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Sazonalidade da dieta e hábitos alimentares do gavião-peneira (Elanus leucurus) em habitats agrícolas no sul do Brasil /Scheibler, Daniel Ricardo. January 2003 (has links)
Orientador: Edwin O'Neill Willis / Resumo: Eu analisei a dieta sazonal e os hábitos alimentares do gavião-peneira (Elanus leucurus) numa área agrícola (29o35'S, 52o12'W) no município de Venâncio Aires, Rio Grande do Sul, através de restos de presas encontradas em 1134 pelotas que eu coletei entre dezembro de 1997 e novembro de 2000. Pequenos mamíferos foram as presas mais consumidas (95%), seguido por aves (4,6%) e répteis mais insetos (0,4%). A dieta do gavião claramente refletiu o impacto da atividade agrícola sobre seu hábitat. O roedor exótico Mus musculus foi a espécie mais predada (67,4%) e, secundariamente, os roedores nativos Akodon paranaensis e Necromys lasiurus, o marsupial Monodelphis dimidiata e as aves. O roedor Cavia aperea também foi importante devido à biomassa fornecida para a dieta do gavião. Mus musculus foi a presa mais consumida durante todas as épocas do ano, porém, apresentou um claro padrão de variação sazonal, com taxas de consumo máximas e mínimas registradas para o inverno e verão, respectivamente. Houve relativamente pouca variação interanual na dieta. Na época não reprodutiva do gavião-peneira (outono/inverno), M. musculus forneceu a maior parte da biomassa ingerida por este predador. Porém, em sua época reprodutiva (primavera/verão), as presas nativas de pequenos mamíferos também contribuíram significativamente. A biomassa ingerida por pelota e o tamanho das presas de pequenos mamíferos consumidas aumentaram durante a época de reprodução do gavião. Isto aconteceu sobretudo por causa do aumento do consumo sobre indivíduos adultos de M. musculus, A. paranaensis, N. lasiurus e M. dimidiata durante esse período / Abstract: I analyzed the seasonal diet and food habits of the White-tailed Kite (Elanus leucurus) in an agricultural area (29o35'S, 52o12'W) near Venâncio Aires, southern Brazil, from 1,134 pellets collected from December 1997 to November 2000. Small mammals were the main prey (95%), followed by birds (4.6%), and reptiles plus insects (0.4%). The diet of the White-tailed Kite clearly reflected the agricultural impact on its habitat. The exotic rodent Mus musculus was the principal prey (67.4%) and, secondarily, the native rodents Akodon paranaensis and Necromys lasiurus, the marsupial Monodelphis dimidiata, and birds. The rodent Cavia aperea was also important due to its biomass. Mus musculus was the prey more taken during all seasons, however, it showed an evident pattern of seasonal variation, with maximum and minimum consumption rates during the winter and summer, respectively. There was relatively little variation in the kites' diet between years. During the kite non-breeding season (fall-winter), M. musculus furnished most of the biomass ingested. However, during its breeding season (spring-summer), native small mammal prey also contributed significantly. The biomass ingested per pellet and size of small mammal prey taken increased during the kite breeding season. This occurred primarily because of the greater consumption of adult individuals of M. musculus, A. paranaensis, N. lasiurus and M. dimidiata during this period / Mestre
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Ácaros de penas (Acari: Astigmata) em aves não passeriformes do Brasil /Pedroso, Luiz Gustavo de Almeida. January 2015 (has links)
Orientador: Fabio Akashi Hernandes / Banca: Claudio José Von Zuben / Banca: Carlos Holger Wenzel Flachtmann / Resumo: Ácaros de penas são os artrópodes mais abundantes e diversos de vida permanente que habitam a superfície do corpo das aves. Eles possuem adaptações morfológicas para a vida em 4 tipos de microhabitats no corpo de seus hospedeiros, o que aumenta a diversidade de espécies de ácaros por espécie de ave consideravelmente. Existe ainda uma alta especificidade entre ave e ácaro, devido a transmissão ocorrer principalmente no cuidado parental, de modo que cada grupo de ave tende a apresentar seu grupo específico de ácaros de penas, o que dá indícios à evolução paralela entre os grupos. Apesar de casos isolados de parasitismo, ácaros de penas geralmente não causam danos a seus hospedeiros, e são considerados ectocomensais. O Brasil é um dos países com a maior diversidade de aves, com mais de 1900 espécies; dessas, são conhecidos ácaros de penas de pouco mais de 250 espécies, de modo que muitas ordens de aves no país nunca tiveram sua fauna de ácaros de penas explorada. Desse modo o objetivo do presente estudo é levantar ácaros de penas em aves não Passeriformes do Brasil. O principal método de coleta desses ectocomensais foi de lavagem de hospedeiros encontrados mortos em acidentes em rodovias e aeroportos do país, com seguinte coleta de ácaros do material filtrado sob estereomicroscópio, também foram realizadas coletas em peles taxidermizadas de museus e de penas provenientes de aves em cativeiro. Os ácaros coletados foram montados em lâminas de microscopia para identificação utilizando-se o meio de Hoyer. No total, 62 espécies de aves de 17 ordens tiveram seus ácaros de penas analisados, e 32 espécies de aves tiveram seus ácaros de penas analisados pela primeira vez. 139 espécies de ácaros de 77 gêneros foram encontrados, sendo 48 o número de ácaros identificados até o nível específico e 10 são possíveis novos gêneros. A superfamília Analgoidea, que ocorre principalmente em aves Passeriformes... / Abstract: Feather mites are the most diverse fauna of arthropods that permanently lives on birds. These mites are morphologicaly adapted to four different microhabitats on their host feathers, which contributes to their diversity. There is a high specificity between the mites and their bird hosts, especially due to the transmission process that occurs mainly from parents to offspring during the parental care, so that each bird group often hosts a specific feather mite fauna, exposing the parallel evolution between these groups. Despite some isolated cases of parasitism, most feather mites are not true parasites, but are rather considered as ectocommensals. Brazil is one of the richest countries in bird diversity, with more than 1900 species reported; in spite of that, feather mites are known for only about 250 Brazilian birds, and even some bird orders have never have examined for feather mites. The aim of this study is to report the feather mite fauna from non passerine birds in Brazil. Roadkilled birds were washed and the mites which remained in the filter paper were collected under dissecting microscope. Feather mites were also collected from museum skins and from feathers collected from captivity birds. The mites were mounted on microscopic slides for identification using Hoyer‟s medium. In total, 62 bird species in 17 orders had their feather mites analyzed, 32 of which being analyzed for the first time. 139 species of feather mites of 77 genera were recorded, being 48 mites identified to the species level and 10 probably represent new genera. 57 mites species belonged to the superfamily Analgoidea, which occurs mainly on the order Passeriformes and on aquatic birds, while Pterolichoidea, with 82 recorded species, occurs mainly on non passerine, terrestrial birds. The most abundant mite family was Pterolichidae (Pterolichoidea), with 40 species in 9 bird orders, followed by Xolalgidae (Analgoidea) (19 species) and Gabuciniidae ... / Mestre
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O efeito da estrutura da matriz na percepção de aves na paisagem /Giubbina, Marina Furlan. January 2015 (has links)
Título da capa: O efeito da estrutura da matriz na percepção de aves de sub-bosque na paisagem / Orientador: Milton Cezar Ribeiro / Coorientador: Marco Aurelio Pizo / Banca: Carlos Otavio Araujo Gussoni / Banca: Eduardo Roberto Alexandrino / Resumo: O aumento da demanda de produtos agrícolas vem causando intensa perda e fragmentação de habitat, resultando em modificações espaciais na paisagem e perda de biodiversidade. As modificações no uso e cobertura do solo, causadas por atividades antrópicas, são chamadas de matriz e sua composição e estrutura podem gerar uma grande barreira na movimentação de organismos entre fragmentos, influenciando negativamente a conectividade funcional para muitas espécies. O experimento de playback tem se mostrado eficiente para realizar experimentos de movimentação de aves entre fragmentos para inferências sobre conectividade funcional e percepção da paisagem pelas espécies. Deste modo, este estudo teve como objetivo avaliar a presença e estrutura da matriz na movimentação na paisagem das espécies de aves Thamnophilus caerulescens (choca-da-mata) e Synallaxis frontalis (petrim). Doze paisagens contendo as matrizes cana-de-açúcar e Eucalyptus e fragmentos florestais configurados espacialmente contendo sinuosidades foram selecionados. Utilizando o método de playback nas sinuosidades as aves tiveram a opção de seguir as vocalizações de um ponto para outro da curva por uma rota mais curta atravessando a matriz e outra mais longa pela borda do fragmento. As distâncias entre os playbacks variaram de 30 a 130 metros. O controle foi realizado dentro dos remanescentes, no qual as vocalizações foram reproduzidas inicialmente na borda dos fragmentos e foi-se adentrando ao remanescente até à distância que os indivíduos cessaram as respostas. Assim, através de análises de variância, foi possível verificar que há maior preferência de seguir o playback pela borda do fragmento do que pelas matrizes. Também foi apurado que há uma correlação negativa entre distância e probabilidade de passagem pela matriz e que as espécies seguem o playback a distâncias maiores no controle do que em ambas as matrizes. Ao comparar cana-de-açúcar... / Abstract: The increased demand for agricultural products results in intense habitat loss and fragmentation, causing spatial changes in landscapes and biodiversity loss. The intervening matrix, i.e. non-habitat environments surrounding habitat patches, can act as barrier in the movement of organisms between fragments, reducing the functional connectivity for many species. But the influence of matrix composition and its structure on fauna movement rarely has been quantified. Thus, this study aimed to evaluate the influence of the presence and structure of the matrix in the movement of two forest-dependent bird species: Thamnophilus caerulescens and Synallaxis frontalis. Twelve landscapes containing sugarcane and Eucalyptus matrices Using playback trials in the sinuosity the birds had the option of following the vocalizations from one point to another in the curve by two different routes, (1) a shorter one through the matrix and (2) another longer inside fragment's edge. The distances between the playbacks ranged from 30 to 130 meters. Control trials were done within the remaining, in which the vocalizations were first played at the forest edges. As the individuals answered the voalizations, the playback was reproduced 10 meters increasingly inside the remnant, observing the distances traveled by each species. Thus, through analysis of variance and GLMS, it observed that there is a greater preference by following the playback inside the forest edge than by the matrix. It was also found that there is a negative correlation between distance and probability to cross the matrix and the species followed playback at greater distances in control than in both routes. By comparing sugarcane and Eucalyptus it was found that the first was more permeable than the latter, demonstrating that the structure of the matrix interferes their permeability. The routes that individuals followed the playback differ between the matrices, and there was a greater expenditure of ... / Mestre
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Fatores que influenciam a presença de Tangara cayana e Taraba major na região oeste do Estado de São Paulo, Brasil /Meira, Natalia Toni de. January 2016 (has links)
Orientador: Fernando Frei / Banca: Ciro Cesar Zanini Branco / Banca: Maria Cecília Barbosa de Toledo / Resumo: O habitat de um animal é influenciado por muitos fatores, portanto conhecer suas necessidades ecológicas permite propiciar um sucesso em sua conservação, um exemplo são as aves que devido a alterações ambientais pode ter sua riqueza e abundância modificadas. O objetivo do estudo foi avaliar quais fatores determinam a presença de Tangara cayana e Taraba major em uma área influenciada por atividades antrópicas. Testamos a hipótese de que a distribuição de Tangara cayana fosse mais dispersa e a de Taraba major fosse mais próxima a pontos hídricos. O estudo foi realizado entre os meses de agosto de 2014 até setembro de 2015 com observações das aves em 120 pontos fixos de 150m² em propriedades rurais de Assis-SP, foram avaliadas algumas variáveis entre elas céu e temperatura no momento da observação, interior ou borda de uma floresta, área aberta, região de várzea, presença de árvores mortas como poleiro, árvores mortas com insetos, árvores frutíferas, gramíneas, cobertura e altura do dossel, distância de culturas e pastagens, distância da rodovia e de estradas não pavimentadas, distância de linha férrea, distância de pontos hídricos e de residências. Os dados foram analisados através da Regressão Logística para a criação de modelos de probabilidade. E também se comparou o mesmo ambiente estudado entre os anos de 1970 e 2014. Os resultados sugerem que a presença de T. cayana é favorecida quando a temperatura está reduzida, quando há uma proximidade aos pontos hídricos, quando o do... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The habitat of an animal is influenced by many factors, so know their ecological needs enables provide a success in its conservation, an example are the birds that due to environmental changes can have their wealth and abundance changed. The aim of this study was to evaluate which factors determine the presence of Tangara cayana and Taraba major in an area influenced by human activities. We tested the hypothesis that the distribution was more dispersed Tangara cayana and Taraba major was the nearest water point. The study was conducted between the months of August 2014 to September 2015. Observations of birds were conducted in 120 fixed points of 150m² in farms of Assis-SP. We evaluated some variables including sky and temperature at the time of observation, inside or edge a forest, open area, lowland region, the presence of dead trees as perch, dead trees with insects, fruit trees, grasses, canopy cover and height, distance to crops and pastures, away from the highway and unpaved roads, distance rail line, distance to water points and residences. Data were analyzed using logistic regression to create models of probability. Also, comparing the same environment study between 1970 and 2014. The results suggest that the presence of T. cayana is favored when the temperature is reduced when there is a water proximity to points when the canopy is raised and when it is on the edge of the forest. To T. major species reduced temperature, proximity of water points and greater distance ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Determinación de la diversidad y estructura genética de patos criollos (Cairina moschata L. 1758) de los departamentos de Lambayeque y San Martín mediante el uso de microsatélitesAcuña Rodriguez, Wendy January 2016 (has links)
Examina la diversidad y estructura genética de dos poblaciones de patos criollos, Cairina moschata, empleando el polimorfismo genético de 18 marcadores microsatélites. Los parámetros utilizados incluyen número de alelos (A), números efectivo de alelos (Ae) y promedio de heterocigosidad (He) de cada población. Los resultados muestran que 11 de los 18 loci de microsatélites son altamente polimórficos: APH07, APH09, APH13, APT004, APT21, APT25, APT29, AY295, CAUD001, CAUD022 y CMO211 (PIC> 0.025). El promedio de A (6.6), Ae (2.23) y He (0.3803) de las dos poblaciones de patos es moderado a bajo, lo que indica que el polimorfismo genético y la diversidad genética son moderados. La prueba de Hardy-Weinberg demuestra que las dos poblaciones en este estudio se encuentran en desequilibrio H-W. El resultado del análisis de estadísticos F y R muestra valores de 0.115 y 0.011, lo que indica la estructuración genética baja a moderada. La tasa de endogamia (FIS) dio resultados significativos, lo que demuestra la carencia de buenos programas de manejo de la especie. Los datos indican que el 60% de los loci microsatélites evaluados son eficaces para el análisis de la diversidad genética en poblaciones de patos criollos de la región norte del Perú. / Tesis
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Detección de Chlamydia psittaci en guacamayos (Ara spp) y loros (Amazonas spp y Pionus sp) en cautiverio de un parque zoológico de Lima, PerúYupanqui Castañeda, Carmen Milagros January 2015 (has links)
Publicación a texto completo no autorizada por el autor / Evalúa la presencia de Chlamydia psittaci en 134 aves mantenidas en cautiverio de un parque zoológico de Lima, Perú. Realizó un aislamiento celular, mediante la inoculación de las muestras orofaríngeas en cultivos de células BGM, los cuales se llevaron a incubación 37°C por 6 días para continuar con la técnica de fijación, y bloqueo y posteriormente con la prueba de inmunofluorescencia directa para encontrar dicha bacteria. Las muestras fueron transportadas a Bélgica para su procesamiento, para lo cual fue necesario obtener los permisos/certificados de exportación e importación de cada país por ser procedentes de especies pertenecientes a los apéndices I y II anexos A y B de la lista del CITES (Convención sobre el comercio internacional de especies amenazadas de fauna y flora silvestre). Entre las aves muestreadas se tuvieron 6 especies de guacamayos: Ara ararauna (n=15), Ara chloroptera (n=18), Ara (Primolius) couloni (n=13), Ara macao (n=12), Ara militaris (n=8), Ara severa (n=2); 5 especies de loros de gran tamaño: Amazona amazonica (n=7), Amazona farinosa (n=14), Amazona festiva (n=5), Amazona mercenaria (n=5), Amazona ochrocephala (n=12) y 1 especie de loro de menor tamaño: Pionus menstruss (n=23). Al final del estudio, del total de aves estudiadas, se hallaron 24 (17.91%) aves positivas a Chlamydia psittaci; todas las especies del presente estudio dieron positivo, a excepción de Ara (Primolius) couloni. Esta es la primera vez que se diagnostica C. psittaci en Perú, específicamente, en aves psitácidas. / Tesis
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Diseño de una técnica biomolecular para la identificación de Haemophilus paragallinarum aislados de aves comercialesMendoza Espinoza, Alfredo January 2003 (has links)
En el presente estudio se diseñó una técnica molecular alternativa para la identificación de Haemophilus paragallinarum, agente causal de la Coriza Infecciosa, basada en el polimorfismo en longitud de los fragmentos de restricción de los genes ribosómicos 16S amplificados por la reacción en cadena de la polimerasa (RFLP-PCR). Esta metodología fue propuesta debido a que las técnicas, HPG-1 y HPG-2, las cuales vienen siendo utilizadas en la identificación de este patógeno, mostraron baja sensibilidad y reacción cruzada con Escherichia coli, respectivamente. En la técnica HPG-2 se encontró dos productos de amplificación entre 450 y 500 pb confundiéndose con el producto de 500 pb que se obtiene con H. paragallinarum. Para la estandarización de la técnica molecular propuesta, se utilizaron las cepas de referencia ATCC 29545, B y C de H. paragallinarum, y como controles negativos a Ornithobacterium rhinotracheale, Pasteurella spp., microorganismos con características morfológicas, bioquímicas y cuadros clínicos similares a H. paragallinarum; y E. coli, esta última, asociada en la Coriza Infecciosa complicada. Se utilizaron cebadores universales para amplificar los genes ribosómicos 16S con los que se obtuvo un fragmento de 1500 pb para todas las cepas, éstos fueron cortados con enzimas de restricción seleccionadas mediante el análisis de las secuencias de los genes ribosómicos 16S depositadas en el GenBank (banco de genes). Con el RFLP-PCR se obtuvo una mayor especificidad y sensibilidad ya que se identificaron perfiles genéticos específicos para H. paragallinarum y diferentes a los de O. rhinotracheale, Pasteurella spp y E. coli. La técnica diseñada fue utilizada en la identificación de 19 cepas aisladas de muestras clínicas de senos infraorbitarios y cornetes nasales de gallinas reproductoras, de postura y pollos de carne de diversas zonas del Perú obteniendo resultados reproducibles y demostrando la validez de esta técnica y su uso para una rápida identificación de microorganismos implicados en infecciones respiratorias en aves comerciales.
Palabras claves: Haemophilus paragallinarum, Ornithobacterium rhinotracheale, Coriza Infecciosa, genes ribosómicos 16S, RFLP-PCR. / --- In the present study, a technical molecular alternative for the identification of Haemophilus paragallinarum, causal agent of the Infectious Coryza, based on the restriction fragments length polymorphism of the 16S ribosomal genes amplified by the chain reaction polymerase (RFLP-PCR) was designed. This methodology was proposed due to the fact that the HPG-1 and HPG-2 techniques, which have been used for the identification of this pathogen, showed low sensitivity and crossed reaction with Escherichia coli respectively. In the HPG-2 technique, two amplification products between 450 and 500 bp were obtained, similar with the 500 bp product obtained with H. paragallinarum. For the standardization of the proposed molecular technique, we used the ATCC 29545 reference strain and the B and C strains of H. paragallinarum, as well as Ornithobacterium rhinotracheale, Pasteurella spp., microorganisms with similar morphological, biochemical characteristics and clinical signs to those of H. paragallinarum, and E. coli, bacterium associated in the complicated Infectious Coryza, as negative controls. Universal primers for amplifying the 16S ribosomal genes were used, obtaining a 1500 bp fragment for all strains which were cut by restriction enzymes selected by means of the analysis of sequences of the 16S ribosomal genes located in the Gene bank (bank of genes). With the RFLP-PCR a high specificity and sensibility were obtained since specific profiles for H. paragallinarum and different from those of O. rhinotracheale, Pasteurella spp. and E. coli were identified. The designed technique was used for the identification of 19 strains isolated from clinical samples of infraorbital sinus and nasal cornets of breeders and laying hens, and broiler chickens of diverse zones of Peru obtaining reproducible results and demonstrating the validity of this technique and its use for a rapid identification of microorganisms involved in respiratory infections in commercial birds.
Key words: Haemophilus paragallinarum, Ornithobacterium rhinotracheale, Infectious Coryza, 16S ribosomal genes, RFLP-PCR. / Tesis
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Selección del habitat de Turdus Falcaklandii y su rol sobre la dispersión de semillas de especies exóticas en bosques nativos de la Isla Robinson Crusoe / Habitat selection of Turdus Falcklandii and it's role over exotic species seed dispersal in native forest of Robinson Crusoe islandMeneses Álvarez, Luis Octavio January 2016 (has links)
Memoria para optar al título profesional de Ingeniero en Recursos Naturales Renovables / Los animales dispersores de semillas son especies clave para la reproducción y persistencia de especies de plantas nativas. Sin embargo, estos dispersores de semillas también juegan un rol opuesto al contribuir a diseminar semillas de especies invasoras hacia el bosque nativo, siendo aquel efecto perjudicial altamente dependiente del comportamiento de movimiento y selección de hábitat de estos animales. Aquí se evalúa como las decisiones de movimiento y selección de hábitat del Zorzal (Turdus falcklandii) lo convierten en un eficiente dispersor de semillas de la invasiva Mora (Rubus ulmifolius) dentro de pequeños parches remanentes de bosque nativo en la isla de Robinson Crusoe. Se usó telemetría para rastrear movimientos de escala fina de 16 zorzales durante el otoño austral. Se aplicó un Modelo de movimiento de puente Browniano (BBMM) para determinar la disponibilidad de hábitat a lo largo de cada ruta para cada zorzal. Se utilizó un modelo multiestado para determinar las probabilidades transicionales de moverse entre diferentes estados de hábitat, incluyendo la matriz de especies invasoras y parches de bosque nativo. Los zorzales tienden a estar dentro de los parches de bosque nativo, con frecuentes viajes hacia la matriz, pero retornando al bosque después de pocos minutos. Este comportamiento del movimiento sugiere que los zorzales se alimentan de mora dentro de la matriz, llevando sus semillas dentro de los parches de bosque nativo, favoreciendo el establecimiento de especies invasoras.
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Diseño de una técnica biomolecular para la identificación de Haemophilus paragallinarum aislados de aves comercialesMendoza Espinoza, Alfredo January 2003 (has links)
En el presente estudio se diseñó una técnica molecular alternativa para la identificación de Haemophilus paragallinarum, agente causal de la Coriza Infecciosa, basada en el polimorfismo en longitud de los fragmentos de restricción de los genes ribosómicos 16S amplificados por la reacción en cadena de la polimerasa (RFLP-PCR). Esta metodología fue propuesta debido a que las técnicas, HPG-1 y HPG-2, las cuales vienen siendo utilizadas en la identificación de este patógeno, mostraron baja sensibilidad y reacción cruzada con Escherichia coli, respectivamente. En la técnica HPG-2 se encontró dos productos de amplificación entre 450 y 500 pb confundiéndose con el producto de 500 pb que se obtiene con H. paragallinarum. Para la estandarización de la técnica molecular propuesta, se utilizaron las cepas de referencia ATCC 29545, B y C de H. paragallinarum, y como controles negativos a Ornithobacterium rhinotracheale, Pasteurella spp., microorganismos con características morfológicas, bioquímicas y cuadros clínicos similares a H. paragallinarum; y E. coli, esta última, asociada en la Coriza Infecciosa complicada. Se utilizaron cebadores universales para amplificar los genes ribosómicos 16S con los que se obtuvo un fragmento de 1500 pb para todas las cepas, éstos fueron cortados con enzimas de restricción seleccionadas mediante el análisis de las secuencias de los genes ribosómicos 16S depositadas en el GenBank (banco de genes). Con el RFLP-PCR se obtuvo una mayor especificidad y sensibilidad ya que se identificaron perfiles genéticos específicos para H. paragallinarum y diferentes a los de O. rhinotracheale, Pasteurella spp y E. coli. La técnica diseñada fue utilizada en la identificación de 19 cepas aisladas de muestras clínicas de senos infraorbitarios y cornetes nasales de gallinas reproductoras, de postura y pollos de carne de diversas zonas del Perú obteniendo resultados reproducibles y demostrando la validez de esta técnica y su uso para una rápida identificación de microorganismos implicados en infecciones respiratorias en aves comerciales. Palabras claves: Haemophilus paragallinarum, Ornithobacterium rhinotracheale, Coriza Infecciosa, genes ribosómicos 16S, RFLP-PCR. / In the present study, a technical molecular alternative for the identification of Haemophilus paragallinarum, causal agent of the Infectious Coryza, based on the restriction fragments length polymorphism of the 16S ribosomal genes amplified by the chain reaction polymerase (RFLP-PCR) was designed. This methodology was proposed due to the fact that the HPG-1 and HPG-2 techniques, which have been used for the identification of this pathogen, showed low sensitivity and crossed reaction with Escherichia coli respectively. In the HPG-2 technique, two amplification products between 450 and 500 bp were obtained, similar with the 500 bp product obtained with H. paragallinarum. For the standardization of the proposed molecular technique, we used the ATCC 29545 reference strain and the B and C strains of H. paragallinarum, as well as Ornithobacterium rhinotracheale, Pasteurella spp., microorganisms with similar morphological, biochemical characteristics and clinical signs to those of H. paragallinarum, and E. coli, bacterium associated in the complicated Infectious Coryza, as negative controls. Universal primers for amplifying the 16S ribosomal genes were used, obtaining a 1500 bp fragment for all strains which were cut by restriction enzymes selected by means of the analysis of sequences of the 16S ribosomal genes located in the Gene bank (bank of genes). With the RFLP-PCR a high specificity and sensibility were obtained since specific profiles for H. paragallinarum and different from those of O. rhinotracheale, Pasteurella spp. and E. coli were identified. The designed technique was used for the identification of 19 strains isolated from clinical samples of infraorbital sinus and nasal cornets of breeders and laying hens, and broiler chickens of diverse zones of Peru obtaining reproducible results and demonstrating the validity of this technique and its use for a rapid identification of microorganisms involved in respiratory infections in commercial birds. Key words: Haemophilus paragallinarum, Ornithobacterium rhinotracheale, Infectious Coryza, 16S ribosomal genes, RFLP-PCR.
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Las comunidades parasitarias como expresión de distinto comportamiento trófico en aves del Mar ArgentinoDiaz, Julia Inés January 2006 (has links)
El objetivo de este trabajo es caracterizar las comunidades de helmintos de dos especies de aves marinas con marcada diferencia en su comportamiento alimenticio, teniendo en cuenta la influencia que las tramas tróficas ejercen sobre la diversidad y estructuración de las comunidades parasitarias. Se escogió como modelo de especie estenofágica al pingüino de Magallanes (Spheniscus magellanicus) y de especie eurifágica a la gaviota cocinera (Larus dominicanus). Veintisiete pingüinos y veintinueve gaviotas fueron colectados en las costas de Península Valdés, provincia de Chubut, Argentina. Adicionalmente, fueron analizados cuatro pingüinos procedentes de la costa de la ciudad de Mar del Plata, provincia de Buenos Aires, Argentina. Spheniscus magellanicus albergó 6 especies de helmintos: 2 cestodes (Tetrabothrius lutzi y Tetrabothrius n. sp-Tetrabothriidae-), 1 digeneo (Cardiocephaloides physalis-Strigeidae-), 2 nematodes (Cosmocephalus obvelatus-Acuariidae- y Contracaecum pelagicum-Anisakidae-) y 1 acantocéfalo (Corynosoma sp.-Polymorphidae-). La fauna de helmintos de Larus dominicanus estuvo constituida por 19 especies: 3 cestodes (Tetrabothrius sp., -Tetrabothriidae- y 2 Dilepididae indeterminados); 10 digeneos (Himasthla escamosa y Stephanoprora sp.-Echinostomatidae-, Odhneria odhneri, Maritrema sp. 1 y Maritrema sp. 2, -Microphallidae-, Bartolius pierrei y un género indeterminado-Gymnophallidae-, Parorchis acanthus -Philophtalmidae-, Brachylecithum (Brachylecithum) sp.-Dicroceoelidae- y un Diplostomidae indeterminado); 4 nematodes (Cosmocephalus obvelatus y Paracuaria adunca-;Acuariidae-, larvas de Contracaecum sp.-Anisakidae- y un Capillaridae indeterminado) y 2 acantocéfalos (Corynosoma sp. y Profilicollis sp.-Polymorphidae-). El análisis a nivel infracomunitario reveló que las especies parásitas de S. magellanicus en Península Valdés presentan una localización específica a lo largo del tracto digestivo y que su distribución no se ve afectada por relaciones inter ni intraespecíficas. Solamente en el caso de Corynosoma sp. se observó cierto grado de competencia intraespecífica. La comunidad estuvo caracterizada por la presencia de una especie central (T. lutzi), tres secundarias (C. physalis, C. pelagicum, Corynosoma sp.) y una satélite (C. obvelatus). La similitud entre las infracomunidades fue muy alta debido a la existencia de un núcleo de especies que co-ocurren frecuentemente. En el caso de Larus dominicanus, se registraron relaciones inter e intraespecíficas que sugieren la competencia por un mismo recurso. La comunidad estuvo caracterizada por un alto porcentaje de especies secundarias y satélites, no asociadas positivamente, confiriendo escasa similitud a las infracomunidades. En la comunidad de S. magellanicus las especies más prevalentes y abundantes fueron las que presentaron mayor especificidad hospedatoria, respondiendo al modelo de "intercambio" observado generalmente en los peces. Por el contrario, las especies de Larus dominicanus presentaron características intermedias entre el modelo de intercambio y el modelo de "recurso amplio" característico de las aves, en donde las especies más prevalentes y abundantes son las menos específicas. Las características observadas en S. magellanicus (e. g. baja riqueza, escasas interacciones) definen comunidades del tipo "aislacionista", comunes en hospedadores ectotérmicos. La comunidad de helmintos de Larus dominicanus, tuvo características mixtas, sin embargo la mayoría de ellas definen comunidades del tipo "interactiva" (e. g. alta riqueza, relaciones inter e intraespecíficas), lo cual es común en animales endotérmicos. El hábito estenofágico del pingüino de Magallanes limita la incorporación de especies parásitas y favorece la co-ocurrencia entre ellas, mientras que el hábito eurifágico de la gaviota cocinera se refleja en una mayor riqueza específica. Los resultados obtenidos indican que la dieta determina la estructura de las comunidades de helmintos, y que las infracomunidades son predecibles sólo cuando los hospedadores poseen una dieta poco variada (estenofágica) y estable en el tiempo. Al comparar los resultados del presente trabajo con los obtenidos por otros autores se observa que la riqueza específica de L. dominicanus en el área de estudio es mayor a la reportada para otras localidades, lo cual sugiere que las gaviotas de Playa Fracasso poseen una dieta más natural y diversa que aquellas procedentes de ambientes influenciados por la presencia humana (e. g. basurales, zonas de descarte pesquero), áreas continentales u otras costas marinas. La composición de la fauna parasitaria de los pingüinos colectados en la costa de Mar del Plata sugiere que estos ejemplares no provienen de la misma colonia reproductiva que el resto de los individuos, y que probablemente procedan de poblaciones más australes en donde la disponibilidad de ítems presa es diferente. El estudio de las comunidades de helmintos permite conocer las variaciones en el comportamiento trófico de una misma especie hospedadora a nivel poblacional. / The aim of the present work is to describe the helminth communities of tow marine birds, the Magellanic penguin (Spheniscus magellanicus) as a model of stenophagic species and the Kelp gull (Larus dominicanus) as a model of euryphagic species. Taking into account the different trophic behavior of these birds it was analyzed the diversity and the parasite community structure. Twenty-seven penguins and twenty-nine gulls were collected along the Península Valdés coasts, Chubut province, Argentina. Additionally, four penguins found in Mar del Plata coast, Buenos Aires province, were prospected. Spheniscus magellanicus harbored six helminth species: 2 cestoda (Tetrabothrius lutzi and Tetrabothrius n. sp-;Tetrabothriidae-), 1 digena (Cardiocephaloides physalis-Strigeidae-), 2 nematoda (Cosmocephalus obvelatus –Acuariidae- and Contracaecum pelagicum-Anisakidae) and 1 acantocefala (Corynosoma sp.-Polymorphidae-). The helminth fauna of Larus dominicanus was constituted by 19 species: 3 cestoda (Tetrabothrius sp., -Tetrabothriidae- and 2 uncertain Dilepididae); 10 digenea (Himasthla escamosa and Stephanoprora sp.-Echinostomatidae-, Odhneria odhneri, Maritrema sp. 1 and Maritrema sp. 2, -Microphallidae-, Bartolius pierrei and 1 uncertain genus-Gymnophallidae, Parorchis acanthus -Philophtalmidae-, Brachylecithum (Brachylecithum) sp.-Dicroceoelidae- and 1 uncertain Diplostomidae); 4 nematoda (Cosmocephalus obvelatus and Paracuaria adunca-Acuariidae-, Contracaecum sp. larvae-Anisakidae- and 1 uncertain Capillaridae) and 2 acantocefala (Corynosoma sp. and Profilicollis sp.-Polymorphidae-). The infracommunity level analyzes showed that the helminth species of S. magellanicus in Península Valdés have a specific location along the digestive tract and their distribution is not affected neither by inter nor intra-specific relations. Nevertheless, Corynosoma sp. showed a little degree of intraspecific competence. The community was conformed by one core species (T. lutzi), three secondary species (C. physalis, C. pelagicum, Corynosoma sp.) and one satellite species (C. obvelatus). The similarity between the infracommunities was high duo to the existence of a group of species that frequently co-occur. In the community of Larus dominicanus were registered both inter and intraspecific relations, suggesting the competence by the same resource. The community was characterized by a high number of secondary and satellite species without association, conferring scare similarity between infracommunities. The helminth community of S. magellanicus, fit with the "trade-off" model - prevalent and abundant species are host - specific-. This model is frequently observed in fishes. In contrast, the helminth species of L. dominicanus showed intermediate features between the "trade-off" model and the "broad-resource" model. This last model is frequently observed in birds, and is characterized by prevalent and abundant species, which ones are not specific. The features observed in S. magellanicus (e. g. low richness, scare interactions) permit to define an "isolationist" community, frequently found in ectothermic hosts. Larus dominicanus has mixed characteristics, most of them define an "interactive" community (e. g. high richness, inter and intraspecific relations) common in endothermic animals. The stenophagic behavior of the Magellanic penguin reduces the incorporation of helminth species and favors the co-occurrence between them, while the euryphagic behavior of the Kelp gull is reflected in a higher richness. These results indicate that the diet is an important factor in determine the helminthes community structure and the predictability of the infracommunities is possible only when the diet of the host is stenophagic and is stable along the time. Comparing the present results with those found by previous authors, it is possible to observe that the specific richness of Larus dominicanus in Península Valdés is higher than in others localities. This suggests that the diet of the gulls in this area is more natural and diverse than those coming from others habitats (e. g. landfills, continental areas, others marine coasts). The composition of the helminth fauna of penguin from Mar del Plata suggest that these specimens come from another breeding colony that the remaining samples, where the availability of the items preys are different. The study of the helminth communities allow us to know the variations in the diet of populations of the same host species.
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