The take-off and landing of an Unmanned Aerial Vehicle (UAV) is often the most critical and accident prone portion of its mission. This potential hazard coupled with the time and resources necessary to train a remote UAV pilot makes it desirable to have autonomous take-off and landing capabilities for UAVs. However, a robust, reliable, and accurate autonomous takeoff and landing capability for fixed-wing aircraft is not an available feature in many low-cost UAV flight control systems. This thesis describes the design of an autonomous take-off and landing algorithm implemented on an existing low-cost flight control system for a small fixed wing UAV. This thesis also describes the autonomous takeoff and landing algorithm development and gives validation results from hardware in the loop simulation.

Submitted by Luiz Felipe Barbosa (luiz.fbabreu2@ufpe.br) on 2015-04-17T13:20:14Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação Kyllderes Lima.pdf: 3823413 bytes, checksum: 1c5cddb8b4e9dac3ccfcf18af71ce813 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-17T13:20:14Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação Kyllderes Lima.pdf: 3823413 bytes, checksum: 1c5cddb8b4e9dac3ccfcf18af71ce813 (MD5) Previous issue date: 2013-07-30 / FACEPE / O objetivo desta pesquisa foi estudar a distribuição e estrutura das associações de corais, nas piscinas do topo recifal do Atol das Rocas- RN e descrever o fenômeno de branqueamento nas colônias ao longo do Atol. Para isto foram realizadas cinco expedições à referida localidade, onde através de mergulhos autônomos e livres foi analisada a distribuição dos organismos e formações coralíneas das piscinas através do método de interseção de linhas, sendo realizado um total de 180 transecções; tambémforam realizados 80 transectos de 10x3 m de área para medir o tamanho dos corais nas piscinas e as colônias foram monitoradas ao longo de um ano através do método‘Coral Watch’ utilizando o cartão de coloração ‘Coral Health Chart’ em intervalos de 3 meses. Para fins comparativos de perfis ecológicos das localidades, as piscinas foram divididas em seis categorias. A cobertura de organismos do Atol das Rocas apresentou o predominio de algas filamentosas (59%) e algas frondosas (14%). Estes dois grupos com altissima frequência de ocorrência, 100 e 86% respectivamente. As análises das associações de organismos através dostestes MDS e ANOSIM mostraram diferenças entre as categorias de piscinas, mas estas tiveram pouco poder explicativo (alto stress 0,22 R= 0,114). Estas diferenças foram observadas entre as comunidades encontradas nas regiões anamórficas do recife (Costa, Topo e Frente) e dentro das próprias piscinas entre as comunidades da base e das regiões de menor batimetria destes ambientes. Houve variação significativa entre o tamanho das colônias de Siderastrea stellata e Porites astreoides ao longo das piscinas, (ANOVA Kruskal- Wallis; p< 0,005) sendo encontradas também, nas regiões rasas, colônias de tamanho reduzido quanto aos padrões de regiões costeiras. O branqueamento se comportou de forma aleatória em todos os ambientes. Não foi encontrada diferença significativa que apresentasse algum padrão neste tipo de anomalia nas colônias de corais ao longo das diferentes categorias de piscinas ou ao longo do tempo. Diversas colônias do coral Siderastrea stellata, Porites astreoides e Mussismilia hispida apresentaram coloração anômala, branqueamento total ou no caso de Siderastrea stellata bandas brancas ou ‘darkspot‘. Diversos pesquisadores no mundo encontraram resultados diferentes dos apresentados nesta pesquisa alguns até estudando este fenômeno no Atol das Rocas encontraram que até 50% dos corais podem ter apresentado branqueamento ou doença em suas colônias após grandes alterações de temperatura, esta pesquisa justifica a alta taxa de corais clareados de forma dispersa devido ao último evento de branqueamento ocorrido em 2010, estando então a região ainda em um estado de recuperação.

GAETA, J. de C. Densidade e distribuição espacial de lagostas espinhosas (Decapoda: Palinuridae) nas piscinas do Atol das Rocas. 2014. 60 f. Dissertação (mestrado em Ciências Marinhas Tropicais) - Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará,Fortaleza, 2014. / Submitted by Nadsa Cid (nadsa@ufc.br) on 2015-04-15T16:54:53Z No. of bitstreams: 1 2014_dis_jdecgaeta.pdf: 2139494 bytes, checksum: d75db770c3c1c7f286ab8294ee8679a0 (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid(nadsa@ufc.br) on 2015-04-15T16:55:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_dis_jdecgaeta.pdf: 2139494 bytes, checksum: d75db770c3c1c7f286ab8294ee8679a0 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-15T16:55:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_dis_jdecgaeta.pdf: 2139494 bytes, checksum: d75db770c3c1c7f286ab8294ee8679a0 (MD5) Previous issue date: 2014 / The loss of natural habitat due to increased human activity on ecosystems causes the degradation of the same, cause upsets and affects the balance of populations of organisms and thus is considered the main cause of the decline rate of species extinctions and population. Lobster populations have suffered a noticeable decline in recent decades due to overexploitation of its stocks offshore Brazil. A tool that is gaining more strength to preserve and restore degraded environments is the creation of protected areas. The Rocas Atoll was the first Marine Conservation Unit created in Brazil in 1979 with the aim to preserve and prevent further damage to biodiversity and scenic beauty within this environment. The data collections were held in april and october 2013 in the pools formed during low tide in the Rocas Atoll at daytime. Sampling was carried out through free diving (apnea) in which the researcher actively sought by lobsters in their refuges covering a total internal area of each sampled pool, measuring the time required for this procedure. Three species of lobsters Panulirus argus (Latreille, 1804), Panulirus echinatus Smith, 1869 e Parribacus antarticus (Lund, 1793) were found. P. echinatus was dominant on the other species and the abundance of this species was 0.02 lobsters/m². It is estimated that the maximum potential of lobsters that can occur in the pools sampled in Rocas Atoll is 6,603 lobsters of this species. Panulirus argus specie was found in low abundances and varied between 0,00035 and 0,001 lobsters/m² in the Rocas Atoll waters.The ecological data collected in situ in april adjust to the proposed model to evaluate lobsters populations, however, the data for october showed an undefined pattern and that does not fit the proposed model. More samples are needed to verify if some factor not measured may influence the application of the model. The Atol das Rocas acts as a concentrator of puerulus postlarvae, juveniles and adults lobsters due to the restriction imposed by the local bathymetry with near 4000 m depth and to the local current system. It is suggested that studies have to being conducted regarding the patterns of larval recruitment, patterns of locally ocean current and populations connectivity in Brazilian lobsters populations to assess whether Atol das Rocas is acting as exporter of lobster larvae, or just providing larvae to self-recruitment of these populations. / A perda do habitat natural devido ao aumento da atividade humana nos ecossistemas acarreta na degradação dos mesmos, causa descontroles e afeta o equilíbrio das populações de organismos e, portanto, é considerada a causa principal da taxa de declínio de espécies e extinções de populações. As populações de lagostas vêm sofrendo um declínio evidente nas últimas décadas devido à sobreexplotação de seus estoques na costa do Brasil. Uma ferramenta que vem ganhando cada vez mais força para preservar e recompor ambientes degradados é a criação de áreas protegidas. A Reserva Biológica do Atol das Rocas foi a primeira Unidade de Conservação marinha criada no Brasil em 1979 com a finalidade de preservar e evitar maiores danos à biodiversidade e beleza cênica que este ambiente apresenta. As coletas de dados foram realizadas em abril e outubro de 2013 nas piscinas que se formam na baixa-mar no Atol das Rocas durante o período diurno. A amostragem foi realizada através de mergulhos livres (apneia) nos quais era feita uma busca ativa pelas lagostas em seus refúgios percorrendo a área total interna de cada piscina amostrada, mensurando o tempo necessário para a coleta dos dados. Foram encontradas três espécies de lagostas Panulirus argus (Latreille, 1804), Panulirus echinatus Smith, 1869 e Parribacus antarticus (Lund, 1793). Houve dominância de P. echinatus sobre as demais espécies e a abundância desta espécie foi de 0,02 lagostas/m². Estima-se que o potencial máximo de lagostas que podem ocorrer nas piscinas amostradas do Atol das Rocas é de 6.603 lagostas desta espécie. A espécie P.argus ocorreu em baixas abundâncias variando entre 0,00035 e 0,001 lagostas/m² nas águas do Atol das Rocas. Os dados ecológicos coletados in situ no mês de abril se ajustaram ao modelo proposto neste trabalho para avaliar populações de lagostas, porém, os dados do mês de outubro apresentaram um padrão indefinido e que não se ajusta ao modelo. São necessárias mais mostragens para verificar se algum fator não mensurado no momento pode estar influenciando a aplicação do modelo. A Reserva Biológica do Atol das Rocas atua como concentrador de pós-larvas puerulus, juvenis e adultos de lagostas devido à restrição imposta pela batimetria com profundidades próximas de 4000 m e ao sistema de correntes local. Sugere-se que estudos sejam realizados a respeito dos padrões de recrutamento larval, das correntes oceânicas localmente e da conectividade de populações de lagostas no Brasil para avaliar se o Atol das Rocas está atuando como exportador de larvas de lagostas, ou apenas fornecendo larvas para o autorecrutamento dessas populações.

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-04-13T13:00:14Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Influência das condições oceanográficas sobre a estrutura da comunidade fitoplanctônica no Atol das Rocas, Atlântico Sul ~1.pdf: 2936800 bytes, checksum: 5a792d6404a0184ffa0f103bd5901478 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-13T13:00:14Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Influência das condições oceanográficas sobre a estrutura da comunidade fitoplanctônica no Atol das Rocas, Atlântico Sul ~1.pdf: 2936800 bytes, checksum: 5a792d6404a0184ffa0f103bd5901478 (MD5) Previous issue date: 2015-08-24 / O conhecimento da composição e distribuição dos produtores primários é fundamental para uma melhor compreensão da dinâmica trófica de regiões oceânicas. A composição do fitoplâncton no Oceano Atlântico Sul ainda está sendo explorada e em algumas regiões esta diversidade nunca foi descrita, como é o caso da Reserva Biológica do Atol das Rocas. O atol situa-se ao sul do equador (3°51’S e 33°49’W), distante 143 milhas náuticas da Cidade de Natal, Estado do Rio Grande do Norte (Brasil). Este estudo teve como principal objetivo caracterizar a estrutura da comunidade fitoplanctônica do entorno e nas piscinas naturais do Atol das Rocas correlacionando com as variáveis ambientais. As amostras foram coletadas no entorno do atol em julho de 2010, utilizando o navio Oceanográfico da Marinha do Brasil, Cruzeiro do Sul. Dois transectos foram estabelecidos de acordo com a corrente superficial, um transecto em direção sudeste (SE) e o outro, em direção noroeste (NO) do atol. Nestes transectos foram determinados três pontos de coleta para cada um. As amostras foram coletadas em diferentes profundidades (superfície e PMC – Profundidade Máxima de Clorofila) e diferentes períodos do dia (dia e noite). Nas piscinas naturais analisadas (Barretinha, Cemitério, Tartarugas, Rocas e Barretão), as coletas ocorreram em períodos climáticos distintos nos anos de 2012 e 2013. Os parâmetros oceanográficos os quais foram empregados para analisar a influência sobre a estrutura do fitoplâncton foram salinidade, temperatura da água, oxigênio dissolvido, teores de nutrientes inorgânicos dissolvidos e clorofila a. Foram realizadas coletas para a análise do microfitoplâncton utilizando rede com malha de 20 μm e densidade fitoplanctônica utilizando garrafa de Niskin. No entorno do atol, a maioria das variáveis ambientais apresentou aumento significativo em função da turbulência no transecto NO. Pode-se observar que houve aumento dos teores de clorofila a e nutrientes, e redução da temperatura e oxigênio na camada de mistura em função da influência da ACAS (Água Central do Atlântico Sul). No transecto NO a comunidade fitoplanctônica correlacionou-se fortemente com os parâmetros salinidade e temperatura, devido a uma instabilidade termohalina decorrente da interação das massas d’água Água Tropical e a Água Central do Atlântico Sul. As amostras apresentaram variação espacial horizontal, com maior participação do filo Ochrophyta próximo ao atol e Dinophyta nos pontos mais distantes, enquanto que na distribuição vertical não houve diferença. Espécies mais abundantes foram Prorocentrum balticum (Lohmann) Loeblich 1970, P. compressum (Bailey) Abéex Dodge 1975 e P. gracile Böhm 1933 e Coccolithus sp.. Já nas piscias naturais, apesar do filo Ochrophyta ter sido o mais evidenciado, as espécies mais representativas encontradas de acordo com a densidade foram Prorocentrum balticum (Lohmann) Loeblich 1970, P. lima (Ehrenberg) F. Stein 1878, Pyrophacus sp. e Ostreopsis ovata Fukuyo 1981. De um modo geral, quatro diferentes filos foram identificados com um total de 195 taxa. No entorno do Atol das Rocas, o aumento de biomassa fitoplanctônica no transecto NO, foi provocado pelo “efeito ilha” e não pela ressurgência. Além disso, as condições oceanográficas influenciaram na distribuição da comunidade fitoplanctônica. Nas piscinas naturais, apesar da composição apresentar diferença espacial, nenhum parâmetro hidrológico foi determinante. No entanto, pode-se observar um padrão sazonal, havendo um aumento quali-quantitativo do fitoplâncton no período chuvoso, no qual, o hidrodinamismo local, proporcionou condições mais favoráveis para o enriquecimento da diversidade, com ênfase nas espécies que compõem a microflora bentônica. / Knowledge of the composition and distribution of primary producers is essential to understand the trophic dynamics of ocean food webs. The composition of phytoplankton in the South Atlantic Ocean is still being explored, and in some regions this diversity has never been described, as in the case of Biological Reserve of Atol das Rocas. The atoll is located in south of the equator (3°51’S and 33°49’W), some 143 nautical miles from the city of Natal, in the state of Rio Grande do Norte (Brazil). The aim of this paper is to characterize the phytoplankton community structure in the natural pools of Atol das Rocas and its surrounding area by correlating environmental variables. The samples were collected around the atoll in July 2010 on board the Brazil Navy Oceanographic ship, the Cruzeiro do Sul. Two transects were established according to the surface current; a transect oriented southeast (SE) and a transect oriented northwest (NW) of atoll. Three collection points were established for each of the transects. The samples were collected at different depths (surface and DCM - Deep Chlorophyll Maximum) and during different periods of the day (daytime and nighttime). Sampling occurred at the pools Barretinha, Cemitério, Tartarugas, Rocas and Barretão in different climate periods of 2012 and 2013. Oceanographic parameters which were used to analyze the influence on phytoplankton structure were salinity, water temperature, dissolved oxygen, dissolved inorganic nutrients content and chlorophyll a. Samples were collected to analyse microphytoplankton using mesh net of 20μm and phytoplankton density using bottle Niskin. Around the atoll, most of the environmental variables increased significantly due to turbulence in NW transect. Increased contents of chlorophyll a and nutrients and a reduction of temperature and oxygen in the mixing layer were also detected due to the influence of the SACW (South Atlantic Central Water). In the NW transect, the phytoplankton community corresponded strongly with the salinity and temperature parameters due to thermohaline instability resulting from the interaction of Tropical Water masses and Central Water masses of the South Atlantic. The samples presented a horizontal spatial variation, with highest participation of the phylo Ochrophyta closer to the atoll and Dinophyta further from the atoll, while vertical distribution patterns were not observed. The most representative species were Prorocentrum balticum (Lohmann) Loeblich 1970, P. compressum (Bailey) Abéex Dodge 1975 and P. gracile Böhm 1933, and Coccolithus sp.. The predominant group in the natural pools was Ochrophyta. In spite of the predominance of this group, the most representative species found in the pools in terms of density were Prorocentrum balticum (Lohmann) Loeblich 1970, P. lima (Ehrenberg) F.Stein 1878, Pyrophacus sp. and Ostreopsis ovata Fukuyo 1981. In general, four different phyla were identified with a total of 195 taxa. In the area surrounding Atol das Rocas, an increase in phytoplankton biomass in transect NW was caused by the "island effect" and not by the upwelling. Furthermore, the oceanographic conditions influenced the distribution of the phytoplankton community. Despite the spatial difference of the composition found in the natural pools, there was no determinant hydrological parameter. However, a seasonal pattern was observed, with a qualitative and quantitative increase of phytoplankton during the rainy season when the local hydrodynamics provides more favourable conditions for the enrichment of diversity, especially among species that compose the benthic microflora.

Esta tese aborda a geobiologia do único Atol do Oceano Atlântico Sul. Diferentes classificações foram realizadas para o complexo recifal de Rocas ao longo dos séculos XIX e XX, as quais são avaliadas historicamente. Análises biogeomorfológicas e de mapeamento das unidades recifais foram realizadas no Atol das Rocas para a compreensão da dinâmica sedimentar e do relevo deste recife oceânico. Os diferentes compartimentos recifais são afetados por processos biogeomorfológicos como controle de processos erosivos, bioproteção, bioerosão recifal, bioturbação, cimentação de areia carbonática biogênica, produção de sedimentos biodetríticos e bioconstrução (principalmente de algas calcáreas, corais, vermetídeos e foraminíferos). Organismos diversos incluindo aves, peixes, tartarugas, corais, zoantídeos, algas, moluscos, poliquetas, sipunculídeos, foraminíferos e microorganismos agem nos diferentes grupos de processos biogeomorfológicos gerando as características únicas do Atol. O recife oceânico se desenvolveu provavelmente nos últimos 7000 anos do Período Neógeno. A paleohidrodinâmica da corrente oceânica, variações no gradiente de energia no lado a barlavento e sotavento e, sobretudo, as oscilações eustáticas holocênicas foram preponderantes na evolução recifal. Em níveis de mar alto uma grande laguna composta por comunidades bentônicas se formou com grande diversidade biológica. Eventos regressivos e de erosão por ação de ondas e correntes levou as feições observadas atualmente, tais como o ambiente lagunar raso (<6m profundidade), de um amplo depósito arenoso e das ilhas à sotavento. A dinâmica temporal e espacial de sete comunidades principais de ambientes submersos, intertidais e emersos é demonstrada pela primeira vez. / This thesis approaches the geobiology of the only Atoll in the South Atlantic Ocean. Different classifications were made for Rocas Reef Complex along the nineteenth and twentieth century, which are evaluated historically. Biogeomorphological analysis and mapping of the reef units were done on the Rocas Atoll for the comprehension of the sedimentary dynamic and of the relief of this oceanic reef. The different reef compartments are affected by biogeomorphological processes such as erosive process control, bioprotection, bioerosion, bioturbation, cementing of the biogenic carbonate sand, production of biodetritic sediments and bioconstruction (especially of calcareous algae, vermetids, corals and foraminifers). Different organisms including birds, fishes, turtles, corals, zoanthids, algae, mollusks, polychaets, sipunculids, foraminifers and microorganisms act in the different groups of biogeomorphological processes generating the unique characteristics of the Atoll. The oceanic reef developed over the past 7000 years in the Neogene Period. The paleohydrodynamic of the oceanic current, variations of the gradient of energy on the leeward/windward side and, above all, the eustatic holocenic oscillations were predominant in the reef evolution. In high sea levels a lagoon composed by bentonic communities formed with great biological diversity. The regression and erosion by waves and currents led to the formation of shallow lagoon environment, extensive sandy deposit and the Islands in leeward side. The temporal and spatial dynamic of seven main communities of underwater, intertidal and emerged environments is shown for the first time.

PAIVA, Carolina Cerqueira de. Distribuição de recrutas e adultos de cinco espécies de peixes recifais do Atol das Rocas. 2008. 76f. Dissertação(Mestrado em engenharia de Pesca) - Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2008. / Submitted by Maria Naires Souza (marianaires@ufc.br) on 2011-12-02T23:07:47Z No. of bitstreams: 1 2008-dis-ccpaiva.pdf: 3925479 bytes, checksum: c5d5fc9f1c2ec9e4662e821839088cba (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Nascimento(vieiraaline@yahoo.com.br) on 2011-12-08T12:07:01Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008-dis-ccpaiva.pdf: 3925479 bytes, checksum: c5d5fc9f1c2ec9e4662e821839088cba (MD5) / Made available in DSpace on 2011-12-08T12:07:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008-dis-ccpaiva.pdf: 3925479 bytes, checksum: c5d5fc9f1c2ec9e4662e821839088cba (MD5) Previous issue date: 2008-10-02 / The success in the recruitment of reef fish depends on the number of individuals who survive after larvae have entered in the reef environment. Different post-recruitment processes are responsible for the distribution of recruits and adults and consequently, for the structure of their populations. The distribution of Abudefduf saxatilis, Stegastes rocasensis, Thalassoma noronhanum, Acanthurus chirurgus and Acanthurus coeruleus recruits and adults were assessed through visual censuses in the Atol das Rocas. 13 sample stations with contrasting features were pooled in five categories: nine pools, a tidal pond formation, a patch reef formation, a sandstone reef and an algae crest. Pools were classified as connected (Barretinha, Barreta Falsa and Podes Crer) and non-permanently connected (Farol 2, Garoupinha, Cemitério, Âncoras, Abrolhos and Tartarugas) with the ocean. Non-connected pools were classified in shallow (Farol 2, Garoupinha and Cemitério) and deep (Âncoras, Abrolhos and Tartarugas). Unifactorial analysis of variance revealed that tidal ponds and pools were the most preferred categories among recruits, while the majority of adults avoided tidal ponds. Independent t-tests per groups demonstrated that the type of pool connectivity with the ocean affected the distribution of the largest part of recruits, however to a much lesser extent in the case of adults. Non-connected pool depth affected the distribution of most recruits and all adults. Migratory movements, structural complexity, reef substrate coverage, the presence of conspecifics, food availability and predator presence are post-recruitment processes that probably affected recruit and adult distribution. Depth may have also influenced A. chirurgus, A. saxatilis recruits and A. coeruleus adults to a certain extent. No A. coeruleus recruits have been observed. / O sucesso no recrutamento de peixes recifais depende do número de indivíduos que sobrevivem após a entrada das larvas no ambiente recifal. Diversos processos pós-recrutamento são responsáveis pela distribuição de recrutas e adultos e, conseqüentemente, pela estruturação da população destes. A partir da realização de censos visuais subaquáticos foi caracterizada a distribuição dos recrutas e adultos de Abudefduf saxatilis, Stegastes rocasensis, Thalassoma noronhanum, Acanthurus chirurgus e Acanthurus coeruleus no Atol das Rocas. Foram amostradas 13 estações com características contrastantes, formando cinco categorias: nove piscinas, uma formação de poças de maré, uma formação de recifes em mancha, um recife de arenito e uma crista algálica. As piscinas foram classificadas em conectadas (Barretinha, Barreta Falsa e Podes Crer) e não conectadas (Farol 2, Garoupinha, Cemitério, Âncoras, Abrolhos e Tartarugas) permanentemente com o oceano. As piscinas não conectadas, por sua vez, foram classificadas em rasas (Farol 2, Garoupinha e Cemitério) e fundas (Âncoras, Abrolhos e Tartarugas). Análises de variância unifatoriais revelaram que as poças de maré e as piscinas foram as categorias de maior preferência entre os recrutas enquanto as poças de maré foram evitadas pela maioria dos adultos. Testes-t independente por grupos demonstraram que o tipo de conectividade das piscinas com o oceano interferiu na distribuição da maior parte dos recrutas, mas nem tanto na dos adultos. Já a profundidade das piscinas não conectadas influenciou a distribuição da maioria dos recrutas e de todos os adultos. Movimentos migratórios, complexidade estrutural e cobertura do substrato, presença de outros indivíduos da mesma espécie, disponibilidade de alimento e presença de predadores são os processos pós-recrutamento que provavelmente influenciaram a distribuição de recrutas e adultos. Além disso, a profundidade também pode ter exercido alguma interferência na distribuição de A. chirurgus, dos recrutas de A. saxatilis e dos adultos de A. coeruleus. Não foram observados recrutas de A. coeruleus

Esta tese aborda a geobiologia do único Atol do Oceano Atlântico Sul. Diferentes classificações foram realizadas para o complexo recifal de Rocas ao longo dos séculos XIX e XX, as quais são avaliadas historicamente. Análises biogeomorfológicas e de mapeamento das unidades recifais foram realizadas no Atol das Rocas para a compreensão da dinâmica sedimentar e do relevo deste recife oceânico. Os diferentes compartimentos recifais são afetados por processos biogeomorfológicos como controle de processos erosivos, bioproteção, bioerosão recifal, bioturbação, cimentação de areia carbonática biogênica, produção de sedimentos biodetríticos e bioconstrução (principalmente de algas calcáreas, corais, vermetídeos e foraminíferos). Organismos diversos incluindo aves, peixes, tartarugas, corais, zoantídeos, algas, moluscos, poliquetas, sipunculídeos, foraminíferos e microorganismos agem nos diferentes grupos de processos biogeomorfológicos gerando as características únicas do Atol. O recife oceânico se desenvolveu provavelmente nos últimos 7000 anos do Período Neógeno. A paleohidrodinâmica da corrente oceânica, variações no gradiente de energia no lado a barlavento e sotavento e, sobretudo, as oscilações eustáticas holocênicas foram preponderantes na evolução recifal. Em níveis de mar alto uma grande laguna composta por comunidades bentônicas se formou com grande diversidade biológica. Eventos regressivos e de erosão por ação de ondas e correntes levou as feições observadas atualmente, tais como o ambiente lagunar raso (<6m profundidade), de um amplo depósito arenoso e das ilhas à sotavento. A dinâmica temporal e espacial de sete comunidades principais de ambientes submersos, intertidais e emersos é demonstrada pela primeira vez. / This thesis approaches the geobiology of the only Atoll in the South Atlantic Ocean. Different classifications were made for Rocas Reef Complex along the nineteenth and twentieth century, which are evaluated historically. Biogeomorphological analysis and mapping of the reef units were done on the Rocas Atoll for the comprehension of the sedimentary dynamic and of the relief of this oceanic reef. The different reef compartments are affected by biogeomorphological processes such as erosive process control, bioprotection, bioerosion, bioturbation, cementing of the biogenic carbonate sand, production of biodetritic sediments and bioconstruction (especially of calcareous algae, vermetids, corals and foraminifers). Different organisms including birds, fishes, turtles, corals, zoanthids, algae, mollusks, polychaets, sipunculids, foraminifers and microorganisms act in the different groups of biogeomorphological processes generating the unique characteristics of the Atoll. The oceanic reef developed over the past 7000 years in the Neogene Period. The paleohydrodynamic of the oceanic current, variations of the gradient of energy on the leeward/windward side and, above all, the eustatic holocenic oscillations were predominant in the reef evolution. In high sea levels a lagoon composed by bentonic communities formed with great biological diversity. The regression and erosion by waves and currents led to the formation of shallow lagoon environment, extensive sandy deposit and the Islands in leeward side. The temporal and spatial dynamic of seven main communities of underwater, intertidal and emerged environments is shown for the first time.

Esta tese aborda a geobiologia do único Atol do Oceano Atlântico Sul. Diferentes classificações foram realizadas para o complexo recifal de Rocas ao longo dos séculos XIX e XX, as quais são avaliadas historicamente. Análises biogeomorfológicas e de mapeamento das unidades recifais foram realizadas no Atol das Rocas para a compreensão da dinâmica sedimentar e do relevo deste recife oceânico. Os diferentes compartimentos recifais são afetados por processos biogeomorfológicos como controle de processos erosivos, bioproteção, bioerosão recifal, bioturbação, cimentação de areia carbonática biogênica, produção de sedimentos biodetríticos e bioconstrução (principalmente de algas calcáreas, corais, vermetídeos e foraminíferos). Organismos diversos incluindo aves, peixes, tartarugas, corais, zoantídeos, algas, moluscos, poliquetas, sipunculídeos, foraminíferos e microorganismos agem nos diferentes grupos de processos biogeomorfológicos gerando as características únicas do Atol. O recife oceânico se desenvolveu provavelmente nos últimos 7000 anos do Período Neógeno. A paleohidrodinâmica da corrente oceânica, variações no gradiente de energia no lado a barlavento e sotavento e, sobretudo, as oscilações eustáticas holocênicas foram preponderantes na evolução recifal. Em níveis de mar alto uma grande laguna composta por comunidades bentônicas se formou com grande diversidade biológica. Eventos regressivos e de erosão por ação de ondas e correntes levou as feições observadas atualmente, tais como o ambiente lagunar raso (<6m profundidade), de um amplo depósito arenoso e das ilhas à sotavento. A dinâmica temporal e espacial de sete comunidades principais de ambientes submersos, intertidais e emersos é demonstrada pela primeira vez. / This thesis approaches the geobiology of the only Atoll in the South Atlantic Ocean. Different classifications were made for Rocas Reef Complex along the nineteenth and twentieth century, which are evaluated historically. Biogeomorphological analysis and mapping of the reef units were done on the Rocas Atoll for the comprehension of the sedimentary dynamic and of the relief of this oceanic reef. The different reef compartments are affected by biogeomorphological processes such as erosive process control, bioprotection, bioerosion, bioturbation, cementing of the biogenic carbonate sand, production of biodetritic sediments and bioconstruction (especially of calcareous algae, vermetids, corals and foraminifers). Different organisms including birds, fishes, turtles, corals, zoanthids, algae, mollusks, polychaets, sipunculids, foraminifers and microorganisms act in the different groups of biogeomorphological processes generating the unique characteristics of the Atoll. The oceanic reef developed over the past 7000 years in the Neogene Period. The paleohydrodynamic of the oceanic current, variations of the gradient of energy on the leeward/windward side and, above all, the eustatic holocenic oscillations were predominant in the reef evolution. In high sea levels a lagoon composed by bentonic communities formed with great biological diversity. The regression and erosion by waves and currents led to the formation of shallow lagoon environment, extensive sandy deposit and the Islands in leeward side. The temporal and spatial dynamic of seven main communities of underwater, intertidal and emerged environments is shown for the first time.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-08-09T11:59:41Z No. of bitstreams: 1 Isis Santos Cabral Carneiro.pdf: 1623059 bytes, checksum: c3b08c3aad9561bb6e52b0ccf1e4e5d0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-09T11:59:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Isis Santos Cabral Carneiro.pdf: 1623059 bytes, checksum: c3b08c3aad9561bb6e52b0ccf1e4e5d0 (MD5) Previous issue date: 2016-02-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The reef environments have the highest species diversity among marine ecosystems. The reef fish communities are characterized by their high diversity, both in terms of numbers of species as in morphology and are important components of the biota of these environments, working in the structuring of communities through predation and competition processes. The structure of fish populations respond to various environmental factors (rainfall regime, environmental geomorphology, tidal dynamics, water transparency, quality and type of organic matter, current velocity and availability of food resources), these factors influence the spatial distribution and temporal species. Thus, this aimed to understand the timeline distribution of fish populations between the pools with or without connection to the open sea in Rocas Atoll, identifying the environmental characteristics with the greatest influence on the structure of fish populations. This is the only atoll in the South Atlantic Ocean and is located 266 km off the Brazilian coast, differs from other atolls because it is composed exclusively of algae encrusting coralline. In its plateau occur tidal pools, canals and sandy islands. 90 hours of diving were held in two pools with connection to the open sea and two disjoint through five linearly arranged transects the edge to the center of the pool, including the dry and rainy seasons. The temperature data were recorded, salinity, pH and dissolved oxygen from each pool much water in the dry season and the rainy. It was identified to the substrate composition of the pools through the photos using the methodology Coral Point Count with Excel Extensions program. 12,065 individuals, distributed in 20 families and 33 species were observed. The pools with connection with the sea showed the highest values of diversity and abundance and presented as the most abundant species Thalassoma noronhanum, Acanthurus chirurgus, Abudefduf saxatilis and Stegastes rocacensis, these species are equivalent to 87.3% of relative abundance these pools. The pools without connection with the sea showed a difference in the fish community in comparison to the pools with connection, being the most abundant species the A.saxatilis, A. chirurgus, T. noronhanum and Haemulon chrysargyreum. The richness, diversity and equitability varied between climatic periods and connection type. A significant correlation between the diversity and depth (RS 0,322e = p <0.05) was observed. They were observed seven types of substrate: coral, zoanthid, turf algae, seaweed, corallinae algae, gravel and sand. The substrate showed a correlation between the two pools open with rS = 0.857, p <0.05 where both presented seaweed as most of the substrate. In Rocas Atoll the connection type and depth of the pool, time of year and the type of substrate influence the composition and distribution of fish populations between the pools. / Os ambientes recifais apresentam a maior diversidade de espécies dentre os ecossistemas marinhos. As comunidades de peixes recifais são caracterizadas pela sua elevada diversidade, tanto em termos de números de espécies como em morfologia, sendo componentes importantes da biota destes ambientes, atuando na estruturação das comunidades através de processos de predação e competição. A estrutura da ictiofauna responde a diversos fatores ambientais (regime de pluviosidade, geomorfologia do ambiente, dinâmica da maré, transparência da água, qualidade e tipo de matéria orgânica, velocidade das correntes e disponibilidade dos recursos alimentares), esses fatores influenciam na distribuição espacial e temporal das espécies. Desta forma, o presente objetivou compreender a distribuição espaço temporal da ictiofauna entre as piscinas com ou sem conexão com o mar aberto no Atol das Rocas, identificando as características ambientais com maior influência na estruturação da ictiofauna. Este é o único atol do Oceano Atlântico Sul e está localizado a 266 km da costa brasileira, difere dos outros atóis porque é composto exclusivamente por algas coralíneas incrustantes. Em seu platô ocorrem piscinas de maré, canais e ilhas arenosas. Foram realizadas 90 horas de mergulho, em duas piscinas com conexão com o mar aberto e duas sem conexão, por meio de cinco transectos dispostos linearmente da borda para o centro da piscina, abrangendo os períodos seco e chuvoso. Foram registrados os dados de temperatura, salinidade, pH e oxigênio dissolvido da água de cada piscina tanto no período seco como no chuvoso. Foi identificada a composicão do substrato das piscinas através da metodologia de fotografias utilizando o programa Coral Point Count with Excel Extensions. Foram observados 12.065 indivíduos, distribuídos em 20 famílias e 33 espécies. As piscinas com conexão com o mar apresentaram os maiores valores de diversidade e abundância e apresentaram como espécie mais abundantes Thalassoma noronhanum, Acanthurus chirurgus, Abudefduf saxatilise, Stegastes rocacensis, essas espécies equivalem a 87,3% da abundância relativa dessas piscinas. As piscinas sem conexão com o mar apresentaram uma diferença na composição ictiofaunística em comparação com as piscinas fechadas, sendo as espécies mais abundantes o Abudefuf saxatilis, A. chirurgus, T. noronhanum e Haemulonchrysargyreum. Os valores de riqueza, diversidade e equitabilidade variaram entre períodos climáticos e tipo de conexão. Foi observada uma correlação entre a diversidade e profundidade (rS=0,322e p<0,05).Foram observados sete tipos de substrato: coral, zoantídeo, alga turf, macroalga, alga coralínea, cascalho e areia. O substrato apresentou correlação entre as duas piscinas abertas com rS =0,857 e p<0,05 onde ambas apresentaram macroalgas como maior parte do substrato. No Atol das Rocas o tipo de conexão e profundidade da piscina, período do ano e o tipo de substrato influenciam na composição e distribuição da ictiofauna entre as piscinas.

nÃo hà / O sucesso no recrutamento de peixes recifais depende do nÃmero de indivÃduos que sobrevivem apÃs a entrada das larvas no ambiente recifal. Diversos processos pÃs-recrutamento sÃo responsÃveis pela distribuiÃÃo de recrutas e adultos e, conseqÃentemente, pela estruturaÃÃo da populaÃÃo destes. A partir da realizaÃÃo de censos visuais subaquÃticos foi caracterizada a distribuiÃÃo dos recrutas e adultos de Abudefduf saxatilis, Stegastes rocasensis, Thalassoma noronhanum, Acanthurus chirurgus e Acanthurus coeruleus no Atol das Rocas. Foram amostradas 13 estaÃÃes com caracterÃsticas contrastantes, formando cinco categorias: nove piscinas, uma formaÃÃo de poÃas de marÃ, uma formaÃÃo de recifes em mancha, um recife de arenito e uma crista algÃlica. As piscinas foram classificadas em conectadas (Barretinha, Barreta Falsa e Podes Crer) e nÃo conectadas (Farol 2, Garoupinha, CemitÃrio, Ãncoras, Abrolhos e Tartarugas) permanentemente com o oceano. As piscinas nÃo conectadas, por sua vez, foram classificadas em rasas (Farol 2, Garoupinha e CemitÃrio) e fundas (Ãncoras, Abrolhos e Tartarugas). AnÃlises de variÃncia unifatoriais revelaram que as poÃas de marà e as piscinas foram as categorias de maior preferÃncia entre os recrutas enquanto as poÃas de marà foram evitadas pela maioria dos adultos. Testes-t independente por grupos demonstraram que o tipo de conectividade das piscinas com o oceano interferiu na distribuiÃÃo da maior parte dos recrutas, mas nem tanto na dos adultos. Jà a profundidade das piscinas nÃo conectadas influenciou a distribuiÃÃo da maioria dos recrutas e de todos os adultos. Movimentos migratÃrios, complexidade estrutural e cobertura do substrato, presenÃa de outros indivÃduos da mesma espÃcie, disponibilidade de alimento e presenÃa de predadores sÃo os processos pÃs-recrutamento que provavelmente influenciaram a distribuiÃÃo de recrutas e adultos. AlÃm disso, a profundidade tambÃm pode ter exercido alguma interferÃncia na distribuiÃÃo de A. chirurgus, dos recrutas de A. saxatilis e dos adultos de A. coeruleus. NÃo foram observados recrutas de A. coeruleus / The success in the recruitment of reef fish depends on the number of individuals who survive after larvae have entered in the reef environment. Different post-recruitment processes are responsible for the distribution of recruits and adults and consequently, for the structure of their populations. The distribution of Abudefduf saxatilis, Stegastes rocasensis, Thalassoma noronhanum, Acanthurus chirurgus and Acanthurus coeruleus recruits and adults were assessed through visual censuses in the Atol das Rocas. 13 sample stations with contrasting features were pooled in five categories: nine pools, a tidal pond formation, a patch reef formation, a sandstone reef and an algae crest. Pools were classified as connected (Barretinha, Barreta Falsa and Podes Crer) and non-permanently connected (Farol 2, Garoupinha, CemitÃrio, Ãncoras, Abrolhos and Tartarugas) with the ocean. Non-connected pools were classified in shallow (Farol 2, Garoupinha and CemitÃrio) and deep (Ãncoras, Abrolhos and Tartarugas). Unifactorial analysis of variance revealed that tidal ponds and pools were the most preferred categories among recruits, while the majority of adults avoided tidal ponds. Independent t-tests per groups demonstrated that the type of pool connectivity with the ocean affected the distribution of the largest part of recruits, however to a much lesser extent in the case of adults. Non-connected pool depth affected the distribution of most recruits and all adults. Migratory movements, structural complexity, reef substrate coverage, the presence of conspecifics, food availability and predator presence are post-recruitment processes that probably affected recruit and adult distribution. Depth may have also influenced A. chirurgus, A. saxatilis recruits and A. coeruleus adults to a certain extent. No A. coeruleus recruits have been observed.