Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2017. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2017-08-10T16:18:55Z No. of bitstreams: 1 2017_PedroDinizAlves.pdf: 4923011 bytes, checksum: 6ca1cf97c92b15cf7d054111e8fcaeaa (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-09-26T16:03:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_PedroDinizAlves.pdf: 4923011 bytes, checksum: 6ca1cf97c92b15cf7d054111e8fcaeaa (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-26T16:03:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_PedroDinizAlves.pdf: 4923011 bytes, checksum: 6ca1cf97c92b15cf7d054111e8fcaeaa (MD5) Previous issue date: 2017-09-26 / A seleção sexual é um dos principais mecanismos de evolução do canto em aves. No entanto, evidências apoiando essa ideia são amplamente baseadas em estudos com canto em machos, mesmo considerando que fêmeas cantem em mais de 70% das espécies de passeriformes, e parceiros reprodutores coordenem seus cantos em duetos em mais 18% das espécies de aves. A função adaptativa do dueto ainda não é bem compreendida e mais de oito hipóteses já foram propostas. O dueto pode surgir através de cooperação ou conflito entre parceiros reprodutores, e pode ser direcionado ao parceiro ou a indivíduos externos ao par reprodutor. Neste estudo, investiguei a função adaptativa dos cantos de fêmeas e machos em uma espécie que canta em dueto, analisando como a expressão desses cantos varia em diferentes contextos de territorialidade, socialidade e reprodução. O modelo de estudo foi o João-de-barro (Furnarius rufus; Aves: Furnariidae), uma espécie socialmente monogâmica, territorial durante todo o ano, aparentemente monocromática e com cantos sexo-específicos. Meus objetivos foram: 1) testar se as funções dos cantos em dueto variam com o sexo, papel no dueto (início ou resposta de canto) e nível de organização do dueto (individual ou casal), avaliando a relação entre expressão do canto, sazonalidade reprodutiva e ocorrência de interações territoriais; 2) investigar a resposta de parceiros reprodutores em grupos com ou sem filhotes jovens ao playback de solo de fêmea, solo de macho e dueto, testando indiretamente as funções desses tipos de canto; 3) descrever o sistema de acasalamento genético do João-de-barro e testar se o canto nessa espécie se correlaciona com a qualidade territorial e sucesso reprodutivo; 4) testar se o nível de coordenação do dueto sinaliza a qualidade ou motivação do casal em competir por territórios, por meio de um experimento de playback de cantos com níveis variados de coordenação temporal; e 5) testar se existe dimorfismo sexual e pareamento seletivo em tamanho do corpo ou coloração da plumagem, o que indicaria um papel da seleção sexual nessa outra modalidade sensorial. Os principais resultados do estudo foram: 1) parceiros reprodutores coordenaram a maioria dos seus cantos em duetos (61%), e machos iniciaram mais cantos do que fêmeas; a função do canto variou em função da interação entre sexo, papel no dueto e nível de organização do dueto, mas, em geral, foi relacionada à defesa de território e do vínculo social do casal; 2) parceiros foram coordenados e equivalentes na resposta aos playbacks de coespecíficos; playbacks de solos foram mais ameaçadores do que playbacks de duetos para casais sem jovens, enquanto playbacks de duetos ameaçaram mais casais com jovens do que playbacks de solos, indicando que a defesa do vínculo social é importante para casais sem jovens e a defesa de territórios é importante para casais com jovens; 3) a taxa de paternidade extrapar foi baixa (<4% dos ninhegos) e o sucesso reprodutivo foi alto (100% dos casais produziram pelo menos um juvenil); o investimento em canto pela fêmea e a duração do dueto se correlacionaram com a qualidade dos territórios, mas não com o sucesso reprodutivo do casal; 4) o nível de coordenação do dueto não indicou a qualidade ou motivação do casal na defesa territorial, visto que parceiros responderam de forma coordenada e equivalente a todos os playbacks coespecíficos; 5) foi encontrada evidência de monocromatismo sexual e pequeno (~4%) dimorfismo em tamanho, além de ausência de pareamento seletivo. Em conclusão, este estudo demonstra que parceiros reprodutores de João-de-barro coordenam seus cantos em dueto de forma cooperativa e por múltiplas razões, principalmente para defenderem território e o próprio vínculo social do casal. / Sexual selection is one of the main forces driving the evolution of bird song. However, evidence supporting this idea comes mainly from studies conducted on male song, despite the fact that female song occurs in 71% of bird species and mated partners coordinate their songs in more than 18% of bird species. The function of duetting is poorly understood and more than eight hypotheses have been proposed to explain duet function. Duets may arise from cooperation or conflict between breeding partners and the duet participation may be directed at either partners or strangers. Here, I investigated the adaptive function of female and male songs in a duetting species, and associated song expression to different contexts of territoriality, sociality and reproduction. The study species was the Rufous Hornero (Furnarius rufus; Aves: Furnariidae), a Neotropical, socially monogamous, year-round territorial and apparently monochromatic bird species. Duets are composed by sex-specific song types in this species. My objectives were to: 1) verify whether song function in duets varies with sex, singing role (song initiation or song answering), and level of duet organization (individual or pair), examining the relation among song expression, breeding seasonality and occurrence of territorial interactions; 2) investigate the response of mated pairs with and without juveniles to the playback of female solo, male solo and duet, testing for functions of these song types; 3) describe the genetic mating system of the Rufous Horneros and test for fitness consequences (territorial quality and reproductive success) of song expression; 4) test the coalition quality hypothesis to explain the function of the degree of duet coordination in this species, through a playback experiment with duet stimuli varying in the degree of phrase coordination; and 5) test for sexual dimorphism and assortative mating relative to body size and plumage coloration, which could indicate a role of sexual selection in this sensory modality. Our main results were: 1) partners coordinated most of their songs into duets (61%), and males initiated more songs than females; song function depended on an interaction of sex, singing role and level of duet organization, but, in general, song function was related to territory defense and mutual mate guarding; 2) partners were coordinated and equivalent in playback responses; playback of solos were more threatening than playback of duets to pairs without juveniles, while the playback of duets threatened more pairs with juveniles than did playback of solos, indicating that mutual mate guarding is important to pairs without juveniles, and territory defense is important to pairs with juveniles; 3) extra-pair paternity was low (<4% of the nestlings) and breeding success was high (100% of the pairs produced at least one fledgling); female song rate and duet duration were correlated with territory quality, but not to breeding success; 4) the degree of duet coordination did not signal coalition quality or motivation of breeding partners to fight for territorial resources, because partners responded with equal aggressiveness and coordination all conspecific playbacks; 5) I found evidence of sexual monochromatism, slight (~4%) sexual dimorphism in body size and lack of assortative mating. In conclusion, this study showed that Rufous Hornero’s breeding partners coordinate their songs into duets in a cooperative way and for multiple purposes, especially for territory defense and guarding the social pair bond.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, 2015. / Submitted by Andrielle Gomes (andriellemacedo@bce.unb.br) on 2015-06-30T18:12:42Z No. of bitstreams: 1 2015_GislaineAparecidaFernandes.pdf: 1639286 bytes, checksum: 37466a8311751953891135ea5481a04a (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2015-10-14T16:52:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_GislaineAparecidaFernandes.pdf: 1639286 bytes, checksum: 37466a8311751953891135ea5481a04a (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-14T16:52:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_GislaineAparecidaFernandes.pdf: 1639286 bytes, checksum: 37466a8311751953891135ea5481a04a (MD5) / As espécies do gênero Amazona são consideradas monogâmicas sociais, não sendo identificado até o momento casos de fertilização extra-par (FEP). Outra característica importante em relação ao comportamento reprodutivo das espécies deste gênero é a fidelidade ao ninho, pois os indivíduos geralmente selecionam locais mais seguros para nidificar, como por exemplo, locais com baixos níveis de predação. O fato de que a maioria dos psitacídeos, em particular as espécies deste gênero, não apresenta dimorfismo sexual dificulta a análise de diversos aspectos relacionados ao sistema de acasalamento, exigindo do pesquisador a observação de comportamentos críticos. Uma das alternativas que vem sendo aplicada para superar estas limitações em estudos de comportamento reprodutivo em aves é o uso de marcadores moleculares co-dominantes e altamente polimórficos como os microssatélites. Neste contexto, ainda se conhece pouco a respeito da biologia reprodutiva do papagaio-de-cara-roxa (Amazona brasiliensis), necessitando uma atenção maior sobre esta questão. Neste trabalho nós contribuímos com mais informações para melhor compreensão acerca da biologia reprodutiva do papagaio-de-cara-roxa a partir da estimativa da relação de parentesco entre ninhegos encontrados em ninhos naturais e artificiais na região da Baia de Paranaguá, no estado do Paraná, com oito loci de microssatélite. Os resultados obtidos mostraram que 76% dos ninhegos analisados apresentaram relação de parentesco de irmãos, 20% de meio-irmãos e 4% de não relacionados. Os casos de irmandade foram interpretados como evidência de monogamia do casal, os de meio-irmãos como casos de FEP, enquanto os não-relacionados como casos de competição intra-específica de ninho. Os resultados também mostraram que esta espécie apresenta uma taxa de 83% de reocupação de cavidades, a maior já descrita para o gênero, sendo que a reocupação pelo mesmo casal foi de 71%. Portanto, nós concluímos que Amazona brasiliensis não pode ser considerada monogâmica genética já que há evidência de FEP. Por outro lado, apresenta um padrão de fidelidade ao sítio reprodutivo, já que a maior parte dos casais analisados ocuparam a mesma cavidade nas estações reprodutivas seguintes, mesmo havendo perda de ninhada na estação reprodutiva anterior. / The species of the genus Amazona are considered social monogamous, not being identified yet cases of extra-pair fertilization (EPF). Another important feature in relation to the reproductive behavior in species of this genus is fidelity to the nest, as a kind usually selects the safest places to nest, for example, sites with low levels of predation. The fact that most parrots, particularly species of this genus, do not show sexual dimorphism complicates the analysis of various aspects related to the mating system, requiring the researcher to observe critical behaviors. One alternative that has been applied to overcome these limitations in reproductive behavior studies in birds is the use of co-dominant and highly polymorphic molecular markers as microsatellites. In this context, little is known about the reproductive Red-tailed amazon biology (Amazona brasiliensis), requiring greater attention on this issue. In this work, we contribute more information to better understanding reproductive biology of Red-tailed amazon from the estimate of the kinship relation between nestlings found in natural and artificial nests in the region of Paranaguá Bay, in Paraná with eight microsatellite loci. The results showed that 76% of nestlings analyzed showed kinship relation of full-sibs, 20% of half-sibs and 4% unrelated. Cases of full-sibs were interpreted as evidence of couple monogamy, the half-sibs as cases of EPF, while unrelated as cases of intraspecific competition nest. The results also showed that this species has a rate of 83% cavity reoccupation, the largest ever reported to the genus, and the reoccupation by the same couple was 71%. Therefore, we conclude that Amazon brasiliensis can not be regarded as genetic monogamous since there is evidence of EPF. However, shows a pattern of the nest site fidelity, since most of analyzed couples occupied the same cavity in the following breeding seasons and the loss in previous breeding season does not seem to influence the cavity reoccupation at next station.

Made available in DSpace on 2014-06-28T02:02:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000458917-Texto+Completo-0.pdf: 1917825 bytes, checksum: 2ca6f58d7f644c84a939a28ad578855d (MD5) Previous issue date: 2014 / The Uruguayan savanna ecoregion has been affected by land use changes, particularly livestock production and monocultures, such as soybean. As consequence, the habitat quality and the avian assemblages in the region are also being affected, and if we are to protect this habitat and its bird species, studies that generate information that can be used for conservation interventions in the region are essential. We sampled bird species in semi-natural grassland and soybean sites with grassland patches, in Rio Grande do Sul and Uruguay, between 2010 and 2012. In two chapters we evaluated (1) the differences in species richness, density and composition of the avian assemblage in semi-natural grasslands and soybean fields, and (2) the patterns of habitat use by grassland birds, through assessment of species richness and abundance. In the first chapter, we found that soybean fields have the lower species richness. Moreover, species considered as grassland specialists had the greatest value of density in semi-natural grassland sites, and species that are common and habitat generalists were more abundant in the soybean fields. Turning to species composition, our results demonstrated that the types of land use were clearly separated. Among the species recorded, five are classified as threatened or near-threatened according to global and/or regional red lists: Rhea americana, Athene cunicularia and Xolmis dominicanus were recorded in both soya and semi-natural grassland sites, whereas Cistothorus platensis and Xanthopsar flavus were recorded only in semi-natural grassland sites. In the second chapter we analyzed the habitat use of grassland birds by establishing a buffer of 100 meters in each of the 160 points sampled.We calculated the percentage of each land use type in each buffer and found that most of the grassland’s bird species analyzed occurred preferentially in sites with large percentage of natural grasslands and/or wet grasslands, and none of them used the soybean fields preferentially. Moreover, more than 60% of the records occurred in the buffers composed by over 90% of natural grassland, and the same pattern was found for the total number of individuals of all bird species. Based on our results, we can conclude that the natural grassland sites are important for the maintenance of the avian assemblage in the region. For the conservation of the grasslands in the region, some important measures are needed, such as 1) control on agricultural management practices (e. g. maintain patches of grasslands in the soybean fields), and 2) development of policies combining agriculture production and conservation of biodiversity. / A ecoregião da Savana Uruguaia vem sendo constantemente alterada, principalmente quanto ao uso do solo para implantação de pastagens e agricultura intensiva. Consequentemente, a qualidade dos habitats e as populações de aves também são afetadas. Estudos que gerem informações sobre como a densidade das espécies varia em ambientes alterados, e que possam proporcionar ações de conservação das áreas naturais são necessários. Entre 2010 e 2012 amostramos as espécies de aves, através de pontos de contagem, em áreas de campos semi-naturais e de cultivos de soja com manchas de campos, no Rio Grande do Sul e no Uruguai. Avaliamos, em dois capítulos, (1) as diferenças na riqueza, densidade e composição das assembleias de aves nestes dois tipos de uso do solo e (2) os padrões de uso do habitat pelas aves campestres através da avaliação da riqueza e abundância das mesmas nestes diferentes ambientes. Com referência ao primeiro capítulo, os cultivos de soja apresentaram menor riqueza de espécies do que os campos semi-naturais. O mesmo ocorreu com a densidade das espécies, sendo que espécies consideradas mais especialistas apresentaram os maiores valores de densidade em áreas de campo semi-natural e espécies mais comuns e generalistas foram abundantes na soja. Quanto à composição de espécies, os tipos de uso do solo foram claramente separados. Cinco das espécies registradas são consideradas ameaçadas ou quase ameaçadas global e/ou regionalmente - Rhea americana, Athene cunicularia e Xolmis dominicanus foram registradas tanto nas áreas de soja quanto nas de campos semi-naturais, já Cistothorus platensis e Xanthopsar flavus foram registradas apenas nos campos semi-naturais).Quanto ao segundo capítulo, estabelecemos um buffer de 100 metros para cada um dos 160 pontos amostrados, e calculamos a porcentagem de cada tipo de uso do solo nos tampões, em cada ponto. Dentre as espécies de aves campestres analisadas, a maioria delas ocorreu preferencialmente em campos naturais e/ou campos naturais úmidos, e nenhuma usou primeiramente as áreas de soja. Além disso, mais de 60% dos registros de ocorrência e do número total de indivíduos destas aves foram registrados nos buffers compostos por mais de 90% de campo natural. A partir destes resultados, concluímos o quão importantes são as áreas de campo natural para a manutenção da assembleia de aves. Para a conservação dessas espécies, porém, são necessárias algumas medidas importantes dentre as quais podemos destacar: 1) práticas de manejo (por exemplo, a manutenção de manchas de campo entre os cultivos de soja) e 2) políticas que aliem a produção da agricultura e a conservação da biodiversidade. Além disso, é importante entender a resposta das diferentes espécies de aves frente às alterações do habitat que estão acontecendo na região.

El Perú uno de los países con mayor biodiversidad biológica en el mundo y el tercero con mayor diversidad de aves en el planeta. Sin embargo, pocos peruanos están conscientes de esta riqueza y de su importancia. En ese sentido, debemos desarrollar de manera urgente, un vínculo con nuestra naturaleza a través de iniciativas que se encuentren al alcance de todos. Haciendo una investigación sobre los materiales de difusión acerca de nuestras aves, he podido comprobar que los jóvenes no tienen interés por nuestra biodiversidad debido a la ausencia de este tema en el currículo escolar y a la falta de materiales con información clara, amena, llamativa, interesante y accesible a personas ajenas a los conocimientos científicos aplicadas a soportes actualizados al mundo de hoy. Por tal razón, he creado un proyecto en el que, con ayuda de la participación del público, se pueda dar un enfoque nuevo a la difusión de la biodiversidad de nuestro país. “Flora y Fauna Perú” es un proyecto cuyo objetivo es crear un nuevo modelo de difusión de nuestra biodiversidad a través de internet dirigido a un público con pocos conocimientos en el tema. Para ello, he desarrollado un prototipo construido en base a un largo proceso de experimentación con mi público objetivo

Apesar de ainda não terem sido relatados Coronavírus aviários com potencial zoonótico, espécies de aves silvestres e domésticas podem portar CoVs de grande importância econômica como o vírus da Bronquite Infecciosa (IBV). Além disso, nos últimos anos, diversos novos CoVs geneticamente distintos do IBV vêm sendo identificados em diferentes famílias de aves e mamíferos silvestres e domésticos. O Brasil contem 18% do total da diversidade de espécies de aves no mundo, no entanto, estudos sobre a presença de Coronavírus em aves silvestres ainda são bastante escassos. O presente estudo tem por objetivo realizar análise retrospectiva da presença de Coronavírus em amostras de aves silvestres e domésticas de diferentes regiões brasileiras coletadas entre os anos de 2004 e 2013 através de RT-PCR; realizar a caracterização molecular e a análise filogenética afim de correlacionar sua epidemiologia às rotas de migrações de aves, à proximidade das regiões urbanas e de granjas avícolas, verificando a possibilidade de transmissão. Do total de 746 amostras testadas, 25 apresentaram resultados positivos para os Coronavírus com primers para o gene da RpRd e foram sequenciadas. Obtivemos sucesso no sequenciamento de 7 dessas amostras, sendo 4 positivas para Gammacoronavírus e 3 positivas para Deltacoronavírus. Na tentativa de sequenciamento do gene da proteína S uma galinha (Gallus gallus), da Ilha de Marajó-PA, mostrou sequência que foi identificada como uma cepa de IBV. Este trabalho é inédito no Brasil, pois demonstra a presença de Gamma e Deltacoronavírus aviários circulando em diversas regiões, próximo a áreas urbanas e indústrias avícolas, mostrando evidências de que aves silvestres podem carrear estes Coronavírus entre diferentes sítios migratórios no Brasil. / Regardless it has never been reported any avian Coronavirus with zoonotic potential, species of both wild and domestic birds can carry CoVs of great economic importance as the Infectious Bronchitis Virus (IBV). Furthermore, recently, many new CoVs, genetically distinct from IBV have been identified in different families of wild and domestic birds and mammals. Even though Brazil contains 18% of the bird species diversity in the world studies about the presence of Coronaviruses in wild birds are still quite scarce. This study aims to perform retrospective analysis of the presence of coronavirus in wild birds and domestic samples of different Brazilian regions collected between the years 2004 and 2013 by RT PCR and to perform molecular characterization and phylogenetic analysis in order to correlate its epidemiology to routes of bird migrations , the proximity of urban and poultry industry regions , verifying the possibility of transmission. Of the amount of 746 samples tested, 25 were positive for Coronavirus in PCR and nested PCR tests with primers for RpRd gene and were sequenced. We have succeeded in sequencing 7 of these samples which 4 were positive for Gammacoronavirus and 3 for Deltacoronavirus. In attempt of sequencing the S protein gene, we have succeeded in a chicken sample (Gallus gallus) from Ilha de Marajó-PA. This sample was identified as a strain of IBV. This work is unprecedented in Brazil, as it demonstrates the presence of Gamma and Deltacoronavirus in birds circulating in different regions, close to urban areas and poultry industries, showing evidence that wild birds may carry these Coronavirus between different migratory sites in Brazil.

Made available in DSpace on 2016-08-18T17:23:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Daniel Rocha.pdf: 2551995 bytes, checksum: 65ba8cf188c0a50be02f159bd8286406 (MD5) Previous issue date: 2014-02-20 / Assessment of compliance of the Program Monitoring Migratory Birds (PMMB) during deployment pier in San Luis - MA, through documents obtained from the entrepreneur and the environmental agency. It was shown in this study that several PMMB guidelines were not followed and the results showed different patterns of the studies of other authors for the same region. Therefore, the PMMB was not completed as proposed and the results of monitoring may have been committed in this sense is not possible to define the dynamics of interference in birds studied by the project. / Avaliação do cumprimento do Programa de Monitoramento de Aves Migratórias (PMAM) durante a implantação de píer em São Luís MA, por meio de documentos obtidos junto ao empreendedor e ao órgão ambiental. Foi evidenciado nessa pesquisa que várias diretrizes do PMAM não foram seguidas e que os resultados mostraram padrões diferentes dos estudos de outros autores, para a mesma região. Portanto, o PMAM não foi cumprido conforme proposto e os resultados dos monitoramentos podem ter ficado comprometidos, nesse sentido não é possível definir a interferência na dinâmica das aves estudadas por parte do empreendimento.

Apesar de ainda não terem sido relatados Coronavírus aviários com potencial zoonótico, espécies de aves silvestres e domésticas podem portar CoVs de grande importância econômica como o vírus da Bronquite Infecciosa (IBV). Além disso, nos últimos anos, diversos novos CoVs geneticamente distintos do IBV vêm sendo identificados em diferentes famílias de aves e mamíferos silvestres e domésticos. O Brasil contem 18% do total da diversidade de espécies de aves no mundo, no entanto, estudos sobre a presença de Coronavírus em aves silvestres ainda são bastante escassos. O presente estudo tem por objetivo realizar análise retrospectiva da presença de Coronavírus em amostras de aves silvestres e domésticas de diferentes regiões brasileiras coletadas entre os anos de 2004 e 2013 através de RT-PCR; realizar a caracterização molecular e a análise filogenética afim de correlacionar sua epidemiologia às rotas de migrações de aves, à proximidade das regiões urbanas e de granjas avícolas, verificando a possibilidade de transmissão. Do total de 746 amostras testadas, 25 apresentaram resultados positivos para os Coronavírus com primers para o gene da RpRd e foram sequenciadas. Obtivemos sucesso no sequenciamento de 7 dessas amostras, sendo 4 positivas para Gammacoronavírus e 3 positivas para Deltacoronavírus. Na tentativa de sequenciamento do gene da proteína S uma galinha (Gallus gallus), da Ilha de Marajó-PA, mostrou sequência que foi identificada como uma cepa de IBV. Este trabalho é inédito no Brasil, pois demonstra a presença de Gamma e Deltacoronavírus aviários circulando em diversas regiões, próximo a áreas urbanas e indústrias avícolas, mostrando evidências de que aves silvestres podem carrear estes Coronavírus entre diferentes sítios migratórios no Brasil. / Regardless it has never been reported any avian Coronavirus with zoonotic potential, species of both wild and domestic birds can carry CoVs of great economic importance as the Infectious Bronchitis Virus (IBV). Furthermore, recently, many new CoVs, genetically distinct from IBV have been identified in different families of wild and domestic birds and mammals. Even though Brazil contains 18% of the bird species diversity in the world studies about the presence of Coronaviruses in wild birds are still quite scarce. This study aims to perform retrospective analysis of the presence of coronavirus in wild birds and domestic samples of different Brazilian regions collected between the years 2004 and 2013 by RT PCR and to perform molecular characterization and phylogenetic analysis in order to correlate its epidemiology to routes of bird migrations , the proximity of urban and poultry industry regions , verifying the possibility of transmission. Of the amount of 746 samples tested, 25 were positive for Coronavirus in PCR and nested PCR tests with primers for RpRd gene and were sequenced. We have succeeded in sequencing 7 of these samples which 4 were positive for Gammacoronavirus and 3 for Deltacoronavirus. In attempt of sequencing the S protein gene, we have succeeded in a chicken sample (Gallus gallus) from Ilha de Marajó-PA. This sample was identified as a strain of IBV. This work is unprecedented in Brazil, as it demonstrates the presence of Gamma and Deltacoronavirus in birds circulating in different regions, close to urban areas and poultry industries, showing evidence that wild birds may carry these Coronavirus between different migratory sites in Brazil.

Memoria para optar al Titulo Profesional de Médico Veterinario / Se analizaron 216 muestras de heces correspondientes a 36 jaulas de aves en el Zoológico Metropolitano. La toma de muestras se realizó día por medio con un total de tres muestras por jaula en dos periodos de muestreo, Marzo-Abril y Septiembre-Octubre. Once de estas jaulas eran habitadas sólo por una especie (jaulas monoespecíficas). Se detectó la presencia de huevos correspondientes a: Ascaridea, Capillaria sp., Strongiloidea, y ooquistes de Eimeria sp., e Isospora sp.. Durante el primer periodo de muestreo el porcentaje de muestras positivas fue de un 16, 7%, y en el segundo de un 44,4%, porcentaje que se acerca a los observados en carnívoros y primates no humanos del Parque Zoológico Metropolitano por diversos autores. La estructura parasitaria encontrada con más frecuencia fueron los ooquistes de Eimeria sp. En orden descendente le siguieron los huevos de: Ascaridea, Capillaria sp.,Strongiloidea y los ooquistes de Isospora sp. No se observó diferencias estadísticamente significativas en la frecuencia de aparición de los ooquistes de Eimeria sp. en las jaulas monoespecíficas, ni tampoco se observó diferencias estadísticamente significativas en la cantidad de huevos por gramo de heces (hpg) de Eimeria sp. y Ascaridios en las jaulas positivas a estos parásitos en ambos periodos de muestreo

Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario. / Los delitos contra la fauna silvestre son cada vez más frecuentes. Dentro de estos se destaca el tráfico animal, una práctica ilegal que tiene impacto directo en la conservación de la fauna, porque extraen individuos de su habitad, introduce especies invasoras a otras regiones, genera movimiento de patógenos entre fronteras, además del maltrato que sufren las especies por las condiciones en las que son transportadas. Por esta razón, surge la necesidad de generar herramientas que permitan cuantificar el real impacto de este delito y las principales especies victimizadas, para así emplear medidas de mitigación. Para esto, es de gran relevancia lograr identificar los restos óseos de las especies halladas en los sitios de suceso. La identificación de especies a través de restos óseos, es una técnica rápida y de bajo costo, la cual se puede usar en terreno. Para lograr la correcta identificación de las especies en cuestión, es necesario contar con una guía estandarizada de los huesos de las diferentes especies. En el presente estudio se logró describir estructuras anatómicas de los huesos de cráneo, mandíbula, húmero, esternón, pelvis y fémur de las cuatro especies de interés: amazona frentiazul (Amazona aestiva), guacamayo azul-amarillo (Ara ararauna), guacamayo escarlata (Ara macao) y guacamayo rojo (Ara chloreoptera). Además, se consiguió comparar las características morfológicas diferenciales y específicas, que permiten identificarlas correctamente. Así, en el análisis de los resultados, se encontraron diferencias en la forma y desarrollo de ciertas estructuras, principalmente en el cráneo, esternón, pelvis y fémur, que permiten diferenciar una especie respecto de las otras, convirtiéndose en los huesos más relevantes en el proceso de identificación de amazona en relación a las tres especies de guacamayo, pero no así entre guacamayos mismos. El cráneo, es la estructura que presentó las mayores diferencias anatómicas, en la unión entre el proceso postorbital y arco suborbital, en la forma y disposición de las narinas, y en la proyección del hueso prefontal. Esto nos permitirá construir una guía anatómica osteológica comparativa, que permita su identificación en el sitio de suceso. / Crimes against wildlife are becoming more frequent. These include animal trafficking, an illegal practice that has a direct impact on the conservation of wildlife, because they extract individuals from their habitat, introduce invasive species into other regions, generate movement of pathogens across borders, as well as the mistreatment of the animals. Species by the conditions in which they are transported. For this reason, the need arises to generate tools to quantify the real impact of this crime and the main victimized species, in order to use mitigation measures. For this, it is of great relevance to identify the bone remains of the species found in the sites of success. Identification of species through skeletal remains is a quick and inexpensive technique, which can be used on the ground. To achieve the correct identification of the species in question, it is necessary to have a standardized guide of the bones of the different species. In the present study, anatomical structures of the skull, jaw, humerus, sternum, pelvis and femur bones of the four species of interest were described: amazona frentiazul (Amazona aestiva), blue-yellow macaw (Ara ararauna), scarlet macaw Ara macao) and red macaw (Ara chloreoptera). In addition, it was possible to compare the differential and specific morphological characteristics, which allow to identify them correctly. Thus, in the analysis of the results, differences were found in the shape and development of certain structures, mainly in the skull, sternum, pelvis and femur, that allow differentiating one species from the others, becoming the most relevant bones in the Process of identification of Amazon in relation to the three species of macaw, but not so among macaws themselves. The skull is the structure that presented the greatest anatomical differences, in the union between the postorbital process and suborbital arch, in the shape and arrangement of the nostrils, and in the projection of the prefrontal bone. This will allow us to construct a comparative anatomical osteological guide, allowing its identification at the site of occurrence.

En el presente trabajo de tesis se analizaron 2775 muestras de suero de aves (Gallus gallus) recolectadas en el programa de Monitoreo Serológico realizado en el Perú por el Servicio Nacional de Sanidad Agraria (SENASA) desde el 27 de agosto del 2001 al 18 de enero del 2002. Las muestras fueron clasificadas de acuerdo al tipo de explotación en: Aves de Postura (n =299), Pollos de Carne (n =704), Aves de Crianza Casera (n =1200) y Aves de Riña (n =492). Para el análisis de resultados se diseño una tabla de interpretación, la cual con la intervención de un panel de expertos consistió en la estandarización de resultados serológicos de la prueba de inhibición de la hemoaglutinación (HI), para la enfermedad de Newcastle, de acuerdo a los títulos de anticuerpos obtenidos. El resultado del análisis del total de muestras analizadas dio una frecuencia de 4.7% de aves consideradas positivas las que presentaron títulos de anticuerpos compatibles a desafío de campo al virus de la ENC. El análisis por tipo de explotación dio una frecuencia de 11.71% para las aves de crianza tecnificada de postura y de 3.9% para las aves de crianza no tecnificada casera. El análisis de regresión logística multinomial muestra al grupo de aves de postura como factor de riesgo, asociado al titulo de anticuerpos de la prueba HI compatible con desafío al virus de la ENC. El presente estudio concluye que el virus de la ENC es endémico en las aves de crianza tecnificada para los departamentos de Ica, Arequipa, Moquegua, Tacna, Junín, Huancavelica, Ayacucho, Cuzco, Apurímac y Puno, siendo en esta zona las aves de postura el principal factor de riesgo. / In the present thesis work has been analyzed 2775 samples of avian serum collected in the serologic screening of Peru done by El Servicio nacional de Sanidad Agraria (Senasa) from August 27 2001 to January 18 2002. The samples were classified according to the type of exploitation in: Layers (n =299) , broilers (n =704), in-house breeding (n =1200) and cock fight breeding (n =492). The analysis of the results was interpreted by the use of a chart of interpretation designed by a panel of experts, which consisted in the standardization of the serologist results of the inhibition of hemoaglutination test (HI), for the Newcastle disease (ND) according to the level of antibody titel obbteined. The result of the analysis of the total of samples analyzed gave a frequency of 4.7% of birds considered positives which presented tittles of antibodies compatibles to a field challenge of the ND virus. The analysis by type of exploitation gave a frequency of 11.71% for the layers and a 3.9% for the in-house breeding. The analysis of multinomial logistic regression shows that the group of layers as a risk factor, associated to the title of antibodies of the HI test compatible to a challenge of the ND virus. The present study concludes that the ND virus is endemic in the layers breeding for the de departments of Ica, Arequipa, Moquegua, Tacna, Junín, Huancavelica, Ayacucho, Cuzco, Apurímac and Puno.