trata de um táxon novo e será estudado a posteriori. / Biological interactions play an important role by maintaining and regulating natural populations. As most interactions, parasitism may be influenced by the environment, with anthropogenic changes caused by humans strongly affecting the equilibrium in biological assemblages of their hosts. Herein, we described and analyzed the hemoparasites richness and composition in anurans from oil palm crops and surrounding forest fragments in the eastern Amazon, Brazil. In addition, we analyzed which hemoparasites are most frequent and whether the type of infection is related with anurans habits (terrestrial or arboreal). We collected 128 anurans in both environments (forest and oil palm plantations) during rainy season, in April 2016 and 2017. In the laboratory, we collected blood samples from each individual, and carried out smear and imprint methods of their livers to identify the parasites. We found seven hemoparasites groups in 55 individuals (43%) in both habitats. In oil palm plantations, there were more infected specimens and more mixed infections than in forests. Parasites of the genus Trypanosoma were the most frequent, found in 67% of infected anurans in both environments. Besides, we identified six distinct morphological groups, mainly in terrestrial anurans. We found two distinct Haemogregarines groups in six anurans, most terrestrial. In addition, we found an Apicomplexa parasite in specimens of Trachycephalus typhonius, which is probably a new taxon and will be studied a posteriori.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-09-05T15:03:40Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_ComposicaoRiquezaEspecies.pdf: 2989060 bytes, checksum: 9ae398fbe92f07733277508c55c5e72f (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-09-12T12:58:21Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_ComposicaoRiquezaEspecies.pdf: 2989060 bytes, checksum: 9ae398fbe92f07733277508c55c5e72f (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-12T12:58:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_ComposicaoRiquezaEspecies.pdf: 2989060 bytes, checksum: 9ae398fbe92f07733277508c55c5e72f (MD5) Previous issue date: 2006 / A perda e fragmentação de habitats representam sérios riscos à manutenção das espécies de anfibios na Amazônia. Neste estudo, determinamos a composição, a riqueza e abundância das espécies de anuros em fragmentos florestais nas Zonas de Proteção da Vida Silvestre (ZPVS) estabelecidas no Lago de Tucuruí, leste do Pará. Os anuros foram amostrados através de transectos em doze fragmentos de diferentes tamanhos distribuídos igualmente entre as duas ZPVS, uma na margem direita (ZPVS-D) e outra na margem esquerda (ZPVS-E) do Lago. Os animais foram registrados através dos métodos de procura ativa e armadilhas de interceptação e queda. De janeiro a julho de 2005 registramos 2370 indivíduos de 35 espécies de anuros. Destas espécies, 30 foram encontradas na ZPVS-E (13 exclusivas) e 22 na ZPVS-D (cinco espécies exclusivas). Sete estimadores de riqueza de espécies foram obtidos com o auxílio do Programa EstimateS®. Para a maioria dos estimadores, as curvas de acumulação de espécies tenderam a uma certa estabilidade. Entretanto, as estimativas de riqueza de espécies variaram entre os estimadores, sendo a estimativa Bootstrap a mais baixa (38 espécies) e Jackknife a mais alta (45 espécies). A combinação das espécies de anuros observadas neste estudo com nove espécies registradas na Coleção Herpetológica do Museu Paraense Emílio Goeldi, resultaram num total de 44 espécies, indicando que os estimadores de riqueza de espécies tiveram um bom desempenho. A similaridade de espécies de anuros, foi maior entre os fragmentos de uma mesma ZPVS do que entre fragmentos do mesmo tamanho. A riqueza de espécies foi positivamente e significativamente relacionada com o tamanho, mas não com o grau de isolamento dos fragmentos. Não houve relação significativa do número de indivíduos observados por fragmento e o tamanho dos fragmentos. A diferença na composição e riqueza de espécies encontrada entre as duas ZPVS indica certa complementariedade entre as duas unidades para a conservação da anurofauna local, assim como a necessidade de maior esforço de amostragem de anuros, principalmente através da ampliação da área de estudo, para uma melhor compreensão destas diferenças e suas implicações. / Habitat loss and forest fragmentation represent serious risk to anuran species maintenance in Amazonian. Herein, we determine composition, richness and abundance of anuran species in forest fragments at two Zones of wildlife protection (ZWP) established at the Tucuruí dam, east Pará state. Anuran fauna was sampled through transects at twelve fragments of different sizes, distributed along the two ZWP, the first on the right (ZWP-R) and the second on the left (ZWP-L) edge of the lake. Frogs were registered through active search and pitfall trap captures. From January to July 2005 we registered 2370 individuals from 35 anuran species. Thirty species were found in the ZWP-L (13 exclusive species) and 22 in the ZWP-R (five exclusive species). Seven estimators of species richness were obtained with the use of EstimateS® Software. For the most estimators, curves of species accumulation trended to stability. However, estimates of species richness varied among the estimators, with bootstrap the lowest (38) and the Jacknife the highest (45) values. The combination of the species observed here with the nine species registered in the Herpetological Collection of the Museu Paraense Emílio Goeldi resulted in 44 species, suggesting that estimators for species richness had a reasonable performance. Similarity of anuran species was higher among fragments from the same edge of the lake than from similar size fragments. Species richness was positive and significantly related to size, but not to distance from the fragment from continuous forest. There was no significant relationship between number of individuals observed in the fragment and the fragment size. Differences in the species composition between the two ZWP suggest certain complementariety of the two unities to the conservation of the local anuran fauna, as well the need of a higher effort of anuran sampling, principally through the increase of study area, for the best comprehension of these differences and their implications.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-09-17T15:45:16Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Dissertacao_DistribuicaoEspacialAnuros.pdf: 1488475 bytes, checksum: e9cd47c0e8609f7d7ca48efea48fc97e (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-09-19T14:11:55Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Dissertacao_DistribuicaoEspacialAnuros.pdf: 1488475 bytes, checksum: e9cd47c0e8609f7d7ca48efea48fc97e (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-19T14:11:56Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Dissertacao_DistribuicaoEspacialAnuros.pdf: 1488475 bytes, checksum: e9cd47c0e8609f7d7ca48efea48fc97e (MD5) Previous issue date: 2008 / O presente estudo investigou a relação de comunidades de anuros de serapilheira e lagartos com a área basal de árvores, densidade do sub-bosque, cobertura do dossel e profundidade da serapilheira, a fim de verificar se a distribuição dessa comunidade, assim como de algumas espécies analisadas separadamente, seria determinada por estes fatores ambientais. A amostragem ocorreu entre agosto e novembro de 2007, em uma grade de 25 km² implantada pelo Programa de Pesquisa em Biodiversidade (PPBio) / Amazônia, localizada na Floresta Nacional de Caxiuanã, Pará, Brasil. Duas técnicas de amostragem foram utilizadas: procura ativa diurna e armadilhas de interceptação e queda. No total, foram registrados 892 lagartos e anuros, pertencentes a 27 espécies (15 de anuros e 12 de lagartos). Na coleta ativa foram registradas 12 espécies de anuros (101 indivíduos) e 12 de lagartos (171 indivíduos), enquanto que nas armadilhas de interceptação e queda foram 11 espécies de anuros (327 indivíduos) e 15 de lagartos (293 indivíduos). Não houve relação significativa entre a distribuição das comunidades de anuros e lagartos com as variáveis preditoras, indicando que essas espécies ocorrem ao longo de todos os gradientes ambientais estudados. Apenas os lagartos Coleodactylus amazonicus e Ptychoglossus brevifrontalis apresentaram uma relação entre a sua distribuição e a densidade do sub-bosque e profundidade da serapilheira, respectivamente. Espera-se com este estudo contribuir para o aprimoramento do desenho amostral da herpetofauna do PPBio. / This study aims to investigate the relationship between anuran and lizard communities, as well as of some individual species, with leaf litter depth, total basal area of trees, understorey vegetation density, and canopy cover. Sampling occurred between August and November 2007, in a 25 km² grid implanted by the ‘Programa de Pesquisa em Biodiversidade’ (Biodiversity Research Program - PPBIO) / Amazônia, located in the Floresta Nacional de Caxiuanã, Pará, Brazil. Two sampling methods were used: active search and pitfall traps with drift fences. A total of 892 lizard and anuran individuals, of 27 species (15 anuran and 12 lizard species), were recorded. Twelve anuran species (101 individuals) and 12 lizard species (171 individuals) were registered through active search, whereas 11 anuran species (327 individuals) and 15 lizard species (293 individuals) were captured by pitfall traps. No significant relationship was found between distribution of anuran and lizard communities with environmental predictors, indicating that these species occur throughout all studied environmental gradients. Only the lizards Coleodactylus amazonicus and Ptychoglossus brevifrontalis were significantly associated with understorey vegetation density and leaf litter depth, respectively. This study is expected to contribute to the improvement of the research design for the herpetofauna within PPBIO.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-11-01T22:05:54Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_InfluenciaFatoresAmbientais.pdf: 2881814 bytes, checksum: dcf09ae49d631a4d162a3c2b67262d10 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-11-14T17:11:10Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_InfluenciaFatoresAmbientais.pdf: 2881814 bytes, checksum: dcf09ae49d631a4d162a3c2b67262d10 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-11-14T17:11:10Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_InfluenciaFatoresAmbientais.pdf: 2881814 bytes, checksum: dcf09ae49d631a4d162a3c2b67262d10 (MD5) Previous issue date: 2010 / Esta dissertação foi dividida em dois capítulos, formatados de acordo com as normas das revistas ao qual deverão ser submetidos. O primeiro capítulo intitulado “Anuran species composition and their reproductive modes in transitional Amazonian forest, Brazil” discutirá a composição da anurofauna de uma área de floresta de transição Amazônia-Cerrado, na fazenda Tanguro, Mato Grosso, considerando principalmente a diversidade de modos reprodutivos dessa comunidade nos diferentes ambientes presentes nessa área. Esse capítulo segue nas normas da revista “Journal of natural history”, onde já encontra-se submetido e com os referidos autores. No segundo capítulo, intitulado “Influência de fatores ambientais na distribuição e diversidade de anuros em floresta de transição na Amazônia meridional”, trata de um estudo sobre a influência de fatores ambientais sobre a diversidade e a composição quantitativa e qualitativa das espécies em cinco diferentes ambientes encontrados na área de estudo (Mata Ciliar Preservada, Mata Ciliar Alterada, Margem do rio Tanguro, Seringal e Área Desmatada). Esse capítulo está formatado de acordo com as normas da revista “Biodiversity and Conservation”.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-11-14T18:06:50Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_EstudosCromossomicosAnuros.pdf: 2376687 bytes, checksum: 47c08d5fecec451c4a49b4ad47ae4e09 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-11-22T14:29:43Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_EstudosCromossomicosAnuros.pdf: 2376687 bytes, checksum: 47c08d5fecec451c4a49b4ad47ae4e09 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-11-22T14:29:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_EstudosCromossomicosAnuros.pdf: 2376687 bytes, checksum: 47c08d5fecec451c4a49b4ad47ae4e09 (MD5) Previous issue date: 2010 / Embora exista uma grande diversidade de complementos cromossômicos em Leptodactylidae (2n = 18 a 2n = 26) e Hylidae (2n = 20 a 2n = 32), a elevada fragmentação de dados limita o acesso a informações sobre as origens e os mecanismos responsáveis por esta diversidade. Isto provavelmente tem influenciado que os dados citogenéticos tenham sido principalmente utilizados na caracterização do status de espécies mais do que incluídos amplamente em análises filogenéticas. Este trabalho aborda, por meio de dados citogenéticos, aspectos evolutivos de três grandes grupos de anuros de ampla distribuição na região Neotropical. O gênero Leptodactylus é agrupado com Hydrolaetare, Paratelmatobius e Scythrophrys na família Leptodactylidae. Os antecedentes cromossômicos neste gênero indicam variações nos números diplóides de 2n = 18 a 2n = 26, assim como variações nos números fundamentais (número de braços autossômicos, NF) e nas posições das Regiões Organizadoras do Nucléolo (NOR). Os resultados das análises de 26 espécies de Leptodactylus empregando diversas técnicas representa, provavelmente, a análise citogenética mais inclusiva realizada no gênero Leptodactylus até o momento, e os resultados constituem um marco para a proposição de hipóteses consistentes de evolução cromossômica no gênero. A tribo Lophyiohylini agrupa atualmente 81 espécies distribuídas em 10 gêneros. A informação citogenética é escassa e restrita apenas a 12 espécies. São aqui apresentados comparativamente dados citogenéticos em espécies dos gêneros Argenteohyla, Itapotihyla, Phyllodytes, Trachycephalus e Osteocephalus. Os resultados indicam que, com exceção de O. buckleyi (2n = 26; NF = 50) e P. edelmoi (2n = 22; NF = 44), todas as demais espécies analisadas coincidem com os dados citogenéticos disponíveis, que indicam um 2n = 24 (NF = 48) na maioria das espécies cariotipadas, com NOR e constrições secundarias (CS) localizadas no par 11. Entretanto, em Phyllodytes edelmoi e Argentohyla siemersi pederseni, essas regiões localizam-se nos pares 2 e 5, respectivamente. Blocos heterocromáticos foram associados às CS adicionais (sítios frágeis) em Osteocephalus, mas não em Trachycephalus. Dados citogenéticos nos gêneros Nyctimantis e Tepuihyla, assim como técnicas com maior poder de resolução e estudos mais inclusivos, são necessários para compreender melhor a evolução cromossômica da tribo. A tribo Dendropsophini atualmente agrupa os gêneros Scinax, Pseudis, Scarthyla, Sphaenorhynchus, Xenohyla e Dendropsophus. Os dados citogenéticos registrados em todos os gêneros revelaram uma elevada diversidade cariotípica com grandes variações nos números diplóides (2n = 22 em Scarthyla; 2n = 24 em Scinax e Xenohyla; 2n = 24, 24 +1-2B e 26 em Sphaenorhynchus; 2n = 24 e 28 em Pseudis; e, 2n = 30 em Dendropsophus). O 2n = 24 observado em X. truncata indica que o 2n = 30constitui uma sinapomorfia do gênero Dendropsophus. A localização das NOR no par 7 é uma característica compartilhada por espécies dos gêneros Scarthyla, Xenohyla, Pseudis e Sphaenorhynchus, com algumas exceções nos dois últimos (P. caraya e S. carneus). Entretanto, o gênero Dendropsophus exibe uma interessante diversidade em relação a número e localização das NOR. Por outro lado, a distribuição de heterocromatina apresentou padrões variáveis, particularmente gênero Pseudis. Embora exista uma excepcional variação cromossômica neste grupo, a informação fragmentária em alguns gêneros dificulta a formulação de hipóteses consistentes sobre o papel dos cromossomos na evolução do grupo. / Although there exists a large variety of chromosomal complements in Leptodactylidae (2n = 18 to 2n = 26) and Hylidae (2n = 20 to 2n = 32), the high fragmentation of data limits the access to the information about the origins and underlying mechanisms of its diversity. This, probably, had influence on the use of cytogenetic data on the characterization of species status more than been widely included in phylogenetic analyses. This work approaches, through cytogenetic data, some evolutionary aspects of three maior groups of anurans widely distributed in the Neotropical region. The genus Leptodactylus is clustered with Hydrolaetare, Paratelmatobius and Scythrophrys in the family Leptodactylidae. The chromosomal background in the genus indicates variation of the diploid numbers from 2n = 18 to 2n = 26, as well as, variation on the fundamental numbers (number of autosomic arms, FN) and on the position of Nucleolus Organizer Regions (NOR). Results of the analysis of 26 species of Leptodactylus, using several techniques, probably represents the most inclusive cytogenetic analyses on the genus Leptodactylus until now and its results provides appropriate bases to establish consistent relationships of chromosomal evolution on the genus Leptodactylus. Actually the Lophyiohylini tribe cluster 81 species distributed in 10 genera. The cytogenetic information is scarce and restrict to only 12 species. In the present study, are presented, comparatively, cytogenetic data of species from Argenteohyla, Itapotihyla, Phyllodytes, Trachycephalus and Osteocephalus genera. With exception of O. buckleyi (2n = 26; NF = 50) and P. edelmoi (2n = 22; NF = 44), the results indicate that all the others analyzed species coincide with cytogenetic data available, that indicates 2n = 24 (NF = 48) on the majority of karyotyped species, with NOR and secondary constrictions (SC) located on the 11 pair. However, in Phyllodytes edelmoi and Argentohyla siemersi pederseni, these regions are located on pairs 2 and 5, respectively. Heterochromatic blocks were associated to additional SC (fragile sites) in Osteocephalus, but not in Trachycephalus. Cytogenetic data on the Nyctimantis and Tepuihyla genera, techniques with techniques with higher resolution and more inclusive studies are necessary to better comprehend the chromosomal evolution of the tribe. The Dendropsophini tribe actually clusters the Scinax, Pseudis, Scarthyla, Sphaenorhynchus, Xenohyla and Dendropsophus genera. The registered cytogenetic data of all the genera revealed high karyotype diversity with great variation on the diploid numbers (2n = 22 in Scarthyla; 2n = 24 in Scinax and Xenohyla; 2n = 24, 24 +1- 2B e 26 in Sphaenorhynchus; 2n = 24 and 28 in Pseudis; and, 2n = 30 in Dendropsophus). The 2n=24 observed in X. truncata indicates that 2n=30 constitute a synapomorphy of the Dendropsophus genus. The NOR localization on the pair 7 is a characteristic shared by species of Scarthyla, Xenohyla, Pseudis and Sphenorhynchus, with some exceptions in the last two genera (P. caraya and S. carneus). However, the Dendropsophus genus displays an interesting diversity related to the number and its localization. On the other hand, the heterochromatin distribution presented standard variables, particularly on genus Pseudis. Although there is an exceptional chromosome variation in this group, fragmentary information in some genera made difficult to formulate consistent hypotheses about the role of chromosomes in the evolution of the group.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2015-09-24T17:26:03Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Dissertacao_DietaUsoHabitat.pdf: 1202955 bytes, checksum: 7cf316d2015dcfbfa07a76235c320f75 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2015-09-28T14:18:18Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Dissertacao_DietaUsoHabitat.pdf: 1202955 bytes, checksum: 7cf316d2015dcfbfa07a76235c320f75 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-09-28T14:18:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Dissertacao_DietaUsoHabitat.pdf: 1202955 bytes, checksum: 7cf316d2015dcfbfa07a76235c320f75 (MD5) Previous issue date: 2013 / Um dos principais atributos do nicho ecológico das espécies é a ecologia trófica, que afeta a sobrevivência e tamanho das populações. Neste estudo registramos a contribuição das presas na dieta de Physalaemus ephippifer, testamos se havia variação na alimentação desta espécie de acordo com os sexos e os períodos do ano (seco e chuvoso) em três populações de P. ephippifer na Amazônia Oriental. Para isso, analisamos a dieta da espécie quanto a frequência de ocorrência das presas, amplitude e sobreposição trófica, além do índice de importância alimentar. Analisamos 102 espécimes (69 machos e 33 fêmeas), registrando que os itens mais importantes da dieta de P. ephippifer, no geral, eram cupins e formigas. Entretanto, analisando separadamente os sexos e períodos do ano os itens mais importantes na dieta das fêmeas do chuvoso foram larvas de Coleoptera, fêmeas do seco foram cupins e machos nos dois períodos foram formigas. Por se tratar de uma espécie especialista, o presente estudo evidenciou que a dieta não variou de acordo com o sexo ou períodos do ano. Por outro lado, fêmeas, principalmente do período chuvoso apresentaram larvas e cupins como presas mais importantes, sendo também mais nutritivas que a dieta dos machos, coincidindo com o período reprodutivo da espécie, onde as fêmeas necessitariam de maior quantidade de energia para produção de gametas.

Submitted by Nathalya Silva (nathyjf033@gmail.com) on 2017-05-30T15:31:26Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_EfeitoMetilmercurioGirinos.pdf: 3765057 bytes, checksum: 86c3fe659eb6e161449eb58cdc74b21f (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-06-06T21:15:55Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_EfeitoMetilmercurioGirinos.pdf: 3765057 bytes, checksum: 86c3fe659eb6e161449eb58cdc74b21f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-06T21:15:55Z (GMT). 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Concentrações de MeHg em altas doses podem provocar óbvios efeitos letárgicos e a mortalidade da larva do anfíbio, porém as dúvidas se desvelam em buscar conhecimentos quanto aos efeitos das doses sub-crônicas do MeHg. Portanto, a presente pesquisa tem por objetivo explorar os efeitos da exposição subcrônica do MeHg em um modelo experimental, a espécie Physalaemus ephippifer, descrevendo, identificando e caracterizando as possíveis alterações no desempenho físico das larvas e dos recém-metamorfoseados, além de alterações teratogênicas e alterações morfológicas no sistema nervoso e sensorial. Após o ensaio toxicológico, nas concentrações de 0,007μg/ml, 0,004 μg/ml, 0,0007 μg/ml e 0,0004 μg/ml e controle negativo, os animais foram analisados pelo emprego das técnicas de análise comportamental simulando fuga predatória, análises morfométricas e análises de microscopia de luz e eletrônica de varredura. A pesquisa revelou que as concentrações utilizadas não provocam debilidades locomotoras nos girinos e nem danos morfológicos anatômicos aparentes, porém, levam ao aparecimento de uma massiva quantidade de células com núcleos picnóticos nas áreas do cerebelo e tectum óptico. Tal alteração, que se mantém no indivíduo mesmo depois da metamorfose, leva a uma debilidade locomotora na concentração de 0,007μg/ml, no qual é também a concentração em que se observa um aumento da incidência de danos teratogênicos (má formação da córnea). Dessa maneira, concluiu-se que o MeHg é um agente neurotóxico e teratogênico para P. ephippifer e que tais características levam a um decréscimo na performance locomotora. O presente trabalho pode fornecer subsídios para a compreensão da ação do MeHg nas populações de anfíbios que convivem em ambientes em que este contaminante está presente como integrante do ecossistema. / The metal contamination in amphibians has been taken into account as one of the factors contributing to the population decline of these animals. The mercury (Hg) is an environmental contaminant showing high levels of toxicity. Its organic form, methylmercury (MeHg), may bioaccumulative reaching high levels in the trophic chain. For amphibian populations, bioaccumulation of metals is important once that such animals may be MeHg diffusers from the aquatic environment to the terrestrial environment because of their double life cycle. MeHg concentrations in high doses can cause obvious lethargic effects and larvae mortality of amphibious, however little is known about subchronic effects of MeHg doses. Therefore, the present research aims to explore the effects of subchronic exposure to MeHg in one experimental model, the species Physalaemus ephippifer, describing, identifying and characterizing the possible changes in physical performance of larvae and newly metamorphosed, in addition to teratogenic and morphological changes in the sensory and nervous system. After the toxicological test, with MeHg concentrations of 0.007 μg/ml, 0.004 μg/ml 0.0007 μg/ml and 0.0004 μg / ml and negative control, the animals were assessed by behavioral analysis simulating breakout predatory, morphometric and analysis in light microscopy and scanning electron microscopy. Our results revealed that MeHg concentrations did not induce locomotor weaknesses in tadpoles and nor apparent anatomical morphological damage, however, it induces the appearance of a massive cell count of pyknotic nuclei in the areas of the cerebellum and optic tectum. Such alteration, which remains in the animal even after metamorphosis, induces a locomotor weakness in concentration of 0,007μg/ml which is also the concentration where one increased teratogenic damage effect (corneal malformation) is observed. Therefore, we conclude that MeHg is a neurotoxic and teratogenic agent for P. ephippifer and that such features lead to one decrease in locomotor performance. The present work may contribute to the knowledge on effect of MeHg in amphibian populations that live in environments where this contaminant is present as member of the ecosystem.

Orientador: Itamar Alves Martins / Banca: Denise de Cerqueira Rossa Feres / Banca: Célio Fernando Baptista Haddad / Resumo: A Floresta Atlântica é o bioma com maior diversidade e taxa de endemismo de anfíbios anuros do mundo. Esse bioma consiste em sua maior parte de pequenos fragmentos isolados, ainda sob intensa pressão antrópica, colocando em risco a sua biodiversidade. Os anfíbios são especialmente susceptíveis à degradação ambiental devido a sua fisiologia ectotérmica, a pele permeável, a sua vulnerabilidade a diversos agentes biológicos ou químicos e por apresentarem ovos e larvas dependentes da água ou de ambiente úmidos. Tais características fazem destes animais bons modelos para o estudo de questões relacionadas à modificação de hábitats, sejam elas relativas à identificação de padrões ou inferência sobre processos associados à fragmentação ou perda do hábitat original, ou mesmo ocupação e colonização em áreas alteradas. Dentro deste contexto, este trabalho teve como objetivos principais, (1) determinar a diversidade e a estrutura de uma comunidade de anfíbios anuros e (2) investigar a possível influência do tipo de formação vegetal na composição da anurofauna terrestre, em uma região de domínio Atlântico, localizada na Serra da Mantiqueira entre os Municípios de Piquete, SP, e Marmelópolis, MG00; (22°29'37,9" a 22°31'15,7" S e 45°08'57,8" a 45°09'35,4" W; 1500 a 1640m). A partir do inventário mensal das espécies em campo durante 23 meses consecutivos para o primeiro objetivo e por 12 meses consecutivos para o segundo, utilizando-se dos métodos de procura visual e auditiva e de armadilhas de interceptação e queda, foram determinadas a abundância, a riqueza e as distribuições espaciais e temporais de anuros em diferentes áreas: mata secundária tardia, mata de araucária, plantações de Eucalyptus sp, riachos, poças permanentes e temporárias em área aberta e interior de floresta e brejos de borda de mata e de área aberta... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The Atlantic Forest is the biome with the highest diversity and rate of endemism for anuran amphibians in the world. This biome currently consists mostly of isolated small forest remnants under high anthropogenic pressure, threatening its biodiversity. Amphibians are especially susceptible to environmental degradation due to their physiology, permeable skin, and their vulnerability to several biological or chemicals agents and for having eggs and larvae that depend on water or humid environments to complete their development. These features make them useful models to study the effects of hábitat change, e.g., the identification of patterns and processes associated with fragmentation or hábitat loss, or even the occupation and colonization in disturbed areas. Within this context, the main aims of this study are: (1) to determine the diversity and the structure of an anuran community and (2) to investigate the influence of vegetation type on the composition of leaf litter frogs in an Atlantic Forest area, located in the Mantiqueira mountain range between Piquete, state of São Paulo and Marmelópolis, state of Minas Gerais (22° 29' 37.9" S; 45° 08' 57.8" W and 22° 31' 15.7" S; 45° 09' 35.4" W, 1500 to 1640 m a.s.l.). I conducted 23 monthly samplings using visual and acoustical survey techniques and 12 monthly samplings using pitfall traps to estimate the abundance and richness and to determine the spatial and temporal distributions of anurans in several areas: late secondary forest, Araucaria forest, Eucalyptus woodlots, streams, permanent and temporary ponds in open and forested areas, and swamps at the forest edge and open areas. I recorded 32 species, 15 of which using pitfall traps. The species richness and abundance were different in the hábitats sampled. The forest hábitats had the highest richness (n = 16) and abundance (n = 432). Litter depth was positively correlated... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre