Os ecossistemas aquáticos são afetados por processos que ocorrem em escalas finas (locais) e amplas (regionais). Os processos locais incluem, por exemplo, filtros ambientais e interações interespecíficas, enquanto que os regionais abrangem principalmente questões relacionadas à dispersão de indivíduos. O entendimento de como esses processos atuam sobre comunidades, populações e interações em peixes de riachos é fundamental para a conservação dos ecossistemas aquáticos, pois permite predizer as consequências de alterações antrópicas e fornece subsídios para ações de manejo e políticas de conservação. Na presente tese, eu desenvolvi cinco estudos em distintas escalas espaciais. Cada um é apresentado em capítulos distintos. Nos capítulos 1 e 2, eu abordei questões relacionadas à compreensão de como alterações antrópicas feitas em distintas escalas espaciais influenciam as diversidades alfa e beta de comunidades de peixes de riachos. No capítulo 3, eu procurei entender como processos previstos na teoria de metacomunidades influenciam mudanças temporais na composição e abundâncias de espécies em comunidades locais. No capítulo 4, eu estudei como os impactos antrópicos levam a alterações no papel trófico e no intestino de populações de uma espécie generalista e persistente. Por fim, no capítulo 5, eu usei uma abordagem de aninhamento, desenvolvida inicialmente na Ecologia de Comunidades, para avaliar a ocupação de larvas de uma espécie de quironomídeo (Diptera) sobre o corpo de seu hospedeiro (uma espécie de peixe da família Loricaridae). / Aquatic ecosystems are influenced by processes that occur at fine (local) and broad (regional) scales. Local processes include, for example, environmental filters and interspecific interactions, whereas regional processes encompass mainly questions regarding individual dispersion. Knowledge on how these processes affect communities, populations and interactions in stream fish is essential for conservation of aquatic ecosystems, as it allows predicting consequences of human-alterations and provides subsidy for management actions and conservation policies. In this dissertation, I developed five studies using distinct spatial scales. I presented each one in a separate chapter. In the 1st and 2nd chapters, I addressed questions concerned with the understanding of how human alterations at different spatial scales influence alpha and beta diversity of stream fish communities. In the 3rd chapter I looked for understanding how processes predicted in metacommunity theory influence mid- to long-term changes in composition and species abundances of local communities. In the 4th chapter, I studied how anthropic impact drives modification in the trophic role and intestine of a generalist and persistent fish species. Lastly, in the 5th chapter, I employed nestedness approach previously developed for Community Ecology to evaluate occupation of chironomid species larvae (Diptera) on the body of its host (an armored catfish species of the family Loricariidae).

Humanity has evidenced significant changes in the enviromental causing impacts from different nature in the biosphera. Desertification for example, is a serious problem in places where it happens. In Brazil, the susceptible area to this process are located at the northeasthern, it is what we call "Sertão", where is the city of Sergipe "Nossa Senhora da Glória”. This study aimed to analyse the enviromental degradation and the process of anthropic desertification in the city of Nossa Senhora da Glória. Object of this study. So, to achieve this and other specific goals were used many methodological procedures associated to different stages, highlighting among them the bibliographic data and other documents that were useful to investigate the object of study, beside the outside activities. The results of this study show that in this city is evident in different places in the rural areas the prevalance of degraded areas and susceptible to the process of a thropic desertification, even if in reversible conditions with application of effective measures to combat the phenomenon. The human or the anthropic activities is was detected as being responsible as immediate causes the over cultivation, overgrazing, deforestation, and poor irrigation. Moreover, it must be... Recognized other deeper causes directly related to poverety, and it is not given other alternative to the farmers, instead of remove from the land as much as possible to solve their immediate needs, even compromising their long-term survival. On the other hand, the socio-economical vulnerability from the population of this region show low income, file expectancy, low economic productivity, concentration of land and wealth in the hands of a few, it is further agraveted by periodic droughts plaguing the semiarid region. It is conclused that thos whole situation reflected in the worsening of enviromental problems to be overcome depends on actions the go beyond sectoral polices and remedial guidance. / A humanidade tem evidenciado significativas mudanças no meio ambiente ocasionando impactos de diferentes naturezas na biosfera. A desertificação por exemplo, constitui um grave problema nos ambientes em que ocorre. No Brasil as áreas suscetíveis a esse processo localizam-se no Sertão nordestino, onde se situa o município sergipano de Nossa Senhora da Glória, objeto deste estudo. A presente pesquisa visou analisar a degradação ambiental e o processo de desertificação antrópica no município sergipano de Nossa Senhora da Glória. Assim, para atingir esse e outros objetivos específicos utilizaram-se diversos procedimentos metodológicos associados a diferentes etapas, destacando-se entre eles o levantamento de dados bibliográficos e de outros documentos que se mostraram úteis para a investigação do objeto, além das atividades de campo. Os resultados desse estudo mostram que no referido município evidencia-se em diferentes localidades do espaço rural a predominância de áreas degradadas e suscetíveis ao processo de desertificação antrópica, ainda em condições reversíveis com aplicação de medidas eficazes de combate ao fenômeno. No que pese as atividades humanas ou antrópicas detectou-se como responsáveis por suas causas imediatas o sobrecultivo, o pastoreio excessivo, o desmatamento e a irrigação inadequada. Além disso, há de se reconhecer outras causas mais profundas diretamente ligadas a pobreza que não deixam outra alternativa aos agricultores a não ser retirar o máximo da terra para satisfazer as suas necessidades imediatas, ainda que comprometendo sua subsistência a longo prazo. Por outro lado, a situação de vulnerabilidade socioeconômica da população sertaneja do município apresentando baixos índices de renda, expectativa de vida, baixa produtividade econômica, concentração de terras e de riqueza em poder de poucos, ainda é agravada pelas secas periódicas que assolam a região semiárida. Disso conclui-se que, toda essa situação repercute no agravamento dos problemas ambientais que para serem transpostos dependem de ações que vão além de políticas setoriais e de orientação remedial.

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-05-09T14:22:29Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTAÇÃO ATUALIZADA _ Ranilson Aquino.pdf: 1800812 bytes, checksum: 8ba3d3ee5ead19d5f5002d11ee2c10b8 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-09T14:22:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTAÇÃO ATUALIZADA _ Ranilson Aquino.pdf: 1800812 bytes, checksum: 8ba3d3ee5ead19d5f5002d11ee2c10b8 (MD5) Previous issue date: 2015-07-30 / CAPEs / A herbivoria é o consumo de partes das plantas que pode afetar negativamente seu fitness, sendo um dos fatores responsáveis pela estruturação e composição das comunidades vegetais. Fatores, como disponibilidade de recursos e perturbações antrópicas, possuem papel relevante nas respostas à atuação dos herbívoros. Entretanto, as plantas não são passivas frente à herbivoria, desenvolvendo diversas estratégias de defesa no decorrer do seu tempo evolutivo, como a síntese de metabólitos secundários. O objetivo do estudo foi analisar se existe relação entre as taxas de herbivoria em áreas de Caatinga, com e sem perturbações antrópicas, e a quantidade de compostos fenólicos e taninos totais presentes em indivíduos de Aspidosperma pyrifolium Mart. (Pereiro). Foram avaliados 270 indivíduos de Pereiro em 9 áreas preservadas e 9 áreas impactadas distribuídas na microrregião de Itaparica, Pernambuco. Foram realizadas medidas biométricas, além da coleta arbitrária de 30 folhas, de cada indivíduo para avaliação das taxas de herbivoria foliar, carbono, nitrogênio, compostos fenólicos e taninos. Os dados foram analisados através de Análise de Regressão Linear Simples e ANOVA fatorial seguida de teste de Tukey 5% “a posteriori”. Análises biométricas não verificaram diferenças significativas entre as áreas e nem relação com o conteúdo de compostos fenólicos. Taxas de nitrogênio foram maiores no mês mais seco nas áreas impactadas e preservadas (17,66 ± 0,63 e 17,04 ± 0,58), enquanto os teores de carbono foram maiores no fim da estação chuvosa (26,51 ± 1,08 e 27,57 ± 1,91), para ambas as áreas. As concentrações de compostos fenólicos (R = -0,51 e p = 0) e taninos (R = -0,50 e p = 0) tiveram relação negativa com as taxas de herbivoria das áreas impactadas, que também apresentaram maior taxa de herbivoria, enquanto nas áreas preservadas essa relação não foi observada. Embora a influência da pecuária extensiva possa ser notada nas áreas tidas como impactadas ela não pode ser considerada a causa única das taxas de herbivoria/produção de compostos de defesa. / Herbivory is the consumption of plant parts that can negatively affect your fitness, one of the factors responsible for the structuring and composition of plants communities. Factors such as resources availability and human disturbances, have an important role in the herbivores responses. However, plants aren’t passive front herbivory, developing various defense strategies in the course of its evolutionary time, as the synthesis of secondary metabolites. The aim of the study was to examine whether there is relationship between herbivory rates in areas of Caatinga, with and without human disturbances, and the amount of phenolic compounds and total tannins presents in Aspidosperma pyrifolium Mart. individuals (Pereiro). We evaluated 270 individuals from Pereiro in 9 preserved areas and 9 impacted areas distributed in Itaparica’s region, Pernambuco. Biometric measurements were performed, as well as arbitrary collection of 30 leafs, each individual to assess the rates of leaf herbivory, carbon, nitrogen, phenolics and tannins. Data were analyzed by Simple Linear Regression Analysis and factor ANOVA followed by Tukey test 5% "a posteriori". Biometric analysis found no significant differences between areas and not related to the content of phenolic compounds. Nitrogen rates were higher in the driest month in the impacted and preserved areas (17.66 ± 0.63 and 17.04 ± 0.58), while the carbon levels were higher at the end of the rainy season (26.51 ± 1.08 and 27.57 ± 1.91), for both areas. The concentrations of phenolic compounds (R = -0.51 p = 0) and tannins (R = -0.50 p = 0) had negative relationship with herbivory rates of impacted areas, which also had higher herbivory rate while in preserved areas this relationship was not observed. Although the influence of extensive livestock farming can be noticed in impacted areas it can’t be considered the sole cause of the rates of herbivory/production of defense compounds.

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-07-13T19:07:12Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Diego Antônio Botelho de Cedro - 2011.pdf: 1761895 bytes, checksum: 5c6848ceaebbfd0061312bc3fafef51d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-07-14T13:39:29Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Diego Antônio Botelho de Cedro - 2011.pdf: 1761895 bytes, checksum: 5c6848ceaebbfd0061312bc3fafef51d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-14T13:39:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Diego Antônio Botelho de Cedro - 2011.pdf: 1761895 bytes, checksum: 5c6848ceaebbfd0061312bc3fafef51d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2011-09-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Wetlands are complex ecosystems with Genesis, evolution and dynamic private situated in soil/water interface and relief, which has a key role in the hydrological dynamics and on biodiversity. These areas are extremely vulnerable to human actions, which are controlled by a complex natural system processes, sensitive to the effects of occupation and management techniques are not appropriate. This research has emerged on the importance of studying the humid areas of Cerrado biome, using as example the basin of the Caiapó river, one of the tributaries of the right bank of the rio Araguaia, Goiás. In the survey were identified and classified the humid areas of the basin selected, raised and classified the anthropic use classes for spatial analysis and temporal behavior of the forward to the evolution of the use and the relationship between these antagonistic classes.The images used for land-use studies and identification of wetlands were those for the years 1975, 1985, 1995 and 2009, obtained by means of the satellites Landsat MSS 1 (1975) and Landsat 5 TM (all other). Such images were referenced and mosaicadas with employment, and threaded software ENVI and classified with the Spring software for identification of areas of interest. So if you could cover the entire area of the basin of the Caiapó river were used three Landsat 5 TM scenes, being they orbit/point 223/71, 72 and 223/224/71 4 and Landsat scenes 1 MSS, the lifting of the year 1975, orbit/point 239/071/072, 239, 240 and 240/071/072. The wetlands were classified in Mata Galeria/Ciliar, Campo Limpo Úmido, Campo Sujo Úmido, Várzeas, Vereda/Buritizal, Lake and Rivers/water; the anthropic soil usage types have been classified in agriculture, grazing, urban area and preserved area. The products generated in shape format, were converted to AscII format and transported to the software metrics analysis for Fragstats landscape. This way, we obtained a database on the humid areas, containing various satellite images of the months subsequent to the rainy season (may, June and July) for these years, was also developed a methodology for identifying wetlands to this roster 1: 150,000 and, finally, the results have been achieved where reveals the predominance of Ciliary/Gallery Forest class between the humid areas in the year 2009 and also, the advancement of agricultural activities on these areas, often disregarding the environmental laws in force. The integrated use of the basic tools of remote sensing and geo-processing proved efficient for this kind of work, producing useful information for better understanding of the process of fragmentation in the area. / Discorrer sobre as áreas úmidas como ecossistemas complexos com gênese, evolução e dinâmica particular, situados na a partir da inter-relação água e solo/relevo, tendo um papel fundamental na dinâmica hidrológica e na biodiversidade. Essas áreas são extremamente vulneráveis as ações antrópicas, tendo em vista que são controladas por um complexo sistema natural, sensível aos processos de ocupação e aos efeitos de técnicas de manejo não adequadas. Essa pesquisa surgiu da importância de se estudar as áreas úmidas do bioma Cerrado, utilizando como exemplo a bacia do rio Caiapó, um dos afluentes da margem direita do rio Araguaia, no estado de Goiás. Na pesquisa foram identificadas e classificadas as áreas úmidas da bacia selecionada, levantadas e classificadas as classes de uso antrópico para análise espacial e do comportamento temporal frente à evolução do uso e as relações entre essas classes antagônicas. As imagens utilizadas para estudos do uso do solo e identificação das áreas úmidas foram aquelas referentes aos anos de 1975, 1985, 1995 e 2009, obtidas por meio dos satélites Landsat1 MSS(1975) eLandsat 5 TM (todas as demais). Tais imagens foram georreferenciadas e mosaicadas com emprego do software ENVI, e segmentadas e classificadas com o software Spring para identificação das áreas de interesse. Para que se conseguisse abranger toda a área da bacia do rio Caiapó foram utilizadas três cenas Landsat5 TM, sendo elas de órbita/ponto 223/71, 223/72 e 224/71 e 4 cenas Landsat1 MSS, para o levantamento do ano de 1975, de órbita/ponto 239/071, 239/072, 240/071 e 240/072. As áreas úmidas foram classificadas em Mata Galeria/Ciliar, Campo Limpo Úmido, Campo Sujo Úmido, Várzeas, Vereda/Buritizal, Lago e Rios/Água; os tipos de uso antrópico do solo foram classificados em Agricultura, Pastagem, Área Urbana e Área Preservada. Os produtos gerados, em formato shape, foram convertidos para formato AscII e transportados para o software Fragstatspara análise das métricas da paisagem. Desta forma, obteve-se um banco de dados sobre as áreas úmidas, contendo diversas imagens de satélite dos meses posteriores ao período chuvoso (Maio, junho e julho) para os referidos anos, também foi desenvolvida uma metodologia para identificação de áreas úmidas a essa escala de trabalho 1:150.000 e, por fim, foram alcançados resultados onde se revela à predominância da classe de Mata Galeria/Ciliar entre as áreas úmidas no ano de 2009 e também, o avanço de atividades agrícolas sobre essas áreas, muitas vezes desrespeitando as leis ambientais vigentes. O uso integrado das ferramentas básicas do sensoriamento remoto e geoprocessamento mostraram-se eficiente para esse tipo de trabalho, produzindo informações úteis para a melhor compreensão do processo de fragmentação na área.

Submitted by Biblioteca de Pós-Graduação em Geoquímica BGQ (bgq@ndc.uff.br) on 2017-05-16T15:50:12Z No. of bitstreams: 1 Eline GonçalvesFinal.pdf: 2362766 bytes, checksum: 5ff7da387d547cd2c43ba7dfeb37be30 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-16T15:50:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Eline GonçalvesFinal.pdf: 2362766 bytes, checksum: 5ff7da387d547cd2c43ba7dfeb37be30 (MD5) / Universidade Federal Fluminense. Instituto de Química. Programa de Pós-Graduação em Geoquímica, Niterói, RJ / Estudos recentes em várias partes do mundo têm relatado a distribuição de produtos farmacêuticos e de higiene pessoal (PPCPs), em águas superficiais contaminadas por efluentes de esgoto. Um potencial indicador e/ ou marcador de contaminação antrópica é cafeína. A cafeína é amplamente consumida pela população e sua utilização como indicador de poluição das águas superficiais por esgoto doméstico foi avaliada neste estudo. Concentrações de cafeína em amostras coletadas no rio Paquequer, localizado no município de Te resópolis/ RJ, foram comparadas com outros tradicionais parâmetros de qualidade da água (fosfato, nitrato, amônio, condutividade elétrica, coliformes totais e coliformes fecais), a fim de caracterizá - la como um eficiente indicador de poluição antrópica urb ana no ambiente aquático. O rio Paquequer nasce no Parque Nacional da Serra dos Órgãos (PARNASO) e seu percurso corta grande parte da área urbana do município de Teresópolis. Desta forma, foram coletadas amostradas de água em sete pontos ao longo do rio, c onsiderando os diferentes usos do solo (3 pontos na área preservada e 4 pontos na área urbana do município) e os períodos de chuva e estiagem. A cafeína foi detectada utilizando extração em fase sólida (SPE) e a Cromatografia Líquida de Alta Eficiência (HP LC) com detector de arranjo de diodos (DAD); suas concentraçõe s foram encontradas em um intervalo de 0,16 a 47,5 μg L - 1 , com um limite de detecção de 0,05 μg L - 1 e de quantificação de 0,15 μg L - 1 . As menores concentrações de cafeína foram encontradas em amostras analisadas na área do PARNASO, a correlação entre essas concentrações e as de amônia e fosfato encontradas nesta área não obtiveram qualquer relação, o que sugere a provável presença de fontes naturais de cafeína, tais como a vegetação, e não, fontes antrópicas. Já os resultados encontrados ao longo da área ur bana mostram um incremento e uma significativa correlação entre as concentrações de cafeína, amônia e fosfato, em conformidade com o aumento do aporte de esgoto no rio. Esses resultados sugerem que a cafeína pode ser utilizada como indicador de contaminaçã o por esgoto doméstico em águas superficiais, principalmente quando há dúvidas sobre a fonte da contaminação. / Recent studies around the world have reported the distribution of pharmaceuticals and personal care products (PPCPs) in surface water contaminated by sewage effluent. A potential indicator and/or marker of human contamination is caffeine. Caffeine is widely consumed by the population and its use as an indicator of pollution of surface waters by domestic sewage was evaluated in this study. Concentrations of caffeine in samples collected in the river Paquequer, located in the city of Teresópolis/ RJ, were compared with other traditional water quality parameters (phosphate, nitrate, ammonium, electrical conductivity, total coliforms and fecal coliforms), in order to characterize it as an effective indicator of anthropogenic pollution in urban aquatic environment. The river Paquequer has its source in th e Parque Nacional da Serra dos Órgãos (PARNASO) and its route crosses the urban area of the city of Teresópolis. Thus, samples of water were collected at seven points along the river, considering the different uses of soil (3 points in the preserved area a nd 4 points in the urban area) and the periods of rain and drought. The caffeine was detected in using solid phase extraction (SPE) and the high efficiency liquid chromatography (HPLC) with the diode array detector (DAD); their concentrations were found in a range of 0.16 to 47.5 μ g L - 1 , with a detection limit of 0.05 μ g L - 1 and quantification of 0.15 μ g L - 1 . The lowest concentrations of caffeine were found in samples in the area of PARNASO, the correlation between these concentrations of ammonium and phosp hate found in this area have not received any relationship, suggesting the likely presence of natural sources of caffeine, such as vegetation, and not, anthropic. However, the results found along the urban area show an increase in and a significant correla tion between the concentrations of caffeine, ammonium and phosphate, in agreement with the increase in the contribution of sewage in the river. These results suggest that caffeine can be used as an indicator of contamination by domestic sewage into surface waters, especially when there are questions about the source of contamination

L’urbanisation représente aujourd’hui une des grandes menaces pour l’environnement, notamment dans les zones littorales où l’exploitation des ressources naturelles est plurielle. Ce travail propose d’apporter une connaissance à deux échelles d’analyse, régionale et communale, sur les changements environnementaux qui ont eu lieu pendant 70 ans d’urbanisation de la Região dos Lagos, située dans l’État de Rio de Janeiro au Brésil. Le phénomène d’urbanisation est caractérisé par deux processus menant à la consommation des espaces naturels et anthropo-naturels : l’extension et la densification urbaines. Ces deux processus posent des questions sur la durabilité de ces espaces, dans une région où l’habitat individuel, à faible densité bâtie et de population, sous la forme de lotissements destinés à l’utilisation temporaire est prédominant. Le lotissement et le logement sont deux éléments d’analyse pratique permettant de comprendre : le développement de l’urbanisation au niveau communal, à partir d’un regard historique et spatial ; et le choix de la localisation des lotissements et leurs caractéristiques d’occupation. Le renvoi à l’échelle régionale montre en effet que toute la région subit les mêmes processus de consommation des espaces naturels et anthropo-naturels et que la durabilité est à l’épreuve des changements des relations homme-nature, fortement touchées par des enjeux environnementaux variés. / Urbanization represents nowadays one of the great threats to the environment, mainly in the coastal zones, where the exploitation of natural resources is diversified. This thesis proposes to put in evidence, in two scales of analysis, the environmental changes, during 70 years of Região dos Lagos urbanization, a region situated in Rio de Janeiro State, in Brazil. The urbanization phenomenon is characterized by two process leading to the natural and anthropic-natural spaces consummation : urban extension and densification. These two processes put in question the sustainability of natural and anthropic-natural spaces, in the region where individual habitat, at low built and population density, characterized by residential allotments are often used temporarily. The allotments and the habitat are two elements of practical analysis that highlight the urbanization development at municipal scale, in an historical and spatial structure, and that to induce hypothesis that have oriented the choices of allotments localization and its characteristics of occupation. The return to the regional scale highlight effectively that all the region has been undergone the same natural and anthropic-natural spaces consummation processes, and sustainability is taken by human and nature relations changes, strongly affected by different environmental concerns.

Orientador: Prof. Dr. Márcio de Souza Werneck / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Evolução e Diversidade, Santo André, 2017. / The variation in species richness has been explained by two major hypotheses: 1) Energy and Water dynamics, which explains the latitudinal gradient of biodiversity; and 2) Habitat Heterogeneity hypothesis, which shows that structurally more complex environments provide more niches by adding species diversity. Nevertheless, small scale studies have been pointed out the importance of the relationship between the number of species and the internal structure of the habitat and its disturbances. Due to the extensive effect of human disturbances on the biosphere, a more complex view of the relationships between human-modified tropical landscapes and their effects on all dimensions of biological diversity is necessary to ensure the success of biodiversity conservation and the management of the ecosystems functions. In this work, we analyzed the effect of anthropic land-use and natural coverage on the species richness of birds and mammals and mammalian guilds in the state of São Paulo, Brazil. We focused on three phases: 1) Energy - Water 2) Natural Coverage as an approximation to environment heterogeneity and 3) Anthropic land-use as an approximation to the effect of human disturbances. Using the Maximum Likelihood approach to select models, we selected the best explanatory variables for species richness to perform models to test the three hypotheses proposed to explain the richness of each group, the individual effect of each variable was also analyzed. Our database presented a great bias product of an unequal sampling effort along the grid that was attenuated by the selection of the best-surveyed cells through a complementarity analysis. We found that the anthropic land-use is the best explanatory hypothesis for birds and mammals richness. For mammalian guilds richness the Energy + Water hypothesis occupies the second place contrasting with the results widely presented in the literature, and revealing the importance of factors associated with human impact at regional scale. It emphasizes the positive relationship between richness and native vegetation cover, Conservation Units and Reforestation, and the negative relationship with the agricultural land-use. That reveals the importance of designing management policies that involve the conservation of remnants of native vegetation, the maintenance and creation of protected areas, and the focus of reforestation efforts for a more complex Forest Transition promoting the landscape connectivity. / A variação na riqueza de espécies tem sido explicada por duas grandes hipóteses, 1) a dinâmica da Energia e Água, que explica o gradiente latitudinal da biodiversidade e2) aHipótese da Heterogeneidade da Hábitat que expõe que os ambientes estruturalmente mais complexos fornecem maior quantidade de nichos acrescentando a diversidade de espécies. Porém, em menor escala muitos estúdios têm sinalado a importância da relação entre o número de espécies e a estrutura interna do hábitat e suas perturbações. Devido ao extenso efeito das perturbações humanas na biosfera faz-se necessário uma visão mais complexa das relações das paisagens tropicais modificadas pelo homem e seus efeitos sobre todas as dimensões da diversidade biológica, para garantir o sucesso da conservação da biodiversidade e o manejo das funciones dos ecossistemas. Nesse trabalho, nós analisamos o efeito do uso antrópico do soloe a cobertura natural sobre a riqueza de espécies de aves e mamíferos e a riqueza de guildas de mamíferos no estado de São Paulo, Brasil. Nós concentramo-nos em três hipóteses: 1) Energia ¿ Água 2) Cobertura Natural como uma aproximação à heterogeneidade do hábitat e 3) Uso Antrópico do Solo como uma aproximação ao efeito das perturbações humanas. Usando o enfoque de Máxima Verossimilhança para seleção de modelos, selecionamos as variáveis que melhor explicaram a riqueza, para logo testar as três hipóteses propostas para explicar a riqueza de cada grupo, também foi analisado o efeito individual de cada variável. Nossa base de dados apresentou um grande viés produto dum desigual esforço de amostragem ao longo do grid que foi atenuado pela seleção das células melhor amostradas a traves dum analise de complementariedade. Nós encontramos que o uso antrópico do solo é o melhor preditor para a riqueza de aves e mamíferos, mas para a riqueza de guildas de mamíferos a Energia + Água ocupa o segundo lugar, contrastando com os resultados amplamente apresentados na literatura, e revelando a importância dos fatores associados ao impacto humano a escala regional. Ressalta a relação positiva entre a riqueza e a cobertura de vegetação nativa, Unidades de Conservação e Reflorestamento, e a relação negativa com o uso agrícola do solo. Esso revela a importância de desenhar políticas de manejo que envolvam a conservação dos remanentes de vegetação nativa, o mantimento e criação de áreas protegidas, e focalização dos esforços de reflorestamento para uma Transição Florestal mais complexa em função da conectividade da paisagem.

Submitted by Ricardo Cedraz Duque Moliterno (ricardo.moliterno@uefs.br) on 2016-03-09T00:16:51Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Euclides_PPGM_2016.pdf: 8675089 bytes, checksum: 11d6d78776ee49a83a1ddb81459fe3f1 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-09T00:16:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Euclides_PPGM_2016.pdf: 8675089 bytes, checksum: 11d6d78776ee49a83a1ddb81459fe3f1 (MD5) Previous issue date: 2016-02-22 / The expansion of the urban area in the city of Matola in Mozambique has been significant in recent decades and it has happened in an unstructured way. This occupation contributes to the destruction of both the ecological and environmental structure of the city. One of the strategies to minimize these effects is to consider the legislation, concerning the urban land use and the preservation / conservation of vegetation, as well as the preparation of the Environmental Zoning. The main objective was, to propose an Environmental Zoning based on the analysis of urban sprawl and its impact on the environment, the distribution of vegetation over a period of 17 years (1997-2014) and the legislation to contribute with elements that inform and enable the development of urban and environmental planning in the municipality of Matola. Three satellite images from TM / Landsat 5 and OLI / Landsat 8 orbital sensor, SRTM data, population data and digital database of the city/country were utilized as input data. It was employed visual interpretation, images segmentations digital classification and geoprocessing technics. Results, indicated that urban area increased about 180.964m2, corresponding to 254.91% between 1997 and 2014. The area of vegetation cover reduced to 118.74m2 (52.62%) in 17 years. The Vegetation Cover Index (VCI) for total mapped area, reduced from, 61.25% in 1997, to 39.65% in 2007 and 29.02% in 2014. However, the detailed study of the VCI to different neighborhoods of Matola, showed a very uneven spatial distribution. The Environmental Zoning proposed, was made by integrating several information?s plans (thematic maps) and features five zones, namely: (i) Total Conservation Zone; (ii) Sustainable Use Conservation Zone; (iii) Expansion Urban Zone; (iv) Environmental Control Zone and (v) Recovery Zone. Has also proposed the creation of three protected areas located in the Total Conservation Zone: (i) Integral Natural Reserve, (ii) Natural Monument and (iii) Permanent Protection Green Area. This research will be important to municipal management and will serve as a basis for preparing the next general and partial urbanization plans and Matola Master Plan 2019/2020, achieving the objectives of the Environmental Strategy for Sustainable Development of Mozambique (2007 - 2017) and the objectives of Agenda 2030 of the UN. / A expans?o da macha urbana no Munic?pio da Matola em Mo?ambique tem sido significante nas ?ltimas d?cadas e ? feita de forma n?o estruturada. Esta forma de ocupa??o do espa?o contribui para a destrui??o da sua estrutura ecol?gica e ambiental. Uma das estrat?gias para minimizar esses efeitos ? levar em considera??o a legisla??o, concernente ? ocupa??o do solo urbano e ? preserva??o/conserva??o da cobertura vegetal, assim como a elabora??o do Zoneamento Ambiental. A pesquisa tem como objetivo elaborar uma proposta de Zoneamento Ambiental a partir da an?lise da expans?o urbana, da distribui??o da cobertura vegetal em um per?odo de 17 anos (1997 - 2014) e da legisla??o, de forma a contribuir com elementos que informem ou possibilitem a elabora??o dos planejamentos urbano e ambiental do Munic?pio da Matola. Foram usadas tr?s imagens dos sensores orbitais TM/Landsat 5 e OLI/Landsat 8, dados SRTM, dados populacionais e a base de dados cartogr?fica digital do Munic?pio/Pa?s. Empregaram-se t?cnicas de interpreta??o visual, de segmenta??o, de classifica??o de imagens e de geoprocessamento. Dos resultados, a ?rea urbana aumentou cerca de 180,964m2, o que corresponde a 254,91% em rela??o ao ano de 1997. A ?rea da cobertura vegetal reduziu 118,74m2 (52,62%) em 17 anos. Verificou-se redu??o do ?ndice de Cobertura Vegetal (ICV) da totalidade na ?rea mapeada ao longo do tempo, sendo 61,25% em 1997, 39,65% em 2007 e 29,02% em 2014. No entanto, o estudo detalhado do ICV tendo como recorte espacial os bairros, mostrou distribui??o espacial bastante desigual. O Zoneamento Ambiental proposto, foi elaborado a partir da integra??o de diferentes planos de informa??o (mapas tem?ticos) e apresenta cinco zonas: (i) Zona de Conserva??o Total; (ii) Zona de Conserva??o de Uso Sustent?vel; (iii) Zona de Expans?o Urbana; (iv) Zona de Controle Ambiental e (v) Zona de Recupera??o. Foi tamb?m proposto a cria??o de tr?s Unidades de Conserva??o localizadas na Zona de Conserva??o Total: (i) Reserva Natural Integral, (ii) Monumento Natural e (iii) ?rea Verde de Prote??o Permanente. O trabalho ser? de grande valia para a gest?o municipal e servir? de base para, a elabora??o dos pr?ximos planos gerais e parciais de urbaniza??o e o Plano de Estrutura Urbana da Cidade da Matola de 2019/2020, alcan?ar os objetivos da Estrat?gia Ambiental para o Desenvolvimento Sustent?vel de Mo?ambique (2007 - 2017) e os objetivos da Agenda 2030 da ONU.

En Amérique Latine, les punaises hématophages Triatominae transmettent à l’homme le parasite Trypanosoma cruzi, responsable de la maladie de Chagas touchant actuellement 5 millions de personnes. Même si les programmes d’éradication chimique des vecteurs sont efficaces, la maladie persiste du fait de la recolonisation des habitations humaines par des vecteurs provenant d’habitats naturels. Ainsi, certaines espèces présentent une capacité d’adaptation aux anthroposystèmes (processus de domiciliation), alors que d’autres espèces apparentées ne l’ont pas. Comprendre cette capacité d’adaptation est crucial d’un point de vue épidémiologique afin de cibler les espèces présentant un risque pour l’homme. La capacité à s’adapter à un nouvel habitat pourrait être liée à l’évolution du répertoire de gènes du système chimiosensoriel, important pour la perception du milieu. Cette étude a porté sur le système chimiosensoriel des Triatominae dans le but de documenter le processus d’adaptation et donc de domiciliation des vecteurs. Des données transcriptomiques obtenues en séquençage à haut débit ont été utilisées pour annoter et répertorier les gènes chimiosensoriels ainsi que pour comparer leur expression au sein de punaises hématophages d’habitats différents. L’existence d’une relation entre les variations de ces gènes chez différentes espèces de Triatominae et leur capacité d’adaptation à un habitat a par la suite été évaluée. L’espèce T. brasiliensis en voie de domiciliation au Brésil et présentant à la fois des populations sylvatiques, péri-domiciliaires et domiciliaires, et différentes espèces du genre Rhodnius d’habitats variés, ont été étudiées, notamment les deux espèces sœurs, R. robustus, sylvatique en Amazonie et R. prolixus majoritairement domiciliée dans toute son aire de répartition. En l’absence de génomes de références suffisamment proches de T. brasiliensis et des 10 espèces de Rhodnius étudiées, leurs transcriptomes ont été assemblés de novo. Les transcriptomes des deux espèces R. prolixus et R. robustus ont été assemblés par alignement sur le génome de R. prolixus. Chez ces différentes espèces de Triatominae étudiées, l’analyse du répertoire des gènes chimiosensoriels codant les OBPs et CSPs (familles multigéniques) comparé à celui d’autres Paranéoptères a montré des expansions géniques pouvant refléter des processus adaptatifs. Par ailleurs, chez les différentes espèces du genre Rhodnius, il existe une corrélation positive entre le nombre de gènes codant les OBPs et la capacité de domiciliation, suggérant l’implication de cette famille de gènes dans l’adaptation au milieu anthropique. Les analyses d’expression différentielle concernant les différentes populations de T. brasiliensis et les espèces R. prolixus/R. robustus ont montré qu’un certain nombre de transcrits sont différentiellement exprimés selon l’environnement dans lequel ont évolué les punaises notamment des gènes chimiosensoriels (OBPs, CSPs) ainsi que des gènes impliqués dans le rythme circadien et le comportement de recherche alimentaire (Takeout), dans la réponse à des stress environnementaux comme des gènes de détoxification (P450, glutathione S-transférase), dans la résistance à des changements climatiques (Heat-shock protéines) et dans la protection du milieu extérieur (protéines cuticulaires). Ce travail a permis de mettre à la disposition de la communauté scientifique des outils performants pour l’étude du processus de domiciliation des vecteurs de la maladie de Chagas (transcriptome, répertoire de gènes). Il a également permis de révéler des gènes qui pourraient être impliqués dans l’adaptation et/ou la plasticité phénotypique en réponse à un changement d’habitat. La compréhension des bases moléculaires de l’adaptation des vecteurs aux habitations humaines ouvre des potentialités de développer des méthodes alternatives de lutte contre les vecteurs qui pourraient être basées sur une perturbation de la communication chimique. / In Latin America, the bloodsucking bugs (Triatominae, Hemiptera, Reduviidae) are vectors of the parasite Trypanosoma cruzi, which causes Chagas disease. More than five million people are infected. Even if chemical control campaigns are effective against vectors, the disease persists due to the recolonization of human habitations by vectors from natural habitats. Some species have the capacity to adapt to anthroposystems (domiciliation process), while other related species do not. Understanding this capacity to adapt is crucial from an epidemiological perspective to target species at risk to humans. The capacity to adapt to a new habitat could be linked to changes in the repertoire of chemosensory system genes, particularly for odorant binding proteins (OBP) and chemosensory proteins (CSP), which are important proteins to detect various odor stimuli. This study is based on the chemosensory system of Triatominae to document the adaptation process and then the domiciliation of the vectors. Transcriptomic data obtained by high-throughput sequencing were used to annotate and list the chemosensory genes and also to compare their expression in bloodsucking bugs from different habitats. The relationship between changes in these genes in different Triatominae species and their ability to adapt to a new habitat was evaluated. The species T. brasiliensis, which is in the process of domiciliation in Brazil with sylvatic, peridomiciliary and domiciliary populations, and various species of the genus Rhodnius from diverse habitats were studied, especially the two sibling species R. robustus, sylvatic in the Amazonia and R. prolixus mostly domiciliary throughout its geographical range. In the absence of a reference genome for T. brasiliensis, a reference transcriptome via de novo assembly (data 454 and Illumina) was achieved. The reference transcriptomes for 10 Rhodnius species were also established using the de novo assembly method. A genome reference based method on R. prolixus was also used to assemble the transcriptome of the two species R. prolixus and R. robustus. In the different species of the Triatominae studied, the chemosensory gene repertoire showed a high diversity and genic expansions compared to that of others Paraneoptera, which could reflect adaptive process. Furthermore, a positive correlation was shown between the number of OBP genes in Rhodnius species and their domiciliation ability, suggesting that this gene family is involved in the adaptation to anthropogenic environment. The differential expression analyses on the T. brasiliensis populations and the R. prolixus / R. robustus species showed that some transcripts are differentially expressed according to the environment in which the bugs have evolved, especially the chemosensory genes (OBP, CSP) and also genes involved in the circadian rhythm and foraging behavior (Takeout), in the response to environmental stress such as detoxification genes (P450, glutathione S-transferase), in resistance to climatic changes (heat-shock proteins) and in protection from the external environment (cuticular proteins).This work has helped make available to the scientific community powerful tools for studying the process of domiciliation of Chagas disease vectors (transcriptome, gene repertoire). It also revealed genes that could be involved in the adaptation and/or phenotypic plasticity in response to a change in habitat. Understanding the molecular basis of vector adaptation to human dwellings opens the potential to develop new tools to control the disease vectors, for example by disrupting chemical communication.

Orientador: Cenira Maria Lupinacci / Resumo: A taxa de crescimento urbano no mundo vem aumentando, conforme estudos das Nações Unidas (2015). No Brasil, este fato também se intensificou a partir da década de 1970, com o desenvolvimento das cidades médias. Dessa forma, o objetivo desta pesquisa foi identificar e analisar os níveis de restrição do relevo ao uso urbano, no setor sul da cidade de Araras-SP. Para que o objetivo proposto fosse alcançado, foi necessária a elaboração de alguns produtos cartográficos. A cartografia-geomorfológica-histórico-evolutiva, bem como as cartas de uso da terra dos anos de 1962, 1978, 1988, 1997, 2010 e 2016 permitiram visualizar as mudanças imprimidas pela ação antrópica e avaliar os estágios de evolução no meio urbano, conforme Nir (1983). A carta de fragilidade física foi construída a partir das cartas de declividade e de materiais inconsolidados, fazendo o uso das feições erosivas. Os dados obtidos por meio dos mapeamentos foram analisados sob a perspectiva da Teoria Geral dos Sistemas (TGS), entendendo a área de estudo como um sistema controlado já que apresenta interferência antrópica. Assim, constatou-se que o processo de urbanização, no período de 54 anos, acarretou feições antropogênicas, tais como aterros, cortes, ruptura topográfica antrópica, canal fluvial retificado, canal fluvial canalizado, canal artificial para o escoamento de águas pluviais, saída de drenagem, vertente côncava e convexa antrópica, terraço agrícola, bacia de contenção e limite do reservatório de contenção.... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: According to reports from United Nations (2015), the rate of urban growth has been increasing around the world. In Brazil, the same fact is verified as of 1970’s with the medium cities development. Thereby, the aim of this research was to identify and analyze the relief restriction levels to urban use in Araras (SP) city, in the South area. It was necessary the preparation of some cartographic mapping to achieve the proposed. Both the evolutive historic geomorphological cartography and land cover map in 1962, 1978, 1988, 1997, 2010 and 2016 allowed to view imposed changes by anthropic action and assess the evolution stages in the urban area, according to Nir (1983). The environment fragility map was built from slope and unconsolidated materials maps, using of erosion features. The obtained data through the mapping were analyzed from Systems General Theory (SGT), analyzing the area of study as controlled system due to anthropic interference. Thus, in 54 years the urbanization process caused anthropogenic features such as embankment, cutting, anthropic topographic breaks, rectified canal, canalization canal, artificial canal to flow rainwater, drainage exit, anthropic concave and convex slope, agricultural terrace, contention basin and contention reservoir. The data of environment fragility and land cover use subsidized the relief restriction levels to urban use. The sectors which have restriction to urban use very high, high and averagely high are to close headwater, concave s... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre